长链非编码RNA多态性与肿瘤遗传易感性

长链非编码RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一类长度超过200个核苷酸且不能翻译成蛋白质的RNA分子。作为一类新的调控分子,LncRNAs可通过转录、转录后和表观遗传学等多水平调控基因表达,参与人类疾病的发生发展进程。LncRNAs基因存在广泛的单核甘酸多态位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNPs),这些位点的变异可能影响LncRNAs的调控功能,从而导致个体对某些疾病包括肿瘤的遗传易感性改变。本文就国内外最新研究进展,对LncRNAs SNPs与人类恶性肿瘤发生发展的关系作一综述。     

长链非编码RNA在乳腺癌中的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,Lnc RNA)是非编码RNA的重要一员,长度超过200个核苷酸,缺乏开放的阅读框,无编码蛋白质的功能。近年来研究发现Lnc RNA的表达异常与乳腺癌的发生、发展和侵袭转移密切相关。最新研究数据显示,Lnc RNA的组织特异性表达具有区分正常和肿瘤组织甚至乳腺癌不同阶段的潜能,深入研究Lnc RNA在乳腺癌中的机制作用有望对乳腺癌的早期诊断、治疗、预后提供新的思路与方法。     

长链非编码RNA与肿瘤诊断

非编码RNA参与了多种疾病尤其是肿瘤发生发展的调控过程,是近期研究热点之一。随着高通量筛选方法的完善,越来越多的lncRNA分子被发现,并有望成为新型肿瘤诊断标志物和肿瘤治疗的靶点。近期研究提示lncRNA在肿瘤诊断和治疗方面具有良好的临床应用前景。本文介绍了lncRNA近期研究进展,相关lncRNA数据库的使用,并着重介绍了lncRNA与肿瘤诊断和预后关系研究情况。     

长链非编码RNA与乳腺癌耐药研究

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)是一类转录本长度超过200个核苷酸功能性的RNA分子,本身不具有编码蛋白质的能力,在表观遗传学水平、转录水平、转录后水平上发挥重要的调控作用。以往研究者们对lnc RNA与肿瘤发生发展的关系进行了大量的研究。目前,学者们聚焦于lnc RNA与肿瘤耐药机制的研究,本文结合近几年国内外最新报道,对lnc RNA诱导乳腺癌耐药机制进行汇总,旨在为乳腺癌治疗寻找新的靶标和诊疗思路。     

宫颈癌相关的长链非编码RNA研究进展

宫颈癌是女性常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率均位列女性肿瘤的第二位.宫颈癌发生和发展是一种多阶段调控过程,涉及多种基因.长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度＞200个核苷酸(nt)的非编码RNA(ncRNA),可表现在遗传水平、转录水平和转录后水平上,通过多种作用机制调控靶基因的表达,影响细胞信号通路,进而参...     

长链非编码RNA CRNDE检测在乳腺癌诊断中的意义

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNAs) CRNDE在乳腺癌患者血浆中的表达及临床意义。 方法 采用实时荧光定量聚合酶链反应方法检测76例乳腺癌患者组织、远端癌旁组织及血浆lncRNA CRNDE的表达情况。分析血浆中lncRNA CRNDE表达与乳腺癌的临床病理特征关系, 采用受试者工作特征曲线(ROC)评价血浆lncRNA CRNDE水平对乳腺癌的诊断效能。同时收集同期80例健康体检者为对照组检测其血浆中血浆lncRNA CRNDE表达情况。 结果 lncRNA CRNDE 在乳腺癌组织中的表达(2.73±1.66)明显高于癌旁组织(2.06±1.67),且在患者血浆中的表达水平(1.79±1.05)高于健康对照者(1.40±1.12),差异均有统计学意义(均P＜0.05);血浆中lncRNA CRNDE的表达水平与患者临床病理特征无关(P＞0.05);ROC曲线分析发现AUC为 0.66。 结论 血浆中高表达的lncRNA CRNDE可作为乳腺癌诊断的一个潜在的新型生物标志物。     

长链非编码RNA及其在代谢疾病中研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是20世纪末期被发现的一类具有特定功能的非编码RNA(noncoding RNAs,ncRNAs)。发现初期,lncRNAs被认为是不具有生物学功能。随着microRNA,shRNA,siRNA,tRNA等非编码RNA等陆续发现,其在研究和实际应用中的地位也越来越重要,人们开始把精力投放到非编码RNA的研究。持续深入地研究发现,lncRNAs被作为一类具有特定功能的非编码RNA,在细胞的增殖、分化和机体的发育中发挥着重大作用。人们生活水平的不断提高,包括糖尿病、妊娠期糖尿病、肥胖等在内的多种代谢疾病的发病率也在显著提高,而目前关于lncRNAs在糖尿病、妊娠期糖尿病、肥胖等在内的多种代谢疾病中的研究报道还比较少,全文主要总结了近几年关于lncRNAs相关作用机制的研究及其在一些代谢疾病中的研究进展。     

长链非编码RNA调控自噬的研究进展

随着检测技术的发展,人们对非编码RNA的认识不断加深。长链非编码RNA作为非编码RNA的重要组成部分,其特异性表达或调控异常与细胞凋亡、周期、自噬等结局密切相关,同时也在多种疾病进程中起重要作用。自噬作为近几年来的研究热点,其作用机制及在疾病进程中的调控逐渐被人们认识,关于长链非编码RNA和自噬的研究也越来越多。本文根据近几年的相关文献,围绕长链非编码RNA在自噬过程中的调控作用进行概述。     

长链非编码RNA THOR在生殖与肿瘤中调控的研究现状

睾丸相关的高度保守的致癌性lncRNA(Testis-associated Highly-conserved Oncogenic long non-coding RNA,THOR)是一类非编码RNA,在哺乳动物睾丸及肿瘤组织中特异性表达,参与雄性生殖过程,调控肿瘤细胞的发生发展。本文对lnc-THOR在生殖和肿瘤中的研究进展进行综述,为雄性生殖有关疾病和肿瘤的表观遗传机制研究提供新的见解,并为其寻找潜在的治疗靶点。     

长链非编码RNA CCAT1在女性恶性肿瘤中的研究进展

近年来,女性恶性肿瘤的发病率和死亡率不断上升,对女性的生殖健康造成了极大的危害。其中,最常见的四种女性恶性肿瘤是乳腺癌、宫颈癌、子宫内膜癌和卵巢癌,这4种癌症致死率分别为6%~10%、18%~46%、12%~57%、41%~87%(数据来自世界卫生组织网站)。这些肿瘤严重威胁着妇女的健康,给妇女的家庭和社会带来了极大的负担。因此,探索有效的途径来对抗这些致命的癌症变得至关重要。LncRNA是癌症诊断和治疗领域的新星。     

长链非编码RNA在医学寄生虫学研究中的进展

长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）是一类长度大于200 nt且基本不编码蛋白质的转录本,以RNA形式在表观遗传水平、转录及转录后水平影响基因的表达,广泛参与机体的病理生理过程。本文围绕lncRNA分子在寄生虫学领域中的研究进展做一综述,旨在为防治寄生虫疾病寻找新的靶点。     

长链非编码RNA在肝细胞癌诊断及预后中的研究进展

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发病率和病死率高,早期诊断、早期治疗成为提高患者生存率的关键。因此,有必要研发高效、无创的早期诊断及预后新型标志物。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是近年来肝癌研究领域一个新的热点。本文主要阐述lncRNA对肝细胞癌诊断及预后的价值。     

长链非编码RNA对弥漫大B细胞淋巴瘤患者的预后价值

目的  识别与弥漫大B细胞淋巴瘤（diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL）患者预后相关的长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）并评估其预后价值。 方法  从高通量基因表达数据库（gene expression omnibus,GEO）下载DLBCL患者的基因和临床信息：GSE31312（n=424,训练集）和GSE10846（n=295,验证集）。在训练集中通过套索算法（least absolute shrinkage and selection operator,LASSO）结合平稳选择法以及多因素Cox回归筛选与患者预后相关的lncRNA。根据所筛lncRNA将患者进行危险分层（高危组和低危组）并进行log-rank检验。然后分别建立国际预后指数（international prognostic index,IPI）、lncRNA及IPI+lncRNA的Cox比例风险模型,依据时点/动态受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线法对各模型的预测准确度进行评价和比较。 结果  共发现8个与DLBCL预后相关的lncRNA。训练和验证集中,两组患者生存曲线的差异均有统计学意义（训练集：χ²=73.1,P < 0.001;验证集：χ²=13.4,P < 0.001）,IPI+lncRNA模型的C指数与其他两个模型相比,差异也具有统计学意义（训练集：IPI+lncRNA vs. IPI：Z=76.536,P < 0.001;IPI+lncRNA vs. lncRNA：Z=17.714,P < 0.001;验证集：IPI+lncRNA vs. IPI：Z=42.427,P < 0.001;IPI+lncRNA vs. lncRNA：Z=30.587,P < 0.001）。 结论  本研究发现的8个lncRNA可以作为DLBCL的预后标志物,与IPI结合可提高对DLBCL患者预后判断的准确性。     

血浆长链非编码RNA PITPNA - AS1表达与缺血性脑卒中发病风险的关联性研究

目的 探索血浆长链非编码RNA（lncRNA）PITPNA - AS1表达水平与缺血性脑卒中（IS）发病风险的关联,分析PITPNA - AS1是否可作为IS的生物标记物。方法 采用病例对照研究,收集深圳地区IS新发病例及正常对照各302例,按同性别、年龄（±3）岁进行1∶1匹配,通过微滴式数字PCR检测血浆PITPNA - AS1的表达水平,采用条件logistic回归分析PITPNA - AS1表达水平与IS发病风险之间的关联,采用受试者工作特征曲线及重新分类的方法分析PITPNA - AS1作为IS生物标记物的可行性。结果 与对照组相比,IS病例组血浆PITPNA - AS1的表达水平较高,差异有统计学意义（P＜0.001）,校正其他危险因素后,OR为2.87（95% CI:1.84～4.46）。与只纳入其他危险因素的模型相比,加入PITPNA - AS1能增加模型的曲线下面积（P = 0.013）,净重分类改善度为0.35（95% CI:0.19～0.51）,综合区分改善度为0.10（95% CI:0.03～0.17）。结论 血浆lncRNA PITPNA - AS1表达水平与IS发病风险有关,PITPNA - AS1具有成为IS生物标记物的潜能。     

肺结核患者外周血中长链非编码RNA MALAT1、NEAT1和NEAT2的表达研究

目的  分析肺结核患者与健康对照之间外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)中长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)MALAT1、NEAT1和NEAT2的表达差异。 方法  利用定量逆转录聚合酶链式反应技术检测79例肺结核患者和82例健康对照PBMC中lncRNA的表达水平, 同时进一步分析lncRNA表达水平与肺结核患者部分临床特征、实验室指标之间的联系。 结果  肺结核患者PBMC中MALAT1、NEAT1的表达水平均高于健康对照, 差异有统计学意义(Z=-4.386, P < 0.001;Z=-10.175, P < 0.001);NEAT2在两组之间的表达差异无统计学意义(Z=-0.203, P=0.839)。LncRNA表达水平与肺结核患者部分临床特征、实验指标关联分析结果显示, 初治肺结核患者PBMC中NEAT2的表达水平高于复发肺结核患者, 而痰涂片阳性肺结核患者PBMC中NEAT2的表达水平低于痰涂片阴性患者, 差异均有统计学意义(均有P < 0.05);MALAT1水平与血沉含量之间呈负相关(r_s=-0.256, P=0.034)。 结论  MALAT1、NEAT1在肺结核患者外周血中是异常表达的, 可能参与了肺结核的发病过程。     

长链非编码RNA SFTA1P在非小细胞肺癌组织中的表达和细胞功能研究

  目的   研究长链非编码RNA SFTA1P在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)中的表达情况, 以及对NSCLC细胞系生物学功能的影响。   方法   运用定量即时聚合酶链锁反应(quantitative real time polymerase chain reaction, qRT-PCR)检测SFTA1P在18对非小细胞肺癌组织及癌旁组织中的表达情况; 用qRT-PCR检测5株NSCLC细胞系(A549、SPCA1、H1975、H460和H1299)和1株肺正常上皮细胞系(human bronchial epithelial, HBE)中SFTA1P的表达情况; 构建SFTA1P的过表达载体, 通过转染构建过表达细胞模型; 运用CCK-8、Transwell等实验方法检测SFTA1P过表达对NSCLC细胞增殖、侵袭、迁移的影响。   结果   SFTA1P在非小细胞肺癌组织中的表达低于癌旁组织(t=2.158, P=0.043);与HBE细胞相比较, SFTA1P在A549和H460细胞系中相对低表达(t=5.769, P=0.004; t=5.772, P=0.004), 在H1299和H1975细胞系中相对高表达(t=22.248, P < 0.001; t=11.814, P < 0.001);SFTA1P过表达质粒转染A549和H460细胞系后, 与空质粒的对照组比较, SFTA1P的表达均升高, 且有统计学差异(均有P < 0.05);过表达SFTA1P可以抑制非小细胞肺癌细胞H460、A549的增殖、侵袭、迁移, 差异有统计学意义(均有P < 0.05)。   结论   SFTA1P基因能够抑制NSCLC细胞的增殖、迁移、侵袭等生物学功能, SFTA1P在肿瘤发生和发展中可能起着抑癌基因的作用。     

基于3个甲基化调控的长链非编码RNA建立结肠腺癌的风险模型

目的  本研究通过挖掘癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库和基因表达公共数据库(gene expression omnibus, GEO),鉴定结肠腺癌(colon adenocarcinoma, COAD)中甲基化调控的长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)并判断其预后价值。 方法  从TCGA数据库下载COAD患者的表达谱数据、DNA甲基化数据以及相应的临床数据。从GEO数据库下载GSE39582队列表达谱数据。使用R 4.0软件,通过“edgeR”和“limma”包筛选差异表达基因并通过Spearman秩次相关判断基因表达值和甲基化值的相关性。使用Cox回归模型构建风险模型。 结果  通过对TCGA和GEO数据库的联合分析,鉴定出23个甲基化调控的lncRNA。单因素Cox分析鉴定出4个甲基化调控的lncRNA(LINC00675、LINC01082、LINC01207和RP1-170O19.14)与COAD患者的总生存期(overall survival,OS)相关。采用逐步Cox回归分析构建风险模型,风险评分=(-0.148 19×表达量_LINC01082)+(-0.120 50×表达量_LINC01207)+(-0.120 46×表达量_{RP1-170O19.14})。 结论  本研究基于甲基化调控的lncRNA构建COAD患者的风险模型,可以促进对COAD患者OS的个体化预测。