食管鳞状细胞癌及癌旁组织蛋白表达谱的差异分析

目的：应用蛋白质组学方法筛选食管鳞状细胞癌组织与癌旁正常食管组织中的差异表达蛋白质。方法：收集10例食管鳞状细胞癌组织及其配对的正常食管组织，提取组织蛋白质，进行二维电泳，经图像分析识别差异表达蛋白，应用基质辅助激光解吸离子化-飞行时间质谱分析鉴定差异表达蛋白质；应用免疫组化检测HSP27、ANX1在40例食管鳞状细胞癌组织标本及其配对的食管正常上皮组织中的表达。结果：通过肽指纹图谱分析鉴定了6个差异表达蛋白质，SCCA1、KRT4和ANX1在食管鳞状细胞癌组织中表达下调，TIM1、MnSOD和HSP27在食管鳞状细胞癌组织中表达上调。免疫组化检测显示HSP27在食管鳞状细胞癌组织中高表达，ANX1在食管鳞状细胞癌组织中低表达，与蛋白质组学的分析结果一致。结论：食管鳞状细胞癌与癌旁正常组织之间存在蛋白质表达差异。寻找食管鳞状细胞癌组织与正常食管组织之间表达差异蛋白质，为探讨食管鳞状细胞癌发病分子机制提供了有用依据。     

食管鳞状细胞癌与癌旁组织蛋白表达谱的差异

目的应用蛋白质组学方法筛选食管鳞状细胞癌组织与癌旁正常食管组织中的差异表达蛋白质。方法收集10例食管鳞状细胞癌组织及其配对的正常食管组织,提取组织蛋白质,进行二维电泳,经图像分析识别差异表达蛋白,应用基质辅助激光解吸离子化-飞行时间质谱分析鉴定差异表达蛋白质;应用免疫组化检测HSP27、ANX1在40例食管鳞状细胞癌组织标本及其配对的食管正常上皮组织中的表达。结果通过肽指纹图谱分析鉴定了6个差异表达蛋白质,SCCA1、KRT4和ANX1在食管鳞状细胞癌组织中表达下调,TIM1、MnSOD和HSP27在食管鳞状细胞癌组织中表达上调。免疫组化检测显示HSP27在食管鳞状细胞癌组织中高表达,ANX1在食管鳞状细胞癌组织中低表达,与蛋白质组学的分析结果一致。结论食管鳞状细胞癌与癌旁正常组织之间存在蛋白质表达差异。寻找食管鳞状细胞癌组织与正常食管组织之间表达差异蛋白质,为探讨食管鳞状细胞癌发病分子机制提供了有用依据。     

食管鳞状细胞癌中驱动基因的多组学关联分析

目的 探讨食管鳞癌驱动基因的体细胞突变、拷贝数改变、基因表达和DNA甲基化等多个分子层面的改变及其交互影响。方法 从肿瘤基因组图谱计划(TCGA)下载95例食管鳞癌多组学数据,结合实验室前期91例患者测序结果进行分析;根据驱动基因突变将患者分组,对两组患者的基因表达水平进行非配对t检验;通过Spearman秩相关进行拷贝数改变、DNA甲基化与驱动基因表达水平的关联分析;通过Log-Rank检验对突变组和非突变组患者生存曲线进行比较。结果 多维度数据关联分析结果显示,驱动基因TP53、RB1、ZNF750和PTCH1的表达水平在突变组与非突变组间比较,差异有统计学意义(P=0.011, FC=1.43; P=0.045, FC=0.44; P=0.012, FC=2.20; P=0.011, FC=2.62);驱动基因CUL3、PIK3CA、RBPJ、FBXW7、CDKN2A、PTEN、RB1和CERBBP的表达水平与其拷贝数改变呈显著正相关;多个驱动基因表达受启动子和基因体甲基化的共同调控,并且在两部分数据中存在差异;驱动基因CREBBP(P=0.000)和FAT1(P=0.002)的突变与患者预后相关,可作为食管鳞癌潜在的预后标志物。结论 通过对食管鳞癌多组学数据的整合分析,阐述了食管鳞癌中体细胞突变、拷贝数改变、DNA甲基化与20个驱动基因表达水平的关联,并发现CREBBP和FAT1的突变可能成为食管鳞癌患者潜在的预后标志物。这些结果为进一步探究驱动基因在食管鳞癌中的功能机制奠定了一定基础。     

食管鳞状细胞癌组织中ADAMTS18基因的表达及临床意义

目的通过对食管鳞状细胞癌(ESCC)组织中含凝血酶敏感素基序的去整合素金属蛋白酶18(ADAMTS18)m RNA及蛋白表达情况的检测,探讨ADAMTS18在ESCC发生、发展中所起的作用及临床意义,为ESCC的临床早期诊断及预后评估提供新的客观参考指标。方法采用半定量-逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)的方法及免疫组化S-P的方法(生物素-链霉卵白素过氧化酶系统)对72例ESCC组织及癌旁正常组织中ADAMTS18 m RNA及蛋白的表达进行检测。结果 1ADAMTS18 m RNA在ESCC组织中的相对表达量为(0.361±0.115),在癌旁正常组织中表达量为(0.879±0.265),ESCC组织中ADAMTS18 m RNA表达量显著低于癌旁正常组织(P<0.01);ADAMTS18 m RNA在高/中分化鳞癌组中的相对表达量为(0.496±0.153),在低分化鳞癌组中为(0.232±0.088),低分化鳞癌组ADAMTS18 m RNA表达量显著低于高/中分化鳞癌组(P<0.05)。2ADAMTS18蛋白在ESCC组织中的阳性表达率为34.7%(25/72),在癌旁组织中的阳性表达率为93.1%(67/72),ADAMTS18蛋白在ESCC组织中阳性表达率显著低于癌旁组织(P<0.01);ADAMTS18蛋白在高/中分化鳞癌组中的阳性表达率为45.4%(20/44),在低分化鳞癌组中为17.8%(5/28),低分化鳞癌组ADAMTS18蛋白阳性表达率显著低于高/中分化鳞癌组(P<0.05)。结论 ADAMTS18基因在ESCC中的异常表达与ESCC的发生、发展及组织分化程度关系密切,检测ESCC组织中ADAMTS18基因的表达情况,有助于ESCC早期诊断及预后评估。     

血管内皮生长因子在原发性食管鳞状细胞癌中的表达及意义

目的：探讨原发性食管鳞状细胞癌中血管内皮生长因子（VEGF）的表达情况及其与肿瘤血管生成和预后的关系。方法：采用免疫组织化学染色方法,分别以抗VEGF多克隆抗体的抗F－VIII单克隆抗体检测82例手术切除标本中VEGF的表达水平和肿瘤微血管密度（MVD）值,分析二者之间及与患者预后的相关性。结果：全组病例中,肿瘤细胞VEGF阳性率为63．4％（52／82）VEGF阴性和VEGF阳性的3年和5年生存率分别为53．4％和46．6％;19．2％和11．5％。MVD中位值为37个/mm^2(9-150个／mm^2)。VEGF的表达水平与MVD值密切相关（P＝0．001）。MVD与患者的预后显著相关（P＝0．017）。随着VEGF表达水平增高,患者预后明显恶化（P＝0．000）。结论：VEGF在食管鳞状细胞癌的肿瘤血管生成过程中发挥重要的调控作用。多因素预后分析表明VEGF的表达可作为食管鳞状细胞癌患者独立的预后判断指标。     

口腔鳞状细胞癌m6A相关差异表达基因的生物信息学分析

目的:筛选口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)m~6A相关的差异表达基因,探寻相关信号通路,为OSCC提供候选的诊断标记物和分子治疗靶点。方法:下载TCGA数据库中OSCC数据,提取m~6A相关基因的表达。R软件筛选正常组织和肿瘤组织间的差异表达基因,对m~6A相关基因进行聚类分析与相关性分析。基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)研究差异基因的信号通路。结果:本研究筛选出8个差异表达基因(P<0.05),包括HNRNPC、KIAA1429、METTL3、METTL14、RBM15、WTAP、YTHDF1和YTHDF2,差异基因在癌组织的表达量均高于正常组织(P<0.05)。m~6A相关基因之间存在复杂的相关性。GSEA富集分析显示,差异表达基因主要参与细胞周期、碱基切除修复、同源重组和剪接体等相关信号通路。结论:HNRNPC、KIAA1429、METTL3、METTL14、RBM15、WTAP、YTHDF1与YTHDF2可作为OSCC的候选诊断标记物和分子治疗靶点。     

基于CT影像组学对食管鳞状细胞癌病理分化程度的预测

目的：探讨CT影像组学在预测食管鳞状细胞癌分化程度中的价值。方法：回顾性分析2008年1月到2016年8月经手术病理切片证实为食管鳞状细胞癌,临床资料完善和术前行CT增强扫描并获得完整图像的160例,随机分成训练集(103例)和验证集(57例),运用Matlab软件对图像进行特征提取并进行筛选,建立影像组学标签。结合获得的影像组学标签和临床资料建立多变量logistic回归分析,建立影像组学模型(radiomics predictive mode)并进行验证。运用受试者操作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线评价模型术前预测食管鳞状细胞癌分化程度的效能。结果：影像组学标签为食道癌病理分化程度显著的独立预测因素。影像组学预测模型在训练组中的曲线下面积(area under curve,AUC)值为0.791,敏感度为81.6%,特异度为72.3%;在验证集中的AUC值为0.757,敏感度为70.0%,特异度为73.0%。结论：基于CT影像提取的影像组学特征构建的模型,对于术前预测食管癌分化程度具有一定的效能。     

皮肤鳞状细胞癌相关差异表达基因及信号通路的生物信息学筛选

目的探讨皮肤鳞状细胞癌组织中的差异表达基因。方法从基因表达综合数据库(GEO)在线数据库中下载皮肤鳞状细胞癌(cSCC)组织相关的基因表达谱芯片数据集GSE42677和GSE53462,利用Limma包筛选肿瘤组织和正常皮肤组织之间的差异表达基因;利用DAVID工具对差异表达基因进行基因本体论(GO)和功能富集分析;利用STRING数据库分析差异表达基因之间的相互作用,并利用Cytoscape软件构建蛋白质之间相互作用网络,筛选核心基因和模块。结果两组芯片数据中共同上调表达基因43个,共同下调表达基因65个,这些差异基因主要富集在细胞增殖、皮肤发展、先天免疫反应、Toll样受体、趋化因子、转录调控、氨基酸代谢和p53信号通路;构建了这些基因之间的相互作用网络,获得cSCC相关前20核心基因,分别为CXCL8、 CCND1、 KIT、 PI3、 SPP1、 PLAU、 GATA3、 PLAUR、 CDKN2A、S100A7、KRT16、CXCL1、DEFB4A、ISG15、KRT2、S100A12、KRT6B、ISG20、OASL和IFI6。结论 cSCC组织与正常皮肤组织之间存在大量的差异表达基因,CXCL8、CCND1、KIT、PI3、SPP1、PLAU、GATA3、PLAUR、CDKN2A和S100A7等基因及其介导的信号通路在cSCC的发生过程中可能起着重要作用。     

食管鳞状细胞癌中p53基因变异的临床意义及地域性差别

为了进一步了解食管癌的临床病理及地域性差异的分子生物学基础，我们对浙江省及河南省林县的存档食管鳞状细胞癌组织中中3基因的变异进行了检测分析。一、材料与方法1．材料：92例食管癌组织及相应的远端（Z5cm）食管粘膜上皮正常组织或周围未浸润淋巴结组织取自浙江省肿瘤医院病理科与河南省林县早期癌研究所有随访资料的存档五蜡标本，均经病理诊断证实。2．DNA提取：刀ap厚石蜡包埋组织经常规脱蜡至水后，加入组织消化液（100Inmol／LTris·CI，pH84），0．5Inlnol／L依地酸（IZD．－－x），互％十二烷基硫酸钠（SDS），0．5lug…     

Survivin蛋白在食管鳞状细胞癌中的表达及意义

目的:探讨Survivin蛋白在食管鳞状细胞癌中的表达和临床意义。方法:S-P法检测86例食管鳞癌标本及其癌旁组织Survivin蛋白表达情况,研究其与食管鳞癌临床病理特征之间的关系。结果:Survivin蛋白主要位于肿瘤细胞胞质,在食管鳞癌组织阳性表达率为75.5%(65/86),癌旁组织中不表达,其表达与淋巴结转移密切相关(P<0.05),与鳞癌分化程度无关(P>0.05)。结论:Survivin表达可能与食管鳞癌的发生、发展及淋巴结转移密切相关,其表达水平可以作为判断食管癌恶性潜能的重要生物学指标。     

食管鳞状细胞癌p53基因突变研究

目的 为进一步阐明p53基因突变和p53蛋白过度表达的关系及两者与食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma，ESCC）发生发展的相关性。方法采用激光显微切割，PCR扩增，单链构象多态性分析，直接测序和免疫组织化学方法，检测56例ESCCp53基因突变和p53蛋白过度表达情况。结果 总的突变率为77％（43／56），主要形式为点突变64％，而最好发生突变的部位是外显子5，占51％。最多的碱基转化形式是G→CA：T或C：G→T：A，占55％。p53蛋白过表达阳性为46％（26／56），其中23例含有p53基因突变，两者符合率高达95％（53／56）。结论 p53基因的缺失突变及p53蛋白过表达与食管鳞状细胞癌的发生发展密切相关。p53蛋白过表达在很大程度上可以反映p53基因的功能状态。     

食管鳞状细胞癌p16基因变异及其与肿瘤病理的关系

目的 探讨p16基因与原发性食管鳞状细胞癌发生、发展的关系。方法 应用聚合酶链反应-单链构象多态分析方法检测53例食管鳞状细胞癌组织中p16基因的缺失和突变，分析p16基因变异与食管鳞状细胞癌的临床病理关系。结果 53例食管癌患者中，14例为p16基因纯合性缺失，12例存在突变。p16基因变异在淋巴结转移、远处转移及临床分期方面差异有显著性(P＜0．05)；在性别、年龄、肿瘤长度及肿瘤浸润深度方面差异无显著性(P＞0．05)。结论 p16基因的缺失与突变可能是食管鳞状细胞癌的晚期事件，它在食管癌的发生、发展中起重要作用。p16基因缺失与突变的检测可作为判断食管鳞状细胞癌恶性程度、发展及预后的一个重要指标。     

老年食管鳞状细胞癌放疗疗效及影响预后因素研究

目的探讨影响老年食管鳞状细胞癌放疗治疗的生存因素。方法回顾性分析2007年10月～2008年9月来我院就诊并予以放射治疗的148例食管鳞状细胞癌患者的临床资料。结果148例患者经治疗完全缓解43例,部分缓解69例,无缓解36例,总有效率为75．68％。本组患者1、3年的生存率分别为91．22％、66．22％,中位生存时间为41．9个月。单因素分析：老年食管癌患者的化疗史、放射剂量、放疗方式与放疗疗效密切相关。多因素分析：老年食管癌患者的近期疗效、放疗剂量与预后密切相关。结论对近期疗效未缓解、放疗剂量〈60Gy的老年患者,临床上需予以特别观察,以提高其临床生存率。     

中期因子在食管鳞状细胞癌中的表达及生物学功能研究

目的:探讨中期因子(midkine,MDK)在食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中的表达及其生物学功能.方法:收集本院胸外科行手术切除的食管鳞状细胞癌组织及对应癌旁组织60例,采用免疫组化染色方法检测肿瘤组织及对应癌旁组织中MDK的表达情况,统计分析MDK表达与肿瘤临床病理特征间的相关性;体外培养人食管鳞状细胞癌Eca-109细胞,利用siRNA特异性敲低细胞内MDK的表达水平,分别采用MTT及流式细胞仪检测Eca-109细胞增殖及凋亡能力的变化.结果:与癌旁组织相比,ESCC组织中MDK呈明显高表达趋势(P＜0.05);ESCC组织中MDK高表达与肿瘤体积增大(＞3 cm)、肿瘤淋巴结转移及高TNM分期(Ⅲ+Ⅳ期)相关(P＜0.05);在体外,敲低MDK表达可显著抑制Eca-109细胞增殖能力,并促进细胞凋亡的发生(P＜0.05).结论:中期因子与食管癌组织生长有关,特异性下调食管癌细胞内MDK的表达能够显著抑制食管癌细胞增殖并促进其凋亡的发生.     

食管鳞状细胞癌染色体13q11-12杂合性丢失

目的分析食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)在13号染色体长臂11-12区(13q11-12)上的等位基因杂合性丢失(LOH),以期寻找13q11-12区上可能存在的与食管鳞状细胞癌有关肿瘤抑制基因的缺失区域。方法用9个位于13q11-12区的微卫星标志物,对56例ESCC患者组织切片激光显微切割后,进行PCR-LOH分析;56例ESCC患者包括34例有上消化道癌家族史,22例无上消化道癌家族史。结果56例ESCC患者中,49例(87.5%)显示一个或更多位点LOH;并发现一个LOH高频率区,位于位点D13S787和D13S221之间,物理距离仅有1.83 Mb;在位点D13S1236有上消化道癌家族史组LOH为89%,明显高于无上消化道癌家族史组53%(P=0.031<0.05),差异有显著性意义。结论研究提示染色体13q11-12的LOH可能在食管癌发生、发展中起重要作用;在染色体13q11-12区上,可能存在一个或多个与ESCC发生发展有关的肿瘤抑制基因(TSG)。     

BRM基因多态与食管鳞状细胞癌易感性的关联研究

目的:研究BRM-741位点和BRM-1321位点的插入/缺失多态与中国汉族人群食管鳞状细胞癌(ESCC)易感性的关系。方法:采用病例-对照研究,以聚合酶链反应-聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法,分析343例ESCC患者和362名性别、年龄等人口学特征与病例频数匹配的健康对照者的BRM-741以及BRM-1321基因型分布情况。logistic 回归分析BRM基因多态与ESCC易感性的关系。结果:BRM-741多态与ESCC的患病风险无相关性(P>0.05),而BRM-1321多态与ESCC的发生有相关性(P<0.01)。携带BRM-1321插入/插入基因型的个体发生ESCC的风险较携带BRM-1321缺失/缺失基因型者增加了94.0%(OR=1.94,95%CI=1.11~3.38)。与缺失型等位基因比较,插入型等位基因增加了35.0%的ESCC易感性(OR=1.35,95%CI=1.07~1.71)。结论:BRM-1321多态与中国汉族人群ESCC遗传易感性有关,BRM-741基因多态与中国汉族人群ESCC的患病风险无关。     

食管鳞状细胞癌中SFRP4表达水平及临床意义

目的 观察分泌型卷曲相关蛋白4(SFRP4)在食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞、血清及组织中的表达,并探讨其临床价值.方法 比较食管鳞状上皮细胞系HET-1A和ESCC细胞系中SFRP4的表达情况.收集2019年6月至2020年10月联勤保障部队第九〇〇医院(以下简称"我院")诊治的70例ESCC患者、70例Barret...     

Mir-106b表达与食管鳞状细胞癌的关系

目的研究微小RNA106b（mir-106b）在食管鳞状细胞癌组织中的表达情况,并进一步分析其与肿瘤的临床病理学特征及 预后的相关性。方法收集200例2001~2007年中国医学科学院接收的食管鳞状细胞癌患者手术切除获得的肿瘤组织和相对应 的癌旁组织,采用qRT-PCR方法检测mir-106b在组织中的相对表达水平,并通过northern blot进一步验证其表达情况。应用统 计学方法分析mir-106b表达量与肿瘤临床病理学特征及预后的相关性。结果相对于癌旁组织,食管鳞状细胞癌肿瘤组织中 mir-106b的表达水平显著升高,统计学数据显示,mir-106b的表达量与淋巴结转移、肿瘤分期及吸烟有相关性（P<0.05）。并且, mir-106b表达水平较低的患者的生存率（60个月）显著高于mir-106b表达水平较高的患者（37个月,P=0.024）。另外,Cox回归 分析显示,mir-106b的表达量、区域淋巴结转移及吸烟均为是食管鳞状细胞癌患者独立预后因子（P<0.05）。结论mir-106b在 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织中高表达,且与淋巴结转移及预后不良密切相关,可用作ESCC的诊断及预后生物标志物。