基于网络药理学探究当归补血汤治疗骨质疏松症的分子作用机制

目的 基于系统网络药理学方法探讨当归补血汤治疗骨质疏松(OP)的分子作用机制.方法 通过TCMSP平台筛选当归补血汤主要化学成分、对应靶点及靶标基因,借助GeneCards数据库获取OP已知的相关靶点,将药物靶基因映射到疾病靶基因获得当归补血汤作用于OP的预测靶点;利用Cytoscape 3.5.1软件构建有效活性化合...     

基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病的作用机制

目的:基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease, CKD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库收集药物活性成分和潜在靶点,通过GeneCards和Disgenet数据库获取CKD靶点;利用软件Venny2.1获取药物-疾病交集靶点,采用STRING数据库构建PPI蛋白网络,并筛选核心靶点;通过DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,借助软件Cytoseape3.9.1构建活性成分-疾病-靶点-信号通路网络。结果:筛选得到健脾养血排毒方有效成分130种,主要为槲皮素、山柰酚、刺芒炳花素等,涉及257个靶点基因;疾病靶点1 817个,健脾养血排毒方-CKD交集靶点156个,经拓扑分析获得TNF、VEGFA、TP53等69个核心靶点;富集分析涉及PI3K-Akt、AGE-RAGE及MAPK信号通路。结论:本研究初步探析了健脾养血排毒方治疗CKD的活性成分、潜在靶点及信号通路,为其干预CKD的作用机制提供了理论依据。     

基于网络药理学探讨二至丸治疗慢性肾脏病的作用机制

目的:采用网络药理学的方法探讨二至丸治疗慢性肾脏病(CKD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库收集二至丸的有效成分及靶点,构建化合物-靶点网络;使用DisGeNET、OMIM、DrugBank数据库收集CKD的作用靶点,获得药物与疾病的交集靶点后,使用在线STRING数据库进行分析,构建PPI网络图,获取核心靶点蛋白,利用Metascape数据库对交集靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。结果:共收集到23个有效成分,包括槲皮素、木樨草素等,药物靶点蛋白211个,疾病基因905个,49个共同靶点,主要作用于IL6、VEGFA、IL1B等20个核心靶点,涉及活性氧代谢过程、细胞因子介导的信号通路等1 491条GO富集功能和剪切应力与动脉粥样硬化通路、AGEs-RAGE介导信号通路、IL-17信号通路等97条KEGG信号通路。结论:二至丸治疗CKD具有多途径、多靶点作用的特点,为今后进一步药理研究及临床试验提供参考。     

基于网络药理学分析尿毒清颗粒治疗慢性肾脏病的内在机制

目的:该文利用网络药理学理念和网络分析技术,探讨尿毒清颗粒治疗慢性肾脏病的潜在活性成分和可能作用机制.方法:利用TCMSP平台获得尿毒清颗粒(主要成分由大黄、黄芪、桑白皮、苦参、白术、茯苓、白芍、丹参、车前草组成)主要活性成分和作用靶点信息;利用GeneCards数据库获取与慢性肾脏病相关的基因靶点,采用Cytosca...     

基于网络药理学的桑白皮-紫苏子药对治疗慢性肾脏病的作用机制探析

目的:基于网络药理学探究桑白皮-紫苏子药对治疗慢性肾脏病(CKD)的作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、STRING平台、DisGeNet平台筛选桑白皮-紫苏子药对的活性成分及治疗CKD的作用靶标.借助Cytoscape 3.6.0软件构建桑白皮-紫苏子药对活性成分-CKD靶标网络.结合STRIN...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨益气养阴汤治疗甲状腺癌术后的作用机制

目的：利用网络药理学和分子对接技术探讨益气养阴汤治疗甲状腺癌术后的作用机制。方法：通过本草组鉴（HERB）数据库检索益气养阴汤10味药物化学成分,通过PubChem、SwissADNE筛选药物活性成分,Swiss target prediction预测活性成分作用靶点。在Gene Cards、OMIM、DisGeNET、Drug Bank数据库检索获得甲状腺癌术后的疾病靶点。Venny2.1.0平台获得药物与疾病的交集靶点,使用String数据库构建交集靶点蛋白互作网络,并导入Cytoscape3.9.1筛选得到核心靶点蛋白;借助Cytoscape3.9.1构建药物-活性成分-靶点网络图,并获取关键活性成分;使用Metascape数据库进行GO和KEGG富集分析;对关键靶点和关键成分进行分子对接验证。结果：得到益气养阴汤活性成分157种,预测活性成分作用靶点507个,甲状腺癌术后相关疾病靶点1817个,药物活性成分—疾病交集靶点154个。PPI分析得到SRC、HSP90AA1、PIK3R1、PIK3CA、AKT1为关键靶点基因,槲皮素、山柰酚、木犀草素为关键活性成分,分子对接显示关键靶...     

基于网络药理学探讨黄芪-当归治疗糖尿病足的作用机制

目的:采用网络药理学方法分析黄芪-当归(HQ-DG)治疗糖尿病足,促进溃疡愈合的作用机制.方法:检索中药系统药理学数据库与分析(TCMSP)数据库,查阅文献获得黄芪-当归潜在活性成分及作用靶点,通过GeneCards数据库、OMIM数据库、DDT数据库和Drugbank数据库获得糖尿病足的疾病潜在靶点;应用Metasc...     

基于网络药理学探讨二仙汤治疗骨质疏松症作用机制

目的基于网络药理学探讨二仙汤治疗骨质疏松症作用机制。方法借助TCMSP和Uniprot数据库筛选二仙汤活性成分和作用靶标;通过TTD、Genecards、OMIM、DisGeNET在线数据库搜索骨质疏松症基因;运用Cytoscape3.7.0软件构建“二仙汤药物-活性成分-交集靶标基因”网络图;使用STRING数据库构建PPI网络并基于CytoHubba插件中的MCC算法筛选获得关键基因;运用g:Profiler对关键基因进行GO分析和KEGG通路富集分析,并使用Omicshare工具绘制高级气泡图,使用R软件绘制通路机制图。结果二仙汤活性成分有104种,二仙汤作用靶标与骨质疏松症基因的交集靶标基因有145个,基于MCC算法得到关键基因50个。GO分析结果显示,生物途径主要包括信号转导、生物过程的阳性调节等;细胞组分包括胞内细胞器腔、核浆等;分子功能主要包括酶结合、信号受体结合等。KEGG富集通路结果显示关键基因主要富集在PI3K-Akt、MAPK、NF-kB、TNF、Wnt、雌激素等信号通路。结论二仙汤中的淫羊藿苷、槲皮素、山柰酚等活性成分可能通过PI3K-Akt、MAPK、NF-kB、TNF、Wnt、雌激素等信号通路,作用于JUN、TNF-α、IL6、AR等多个关键基因,起到调节骨代谢,促进成骨细胞生成和抑制破骨细胞分化,治疗骨质疏松症的目的。     

基于网络药理学探究补阳还五汤治疗糖尿病肾病的作用机制

目的:采用网络药理学方法探究补阳还五汤治疗糖尿病肾病(DN)的潜在作用机制.方法:通过TCMSP、PubChem和SwissTargetPrediction网站检索补阳还五汤的活性成分及靶标基因,通过TTD、OMIM、DrugBank、DisGENT数据库获取DN的相关靶标基因,将药物靶标与疾病靶标进行映射,以VENN...     

基于网络药理学探讨通幽汤治疗食管癌的作用机制

目的 运用网络药理学的方法探讨通幽汤治疗食管癌的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药综合数据库(Traditional Ch...     

加味当归补血汤治疗慢性肾衰竭36例

慢性肾衰竭（chronic renal failure,CRF）是由于多种原发性或继发性慢性肾脏疾患所致进行性肾功能损害所出现的一系列症状或代谢紊乱组成的临床综合征。我们曾使用加味当归补血汤治疗CRF贫血,收到良好效果,近年来我们对本方作了进一步治疗观察,使CRF患者病情明显好转,肾功能改善,延缓了肾脏替代治疗,提高了生存质量,现报告总结如下。     

基于网络药理学联合分子对接研究六磨汤治疗肿瘤性肠梗阻的作用机制

目的:采用网络药理学联合分子对接的方法,筛选出六磨汤的主要活性化合物,预测六磨汤治疗肿瘤性肠梗阻的潜在作用靶点及信号通路,以探讨其治疗肿瘤性肠梗阻的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库和相关文献记载检索六磨汤中6味药的化学成分和作用靶点;通过GeneCards数据库、OMIM数据库、DrugBank数据库及Phar...     

基于网络药理学及分子对接技术探讨夏枯草治疗甲状腺癌的作用机制

目的 运用网络药理学联合分子对接技术分析夏枯草治疗甲状腺癌的分子机制。方法 利用TCMSP数据库预测夏枯草的主要活性成分,并用TCMSP和PubChem数据库获取所有活性成分对应靶点;通过GeneCards及OMIM数据库收集甲状腺治疗甲状腺癌的靶点。利用STRING数据库获取蛋白间的相互作用信息,并通过R语言进行拓扑学分析及可视化。利用R包clusterProfiler对上述取得的药物和疾病的交集靶点进行GO和KEGG pathway分析。利用Cytoscape 3.7.2构建活性成分-靶点-疾病网络,并进行拓扑学分析,得到核心化合物,用分子对接对核心靶点和化合物进行验证。结果 槲皮素、木犀草素、山奈酚、谷甾醇可能是夏枯草治疗甲状腺癌的核心成分,AKTI、VEGFA、CASP3、MYC、JUN、MAPK8、IL6、EGFR、MAPK1、EGF可能是治疗的重要靶点。结论 夏枯草治疗甲状腺癌体现了多成分、多靶点、多通路的特点,为夏枯草有效成分的筛选及进一步研究提供了理论基础。     

基于网络药理学和分子对接探讨程氏萆薢分清饮治疗慢性前列腺炎的机制研究

目的:运用网络药理学研究和分子对接技术,探讨程氏萆薢分清饮治疗慢性前列腺炎(CP)的潜在机制.方法:借助TCMSP数据库筛选萆薢分清饮的活性成分及对应蛋白靶点,并利用Uniprot数据库确定基因靶点简称,通过Cytoscape3.7.2软件构建"中药-有效成分-靶点"作用网络.借助GeneCards和OMIM数据库筛选...     

肉苁蓉治疗慢性肾脏病和骨质疏松症的潜在双效成分及作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨肉苁蓉治疗慢性肾脏病合并骨质疏松症(CKD-OP)的潜在双效成分及作用机制。方法 通过多个数据库和文献检索筛选出肉苁蓉的活性成分及其对应靶点与慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)和骨质疏松症(osteoporosis,OP)疾病相关靶点的交集,于STRING数据库构建PPI网络,经CytoHubba插件筛选核心靶点后在DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,于Cytoscape构建活性成分-核心靶点-信号通路网络后获得关键成分、关键靶点和关键信号通路,最后在AutoDockTools进行分子对接验证。结果 得到肉苁蓉治疗CKD-OP关键成分3个(槲皮素、β-谷甾醇、红景天苷),关键靶点6个(TNF、AKT1、MAPK1、JUN、RELA和PTGS2),关键信号通路3条(TNF 、NF-κB 和Oxytocin 信号通路)。结论 初步揭示肉苁蓉通过“多成分-多靶点-多途径”的特点治疗CKD-OP的潜在分子药理机制,为中药现代化和CKD-OP的治疗提供了理论依据和思路。     

基于网络药理学和分子对接探讨顾步汤治疗糖尿病足作用机制的研究

目的:通过网络药理学和分子对接方法,预测顾步汤治疗糖尿病足(DF)的作用机制.方法:通过TCMSP数据库获取顾步汤各中药有效成分并预测其作用靶点;通过检索TTD数据库和CTD数据库筛选DF的靶点,并将成分靶点与疾病靶点取交集得到关键靶点;通过STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;运用Cytoscape...     

基于网络药理学与分子对接探讨沉香治疗缺氧性肾损伤的作用机制

目的:基于网络药理学探究沉香治疗缺氧性肾损伤的潜在机制。方法:通过TCMSP数据库筛取沉香活性组分及作用靶点;从GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库获取肾缺氧相关靶点,利用String平台构建PPI网络并挖掘潜在蛋白质功能模块。Metascape平台分析所涉及的生物过程及通路,Cytoscape 3.8.2软件构建“沉香成分—肾脏缺氧靶点—通路”网络,Autodock软件进行分子对接验证。结果:沉香改善肾脏缺氧的核心成分包括槲皮素、β-谷甾醇、6,7-二甲氧基-2-(苯乙基)色酮等,核心靶点有BAX、IL6、AKT1、BCL2、TP53等,对接结果中Affinity小于-5者占93.3%,提示靶点和成分间较好的结合活性。关键靶点主要富集于AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、HIF-1信号通路以及p53信号通路等20个显著相关通路,涉及细胞凋亡、炎症反应、免疫调节、缺氧及氧化应激等100多个显著相关生物学过程。结论:本研究初步探析了沉香治疗缺氧性肾损伤的潜在机制,为沉香在肾脏疾病中的应用提供科学依据。     

基于网络药理学及分子对接探究麻黄附子甘草汤合肾着汤治疗膜性肾病的作用机制

目的:通过网络药理学探讨麻黄附子甘草汤合肾着汤治疗膜性肾病(MN)的作用机制。方法:通过TCMSP平台收集麻黄附子甘草汤合肾着汤的活性成分与靶点信息;在GeneCards、OMIN、TTD、DrugBank数据库获得MN相关靶点;利用STRING分析两者交集靶点的相互作用关系并筛选核心靶点;核心靶点输至Metascape数据库进行GO及KEGG富集;使用AutoDock进行分子对接验证。结果:共获得253个复方靶点,4 092个疾病靶点及170个交集靶点;在PPI网络中共获得23个核心靶点并通过Matescape平台得出靶点通路信息;分子对接结果表明主要成分与核心靶点具有良好的结合能力。结论:网络药理学研究得出,方中槲皮素、山奈酚等核心成分作用与AKT1、TNP、TP53、JUN等核心靶点通过直接或间接调控AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路发挥治疗MN的作用。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨通关丸治疗良性前列腺增生的作用机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨通关丸治疗良性前列腺增生(BPH)的作用机制.方法:查询TCMSP、BATMAN-TCM及ETCM获取通关丸的药物成分,在Swiss Target Prediction对药物成分的ADME进行筛选,并预测筛选后的药物成分的作用靶点;运用DisGeNET、Genecards及OMIM...     

益肾汤结肠透析对慢性肾脏病3～4期患者IS、PCS的影响

目的:探讨益肾汤结肠透析对CKD3～4期患者IS、PCS的影响及意义.方法:选择患者为2018年03月—2019年07月在我科住院及门诊的CKD3～4期患者113例,随机分为对照组、结肠透析组及益肾汤结肠透析组;对照组以对症治疗为主,结肠透析组在对照组治疗基础上联合结肠透析3次/周,2 h/次,益肾汤结肠透析组在结肠透...