盐城市2018-2019年手足口病和疱疹性咽峡炎病原学特征分析

目的 探讨盐城市近年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)和疱疹性咽峡炎病原学特征,以及柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)、10型(CVA10)分离株VP1区序列分子进化规律.方法 收集全市哨点监测医院诊断为HFMD和疱疹性咽峡炎病例标本,采用实时荧...     

长春地区儿童疱疹性咽峡炎病原研究

目的了解长春地区2012年、2013年儿童疱疹性咽峡炎主要病原类型。方法采集2012年、2013年儿童疱疹性咽峡炎患者的咽拭子标本,通过半巢式RT-PCR及VP1区基因序列分析进行病原分型鉴定。结果本研究采集的110份儿童疱疹性咽峡炎标本中,经鉴定肠道病毒(enterovirus,EV)阳性82份,阳性率为74.55%;其中2012年检测前3位的型别分别为CVA10(18/32)、CVA2(7/32)及CVA3、CVA16(3/32);2013年检测前3位的型别分别为CVA6(25/50)、CVA2(13/26)及CVA4、CVA10(3/50)。系统进化树分析结果表明,2012年和2013年吉林省肠道病毒的流行均存在3个或3个以上的传播链。结论 2012年、2013年引起长春地区儿童疱疹性咽峡炎的主要病原分别为CVA10及CVA6,且同期存在不同的传播链。     

手足口病配对标本病原学检测及流行病学特征分析

目的比较手足口病门诊患者疱疹液、咽拭液肠道病毒检出率及一致性,分析病例群流行病学特征。方法以准分层随机法抽取同人疱疹液和咽拭液配对标本451人份,用实时荧光定量逆转录多聚酶链反应检测柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A group 16 strain,CVA16)、肠道病毒71型(enterovirus71,EV71)和总肠道病毒(Pan-enterovirus,EV)。统计分析用卡方检验、Kappa检验、秩和检验。结果疱疹液标本EV、CVA16、EV71阳性率为77. 38%、39. 47%、28. 16%,咽拭液标本为64. 97%、31. 49%、26. 39%,疱疹液检出率为高(χ~2值为39. 20,24. 92,3. 06,P值为0. 000,0. 000,0. 077)。EV71、CVA16、EV检出一致性的Kappa检验K值为0. 911,0. 750,0. 576,P 0. 001,差异有统计学意义。疱疹液、咽拭液中EV、CVA16、EV71检出率顺序,与其Kappa检验K值顺序相反。病例星期分布性别比稳定,动态趋势一致但发病不均匀,呈以星期六为顶点并递降的峰形。结论手足口病门诊标本疱疹液优于咽拭液;病原检出率顺序与检出一致性K值顺序不一致;在一般流行病学特征下,手足口病发病星期分布可能不均并伴跨周单峰; 2016年十堰市手足口病主要病原是CVA16、EV71。     

五华县2010—2013年手足口病病原学监测结果

目的了解五华县手足口病病原学特征,为防控提供依据。方法采集五华县2010—2013年哨点医院手足口病病例粪便标本,用荧光定量PCR法进行肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A组16型（CoxA16）和其他肠道病毒核酸检测。结果共检测214份标本,肠道病毒总检出率67.3%,其中EV71检出率17.8%、CoxA16型检出率14.5%、其他肠道病毒检出率35.0%;男女EV71、CoxA16和其他肠道病毒的检出率类似;手足口病主要病原2010年是EV71型,2011年至现在为其他肠道病毒;患儿检出率随年龄升高而降低,5岁以下病例占98.6%（142/144）。结论五华县手足口病感染率较高,开展手足口病流行病学和病原学研究,有助于提出有针对性的防控措施。     

2010～2012年北京市顺义区手足口病病原学检测结果分析

目的 通过对2010～2012年北京市顺义区手足口病（Hand-foot-and-mouth disease,HMFD）实验室检测结果分析,了解顺义区手足口病病原学特征,为手足口病防控工作提供科学依据.方法 对2010～2012年顺义区684例临床诊断为手足口病患者标本,应用实时荧光定量RT-PCR法检测标本中的肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A组16型（CVA16）、非EV71和CVA16的其它肠道病毒（EV）特异性核酸.结果 684例HFMD患者标本中,肠道病毒阳性率为47.37％ （324/684）.病原谱构成以CVA16型为主,占55.56％（180/324）,其次为EV71占32.41％（105/324）,其他肠道病毒占12.03％ （39/324）;4～7月为HFMD检出高峰期;0～5岁为高风险年龄组;性别比1.49∶1,男性阳性率略高于女性,但差异无统计学意义（x2 =0.163,P＞0.05）;散居病例阳性检出率较高.结论 2010 ～2012年顺义区HFMD病例病毒阳性检出率较高,CVA16是优势病毒型别;每年春夏季节,应加强对流动人口聚居区5岁以下儿童的手足口病防控工作.     

2018年成都市疱疹性咽峡炎聚集性和暴发疫情分析

目的了解成都市疱疹性咽峡炎聚集性和暴发疫情流行特征,为制定科学防控处置方案提供依据。方法收集2018年成都市报告处置的疱疹性咽峡炎聚集性和暴发疫情信息,采用描述性流行病学方法分析疫情三间分布特征。结果 2018年成都市共报告疱疹性咽峡炎聚集性和暴发疫情30起,其中暴发疫情1起,疫情主要发生在托幼机构(96.67%,29/30),累计报告病例148例,临床症状以咽部疱疹(38.01%)、发热(33.03%)为主。病例标本肠道病毒阳性检出率为53.13%,其中其他肠道病毒(EV-A71、CV-A16除外)检出率68.75%,CV-A16检出率31.25%,EV-A71检出率6.25%。结论成都市托幼机构疱疹性咽峡炎聚集性疫情呈高发态势,应制定针对性的科学防控策略,加强托幼机构传染病督导管理,有效防控疫情蔓延。     

宁波市2011年 — 2013年手足口病密切接触者肠道病毒带毒状况调查

  目的  了解浙江省宁波市手足口病患者密切接触人群肠道病毒携带情况及其影响因素,为手足口病的防控提供参考依据。  方法  采集2016年1月 — 2017年12月宁波慈溪市、余姚市和奉化区手足口病患者密切接触人群的1 097份标本进行了肠道病毒核酸检测。  结果  宁波市2016 — 2017年采集的1 097份手足口病患者密切接触人群标本中,检出肠道病毒207份,肠道病毒检出率为18.87 %;其中分别检出肠道病毒71型（EV-A71）、柯萨奇病毒A组16型（CV-A16）和其他肠道病毒29、56和122份,检出率分别为2.64 %、5.10 % 和11.12 %。多因素非条件logistic回归分析结果显示,手足口病患者密切接触人群肛拭子和咽拭子较粪便标本肠道病毒检出率低;流行季节为4 — 7月和接触患者病原学检测结果为阳性的手足口病患者密切接触人群肠道病毒检出率较高。  结论  手足口病密切接触人群肠道病毒携带率较高,标本类型、流行季节和接触患者病原检测结果是手足口病患者密切接触人群肠道病毒检出情况的主要影响因素。     

深圳市大鹏新区2起儿童疱疹性咽颊炎聚集性疫情的病原鉴定与基因分型分析

【目的】分析2021年5月深圳市大鹏新区2起儿童疱疹性咽颊炎疫情的病原特征及其基因型。【方法】采集2起疱疹性咽峡炎暴发疫情患儿的5份咽拭子,用实时荧光聚合酶链式反应（PCR）对其进行常见肠道病毒的基因检测,采用逆转录巢式聚合酶链式反应（RT-nPCR）法扩增肠道病毒VP1区,通过测序和比对进行序列分析,运用MEGA7软件中的CLUSTAL W程序进行位点对齐并构建系统进化树。【结果】引起这2起疱疹性咽峡炎疫情的病原体为柯萨奇病毒A4(CVA4)。VP1区基因序列分析发现2起疫情样本之间的核苷酸同源性为92%;A幼儿园的3株毒株与深圳2018株（MN840533）进化关系最近,核苷酸同源性为98.11%;B幼儿园的2株毒株与四川2018株（MW178763）进化关系最近,核苷酸同源性为97.88%。系统进化树显示,本研究的5株CVA4病毒均属C2基因亚型。【结论】2起儿童疱疹性咽颊炎疫情都是由CVA4病毒引起,均属C2基因亚型。     

基于临床症状和病原学特征的手足口病与疱疹性咽峡炎流行病学分析*

目的了解上海市浦东新区儿童手足口病和疱疹性咽峡炎临床症状和病原学特征,比较两者的流行病学特征,为有效防控手足口病和疱疹性咽峡炎的发生提供依据。方法对2016年6月—2017年5月上海市浦东新区手足口病和疱疹性咽峡炎病例进行问卷调查,同时采集病例的咽拭子样本进行肠道病毒检测。结果疱疹性咽峡炎在一些临床症状上和手足口病表现相似,但发热、咽痛、呕吐及头痛的发生率均高于手足口病病例,差异有统计学意义(P0.05)。手足口病与疱疹性咽峡炎的病原学结果不同,手足口病以柯萨奇A6型(Cox A6)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇A16型(Cox A16)为主,疱疹性咽峡炎以其他肠道病毒和Cox A6为主。结论疱疹性咽峡炎应该得到重视,并和手足口病一样进行监测管理,有助于进一步加强有针对性的防控措施。     

2018-2021年北京市石景山区哨点医院疱疹性咽峡炎监测结果分析

目的 掌握北京市石景山区疱疹性咽峡炎流行病学特征、临床特点和病原构成变化趋势。方法 汇总2018-2021年北京市石景山区哨点医院首次就诊的疱疹性咽峡炎病例临床资料和集体单位聚集性疫情资料,并采集患儿咽拭子样本使用荧光定量PCR检测,监测结果用Excel 2013软件进行描述性统计,临床和流行特征分析采用SPSS 17.0软件统计进行统计学分析。计数资料表示为率(%)的形式,率的比较用χ2检验或精确概率法,检验水准ɑ=0.05。结果 2018-2021年石景山区哨点医院共报告疱疹性咽峡炎病例2 990例,占就诊比例115.56/万,发病高峰在4至10月份,年龄主要分布在0~5岁。采集疱疹性咽峡炎合格咽拭子标本230份,检出肠道病毒阳性50份,检出率为21.74%。不同年份疱疹性咽峡炎病原构成不同,但各年总检出率差异无统计学意义(χ^(2)=3.315,P=0.346)。是否发热(OR=2.278,95%CI:1.038~5.000,P=0.036),标本来源(OR=7.739,95%CI:1.375~43.569,P=0.007)和季节(OR=34.483,95%CI:4.566~250.000,P<0.001)是疱疹性咽峡炎检出的危险因素,发病就诊时间间隔(采样时间)是疱疹性咽峡炎检出的保护因素(OR=0.377,95%CI:0.108~1.318,P=0.006)。结论 2018-2021年北京市石景山区疱疹性咽峡炎病原主要是CV-A6和肠道病毒未分型,建议尽早制定诊疗和防控的指导性文件,并持续开展监测工作。     

威海市504例手足口病标本核酸检测结果分析

目的:对威海市504例手足口病(HFMD)患儿粪便样本实验室检测结果进行分析,了解威海地区HFMD病原特征,为今后制定HFMD防治措施提供依据。方法:对送检的504例临床诊断为HFMD患者标本,应用实时荧光(Real-time)RT-PCR法检测标本中的人肠道病毒(HEV)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CVA16)特异性核酸。结果:504例HFMD患者标本中,EV71阳性率为50.99%,CVA16阳性率为18.25%,其它HEV阳性率为17.26%;46例HFMD重症病例中,EV71阳性率84.78%,CVA16阳性率6.52%。结论:威海地区手足口病病原体以EV71和CVA16为主。EV71型是引起重症病例的优势病毒型,应加强监测,特别是4岁以下婴幼儿的监测。     

2014年湖南省郴州市手足口病病原谱及CVA16基因特征分析

目的 了解2014年湖南省郴州市手足口病病原谱和优势毒株的基因特征,为郴州市手足口病的防治提供科学依据。 方法 采集2014年郴州市手足口病监测病例标本,应用荧光PCR方法检测HEV71、CVA16、CVA6、CVA10和其他肠道病毒。未能分型的其他HEV阳性标本进行RT-PCR扩增,通过基因测序鉴定病原体型别。 结果 共检测854份标本,阳性检出率为55.62%。病原谱中已知型别的前5位分别为CVA16(28.00%)、HEV71(25.05%)、CVA6(13.89%)、CVA10(12.42%)、CVB5(0.84%),仍有20.63%的其他HEV未分型。不同月份、不同年龄组、不同病例类型的病原体型别的构成比差异均有统计学意义(均P<0.05);男女性别的病原体型别的构成比差异无统计学意义(P>0.05)。郴州市的6株CVA16分离株均为B1基因亚型。 结论 2014年郴州市的手足口病流行毒株显示了一定的季节性分布特征,主要的几种优势毒株相互交替流行,并与人群的免疫基础相互作用体现在月份和年龄组的分布上。郴州市的CVA16分离株与国内流行株的基因型别一致。     

天津市2013年手足口病病原检测及基因特征

目的 对天津市2013年手足口病(HFMD)进行病原学检测,并对引起HFMD的病原体进行基因特征分析,为天津市HFMD的防控提供基础资料。方法 采用real time RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行核酸检测,对部分阳性标本进行病毒分离;并对病毒分离株进行分型鉴定和种系发生进化分析。结果 2013年共检测HFMD疑似病例1728例,其中检出阳性1390例,总阳性率为80.44%(EV71占16.38%,CVA16占11.46%,CVA6占43.92%,CVA10占1.56%,其他占7.12%);病毒分离株分型鉴定结果显示,获得的12个基因型别分别属于A、B两组肠道病毒;种系发生树分析显示在各基因型中,天津分离株与中国大陆或周边国家流行株亲缘关系较近。结论 2013年天津市HFMD流行的病原谱构成呈现多样性,CVA6是优势病原体。     

实时荧光定量RT-PCR技术在手足口病疫情监测中的应用

[目的]对手足口病患者标本进行病毒核酸检测,探讨实时荧光定量RT-PCR方法在手足口病疫情监测中的意义。[方法]采用实时荧光定量RT-PCR方法对2010年3～8月连云港市采集的307份手足口病患者标本进行肠道病毒核酸检测,并对肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)进行分型。[结果]307份手足口病患者标本中有221份肠道病毒核酸阳性,阳性率71.99%,其中EV71型病毒核酸阳性标本123份,阳性率40.07%,CVA16型病毒核酸阳性标本66份,阳性率21.50%。[结论]实时荧光定量RT-PCR方法耗时短、特异性强、灵敏度高,可作为手足口病疫情监测的诊断方法。     

2012-2013年福州市手足口病原学调查研究

摘要:目的　对2012-2013年福州市手足口病进行病原学调查研究并对其流行病学特征进行分析,旨在全面了解福州地区手足口病的肠道病毒。方法　收集2012-2013年福州市区临床表现为手足口病的样本1031份,通过荧光定量RT-PCR、巢式RT-PCR以及NCBI提供的BLAST序列比对确定肠道病毒型别。利用CVA6特异性引物鉴定2012-2013年福州市其他肠道病毒。对2012年CVA6手足口病例进行流行病学特征分析。结果　1031份标本中878份显示EV阳性,检出率为85.16%（878/1031）,其中EV71 426例,阳性率为45.52%（426/878）;CVA16 93例,阳性率为10.60%（93/878）;其他肠道病毒359例,阳性率为40.88%（359/878）,其中CVA6 为218例,阳性率为24.83%（218/878）。另还发现CVA10和Echo3肠道病毒。流行病学特征分析发现0～5岁年龄组儿童为CVA6主要发病人群（构成比为94.04%）,男女性别比为1.66∶1;CVA6构成比情况在各月有较大差异,总体起伏明显,9月的CVA6病例构成比占62.50%,达到2012年最高峰。结论　EV71、CVA16和CVA6是福州市手足口的主要肠道病原体,CVA6病毒已经超过CVA16成为第二大病原体,2012年CVA6主要发病人群为0～5岁儿童,9月份为发病高峰期。     

湘西自治州2012年手足口病病原学检测结果分析

目的 对湘西州2012年手足口病检测结果进行病原学及流行特征分析,为本州手足口病的防治提供依据.方法 采用Real-time PCR法对1 123例手足口病患者咽拭子标本进行病毒核酸检测. 结果 肠道病毒通用型阳性率65.27％,其中HEV-A71型阳性率35.17％：CVA-16阳性率5.43％;其他肠道病毒型阳性率24.67％,流行季节呈现两个高峰,3-6月为主高峰,其次为10-11月.男女性别为：1.56：1,年龄以0～～3岁婴幼儿为主.HEV-A71经测序序列为C4A,CVA-16测序序列为B,其他肠道病毒经测序鉴定的种类有CVA4、CVA6、CVA10、CVB3、ECH030、CVB5.结论 2012年湘西州手足口病,HEV-A71型和其他肠道病毒型是手足口病流行的主要病原.     

2013-2015年郴州市手足口病病原谱及柯萨奇病毒A6基因特征分析

目的 了解2013-2015年湖南省郴州市手足口病(hand, foot, and mouth disease,HFMD)病原谱和优势毒株基因特征,为该病的防控提供科学依据。 方法 采集2013-2015年郴州市HFMD临床诊断病例肛拭子或粪便标本,用荧光定量PCR方法检测人肠道病毒71型(human enterovirus 71, HEV71)、柯萨奇病毒A组16型(coxasckievirus A16, CVA16)、CVA6、CVA10和其他肠道病毒(HEV)。除上述型别外无法分型的其他HEV阳性标本再进行RT-PCR扩增,通过基因测序比对,鉴定病原体型别。 结果 郴州市2013-2015年共检测HFMD标本2 343 份,肠道病毒阳性1 325份,阳性检出率为56.55%;HFMD病原谱包括16种肠道病毒,已知型别中前5位分别为CVA6(31.77%),CVA16(16.45%),HEV71(13.74%),CVA10(11.47%),柯萨奇B组5型(CVB5)(0.30%),仍有25.13%的其他HEV未分型;聚集性病例以CVA16和其他HEV为主,重症及死亡病例以HEV71和其他HEV为主,不同年份(χ²=64.90,P<0.001)、不同类型( χ²=56.41,P<0.001)。郴州市的CVA6分离株均分布于同一进化簇, 与长沙市分离株亲缘关系最近。 结论 2013-2015年,CVA6已成为郴州地区引发手足口病的主要病原型别,在手足口病监测中应加强非HEV71和非CVA16型肠道病毒检测。     

衡阳市2010年手足口病实验室检测结果分析

目的对衡阳市2010年4-12月手足口病（HFMD）实验室检测结果进行分析,了解衡阳市HFMD流行特征,为今后制定或调整HFMD防治措施提供参考。方法对2010年4-12月衡阳市各县区疾病预防控制中心（CDC）及各类医疗机构送检的625例临床诊断为HFMD患者标本,应用实时荧光（Real-time）RT-PCR法检测标本中的人肠道病毒（HEV）、肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（CVA16）特异性核酸。结果 625例HFMD患者标本中,EV71阳性率为26.08%（163/625）,CVA16阳性率为8.80%（55/625）,其它HEV阳性率为19.84%（124/625）;95例HFMD重症病例中,EV71阳性率（67.80%,40/95）最高,并且男性阳性率（50.85%）略高于女性（27.78%）,未检出CVA16型;9例HFMD重症死亡病例中,6例为EV71型,阳性率为66.67%。4-7月为HFMD高发期,3岁以下为高风险年龄组,重症病例及重症死亡病例比其它年龄组高。结论衡阳市2010年HFMD发病率较高,EV71型是引起重症及重症死亡病例的优势病毒型,应加强监测,特别是3岁以下婴幼儿的监测。     

2018年济南市14株柯萨奇病毒A组6型VP1基因特征分析

目的 分析济南市导致手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)的柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)分离株VP1基因特征及氨基酸变异。方法 2018年济南市HFMD常规监测病例样本经实时荧光RT-PCR检测,随机选择部分CVA6核酸阳性样本进行细胞分离鉴定,扩增阳性分离株VP1基因序列并进行同源性比较、氨基酸变异及系统进化分析。结果 2018年共检测652份样本,其中CVA6核酸阳性率为47.85%（312/652）,远高于人肠道病毒A组71型（human enterovirus A 71, EV71）（7.06%, 46/652）和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16, CVA16)（8.44%,55/652 ）,为济南市HFMD最主要病原体。通过细胞分离成功获得14株CVA6病毒,经VP1基因系统进化分析显示,济南市CVA6分离株均为基因D5亚型,VP1基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为94.2%~100%和98.0%~100%,与2017年广东株（GenBank 登录号MG385796、MG385815）、广西株（GenBank 登录号MH018512）、云南株（GenBank 登录号LC413143）及2014年江西株（GenBank 登录号KY913482）等亲缘关系较近。VP1蛋白主要存在V174I等位点变异,与国内流行的D5亚型基本一致。结论 2018年CVA6病毒为导致济南HFMD的主要病原,与广东、广西、云南和江西等省分离株亲缘关系较近,属于我国目前流行的基因D5亚型。