实时荧光定量PCR在细胞因子mRNA检测研究中的应用

RR-FQ-PCR技术是一种最新PCR技术,具有特异性强、灵敏度高、重复性好、定量准确、速度快、全封闭反应等优点.本文就RT-FQ-PCR概念、原理、方法、研究进展及其在细胞因子mRNA检测中的应用等作一综述.     

实时荧光定量PCR在检测人ANP基因表达的应用

目的建立心房钠尿肽（ANP）基因mRNA表达水平的实时荧光定量PCR检测方法,并对该方法进行初步评价。方法以基因表达产物为模板,建立实时荧光定量PCR检测方法,对样本中的心房钠尿肽含量进行相对定量,比较不同样本组的基因表达水平。结果所建立的实时荧光定量PCR方法熔解曲线中熔解峰单一。肺癌患者胸腔样本的ANP含量为对照样本的4.68倍,血清样本为对照样本的16.03倍。结论所建立的ANP实时荧光定量PCR检测方法具有较高的特异性。肺癌患者胸腔液和血清中ANP的含量明显增高。     

实时荧光定量PCR的应用体会

对于病毒的监测和疾病的诊断,定性检测已不能满足临床需要,实时荧光定量PCR技术(realtime quantitative PCR)于1996年由美国Aplied Biosystems公司推出.     

实时荧光定量PCR检测幼儿腹泻腺病毒

目的:建立实时荧光定量PCR方法,并检测腺病毒Ad40或Ad41感染的粪便标本。方法:用T-A克隆技术构建含腺病毒基因的载体作为标准模板,采用Taqman探针标记技术,建立实时荧光定量PCR方法。采集幼儿腹泻标本248例,分别用直接免疫荧光法和实时荧光定量PCR检测腺病毒Ad40和Ad41,比较两种方法的阳性检出率。结果:实时荧光定量PCR灵敏度和准确度(95.60%和96.80%)均高于直接免疫荧光法(78.5%和82.40%)(P0.05),而两者特异度差异无统计学意义(97.30%vs 96.70%,P0.05)。248例待检样本,直接免疫荧光法检出率为2.42%(6/248),实时荧光定量PCR检出率为7.66%(19/248),明显高于直接免疫荧光法(χ2=3.675,P0.05)。结论:成功建立实时荧光定量PCR检测腺病毒Ad40或Ad41方法。其灵敏度、准确度和阳性检出率经均优于直接免疫荧光法,且简便快速。     

实时荧光定量PCR法筛查唐氏综合征的实验研究

目的建立一种无创性、高特异性的快速筛查唐氏综合征（Down’s syndrome,DS）的检测方法。方法采用实时荧光定量PCR技术对正常人和DS患者外周血样本的有核细胞进行检测,根据△Ct值的差异建立检测方法。结果正常组和唐氏组△Ct值有显著性差异（P〈0．001）,初步建立了实时荧光定量PCR筛查唐氏综合征的快速检测方法。结论实时荧光定量PCR具有无创性、特异性高且简单、快速等优点,适用于唐氏综合征产前筛查。     

实时定量PCR技术在病毒学研究中的应用

近年来发展起来的实时定量PCR技术与传统PCR技术相比，具有灵敏度和特异性高、重复性好、检测范围宽的优点，且极大降低了交叉污染的可能性。广泛应用于病毒感染的定量检测、临床疗效和药物评价、感染人群的普查以及感染源的监测、病毒与疾病之间关系的研究等方面。     

实时荧光定量PCR在检测孕妇血HCMV感染中的研究

目的探讨实时荧光定量PCR(FQ-PCR)检测孕妇血中巨细胞病毒(HCMV)感染的应用。方法采用FQ-PCR技术,对临床疑为HCMV病毒感染的326名孕妇(观察组)和健康孕妇(对照组)210名进行检测。结果观察组和对照组的检出率分别为42.33%、3.81%,观察组HCMV感染率明显高于对照组(χ2=95.6305,P<0.01),两者之间有显著差异。结论FQ-PCR检测HCMV具有方法简单、快速、特异性强、定量准确等优点,应推荐作为检测孕妇血中HCMV感染的首选方法。     

利用荧光定量PCR技术对人肠道乳酸杆菌进行定量检测

目的应用荧光定量PCR技术对人粪便内乳酸杆菌进行定量检测,建立乳酸杆菌的荧光定量PCR检测体系。方法依据人肠道乳酸杆菌16S rDNA序列设计属特异性引物,应用荧光定量PCR技术检测乳酸杆菌的16S rDNA,对粪便中的乳酸杆菌进行定量检测和分析,并与用传统方法所获得的结果进行比较。结果荧光定量PCR检测乳酸杆菌和传统方法检测乳酸杆菌获得的结果接近,差异无统计学意义（P〉0.05）。结论荧光定量PCR技术比传统方法省时、省力,且敏感性和特异性更高。     

实时定量PCR技术在病毒学研究中的应用

近年来发展起来的实时定量PCR技术与传统PCR技术相比,具有灵敏度和特异性高、重复性好、检测范围宽的优点,且极大降低了交叉污染的可能性。广泛应用于病毒感染的定量检测、临床疗效和药物评价、感染人群的普查以及感染源的监测、病毒与疾病之间关系的研究等方面。     

多重实时荧光定量PCR对9种常见呼吸道病原体检测

目的探讨多重实时荧光定量PCR(MRT-PCR)检测9种常见呼吸道病原体的临床应用价值。方法采用Primer Express3.0(ABI)和Primer3 Input 4.0设计引物和探针建立MRT-PCR法,通过构建质粒标准品分析该方法的最低检出限和特异性。并对204例临床标本中副流感病毒1、2、3型、肺炎支原体、肺炎衣原体、呼吸道合胞病毒、腺病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒进行回顾性检测。结果 MRT-PCR法检测病原体的最低检出限达103copies/m L,特异性达100%,无交叉反应。204例咽拭子标本中,MRT-PCR检出呼吸道合胞病毒23例,副流感病毒1、2、3型13例,腺病毒15例,肺炎支原体15例,肺炎衣原体3例,甲型流感病毒13例与乙型流感病毒6例。该结果与其他试剂报告结果完全一致。结论多重实时荧光定量PCR具有快速、准确、特异性强等特点,在呼吸道病原体检测方面有重要价值。     

实时荧光PCR直接检测样本中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌应用研究

目的 探讨实时荧光PCR直接检测病人样本中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的应用价值.方法 对80例经VITEK2COMPACT药敏鉴定系统鉴定为有金黄色葡萄球菌生长(其中MRSA40例,MSSA40例)及20例未检出金黄色葡萄球菌的患者样本进行实时荧光PCR扩增,检测样本中金黄色葡萄球菌特异性核酸片段(耐热核酸酶基因nuc)及耐药基因(mecA)并与药敏鉴定比较,判断实时荧光PCR法检测MRSA的敏感性及特异性;对于两种方法检测结果不一致的18例样本重新接种培养,收集金黄色葡萄球菌菌株进行实时荧光PCR扩增,检测nuc基因及mecA基因,以期发现两种方法检测结果差异原因.结果 100例临床样本两种方法检测结果一致共82例,其中MRSA一致40例,MSSA一致22例,非金葡20例;两种方法检测结果不一致18例,均为PCR基因检测为MRSA而药敏鉴定为MSSA.MRSA检测药敏鉴定阳性40例,检出率为40％,PCR基因检测阳性58例检出率为58％;PCR基因检出率明显高于药敏鉴定,二者结果差异有显著性(P＜0.05);以药敏鉴定为标准,PCR基因检测MRSA的敏感性为100％,特异性为70％;18例金黄色葡萄球菌菌株实时荧光PCR检测MRSA结果与药敏鉴定一致.结论 实时荧光PCR直接检测患者样本中MSSA具有高度敏感性及特异性,但检测MRSA会受到样本中其他含有mecA基因菌的干扰,对于临床结果解释需慎重.即便如此,该方法对于MRSA检测在院感防控方面仍有重要意义.     

罗氏Light Cycler480实时荧光定量PCR系统检测HBV-DNA性能验证

目的 探讨适合本实验室的荧光定量PCR检测HBV-DNA的性能验证方法,评估其是否能满足临床使用要求.方法 参考GB/T 20470-2006《临床实验室室间质量评价要求》,应用实验室检测患者标本、第三方质控品、卫生部临检中心室间参考物质等,按方法学性能评价指标设计验证试验,对检测结果的精密度、准确度,线性范围和参考区间等参数进行性能验证.结果 本检测系统批内精密度和总精密度CV均小于＜5％;分析NCCL发放的高低水平的室间质评参考物,检测结果与靶值的偏倚分别为0.25IU/mL、0.23IU/mL,检测结果偏倚在-0.4～ 0.4IU/mL范围内;线性范围验证结果显示,线性回归方程为Y=0.998X-0.056,R2=0.998,斜率在0.95～ 1.05之间,截距接近于0;参考区间评价结果显示20例健康体检者HBV-DNA定量检测结果均在参考区间内(＜500IU/mL),说明引用的参考区间有效.结论 罗氏Light Cycler 480实时荧光定量PCR系统检测HBV-DNA性能指标均达到规定要求,能满足临床预期要求.     

荧光定量PCR法检测乙型肝炎病毒DNA

目的：了解不同乙型肝炎病毒(HBV)感染患者血清HBV-DNA含量与乙肝血清免疫标志物的关系并探讨其临床意义。方法：用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)方法定量检测375例不同临床类型HBV感染者及70例正常人血清HBV-DNA含量。结果：血清HBsAg阳性组与HBeAg阳性组HBV-DNA的检出率及含量均明显高于HBsAg阴性组和HBeAg阴性组，且HBeAg即使阴性，不论HBeAb阳性组或阴性组均仍有较高的HBV-DNA检出率。不同临床类型HBV感染者中均有HBV-DNA的检出。结论：定量PCR可真实反映HBV感染、复制及病程变化，对乙型肝炎临床诊断及治疗均有一定的临床意义。     

两种人乳头状瘤病毒检测方法的比较

目的 评价导流杂交和实时荧光定量（real-time）PCR对宫颈癌患者HPV感染检测的临床意义.方法 采用导流杂交和real-time PCR分别对190例患者进行HPV感染检测,并对检测结果进行分析.结果 在190例检测标本中,导流杂交法检测出113例HPV阳性,阳性检出率为59.5％,筛查宫颈癌的敏感度为58.1％,特异度为39.2％,阳性预测值为47.8％,阴性预测值为49.4％.real-time PCR检测出106例阳性,阳性检出率为55.8％,筛查宫颈癌的敏感度为54.8％,特异度为43.3％,阳性预测值为48.1％,阴性预测值为50.0％.导流杂交和real-time PCR检出的HPV阳性率差异无统计学意义,而且一致性检验显示两种方法具有较高的一致性（符合率为87.9％）.结论 本研究结果表明,导流杂交和real-time PCR方法检测HPV未表现出较大的差异,在宫颈癌筛查中可以将两种方法结合使用,以提高检测的准确性,降低漏诊率.     

基于微电子阻抗技术实时细胞监测系统在细胞凋亡检测时点选择中的应用

目的 探讨基于微电子阻抗技术的实时细胞监测系统用于确定细胞凋亡最佳检测时间点.方法 应用顺铂诱导胶质瘤细胞U251凋亡,使用实时细胞监测系统连续74 h监测不同药物浓度作用于U251后细胞指数的动态变化,根据药物作用时间与细胞指数关系曲线确定凋亡最佳检测时间点,采用流式细胞仪分析细胞凋亡率.结果 通过实时监测发现,2.5μg/mL、5 μg/mL、10μg/mL顺铂分别在作用49 h、60 h和74 h,U251细胞指数值达到最低;在这些时间点,流式细胞仪检测细胞凋亡率分别达到高峰(15.6±1.4)％,(34.2±7.6)％,(63.9±4.6)％.结论 应用实时细胞监测系统可进行细胞凋亡最佳检测时间点的辅助判断.     

Comparison of Quantitative Cytomegalovirus Real-time PCR in Whole Blood and pp65 Antigenemia Assay: Clinical Utility of CMV Real-time PCR in Hematopoietic Stem Cell Transplant Recipients

Successful preemptive therapy for cytomegalovirus (CMV) infection in transplant patients depends on the availability of sensitive, specific, and timely diagnostic tests for CMV infection. Although the pp65 antigenemia assay has been widely used for this purpose, real-time quantification of CMV DNA has recently been recognized as an alternative diagnostic approach. However, the guidelines for antiviral therapy based on real-time quantitative polymerase chain reaction (RQ-PCR) have yet to be established. From November 2004 to March 2005, a total of 555 whole blood samples from 131 hematopoietic stem cell transplant (HSCT) recipients were prospectively collected. RQ-PCR was conducted using an Artus® CMV LC PCR kit (QIAGEN). Both qualitative and quantitative correlations were drawn between the two methods. Exposure to the antiviral agent influenced the results of the two assays. Additionally, the discrepancy was observed at low levels of antigenemia and CMV DNA load. Via ROC curve analysis, the tentative cutoff value for preemptive therapy was determined to be approximately 2×10⁴ copies/mL (sensitivity, 80.0%; specificity, 50.0%) in the high risk patients, and approximately 3×10⁴ copies/mL (sensitivity, 90.0%; specificity, 70.0%) in the patients at low risk for CMV disease. Further study to validate the optimal cutoff value for the initiation of preemptive therapy is currently underway.     

实时荧光PCR检测乙肝病毒DNA的效果评价

目的 观察应用实时荧光PCR检验法检测乙肝病毒DNA的效果,为临床提高诊断乙型肝炎病毒的准确性提供思路。方法 选取2015年11月~2018年7月于本院就诊的458例乙型肝炎患者作为研究对象,所有患者均经标准的abbot药盒检测确诊,其中大三阳患者241例,小三阳患者217例。患者入院后均采集空腹静脉血,制样本后采用酶联免疫吸附检验法和实时荧光PCR检验,比较两种检验方法对患者乙肝类型的阳性检出率。结果 实时荧光PCR检验法对大三阳的阳性检出率为95.43%,小三阳的阳性检出率为69.58%,均高于酶联免疫吸附检验法的85.06%、55.76%,差异有统计学意义（P＜0.05）。结论 实时荧光PCR检验法可直观的反映乙型肝炎病情状况,具有较高的诊断效果,临床医师可在实际工作中根据患者经济、病情等综合因素进行选用。     

实时荧光定量PCR快速分子诊断唐氏综合征

目的　探讨快速诊断唐氏综合征的检测方法 .方法　采用实时荧光定量PCR技术 ,检测唐氏患者 2 3例、正常人 33例 ,定量分析比较ΔCt值 .结果　正常组和唐氏组ΔCt值有显著性差异 (p <0 .0 0 1) ,并建立了相应的参考值范围 .结论　实时荧光定量PCR具有简单、快速、特异性高等优点 ,可用于快速诊断唐氏综合征