九江市HIV-流行毒株基因序列测定和亚型分析

目的：了解九江市HIV-1流行毒株的亚型分布情况。方法：对采集的6份九江市HIV-1感染者的血浆样品进行RT—PCR扩增，获得GAG基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果：在6份样品中发现B’亚型HIV-1毒株四株，B亚型和A／E重组亚型HIV-1毒株各一株。结论：HIV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂，防控形势严峻。     

湖北省HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析

１９９６年８月下旬采集２０份湖北省ＨＩＶ１感染者外周血，分离单个核细胞（ＰＢＭＣｓ）提取核酸使用ＰＣＲ进行扩增获得ＨＩＶ１膜蛋白（ｅｎｖ）基因的核酸片段，并对其Ｃ２Ｖ３及邻区３５０～４５０个核苷酸序列进行了测定和分析。研究结果表明，这２０份样品均为Ｂ亚型的ＨＩＶ１毒株序列，彼此间的基因离散率为１．９％。与国际ＡＥ亚型参考序列及部分地区Ｂ亚型代表株序列相比较，湖北的２０个毒株与流行与我国云南德宏、四川和河南等地的Ｂ亚型毒株序列十分接近，均属于泰国Ｂ亚型；它们的基因离散率在１．９％～３．２％的范围内。根据以上数据及其它资料提示，ＨＩＶ１在湖北的流行时间不长，该流行区毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型ＨＩＶ１毒株密切相关。     

河北省2007年HIV-1流行毒株基因序列测定及亚型分析

HIV具有基因易变性特点,为探讨河北省HIV-1感染人群传播特点,监测不同人群中亚型毒株的分布和基因变异规律,开展了此项研究.     

深圳市HIV-1流行毒株膜蛋白基因C2-V3区序列测定及亚型分析

目的对深圳市HIV-I流行毒株亚型监测分析。方法应用巢式PCR方法对26份1998年10月-1999年8月采集的深圳市HIV感染者的外周静脉血淋巴细胞样品的基因进行扩增,获得了HIV-1膜蛋白基因(env)的核进片段,并对其C2-V3区及邻近350-450个核苷酸序列进行了测定和分析。结果26份样品中,7份为B亚型、5份为C亚型、14份为E亚型。结论深圳地区人群中流行的HIV-1毒株归属于E、B、C三种亚型,尚未发现其它亚型。     

北京入境人员中HIV-1感染毒株的序列特征和亚型分析

[目的]了解北京入境人员中HIV-1型感染毒株的分子流行病学特征。[方法]采集12份确认为HIV-1型感染者的全血，分离单核细胞(PNMC)，提取前病毒DNA，通过套式PCR扩增得到12份样品的结果，并对其env C2-V3区进行序列测定和分析。[结果]得到的样品分别属于HIV-1型的A、B、C亚型和重组AE型流行株。[结论]北京口岸入境人员中HIV-1型毒株的感染情况比较复杂。提示应加强对入境人员的HIV-1的检测，防止其它亚型的HIV-1型毒株传人我国。     

湖北省HIV-1 B′亚型核心蛋白基因序列分析

目的 分析湖北省人类免疫缺陷病毒(HIV-1)主要流行株核心蛋白(gag)基因P17/24区序列特征,了解其流行特点和变异规律.方法 对湖北省HIV-1主要流行区域进行流行病学调查,应用巢式聚合酶链反应对102例HIV-1感染者的gag基因P17/24区进行扩增,对阳性扩增样本进行基因测序和序列分析.结果 湖北省共发现4种HIV亚型和重组亚型,B'亚型占82.69%,B'/C重组毒株、CRF01-AE重组毒株各占7.69%,C亚型占1.92%;基因序列分析显示,湖北省HIV-1 B'亚型与我国河南和云南省等地的毒株有较高的同源性;氨基酸序列变异分析显示,HIV-1 B'亚型毒株gag基因P17/24区发生不同程度的变异,P17突变位点较多,P24较为保守.结论 B'亚型依然是湖北省HIV优势流行株,HIV-1在湖北省有加快流行和进一步复杂化的趋势.     

浙江省HIV-I流行毒株GAG基因序列测定和亚型分析

〔目的〕利用分子生物学方法了解浙江省境内HIV -I流行毒株的亚型。〔方法〕采集 14份浙江省检出的HIV -I抗体阳性者的抗凝全血 ,从中提取前病毒DNA作为PCR扩增的模板 ,设计特异性引物对gag基因区进行扩增并测定其序列。所得序列与国际标准或参考序列进行比较 ,确定亚型。〔结果〕14份样本中有 9份扩增阳性并得到相应序列 ,扩增率为 6 4 .3%。经过离散率计算和系统树分析后证实 4份样本为A/E流行重组模式 ,3份样本为B亚型 ,1份样本为B/C流行重组模式 ,1份样本为G亚型。〔结论〕目前浙江省境内有多种亚型的HIV -I毒株存在。迫切需要对高危人群进行宣传教育和行为干预措施以阻断HIV/AIDS的流行和传播。     

浙江省HIV-Ⅰ流行毒株GAG基因序列测定和亚型分析

[目的]利用分子生物学方法了解浙江省境内HIV-Ⅰ流行毒株的亚型.[方法]采集14份浙江省检出的HIV-Ⅰ抗体阳性者的抗凝全血,从中提取前病毒DNA作为PCR扩增的模板,设计特异性引物对gag基因区进行扩增并测定其序列.所得序列与国际标准或参考序列进行比较,确定亚型.[结果]14份样本中有9份扩增阳性并得到相应序列,扩增率为64.3%.经过离散率计算和系统树分析后证实4份样本为A/E流行重组模式,3份样本为B亚型,1份样本为B/C流行重组模式,1份样本为G亚型.[结论]目前浙江省境内有多种亚型的HIV-Ⅰ毒株存在.迫切需要对高危人群进行宣传教育和行为干预措施以阻断HIV/AIDS的流行和传播.     

陕西省HIV-Ⅰ流行毒株亚型分析

目的了解陕西省近年来发现的人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者所携带毒株的基因序列特征、亚型种类和毒株来源以及在各高危人群中的分布,推断其传播来源和流行趋势,为本省艾滋病防治工作提供技术资料。方法对HIV感染者进行流行病学相关因素调查,无菌采集HIV感染者抗凝全血,提取前病毒DNA,应用套式聚合酶链式反应（nested-PCR）扩增其膜蛋白基因env,对其C2～V3区及邻区的核苷酸序列进行测定,用GCG软件（Wisconsin公司）进行亚型分析。结果35份样本PCR扩增阳性并得到相应序列。经基因离散率计算和系统树分析,共发现4种HIV-1基因亚型和重组毒株,即HIV-1 B’、C、CRF01-AE和CRF-BC重组型。其中泰国B’亚型为主要流行株,占82.35%（28/34）,主要来源于既往采供血者及其配偶;其次是CRF-BC重组型,占11.77%（4/34）,主要来源于吸毒人群：CRF01-AE和C亚型各1份,分别占2.94%,均来自劳务输出的归国人员。该组样本B’亚型内的基因离散率为5.2%（n=23）;而CRF-BC亚型内的基因离散率为0.9%（n=3）,彼此间显示出较近的传播关系。结论陕西省HIV-1流行株以泰国B’亚型为主,发生在与既往有偿采供血相关的地区和人群,已有6～7年的流行史;首次在当地吸毒人群中发现HIV-1 CRF-BC重组型,并且显示近期高度流行的趋势。加强对既往有偿献血人群和吸毒人群的行为干预,控制HIV病毒在家庭内和吸毒人群中的传播,将是今后本省艾滋病防治工作重点之一。     

HIV-1基因亚型研究进展

HIV的典型遗传特征之一是高度的遗传多样性,这一特征为艾滋病患者的抗病毒治疗和HIV疫苗的研制带来了困难,然而也为研究人群中病毒的传播和进化提供了有利条件.根据HIV基因序列和氨基酸序列的特征,HIV-1可分为多种亚型.对HIV-1基因亚型的分析,可敏感地提示HIV的流行信息,及早发现新的HIV亚型毒株的传播,预测HI流行趋势,为艾滋病诊断试剂的更新换代、HIV疫苗的研制提供依据,还可用于估计疾病进展及抗病毒药物治疗的敏感性与耐药性,在预防和控制艾滋病方面发挥重要作用.     

广东省HIV-1流行株的基因亚型分析

目的　了解广东省人免疫缺陷病毒 - 1(HIV - 1)感染毒株的亚型分布情况。方法　用巢式聚合酶链反应 (nPCR)技术 ,对 1998年初至 2 0 0 2年 2月间广东省内 13例HIV - 1感染者血标本进行膜蛋白基因 (env)部分片段扩增 ,将扩增产物克隆至T载体上并进行序列分析。结果　在 11例扩增成功的血标本中 ,B亚型 6例 ,其中 3例来自献血人员 ,1例为性乱人员和 2例为吸毒人员 ;E亚型 5例 ,其中 3例为性乱人员 ,1例来自吸毒人员 ,1例来自献血人员。 5例E亚型基因离散率为 ( 6 6± 3 8) % ;6例B亚型基因基因离散率为 ( 7 6± 1 9) % ,与来自泰国和国内的B亚型代表株最接近。结论　广东省至少有HIV - 1B和E亚型毒株流行 ,且分布广泛 ,来源复杂     

浙江省HIV-1 CRF01_AE流行株的分子特征分析

目的 分析艾滋病病毒1型(HIV-1)CRF01_AE重组毒株在浙江省的分子流行特征.方法 提取234例HIV-1感染者基因组DNA用巢式聚合酶链反应(nPCR)方法扩增gag部分基因片段,测定序列以后分析核苷酸和氨基酸序列.结果 在扩增阳性并成功测序的192个序列中HIV-1CRF01 AE有81个,占42%,是浙江省HIV主要的流行毒株之一.系统进化树中存在3个bootstrap值＞60的分支簇,其中MIX组包括47个序列,内部基因离散率为2.4%±0.7%,与参考株CM240的基因离散率为3.4%±0.5%;SEX组包括7个样本,组内基因离散率为3.0%±1.2%,与参考株的基因离散率为3.9%±1.0%;MSM组包括12个样本,组内基因离散率为2.8%±1.1%,与参考株的基因离散率为4.9%±0.6%,三者差别有统计学意义.特征性氨基酸分析表明MIX组、SEX组、MSN组共享序列与国际参考株共享序列之间分别存在2个、4个和8个位点的差异.结论 浙江省内HIV-1 CRF01 AE流行株中主要存在三个进化簇,其中两个簇与广西来源株密切相关.CRF01_AE毒株在浙江省内主要以异性性途径和注射吸毒形式传播.     

广东省人免疫缺陷病毒1亚型基因序列特征分析

目的研究广东省人免疫缺陷病毒1（HIV-1）亚型的基因序列特征。方法2002年采集100份HIV-1感染者的外周静脉抗凝血,分离单核细胞（PBMC）,提取前病毒DNA,通过聚合酶链反应（PCR）扩增,获得包膜蛋白（ENV）区基因的核酸片段,并对其C2～V3及邻区核苷酸序列进行测定和分析。所得序列用GCG软件包进行系统进化树和氨基酸变异分析。结果经过离散率计算和系统进化树分析后证实,其PCR扩增阳性的75份样品中,44份（58．7％）为重组毒株CRF01-AE（circulating recombinant form 01-AE）,27份（36％）为CRF—BC,4份为泰国B’亚型（5．3％）。结论广东省HIV-1以CRF01-AE和CRF—BC为主,也存在泰国B’亚型。目前我省境内有多种亚型存在,流行趋势日益严峻。加强艾滋病患者的治疗,以及控制和预防艾滋病的传播是今后面临的重要任务。     

北京市2006年HIV一1流行毒株的gag和env基因序列测定及亚型分析

目的监测2006年北京市北京户籍HIV感染者中HIV-1型流行病毒株的亚型分布特点和变化规律。方法采集北京市2006年新确认北京户籍HIV-1感染者的抗凝全血样品32份,分离血浆,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应方法扩增病毒gag和env基因,并进行序列测定和亚型分析。结果系统进化分析表明北京户籍HIV-1感染者样品分别属于5个亚型,分别为B亚型9份,泰国B亚型2份、C亚型2份,流行重组型CRF07 BC亚型5份,流行重组型CRF01．AE亚型4份。结论北京市居民中已存在多种HIV-1亚型和流行重组型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略。     

辽宁省流行的人类免疫缺陷病毒1基因亚型调查

目的：了解辽宁省人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus-1,HIV-1)各亚型的流行情况,方法：采集1997年6月至2000年12月间辽宁省检出的16例HIV-1感染者的全血标本,提取核酸后用巢式－聚合酶链反应（nested-PCR)技术扩增HIV-1env基因区,用异源双链泳 动分析法（heteroduplex mobility assay,HMA进行HIV-1亚型的分析,结果：辽宁省目前已有HIV-1A、B'、C和E亚型流行。经性途径感染占全部HIV感染的31．25％,分别为泰国B（B'）亚型和A亚型,以B'为主;经注射吸毒感染占全部HIV感染31．25％,分别为C亚型和E亚型,以C亚型为主,其中1名吸毒者为B或E亚型;经输供血途径感染占全部HIV感染的31．25％,主要为泰国B'亚型,也可见C亚型,垂直传播1名为A亚型。结论：辽宁省已有多种亚型HIV-1毒株流行,有效地控制艾滋病经性乱,吸毒和输供血途径传播的问题已迫在眉睫。     

河南省1157份人免疫缺陷病毒1型毒株亚型分析

目的 了解河南省人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株的亚型状况及序列变异、流行特征,分析其传染来源及传播规律,为河南省艾滋病防治策略提供依据.方法 对2005-2006年在河南全省收集的1157例HIV-1感染者抽取静脉血,分离单个核细胞(PBMC),用套式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸(DNA)的膜蛋白(env)基因进行扩增,并对其C2V3区核苷酸序列进行了测定和分析.结果 1157份样本中存在B'、C亚型及BC、AE 2个重组亚型.其在所有分析样本中的比例分别为96.456%(1116/1157)、0.346%(4/1157)、2.593%(30/1157)、0.605%(7/1157).与国内及国际的参考毒株RL42、C.95in21068、07-BC.CN.97.C54A、01AE.TH.90.CM240间的离散率分别为(8.971±3.182)%、(5.109±0.112)%、(3.568 4±0.254)%、(4.775±0.128)%.B'亚型以既往有偿献血人员为主,BC亚型以性传播为主,AE亚型以性传播及既往献血途径为主,C亚型以性传播为主.结论 目前河南省艾滋病感染者中有B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型.泰国B'亚型依然占主导地位.在局部地区,非B'亚型有聚集的现象,应引起当地卫生机构的注意,加大对流动人员的检测.     

河南省人免疫缺陷病毒1型流行现状研究

目的 了解河南省人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株的亚型状况及序列变异、流行特征,分析其传播来源和传播规律.方法 对2006-2007年在河南省采集的1287例HIV-1感染者抽取静脉血,用巢式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸的env基因和gag基因进行扩增,并测定和分析核苷酸序列.结果 1287份样本中存在B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型,其在所有分析样本中的比例分别为95.882%(1234/1287)、0.466%(6/1287)、2.875%(37/1287)、0.777%(10/1287).与国内及国际的参考毒株RL42、C.95in21068、07-BC.CN.97.C54A、01AE.TH.90.CM240间的离散率分别为(9.327±0.245)%、(5.214±0.183)%、(6.278±0.194)%、(5.332±0.1 58)%.结论 目前河南省艾滋病感染者中有B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型.泰国B'亚型依然占主导地位.B'亚型以既往有偿献血人员为主,BC亚型以性传播为主,AE亚型以性传播及既往献血途径为主,C亚型以性传播为主.     

山东省HIV-1C亚型毒株的分子流行病学研究

目的 了解HIV—1C亚型毒株在山东省不同人群中的流行传播情况，分析其传染来源和传播规律。方法 采集7份HIV—1感染的外周静脉防凝血，提取前病毒DNA进行体外扩增，获得包膜蛋白(env)基因的核酸片段，并对其C2—V3及邻区的核苷酸进行测定和分析。结果 7份血样均为HIV—1C亚型感染，系统树和基因距离分析发现，其中5株靠近07—BC重组毒株，2株靠近08—BC重组毒株。结论 山东省C亚型有重组株存在的可能，且人群分布广，传播途径多样，具有广泛传播的潜在危险。