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1.
目的调查重庆市医疗机构中艾滋病病毒(HIV)1型(HIV-1)感染者/艾滋病(AIDS)病人中的HIV-1基因亚型、群体动力学及耐药性。方法收集2013年12月至2016年4月重庆多家医疗机构HIV-1感染者/AIDS病人血浆,通过提取核糖核酸(RNA)、反转录、巢式聚合酶链式反应(PCR),系统发育学和群体遗传学的方法,扩增及分析HIV基因组pol区序列,并检测耐药相关突变。结果共收集657份HIV-1感染者/AIDS病人静脉血样本,扩增及测序得到256份有效的pol基因片段,HIV基因亚型分析显示,重庆医疗机构中流行的HIV-1毒株以CRF07_BC(43.8%,112份)、CRF01_AE(34.8%,89份)为主要基因型;随后依次为CRF08_BC(8.2%,21份)、B(3.5%,9份)、CRF55_01B(2.7%,7份)、CRF68_01B(0.4%,1份)和CRF86_BC(0.4%,1份)。检出耐药基因突变者94例(占36.7%),无耐药基因突变者162例(占63.3%)。不同基因亚型间,pol基因蛋白酶区和反转录酶区的基因突变位点差异无统计学意义(P0.05)。对优势群体CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC的群体遗传学分析,证实重庆市医疗机构中的HIV-1部分基因型群体正在经历扩张。结论重庆市医疗机构中HIV-1病毒基因突变和重组普遍存在。HIV-1CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC基因亚型正在经历缓慢扩张的过程。需持续研究和监控重庆地区HIV-1在感染者中的遗传分化及耐药进展。  相似文献   

2.
目的了解四川省男男性行为人群(MSM)中感染艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)各亚型的流行情况,探索HIV-1感染规律。方法采集近年来MSM人群中HIV感染者的样本,进行核酸提取、聚合酶链反应(PCR)及基因测序,对所得结果进行pol基因初步鉴定,同时用软件MEGA 4.1进行系统发生分析。结果在HIV感染者较多的成都、绵阳和达州三个地区采集的234份样本中,基因测序成功77份,其中CRF07_BC、CRF01_AE和B亚型分别为42份、24份和11份,各组群内基因离散率分别为(1.56%±1.10%)、(2.56%±0.82%)和(5.63%±2.02%)。结论各亚型组群内的部分感染者来自该亚型同一种毒株感染,CRF07_BC、CRF01_AE和B亚型毒株是当前四川省MSM人群HIV-1的主要流行毒株。  相似文献   

3.
目的了解献血人群中艾滋病病毒(HIV)感染者的病毒亚型分布及流行毒株特征,为无偿献血者的招募、健康征询提供科学数据。方法对来自全国13个省市献血人群中的HIV阳性样本进行分子流行病学调查。对pol区基因进行扩增和测序。基于系统进化分析技术构建贝叶斯(BI)和最大似然(ML)系统树,确定毒株亚型,并针对亚型地理分布进行统计分析。结果来自全国13个省市的115例HIV阳性献血者标本中,成功扩增并获得pol区基因序列89例,发现HIV-1基因亚型9种,其中,亚型CRF01_AE和CRF07_BC所占比例最高,分别占46.1%(41/89)和37.1%(33/89);亚型CRF08_BC、B分别占2.2%(2/89)、5.6%(5/89);其他亚型CRF65_CPX、CRF55_01B、CRF59_01B、CRF68_01B、CRF62_BC各占1.1%(1/89)。系统进化进一步分析显示,所占比例最高的是CRF01_AE中的Cluster 4和Cluster 5亚簇以及CRF07_BC中的msm亚簇,所占比例分别达到23.6%(21/89)、21.3%(19/89)和33.7%(30/89),这3个均是全国男男性行为者(MSM)传播途径中的主要流行亚簇。结论全国献血途径检测出的HIV-1基因型呈现复杂的多样性特征,尤其在MSM传播HIV感染者中占绝对优势毒株的CRF01_AE(C4和C5簇)和CRF07_BC-msm簇也是本次在献血人群中发现的主要流行毒株。  相似文献   

4.
5.
目的了解上海市浦东新区近年来男男性行为人群(MSM)中,未经抗病毒治疗的艾滋病病毒1型(HIV-1)抗体阳性者,其HIV-1亚型分布和原发性耐药特征,监测该地区MSM HIV-1毒株的最新流行情况,为当前该区制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法选取2011年至2014年4月份期间确认的MSM HIV-1感染者血浆标本70份,应用巢式反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增pol基因,并对扩增产物进行测序,用Mega 6.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据系统进化树分析确定基因亚型及其特征以及耐药情况。结果获62份pol区基因全序列片段,得到CRF01-AE、CRF07_BC、01B(CRF01_AE与B重组亚型)和B四种亚型。分布显示:CRF01-AE占58.06%(36/62),CRF07_BC占30.65%(19/62),01B占6.45%(4/62),B占4.84%(3/62)。离散率显示:CRF01-AE亚型的平均离散率为(2.1±0.2)%(n=36),CRF07-BC亚型的平均离散率也为(2.1±0.2)%(n=19),B亚型的平均离散率为(5.7±0.6)%(n=3),01B重组亚型的平均离散率为(6.3±.0.6)%(n=4)。耐药特征:62例中有7例分别产生了对核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)及蛋白酶类抑制剂(PIs)的耐药突变,其中2例产生了低度耐药,4例具有潜在的耐药特点。结论上海市浦东新区2011年至2014年4月间,MSM新确证HIV-1感染者中,基因亚型呈多元化趋势,以CRF01-AE和CRF07-BC为主,并已形成了浦东新区范围内的局部流行趋势,新的01B重组毒株已在浦东新区开始出现;HIV-1原发耐药株的传播尚处于低度流行水平,密切监视其流行趋势已显十分必要。  相似文献   

6.
目的了解浦东新区艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的病毒亚型分布特征,为该区制定针对性的艾滋病防治策略和措施提供科学依据。方法采用分层抽样的方法选取浦东新区242例HIV-1感染者的血浆标本,应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,将PCR产物测序分析,确定基因亚型,并结合现场流行病学调查资料进行分析。结果获得186份pol区基因片段,HIV-1亚型分布显示,CRF01_AE比例最大,为52.69%,其次为CRF07_BC,31.72%,B,5.91%。CRF08_BC未在同性性传播者中发现,在异性性传播者中占5.36%。CRF01_AE与B亚型重组体在25岁以下年龄组和外地户籍感染者中相对较高,分别为12.20%和6.25%。在同性性传播者中发现2例CRF01_AE和CRF07_BC的重组体。结论浦东新区HIV感染者HIV-1型流行株呈现多样化的特点,且分布与年龄、户籍、文化程度以及传播途径相关。  相似文献   

7.
目的了解四川省艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)流行毒株的亚型、人群和地域分布。方法通过抽样调查的方法,采集2014年7-9月新报告的、未经抗病毒治疗的HIV-1感染者的血样400份,采用巢式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 pol和gag基因区,对获得的核酸序列进行系统进化分析。比较不同亚型毒株感染者首次随访的CD4^+T淋巴细胞(简称CD4细胞)水平。结果四川省HIV-1流行毒株的亚型有:CRF07_BC(58.22%)、CRF01_AE(29.50%)、CRF08_BC(4.96%)、CRF85_BC(3.39%)、B(2.09%)、C(0.78%)、CRF02_AG(0.52%),以及CRF07_BC/CRF01_AE重组型(0.52%)。毒株分布显示出明显的地域特征。CRF01_AE感染者的基线CD4细胞水平更低。结论以C亚型为骨架的BC重组亚型,在四川省表现出明显的流行优势。提示应结合流行毒株有针对性地提供艾滋病防治工作建议。  相似文献   

8.
目的了解河北省不同途径感染人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型分布特点。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,反转录后采用套式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,进行系统进化树分析,确定基因型。结果对154份HIV-1感染者的样品进行扩增,得到了146份样品的HIV-1基因片段。发现6种HIV-1亚型和重组型,其中B’亚型61例(41.8%),CRF01_AE 59例(40.4%),CRF07_BC 16例(11.0%),CRF08_BC 6例(4.1%),C亚型和B01重组株各2例(1.4%)。血液途径传播为B’亚型,男男性行为传播以CRF01_AE和B’亚型为主。结论河北省不同途径感染人群HIV-1亚型分布具有明显的人群特征。血液途径传播者为单一B’亚型,性传播人群中亚型分布较广。  相似文献   

9.
目的探讨影响男男性行为者(MSM)中艾滋病病毒(HIV)感染者病程进展的因素。方法采用回顾性队列研究,选择2008年1月至2015年12月确诊感染HIV且未治疗的378例MSM中HIV感染者为研究对象,收集血清样本,巢式聚合酶链反应(PCR)扩增HIV-1 pol区基因片段,确定HIV亚型,流式细胞仪检测法测定CD4~+T淋巴细胞水平,采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,对比分析主要亚型CRF07_BC及CRF01_AE感染者CD4~+T淋巴细胞计数从 500个/mm~3下降到350个/mm~3以下的天数,多因素生存分析采用COX比例风险模型。结果 378例MSM中HIV感染者年龄(29.10±0.38)岁,未婚者占81.75%,汉族占96.30%,HIV亚型主要为CRF07_BC(41.53%)、CRF01_AE(34.13%)。中位生存时间为CRF07_BC 2 594 d [95%可信区间(CI):1 357.91~3 830.09]、CRF01_AE 1 393 d(95%CI:1 204.84~1 581.16),生存时间比较差异有统计学意义(P 0.05)。COX结果显示HIV-1亚型(P 0.01)及职业(P=0.043)是影响HIV感染者病程进展的因素,CRF01_AE [风险比(RR)=2.436,95%CI:1.475~4.022]亚型及从事家政及服务业(RR=2.203,95%CI:1.026~4.729)是促进感染者免疫抑制的危险因素。结论近十年广州市MSM中HIV感染者HIV亚型主要为CRF07_BC、CRF01_AE,多个亚型共存,CRF01_AE亚型感染者、从事家政及服务业工作者更容易进展为艾滋病。  相似文献   

10.
目的研究2007-2009年男男性行为人群(MSM)艾滋病病毒-1型(HIV-1)的基因亚型,以监测MSM人群HIV病毒株的最新流行情况。方法采集95例MSM急性HIV-1感染者的外周全血,从外周全血浓缩白细胞中提取脱氧核糖核酸(DNA),用巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)对HIV-1的前病毒DNA进行扩增,然后检测并分析PCR扩增产物的核苷酸序列,确定病毒的基因亚型。结果 95例感染者平均年龄为(35.02±9.15)岁,其中20~50岁的青壮年45例(94.74%),未婚51例(53.68%),大专或大学及以上文化程度者30例(占31.58%)。感染者中共发现CRF01_AE亚型、B亚型、BC重组亚型(包括CRF07_BC和CRF08_BC)及C亚型4种亚型。其中CRF01_AE重组亚型56例(占58.95%),B亚型28例(占29.47%),BC重组亚型10例(占10.53%),C亚型1例(1.05%)。结论 MSM人群急性HIV-1感染者年轻化,文化程度普遍偏低。小样本流行病学调查显示,急性HIV-1感染者中有CRF01_AE亚型、B亚型、BC重组亚型及C亚型4种亚型病毒株流行,CRF01_AE亚型为MSM人群的主要亚型。  相似文献   

11.
目的通过艾滋病病毒(HIV)毒株基因序列构建北京男男性行为者(MSM)传播关系的分子网络,探索HIV毒株在该人群中的传播特征。方法以2013年在北京招募的MSM感染者为调查对象,收集问卷并采集全血。使用比对好的pol基因区序列构建进化树判定亚型。计算两两序列间的基因距离,确定鉴别能力最高的基因距离阈值,最终构建传播网络。结果共获得pol基因区序列405条,主要的亚型为CRF01_AE(230,56.8%)和CRF07_BC(116,28.6%),其他亚型分别为B(40,9.9%)、CRF55_01B(1.2%)、C(1.0%)、CRF15_01B(0.2%)。拟合曲线,观测一系列阈值下传播簇、连接总数的变化,得到1.25%为该人群的最佳基因距离阈值。在此条件下,有233条序列(57.5%)进入传播网络。多因素回归分析显示,年龄25岁、在北京居住时间≥4年、过去3个月与男性有无保护被动肛交及亚型为CRF07_BC的感染者,入网率显著偏高。秩和检验表明,网络内CRF07_BC感染者的关联程度显著高于其他亚型的感染者。结论入网率高、关联程度高的人群具有更高的传播风险,应该有针对性的加强对具有高风险特征的人群的教育和干预。  相似文献   

12.
目的 了解北京市2005-2011年间男男性行为(MSM)人群HIV-1的流行亚型分布及其变化趋势.方法 2005-2006、2007、2008、2009和2010-2011年通过5次横断面调查,对北京市朝阳区MSM人群进行HIV-1抗体阳性筛查,采集阳性者的外周血,提取RNA,通过反转录及套式PCR扩增HIV-1的gag基因,并采用系统进化树来确定其亚型.结果 系统进化树分析发现,MSM人群中HIV-1的主要流行亚型为欧美B、CRF01_AE和CRF07_BC亚型.从2008年开始发现了CRF15_01B亚型,且2005-2011年此类人群中HIV-1主要流行亚型中欧美B亚型所占比例显著下降,而CRF01_AE亚型所占比例显著上升,CRF07_BC亚型所占比例逐年增加.结论 2005-2011年间北京市MSM人群中,HIV-1的流行亚型逐渐呈多元性,出现新的重组亚型,且主要亚型的流行趋势已发生改变.  相似文献   

13.
目的 分析2019-2021年重庆市MSM新发现472例HIV-1感染者分子网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法 收集重庆市疾病预防控制中心性病门诊2019-2021年新报告的MSM感染者血浆样本,扩增pol区基因并测序,构建该人群HIV-1传播分子网络,采用χ2检验进行成簇相关因素分析。结果从580例感染者中,共获得pol区基因序列472条。472例感染者分别属于9种基因亚型,主要亚型为CRF07_BC(344,72.88%)和CRF01_AE(96,20.34%),其他亚型包括CRF55_01B(18,3.81%)、B(4,0.85%)、CRF08_BC(6,1.27%)等。在基因距离0.8%时,共产生32个分子簇,入网率27.33%(129/472),以CRF07_BC入网最高,占82.95%(107/129)。结论MSM中新报告HIV-1感染者病毒基因呈现多样性,并存在传播活跃者。应对传播活跃者实施精准干预,以降低该人群的新发感染率。  相似文献   

14.
目的了解河北省石家庄市2015年新确诊1型艾滋病病毒(HIV-1)流行毒株的亚型分布和原发性耐药情况。方法 2015年石家庄市新报告HIV-1感染者433例,共收集到感染者血浆样本335份,经反转录巢式荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增,最终获得311份样本的HIV-1 pol基因片段并测序。对获得的核酸序列用Neighbor.Joining Tree方法构建进化树,以Boot strap值〉70%来判定HIV-1的基因亚型。同时将序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药基因型分析。结果 311例HIV-1感染者以男性(93.9%)、本市户籍(83.0%)、汉族(96.1%)为主。性接触是最主要的感染途径(98.1%),其中同性性传播占77.5%。311例pol基因序列片段亚型分布显示,CRF01_AE占51.4%(160例),CRF07_BC为28.6%(89例),B亚型为13.2%(41例),未定型CRF01_B为4.2%(13例),CRF08_BC为1.3%(4例),CRF55_01B为0.6%(2例),CRF59_01B为0.3%(1例),CRF65_cpx为0.3%(1例)和CRF01_AE/B为4.2%(13例)。CRF01_AE、CRF07_BC和B是主要的亚型。HIV-1基因亚型分布在性别之间(χ~2=14.039,P=0.005)、不同的职业类型之间(χ~2=21.716,P=0.041)以及不同的传播途径之间(χ~2=20.971,P=0.028)有统计学差异。311例中,14例感染者具有耐药位点,原发耐药率为4.5%,其中蛋白酶抑制剂和核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率均为1.6%(各5例),非核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率为1.3%(4例)。结论石家庄市新报告的HIV-1感染者中,传播途径以同性性接触为主,病毒基因亚型以CRF01_AE为主,但具有多样化特点。原发耐药率为4.5%,处于低水平状态。  相似文献   

15.
目的了解北京男男性行为者(MSM)1型艾滋病病毒(HIV-1)基因多样性情况及影响因素。方法对北京HIV阳性MSM采用横断面调查,通过建立的基于Illumina平台的二代测序技术(NGS),综合两个部分pol基因区片段和一个env基因区片段的结果进行亚型和系统进化分析。结果获得NGS结果的376例样本中,单一亚型样本313例(占83.2%),重组率和共感染率分别为8.2%(31例)和8.5%(32例)。313例单一亚型样本中CRF01_AE亚型188例(60.1%),CRF07_BC亚型86例(27.5%),B亚型32例(10.2%),C亚型3例(1.0%),CRF55_01B亚型4例(1.3%)。376例样本中,亚型内重组率为1.9%(7例),亚型间重组率为6.4%(24例);亚型内共感染率为1.3%(5例),亚型间共感染率为7.2%(27例)。多因素Logistic回归分析结果显示,与HIV-1基因多样性相关的影响因素是无工作(P=0.03),过去3个月使用新型毒品(P=0.03),和通过互联网寻找男性性伴侣的方式(P=0.01)。结论北京MSM的HIV感染者中有较高的HIV-1基因多样性,反映了HIV阳性MSM复杂的高危行为。  相似文献   

16.
目的 了解昆明市MSM HIV-1感染者中整合酶抑制剂(INSTIs)耐药流行情况及分子网络特征。方法收集2019-2020年昆明市新报告HIV-1抗体阳性的MSM血浆样本202份,提取病毒RNA,通过反转录和巢式聚合酶链式反应对编码整合酶的基因片段进行扩增和测序,并分析序列的基因型、基因距离、整合酶抑制剂的耐药突变位点,构建分子网络。结果 在获得的163份样品的整合酶区基因片段中,主要的基因型为C亚型(50.9%,83/163)和CRF01_AE(27.6%,45/163),其他包括URF(12.9%,21/163),CRF55_01B(5.5%,9/163)和B亚型(3.1%,5/163)。其中B亚型的基因距离最大,其次为CRF01_AE,而C亚型和CRF55_01B小于前两者。在研究对象中检出1例样品携带INSTIs的辅助耐药突变位点G163K,耐药位点检出率为0.6%(1/163)。共有60条序列进入网络,≤20岁年龄组的感染者更容易成簇。结论 昆明MSM中INSTIs的耐药率仍处于较低的流行水平。低年龄组的MSM更活跃,在干预措施的覆盖和有效实施上还有待进一步提高。  相似文献   

17.
目的对西双版纳傣族自治州的艾滋病病毒(HIV-1)感染者进行流行病学分析、病毒亚型的检测和耐药性突变的分析,为疫情控制提供依据。方法对2009年7月至2011年6月的348例HIV感染者进行流行病学调查及病毒载量和免疫学检测,并从其中随机抽取50例样本进行部分pol基因序列的测定,据此进行基因型别和耐药性突变的分析。结果 348例HIV感染者,性传播占91.4%;以青壮年感染者较多,其中20~49岁占84.4%;确诊时感染者CD4+T细胞绝对数为(381.0±233.6)个/mm3,病毒载量为(3.81±0.98)log10拷贝数/mL。对50例感染者pol基因测序发现,以欧美B亚型(占60.0%)和CRF08_BC亚型(占20.0%)、CRF01_AE亚型(占14.0%)最为多见。仅1例感染者(CRF08_BC型)检出了M461M蛋白酶抑制剂主要耐药性突变。结论西双版纳傣族自治州的HIV-1新发感染人数仍在快速增加,以性传播为主的趋势进一步明显;有可能发生了欧美B亚型的新流行;而耐药性突变株的流行不明显。  相似文献   

18.
目的分析黑龙江省HIV-1感染者的毒株亚型构成、分子簇形成和耐药株流行情况。方法对2018年1-6月期间新诊断的、尚未进行抗病毒治疗的黑龙江省HIV-1感染者,采集血样、提取病毒RNA,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)/巢式PCR方法扩增HIV-1 pol基因,测序后进行生物信息学分析。结果获得157例HIV-1样本的pol基因序列,检测出7种毒株亚型,以CRF01_AE占比最高,为61.8%(97例),其次为CRF07_BC,占20.4%(32例);21条基因序列形成了10个可能具有传播关系的分子簇,成簇率13.4%;总体耐药率10.2%(16/157),其中NNRTI、NRTI、PI的耐药率分别为5.1%(8/157)、1.3%(2/157)和3.8%(6/157)。结论黑龙江省HIV-1的毒株亚型以CRF01_AE亚型4簇和5簇为主,独特重组毒株URF_01B及A1亚型成簇传播。对治疗前耐药问题应给予密切关注。  相似文献   

19.
男男性行为人群(MSM)仍是我国HIV感染的高危人群,欧美B亚型、CRF01_AE和CRF07_BC亚型是其人群中流行的主要病毒亚型。近年来,MSM中HIV-1亚型的流行趋势发生改变,欧美B亚型所占比例显著下降,CRF01_AE和CRF07_BC亚型所占比例则明显增加,并且出现新的重组亚型。运用分子生物学技术分析我国男男性行为人群中HIV-1病毒亚型分布和变化趋势,可有助于阐明MSM人群中HIV-1的流行规律,追踪传染来源和确定相关危险因素,并为MSM人群精准干预提供重要的参考依据。  相似文献   

20.
目的了解广州市男男性行为人群(MSM)中,人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型流行状况和基因变异特征。方法从2006~2007年广州市发现的、全部19份经男男性传播感染的HIV-1阳性血清样本,应用套式聚合酶链式反应(Nested—PCR)分别扩增gag和fitly区基因,并测定、分析序列。结果被成功扩增的有17份样本,获得13份env基因序列和17份gag基因序列。经系统进化树分析,11份(64.71%)为CRF01_AE,2份(11.76%)为CRF07_BC,4份(23.53%)为B。各亚型组内基因离散率:在env区,CRF01_AE为(8.27±0.93),CRF07_BC为(11.04±1.72),B为(16.65±1.78);在gag区,CRF01_AE为(5.36±0.68),CRF07_BC为(4.29±1.14),B为(11.75±1.35)。V3环顶端四肽分析显示:8份CRF01_AE和2份CRF07_BC V3环顶端四肽均为GPGQ;3份B亚型中2份为GPGR,1份为GWGR。根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况,结果显示:所有样本均被预测使用CCR5辅助受体。结论广州市MSM人群HIV-1感染者中,至少存在CRF01_AE、CRF07_BC 2种重组亚型和B亚型的流行,且大部分流行株可能为使用CCR5辅助受体的巨嗜细胞嗜性/NSI毒株。  相似文献   

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