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1.
目的:分析三阴性乳腺癌(TNBC)细胞系MDA-MB-231(MB-231)与其脑转移细胞系MDA-MB-231Brm (MB-231Brm)中microRNA (miRNA)的表达差异,寻找有价值的三阴性乳腺癌脑转移相关的miRNA。方法:Trizol法提取MB-231和MB-231Brm细胞总RNA,用Illumina高通量测序技术分离并检测miRNA表达情况,将其与已知的miRNA数据库比对,采用miRDeep2软件进行新的miRNA预测;使用差异基因检测法筛选差异表达的miRNA,构建差异表达谱。应用生物信息学分析进行miRNA靶基因的功能分析,并用实时荧光定量PCR (qPCR)进行验证。结果:MB-231和MB-231Brm细胞中miRNA的种类和表达存在差异,两者共有的miRNA为961种,前者自有164种,后者自有196种;与MB-231相比,MB-231Brm细胞的miRNA中,有145个表达显著上调,54个表达显著下调,1 122个表达未见明显差异;差异表达分析显示,与MB-231相比,MB-231Brm中的miR-199a-3p和miR-103a-3p等表达显著增加,而miR-1246和miR-4787-5p等表达显著下降;基因本体分析(GO)发现差异表达的miRNA所调控的靶基因与细胞组分、分子功能及生物过程均相关;qPCR验证发现,与MB-231相比,miR-1246在MB-231Brm中表达显著降低且差异有统计学意义(P < 0.05)。结论:MB-231和MB-231Brm中存在差异表达的miRNA,且在TNBC脑转移过程中其调控的靶基因通过参与细胞组分形成、调节分子功能及调控生物过程等发挥作用;并发现miR-1246在脑转移细胞系中的表达下降,其可能通过某种途径参与TNBC脑转移的发生、发展过程。 相似文献
2.
目的:采用microRNA(miRNA)测序和生物信息学方法,分析大气细颗粒物(PM2.5)染毒人支气管上皮HBE细胞前后差异表达的miRNAs,预测差异miRNAs的生物学功能和信号转导途径。方法:用50 μg/mL的PM2.5混悬液染毒HBE细胞,以未染毒组作为对照组,处理24 h后提取总RNA样品,Small RNA样品预处理试剂盒构建文库,并利用illumina HiSeqTM 2500/MiSeq测序平台进行高通量测序。以调整后P < 0.05的筛选标准得到差异miRNAs,使用miRanda和RNAhybrid两个软件共同预测差异miRNAs的靶基因并进行GO和KEGG功能富集分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件对miRNAs和靶基因及靶基因之间的相互作用关系进行可视化分析。结果:高通量测序方法共检测到PM2.5染毒前后的包含1 137个miRNAs的表达谱,27个为差异表达的miRNAs,其中7个上调,20个下调。GO和KEGG富集分析发现,这些差异miRNAs主要参与细胞代谢、酶活性调节等生物学过程,聚集于胞内如细胞质、细胞器等,涉及代谢途径、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路等与细胞增殖、分化、凋亡及癌症发生等相关的重要信号通路。此外,通过构建相互作用网络图,鉴定了miR-371b-3p、miR-371a-5p、miR-27a-3p、miR-7-5p、miR-372-3p等相互作用数量前11位的核心miRNAs,以及3个核心靶基因(VEGFA、MAPK3、CCR5)。结论:PM2.5染毒HBE细胞后引起了27个miRNAs的差异表达,涉及PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路及MAPK信号通路等与癌症发生发展相关的重要信号通路,其中筛选了11个核心miRNAs和3个核心基因,为深入研究PM2.5致癌毒理作用机制提供了实验依据。 相似文献
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目的:采用microRNA(miRNA)测序和生物信息学方法,分析大气细颗粒物(PM2.5)染毒人支气管上皮HBE细胞前后差异表达的miRNAs,预测差异miRNAs的生物学功能和信号转导途径。方法:用50 μg/mL的PM2.5混悬液染毒HBE细胞,以未染毒组作为对照组,处理24 h后提取总RNA样品,Small RNA样品预处理试剂盒构建文库,并利用illumina HiSeqTM 2500/MiSeq测序平台进行高通量测序。以调整后P < 0.05的筛选标准得到差异miRNAs,使用miRanda和RNAhybrid两个软件共同预测差异miRNAs的靶基因并进行GO和KEGG功能富集分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件对miRNAs和靶基因及靶基因之间的相互作用关系进行可视化分析。结果:高通量测序方法共检测到PM2.5染毒前后的包含1 137个miRNAs的表达谱,27个为差异表达的miRNAs,其中7个上调,20个下调。GO和KEGG富集分析发现,这些差异miRNAs主要参与细胞代谢、酶活性调节等生物学过程,聚集于胞内如细胞质、细胞器等,涉及代谢途径、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路等与细胞增殖、分化、凋亡及癌症发生等相关的重要信号通路。此外,通过构建相互作用网络图,鉴定了miR-371b-3p、miR-371a-5p、miR-27a-3p、miR-7-5p、miR-372-3p等相互作用数量前11位的核心miRNAs,以及3个核心靶基因(VEGFA、MAPK3、CCR5)。结论:PM2.5染毒HBE细胞后引起了27个miRNAs的差异表达,涉及PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路及MAPK信号通路等与癌症发生发展相关的重要信号通路,其中筛选了11个核心miRNAs和3个核心基因,为深入研究PM2.5致癌毒理作用机制提供了实验依据。 相似文献
4.
目的:筛查并验证新疆哈萨克族食管癌组织与正常组织间差异表达的miRNAs,并初步探讨这些miRNAs在食管癌发生演进中的作用。方法:采用miRNA表达谱基因芯片分析系统筛查哈萨克族食管癌组织及远端正常食管组织中差异表达的miRNAs,实时荧光定量PCR检测验证差异显著miRNA的表达情况,分析miRNAs表达与食管癌临床病理指标的关系。结果:与远端正常组织相比较,miR-21、miR-132、miR-130b在哈萨克族食管癌组织中表达上调(P < 0.05),miR-141、miR-143、miR-133b、miR-195表达下调(P < 0.05);miR-140表达变化无统计学意义;miR-21、miR-132、miR-143与食管癌临床分期有关,miR-21、miR-132、miR-143、miR-133b与淋巴结转移有关,miR-21、miR-141、miR-143、miR-133b与食管癌组织分化程度有关(P < 0.05)。结论:本研究采用基因芯片筛查出新疆哈萨克族食管癌组织与远端正常组织中差异表达的miRNAs,实时荧光定量PCR结果与基因芯片检测结果基本一致,miRNA表达的变化与新疆哈萨克族食管癌的发生发展有关。 相似文献
5.
目的:探讨河北省某地氡温泉对周围居民外周血淋巴细胞中miR-16、miR-106b、miR-449a、miR-34a和let-7g表达的影响。方法:采用简单随机抽样法抽取某地氡温泉周边居民43人;同时随机抽取生活习惯相似,但未长期接触过氡温泉的居民44人。采用实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测研究对象淋巴细胞中miRNAs的表达水平。用t检验比较miRNA在氡温泉组和对照组居民外周血淋巴细胞中的差异表达;采用多重线性回归分析miRNA的差异性表达和居民氡暴露的关系。结果:与对照组相比,氡温泉组居民外周血淋巴细胞中miR-106b、miR-449a和let-7g表达水平显著上调(t值分别为4.180、2.422、2.794,P均<0.05)。控制年龄、性别、吸烟和饮酒等因素后,miR-106b、miR-449a和let-7g的差异性表达和居民氡暴露因素呈正相关(t值分别为4.091、2.716、2.440,P均<0.05)。但是miR-16和miR-34a的表达改变与氡暴露无显著相关(t值分别为0.990、0.147,P均>0.05)。结论:miR-106b、miR-449a和let-7g具有作为氡致辐射损伤早期标志物的潜在价值。 相似文献
6.
目的 研究miR-455-5p在上皮性卵巢癌中的表达情况,分析其表达对上皮性卵巢癌发生发展的影响。方法 从GEO数据库中下载正常卵巢上皮组织与上皮性卵巢癌组织miRNA表达数据GSE83693,通过差异表达分析获得上皮性卵巢癌中miRNA差异表达数据,分析miR-455-5p在正常卵巢上皮与上皮性卵巢癌组织中的表达是否存在差异,应用qRT-PCR验证差异表达预测结果;应用生物信息学软件对miR-455-5p靶基因进行KEGG通路富集分析及GO基因功能注释,探究miR-455-5p表达失调在上皮性卵巢癌发生发展过程中的作用。结果 筛选出明显差异表达miRNA 101例,34例表达上调,67例表达下调;其中miR-455-5p呈明显下调(P<0.01),差异倍数为-2.9019;qRT-PCR验证结果显示,上皮性卵巢癌细胞(SKOV-3,OVCAR-3,A2780)中miR-455-5p表达量明显低于正常卵巢上皮细胞(IOSE-80),差异均有统计学意义(P<0.05);KEGG通路富集分析结果显示,miR-455-5p调控的靶基因主要参与的通路共5个,包括有TGF-β信号通路,Hippo信号通路,ECM-受体相互作用,癌症中的转录失调通路,慢性粒细胞白血病,这些通路均与肿瘤相关。GO功能注释分析结果显示上述通路中miR-455-5p调控的靶基因主要参与蛋白质磷酸化,促进细胞增殖、迁移,抑制细胞凋亡,促进上皮-间充质转化,转录调节及调控细胞周期等与肿瘤发生相关的功能。结论 miR-455-5p在上皮性卵巢癌中表达下调,miR-455-5p靶基因参与上皮性卵巢癌肿瘤相关通路与功能,与上皮性卵巢癌发生发展相关。 相似文献
7.
目的:应用miRNA芯片技术建立大鼠腹部手术应激后血清miRNA差异表达谱,从中发现与早期手术创伤后应激相关的miRNAs。方法:建立大鼠部分肝切除手术模型。检测手术前后大鼠血清中ALT、AST和CRP浓度水平及肝脏病理改变,评估腹部创伤后大鼠应激情况。采用miRNA表达谱芯片筛选手术前后大鼠血清中差异表达的miRNAs,并采用实时荧光定量RT-PCR(real-time RT-PCR)进行验证。采用生物信息学软件(MiRand和TargetScan)预测候选miRNA的靶基因。结果:血清miRNA表达谱出现明显改变,24个miRNAs在2/3部分肝切除术(PH)后24h大鼠血清中表达明显升高,特别是miR-9,其在2/3PH术后24h大鼠血清中的表达水平为术前的50多倍,real-time RT-PCR检测miR-9的结果与芯片结果相符。通过生物信息学预测,CDH1、E-cadherin、MTHFD2、PDYN、MCPIP1、BCL2L11、CMA1、Map3k1等可能是miR-9的靶基因。结论:腹部手术创伤后,大鼠血清表达谱发生明显变化,提示miRNA可能参与调控创伤后应激反应。 相似文献
8.
目的:基于microRNA(miRNA)调控网络预测卵巢癌多药耐药相关基因。方法:综合运用文本挖掘、网络构建和预测等生物信息学分析方法,挖掘卵巢癌化疗耐药相关miRNA和miRNA-靶基因数据,并构建miRNA调控网络,利用已知miRNA对卵巢癌多药耐药相关基因进行预测。结果:文本挖掘出11个与卵巢癌化疗耐药相关的miRNA,包括miR-130a、miR-214、let-7i、miR-125b、miR-376c、miR-199a、miR-93、miR-141、miR-130b、miR-193b*和miR-200c。在miRNA靶基因预测数据软件Target Scan中挖掘出47 077个miRNA-靶基因数据,而Pic Tar挖掘出1 675个miRNA-靶基因数据。在miRNA调控网络中,神经素1基因(neuropilins,NRP1)是最重要的Hub-基因。结论:利用已知miRNA构建miRNA调控网络进而预测卵巢癌多药耐药相关基因是一种行之有效的方法。NRP1极有可能在卵巢癌化疗耐药形成中扮演着重要的角色,是卵巢癌潜在的药物治疗靶点。 相似文献
9.
目的:探讨miRNA-202对肺癌细胞A549的调控作用和可能机制。方法:应用DIANA TOOLs及KEGG数据库对miR-202进行生物信息学分析,探讨其可能参与的信号通路和潜在靶基因。通过慢病毒转染,分别上调和下调A549细胞中miR-202的表达,应用MTT法和流式细胞技术检测miR-202对细胞增殖、周期和凋亡的影响。应用qPCR和Western blot技术分别检测miR-202对其预测靶基因PIK3R3的mRNA和蛋白表达水平的调控作用。结果:生物信息学分析显示,miR-202参与的信号通路可能通过对PIK3CA的靶向调控发挥作用。功能研究表明,与阴性对照组相比,上调miR-202表达可抑制A549细胞增殖(P < 0.05),引起细胞周期G1/S期阻滞(P < 0.05),对细胞凋亡无明显影响(P > 0.05)。靶基因研究结果显示,与阴性对照组相比,上调miR-202表达可引起PIK3CA蛋白表达量下降(P < 0.05),但其mRNA的表达无显著改变(P > 0.05)。结论:miR-202可能通过对PIK3CA的负向调控影响A549细胞的增殖和周期,本研究为深入了解miRNA在肺癌中的作用与机制提供了新的线索。 相似文献
10.
目的:分析胰腺癌组织和正常组织差异表达的miRNA,筛选与胰腺癌预后相关的生物标志。方法:下载并整理基因芯片表达汇编数据库(GEO)中GSE32678和GSE71533芯片数据集原始数据,应用R语言筛选差异表达miRNA,结合GSE24279数据集,获得差异表达的miRNA并取交集。应用生物信息学分析工具对交集miRNA进行靶基因预测,进而对靶基因进行功能分析,构建蛋白互作网络(PPI)、miRNA-mRNA调控网络、miRNA-mRNA-pathway调控网络,结合肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)中胰腺癌样本的miRNA表达及预后数据,筛选出胰腺癌预后相关标志物。结果:共筛选出胰腺癌组织和正常组织22个交集miRNA,其中hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375与胰腺癌患者的生存预后密切相关。hsa-miR-125b-5p、hsa-miR-221-3p、hsamiR-31-5p、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-10a-5p是miRNA-mRNA调控网络中的核心miRNA。结论:通过对GEO和TCGA数据库胰腺癌相关数据的分析发现hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375显著影响胰腺癌患者的预后,可以作为判断预后的标志。 相似文献
11.
目的:探讨miR-101基因簇与食管癌发病风险的关系。方法:收集3例食管癌进展期患者的新鲜组织标本进行组织芯片高通量microRNA检测,采用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库食管癌RNA测序数据验证的方式对miR-101基因簇表达水平进行分析;另收集33例食管癌患者癌组织和癌旁组织标本,分别提取样本总RNA,采用实时荧光定量PCR法(qPCR)检测miR-101基因簇相关基因的表达,logistic回归分析miRNA异常表达对食管癌发病风险的影响,受试者特征曲线(ROC)评价miR-101基因簇对食管癌的诊断效力,Fisher检验分析基因簇各miRNA的表达和食管癌患者临床病理指标之间的相关性。结果:miRNA芯片高通量检测及TCGA数据库生物信息学分析结果显示,与食管正常组织相比,miR-101-3p、miR-125a-5p和miR-145-5p在食管癌组织中表达下调(P<0.05)。qPCR结果显示miR-101基因簇在33例食管癌组织中均呈低表达,多因素logistic回归分析显示,miR-101基因簇miR-101-3p、miR-127-5p与miR-145-5p表达水平与食管癌的发病风险呈负相关[OR (95% CI)值分别为:0.717(0.563,0.912)、0.717(0.534,0.962)和0.597(0.426,0.838),均为P<0.05];ROC分析显示miR-101基因簇曲线下面积(AUC)分别为0.753、0.792、0.763和0.800(P<0.05)。此外,miR-101-3p、miR-145-5p的表达水平与食管癌患者肿瘤大小相关(P<0.05),miR-125a-5p的表达水平与患者淋巴结转移相关(P<0.05)。结论:miR-101基因簇在食管癌患者癌组织中呈低表达,可作为食管癌诊断的潜在生物标志物,其在食管癌进程中的功能和调控机制有待进一步研究。 相似文献
12.
目的:探讨过表达SF1a-PRLR及其变体ΔS2 SF1a-PRLR基因对人乳腺癌MCF-7细胞增殖和microRNA表达的影响。方法:利用同源重组技术将SF1a-PRLR和ΔS2 SF1a-PRLR cDNA分别重组至慢病毒,再将携带不同基因的重组病毒,即空病毒、携带SF1a-PRLR cDNA和ΔS2 SF1a-PRLR cDNA的慢病毒分别转染MCF-7细胞,经嘌呤霉素多次筛选得到稳定转染细胞株MCF7-con(对照组)、MCF7-SF1a-PRLR(SF1a组)、MCF7-ΔS2 SF1a-PRLR(ΔS2 SF1a组),将3组稳定转染细胞株培养后进行细胞增殖实验,提取总RNA进行小分子RNA高通量测序。结果:增殖实验结果显示,培养48 h时,对照组、SF1a组和ΔS2 SF1a组的D(492)值分别为1.85±0.29、2.24±0.26、2.57±0.23,3组之间两两比较,差异均有统计学意义(P均 < 0.05)。测序结果显示,各组间microRNA表达均有显著差异,SF1a组与对照组比较,差异表达的microRNAs共有176个(32个表达上调,144个表达下调);ΔS2 SF1a组与对照组相比,差异表达的microRNAs共206个(52个表达上调,154个表达下调);ΔS2 SF1a组与SF1a组比较,差异表达的microRNA共5个(miR-4454、miR-215-5p、miR-797、miR-622表达上调,miR-210-5p表达下调),其中,miR-210-5p在对照组、SF1a组、ΔS2 SF1a组中的相对表达水平分别为66.18、31.67、13.07,两两比较均具有显著差异(P均 < 0.05)。结论:过表达SF1a-PRLR或ΔS2 SF1a-PRLR均能促进人乳腺癌MCF-7细胞的体外增殖且显著影响人乳腺癌MCF-7细胞的microRNA表达,两者对大部分microRNA表达的影响作用相似,仅对miR-4454等5个microRNAs的表达具有显著影响。 相似文献
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目的:通过对肿瘤基因组图谱计划(TCGA)基因表达谱和microRNA测序数据的生物信息学分析,寻找乳腺癌预后相关的关键分子事件。方法:收集并整理TCGA数据库中乳腺癌基因表达谱和microRNA测序数据,通过线性模型和经验贝叶斯方法结合传统t检验筛选乳腺癌中异常表达的基因和microRNA,利用R语言包microRNA-mRNA预测microRNA潜在靶向调控的基因。另外通过基因集富集算法(GAGE)分析预测microRNA及其潜在靶基因在乳腺癌中参与的异常信号调控通路;Cox回归风险模型探讨影响乳腺癌患者预后的关键分子事件。结果:共发现17 533个基因中有344个基因在乳腺癌中异常表达,同时鉴定了135个异常表达的microRNA;通过预测分析发现8个microRNA及31个潜在调控的靶基因参与了139条乳腺癌中异常变化的分子信号通路;Cox回归风险模型结果显示SFRP1表达升高提示预后良好(HR=0.9,P=0.015),has-miR-342-5p单独作用对乳腺癌预后无明显影响(HR=0.99,P=0.144),然而,交互作用研究显示,has-miR-342-5p抑制SFRP1表达时提示乳腺癌病人预后不良(HR=1.88,P=0.016)。结论:通过对TCGA乳腺癌基因表达谱和microRNA测序数据深入挖掘发现了乳腺癌中表达异常的microRNA及其靶基因,进一步分析了它们所参与的关键信号通路,并揭示has-miR-342-5p抑制SFRP1表达的分子事件发生时,乳腺癌病人预后较差。 相似文献
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目的:探讨化疗耐药和化疗敏感患者卵巢癌组织中miR-200b-3p和PAK2 mRNA的表达水平及其临床意义。方法:采用生物信息学方法结合文献综合分析初步预测miR-200b-3p在卵巢癌组织中的靶基因为PAK2,收集山西省肿瘤医院2015-2018年的25例卵巢癌化疗耐药患者组织样本(耐药组)和25例卵巢癌化疗敏感患者组织样本(敏感组),采用实时荧光定量PCR法(qPCR)检测miR-200b-3p和PAK2 mRNA的相对表达量。比较两组患者肿瘤组织中miR-200b-3p和PAK2 mRNA的表达差异,并分析miR-200b-3p、PAK2 mRNA表达水平与上皮性卵巢癌患者临床病理指标的关系。结果:耐药组卵巢癌患者癌组织miR-200b-3p的表达水平显著高于敏感组卵巢癌患者,是敏感组的15.78倍;耐药组卵巢癌患者癌组织PAK2 mRNA的表达水平显著低于敏感组卵巢癌患者,是敏感组的0.03。miR-200b-3p和PAK2 mRNA表达水平呈负相关(r=-0.560,P<0.01)。结论:miR-200b-3p在化疗耐药性卵巢癌组织中过表达,可能是通过靶向调控PAK2 mRNA参与调节化疗耐药和促进卵巢癌转移。 相似文献
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目的: 探讨miR-338基因簇在食管癌组织中的表达模式及其与食管癌发病风险的关系。方法: 选取86例经病理确诊的食管癌患者,分别提取食管癌和癌旁组织总RNA,采用实时荧光定量PCR法检测hsa-miR-338-3p、hsa-miR-338-5p与hsa-miR-657的表达,应用配对样本t检验分析癌和癌旁组织中miRNA表达差异,Pearson相关分析检验基因簇各miRNA表达的相关性,logistic回归分析miRNA异常表达对食管癌发病风险的影响。结果: hsa-miR-338-3p与hsa-miR-338-5p在食管癌组织中的表达均较癌旁组织降低(P均<0.05),hsa-miR-657在食管癌和癌旁组织中表达的差异无统计学意义(P>0.05),hsa-miR-338-3p与hsa-miR-338-5p表达显著相关(r=0.754,P<0.05),hsa-miR-338-5p的低表达增加了食管癌的发病风险(OR=1.264,P<0.05),可能是食管癌的危险因素。结论: miR-338基因簇可能抑制了食管癌的发生,hsa-miR-338-5p可能成为食管癌诊断的潜在标志物。 相似文献
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目的:探讨在甲基丙烯酸环氧丙酯(GMA)诱导人支气管上皮细胞(16HBE)恶性转化过程中长链非编码RNA LINC00472的表达特征及其生物学意义。方法:以DMSO作为溶剂对照组,实验组采用8 μg/mL的GMA染毒处理72 h,重复染毒3次,传代培养,收获两组细胞的第10、20和30代(分别代表前、中、后期)16HBE细胞,采用Arraystar人类LncRNA芯片(v4.0)分析细胞中LINC00472的表达改变,实时荧光定量PCR (qPCR)检测LINC00472和预测靶基因miR-24-3p的相对表达水平。结果:芯片检测结果显示,与同代龄DMSO对照组相比,GMA诱导16HBE细胞恶性转化过程中LINC00472在转化第10代和第20代分别下调2.30倍和3.57倍,第30代上调2.32倍。qPCR检测结果表明,与同代龄对照组相比,LINC00472在早期的相对表达水平差异无统计学意义,而在中期和后期的相对表达水平的变化情况与芯片结果基本一致,其可能的靶基因miR-24-3p在不同时期相对表达水平的差异均具有统计学意义(P < 0.05),但差异倍数均 < 2。结论:LINC00472在GMA诱导16HBE细胞恶性转化的前期表达水平未发生明显改变,而在细胞恶性转化的中期低表达、后期高表达,推测LINC00472可能在GMA诱导16HBE细胞恶性转化后期发挥作用,但LINC00472和miR-24-3p在此过程中是否存在相互作用以及其作用机制有待进一步研究。 相似文献
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目的:研究miR-429和Bmi-1 mRNA在肺癌(LC)组织中的表达及其与患者临床特征、预后之间的关系,并探讨其表达水平对LC患者预后的预测意义。方法:选取2013年1─12月在河北医科大学第四医院就诊的60例LC患者癌组织及癌旁组织,实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测组织中miR-429及Bmi-1 mRNA的表达水平,并分析二者之间表达水平的关系及其与患者临床病理指标及预后之间的关系。结果:与癌旁组织比较,LC组织中miR-429表达水平明显降低,而Bmi-1 mRNA的表达水平明显升高(P < 0.01)。LC组织中miR-429低表达而Bmi-1 mRNA高表达的患者往往瘤组织较大、临床分期较晚、更易发生淋巴结转移,同时患者生存期较短。结论:LC组织中低表达miR-429及高表达Bmi-1 mRNA可能是患者临床进展及预后较差的预测指标。 相似文献
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目的:探讨miR-195-5p对食管鳞癌细胞放射敏感性的影响及作用机制。方法:采用4和8 Gy X射线照射KYSE510和KYSE150细胞,以未照射细胞为对照。采用CCK-8法检测细胞生长情况,qPCR检测细胞内miR-195-5p及survivin mRNA的表达水平,Western blot检测细胞内survivin蛋白的表达水平。KYSE510细胞分为转染miR-195-5p类似物组、转染miR-195-5p拮抗物组和相应的对照组,并采用X射线照射后,Incucyte实时动态活细胞监测和EdU掺入实验测定细胞增殖情况,克隆形成实验和流式细胞术分别测定细胞克隆形成率和凋亡率,双荧光素酶报告基因实验验证各组KYSE150细胞的荧光素酶活性。结果:经X射线照射后的KESE510和KYSE150细胞生长均受到明显抑制,与未照射组相比,照射组细胞miR-195-5p表达降低,survivin蛋白表达升高(P<0.05或0.01)。转染miR-195-5p类似物组的KESE510细胞在接受X射线照射后的存活率较阴性对照组降低,EdU阳性率和克隆存活率降低,凋亡率显著升高,细胞中survivin mRNA和蛋白表达较阴性对照组均降低(P<0.05或0.01);转染miR-195-5p拮抗物组KESE510细胞的EdU阳性率和克隆存活率较阴性对照组升高,细胞中survivin mRNA和蛋白表达均升高(P<0.01)。在KYSE150细胞中过表达miR-195-5p能够抑制BIRC5 3' UTR报告基因的荧光素酶活性(P<0.05)。结论:MiR-195-5p可能通过靶向抑制survivin基因的表达增强食管鳞癌细胞的放射敏感性。 相似文献
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目的:探讨微小RNA-29a(miR-29a)对人胃癌细胞增殖、迁移的影响及其机制。方法:胃癌SGC-7901细胞随机分为miR-29a转染组、质粒对照组、空白对照组、信号转导子与转录激活子3(STAT3)抑制组。miR-29a转染组、质粒对照组采用脂质体转染法分别将has-miR-29a mimics质粒、siRNA对照质粒转染至人胃癌SGC-7901细胞,STAT3抑制组细胞加入STAT3抑制剂溶液,空白对照组不做处理。实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)和Western blot法检测转染后细胞中miR-29a、血管内皮生长因子(VEGF)、STAT3、细胞周期蛋白D1(cyclin D1)mRNA和蛋白的表达情况;MTT、划痕实验分别检测细胞增殖和迁移情况。结果:qPCR和Western blot实验结果显示,与空白对照组和质粒对照组比较,miR-29a转染组的miR-29a相对表达水平升高,VEGF、cyclin D1 mRNA及蛋白相对表达水平与p-STAT3/STAT3比值均下降(P < 0.01)。MTT实验与划痕实验结果显示,与空白对照组和质粒对照组比较,miR-29a转染组细胞在培养24、48、72 h的细胞相对增殖率及迁移率降低(P < 0.01)。与空白对照组比较,STAT3抑制组细胞的cyclin D1 mRNA及蛋白相对表达水平、p-STAT3/STAT3比值均降低,细胞相对增殖率与迁移率降低(P < 0.01)。结论:miR-29a能降低VEGF mRNA、蛋白的表达,抑制人胃癌细胞增殖和迁移,其机制可能与下调p-STAT3及cyclin D1的表达有关。 相似文献