GCK基因多态性与汉族人群血糖水平的关系研究

目的探讨GCK基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs2268576、rs2908297、rs2971676、rs4607517与汉族人群空腹血糖(FG)水平的关系。方法应用Taq Man探针技术在ABI V7平台上对293名健康体检者GCK基因的4个SNP位点进行基因分型,并进行关联分析。结果 SNP位点rs4607517基因型与FG水平存在线性相关性(P=0.002)。rs4607517位点AA组患者平均FG值(5.16 mmol/L±0.49 mmol/L)高于AG组(4.9 mmol/L±0.49 mmol/L)和GG组(4.81 mmol/L±0.41 mmol/L),差异具有统计学意义(P=0.025,P=0.002)。结论 GCK基因内SNP位点rs4607517与中国汉族人群FG水平的遗传易感性相关联。     

哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1调节相关蛋白基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联研究

目的探讨广西地区人群哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1调节相关蛋白基因(Regulatory Associated Protein Of m TOR,complex 1,RPTOR)潜在功能性单核苷酸多态性位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)与肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)遗传易感性的关系。方法采用以医院为基础的病例对照研究方法,以1 048例HCC患者和1 052例年龄、性别匹配的非肿瘤对照为研究对象,对候选的RPTOR基因潜在功能性SNPs(rs3751934CA、rs1062935 TC、rs3751932 TC及rs12602885 GA),应用Taqman-MGB荧光定量PCR方法进行基因分型。结果未发现RPTOR基因单个SNP位点与HCC遗传易感性之间存在显著性统计学关联;进一步按年龄、性别、民族、吸烟史、饮酒史和乙型肝炎病毒感染等因素进行分层分析,结果发现,在乙型肝炎病毒感染者中,RPTOR rs1062935多态性位点与HCC遗传易感性之间存在显著性统计学关联(OR=1.48,95%CI=1.01~2.18),而且该SNP位点与乙型肝炎病毒感染存在交互作用(Pinteraction=0.048)。结论本研究结果提示RPTOR基因rs1062935位点可能与HBV相关HCC的遗传易感性有关。     

钙蛋白酶10基因多态性与2型糖尿病的关联研究:Meta分析

目的 探讨钙蛋白酶10(CAPN10)基因SNP43、SNP44位点及主要单倍型、单倍型组合与2型糖尿病(T2DM)的关联性.方法 根据系统评价的原理和规范,检索PubMed及中文期刊数据库,纳入CAPN10基因与T2DM的病例对照研究.根据种族,采用分层Meta分析评估CAPN10基因多态性与T2DM的关联性.同时评估发表偏倚.结果 各种族与T2DM有关联的基因多态性分别是:蒙古人种,SNP43位点G等位基因OR=1.368(95%CI:1.155～1.620),G/G基因型OR=1.437(95%CI:1.186～1.741),111/221单倍型组合OR=2.762(95%CI:1.287～5.927);高加索人种,SNP44位点C等位基因OR=1.144(95%C1:1.023～1.278),111/111单倍型组合OR=1.291(95%CI:1.050～1.586);混血人种,SNP44位点C等位基因OR=1.653(95%CI:1.025～2.665).结论 SNP43位点G等位基因、G/G基因型、111/221单倍型组合是蒙古人种的危险因素;SNP44位点C等位基因、111/111单倍型组合是高加索人种的危险因素;SNP44位点C等位基因是混血人种的危险因素.     

CFH、CFB基因单核苷酸多态性与中国人老年黄斑变性的相关性研究

目的本实验通过对中国大陆汉族人CFH和CFB基因的多态性进行病例-对照研究。探寻补体旁路途径中相关基因变异与老年黄斑变性(AMD)的发生关系。方法收集200例湿性AMD患者,120例干性AMD患者,500例匹配的正常对照,采用SNaPshot方法对其CFH基因上的7个单核苷酸多态性位点(SNP)和CFB基因上两个SNP位点进行基因型检测,并进行关联分析和单倍体型分析。结果 CFH基因中的4个SNP位点与中国汉族人的湿性AMD有显著的相关性:rs3753394(P=0.0189),rs800292(P=0.0135),rs1061170(P=0.0036)和rs1329428(P=0.0054),该4个位点组成的单倍体型CATA对湿性AMD起到保护作用,其P=3.33E-05,OR=0.569(95%CI:0.434～0.746)。与目前报道的其他人群不同,CFH基因上的rs7535263、rs2274700和rs1410996这3个SNP在中国汉族人中未能发现与湿性AMD有相关。所有研究的CFH基因的SNP与中国人干性AMD无显著相关性。CFB基因单核苷酸多态性与中国人AMD的发生无关。结论通过实验,我们可证实CFH基因中的rs3753394、rs800292、rs1061170和rs1329428位点与中国汉族人的湿性AMD有显著的相关性;而rs7535263、rs2274700和rs1410996这3个SNP在中国汉族人中未能发现其与湿性AMD有相关;同时CFB基因与中国人AMD的发生无关。干性AMD与CFH、CFB基因单核苷酸多态性无关。     

MicroRNA基因单核苷酸多态性和DNA甲基化与儿童乙型肝炎疫苗无或低免疫应答的关联性

目的探讨MicroRNA基因单核苷酸多态性(SNP)和DNA甲基化与儿童乙型肝炎疫苗(HepB)无或低免疫应答的关联性。方法选取广西壮族自治区三家医院出生且已完成3剂HepB接种的8-9月龄儿童,采集血标本,开展乙型肝炎病毒(HBV)DNA含量和血清标志物检测、MicroRNA基因位点的基因型/等位基因SNP检测和DNA甲基化检测;比较HepB无/低应答和正常/高应答儿童MicroRNA基因位点的基因型/等位基因分布和DNA甲基化β值(中位数)。结果 miR196A2基因rs11614913位点的基因型(C/C、C/T、T/T)和等位基因(C、T)、miR499基因rs3746444位点的基因型(G/G、G/A、A/A)和等位基因(G、A)的分布在110名无/低应答和391名正常/高应答儿童之间均无显著性差异。miR196A2_2基因204位点、miR499B基因44、80、162位点的DNA甲基化β值在104名无/低应答和159名正常/高应答儿童之间均有显著性差异(0.028 vs 0.024,Z=-2.12,P=0.017;0.963 vs 0.956,Z=-2.43,P=0.007;0.965 vs 0.958,Z=-1.92,P=0.028;0.976 vs 0.973,Z=-1.93,P=0.027)。结论本研究中儿童HepB无/低免疫应答与MicroRNA基因SNP无显著性关联,而可能与miR196A2_2基因204位点、miR499B基因44、80和162位点的DNA甲基化存在关联。     

甲硫腺苷磷酸化酶基因单核苷酸多态性与汉族人群心肌梗死的关系

目的 探讨甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)基因单核苷酸多态性(SNP)与中国汉族人群心肌梗死(MI)的关系.方法 选取432例初发MI患者及430例同期住院的外科对照患者.选取MTAP基因9个标签SNP,采用PCR-SNP Stream技术对所选标签SNP位点进行分型.并对分型结果进行统计学分析.结果在总体样本中未发现所选SNP位点与MI患病存在关联,经性别分层后,在男性组rs7027989位点的G等位基因在MI组分布频率增高,差异有统计学意义(P=0.003);在显性遗传模型中,GG基因型较AG+AA基因型的男性对象患MI的风险增加了26%,差异有统计学意义(P=0.005),经校正混杂因素后其统计学显著性仍然存在.结论 MTAP基因同汉族人群MI患病相关.     

脂联素基因多态性与2型糖尿病的关联研究

目的探讨广东汉族人群中脂联素基因(ADIPOQ)的单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病的关联。方法采用SNPscanTM多重SNP分型试剂盒,对筛选的2个tagSNP(rs822396、rs3774261)在595名2型糖尿病患者和725名健康对照中进行基因分型,并应用χ2检验、Logistic回归模型等方法分析SNP位点与2型糖尿病的关联性。结果调整性别、BMI和甘油三酯等因素后,rs822396在等位基因关联分析和基因型关联分析中均无统计学意义(P0.05),rs3774261在等位基因关联分析中亦无统计学意义[P=0.077,OR(95%CI)=1.18(0.98,1.41)],但在显性模型下的基因型关联分析中有统计学意义[P=0.028,OR(95%CI)=1.36(1.03,1.79)]。结论在广东汉族人群中,rs822396与2型糖尿病无关联,rs3774261与2型糖尿病的遗传易感性有关,但其具体机制尚需进一步探讨。     

广东汉族人群GLUT4基因多态性与冠心病关系

目的探讨中国广东汉族人群葡萄糖转运蛋白-4(GLUT4)基因多态性与冠心病易感性之间的关系。方法采用多重单核苷酸多态性(SNP)分型试剂盒,对筛选的2个tag SNP位点(rs16956647、rs5435)在1 044例冠心病患者和1 349例非冠心病患者为对照进行基因分型;采用遗传分析软件Plink和统计分析软件SPSS 17.0分析SNP位点与冠心病的关联性。结果 SNP rs5435未满足Hardy-Weinberg平衡条件,予以剔除。校正性别、年龄、高血压、糖尿病、吸烟史、总胆固醇、甘油三酯、心率和体质指数后,rs16956647基因型与冠心病存在明显关联[加性模型:P=0.016,OR=0.80(95%CI=0.67~0.96);显性模型:P=0.002,OR=0.71(95%CI=0.57~0.89)]。进一步按是否患糖尿病分层后进行基因型关联分析,结果显示仅在糖尿病组rs16956647位点与冠心病呈显著关联[加性模型:P=0.048,OR=0.82(95%CI=0.67~0.99);显性模型:P=0.007,OR=0.72(95%CI=0.56~0.91)]。结论在中国广东汉族人群中,GLUT4基因多态性与冠心病易感性之间的关联可能与患者胰岛素抵抗有关。     

细胞周期信号通路相关基因单核苷酸多态性与肝细胞癌临床病理特征关系

目的探讨细胞周期信号通路相关基因CDC25C、CDKN2A(p16)、MCM4、MCM7、PARDC(DNA-PK)、RAD21、RBL2(p107)、YWHAB(14-3-3)、SMAD3、KAT2B、CHEK1单核苷酸多态性(SNP)与肝细胞癌(HCC)临床病理特征的关系,为HCC的预后预测提供科学依据。方法于2007年7月—2011年3月整群抽取在广西医科大学第一附属医院肝胆外科就诊和治疗的498例新发HCC患者进行相关流行病学调查和临床病理资料的收集,并采集其空腹静脉血提取血液样本DNA,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱方法对14个细胞周期信号通路相关基因SNP位点进行基因分型。结果在校正了年龄、性别、民族、HCC家族史、HBs Ag、吸烟和饮酒情况后,多因素非条件logistic回归分析结果显示,携带YWHAB基因rs2425675位点等位基因A基因型AG/AA患者的包膜侵犯风险为基因型GG患者的2.097倍(OR=2.097,95%CI=1.034~4.256);携带RBL2基因rs3929位点等位基因C基因型GC/CC患者的包膜侵犯风险为基因型GG患者的2.234倍(OR=2.234,95%CI=1.100~4.534);携带CDC25C基因rs3734166位点等位基因G基因型GA/GG患者的子灶发生风险为基因型AA患者的0.460倍(OR=0.460,95%CI=0.259~0.816),癌栓发生风险为基因型AA患者的0.651倍(OR=0.651,95%CI=0.439~0.965);携带CHEK1基因rs515255位点等位基因T基因型TC/TT患者的子灶发生风险为基因型CC患者的0.451倍(OR=0.451,95%CI=0.252~0.807),肿瘤数目多发的风险为基因型CC患者的0.655倍(OR=0.655,95%CI=0.442~0.971)。分层分析结果显示,YWHAB基因rs2425675位点在无HCC家族史、不吸烟、不饮酒的患者中,其SNP多态性与肝癌肿瘤包膜侵犯和假包膜的发生存在统计学关联(均P0.05);CDC25C基因rs3734166位点在无HCC家族史、不吸烟、不饮酒、HBs Ag阴性和阳性的患者中,其SNP多态性与子灶、癌栓、脉管侵犯和肝硬化的发生存在统计学关联(均P0.05);CHEK1基因rs515255位点在无HCC家族史、不吸烟、饮酒、不饮酒和HBs Ag阳性的患者中,其SNP多态性与包膜侵犯、子灶的发生和肿瘤数目多发存在统计学关联(均P0.05);RBL2基因rs3929位点在吸烟、不吸烟、饮酒、不饮酒和HBs Ag阴性患者中,其SNP多态性与包膜侵犯和脉管侵犯的发生存在统计学关联(均P0.05)。结论 YWHAB、RBL2、CDC25C和CHEK1基因SNP多态性可能与HCC的临床病理特征相关。     

Calpain10基因多态性与昆明地区人群2型糖尿病相关性研究

目的 探讨Calpain10基因多态性与昆明地区人群2型糖尿病遗传易感性的关系。方法采用病例-对照研究设计，以聚合酶链式反应-等位基因特异性扩增法（PCR-ASA），检测Calpain10基因单核苷酸多态性（SNP）43G／A位点和SNP44T／C位点基因型，并进行关联分析。结果 对131例2型糖尿病患者和131例正常对照进行了Calpain10基因SNP43和SNP44基因分型，与对照组相比，SNP43的G等位基因频率和SNP44的C等位基因频率在昆明地区2型糖尿病人群中显著升高（分别为93．13％，86．26％，P=0．0097；18．70％，9．92％，P=0．004）。结论 Calpain10基因SNP43位点G等位基因和SNP44位点C等位基因可能与昆明地区人群2型糖尿病的发病相关。