H5N1禽流感病毒变异后更易致人感染

据Medscape．com10月5日报道，H5N1禽流感病毒变异后更易致人感染，不过目前还没有演变出可以导致广泛流行的毒株。     

福建省人感染HSN1禽流感病毒血凝素基因测定和分析

目的了解我省人感染高致病性禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因的特点以及和其他毒株序列间的关系。方法从采集自两例福建省感染者的标本中扩增H5N1禽流感病毒血凝素基因并作序列测定，获得的序列同其他H5N1禽流感病毒的血凝素基因进行比较并作进化分析。结果获得福建省的两例感染者中的H5N1禽流感病毒血凝素基因，并推导出该基因的氨基酸序列。结果表明，两株病毒的血凝素基因在蛋白酶水解位点均含有多个连续的碱性氨基酸，符合高致病性禽流感病毒的特征。经Blast程序检索发现，我省两例感染者与国内其他省份的感染者携带的病毒血凝素基因具有很高的相似性，提示国内的H5N1禽流感病毒感染者的病毒来源可能有一定的关系。结论通过对两例福建省感染者标本中的H5N1禽流感病毒血凝素基因进行序列测定，了解病毒基因的部分特点。通过序列比较分析为分子流行病学调查提供线索，但还需对其他基因序列以及病毒的致病性等生物学特征作进一步分析。     

广东省首例人禽流感H5N1 NS、M和NP基因序列测定及分子进化分析

目的对广东省首例人禽流感H5N1的3个内部基因NP、NS和M进行克隆、测序及遗传进化分析,旨在进一步了解该病毒的来源、遗传变异及其分子进化特征。方法采集该例死亡患者尸检肺组织标本提取病毒RNA,用RT-PCR二步法进行反转录和基因扩增。产物经TA克隆到载体中进行测序并对结果进行排列、拼接,参照已发表的病毒序列,对基因进行系统进化分析。结果应用随机引物和自行设计的3对特异性引物扩增出NP、NS和M基因全长cDNA序列。该3个基因同其HA、NA一样均属于A型禽流感病毒,与国内2004-2006年浙江人源病毒及湖南禽源病毒处于同一进化分支,而与香港1997年分离株相距较远。在这3个基因中,NS的变异性最大。宿主特异性相关基因及PDZ结构域配体(PL)基序分析显示其均为禽源基因。结论感染该病例的H5N1与近年在中国不同省份分离的人禽流感H5N1的系统进化分析显示它们很可能存在共同的祖先,需进一步研究不同来源病毒的亲缘关系以及病毒基因的变化是如何影响病毒的生物学特性、毒力和跨宿主传播的。     

福建省人感染H5N1禽流感病毒血凝素基因测定和分析

目的了解我省人感染高致病性禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因的特点以及和其他毒株序列间的关系。方法从采集自两例福建省感染者的标本中扩增H5N1禽流感病毒血凝素基因并作序列测定,获得的序列同其他H5N1禽流感病毒的血凝素基因进行比较并作进化分析。结果获得福建省的两例感染者中的H5N1禽流感病毒血凝素基因,并推导出该基因的氨基酸序列。结果表明,两株病毒的血凝素基因在蛋白酶水解位点均含有多个连续的碱性氨基酸,符合高致病性禽流感病毒的特征。经Blast程序检索发现,我省两例感染者与国内其他省份的感染者携带的病毒血凝素基因具有很高的相似性,提示国内的H5N1禽流感病毒感染者的病毒来源可能有一定的关系。结论通过对两例福建省感染者标本中的H5N1禽流感病毒血凝素基因进行序列测定,了解病毒基因的部分特点。通过序列比较分析为分子流行病学调查提供线索,但还需对其他基因序列以及病毒的致病性等生物学特征作进一步分析。     

科学家发现H5N1型禽流感病毒变异速度惊人

据中国网10月15日报道，在一名越南患身上的H5N1型禽流感病毒毒株中，美国、日本和越南研究人员发现了一些毒株对目前最有效的流感药物“达菲”已具有抗药性。科学家警示，禽流感病毒的变异速度大大超出人们的想象，各国绝不能单纯依赖达菲。     

2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒HA、NA及NS基因进化分析

目的 分析2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血凝素(Hemagglutinin,HA)、神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)及非结构蛋白(Non-structural,NS)基因进化特征.方法 从2014年长沙市活禽市场采集501份环境标本,利用Real-time PCR方法进行A型、H5、H7和H9亚型流感病毒核酸检测,并对单一H5阳性标本进行核苷酸测序,病毒HA、NA和NS基因测序结果进行在线BLAST分析,利用Mega5和Bioedit软件构建核苷酸进化树和氨基酸(Amino acids,aa)比对.结果 从501份环境标本中检出A型H5亚型病毒阳性标本177份(检出率35.33％),其中8份标本经核苷酸测序鉴定为H5N1亚型病毒,进化分析表明大部分H5N1病毒HA基因位于2.3.2分支内,聚集形成一个新亚分支,NA及NS基因位于2.3.2.lb亚分支.HA蛋白受体结合位点aa为QSG,表现为禽流感病毒受体特征;NA蛋白未出现H275Y及N295S aa替换,对神经氨酸酶抑制剂敏感;HA、NA及NS蛋白关键分子位点表现为高致病性的分子特征.结论 2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒HA、NA和NS基因表现为高致病性的分子特征,但不具有对人易感的受体特征,需要进一步监测.     

2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型禽流感病毒分子特征和遗传进化分析

目的 分析2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型禽流感病毒的分子特征和遗传进化特点，为禽流感防控提供参考依据。方法 对2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型单阳性标本进行复核，筛选出Ct值小于30的标本，对HA和NA基因进行靶向扩增和二代测序，从NCBI和GISAID数据库下载参考序列，使用生物信息学软件分别对HA和NA基因进行分子突变位点和遗传进化分析。结果 共完成12株H5亚型HA和NA全基因测序。序列比对结果显示，HA基因最高一致性在98.59%～99.89%,NA基因最高一致性在98.19%～99.85%。遗传进化分析显示，HA基因归属于Clade 2.3.4.4h分支，NA基因归属于欧亚谱系H5N6和H6N6分支。12株毒株的裂解位点均为高致病性禽流感病毒分子特征，受体结合位点为禽源受体，但S123P、S133A、I151T、T156A突变可增强病毒与人源受体的亲和力。HA基因糖基化位点分析显示，常见154位糖基化位点缺失，在124位(-NHTS)新增潜在糖基化位点。结论 2018-2019年福建省禽类外环境中存在Clade 2.3.4.4h进化分支H5N6高致病...     

广东地区人禽流感H5N1毒株神经氨酸酶基因的特征与变异

目的通过对人禽流感H5N1毒株神经氨酸酶（NA）基因序列变异的分析，揭示毒株NA基因的变异与进化。方法检测广东GD01—06毒株NA基因核苷酸序列，同时对全球各地人禽流感H5N1毒株NA基因进行检索，采用DNAStar 5．0软件对检索的人禽流感H5N1毒株NA基因核苷酸序列进行比对和分析；并结合地区资料对变异毒株进行进化速度分析。结果1997至2006年53株毒株NA基因112个氨基酸位点全部置换，占24．9％（112／450）；53株毒株分为两个系列：1997年人禽流感毒株为-个系列，2003至2006年毒株为另-系列。毒株GD-01-06与PC6231-04核苷酸序列同源性为94．1％，与1997、2004至2005年毒株比较，毒株GD-01-06发生Y081H、E363G位点置换。2003至2006年所有毒株均丢失第53位异亮氨酸，且第49位半胱氨酸置换为异亮氨酸，改变蛋白质二级结构。与同义突变比较，毒株GD-01—06的NA基因错义突变错义进化速率（Ka）大于同义进化速率（Ks），显示NA基因进化受到明显选择性免疫压力。结论1997至2006年53株毒株NA基因进化分为两个系列；NA基因进化受到明显选择性免疫压力；2003至2006年毒株C049I置换，导致蛋白质二级结构改变，其意义尚待探讨。     

H5N1亚型禽流感病毒NS1基因在大肠杆菌和昆虫细胞中的表达

目的构建大肠杆菌表达载体pET-NS1和昆虫杆状病毒转移载体pFast-NS1,将H5N1亚型禽流感病毒NS1基因分别在大肠杆菌和昆虫细胞中进行表达,表达产物用Western blot进行检测分析。方法酶切含有NS1基因的质粒pUC-NS1,分别克隆进大肠杆菌表达载体pET-28a(+)和杆状病毒转移载体pFastBac HT A中,分别获得表达载体pET-NS1和pFast-NS1。将pET-NS1转化大肠杆菌BL21,以异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)进行诱导表达;将pFast-NS1转化DH10Bac感受态细胞,提取重组Bac-NS1DNA,以M13为通用引物作PCR鉴定,阳性Bac-NS1用脂质体转染sf9细胞,72h后收集感染细胞。大肠杆菌表达产物和细胞表达产物分别裂解后作SDS-PAGE和Western blot分析。结果成功构建了大肠杆菌表达载体pET-NS1和昆虫杆状病毒转移载体pFast-NS1,大肠杆菌和昆虫细胞中表达的融合蛋白Western blot都能检测到特异性条带。结论NS1基因在大肠杆菌和昆虫细胞中得到成功表达,为获得大量NS1蛋白进行功能研究及抗体制备奠定了基础。     

日、美、英科学家发现禽流感变异关键部位

据医药网12月20日报道，日、美、英三国科研人员对H5N1高致病性禽流感病毒的研究获重大突破，他们确定了病毒基因中两处关键部分，只要这两处发生变异，H5N1病毒就能更容易地感染人类。[第一段]     

DG01株H5N1亚型禽流感病毒全基因组序列分析

根据国内外已公布的AIV H5N1亚型全基因组序列设计了8对引物,对H5N1亚型高致病力禽流感病毒毒株A/Duck/Guangdong/DG01/05(简称DG01)毒株进行了全基因组RT-PCR、测序及序列分析。DG01株基因组由PB22 341bp,PB1 2 341bp,PA2 233bp,HA1 779bp,NP 1 565bp,NA1 398 bp,M1 027bp,NS 875 bp 8个节段组成,与往年及同年一些流行株比较分析结果显示,DG01株具有高致病性禽流感病毒基因特征,NA基因及NS1基因均有部分缺失,从基因特点分析属于2005年流行代表株。     

H5N1禽流感病毒感染孕鼠的研究

目的用H5N1禽流感病毒感染昆明孕鼠,检测病毒在感染孕鼠各组织脏器中的复制及分布情况,并证明病毒能否通过孕鼠的胎盘垂直传染给胎鼠。方法用虎源H5N1亚型禽流感病毒滴鼻感染妊娠10-12 d的昆明孕鼠,观察孕鼠感染后的临床症状。接种病毒后第3、4、5、6和7 d分别处死3只孕鼠,取孕鼠的肺、脑、脾、肾、子宫、胎盘及胎鼠,利用RT-PCR、Real-time PCR和病毒分离方法检测各组织中的病毒核酸和病毒滴度,并进行病理组织学与免疫组织化学检测。结果昆明孕鼠接种病毒后第3 d,即可在肺、脑、脾、肾、子宫及胎盘组织中检测出H5N1禽流感病毒核酸,并从子宫、胎盘分离出H5N1禽流感病毒;感染后第6 d,从胎鼠体内检测到病毒核酸并分离出H5N1禽流感病毒。结论H5N1亚型禽流感病毒可以感染孕鼠,在孕鼠子宫和胎盘复制,感染后期可通过胎盘屏障传给胎鼠。     

H5N1禽流感病毒抗原基因的体外转录及RNA标准品构建

目的 通过基因克隆和体外转录,获得H5N1禽流感病毒血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)、基质蛋白M(M)基因的RNA片段,为病原学检测提供阳性定量标准品.方法　设计H5N1禽流感病毒的HA、NA及M基因全长开放阅读框的克隆引物,提取H5N1禽流感病毒总RNA,用RT-PCR获得相应片段,分别连接至Pgem-T easy...     

人感染H6N1禽流感病毒HA基因的分子特征及进化分析

目的 检测人感染H6N1禽流感病毒HA基因的分子特征、致病机制、来源及进化。方法 从Flu和GISAID两大数据库中获得人感染H6N1及近缘禽流感病毒的HA序列,通过ML、MP、BI法构建系统发育树,推测进化速率和最近共同祖先(TMRCA)时间,并分析相关变异位点、糖基化位点及裂解位点。结果 人感染与台湾3株禽感染H6N1病毒聚成一支,最近共同祖先时间为2002年,目前正在流行,且进化速度很快。其氨基酸序列含有5个N-糖基化位点和2个O-糖基化位点,裂解位点上游仅1个碱性氨基酸,拥有两个特异的变异位点P186L和A287T。结论 人感染H6N1禽流感病毒目前仍是一种低致病性禽流感病毒,其HA基因由家鸡的序列进化而来。由于其高的进化速率及病毒重配的可能性,应引起高度重视。     

含H5N1禽流感病毒核酸序列的病毒样颗粒的制备及应用

目的构建耐RNase酶的内含禽流感病毒H5N1亚型部分核酸序列的病毒样颗粒。方法构建中间载体pET32a-MS2,将禽流感病毒H5N1亚型的HA、NA和M基因片断连接到中间载体上,构建原核表达载体pET32a-MS2-HA,pET32a-MS2-NA和pET32a-MS2-M,分别转化宿主菌,诱导表达制备病毒样颗粒。结果表达载体经PCR、酶切鉴定和测序分析后证实构建成功。电镜观察到了病毒样颗粒,荧光定量RT-PCR试验表明颗粒稳定性良好。结论成功构建了含禽流感病毒H5N1部分核酸序列的病毒样颗粒且稳定性良好,可作为禽流感H5N1亚型RNA检测的标准品和质控品。     

Global epidemiology of human infections with highly pathogenic avian influenza A (H5N1) viruses

Abstract:   From 1997 through 2007, human infections with highly pathogenic avian influenza A (H5N1) viruses resulted in rare, sporadic, severe and fatal cases among persons in 14 countries in Asia, the Middle East, Eastern Europe and Africa. Of 369 reported human H5N1 cases that occurred from 1997 through 2007, overall mortality was 60%. Ten antigenically and genetically distinct clades of H5N1 viruses have been identified to date, and strains from four clades have infected humans. Surveillance has focused upon hospitalized cases of febrile acute lower respiratory tract disease among persons with exposure to sick or dead poultry, or to a human H5N1 case. Detection of H5N1 virus infection is based primarily upon collection of respiratory tract specimens from suspected cases for RT-PCR testing. Most human H5N1 cases were previously healthy children or young adults who developed severe acute pulmonary or multi-organ disease following direct or close contact with sick or dead H5N1 virus–infected poultry. Occasional clusters of H5N1 cases have occurred, predominantly among blood-related family members. Limited human-to-human H5N1 virus transmission has been reported or could not be excluded in some clusters. The frequency of asymptomatic or clinically mild H5N1 virus infection is unknown, but limited investigations suggest that such infections have been rare since 2003. There is no evidence of sustained human-to-human H5N1 virus spread. However, H5N1 viruses continue to circulate and evolve among poultry in many countries, and there are many unanswered questions about human infection with H5N1 viruses. Thus, the pandemic influenza threat presented by H5N1 viruses persists.     

H6N6亚型禽流感病毒进化演变及跨种属传播研究进展

H6N6亚型禽流感病毒(AVI)在欧亚大陆野生鸟类和家禽中广泛流行,通过适应性突变和基因重配,其宿主范围逐渐扩大,遗传分析表明该病毒是高致病禽流感病毒H5N6的先祖之一。近年来研究证实,H6N6亚型AIV可以感染小鼠、雪雕、猪等哺乳动物,甚至在健康人群中检测到H6亚型AIV的血清特异性抗体,表明H6N6亚型禽流感病毒具有跨越物种屏障感染哺乳动物的能力,并对人类健康构成潜在威胁。本文从H6N6病毒起源、流行情况、进化演变及跨种属传播的研究进展进行综述,以期为H6N6亚型AIV的防控提供参考。     

A case of avian influenza A(H5N1) in England,January 2022

On 5 January 2022, high pathogenicity avian influenza A(H5N1) was confirmed in an individual who kept a large flock of ducks at their home in England. The individual remained asymptomatic. H5N1 was confirmed in 19/20 sampled live birds on 22 December 2021. Comprehensive contact tracing (n = 11) revealed no additional primary cases or secondary transmissions. Active surveillance of exposed individuals is essential for case identification. Asymptomatic swabbing helped refine public health risk assessment and facilitated case management given changes in avian influenza epidemiology.     

Continued evolution of highly pathogenic avian influenza A (H5N1): updated nomenclature

Please cite this paper as: WHO/OIE/FAO. (2012) Continued evolution of highly pathogenic avian influenza A(H5N1): Updated nomenclature. Influenza and Other Respiratory Viruses 6(1), 1–5. Background Continued evolution of highly pathogenic avian influenza A (H5N1) throughout many regions of the eastern hemisphere has led to the emergence of new phylogenetic groups. A total of 1637 new H5N1 hemagglutinin (HA) sequences have become available since the previous nomenclature recommendations described in 2009 by the WHO/OIE/FAO H5N1 Evolution Working Group. A comprehensive analysis including all the new data is needed to update HA clade nomenclature. Methods Phylogenetic trees were constructed from data sets of all available H5N1 HA sequences. New clades were designated on the basis of phylogeny and p‐distance using the pre‐established nomenclature system (Emerg Infec Dis 2008; 14:e1). Each circulating H5N1 clade was subjected to further phylogenetic analysis and nucleotide sequence divergence calculations. Results All recently circulating clades (clade 1 in the Mekong River Delta, 2.1.3 in Indonesia, 2.2 in India/Bangladesh, 2.2.1 in Egypt, 2.3.2, 2.3.4 and 7 in Asia) required assignment of divergent HA genes to new second‐, third‐, and/or fourth‐order clades. At the same time, clades 0, 3, 4, 5, 6, 8, 9, and several second‐ and third‐order groups from clade 2 have not been detected since 2008 or earlier. Conclusions New designations are recommended for 12 HA clades, named according to previously defined criteria. In addition, viruses from 13 clades have not been detected since 2008 or earlier. The periodic updating of this dynamic classification system allows continued use of a unified nomenclature in all H5N1 studies.