中国南方汉族人群哮喘与GSDMB/ORMDL3基因多态性

目的 研究GSDMB/ORMDL3基因相关单核苷酸多态性位点(SNP)与中国广东人群哮喘发病、吸烟行为的相关性。方法 于2014年3月-2015年3月对广东医学院附属医院就诊的394例哮喘患者、395名健康成人进行血样采集和问卷调查,用SNaPshot技术检测GSDMB/ORMDL 3基因单核苷酸多态性(SNP)rs7216389、rs4794820、rs11650680基因型,并分析SNP变异与哮喘风险及吸烟因素的相关性。结果 SNP位点rs7216389 C-T和rs4794820 A-G变异增加哮喘发病风险(OR分别为1.8和1.7,均为P<0.0001),而rs11650680 C-T位点变异与哮喘风险无明显相关性(OR=0.8,P=0.1700);吸烟哮喘患者rs7216389 T/T和rs11650680 C/C高于戒烟与非吸烟组,而rs4794820 A/A低于非吸烟组(均为P<0.0001)。结论 rs7216389 C-T、rs4794820 A-G位点变异与哮喘发病风险明显相关,吸烟增加rs7216389 C-T、rs4794820 A-G、rs11650680 T-C位点的变异风险。     

LTA基因单核苷酸多态位点与胃癌易感性的研究

目的通过对江西地区汉族胃癌患者和正常人群中淋巴毒素-α(LTA)基因单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs909253基因型的检测,探讨rs909253位点与胃癌患者易感性的关系。方法利用Sequenom-MassArray-IPLEX检测194例胃癌和250例对照LTA基因多态位点rs909253的基因分型,并利用非条件logistic回归对检测结果进行相关统计。结果 LTA rs909253多态位点GG、GA、AA三种基因型在胃癌的频率分别为26.4%、52.0%和21.6%,与对照组(35.6%、46.4%和18.0%)相比,统计学上无显著意义(χ2=4.403,P=0.111);但胃癌组和正常组的等位基因频率分布差异临近显著,P值达0.059;对年龄和性别进行校正后,携带等位基因G的胃癌发病风险有所增加(OR=1.315,95%CI:1.001~1.728)。结论江西汉族人群胃癌的遗传易感性可能与LTA基因rs909253位点的单核苷酸多态性有关,G等位基因为其发病的危险因素。     

ORMDL3基因多态性与南方成人哮喘发生的相关研究

目的：探讨成人哮喘与ORMDL3基因多态性的关系。方法：选取2011年6月-2012年6月在本院就诊的哮喘病患者152例作为研究对象,纳入的研究对象必须符合家族三代以上祖居在长江以南。根据患者哮喘首次发作的年龄将研究对象分为早发组和晚发组,对照组为同期在本院进行健康体检的成人。哮喘组和对照组均通过PCR技术进行ORMDL3基因多态性分析。结果：哮喘组携带TT型基因的频率和T等位基因的频率明显高于对照组（P〈0.05）。早发组与晚发组携带TT型基因和T等位基因的频率比较差异无统计学意义。结论：成人哮喘与ORMDL3基因多态性有一定的相关性,ORMDL3基因TT型纯合子可能是南方成人哮喘发生的高危基因。     

XPC基因启动区单核苷酸多态与肺癌易感性的相关性

[目的]研究DNA修复基因XPC启动区-371和-27位点单核苷酸多态与肺癌易感性的关系。[方法]以401例肺癌患者为病例组，同时以383名年龄性别频数相匹配的非肿瘤患者作为对照组，采用Taqman MGB探针荧光标记的聚合酶链反应方法检测XPC基因启动区G-371A和G-27C的基因型；运用Phase2．0软件构建这两个多态位点的单体型；以比值比（OR）及其95％可信区间（CI）比较不同基因型的肺癌相对危险度。[结果]病例组与对照组间，XPC G-371A等位基因型和G-27C等位基因型分布差异具有显著性（Х^2=4．33，P〈0．05；Х^2=9．84，P〈0．01）。与携带XPC-371GG基因型的个体相比较，携带XPC-371GA＋AA基因型的个体患肺癌的风险明显降低（OR校正=0．69；95％CI：0．51—0．94）；而携带XPC-27GG基因型的个体相比较，XPC-27CG＋CC基因型患肺癌的风险明显增加（OR校正=2．18；95％CI：1．23—3．85）。进一步单体型分析显示，与人群中分布最广泛的GG单体型比较，AG单体型可以降低风险（OR=0．76；95％CI：0．60。0．96；P〈0．05）；GC单体型明显增加患肺癌的风险（OR=2．06；95％CI：1．20—3．54；P〈0．05）。[结论]XPC启动区．27位点CG＋CC基因型和．371位点GA＋AA基因型与中国人群肺癌易感性有关。     

人类NRAMP1基因单核苷酸多态与接尘工人肺结核易感性

目的 探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1（NRAMP1）基因多态性与接尘工人肺结核易感性的关系.方法 采用1：2病例对照设计,按年龄相差小于5岁,工种、吸烟、饮酒率、总粉尘接触量和矽肺患病同比例匹配,选择61例男性肺结核患者为病例组（矽肺50例、非矽肺11例）,122例男性无肺结核者为对照组（矽肺100例、非矽肺22例）.应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析（PCR-RFLP）技术检测NRAMP1 INT4和D543N位点的多态性.结果 NRAMP1 INT4多态位点野生纯合子（G/G）、杂合子（G/C）和突变纯合子（C/C）在病例组的分布频率分别为63.9%、34.4%、1.6%,与对照组比较,差异有统计学意义（P＜0.05）,NRAMP1 INT4 C等位基因携带者患肺结核的危险性升高（OR=2.73,95% CI：1.32～5.64）,D543N位点多态与接尘工人肺结核易感性之间无关联（P＞0.05）.结论 NRAMP1基因第4内含子G＞C单核苷酸可能是接尘工人肺结核的易感因素.     

XRCC1基因多态与肺癌易感性的关系

目的 探讨DNA修复基因XRCC1多态对肺癌发生易感性的影响.方法 采用病例对照研究的方法选择209例肺癌患者为病例组,256例健康检查者为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测XRCC1基因194、280和399位点的多态性.结果 病例组与对照组XRCC 1-194位点Trp/Trp变异基因型分布频率分别为19.1％、10.9％,两组比较,差异有统计学意义(P＜0.05).该变异基因型携带者发生肺癌的危险度是野生型携带者的2.215倍(95％CI为1.276～3.845).病例组与对照组XRCC1-280位点Hi,His变异基因型分布频率分别为6.7％、4.3％,两组比较,差异有统计学意义(P＜0.05).该变异基因型携带者发生肺癌的危险度是野生型携带者的2.460倍(95％CI为1.141～5.304).病例组与对照组XRCC 1-399位点Gln/Gln基因型分布频率分别为10.0％、9.0％,两组比较,差异无统计学意义(P＞0.05).XRCC1-194、XRCC 1-280多态基因位点与吸烟在肺癌发生中均存在交互作用,携带XRCC1-194 Arg/Trp+Trp+Trp基因型和XRCC 1-280 His/His+Arg/His基因型的吸烟人群患肺癌的危险度分别为4.889(95％CI为2.828～8.452)和6.281(95％CI为3.572～11.046),明显高于携带野生基因型的非吸烟者.结论 携带XRCC1-194 Trp/Trp和XRCC 1-280 His/His突变等位基因及其与吸烟的交互作用使肺癌发生的风险增加,XRCC1基因多态与吸烟在肺癌的发生过程中起一定作用.     

新疆维吾尔族老年人脂蛋白酯酶基因HindⅢ和PvuⅡ位点多态性与血脂的关系

目的 探讨脂蛋白酯酶(LPL)基因HindⅢ和PvuⅡ位点多态性与新疆维吾尔族老年人血脂水平的关系.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,确定109例老年人的HindⅢ和PvuⅡ多态位点各基因型,并测定其各项血脂等体检指标.结果 LPL基因HindⅢH+H-型携带者血葡萄糖浓度[(5.93±1.13) mmol/L]明显高于H-H-型携带者[(4.62±0.83) mmol/L]和H+H+型携带者[(5.48±0.96)mmol/L],差异有统计学意义(P＜0.05);LPL基因PvuⅡp-p-型携带者丙氨酸转氨酶(ALT)浓度[(21.57±8.10) U/L]明显高于p+p-型携带者[(16.19±7.35) U/L]和P+P+型携带者[(15.28±5.93) U/L],差异有统计学意义(P＜0.05);H-H-/P+P-单体型携带者体重明显高于其他单体型携带者,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 LPL基因HindⅢ和PvuⅡ位点多态性可能与新疆维吾尔族老年人血脂水平存在一定关联,其中H+H-基因型可能与血浆高葡萄糖有关,PvuⅡ位点多态性可能与高ALT有关.     

PSCA基因单核苷酸多态性位点与胃溃疡易感性的研究

目的探讨PSCA基因多态性位点与胃溃疡的遗传学关联。方法采用候选基因的遗传学关联研究策略,基于来自中国汉族人群的688名胃溃疡患者以及1 442名健康对照受试者,对覆盖PSCA基因的11个SNP位点与胃溃疡的潜在关联进行考察。利用c2检验来对单个SNP位点的关联信号进行统计分析。结果SNP位点rs2294008与胃溃疡的疾病状态存在显著性关联(OR=0.73,P=4.78×10-5),该SNP的T等位基因在对照组中的分布频率高于病例组差异有统计学意义(P<0.05),因而具有一定的保护性作用。结论 PSCA基因可能是胃溃疡的易感基因。     

miRNAs及其靶基因单核苷酸多态性与肝癌遗传易感性研究

micro RNAs(mi RNAs)是一类进化上保守、长度约19~25个核苷酸(nt)的内源性单链非编码小分子RNAs,能够通过与靶m RNA 3’端非翻译区(3’-UTR)特异性的靶位点结合,引起靶m RNA的降解或抑制其翻译,从而调控基因的转录后表达。单核苷酸多态性(SNP)是一类普遍存在的遗传性多态,位于mi RNAs基因及其附近区域的SNPs可能会改变mi RNAs的功能,进而影响肿瘤的易感性。近年来研究发现,mi RNA相关SNPs与肝癌的发生发展有密切关联,本文就mi RNAs及其靶位点单核苷酸多态性与肝癌的遗传易感性作一综述。     

REG1a基因单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性研究

目的寻找中国汉族人群REG1a基因单核苷酸多态性位点,探讨其基因多态性与胃癌(Gastric Cancer)的关系。方法应用PCR产物测序的方法在中国人群中检测散发性胃癌组(n=183)及对照组(n=204)REG1a基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)。结果REG1a基因第929位(T/C)、第1790位(C/G)、第2751位(A/T)发现3个新的SNP位点,其中第929位和第1790位2个位点基因型在胃癌与健康人群的差异具有统计学意义(P<0.05)。结论对特定人群进行测序可有效筛查出候选SNP位点,初步发现REG1a基因的2处单核苷酸多态性与胃癌的发生、淋巴转移和远处转移有一定关系,为后续利用单核苷酸多态性标志进行胃癌风险预测奠定了研究基础。     

HLA-G基因上游调控区-725单核苷酸多态性与重度子痫前期易感性的关系

目的:采用病例-对照研究,探讨人类白细胞抗原(HLA)-G上游调控区-725单核苷酸多态性与子痫前期的发病是否存在关联。方法:对孕晚期重度子痫前期患者40例、正常足月妊娠妇女41例,提取全血基因组DNA,特异引物巢式聚合酶链反应扩增5’上游调控区,并进行基因测序,对-725位点基因型及等位基因频率进行χ2检验。结果:重度子痫前期组人类白细胞抗原-G基因-725单核苷酸多态性基因型频率GG、GC、CC分别为0%、7.5%、92.5%,正常对照组分别为0%、7.3%、92.7%,两组比较,差异无统计学意义(P0.05)。重度子痫前期组该位点等位基因频率G、C分别为3.8%、96.2%,正常对照组分别为3.7%、96.3%,两组比较差异无统计学意义(P0.05)。结论:HLA-G基因-725单核苷酸多态性与中国河南汉族人群重度子痫前期的发病可能没有直接相关。     

AIF-1基因多态性、体质指数与口腔癌发病风险的关联研究

目的 探讨同种异体移植炎症因子-1（allograft inflammatory factor-1,AIF-1）基因多态性、体质指数（body mass index,BMI）及其交互作用与口腔癌易感性的关系。方法 采用病例对照研究,收集2010年9月~2016年12月经病理确诊的新发口腔癌患者300例及同期该医院体检人群445例。应用TaqMan探针技术检测AIF-1基因的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）。采用非条件Logistic回归分析计算比值比（odd ratios,OR）值及95%可信区间（confidence intervals,CI）,分析AIF-1基因多态性、BMI及其交互作用与口腔癌易感性的关系。结果 GG基因型在共显性模型（OR=0.522,95%CI:0.319～0.855）和隐性模型（OR=0.573,95%CI:0.368～0.893）中均可降低口腔癌的发病风险。进一步的分层分析表明GG基因型在男性、BMI≥24.0 kg/m2、吸烟、非饮酒亚组中同样可降低口腔癌的发病风险。此外,结果还显示BMI<18.5 kg/m2可增大口腔癌的发病风险,而BMI≥24.0 kg/m2则是口腔癌的保护因素,并且AIF-1基因与BMI之间存在相乘交互作用。结论 AIF-1基因rs2857595基因SNPs和BMI≥24.0 kg/m2能降低口腔癌的发病风险,且rs2857595与BMI存在相乘交互作用。     

HSG基因单核苷酸多态性与原发性高血压的相关性研究

目的通过研究不同人群中新发现的增殖抑制基因HSG基因多态性,揭示增殖抑制基因多态性与高血压的关系。方法2002年4月至2003年9月选取原发性高血压患者51例,男27例,女24例,平均年龄(57±8)岁;有高血压家族史的患者20例,女11例,男9例,平均年龄(38±22)。74名健康对照,男38例,女36例,平均年龄(54±8)岁。取外周静脉血并提取DNA,设计相应的引物,PCR扩增法获得相应的产物,应用DNA测序法直接得到PCR产物的核苷酸序列后比较不同人群相同片段的碱基组成及其特征。结果高血压组血清肌酐(CRE)和尿素氮(BUN)含量明显高于血压正常组,而高血压组和有高血压家族史组的收缩压和舒张压均明显高于血压正常组。HSG基因第12位内含子存在着3种突变(1q82139G/A、82153C/G、82273G/),其中后两种单核苷酸变异在高血压与健康人之间存在着明显差异,高血压家族史者与健康人比较也存在明显差异。不同人群中1q82139G/A无明显差异,且在人群中以CC基因型分布较为常见,G点删除更常见于有原发性高血压家族史的人群。结论肾功能的指标(CRE和BUN)可能可以较早地反映高血压的进展和靶器官损害的状态。HSG基因第12位内含子存在着3种突变1q82139G/A、82153C/G和82273G/,其中1q82139G/A可能是一种无义突变,而1q82153C/G及1q82273G/单核苷酸变异     

乳腺癌雌激素调控基因1 rs 13394619位点单核苷酸多态性与子宫内膜异位症易感性的关系

目的探究乳腺癌雌激素调控基因1(growth regulation by estrogen in breast cancer 1,GREB 1)rs13394619位点基因多态性与子宫内膜异位症易感性的相关性。方法选择2017年10月至2019年7月邯郸市中心医院69例子宫内膜异位症患者为研究对象,另选取60例子宫内膜正常者为对照组,实时荧光定量PCR法检测血清GREB 1表达水平,提取血清基因组DNA,聚合酶链式反应-限制性片段多态性法检测GREB 1 rs13394619位点基因分型,Hardy-Weinberg平衡检验群体代表性;分析血清中GREB1表达、rs 13394619位点基因分型与病情严重程度的关系;Logistic回归分析rs 13394619位点基因分型与子宫内膜异位症易感性的相关性。结果与对照组相比,子宫内膜异位症组患者血清GREB 1表达显著升高;与子宫内膜异位症轻度组相比,中重度组患者血清GREB 1表达量显著升高,差异有统计学意义(P<0.05)。两组受试者GREB 1 rs 13394619位点符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;子宫内膜异位症组G等位基因频率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。子宫内膜异位症不同严重程度患者GREB 1 rs 13394619位点基因型频率比较,差异无统计学意义(P>0.05);Logistic回归分析显示GG、GA基因型携带者发生子宫内膜异位症相对危险系数为AA型的1.700倍和1.321倍,G基因携带者发生子宫内膜异位症相对危险系数为A等位基因的1.923倍。结论GREB 1 rs13394619位点多态性与中国北方女性子宫内膜异位症易感性有关,rs 13394619位点可能为功能性单核苷酸多态性,G基因携带者发生子宫内膜异位症风险较高。     

中国炭疽芽胞杆菌荚膜质粒基因单核昔酸多态性研究

目的 研究中国炭疽芽胞杆菌(炭疽杆菌)荚膜质粒基因单核苷酸多态性(SNP)特征.方法 选择中国不同分离年代、地点和来源的95株炭疽杆菌,采用PCR方法扩增荚膜质粒基因上的23个SNP位点,然后进行测序并进行聚类分析.结果 通过聚类分析,95株炭疽杆菌可分为5个群,23个SNP位点中17个位点相同,6个位点存在多态性,其中17.89％(17/95)的菌株与参考菌株Pastuer同源,38.95％(37/95)的菌株与参考菌株Ames Ancestor同源,其余菌株则不同于目前已知的全基因组测序菌株;3株菌在PS-34位点扩增基因片段中缺失长度约80bp的序列,待测的SNP位点包括在该缺失片段中;9株菌株在所有SNP位点扩增阴性,经炭疽杆菌荚膜质粒基因特异引物扩增证实这些菌株缺失荚膜质粒基因.结论 中国炭疽杆菌荚膜质粒SNP位点具有遗传稳定性和自身的特异性,6个SNP位点可作为基因分型的指标.     

2型糖尿病易感基因单核甘酸多态性的研究进展

2型糖尿病是多基因复杂病,具有高度遗传异质性,不同地区、不同种族人群的遗传背景不同,参与2型糖尿病发生的易感基因也不同。近年来单核苷酸多态性与2型糖尿病发病相关性研究的取得了一定的进展,但尚未发现任何一个SNP在所有人群中均与2型糖尿病相关联。本文拟就2型糖尿病相关易感基因单核苷酸多态性及其发病机制研究进展进行综述。     

The -137G/C single nucleotide polymorphism in IL-18 gene promoter contributes to tuberculosis susceptibility in Chinese Han population

BackgroundInterleukin (IL) -18 is crucial to host defense against mycobacterial infections. Recent studies have indicated IL-18 gene polymorphisms are associated with susceptibility to several clinical diseases.ObjectiveThe aim of this study is to investigate the association of IL-18 (-137G/C and -607C/A) gene promoter single nucleotide polymorphisms (SNPs) with susceptibility to tuberculosis (TB), and the effects of those SNPs to its protein producing capacity in Chinese Han population.Methods407 TB patients (including 113 children and 294 adults) and 469 healthy volunteers (including 167 children and 302 adults) from Chinese Han population were enrolled. The IL-18 gene promoter polymorphisms at positions of − 137 and − 607 were determined by sequence specific primer-polymerase chain reaction (SSP-PCR). The IL-18 levels in the supernatants of PBMCs from 46 healthy volunteers were measured by ELISA.ResultsThe gene distribution of IL-18 -137G/C and -607C/A showed none difference between adult and pediatric population. The frequency of IL-18 -137GG genotype was significantly higher in total TB group than that in total healthy control group (79.1% V 69.3%, P < 0.01), while the frequencies of GC genotype and C allele were conversely lower (19.2% V 27.9%, P < 0.01; 11.3% V 16.7%, P < 0.01 respectively). The difference of the -137CC genotype distribution between patients and controls was not observed. At the -607C/A polymorphic site, patient and control groups had a very similar gene distribution. Isolated PBMCs with IL-18 -137GC/CC genotype were able to produce a higher level of IL-18 than those with IL-18 -137GG genotype, either spontaneously or in response to PMA plus calcimycin A23187.ConclusionIL-18 -137G/C polymorphism contributed to TB susceptibility in Chinese Han population. Allele G might be a predisposing gene of TB, while allele C probably plays a role in preventing mycobacterium tuberculosis infection by promoting more vigorous protein expression.     

XRCC1基因单核苷酸多态性与铅毒性遗传易感性的关系

目的研究DNA修复基因XRCC1单核苷酸多态性与铅毒性易感性的关系。方法采集326名某蓄电池企业铅作业工人外周静脉血样品,检测血铅和血锌原卟啉(ZPP),采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)检测XRCC1基因型,分析不同基因型铅作业工人与铅毒性易感性的关系。结果 326名铅作业工人XRCC1基因分布呈现多态现象,各基因型的分布频率符合遗传学的Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);不同基因型组(XRCC1-194CC/CT+TT、XRCC1-280 GG/GA+AA、XRCC1-399GG/GA+AA)工人ZPP差异无统计学意义(P>0.05);XRCC1-194CT+TT基因型组工人平均血铅值高于XRCC1-241CC基因型组(P<0.05),而XRCC1-280GG/GA+AA、XRCC1-399GG/GA+AA基因型组工人平均血铅值差异无统计学意义(P>0.05);以血铅水平1.90μmol/L为界,经χ2检验、logistic回归分析显示,高铅组XRCC1-194CT+TT基因型的比例大于低铅组(P<0.05),XRCC1-194CT+TT基因型组工人较XRCC1-194CC基因型组工人高血铅发生率的风险明显增高(OR=2.78,95%CI=1.49～5.28)。结论XRCC1 Arg194Trp基因单核苷酸多态性与血铅升高有一定关联性,C→T多态性提高了接铅工人对铅毒性易感的风险性,XRCC1-194CT/TT基因型可能是铅毒性易感基因型;XRCC1 Arg280His和XRCC1 Arg399Gln多态性可能与铅毒性易感性无关。