单核细胞增生性李斯特菌PCR快速检测方法建立及应用

目的　通过扩增hly基因PCR法建立快速检测单核细胞增生性李斯特氏菌 (Lm )方法。 方法 :用PCR法扩增hly基因来检测标准菌株及临床分离的Lm的纯培养物和模拟污染的生猪肉、水和牛奶 ,并应用于实际食品检验工作中进行验证。结果　 34株Lm的PCR结果呈阳性 ,而其它李斯特菌 ,包括英诺克李斯特菌、绵羊李斯特菌、西尔李斯特菌、威儿李斯特菌和格氏李斯特菌以及非李斯特菌均未出现特异性的片段。表明所扩增的hly基因 3’末段 82 7bp的DNA片段对Lm具有较高的特异性。PCR法对Lm纯培养物的检测限达 10 5CFU/ml,对模拟污染生猪肉、水和牛奶的 30℃ 16h改良LEB增菌培养液用PCR法检测 ,结果检测限达 10CFU/ 2 5 g(ml)。进一步研究表明该PCR扩增体系能检测出 6 .5pg的LmDNA ,整个检测过程只需 2 4h。采用该法对扬州市区 16 9份食品样品检测 ,8份样品Lm呈阳性且结果与传统的生化鉴定方法完全一致。结论　扩增hly基因的PCR法对Lm的鉴定具有特异性强、灵敏度高、速度快和易操作等优点 ,可用于食品的Lm的分离     

沙门氏菌的invA基因序列分析与分子检测

目的采用聚合酶链反应和DNA序列分析,了解沙门氏菌侵袭蛋白A(invasionproteinA,invA)基因核苷酸序列有何差异,建立沙门氏菌的分子快速检测方法。方法根据沙门氏菌的invA基因核苷酸序列设计一对引物,应用聚合酶链反应技术,分别对3种沙门氏菌标准菌株的invA基因及6种非沙门氏菌株进行PCR扩增,并将扩增的片段进行克隆及序列分析。结果3种沙门氏菌标准菌株PCR均扩增出283bp的特异条带,非沙门氏菌皆无特异带扩增;DNA序列分析证实,沙门氏菌的invA基因核苷酸序列比较保守。结论本研究建立的检测沙门氏菌方法具有较高的特异性与灵敏性,invA基因的序列分析为进一步研究沙门氏菌不同分离株的流行病学、遗传学与分子致病机理奠定了基础。     

blaOXA-51-like碳青霉烯酶基因PCR扩增用于鲍曼不动杆菌检测的可行性评价

目的分析blaOXA-51-like碳青霉烯酶基因PCR扩增用于鲍曼不动杆菌检测和鉴定的可行性。方法PCR扩增105株不动杆菌的blaOXA-51-like碳青霉烯酶基因,并对检测的特异性进行评估。结果PCR检测82株鲍曼不动杆菌blaOXA-51-like碳青霉烯酶基因均阳性,但其中1株PCR产物比预期大（1 664 bp）;测序发现blaOXA-51-like碳青霉烯酶基因中包含一段1 308 bp的插入序列。不动杆菌属其他菌株blaOXA-51-like碳青霉烯酶基因PCR检测均阴性。若以353 bp扩增带作为blaOXA-51-like碳青霉烯酶基因PCR阳性标准,检测的敏感度和特异度分别为98.9%和100%;若以出现PCR扩增条带为阳性标准,则检测的敏感度和特异度均为100%。结论blaOXA-51-like碳青霉烯酶基因PCR扩增用于检测鲍曼不动杆菌特异性较高,但如果仅从扩增片段长度判断,存在出现假阴性的可能。     

恶性肿瘤患者念珠菌感染临床分离株的基因型特征研究

目的建立常见病原念珠菌种间分型方法和白色念珠菌种内的基因分型方法,为临床念珠菌感染的分子诊断和白色念珠菌分子流行病学研究提供依据。方法收集恶性肿瘤念珠菌感染临床株,应用PCR技术扩增念珠菌rDNA的内转录间隔区ITS1-ITS2,根据PCR产物片段的大小进行念珠菌种间分型;采用PCR方法扩增白色念珠菌25S rDNA基因内含子区,以内含子大小及其中可转座I型内含子片段的缺失或插入作为分型依据,对白色念珠菌进行种内基因分型,并对白色念珠菌不同基因型的药敏结果进行分析。结果78株恶性肿瘤患者念珠菌感染临床株依据PCR电泳图谱和科玛嘉显色培养基结果分4种:白色念珠菌58株,大小218 bp;光滑念珠菌10株,大小480 bp;热带念珠菌7株,大小219 bp;克柔念珠菌3株,大小150 bp。临床分离的58株白色念珠菌经PCR方法分为3型:A型32株(450 bp),B型19株(840 bp),C型7株(450、840 bp)。A、B型为主要基因型,B型和C型白色念珠菌对5氟-胞嘧啶的敏感性高于A型。结论PCR方法用于念珠菌种间与种内分型,快速简捷、特异性强、重复性好,比较适合临床念珠菌的分型研究。     

结核分枝杆菌和牛分枝杆菌的二重PCR快速检测

目的建立一种鉴别结核分枝杆菌和牛分枝杆菌的二重PCR快速检测方法。方法根据已发表的结核分枝杆菌23SrRNA和牛分枝杆菌特殊基因序列,设计并合成了两对可扩增结核分枝杆菌和牛分枝杆菌特异性基因片段的引物,建立二重PCR快速检测结核分枝杆菌和牛分枝杆菌的方法,测定其特异性和敏感性,并对238份牛临床样品的DNA分别进行了检测。结果该方法对牛分枝杆菌能扩增出838bp和631bp的特异性基因片段,结核分枝杆菌只扩增出838bp基因片段而扩增不出631bp的特异性基因片段,对参试的其它牛菌株的DNA扩增结果均为阴性。敏感度检测可达到50pg的DNA含量。临床样品检测结核分枝杆菌阳性有21份,牛分枝杆菌阳性有1份,其它临床样品扩增结果全部为阴性。结论本方法可作为牛分枝杆菌的快速检测和流行病学调查的工具。     

多重PCR快速检测鉴别牛布鲁氏菌和牛分枝杆菌的研究与应用

目的利用多重PCR方法建立一种同时快速检测鉴别牛布鲁氏菌和牛分枝杆菌的方法。方法根据牛布鲁氏菌具有种特异性的BCSP-31K基因和牛分枝杆菌23SrRNA，设计并合成了两对分别扩增牛布鲁氏菌和牛分枝杆菌的特异性引物，建立了多重PCR同时快速检测鉴别以上两种病原体的方法。其扩增片段大小牛布鲁氏菌为311bp、牛分枝杆菌为838bp。对所建立的多重PCR方法进行特异性试验和敏感性试验。并应用所建立的方法对临床样品进行检测。结果该多重PCR方法对所有供试的牛布鲁氏菌都能扩增出311bp，结核分枝杆菌都能扩增出838bp目的片段，对其它参试牛的菌株则无311bp和838bp条带，该多重PCR方法对牛布鲁氏菌和牛分枝杆菌的DNA最低检出量为10pg。305份临床样品中10份牛奶样品为牛布鲁氏菌阳性，41份包括36份PPD阳性鼻粘液样品、3份PPD可疑鼻粘液样品和2份PPD阳性牛奶样品为牛分枝杆菌阳性，其余样品均为阴性。     

一种基于momp基因的衣原体分子生物学甄别技术的初步建立

目的利用PCR方法建立一种基于momp基因的衣原体分子甄别方法。方法根据衣原体momp基因的恒定区和可变区分别设计衣原体科特异性引物和种特异性引物，利用PCR方法对本实验室保存的衣原体进行扩增，以达到甄别的目的。利用限制性片段长度多态性（RFLP）分析科特异性PCR扩增产物，研究momp基因的多态性。结果利用建立的PCR方法对本实验室保存的九株衣原体进行了研究，结果表明八株衣原体都是鹦鹉热嗜衣原体，一株为沙眼衣原体。利用限制性片段长度多态性（RFLP）分析科特异性PCR扩增产物，分析了D34、B11001、CW2和CP12四株衣原体，结果可以产生两种不同的带型。结论利用建立的PCR方法可以达到检测甄别衣原体的目的，并可以通过RFLP分析衣原体的侵袭性。     

应用多重PCR方法快速鉴定结核分枝杆菌复合群与非结核分枝杆菌的研究

目的 建立并评估快速鉴定结核分枝杆菌复合群（MTBC）与非结核分枝杆菌（NTM）的多重PCR方法。 方法 应用分别针对MTBC的oxyR-ahpC基因间隔区、MTBC和NTM的rpoB基因可变区的3对分枝杆菌特异性引物进行多重PCR扩增,扩增产物分别为473 bp、235 bp和136 bp。应用该多重PCR方法对6株MTBC标准株、50株NTM标准株、312株MTBC临床分离株和300株NTM临床分离株进行了初步菌种鉴定。 结果 经多重PCR 扩增后进行凝胶电泳,MTBC标准株473 bp和235 bp片段均可见,NTM标准株仅见136 bp片段。312株MTBC临床分离株中,310株扩增出473 bp和235 bp片段,敏感度为99.36%（310/312）,特异度为99.32%（294/296）;300株NTM临床分离株中,294株扩增出136 bp片段,敏感度为98.00%（294/300）,特异度为100.00%（310/310）。 结论 该多重PCR方法可检测并鉴别MTBC及NTM,具有高度的特异度和敏感度,有可能作为鉴别MTBC与NTM的有价值的检测手段。     

人工喷泉中一株军团菌的系统遗传学鉴定

目的检测喷泉水中的1株军团菌并进行分子生物学鉴定和系统发育分析。方法采集潍坊市一处人工喷泉水水样,用细菌基因组试剂盒提取水样中的总细菌基因组DNA,使用针对军团菌属16S rRNA基因片段的特异性引物PCR扩增军团菌属16S rRNA基因片段并测序,与从GenBank获得的另外41株军团菌的16S rRNA的基因序列进行对比分析,采用PAUP*4.0b10软件对16S rRNA基因片段序列数据矩阵进行最大简约法分析并绘制基因进化树。结果 PCR扩增喷泉水提取物中军团菌属特异性16S rRNA基因片段,片段碱基数654 bp。测序分析该菌株(命名为WF-B)的16S rRNA基因序列与Legionella beliardensis 16S rRNA基因序列的遗传距离较近,相似度达99.8%,在构建的最大简约进化树中该菌与L.beliardensis以自检值97%聚类为一枝。结论该喷泉水中检出的军团菌WF-B与L.beliardensis的亲缘关系较近,相关部门应加强监管力度,降低其感染风险。     

动物源性肠出血性大肠杆菌O157︰H7及其三个毒力基因的多重PCR快速检测研究

目的 建立快速、特异的分离鉴定大肠杆菌O157︰H7及其三个主要毒力基因（hylA、eaeA和stx2基因）的多重PCR方法。方法 根据GenBank公布的大肠杆菌O157︰H7菌体抗原rfbE基因、鞭毛抗原fliC基因、溶血素（hlyA） 基因、紧密黏附素（eaeA）基因和志贺样毒素2 （stx2） 基因为靶基因,设计5对特异性引物,在同一扩增体系中进行PCR,优化反应体系,测定特异性和灵敏度,并进行了临床样品的检测。结果 该方法扩增目的基因片段分别为327 bp、247 bp、494 bp、384 bp和779 bp,特异性和灵敏度均高,细菌纯培养物的检测灵敏度为104 cfu/mL。结论 初步建立了快速、灵敏、特异的检测肠出血性大肠杆菌O157︰H7及其三个毒力基因的多重PCR方法,可用于临床动物携带大肠杆菌O157︰H7的分子流行病学调查及食品微生物检测。     

单核细胞增生性李斯特氏菌溶血素基因克隆及原核表达载体构建

目的　构建单核细胞增生性李斯特氏菌 (Listeriamonocytogenes,LMO)溶血素基因重组表达质粒。 方法　本文采用PCR方法扩增出LMO 0 5 86株溶血素 (Hemolysin ,hly)基因 ,将其克隆到pMD18-T中 ,筛选带有插入片段的阳性质粒。经酶切和PCR鉴定 ,然后进行测序。继而用SalⅠ和XbaⅠ双酶切阳性质粒 ,目的片段定向插入pPROEXTMHTa中进行鉴定。结果　hly基因体外扩增产物大小约为 16 4 6bp。核苷酸序列鉴定后 ,其核苷酸序列与国外报道的LMOF6 789株、LMOF2 36 5株同源性分别为 99 70 %和 99 39%。推导出的氨基酸序列与其相应菌株比较 ,同源性分别为 99 82 %和 98 90 %。重组表达质粒经PCR及酶切鉴定表明为正确重组子。结论　在国内首次克隆到LMOhly全基因 ,并构建出含hly基因的原核表达载体。此项工作为进一步LMO溶血素基因的表达奠定了基础。     

产单核细胞李斯特菌减毒候选菌株分子生物学特性研究

目的为了确定用于减毒的产单核细胞李斯特菌菌株,对初筛入选的血清型为1/2a菌株Lm1、Lm2、Lm3和Lm4的分子生物学特性进行了比较研究。方法利用PCR技术均成功地扩增出4株菌株的hly基因及actA和plcB基因片段。以LD50的测定试验作为菌株毒力指征,对4株菌株的毒力进行了测定。结果4株菌株均为强毒菌株,其中菌株Lm4的毒力最强,用BALB/c小鼠测得的LD50为1.47×104CFU。结论确定以Lm4作为候选菌株。     

2014-2019年阜阳市食品和病人分离单增李斯特菌的分子特征分析

目的 比较分析阜阳市食品和病人分离单增李斯特菌的毒力基因、分子型别,建立阜阳市单增李斯特菌分子特征信息数据库,为防控单增李斯特菌病提供科学依据。方法 对阜阳市2014-2019年分离自食品和病人的55株单增李斯特菌,用聚合酶链反应(PCR)检测其毒力基因prfA、plcB、hly、actA、iap、inlA;用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术进行分子分型及同源性分析;用多位点序列分型(MLST)技术进行分子分型和聚类分析。结果 55株单增李斯特菌全部携带prfA、plcB、hly、actA、iap、inlA基因;PFGE将其分为21个带型,相似度60.3%~100%;MLST将其分为14个ST型,ST9型为优势型别;3株病人分离菌株的PFGE带型和ST型互不相同,其中2株病人来源菌株分别与食品分离株具有相同PFGE带型和ST型。结论 阜阳市食品和病人中分离的单增李斯特菌均携带6个毒力基因,食品分离菌株的分子型别呈现出多样性,其中存在同型别单增李斯特菌持续性污染现象,病人分离菌株具有与食品来源菌株相同的PFGE带型和ST型,提示食源性感染的风险较高。     

单核细胞增生性李斯特菌溶血素基因的原核表达

目的为获得大量的单核细胞增生性李斯特氏菌（Listeria monocytogenes，Lmo）溶血素（Hemolysin，hty）蛋白，以便研制Lmo诊断试剂及其在疫苗研制方面的作用。方法本文应用Primer Premier5．00设计引物，引入13amHI和x幻工酶切位点。以前期合成构建的pMDl8-T-hly质粒为模板，通过PCR方法扩增出Lmo0586株溶血素基因。相应酶切后，克隆到原核表达载体pGEX-6p-1中，构建pGEX-6p-hly重组质粒，转化入大肠杆菌BL21（DE3）进行表达。带有重组质粒pGEX-6p-hly的大肠杆菌BL21（DE3）经IPTG诱导后，进行SDS-PAGE及免疫印记分析。结果PCR体外扩增hly基因产物大小约为1624bp，成功构建了重组表达质粒pGEX-6p—hly；SDS-PAGE显示蛋白表达带的分子量约为72ku，重组蛋白主要以包涵体形式表达。表达量占菌体总蛋白的20．8％；Western免疫印记表明具有良好的反应原性。结论在国内首次构建重组质粒pGEX-6p-hly，并以融合蛋白的形式进行了高效表达，同时该蛋白具有特异的抗原反应性，为研制Lmo诊断试剂及其在疫苗研制中的作用奠定了基础。     

The pathogenic potential of different pulsed-field gel electrophoresis types of Listeria monocytogenes strains isolated from food in Northeast Bosnia and Herzegovina

Listeria monocytogenes is often present in meat and meat products that are sold in the area of northeast Bosnia and Herzegovina. The major objective of this study was to examine the virulence of L. monocytogenes strains isolated from these types of food in that geographic area. Polymerase chain reaction was used to detect eight genes responsible for virulence of this pathogen, namely, prfA, inlA, inlB, hly, plcA, plcB, actA, and mpl. All examined isolates were confirmed to possess the eight virulence genes. Ten different pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) macrorestriction profiles were recognized among 19 L. monocytogenes strains after restriction with two different endonucleases (ApaI and AscI). The pathogenicity of three different PFGE types of L. monocytogenes was confirmed through in vivo tests, which were performed on female white mice (Pasteur strain), and it ranged from 3.55 × 10(8) LD50 to 1.58 × 10(10) LD50. All of the three different PFGE types of L. monocytogenes were regarded as moderately virulent in relation to the reference strain L. monocytogenes Scott A. This result might be one of the reasons for the absence of reported listeriosis in northeast Bosnia and Herzegovina, despite the high degree of food contamination with this pathogen.     

Inefficient replication of Listeria innocua in the cytosol of mammalian cells

The efficiency of adherence to, internalization by, and replication in the cytosol of J774 macrophages and HEp-2 epithelial cells was compared between a nonspreading Listeria monocytogenes actA mutant and L. innocua. The studied L. innocua strains were equipped either with listeriolysin alone or with listeriolysin O (LLO) and the recently identified hexose-phosphate transporter of L. monocytogenes. All listerial strains expressed green fluorescent protein (GFP) under the control of the PrfA-dependent actA promoter. GFP expression was observed exclusively in the cytosol of host cells. Escape from the phagosome of LLO-expressing L. innocua strains was as efficient as that from L. monocytogenes. hpt-positive L. innocua showed significantly enhanced adherence to HEp-2 cells, but internalization was only slightly increased, compared with hpt-negative L. innocua. Subsequent replication of L. monocytogenes in the cytosol of the host cells proceeded within the next 6 h in most infected host cells, with a generation time <40 min. L. innocua prfA hly replicated more slowly (with a generation time of 60-90 min), and, in most host cells, bacterial replication stopped after 2-3 rounds of replication. In some cells, bacterial replication did not occur. Twenty-four hours after infection, the majority of J774 cells (>90%) infected with L. monocytogenes actA were dead, whereas most host cells infected with L. innocua were still alive. L. innocua equipped with the prfA, hly, and hpt genes of L. monocytogenes did not show significantly increased cytosolic replication, which indicates that expression of this sugar phosphate uptake system is not sufficient for extensive listerial replication in the cytosol of host cells.     

合肥市市售猪肉产单核细胞李斯特菌分离及hly基因序列分析

目的了解市售猪肉中产单核细胞李斯特菌(Lm)的污染状况及Lm分离菌株hly基因部分序列的分析比较。方法菌株分离鉴定应用多聚酶链反应(PCR);PCR产物直接测序,对780bp片段作序列分析。结果市售猪肉产单核细胞李斯特菌的污染率为1.17%(2/170);分离菌株WLD1和FCY1与国内外14个参考菌株的同源性分别为96.4～98.6%和95.0%～97.2%,而两者之间的同源性仅为95.9%。结论合肥市市售猪肉中有一定程度产单核细胞李斯特菌的污染,且存在李斯特菌病的可能性和食物中毒的潜在危险;分离菌株WLD1和FCY1,尤其是FCY1分化程度较高,Lmhly基因核苷酸序列差异的距离与地理分布、菌株的样品来源无一定的相关性。     

沙门菌、产单核细胞李斯特菌多重PCR检测方法的建立及应用

目的建立沙门菌、产单核细胞李斯特菌多重PCR检测方法,提高检测效率和敏感性。方法选择沙门菌组氨酸转运操纵子基因、产单核细胞李斯特菌溶血素基因序列设计引物,在单一PCR方法基础上,建立检测两种病原菌的多重PCR技术。结果在495bp和850bp处分别出现预期的特异性DNA扩增条带,敏感性试验显示该体系能检测出32pg的沙门菌DNA和274pg的李斯特菌DNA,样品检测表明该方法与单一PCR和国标方法的符合率达100%。结论本研究建立了能同时检测沙门菌和产单核细胞李斯特菌的多重PCR技术,为主要食源性病原菌快速检测提供了新方法。     

寡核苷酸芯片技术检测5种临床肠道病原菌的研究

背景：寡核苷酸芯片是一种检测病原菌的新技术，具有高通量、特异性等特点。目的：采用寡核苷酸芯片技术建立对5种临床常见肠道病原菌（霍乱弧菌、空肠弯曲杆菌、志贺菌、耶尔森菌、单核细胞增生利斯特菌）进行快速、准确鉴定和检测的方法。方法：选取16SrDNA作为检测靶基因，设计通用引物和寡核苷酸探针。病原菌基因组DNA通过16SrDNA通用引物行聚合酶链反应（PCR），扩增后与芯片上的探针杂交。结果：霍乱弧菌、空肠弯曲杆菌、志贺菌、耶尔森菌、单核细胞增生利斯特菌的杂交信号均很强，其他细菌无杂交信号。寡核苷酸芯片的检测时间约5h，其敏感性可达10^3CFU／ml。寡核苷酸芯片对23例临床腹泻样本的检测结果与传统细菌学培养结果完全一致。结论：寡核苷酸芯片的特异性、稳定性、重复性均较好，是检测临床肠道病原菌准确、可靠、实用性强的方法。