INTS10遗传变异及基因-环境交互作用对HBV相关肝癌病理特征的影响

目的 探讨INTS10遗传变异及基因-环境交互作用对HBV相关肝癌病理特征的影响。方法 募集705例新发HBV相关肝癌病例，对INTS10的4个遗传变异（rs4268139、rs4599828、rs7822495和rs7000921）进行检测。采用多因素logistic回归模型分析遗传变异与肿瘤淋巴结转移（tumor node metastasis, TNM）分期、远处转移的关联；应用相乘交互项和“Delta”法探讨基因-环境交互作用。结果 显性模型下，以rs4268139 CC基因型为参照，CG+GG基因型可增加病例首诊时已为晚期的风险（OR=1.64，95%CI=1.08~2.50）。rs4599828 TT基因型的病例首诊时出现远处转移的危险高于CC+CT基因型携带者（OR=2.04，95%CI=1.08~3.85）。叉生分析中，与有运动的rs4268139 CC基因型携带者相比，携带CG+GG基因型且缺乏运动的病例晚期和远处转移风险增高（OR=3.01，95%CI=1.62~5.58；OR=2.19，95%CI=1.12~4.26）。类似，rs4599828 CT+TT基因型且无运动共同增加病例晚期风险（OR=2.22，95%CI=1.34~3.68）。但未观察到有统计学意义的交互作用。结论 INST10 rs4268139 和rs4599828遗传变异可能单独以及联合缺乏运动影响HBV相关肝癌的病理特征。     

CD46 rs1970530遗传变异影响肺腺癌易感性和预后

目的 探讨CD46 rs1970530变异与肺腺癌易感性和预后的关系。方法 该病例对照研究包括400例肺腺癌患者和600例正常对照。使用χ2检验比较病例组和对照组中性别、年龄和吸烟状况之间的分布差异。使用PCR -限制性片段长度多态性分析对CD46 rs1970530遗传变异进行基因分型。使用非条件logistic回归分析CD46 rs1970530变异与肺腺癌易感性的关系。使用Kaplan - Meier生存曲线、Log - Rank检验和Cox多因素回归模型评估CD46 rs1970530变异各基因型患者间的预后差异。通过UALCAN数据库分析CD46基因在肺腺癌组织及其癌旁正常组织中的表达差异,使用Kaplan - Meier Plotter数据库分析CD46表达对肺腺癌患者总体生存时间的影响。结果 CD46基因在肺腺癌组织中的表达显著高于正常组织,且CD46高表达肺腺癌患者的总体生存时间显著高于CD46低表达患者。与CD46 rs1970530 AA基因型携带者相比,至少携带一个G等位基因的肺腺癌患者的发病风险显著增加（OR = 1.52,95%CI:1.10～2.09）。不同性别和年龄的中位生存时间不存在统计学差异（P＞0.05）。在肺腺癌患者中,不吸烟者的中位生存时间（48个月）显著高于吸烟者（19个月）（P = 0.001）。携带CD46 rs1970530 GG基因型的肺腺癌患者的中位生存时间（10个月）显著低于AA基因型（35个月）和AG基因型患者（56个月）（P = 0.002）。多因素COX回归分析显示,CD46 rs1970530GG基因型是肺腺癌患者预后的高危因素（HR = 5.15,95%CI:1.81～14.66）。结论 CD46 rs1970530变异可以增加肺腺癌的发病风险,并提示预后不良。     

IL-6启动子区域遗传变异rs1800796与原发性肝癌预后的关联研究

目的探讨白介素6 (IL-6)基因启动子区域遗传变异rs1800796与原发性肝癌预后的关系。方法采用队列研究,对510例原发性肝癌患者进行随访。采用ABI 7900HT的Taqman基因分型技术对遗传变异位点进行检测;采用Kaplan-Meier法和log-rank检验用来估计和比较不同基因型的生存曲线,应用Cox回归分析rs1800796对原发性肝癌预后的影响。采用Breslow-Day法对基因-环境交互作用的一致性检验进行定性分析。结果遗传变异位点rs1800796 GG基因型携带者发生肝癌死亡的风险显著高于CC基因型携带者(HR=1.65, 95%CI:1.09～2.51)。每增加一个G等位基因,携带者发生肝癌死亡的风险增加22%(HR=1.22; 95%CI:1.01～1.46),且IL-6 rs1800796与发病年龄、肿瘤分期之间存在显著的交互作用。结论 IL-6基因启动子区域的遗传变异位点rs1800796与原发性肝癌患者的死亡风险有显著关联。     

STAT4遗传变异与原发性肝癌病理特征的关联

  目的  探讨STAT4遗传变异及其与运动的交互作用对原发性肝癌患者病理特征的影响。  方法  在601例新发肝癌患者中,采用多因素Logistic回归分析模型分析rs7574865、rs897200、rs1031507与肿瘤淋巴结转移（tumor node metastasis,TNM）分期、门脉癌栓的关联。应用相乘交互项和"Delta"法分别评价相乘和相加交互作用。  结果  在显性模型下,rs897200变异与患者首诊时晚期的风险存在临界统计学关联（调整OR=0.64,95%CI:0.41~1.01,P=0.057）。携带rs1031507 CC+AC基因型的患者晚期风险低于AA基因型患者（调整OR=0.63,95%CI:0.40~0.99,P=0.046）。叉生分析中,与携带rs897200 CT+CC基因型且有运动的患者相比,缺乏运动的TT基因型患者晚期风险增高（OR=3.71,95%CI:1.97~6.98,P < 0.001）。类似,rs1031507AA基因型与缺乏运动共同升高患者的晚期风险（OR=3.78,95%CI:2.01~7.13,P < 0.001）。但未观察到rs897200、rs1031507与运动存在影响肝癌分期的统计学交互作用。  结论  STAT4 rs897200和rs1031507遗传变异的独立效应及与运动的联合效应影响肝癌患者首诊时的临床分期。     

IL-17、TLR4、P2X7基因多态与慢性阻塞性肺疾病的关联研究

目的 探讨炎症相关基因白细胞介素17（interleukin-17,IL-17）、Toll样受体4（toll-like receptors 4,TLR4）、嘌呤受体（purinergic receptor P2X 7,P2X7）遗传多态与慢性阻塞性肺疾病（chronic obstructive pulmonary disease,COPD）易感性的关系。方法 采用病例对照研究设计,病例组为2015年6月~2016年5月南通市第三人民医院收集的COPD确诊患者,共152例。对照组来自参加健康体检的居民,按年龄和性别与病例进行频数匹配,共201例。基因分型采用TaqMan分型技术,关联强度采用OR值及95%CI值表示。结果 采用Bonferroni校正后,IL-17基因rs2275913、rs763780;TLR4基因rs10759932、rs2737190;P2X7基因rs1718119遗传多态与COPD的易感性关联均有统计学意义（均有P<0.05）。rs2275913A等位基因（OR=0.62,95%CI:0.46~0.86,P=0.003）;rs763780C等位基因（OR=1.96,95%CI:1.29~2.98,P=0.001）;rs10759932C等位基因（OR=0.49,95%CI:0.34~0.73,P<0.001）;rs2737190G等位基因（OR=0.51,95%CI:0.37~0.71,P<0.001）。结论 IL-17、TLR4、P2X7基因多态影响COPD遗传易感性。     

miR-34b/c启动子区多态性与原发性肝细胞肝癌易感性的关联研究

目的探讨miR-34b/c rs4938723 T>C与中国人群原发性肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)易感性的关系。方法采用病例对照研究设计,选取501例原发性肝细胞肝癌病例和548例正常对照。选取miR-34b/c rs4938723 T>C为研究位点,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法进行多态性检测,应用Logistic回归计算OR值及95%CI,比较不同基因型与HCC发病风险的关系。结果在调整年龄、性别、吸烟、饮酒因素后,携带rs4938723 TC/CC基因型者与携带rs4938723 TT基因型个体相比,发生肝癌的风险增加了40%(调整OR=1.40,95%CI=1.10～1.80)。进一步分析显示在原发性肝细胞肝癌的发生中rs4938723基因型与饮酒存在交互作用(相乘交互作用P=0.049,相加交互作用P=0.012)。结论本研究表明位于miR-34b/c启动子区的rs4938723 T>C多态性可能影响中国人群原发性肝细胞肝癌发病风险。     

人类白细胞抗原DRA基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联研究

目的 探讨人类白细胞抗原DRA基因（human leukocyte antigen DRA,HLA-DRA）单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与肝细胞癌（Hepatocellular carcinoma,HCC）易感性的关联。方法 采用以医院为来源的非匹配病例对照研究方法,纳入365例HCC患者作为病例组以及365例非HCC患者作为对照组。利用问卷收集研究对象的一般人口学特征和相关暴露因素资料,并采用TaqMan-MGB探针定量PCR法对rs3135395 G>T、rs3135338 T>C和rs2395178 G>C进行基因型检测。应用非条件logistic回归模型计算SNP位点各基因型与HCC易感性的比值比（odds ratio,OR）及95%可信区间（confidence interval,CI）。结果 携带rs3135338 TC基因型和显性模型（TC+CC）的个体HCC易感性较TT基因型携带者显著降低（OR=0.47,95% CI=0.25~0.91,P=0.024;OR=0.53,95% CI=0.28~0.95,P=0.045）。与rs2395178 GG基因型携带者相比,GC基因型和显性模型（GC+CC）携带者HCC易感性显著降低（OR=0.41,95% CI=0.29~0.57,P<0.001;OR=0.58,95% CI=0.41~0.81,P=0.002）。结论 HLA-DRA基因rs3135338 T>C和rs2395178 G>C与HCC易感性相关,可为揭示免疫相关基因遗传多态性对HCC发生的作用提供一定参考。     

硒蛋白单核苷酸多态性与幽门螺旋杆菌感染的关联性

目的 探讨硒蛋白S（selenoprotein S,SelS）rs34713741位点、硒蛋白P（selenoprotein P,Sepp1）rs7579位点单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）与幽门螺旋杆菌（Helicobacter pylori,Hp）感染的关联性。方法 采用等位基因特异性PCR（allele - specific PCR,AS - PCR）技术检测195例Hp感染者和200例对照者SelS（rs34713741）、Sepp1（rs7579）SNPs,统计分析其与Hp感染的关系。结果 rs34713741位点SelS基因SNP与Hp感染存在关联（P＜0.05)。与C等位基因携带者相比,携带T等位基因者感染Hp风险增高1.578倍（OR = 1.578,95%CI:1.191～2.091）;与CC基因型者相比,CT和TT基因型者感染Hp风险均增高（OR = 1.890,95%CI:1.134～3.148;OR = 1.807,95%CI:1.140～2.864）;rs7579位点Sepp1基因SNP与Hp感染无关联（P＞0.05)。结论 SelS基因rs34713741位点T等位基因提高了Hp感染风险,是Hp感染遗传易感基因。     

硒蛋白S基因多态性与布鲁氏菌病遗传易感性的关联性

目的 检测内蒙古包头地区布鲁氏菌病患者硒蛋白S（selenoprotein S,SelS）基因rs28665122、rs34713741位点基因型和等位基因分布频率,探讨SelS基因多态性与本地区布鲁氏菌病患者遗传易感性的关联性。方法 采用一种快速点突变检测技术-等位基因特异性PCR（allele - specific PCR,AS - PCR）技术检测32例慢性期布鲁氏菌病患者和30例健康对照者SelS基因（rs28665122、rs34713741）基因型和等位基因分布频率。结果 布鲁氏菌病患者组与对照组SelS基因rs28665122位点GG、GA、AA基因型及G、A等位基因频率比较无统计学差异（χ2分别为0.203,0.852,均P＞0.05 ）;rs34713741位点CT、CC、TT基因型和C、T等位基因分布频率比较存在统计学差异（χ2分别为9.209,6.580,均P＜0.05）,与C等位基因相比,携带T等位基因者感染布鲁氏菌风险增高3.194倍（OR = 3.194,95%CI:1.489～6.847）,与CC基因型相比,CT和TT基因型者感染布鲁氏菌风险均增高（OR = 3.273,95%CI:0.876～12.223;OR = 4.364,95%CI:1.217～15.641）。结论 本地区布鲁氏菌病与SelS基因rs34713741位点基因多态性有关联,T等位基因可能是其风险易感基因。     

IKBKAP基因多态性与原发性肺癌易感性的病例对照研究

目的 探索IKBKAP基因多态性及单体型与肺癌易感性的关联。方法 采用病例对照研究,使用飞行时间质谱法对IKBKAP SNPs进行基因分型。运用非条件Logistic回归分析探究SNPs与肺癌易感性的关联。应用R软件运行Haplo.stats程序包,分析单体型与原发性肺癌的关联。结果 携带rs2230793 CC基因型者发生原发性肺癌的危险是AA+AC携带者的1.386倍（95%CI:1.007~1.907）。经一般人口学特征校正后,rs1538660 TT基因型者发生原发性肺癌的危险是携带CC基因型的0.713倍（95%CI:0.515~0.986）;携带rs1538660 TT基因型发生原发性肺癌的危险是携带CC+CT基因型的0.724倍（95%CI:0.530~0.988）。rs1538660、rs3204145 TA单体型携带者的原发性肺癌风险是CT携带者的0.862倍（95%CI:0.753~0.987）。结论 IKBKAP基因多态性与原发性肺癌的发生有关。     

脂联素rs266729多态性和肥胖在多囊卵巢综合征中交互作用研究

目的 探讨脂联素rs266729多态性与多囊卵巢综合征(PCOS)关联性及其与肥胖交互作用.方法 采用多聚酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法分析2014年2月至2015年8月住院的120例PCOS患者和同期140例体检正常对照者的rs266729基因型.非条件Logistic分析各基因型与发病易感性的关系以及与肥胖的交互作用.结果 携带C(CC/CT)基因个体患病风险较非C基因携带者(TT)风险明显增加1.55倍(OR=1.55,95%CI:1.41~3.71,P=0.00;校正OR=1.61,95%CI:1.51~4.01,P=0.00);非条件Logistic分析表明认携带CC/CT基因型肥胖个体PCOS罹患风险是携带TT基因非肥胖个体的3.88倍(OR=3.88,95%CI:2.72~5.76,P=0.00;RERI=2.51,95%CI:1.22~3.80;AP=0.54,95%CI:0.34~0.74;S=1.56,95%CI:1.12~2.83).结论 脂联素rs266729多态性增加多囊卵巢综合症罹患风险,且与肥胖存在多囊卵巢综合症发病中存在协同效应.     

Regulome - SNP: shc1 rs11264233与延边地区原发性肝癌风险性的研究

目的 探讨shc1 rs11264233与延边地区肝癌风险性的关系。方法 选取延边地区599名肝癌患者和599名健康对照组人群为研究对象。采用PCR - RFLP方法检测基因型及等位基因分布频率。二元logistic 回归模型分析shc1 rs11264233位点多态性与肝癌遗传易感性的关系。结果 shc1 rs11264233位点存在G和A两种等位基因,GG、GA和AA基因型。shc1 rs11264233位点基因型符合哈迪-温伯格遗传平衡规律。共显性模型中与携带GG基因型的个体相比携带AA基因型的个体更容易患PHC（调整OR = 1.512,95% CI:1.087～2.102,P = 0.014）,隐性模型中AA基因型PHC组风险度显著高于GG和GA组合型中（调整 OR = 1.461,95% CI:1.101～1.940,P = 0.009)。结论 shc1 rs11264233位点单核苷酸多态性与延边地区肝癌风险有明显相关性。     

Keap1 rs11668429和 AHSA2 rs728825与延边地区原发性肝癌发病风险的研究

目的 探讨Keap1 rs11668429和AHSA2rs728825与延边地区肝癌易感性的关系.方法 选取延边地区192名肝癌患者为病例组、190名健康人为对照组进行研究.采用PCR-RFLP方法检测基因型及基因频率.采用二元logistic回归模型分析Keap1 rs11668429位点和AHSA2rs728825...     

谷胱甘肽-S-转移酶基因多态与原发型肝癌的Meta分析

目的：探索谷胱甘肽-S-转移酶（GSTM1、GSTT1、GSTP1）基因多态与原发型肝癌遗传易患性的关系。方法：采用Meta分析方法对国内外1994--2004年关于谷胱甘肽-S-转移酶基因多态与原发型肝癌易患性的研究文献进行综合定量分析。结果：共收集相关文献18篇，累计病例1407例，对照2044例。GSTM1空白基因型可能与原发性肝癌有关，OR值为1．40（95％CI：1．22-1．62）；GSTM1和GSTT1中至少有一个空白基因型的OR值为2．05（95CI：％1．14-3．67），亦提示可能与原发型肝癌的遗传易患性有关；而GSTT1空白基因型、GSTP1突变基因型未显示与原发型肝癌相关，合并的OR值分别为1．13（95％CI：0．77-1．65）和0．68（95％CI：0．47～0．99）。结论：谷胱甘肽-S-转移酶基因多态与原发性肝癌遗传易患性的关系各有不同，GSTM1单项空白基因和GSTM1、GSTT1混合空白基因与原发性肝癌有统计学联系，可能是原发性肝癌的易患因素；GSTT1空白基因型与原发性肝癌未显示有统计学联系，而GSTP1的突变基因型可能是原发性肝癌的保护因素。     

Toll样受体2及Toll样受体9基因多态性与胃癌易感性的关系

目的 探讨Toll样受体2(Toll-like receptor 2,TLR2)及TLR9基因多态性与胃癌易感性的关系.方法 以山东省临朐县胃癌高发现场人群为基础,选取248例胃癌患者,采用年龄、性别匹配的方法在同一地区按分层随机抽样方法选取496例浅表性胃炎或轻度萎缩性胃炎患者为对照,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法检测TLR2基因rs3804099位点及TLR9基因rs187084位点基因型.采用多因素logistic回归模型并调整年龄、性别、幽门螺杆菌感染及吸烟因素后,计算OR值(95%CI).结果 TLR2基因rs3804099位点TT、TC、CC基因型频率在病例组分别为53.2%(132/248)、39.9%(99/248)、6.9%(17/248),在对照组分别为43.5%(216/496)、46.6%(231/496)、9.9%(49/496),各基因型频率在两组间分布的差异有统计学意义(χ2=6.665,P=0.036).多因素logistic回归显示,以TT基因型为参照,携带TC+CC基因型者发生胃癌的风险明显降低(OR=0.68,95%CI:0.50～0.93).联合效应分析显示,以携带rs3804099位点TC+CC基因型且未感染幽门螺杆菌者为参照,携带TT基因型并感染幽门螺杆菌者发生胃癌的风险明显增加(OR=3.42,95%CI:2.16～5.42).TLR9 基因rs187084位点TT、TC、CC基因型频率在病例组分别为35.9%(89/248)、50.0%(124/248)、14.1%(35/248),在对照组分别为33.3%(165/496)、49.0%(243/496)、17.7%(88/496),各基因型频率在两组间分布的差异无统计学意义(χ2=1.684,P=0.431).结论 TLR2 基因rs3804099位点多态与胃癌发病风险密切相关.

Abstract：

Objective To explore the relationship between the polymorphisms of Toll-like receptor 2(TLR2) and TLR9 and the susceptibility to gastric cancer.Methods A population-based case-control study was conducted at Linqu county,Shandong province,China,including a total of 248 cases of gastric cancer.Another total of 496 age and sex-matched controls were randomly selected from the same cohorts.TLR2 rs3804099 and TLR9 rs187084 were detected by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism method.Odds ratios(ORs) and 95% confidence interval(CI) were computed from logistic regression models after adjusting for age,sex,Helicobacter pylori(H.pylori) infection and smoking status.Results The frequencies of TT,TC and CC genotype on TLR2 rs3804099 in control group were 43.5%(216/496),46.6%(231/496) and 9.9%(49/496),respectively; whereas those in case group were 53.2%(132/248),39.9%(99/248) and 6.9%(17/248),respectively.Significant differences in the frequencies of TLR2 rs3804099 were found between case and control groups(χ2=6.665,P=0.036).It was found that compared with the TT genotype,TC+CC genotype carriers obviously less susceptible to gastric cancer(OR=0.68,95%CI:0.50-0.93).Joint effects analysis indicated that the TLR2 rs3804099 TT genotype carriers and H.pylori infectors had higher susceptility to gastric cancer(OR=3.42,95%CI:2.16-5.42),compared with TC+CC genotype carriers and non-H.pylori infection group.The frequencies of TT,TC and CC genotype on TLR9 rs187084 in control group were 33.3%(165/496),49.0%(243/496) and 17.7%(88/496),respectively; whereas those in case group were 35.9%(89/248),50.0%(124/248) and 14.1%(35/248),respectively.No significant association with gastric cancer was observed for TLR9 rs187084 polymorphism(χ2=1.684,P=0.431).Conclusion Our findings indicate that TLR2 rs3804099 is closely associated with susceptibility to gastric cancer.     

PSCA基因多态性及其与胃癌发病风险的关联

目的 探究四川省汉族人群中PSCA基因多态性与胃癌发病风险之间的关联。方法 采用1∶1配对病例对照研究,纳入原发性胃癌病例及健康对照共308对。收集研究对象的人口学特征及胃癌危险因素信息,并对PSCA rs2294008及rs2976392两位点基因多态性进行检测。结果 rs2294008 CC、CT、TT基因型在全部胃癌病例组与对照组中的分布频率分别是:42.9%、46.8%、10.3%和46.8%、46.8%、6.4%;在非贲门癌病例组与对照组中的分布频率分别是:43.2%、44.3%、12.5%和44.9%、47.7%、7.4%。经条件Logistic回归分析发现CT+TT基因型人群患胃癌的风险高于CC基因型携带者（调整OR = 2.272,95%CI,1.263,4.088）。同时,CT+TT基因型人群患非贲门癌的风险亦高于CC基因型携带者（调整OR = 2.238,95%CI,1.139,4.397）。连锁分析显示,rs2976392与rs2294008位点呈完全连锁不平衡（D’=1.000,r2= 1.000）。结论 PSCA rs2294008和rs2976392基因位点多态性与全部胃癌及非贲门癌发病有关。