病例-同胞对照设计统计方法检验效能的比较研究

目的比较病例-同胞对照设计三种统计方法的检验效能。方法应用Monte-Carlo模拟方法,使用Slink软件产生的模拟家系资料,比较同胞-传递不平衡检验(s-TDT)、同胞组不平衡检验(SDT)和同胞对关联检验法(SAT)三种统计方法的检验效能。结果(1)SDT方法的I型误差最接近检验水准α=0.05;(2)在三种遗传模式中,s-TDT方法的效能最高,SAT方法的效能最低。结论病例-同胞对照设计使用患者的同胞作为对照,避免了人群分层现象,可以用来评价遗传因素与疾病之间的关联。     

TGFA基因多态性与NSCL/P的遗传易感性

目的:探讨中国汉族人TGFA基因的多态性对非综合征性唇腭裂的遗传易感性的作用。方法:76例核心家庭和60例正常对照儿童的TGFA基因型,采用病例对照研究和传递不平衡检验进行分析。结果:病例对照研究结果表示:(2χ=7.77,P<0.05),TDT(2χ=5.26,P<0.05))。结论:TGFA C2等位基因在NSCL/P中存在连锁不平衡,TGFA基因多态性可能是中国汉族人NSCL/P的遗传易感性因素。     

梅州地区TLR4基因连锁不平衡与缺血性脑卒中相关性研究

目的 检测梅州地区缺血性脑卒中患者和健康对照人群TLR4基因的（rs10759932、rs11536879、rs11536891、rs1927914）的基因多态性，经连锁不平衡分析其与缺血性脑卒中的相关性。方法 收集2018年1月1日 - 2018年7月31日住院治疗的突发缺血性脑卒中患者作为病例组，同期在体检中心收集健康人群作为对照组。应用Massarray SNP 分型技术检测两组患者TLR4基因的4个位点基因型，进行Hardy - Weinberg（H - W）平衡检测。采用不同模型分析上述位点不同基因型与脑梗死发病风险的相关性，并通过连锁不平衡分析其与缺血性脑卒中的相关性。结果 病例组纳入病例186名，对照组纳入健康人194名；4种SNP位点均符合H - W 平衡。rs1927914位点G/G基因型在对照组出现频率远远高于病例组（χ2 = 9.267，P＜0.05）。rs10759932位点T/T基因型在女性对照组中出现的频率显著高于男性[OR = 0.38 (0.18 - 0.81)，P＜0.05]。4个SNP位点之间均存在连锁不平衡，TGCG基因型组合在缺血性卒中男性患者出现的频率显著高于女性[OR = 3.54 (1.17 - 10.69)，P＜0.05]。结论 梅州地区rs1927914位点A＞G为保护性基因突变，可以降低缺血性脑卒中发生。4个位点的连锁不平衡与缺血性脑卒中发生存在部分性别差异，TGCG组合为男性人群的危险基因，脑卒中发生率显著升高。     

维生素D受体基因与广西壮族骨质疏松相关性研究

目的 探讨维生素D受体（VDR）基因4个单核苷酸多态性（SNPs）位点与壮族中老年人骨质疏松的关系。方法 选取骨量正常的113例壮族中老年和骨量减少的74例、骨质疏松的196例壮族中老年人合并为骨量减少病例组进行病例对照研究。采用KASP基因分型技术对壮族中老人VDR基因的4个位点（rs731236、rs7975323、rs2228570、rs1544410）进行基因分型。结果 壮族中老年人骨密度随年龄增长逐年下降,logistic回归结果显示年龄（P＜0.001,OR = 1.053）,去脂体重（P＜0.001,OR = 0.911）是影响壮族中老年人骨密度的主要因素。VDR基因4个位点均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律（P＞0.05）,rs2228570位点GG基因型与骨量减少风险相关（OR = 3.360,95%CI = 1.565～7.215,P = 0.002）,等位基因A和G相比差异具有统计学意义（P＜0.05）。rs7975323与rs731236位点呈完全连锁不平衡（D’= 1.000）,rs1544410与rs731236呈强连锁不平衡（D’= 0.638,r2 = 0.367）,rs1544410与rs7975323呈强连锁不平衡（D’= 0.799）。 结论 年龄、去脂体重是壮族中老年人骨密度的主要影响因素,VDR基因rs2228570位点的GG基因型是骨量减少的危险因素,等位基因G可能是骨质疏松的遗传易感基因,增加中老年人骨量减少、骨质疏松的发病风险。     

婴幼儿佝偻病VDR基因ApaI、BsmI位点多态性与连锁不平衡分析

目的 探讨婴幼儿佝偻病患者维生素D受体（VDR）基因ApaI、BsmI位点多态性分布特征及连锁不平衡关系及其与佝偻病的遗传易感因素.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对56例佝偻病患儿和76例健康对照儿进行VDR基因ApaI、BsmI位点多态性的检测,分析两组VDR基因型和等位基因频率及两位点间连锁不平衡的关系.结果 两组VDR基因ApaI、BsmI位点基因型频率分布比较差异均无统计学意义（P＞0.05）.VDR基因ApaI、BsmI 位点等位基因频率在两组人群中的分布差异均无统计学意义（P＞0.05）.ApaI与BsmI二位点连锁不平衡系（D＇=0.230,r2=0.01）.结论 VDR基因ApaI、BsmI位点的多态性与维生素D缺乏性佝偻病无明显关系,且两位点不存在连锁不平衡关系.     

病例父母亲对照研究

目的 介绍病例父母亲对照研究的设计及统计分析方法。方法 以TIVS7-2等位基因与人类神经管缺损关联研究为实例,采用单体型相对风险(HRR)分析、基因型相对风险(GRR)分析、传递/不平衡检验(TDT)等方法进行统计分析。结果 采用HRR分析,HRR=1.33(X~2=1.4618,P=0.2266);采用GRR分析,ψ_1=1.26,ψ_2=0.98(X_(2)~2=3.1809,P=0.2038);采用TDT其值为1.4516(P=0.2283)。提示TIVS7-2等位基因与神经管缺损有微弱关联,但HRR经检验差异均无统计学意义。结论 病例父母亲对照设计使用患者双亲作为对照,避免了人群分层现象,可以用来检测与疾病发病相关的基因及评价基因与环境暴露的交互作用。     

MPO和NAT2基因多态性与成人急性白血病易感性

目的研究髓过氧化物酶（MPO）和N-乙酰基转移酶2（NAT2）基因多态性与成人急性白血病易感性的关系.方法用1∶1配对病例-对照研究方法,收集成人急性白血病患者和对照各139例,应用聚合酶链-内切酶片段（PCR-RFLP）方法分析病例组和对照组MPO和NAT2的基因多态性,比较不同基因型与成人急性白血病易感性.结果 MPO-463A等位基因分布频率病例组低于对照组,MPO（G-463A）各基因型在病例组与对照组中的分布差异有统计学意义（χ^2=7.026,P〈0.05,OR=0.505,95%CI=0.325～0.847）.NAT2乙酰化表型频率在病例组与对照组的分布差异无统计学意义（χ^2=2.260,P〉0.05）;但NAT2＊5 481T等位基因和NAT2＊6 590A等位基因分布频率病例组高于对照组（P〈0.05）.结论 MPO与成人急性白血病易感性相关,携带MPO（G-463A）突变基因型（GA/AA）个体可降低白血病的发病风险;NAT2乙酰化表型可能与白血病的易感性无关,但NAT2＊5（C481T）、NAT2＊6（G590A）单核苷酸突变频率病例组明显高于对照组.     

MTHFR基因、CBS基因、环境因素与先天性心脏病的病例对照研究

目的 探讨父母亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因C677T、胱硫醚β-合酶（CBS）基因T833C、环境因素与子代先天性心脏病（CHD）发生之间的关联。方法 采用1：1配对病例对照研究方法，分析115对CHD患儿与对照儿父母的环境暴露因素，并检测其MTHFR与CBS基因型，对CHD可能的危险因素进行单因素及多因素条件logistic回归分析。结果 母亲怀孕早期接触农药（OR=8．62）、妊娠合并症（OR=2．069）、孕早期感冒（OR=4．125）、孕期情绪状况（OR=4．653）、母亲MTHFR基因677TT型（OR=3．872）共5个因素为予代发生CHD的危险因素。结论 母亲MTHFR基因677TT型与子代CHD发生有关，未发现父母CBS基因T833C与子代CHD存在关联，母亲怀孕早期接触农药、妊娠合并症、孕早期感冒、孕期情绪紧张或忧郁可能增加子代发生CHD的危险。     

对数线性模型在病例-父母对照研究中的应用

介绍应用对数线性模型分析病例-父母对照研究设计的方法.以亚甲基四氢叶酸还原酶基因(MTHFR)C677T与唇腭裂的关联研究为例,应用对数线性模型分析母亲、子代基因及其交互作用与唇腭裂的关系.结果显示变异型纯合子母亲的子代发生唇腭裂的风险低于野生型纯合子母亲的子代,S2=0.43 (95％CI:0.19 ～ 0.95),未发现唇腭裂与子代基因及母子交互作用相关.应用对数线性模型分析病例-父母对照研究设计的方法尤其适用于妊娠期疾病与源于胚胎时期疾病等的病因学研究.     

TRPV1 UTR-3基因多态性与北京汉族儿童哮喘的易感性研究

目的研究TRPV1 UTR-3基因多态性对北京汉族儿童哮喘易感性的影响。方法采用ISSAC统一问卷进行病例对照研究,从美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库选取TRPV1基因UTR-3区域rs58868916、rs9899485、rs4790521、rs4790522、rs402369及ENSSNP11193515作为目的SNP。通过PCR方法检测177名哮喘儿童、44名遗传性过敏症儿童及151名非哮喘对照儿童TRPV1基因多态性;通过Hardy-Weinberg平衡检验、卡方检验、连锁不平衡(LD)分析、Logistic回归分析和模型拟合,分析TRPV1基因SNP等位基因频率(MAF)、基因型及单倍型差异。结果Hardy-Weinberg平衡检验的P>0.05,满足基因型均衡要求;哮喘儿童与对照rs4790521T/C等位基因频率有显著差异(P<0.05);rs4790522A/C杂合子携带者哮喘患病风险显著低于纯合子A/A及C/C携带者(OR=0.588,95%CI=0.376～0.920,P<0.05),rs4790521隐性纯合子C/C携带者哮喘患病风险显著高于纯合子T/T及杂合子T/C携带者(OR=2.94,95%CI=1.32～6.53,P<0.01);LD分析显示rs4790521与rs4790522存在连锁不平衡(D’=0.959,r2=0.120),此2位点SNP构建出3个频率大于0.10的单倍型;通过Logistic逐步回归调整年龄、性别、家族遗传史及家庭成员吸烟等混杂因素后,rs4790521SNP的MAF、隐性纯合子C/C、及单倍型Hap2-C/C与儿童哮喘密切相关,是影响儿童哮喘易感性的重要危险因素,P值均小于0.05。结论TRPV1基因UTR-3多态性与中国北京汉族儿童哮喘易感性相关。     

MTHFR、MTRR基因多态性与多囊卵巢综合征的相关性研究

目的探讨亚甲四氢叶酸还原酶(MTHFR)、甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)基因多态性与多囊卵巢综合征(PCOS)的相关性。方法应用病例对照研究,收集2018年4月-2018年8月在广东省妇幼保健院就诊的育龄期PCOS患者55例为PCOS组,选取46例月经规则、有排卵,并完成一次生育的非PCOS患者作为对照组。在PCOS组中,按HOMA稳态模型(HOMA-IR)分为两组,PCOS胰岛素抵抗(PCOS-IR)组和PCOS非胰岛素抵抗(PCOS-NIR)组,按多毛评分标准(m FG score)和血清游离雄激素指数(FAI)分为两组,高雄激素症组和非高雄激素症组,分别提取血浆,利用荧光定量PCR方法检测MTHFR基因C677T、A1298C及MTRR基因A66G的单核苷酸多态性(SNPs),同时采用化学发光法检测两组血浆维生素B12、叶酸及同型半胱氨酸(HCY)的含量。结果MTHFR基因C677T等位基因C在PCOS组分布频率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),等位基因C使PCOS的风险增加2.077倍(95%CI:1.132~3.812)。677CC基因型在PCOS组的分布频率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),野生基因型(CC)与纯合突变基因型(TT)相比,患PCOS的风险提高了4.392倍(95%CI:1.005~19.196)。两组MTHFR基因A1298C、MTRR基因A66G各基因型和等位基因频率的分布差异无统计学意义(P>0.05)。在PCOS组中,PCOS-IR组和PCOS-NIR组以及高雄激素症组和非高雄激素症组在MTHFR基因C677T、A1298C及MTRR基因A66G各基因型分布差异无统计学意义(P>0.05),MTHFR C677T、A1298C及MTRR A66G位点分布之间不存在交互作用(P>0.05)。PCOS组中HCY水平较对照组明显升高,差异有统计学意义(P<0.05),两组血清维生素B12、叶酸水平差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论MTHFR基因C677T多态性与PCOS的发病有一定的相关性,CC基因型可增加PCOS的发生风险,但与胰岛素抵抗(IR)和高雄激素症的发生风险无关。MTHFR基因A1298C、MTRRA66G各基因型与PCOS的发生、IR及高雄激素症的发生无关,PCOS组HCY偏高。     

MTHFR基因C677T多态性与原因不明复发性自然流产的相关性

目的:检测MTHFR基因C677T多态性及其与原因不明复发性自然流产(Unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)的关系。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对非孕期URSA妇女159例及127例正常对照妇女进行MTHFR基因C677T等位基因检测,并对部分标本进行测序验证,计算患者组与对照组的基因型频率以及该多态性与URSA的相关性。结果:患者组与对照组T/T纯合子频率分别为37.1%(59/159)和16.5%(21/127),患者组与对照组T等位基因频率分别为62.9%(200/318)和47.2%(120/254),两组分别比较,差异均有统计学意义(P<0.01),对TT基因型与URSA的相关性分析表明,TT基因型妇女发生URSA的相对风险增加(OR=2.978,95%CI 1.678～5.256)。结论:MTHFR基因C677T多态性可能是山东地区URSA发病的遗传风险因素。     

贵阳市育龄女性MTHFR和MTRR基因多态性与自然流产的相关性分析

目的分析贵阳市育龄女性亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)、甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)基因多态性与自然流产的相关性,降低贵阳市育龄女性自然流产发生率。方法选取2016—2019年在贵阳市妇幼保健院进行孕前优生咨询的525例育龄女性为研究对象,按照有无自然流产史分为两组,病例组175例女性,对照组350例女性。比较两组育龄女性MTHFR C677T、A1298C及MTRR A66G基因型和等位基因分布。结果病例组MTHFR C677T野生基因型CC型69例(39.4%),杂合突变CT型76例(43.4%),纯合突变TT型30例(17.1%),对照组MTHFR C677T野生基因型CC型154例(44.0%),杂合突变CT型164例(46.9%),纯合突变TT型32例(9.1%),两组比较差异具有统计学意义(χ²=7.20,P<0.05);病例组的T等位基因频率为38.9%,较对照组T等位基因频率(32.6%)明显升高,差异有统计学意义(χ²=4.07,P<0.05)。两组MTHFR A1298C基因型分布比较差异无统计学意义(P...     

泸州汉族人群MTHFR基因多态性分布及育龄妇女该基因多态性与复发性流产相关性的研究

目的了解泸州市亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性分布情况以及该单核苷酸多态性与复发性流产的相关性。方法选取2016-2018年在西南医科大学附属医院进行MTHFR基因检测的泸州汉族人群691例为研究对象,利用PCR-微阵列基因芯片法检测其C677T单核苷酸多态性,统计得出3种基因型的频率以及等位基因频率,并与全国其他地区已报道的多态性分布特征进行比较。结果泸州汉族人群CC、CT与TT基因型频率分别为39.2%、46.7%、14.0%,T等位基因频率为37.4%。其中女性T等位基因频率为38.1%,基因分布与纬度相近地区(N25°~31°)差异无统计学意义(P>0.05),与南方的海南、惠州及北方的西安、银川、赤峰、烟台人群差异有统计学意义(P<0.05)。在泸州育龄妇女中,复发性流产与MTHFR C677T基因多态性暂未发现存在直接关联。结论泸州地区汉族人群的MTHFR基因分布具有西南地区的分布特征,T等位基因频率整体呈现出随着纬度升高而升高的趋势。     

MTHFRC677T基因多态性与复发性流产的关系

目的探讨亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,简称MTHFR)C677T基因多态性与复发性流产(recurrent abortion,简称RA)发病的相关性。方法采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析RA组60例和对照组60例MTHFRC677T的基因型。结果RA孕妇及胚胎绒毛组织MTHFR677TT基因型频率和T等位基因频率高于对照组(p<0.05);MTHFR677的3种基因型在流产组和对照组的分布差异有统计学意义(p<0.01),流产组CT TT基因型频率也高于对照组(p<0.05)。结论RA患者和胚胎绒毛组织MTHFR677TT突变与RA有相关性。     

胃癌亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性及其与微卫星不稳的关系

目的探讨胃癌亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因多态性与微卫星不稳的关系。方法采用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性技术检测122例胃癌和101名正常对照的MTHFR基因C677T和A1298C多态性；采用PCR为基础的方法检测微卫星不稳定性（MSI）。结果MTHFR C677T多态性可分为677CC、677CT和677TT三种类型。胃癌组3种基因型频率分别为47．5％、39．3％和13．1％；对照组分别为48．5％、42．6％和8．9％，两组相比差异无统计学意义（P〉0．05）。以677CC基因型做为参考，胃贲门癌677CT基因型OR值为0．38，95％CI：0．15～0．98；TT基因型OR值为0．26，95％CI：0．03～2．18；677CT＋TT基因型OR值为0．36，95％CI：0．07～0．98。胃体癌677TT基因型OR值为3．03，95％CI：1．07～8．65。MTHFR A1298C多态性可分为1298AA、1298AC和1298CC3种类型。胃癌组3种基因型频率分别为59．8％、36．1％和4．1％；对照组分别为57．4％，37．6％和5．0％，两组相比差异无统计学意义（P〉0．05）。以1298AA基因型的OR值为1．00，胃窦癌AC基因型的OR值为0．87，95％CI：0．42～1．82，CC基因型的OR值为0．41，95％CI：0．05～3．72。MTHFR 677TT基因型胃癌与微卫星不稳显著相关（P〈0．05），而MTHFR A1298C多态性与微卫星不稳无关（P〉0．05）。结论重庆地区人群中MTHFR C677T多态性是胃贲门癌的保护因素，是胃体癌的危险因素；MTHFR A1298C多态性可能是胃窦癌的保护因素；677TT基因型胃癌的发生可能涉及到MSI途径。     

MTHFRC677T基因多态性与复发性流产的关系

目的探讨亚甲基四氢叶酸还原酶（methylenetetrahydrofolate reductase，简称MTHFR）C677T基因多态性与复发性流产（recurrent abortion，简称RA）发病的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）分析RA组60例和对照组60例MTHFRC677T的基因型。结果RA孕妇及胚胎绒毛组织MTHFR677TT基因型频率和T等位基因频率高于对照组（p〈0．05）；MTHFR677的3种基因型在流产组和对照组的分布差异有统计学意义（p〈0．01），流产组CT＋TT基因型频率也高于对照组（p〈0．05）。结论RA患者和胚胎绒毛组织MTHFR677TT突变与RA有相关性。     

亚甲基四氢叶酸还原酶和甲硫氨酸合成酶还原酶基因多态性研究

目的:探讨编码叶酸代谢通路中关键酶的基因多态性与新生儿神经管缺陷(NTDs)间的关联性,及在部分中国女性人群中的分布特征,从而指导孕期叶酸补充和风险监测。方法:采用循证医学方法对5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C和甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G与NTDs的关联性进行Meta分析,并在中国的北方(山东、河南)和南方(四川、海南)地区进行了1 017例样本的分子流行病学研究。结果:MTHFR C677T位点TT基因型相对于CC型的比值比为3.35(95%CI:1.39～8.13),TT型在北方和南方女性人群中的频率分别为37.35%和10.44%,差异有统计学意义;MTHFR A1298C和MTRR A66G虽然从生物学机制上与NTDs的发生密切相关,但尚需进行大规模的人群研究。结论:基于MTHFR和MTRR多态性检测的孕期叶酸补充指导和监测将是进一步降低新生儿出生缺陷的重要方法。     

佛山市汉族人群叶酸代谢通路关键酶基因MTHFR C677T多态性分布特征调查

目的 调查佛山市体检人群叶酸代谢障碍关键酶基因5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T位点基因多态性分布情况。方法 以佛山市182位女性和120位男性为研究对象,均为汉族人群,检测其MTHFR C677T基因位点多态性,分析性别、地域与基因多态性分布特征的关系。结果 调查的302例佛山市汉族人群MTHFR C677T位点CC、CT、TT基因型所占比例分别为62.6%、31.8%、5.6%,等位基因C、T所占比例分别为78.5%、21.5%。佛山市汉族男性与汉族女性MTHFR C677T位点多态性分布情况差异无统计学意义(P＞0.05)。佛山市汉族人群与已有数据报道的武汉、西安、长治、青岛、北京、乌鲁木齐等地的汉族人群的MTHFR C677T位点基因型、等位基因的分布情况差异均有统计学意义(P＜0.05)。佛山市汉族人群与回族、蒙族、维吾尔族、苗族MTHFR C677T位点基因型、等位基因的分布情况差异有统计学意义(P＜0.05),与布依族差异无统计学意义(P＞0.05)。结论 佛山市汉族人群MTHFR C677T位点多态性分布情况与其他地区、其他民族有显著差异,在实施个性化日常保健措施时可将遗传因素纳入考虑。     

叶酸代谢相关基因MTHFR、MS基因多态与胰腺癌风险关联

目的 探讨亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）及甲硫氨酸合成酶（MS）基因多态与胰腺癌风险的关系.方法 采用以医院为基础的病例对照研究（胰腺癌新发病例101例,对照337人）方法,进行MTHFR C677T、A1298C及MS A2756G基因多态与胰腺癌风险关联分析,采用PCR-RFLP方法进行两候选基因分型.结果 携带MTHFR-677 CT及TT基因型者发生胰腺癌风险是CC基因型个体的2.17（95%CI：1.26～3.85）及3.53（95%CI：1.85～6.84）倍,呈明显的等位基因-效应关系;未观察到MTHFR 1298多态单独对胰腺癌发生的影响,但发现它与C677T有联合作用.MTHFR677CT与TT基因型与吸烟、饮酒有明显的正向交互,产生交互作用的ORint值分别为1.78（P=0.0010）和2.10（P=0.0051）.未发现MS A2756G多态与胰腺癌的发生之间存在统计学的显著关联.结论 MTHFR C677T多态与胰腺癌发生风险显著关联,且与吸烟、饮酒存在正向交互作用.