血浆载脂蛋白B基因3′端可变数目串联重复序列的结构研究

目的研究载脂蛋白B(apolipoproteinB,apoB)基因apoB3′端可变数目串联重复序列(variable numberoftandemrepeats,VNTR)多态性与序列结构。方法应用聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳技术检测了522名随机抽取的体检人员apoB基因3′VNTR多态性,选取26个样本的PCR产物进行DNA序列测定。结果分离出16个等位基因即高变单元(hypervariableelement,HVE),其中杂合子多于纯合子,最大的等位基因是HVE58,最小的是HVE24;HVE34频率最高40.4%,其次是HVE32,占34.7%。对26名60个等位基因进行的DNA核苷酸测序中,发现一个等位基因异构体(Y A=ATAATTAAATATTT),4个结构模式。结论中国人与欧美人群在apoB基因3′VNTR等位基因频率分布上存在明显差异,在等位基因异构体与结构模式上也存在不同。     

冠心病家族史青少年载脂蛋白E、B的基因多态性

目的 探讨青少年载脂蛋白E(apolipoprotein E，apoE)、apoB基因多态性对冠心病的遗传易感性。方法 应用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性技术，对244名健康汉族大学生(冠心病家族史阳性者109人，阴性者135人)的apoE、apoB XbaI、apoB 3’可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeat ，VNTR)基因型进行分析。结果 阳性组的e4、x^ 、VNTR—B(hypervariable element，HVE＞38)等位基因频率显著高于阴性组(P＜0．05)，且与血总胆固醇、低密度脂蛋白—胆固醇、aPoBl00水平升高有显著相关(P＜0．05)。结论 apoE的e4、apoB Xba I的x^ 、apoB3’VNTR的VNTR—B可能为冠心病的重要遗传标记。     

APOB基因3′端短串联重复序列多态性与新疆维吾尔族自然长寿的关系

目的探讨载脂蛋白B（apolipoprotein B，APOB）基因第29外显子3′端可变数目串联重复序列（variable number of tandem repeat, VNTR）多态性与维吾尔族自然长寿的关系。方法选择191名年龄90岁以上的健康个体为长寿组，另选53名年龄65～70岁、性别、地域相匹配已自然死亡的正常个体为对照组。应用序列特异引物PCR和PCR-直接测序等技术对APOB进行分型，并测定等位基因HVE36和HVE48的核苷酸序列。结果在维吾尔族人群（长寿组191名，对照组53名）中，共发现14个等位基因。长寿组中HVE36、HVE42频率显著高于对照组（P〈0．05），并且HVE44、HVE46、HVE48、HVE58仅见于长寿组，而HVE26、HVE30、HVE34显著低于对照组（P〈0．05）。逐步逻辑回归分析显示，L等位基因和LL基因型与年龄呈正相关，而S等位基因和SS基因型与年龄呈负相关（P〈0．05）。核苷酸序列分析显示，每一种等位基因由富含AT的15bp长的基本单位或它们的变异体串联重复而构成。结论APOB等位基因S和基因型SS可能是维吾尔族自然长寿老人的危险因素，而等位基因L和基因型LL则是其保护因子。     

湖南地区汉族人多巴胺D4受体基因48 bp可变数目串联重复多态性分布

目的 了解湖南地区汉族人群多巴胺D4受体（dopamine D4 receptor，DRD4）基因48 bp可变数目串联重复（variable number tandem repeat,VNTR）多态性基因型及等位基因的频率分布。方法 随机抽取湖南地区304名汉族健康正常人，采用聚合酶链反应、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染技术检测基因型和等位基因的频率。结果 （1）湖南汉族人群DRD4基因48 bp VNTR多态性共检测出7种等位基因、12种基因型。最常见的等位基因是5等位基因（DRD4＊5），频率为70．6％。（2）湖南汉族人群DRD4基因48 bp VNTR多态性各等位基因频率与中国上海、北京、四川地区人群存在明显的差异。（3）湖南汉族人群DRD4基因48 bp VNTR多态性各等位基因频率与日本、美国、墨西哥、意大利人群也存在明显差异。结论 DRD4基因48 bp VNTR多态性分布存在不同程度的地区差异和种族差异。     

APOB基因3''''端短串联重复序列多态性与新疆维吾尔族自然长寿的关系

目的 探讨载脂蛋白B(apolipoprotein B,APOB)基因第29外显子3'端可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeat, VNTR)多态性与维吾尔族自然长寿的关系.方法 选择191名年龄90岁以上的健康个体为长寿组,另选53名年龄65～70岁、性别、地域相匹配已自然死亡的正常个体为对照组.应用序列特异引物PCR和PCR-直接测序等技术对APOB进行分型,并测定等位基因HVE36和HVE48的核苷酸序列. 结果 在维吾尔族人群(长寿组191名,对照组53名)中,共发现14个等位基因.长寿组中HVE36、HVE42频率显著高于对照组(P＜0.05),并且HVE44、HVE46、HVE48、HVE58仅见于长寿组,而HVE26、HVE30、HVE34显著低于对照组(P＜0.05).逐步逻辑回归分析显示,L等位基因和LL基因型与年龄呈正相关,而S等位基因和SS基因型与年龄呈负相关(P＜0.05).核苷酸序列分析显示,每一种等位基因由富含 AT的15 bp长的基本单位或它们的变异体串联重复而构成.结论 APOB等位基因S和基因型SS可能是维吾尔族自然长寿老人的危险因素,而等位基因L和基因型LL则是其保护因子.     

我国汉族人群α1基因数目可变串联重复序列分布特征的研究

目的：研究我国汉族人群免疫球蛋白α1基因中3个数目可变串联重复序列(VNTR)多态性分布特征，及其与已报道的高加索人群相比较的特点。 方法: 从现存数据库中寻找α1基因内的3个VNTR位点，即α1基因3’端的hs1,2增强子内的VNTR1、其上游6 Kb 的VNTR2和位于α1基因第5外显子的E5VNTR。 提取201例广东汉族人基因组DNA，PCR分别扩增含上述3个VNTR位点片段，2%－3％凝胶电泳分带鉴定基因型，并以测序证实。 结果: 与高加索人群比较我国汉族人群α1基因 VNTR1多态性分布特征表现为：C（3次重复）等位基因频率明显升高（10.0% vs 1.0%）， A（1次重复）等位基因频率偏低（30.3% vs 36.1%-39.4%）, 差异显著（χ2=72.85，P＜0.01）。 基因型BB占37.8％， AB占32.3％，AA占12％，BC占11.4％, AC占4.5％, CC占2.0％， BC、AC基因型分布频率显著高于高加索人群，而AB型分布频率显著低于高加索人群（χ2=73.77，P＜0.01）。另外两个数据库中报道的VNTR位点（VNTR 2及E5VNTR）在我们所测人群中呈均一分布,PCR产物长度分别为136 bp(VNTR 2)和535 bp(E5VNTR)。 结论: 我国汉族人群α1基因 VNTR多态性分布与基因组数据库中基于高加索人群的资料不尽相同，其中Iα1 hs1,2 VNTR1多态性不同于高加索人群，突出表现为C等位基因频率及BC、AC基因型频率显著高于高加索人群。而VNTR2和E5VNTR在被检人群中未见多态性。本研究弥补了现存数据库中缺乏我国汉族人群相应数据的不足, 同时为以α1基因为候选基因找寻疾病基因的研究提供了可靠的数据。     

特发性扩张型心肌病CTLA-4基因3''非翻译区(AT)n微卫星多态性研究

目的 特发性扩张型心肌病（idiopathic dilated cardiomyopathy，IDC）的发病机制与T细胞免疫应答密切相关。细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（cytotoxic T lymphocyte antigen-4，CTLA-4）主要在已激活的T细胞上表达，通过与CIY28竞争结合B7，抑制T细胞过度激活，维持免疫系统内环境稳定。CTLA-4基因3’非翻译区（AT）n微卫星多态性影响CTLA-4功能。本研究旨在探讨外周血单个核细胞（PBMC）CTLA-表达状况及3’非翻译区（AT）n微卫星基因多态性与IDC的相关性。方法分别用原位杂交、免疫组化、序列特异性引物PCR等方法检测38例无血缘关系的北方汉族IDC患者以及50例正常对照者的CTLA-4mRNA、蛋白质表达、CTLA-4基因外显子3’末端非翻译区（AT）n重复序列多态性，并对PCR扩增产物进行序列分析。结果IDC组与对照组相比，PBMC经金黄色葡萄球菌肠毒素B刺激后CTLA-4mRNA、蛋白质表达强度显著减弱，且无一定规律；3’末端非翻译区共发现18种CTLA-4等位基因，与对照组比较，106bp等位基因频率在IDC患者中显著增高[22．22％ vs 1％，P=0．0002．OR=23．56，95％可信区间（CI）：9．65～83．74]。结论IDC患者CTLA-4基因转录和表达缺陷，该缺陷与CTLA-4基因3’末端非翻译区（AT）n重复序列多态性存在关联。     

广西地区壮族Graves病与CTLA4基因多态性相关性研究

目的分析CTLA4基因微卫星多态性与广西地区壮族Graves病（Graves’disease，GD）相关性。方法提取48例广西地区壮族GD患者和44名正常对照组的外周血白细胞基因组DNA，应用聚合酶链反应检测CTLA4第4外显子的3’非翻译区包含（AT）n[CTLA4（AT）n]重复序列的特异性等位基因。结果广西地区壮族人CTLA4微卫星多态性检出19种等位基因。壮族GD组106bp等位基因频率与正常对照组比较显著增高，差异有统计学意义（P〈0．05）。结论广西壮族GD患者与CTLA4基因多态性明显相关,CTA4（AT）n 106bp可能是广西壮族GD的易感等位基因。     

辽宁汉族人群HLA-B等位基因多态性的分布

目的调查辽宁汉族人群HLA-B等位基因的遗传多态性。方法用聚合酶链反应．序列特异性引物方法对辽宁8962名健康无关汉族人进行HLA-B等位基因分型，计算HLA-B等位基因频率并与不同人群HLA-B等位基因的多态性进行比较。结果共检出HLA-B等位基因34种，其中B＊15（14．42％）、B＊40（14．33％）和B＊13（11．99％）基因频率分布较高，B＊82、B＊83等位基因未检出；HLA-B座位特异性49种。该人群与南北方汉族人群、日本人、黑人和白人分别进行X^2检验差异有统计学意义，X^2值分别为1584．799、72．145、1393．339、7406．288和5311．947。结论辽宁汉族人群HLA-B基因多态性分布有其自身特点，它的遗传特征不同于既往的南、北方汉族。     

广西黑衣壮族人群载脂蛋白B基因3''端高可变区等位基因多态性与血脂水平的关系

目的研究广西黑衣壮族人群载脂蛋白B基因3′端高可变区等位基因(variable number of tan-dem repeats region3′of apolipoprotein Bgene,3′APOB-VNTR)多态性及其与血脂水平的关系。方法采用整群抽样方法对548名黑衣壮族人群进行流行病学调查及测定血脂和载脂蛋白水平;用聚合酶链反应和琼脂糖凝胶电泳法检测3′APOB-VNTR等位基因及其基因型的分布频率;对黑衣壮最常见的等位基因进行测序验证。并将其结果与496名当地的汉族人群作比较。结果两组人群均可检出19种高可变区等位基因(hy-pervariable elements,HVE),分别为HVE24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62和64,但黑衣壮族人群未检出HVE56和58,汉族人群未发现HVE48和62。黑衣壮族人群以HVE32的频率最高(25.9%),而汉族人群则以HVE34最常见(27.2%)。黑衣壮族人群HVE26、30、46、杂合子和小等位基因(HVE<38,S)的频率明显高于汉族人群,而HVE34、38、40、纯合子和大等位基因(HVE≥38,L)的频率则明显低于汉族人群。黑衣壮族人群带VNTR-LS基因型者的总胆固醇、高密度脂蛋白-胆固醇和载脂蛋白B水平明显高于VNTR-LL者。黑衣壮族人群纯合子者总胆固醇、高密度脂蛋白-胆固醇和载脂蛋白B水平也明显高于杂合子者。两民族组VNTR-SS基因型者的血脂水平与VNTR-LS或VNTR-LL基因型者比较差异无统计学意义。结论本研究结果显示广西黑衣壮族人群3′APOB-VNTR多态性的分布与汉族人群之间存在差异,黑衣壮族人群3′APOB-VNTR多态性与血脂水平有关联。     

吉林汉族人群HLA-A高分辨基因的多态性分析*

背景：HLA与免疫遗传学、免疫生物学密切相关,其分型对于器官移植和非感染性疾病的易感性有重要意义。 目的：调查吉林汉族人群HLA-A位点基因多态性,分析不同人群HLA-A等位基因频率分布特征。 方法：采用基因测序技术检测2 196名吉林汉族人HLA-A位点第2、3、4外显子序列,软件分析得到分型结果,计算各等位基因频率并与不同人群进行比较。 结果与结论：共检测到42种HLA-A等位基因,其中3种等位基因频率≥5%,分别是HLA-A*02:01(8.5%),HLA-A*11:01(8.2%)和HLA-A*24:02(7.3%),这3种等位基因频率合计为24.0%。同时,检测到39种等位基因频率<0.5%的HLA-A等位基因,这39种等位基因频率合计为76.0%。吉林汉族人群HLA-A等位基因频率分布与美国亚裔人群、中国香港华人、日本人相比存在一定差异。提示吉林汉族人群HLA-A基因的分布有地域特征。      

广东汉族人群HLA-B基因多态性研究

目的调查广东汉族人群HLA-B位点基因多态性，比较不同人群HLA—B等位基因频率分布特征。方法应用测序技术测定562名广东汉族人HLA-B位点第2、3、4外显子序列，比对数据库得到分型结果，计算HLA-B等位基因频率并与不同人群进行比较。结果共检测到59种HLA-B等位基因，其中6种等位基因频率≥5％，分别是HLA-B＊4601（14．5％），HLA-B＊400101（14．4％），HLA—B＊1502（11．5％），HLA—B＊1301（8．6％），HLA-B＊5801（8．1％）和HLA-B＊380201（6．4％）。这6种等位基因的等位基因频率合计为63．5％。同时，检测到30种等位基因频率〈0．5％的HLA-B等位基因，这30种等位基因的等位基因频率合计为4．9％。广东汉族人群HLA-B等位基因频率总体分布与中国香港华人、新加坡华人比较差异无统计学意义（P〉0．05），但与日本人比较差异有统计学意义。结论分析了HLA-B基因在广东汉族人群中的分布特征，提供了较完整的HLA-B等位基因频率分布资料，为遗传学及疾病相关性等研究提供了重要的参考数据。     

Characterization of HLA‐F polymorphism in four distinct populations in Mainland China

Currently, there is a lack of information on polymorphism of human leucocyte antigen‐F (HLA‐F) gene in ethnically diverse human populations. In this study, HLA‐F allelic typing was performed for 690 individuals representing two southern Chinese Han populations (Hunan Han and Guangdong Han) and two northern Chinese populations (Inner Mongolia Han and Inner Mongolia Mongol), using polymerase chain reaction‐sequence‐specific priming (PCR‐SSP) and PCR‐sequencing methods. Our results showed that (i) HLA‐F*01 : 01 predominated in each population with a frequency >0.94 and HLA‐F*01 : 03 was relatively more common in the two northern Chinese populations with a frequency of approximately 0.05; (ii) both geographical and ethnical factors are related to HLA‐F allelic distribution, as evidenced by the significant difference in HLA‐F allelic distribution between the Hunan Han population and the two northern Chinese populations; (iii) significant linkage disequilibrium (LD) was observed for haplotype HLA‐A*03‐F*01 : 03 in three populations. In most cases, this haplotype extended to HLA‐E*01 : 03; and (iv) Ewens–Watterson homozygosity statistic at the HLA‐F locus did not depart significantly from expectation in each of the four populations. Our data revealed a low level of HLA‐F allelic variation in Chinese populations, suggesting that HLA‐F gene may have existed before some of the HLA‐A polymorphism and have been evolving under neutrality.     

中国人内源性高甘油三酯血症患者载脂蛋白AⅣ基因VNTR多态性的分析

目的探讨载脂蛋白AⅣ(apolipoproteinAⅣ,apoAⅣ)基因变异与中国人内源性高甘油三酯血症是否有关联,为研究本病的分子遗传基础提供依据.方法应用多聚酶链反应和DNA片段序列分析法,对48名正常人及47例内源性高甘油三酯血症(endogenous hypertriglyceridemia,HTG)患者apoAⅣ基因3′端可变串联重复序列(variablenumbertandemrepeat,VNTR)进行分析.结果中国人apoAⅣ基因3′端VNTR多态位点CTGT三连重复[(CTGT)3]等位基因的频率为0.253,与德国白种人的0.607和意大利白种人的0.522差异存在显著性(P＜0.01,P＜0.01),而与日本人的0.262相近(P＞0.05).HTG组和对照组之间(CTGT)3等位基因的频率差异无显著性(0.223vs0.281,P＞0.05),对照组VNTR3/3基因型携带者其血清LDLC水平显著高于3/4型携带者(3.698±0.67mmol/Lvs2.974±0.54mmol/L,P＜0.05).结论apoAⅣ基因VNTR多态性与血清低密度脂蛋白胆固醇(low-density lipoprotein     

Genetic variation and relationships at six VNTR loci in two distinct sample populations in Brazil

BACKGROUND: The Brazilian population has been the focus of intensive genetic study due to admixture characteristics whereas there are few reports on the variability of VNTR loci in Brazil. PRIMARY OBJECTIVE: The aim of this study was to analyse genetic parameters in sample populations from two geographically distant regions: S?o Luis City, in Maranh?o State and Campinas City, in S?o Paulo State. We investigated if distinct colonization influences could produce detectable differences in genetic background. SUBJECT AND METHODS: DNA samples from peripheral drained blood were obtained from unrelated individuals who underwent paternity testing. Allelic variation in six VNTR loci (D2S44, D4S139, D5S110, D8S358, DI0S28 and D17S79) was evaluated. The results were compared to reference databases available for general Latin-derived European and African-American populations as well as for other Brazilian groups. RESULTS: This study reveals that forensic population parameters did not show differences among regions, although we detected admixture values varying between the south-east and north-east of Brazil. CONCLUSIONS: Differences between the two samples are probably due to different admixture proportions of European- and African-derived alleles in each region: both populations are in Hardy Weinberg equilibrium. In addition, the allelic frequency for all loci, in both populations, can be used as database for forensic purposes.     

中国乳腺癌患者BRCA1基因突变的研究

目的　在中国乳腺癌患者 BRCA1基因外显子 2、2 0和 11部分序列中寻找突变位点 ,探讨其与乳腺癌发病的关系。方法收集 86例无血缘关系的乳腺癌患者 ,用聚合酶链反应 -双链四色荧光标记的方法 ,分析 BRCA1基因的外显子 2和 2 0的全长序列和外显子 11的部分序列。结果　外显子 2、2 0和 11的序列中均未发现有突变 ,仅在外显子 11A的序列上有一个 C/ T多态 ,基因型频率高达 4 2 %。对这个高频单核苷酸多态 (single nucleotide ploymorphism,SNP)位点 ,先作了 Hardy- Weinberg检测 ,P>0 .0 5 ,确定这个 SNP的频率不受杂合性缺失的影响。再进行 χ2检测 ,与正常对照组进行比较 ,P>0 .1,两者差异无显著性。结论　这个高频 SNP位点与乳腺癌的发生无显著相关 ;在中国人群中没有发现其他乳腺癌患者人群中普遍存在的这几个突变热点 ,说明外显子 2、2 0和 11上的这部分序列对中国人群的乳腺癌发生影响不大。     

中国湖北地区IL-1RN内含子2基因多态性分布的研究

目的 :探讨湖北地区汉族健康人群白细胞介素 1受体拮抗剂(IL 1Ra)内含子 2基因多态性的分布 ,比较其在不同种族间分布的差异。方法 :采用PCR方法检测了 2 5 1例湖北地区汉族健康人群IL 1Ra基因内含子 2的可变数串联重复 (VNTR)多态性 ,并结合文献进行不同种族间的比较分析。结果 :湖北地区汉族健康人群基因型以Ⅰ /Ⅰ型最为常见 ,其次为Ⅰ /Ⅱ型 ,Ⅰ /Ⅳ和Ⅱ /Ⅱ型较为罕见 ,分布频率依次为 0 .813、0 .167、0 .0 16、0 .0 0 4;其等位基因以Ⅰ型最为常见 ,其次为Ⅱ型 ,Ⅳ型较为罕见。与美、德和日本等国家人群相比 ,该VNTR多态性均存在显著性差异 (P <0 .0 0 5 ) ,与国内江苏和重庆地区人群相比虽无显著性差异 (P >0 .0 5 ) ,但在湖北地区发现了较为罕见的Ⅰ /Ⅳ和Ⅱ /Ⅱ基因型。结论 :湖北地区汉族人群IL 1Ra基因内含子 2存在VNTR多态性 ,其在不同种族间的分布存在显著性差异