HCV基因型在流行病和临床上的意义

近年来丙型肝炎病毒（Hepatitis C Virus,HCV）基因型愈来愈受到大家的关注,Simmonds分型法现在应用最为广泛,其分布不仅具有明显的“三间”流行病学特征,而且研究还发现HCV基因型存在多种生物学活性,与传播途径、临床类型、肝病严重程度、临床多样性、抗病毒疗效和疫苗的研发等密切相关。故本文就从HCV基因分型及在流行病和临床上的意义作一概述。     

合肥地区血透患者及献血员丙肝病毒感染者HCV基因分布

目的：通过对合肥地区血透患者及献血员丙肝病毒感者ＨＣＶ基因分布的调查,了解合肥地区ＨＣＶ基因型分布,从而为丙型病毒性肝炎的防治提供依据。方法：采用异硫氰酸胍一步法提取核酸,将ＰＣＲ产物在２％琼脂糖凝胶中电泳,溴乙碇染色,置紫外灯下判断结果。结果：８４例抗－ＨＣＶ阳性者,ＨＣＶＲＮＡ阳性者为６１例,６１例中ＨＣＶ－Ⅱ６０例占９８．３６ ％,ＨＣＶ－Ⅲ只有１例,占１．６４ ％。结论：表明合肥地区ＨＣＶ 感染以Ⅰｂ／Ⅱ占绝大多数,未见混合感染和其他基因型。     

套式PCR检测新疆地区不同人群HCV基因型

对采自新疆地区不同人群１１２２份血清分别进行抗－ＨＣＶ ＥＬＩＳＡ和ＨＣＸＶ ＲＮＡ基因型检测，结果显示：该地区自然人群，职业献血员，肝硬变和肝细胞癌患者抗－ＨＣＶ阳性率分别为２．０％，３５．７％，４２．５％及２０．８％，该人群ＨＣＶ基因型以混合型感染为主，单一基因型感染以Ⅱ型为主。     

衡阳地区HCV基因型分布特征及DAA应用的疗效观察

目的了解衡阳地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布特征,观察直接抗病毒药物(DAA)对不同基因型丙型肝炎的治疗效果。方法对衡阳地区1 148例HCV患者进行基因分型检测及分析,并对133例应用DAA治疗的慢性丙型肝炎患者定期进行血清病毒含量和生化指标检测,观察不同基因型患者抗病毒治疗的应答情况。结果衡阳地区检测出4种HCV基因型(1、2、3、6)和7种基因亚型(1a、1b、2a、3a、3b、6a、6n),以1b型为主。在DAA治疗的HCV患者中,1b型和非1b型获得的病毒学应答率分别为98.78%和100.00%;生化学应答率均为100.00%。结论衡阳地区HCV感染以1b型为主,且女性高于男性,年龄≥50岁患者高于年龄＜50岁患者。DAA治疗不同基因型慢性HCV均能获得高持续病毒学应答,且疗效显著。     

广州地区无偿献血人群HCV的基因分型研究

目的 探讨广州地区无偿献血人群中丙型肝炎病毒(HCV)基因型(亚型)的分布.方法 从无偿献血人群中收集HCV RNA阳性标本,通过RT-PCR扩增NS5B基因,阳性结果进行核苷酸序列测定,然后与GenBank中已知序列进行比较和分子进化分析,以确定HCV基因型(亚型).结果 对广州地区69例HCVRNA阳性血液标本进行NS5B基因扩增,扩增阳性67例,其中lb占37.31%(25/67),2a占 4.48%(3/67),3a占7.46%(5/67),3b占4.48%(3/67),6a占44.78%(30/67),6n占1.49%(1/67).结论 HCVlb和6a为广州地区无偿献血人群中流行的主要基因型(亚型).     

联合分析HCV种属信息区和高度保守区序列确定广东地区HCV基因型和亚型

目的扩增HCV种属信息区NS5B和高度保守区5-UTR基因序列,用系统进化树法深入分析HCV基因型和亚型,阐明广东地区丙型肝炎患者HCV基因型和基因亚型的特点。方法采集99例慢性丙型肝炎病例血清,应用RT-PCR技术分别扩增HCVNS5B区和5-UTR特定片段,测序后进行系统进化树分析,确定HCV基因型及亚型。结果99例患者标本均准确分型,其中NS5B区段分型74例,5-UTR区段分型99例。HCV基因型和亚型的分布:1a亚型1例、1b亚型59例、1型7例、2a亚型11例、3a亚型3例、3b亚型2例、3型3例、6a亚型13例;另有2例标本在两区段分型不同,5-UTR/NS5B区段分型分别为6a/1b和3a/1b。两区段共同分型74例,72例标本在两区段基因型一致,2例标本在两区段基因型不同,为HCV重组体。结论联合分析HCV不同区段基因序列,可提高HCV基因分型的准确度及灵敏性。广东地区慢性丙型肝炎患者HCV基因亚型分布以1b为主;其次为6a和2a;3型中的a、b亚型也占有一定比例。     

系统进化树分析慢性丙型肝炎患者HCV基因分型

目的了解浙江省慢性丙型肝炎患者HCV基因型分布情况。方法参考Ohno的分型方法,采用巢式RT-PCR法扩增抗HCV抗体阳性患者的血清样品HCV核心(core)基因部分区段(-12nt～+343nt),克隆并测序[1];以Clustalw软件对所克隆片段进行系统进化树分析并分型。结果在60份HCV抗体阳性血清中,HCV检出率为55%(33例);系统进化树分析提示共有1b、2a、3a、3b、6a 5个不同的基因型,以1b、3b和2a基因型为主,其中1b阳性率为52%(17例)。结论浙江省慢性HCV感染者中HCV基因型呈现出以1b、3b和2a为主、多基因型存在的特点。     

圆形分布分析陕西省流行性感冒的季节特征

摘要：目的  分析2006～2015年陕西省流行性感冒（IFV）的季节分布及流行趋势,为疾病防治提供依据。方法  选取2006～2015年陕西省IFV的阳性病例资料,用圆形分布法分析各年IFV流行的集中趋势,并计算高峰日和高峰期。对10年间的IFV优势病毒进行流行趋势研究,并分析其成因。结果  陕西省IFV的流行存在很强的季节性,冬季高发,其中12月～次年2月为总流行高峰期,总高峰日为12月26日。2009和2014年陕西省IFV发病水平较高,4种型别在10年间交替流行。结论  陕西省IFV的发病具有很强的季节性,集中趋势明显,冬季高发,应当加强疫苗接种工作及预防控制措施。

     

中国大陆基因2a/Ⅲ型丙型肝炎病毒部分基因的cDNA序列分析

目的分析来源于徐州的中国株２ａ／Ⅲ型丙型肝炎病毒（ＨＣ－ＸＺ）的部分核苷酸序列。方法以逆转录巢式聚合酶链反应获得位于７９１８位至８２９３位间的ｃＤＮＡ片段，聚合酶链反应直接序列分析技术测定核苷酸序列，计算机分析其特征。结果与日本株２ａ／Ⅲ型丙型肝炎病毒（ＨＣＪ６）及中国株１ｂ／Ⅱ型丙型肝炎病毒ＨＣＣ２相比，ＨＣＸＺ在核苷酸水平的同源性分别为８９．６０％与６８．００％，在氨基酸水平的同源性分别为９２．９２％与６９．０３％。ＨＣＸＺ与ＨＣＪ６在此区域的亲水性相仿。结论ＨＣＸＺ与ＨＣＪ６属于同一亚型，且亲缘性较高。     

丙型肝炎病毒（HCV）基因分型及序列动态变化研究

目的 研究HCV基因型别及序列动态变化。方法采用HCV型特异性引物PCR扩增检测及HCV5’-非编码区(NCR)和核心区测序确定不同时间、不同病人HCV感染者血清标本的HCV型别,并进行序列分析和比较。结果所测HCV基因型均为1b和2a型;HCV基因型随时间的推移发生1b和2a型的转换,且转换过程中有混合感染现象。同一型5’-NCR基因序列无变化,与时间和病人无关;核心区1b型序列均相同,与时间和病人无关,2a型序列因病人而异。结论HCV基因型的变化是多层次的,首先是型的变化,其次是准种,再次是不同的毒株。5’-NCR和核心区序列比较保守。     

HCV HVR1准种在不同基因型丙型肝炎患者中的分布

目的:通过研究丙型肝炎病毒高变区1(HCV HVR1)准种复杂性与基因型之间的关系,探讨不同基因型HCV致病性差异的机制.方法:采用C区型特异性引物PCR法进行HCV基因分型,采用单链构象多态性聚合酶链反应法(SSCP法)检测HCV HVR1准种.结果:68例丙型肝炎患者中,Ⅱ型49例(72%),Ⅲ型13例(19%),Ⅱ、Ⅲ混合型6例(9%).Ⅱ型和Ⅱ、Ⅲ混合型HCV感染患者的HCV HVR1准种复杂性(SSCP条带数)明显高于Ⅲ型感染的患者,且与疾病严重程度关系密切.结论:HCV HVR1准种复杂性的差异可能是导致不同基因型HCV致病性差异的因素之一.     

泰安地区HBV基因型分布及临床意义

目的了解泰安地区乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因型分布情况,探讨HBV基因型与临床的相关性。方法随机选择泰安地区HBV患者,其中无症状HBV携带者37例,慢性乙型肝炎68例,乙型肝炎肝硬化35例,原发性肝癌26例。应用PCR微板核酸杂交EL IS A技术,进行血清HBV基因分型测定。结果166例标本中,160例(96.39%)可检出基因型,其中B基因型47例(28.31%),C基因型109例(65.66%),B+C混合基因型4例(2.4%);未检出A、D、E、F基因型。结论泰安地区HBV感染者中,HBV基因主要存在B、C、B+C型,不同基因型与慢性乙型肝炎、肝硬化、原发性肝癌有相关性,C基因型HBV感染者较B基因型更易发展成肝硬化、原发性肝癌。     

Distribution of Hepatitis B Virus Genotypes and Its Clinical Significance in Hubei Province, China

The distribution of hepatitis B virus genotype in Hubei province and its clinical signifi- cance were investigated. HBV genotypes of 276 patients were detected by PCR-microplate sandwich hybrization-ELISA technique. The level of HBV DNA was detected by using PCR-fluorescence quantification test. Among 276 patients, there were 78 cases of HBV asymptomatic carriers, 110 cases of chronic hepatitis B (CHB), 62 cases of severe hepatitis (SH) or liver cirrhosis (LC) and 26 cases of hepatocellular carcinoma (HCC). The genotypes of HBV included C, B, mixtures (B C, B D, C D) and D, accounting for 55.8%, 25.4%, 16.7% and 2.1% respectively. The average level of HBV DNA in genotypes C, B, mixtures and D was 1.20×106, 7.81×104, 3.26×105 and 5.01×104 cop- ies/mL respectively. The ratio of SH, LC and HCC in genotype B, C and mixtures was 20%, 30% and 48% respectively. Statistical analysis revealed the percentage of genotype mixtures infection was sig- nificantly higher than that of genotype B infection. There was no significant difference in the per- centage between genotype B and genotype C or between genotype C and mixtures. The distribution of genotype B, C and mixtures in SH, LC and HCC was significantly different. The frequency of HCC was zero in patients with co-infection. Genotype D was only related with SH and LC. The in- creased ALT could be converted to categorical grades of severity. From mild, moderate to severity, the prevalence of genotype C showed an opposite trend, although no statistically significant differ- ence was observed. The HBeAg positive rate was higher in patients with genotype C infection than in those with genotype B, especially in the patients whose ages were from 31 to 40 years old. Compared with genotype B, genotype C showed a higher HBeAg positive rate in patients with SH and LC. The percentage of SH, LC and HCC was higher in patients with genotype C and mixtures infection. On the contrary, the percentage of genotype B was lower. The HBeAg positive rate in patients with genotype C infection was higher than those with genotype B infection. Genotype C and mixtures may be associated with development of severe liver disease.     

献血员、血透及肝病患者丙型肝炎病毒基因分型

探讨本地区丙型肝炎病毒感染者的基因分型。方法应用逆转录聚合酶链反应进行ＨＣＶ－ＲＮＡ检测,并对其阳性产物进行ＨＣＶ非结构５区的限制性片段长度多态性分析,结果：安徽省丙型肝炎患者ＨＣＶ基因型有五种,即Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅱ／Ⅲ型,其构成比分别为０．５３％、７５．６６％、１３．２３％、０．５３％、６．３５％。丙肝患者不同病种与ＨＣＶ基因型分布差异无显著性,献血员与输血后丙型肝炎患者间分布差异无显著性,血透     

实时荧光PCR技术在丙型肝炎病毒基因型检测中的应用

目的 探讨实时荧光PCR技术在丙型肝炎病毒(HCV)基因型检测中的应用价值.方法 采用一步法逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)结合TaqMan技术,对HCV基因型进行实时荧光PCR检测;巢式RT-PCR扩增HCV的NS5B基因区域,测序后进行HCV基因亚型分析并与实时荧光PCR分型结果进行比较.结果 实时荧光PCR共分型119例,1型71例(59.7%),非1型48例(40.3%)其中110例成功进行测序分型;测序分型的110例中,1型73例(均为1b型),占66.4%,非1型37例(其中2a型7例、3a型6例、3b型3例、4a型1例、4k型1例、5a型1例、6a型17例、6n型1例),占33.6%.与110例测序分型的结果比较,实时荧光PCR分型总的符合率为71.8%(79/110),其中1型的符合率为80.9%(55/68),非1型的符合率为57.1%(24/42).结论 实时荧光PCR进行HCV基因型检测操作简便、快速,但分型结果特异性不高.     

不同人群丙型肝炎病毒基因分型

目的 研究不同人群丙型肝炎病毒的基因分型。方法 对141例抗HCV（ ）、60例抗HCV（-）及28例正常献血员的共132份HCV-RNA阳性血清,运用限制性片段长度多态性分析（RFLP）法作酶切分型。结果 3组人群不同基因型检出率分别是1b/Ⅱ型87.18%、100%、100%;2a/Ⅲ1.71%、0、0;两者混合型（1b/2a型）11.11%、0、0。对抗HCV（ ）血清,分为ALT正常组和异常组,2组人群不同基因型检出率分别是1b/Ⅱ型93.33%、83.33%;2a/Ⅲ型0、2.78%;两者混合型7.14%、13.89%。结论 我国不同人群中HCV感染者均以HCV1b/Ⅱ型为主,今后应以HCV1b/Ⅱ型为重点,加强HCV的诊断、治疗和疫苗研制工作。     

保定市丙型肝炎病毒基因型分布特征及临床意义

目的 了解保定市丙型肝炎病毒（HCV）基因型分布特征及其与丙型肝炎病毒核糖核酸（HCV-RNA）载量、肝病程度的相关性,为其防治提供依据。方法 对2010年1月—2017年9月758例HCV-RNA阳性者进行HCV的基因型检测,分析其基因型与HCV-RNA含量和肝病程度的相关性。结果 758例HCV感染患者中1b型和2a型分别为50.79%（385/758）和36.68%（278/758）。HCV基因型的分布特征与性别、感染途径及种族差异均无统计学意义（P>0.05）。1b型患者ALT、AST、GGT及HCV-RNA水平均高于2a型和其他型患者,差异有统计学意义（P<0.05）。不同程度肝病患者的HCV基因型分布差异有统计学意义（P<0.05）,1b型丙肝肝硬化及肝癌比例高于其他基因型,差异有统计学意义（P<0.05）。1b型患者对长效干扰素加利巴韦林治疗的ETVR应答率（57.92％ vs 83.09％）和SVR应答率（24.68％ vs 60.79％）均明显低于2a型患者（P<0.05）。相关分析显示,1b型患者ALT与HCV-RNA呈正相关（r=0.685,P<0.01）。结论 保定市丙型肝炎病毒基因型流行株为1b型和2a型,其中1b型与丙肝肝硬化、肝癌的产生有一定的相关性。     

丙型肝炎病毒核心抗原的检测及其临床意义

目的 探讨HCV 核心抗原在HCV 感染诊断和治疗中的作用.方法 丙肝核心总抗原检测采用酶联免疫法;丙型肝炎抗体检测采用第三代酶联免疫法.所有血清标本均进行HCV-RNA 和肝功能检测.丙肝核酸定量采用PCR- 荧光探针法;肝功能检测采用紫外连读检测法.结果 90 例中,HCV-cAg 检测阳性率为42.22%(38/90).HCV-cAg 阳性组HCV-RNA 阳性率100%(38/38),显著高于HCV-cAg 阴性组的71.15%(37/52).阳性组丙氨酸氨基转移酶(alanine aminotransferase,ALT)异常率63.16%(24/38),显著高于HCV-cAg 阴性组的40.38%(21/52),两组间比较(P<0.05).HCV-cAg 阴性组中59.62% (31/52)的患者ALT 在正常范围内(ALT<40U/L),显著高于HCV-cAg 阳性组的36.84%(14/38) ;而HCV-cAg 阳性组中36.84%(14/38)ALT 值均>100U/L,明显高于HCV-cAg 阴性组的9.62%(5/52).两组间比较(P<0.05).丙肝核心抗原HCV-cAg 和HCVRNA有很好的正相关性,HCV-cAg 与ALT 水平也有一定相关性,可以反映肝功损害程度.结论 丙肝核心抗原HCV-cAg是慢性丙肝感染良好的监测指标.     

中国东北地区HCVRNA阳性血清RT－PCR产物的RFLP分型

为了解东北地区ＨＣＶ感染的基因型，对东北地区４５例ＨＣＶＲＮＡ阳性血清的ＰＣＲ产物用ＲＦＬＰ分析进行基因分型，结果：ＨＣＶⅡ型占８２．２％，Ⅲ型占１５．６％，Ⅱ／Ⅲ混合型占２．２％型。与国内其它地区ＨＣＶ基因型构成比无显著性差异。证明东北地区ＨＣＶ感染也以Ⅱ型为主。