云南地区丙型肝炎病毒基因亚型及RNA载量在丙型肝炎进展中的变化

目的 检测云南地区慢性丙型肝炎、丙肝相关性肝硬化、丙肝相关性肝癌患者中丙肝病毒 (HCV) 的基因亚型及RNA载量在疾病进展过程中的变化.方法 通过收集2016年1月至2017年4月昆明医科大学第一附属医院及云南省传染病医院收治的患者241例, 其中丙型肝炎组患者169例, 丙肝相关性肝硬化组56例, 丙肝相关的肝癌组16例作为研究对象.采用PCR荧光探针法检测血清中丙肝病毒基因亚型以及HCV RNA载量.结果 在丙型肝炎患者中3b型最多 (27.81%) ;在丙肝相关性肝硬化患者中1b型最多 (30.36%) ;在丙肝相关性肝癌中3 b型最多 (31.25%) .3组患者基因亚型比例无显著差别 (P>0.05) .慢性丙型肝炎、丙肝相关性肝硬化、丙肝相关性肝癌组患者的HCV RNA载量分别为 (332±114) Copies/m L、 (189±73) Copies/m L、 (152±56) Copies/m L.3组患者HCV RNA载量的差异显著 (P<0.01) , 慢性丙型肝炎组高于其他2组 (P<0.01) , 但丙肝相关性肝硬化组与丙肝相关性肝癌组患者HCV RNA载量没有明显差别 (P>0.05) .结论 云南地区丙型肝炎中以3b型为主, 丙肝相关性肝硬化中以1b型为主, 丙肝相关性肝癌中3b型为主.在慢性丙型肝炎进展过程中HCV RNA载量减低.     

北京地区慢性丙型肝炎患者血清HCV-RNA定量检测与基因分型的研究

目的:探讨北京地区慢性丙型肝炎患者血清HCV-RNA定量检测和HCV基因分型的相关性。方法:用荧光定量PCR法检测310例北京地区慢性丙型肝炎患者血清HCV-RNA标本,应用RT-PCR和型特异性引物法对310例标本进行基因分型。结果:在310例标本中,HCV1b型有217例(70%),2a型74例(23.9%),2b型8例(2.6%),1b/2a混合型5例(1.6%),未分型6例(1.9%)。对299例HCV单基因型患者的基因型与性别的相关性进行统计学分析,结果显示没有统计学差异(χ2=0.028,P<0.978)。299例患者的首次血清病毒RNA定量测定与基因型之间有明显的统计学差异(F=16.525,P<0.01)。结论:北京地区丙型肝炎病毒感染以1b型为主,基因型在性别上的分布没有差异。治疗前HCV基因型与体内病毒的含量密切相关。     

天津地区丙型肝炎病毒基因型与临床的相关性研究

目的：研究丙型肝炎病毒（HCV）基因型,了解天津地区丙型肝炎的分布情况。方法：收集252例丙型肝炎患者的血清标本,采用基因测序法进行HCV基因型的检测,并对基因型与其他临床指标进行分析。结果：252例丙型肝炎患者分别感染1b、1a、1c、2a、2i、3a、3b、4a和6a共9种基因亚型,其中1b型占59．9％,其次是3a型,占12．7％。对1型、2型、3型和4型4种基因型进行肝功能、HCVRNA病毒载量比较,经单因素方差分析有明显统计学差异（P〈0．05）;对HCV感染的不同肝病程度患者的基因型分布进行分析,无显著性差异（P〉0．05）。结论：天津地区丙型肝炎病毒感染以1b型为主,其次为3a型。HCV基因型与HCVRNA病毒载量、肝脏损伤指标有明显统计学差异。     

联合分析HCV种属信息区和高度保守区序列确定广东地区HCV基因型和亚型

目的扩增HCV种属信息区NS5B和高度保守区5-UTR基因序列,用系统进化树法深入分析HCV基因型和亚型,阐明广东地区丙型肝炎患者HCV基因型和基因亚型的特点。方法采集99例慢性丙型肝炎病例血清,应用RT-PCR技术分别扩增HCVNS5B区和5-UTR特定片段,测序后进行系统进化树分析,确定HCV基因型及亚型。结果99例患者标本均准确分型,其中NS5B区段分型74例,5-UTR区段分型99例。HCV基因型和亚型的分布:1a亚型1例、1b亚型59例、1型7例、2a亚型11例、3a亚型3例、3b亚型2例、3型3例、6a亚型13例;另有2例标本在两区段分型不同,5-UTR/NS5B区段分型分别为6a/1b和3a/1b。两区段共同分型74例,72例标本在两区段基因型一致,2例标本在两区段基因型不同,为HCV重组体。结论联合分析HCV不同区段基因序列,可提高HCV基因分型的准确度及灵敏性。广东地区慢性丙型肝炎患者HCV基因亚型分布以1b为主;其次为6a和2a;3型中的a、b亚型也占有一定比例。     

中国西南三地HCV基因型的分布及临床特征

目的  了解丙型肝炎病毒（HCV）基因型在四川（川）、云南（滇）、贵州（黔）等中国西南地区汉族丙型肝炎患者中的分布及临床特征，为丙型肝炎的防治提供依据。方法  对221例来自川、滇、黔地区的丙型肝炎患者，采用焦磷酸测序法进行HCV基因分型并分析不同基因型丙型肝炎致病性的差异。结果  ①216例HCV- RNA阳性的丙肝患者被成功分型，共发现1、2、3、6等4种常见基因型和1a、1b、2a、2b、3a、3b、6a等7种常见基因亚型，其所占比例为：1a型5.1%（11/216）、1b型36.1%（78/216）、2a型3.7%（8/216）、2b型0.9 %（2/216）、3a型7.4%（16/216）、3b型27.8%（60/216）、6a型17.1%（37/216），此外，还发现其他少见亚型（4a/6n）共4例，占1.9%（4/216）。②川、滇、黔分布前3位的基因亚型分别是3b、1b、6a和3b、1b、2a/3a及1b、6a、3b；男、女患者比例最高的亚型分别是3b（33.1%）和1b（48.3%）；>40岁患者以1b（39.8%）、3b（18.6%）、6a（15.9%）为主；<40岁患者以3b（37.9%）、1b（32.1%）、6a（18.4%）为主；感染方式以输血（血制品）40.1%为主，其他及不明原因者也占较大比例（33.8%）。③急性丙型肝炎、慢性丙型肝炎、丙肝后肝硬化和肝癌4种临床类型的丙型肝炎均以1b型比例最高，其次是3b、6a型；1b型患者的HCV载量及肝功能损害指标均高于其他亚型患者（P <0.05）。结论  川、滇、黔等中国西南部地区HCV-RNA阳性的汉族HCV感染者以1b、3b、6a为优势基因，且呈多样化分布；HCV载量较高的1b亚型，可能更容易导致患者肝功能的损害以及丙型肝炎的慢性化、肝脏的纤维化和癌变。

     

保定市丙型肝炎病毒基因型分布特征及临床意义

目的 了解保定市丙型肝炎病毒（HCV）基因型分布特征及其与丙型肝炎病毒核糖核酸（HCV-RNA）载量、肝病程度的相关性,为其防治提供依据。方法 对2010年1月—2017年9月758例HCV-RNA阳性者进行HCV的基因型检测,分析其基因型与HCV-RNA含量和肝病程度的相关性。结果 758例HCV感染患者中1b型和2a型分别为50.79%（385/758）和36.68%（278/758）。HCV基因型的分布特征与性别、感染途径及种族差异均无统计学意义（P>0.05）。1b型患者ALT、AST、GGT及HCV-RNA水平均高于2a型和其他型患者,差异有统计学意义（P<0.05）。不同程度肝病患者的HCV基因型分布差异有统计学意义（P<0.05）,1b型丙肝肝硬化及肝癌比例高于其他基因型,差异有统计学意义（P<0.05）。1b型患者对长效干扰素加利巴韦林治疗的ETVR应答率（57.92％ vs 83.09％）和SVR应答率（24.68％ vs 60.79％）均明显低于2a型患者（P<0.05）。相关分析显示,1b型患者ALT与HCV-RNA呈正相关（r=0.685,P<0.01）。结论 保定市丙型肝炎病毒基因型流行株为1b型和2a型,其中1b型与丙肝肝硬化、肝癌的产生有一定的相关性。     

对比分析5'-UTR和NS5b区序列确定广东地区HCV基因亚型

［摘要］ 目的 对比丙型肝炎病毒（HCV）不同区段系统进化分析法基因分型的差异,探讨广东地区丙型肝炎患者的HCV基因亚型分布。方法 RT-PCR分别扩增HCV5'-UTR（71nt-311nt）共241bp和NS5b区（8249nt-8650nt）共402bp的片段。序列分析后进行系统进化分析以确定病毒基因型及亚型。结果 HCV NS5b区段分型74例,其中1b亚型51例,2a亚型10例,6a亚型8例,3a亚型2例,3b亚型2例,1a亚型1例;5'UTR区分型74例,其中1型45例,2型11例,6a亚型10例,3a亚型3例,3b亚型5例;两区段共同分型49例,47例基因型一致,2例不同。结论 对比分析HCV不同区段基因序列,可深化对HCV基因型和亚型的了解。初步表明广东地区慢性丙型肝炎患者HCV基因亚型分布以1b为主;其次为2a、6a,两者比例相当;3b、3a也占有一定比例。 ［关键词］丙型肝炎病毒;基因型;5'-非编码区;NS5b区;系统进化分析     

云南省曲靖市非高危人群丙型肝炎病毒基因型分析

目的对曲靖市感染丙型肝炎的非高危人群进行丙型肝炎病毒(HCV)基因分型研究,寻找本地区流行基因型,为丙型肝炎的科学防治提供依据。方法采集住院病人血液,提取RNA,采用HCV特异性引物进行巢式RT-PCR扩增,PCR产物直接测序,采用生物信息学软件进行序列分析。结果共采集228例病人血清,排除具有高危因素影响的血清29例,非高危人群丙型肝炎病人血清199例。共检出4个基因型(1、2、3、6),5个基因亚型(1b、2a、3a、3b和6a),有37例不能鉴别的基因亚型。其中1b型78例(39. 2%)、2a型42例(21. 1%)、3a型15例(7. 5%)、3b型23例(11. 6%)、6a型4例(3. 0%)和未能分型37例(18. 6%)。根据文献检索提取云南省HCV基因分型流行情况,对于HIV/HCV共感染的静脉吸毒者(Intraductal Ultrasonography,IDUS)和静脉吸毒HCV感染者,前3位的基因亚型分别为3b、3a、1b;对于标本来源为医院病人,未进行感染途径分类,前3位的基因亚型分别为1b、3b、2a。结论曲靖市丙型肝炎非高危感染人群主要HCV基因亚型1b型和2a型与我国的主要基因亚型基本一致,与云南省主要的HCV基因亚型略有区别,但与同地区的HIV/HCV共感染的静脉吸毒者HCV基因型有着明显区别。     

CHC患者HCV基因分型及与肝功能指标的关系

目的 探讨慢性丙型肝炎(CHC,以下简称丙肝)患者丙型肝炎病毒(HCV)基因分型与肝功能指标的关联性。方法 收集2018年1月~2019年7月笔者医院就诊的丙肝患者94例,采用RT-qPCR一步法对其进行HCV基因分型,并统计分析丙肝患者的基因型分布以及基因型与肝功能相关指标的相关性。结果 在94例丙肝患者中,有阳性扩增曲线的HCV基因型共90例,阳性检出率为95.7%,其中1b型、3b型、6a型、3a型和2a型分别占31.9%、23.4%、21.2%、12.8%和6.4%。HCV 3b型CHC患者的丙氨酸转移酶(ALT)和天门冬氨酸氨基转移酶(AST)水平高于其他4种基因型(P均<0.01),HCV 6a型的HCV RNA拷贝数高于其他4种基因型(P=0.041)。CHC患者HCV基因型与TIBL和DIBL无明显相关(P均>0.05)。结论HCV基因型最主要型别是HCV 1b型,HCV基因型与ALT、AST水平及HCV RNA拷贝数之间存在相关性。HCV基因分型检测可为临床判断CHC病情提供实验室依据。     

丙型肝炎患者5080例Anti-HCV、HCV-RNA及基因分型分析

目的:对5 080例丙型肝炎患者Anti-HCV、HCV-RNA及基因分型三项检验结果进行分析。方法:采用增强发光免疫法检测Anti-HCV;实时荧光定量PCR法检验HCV-RNA;HCV-RNA含量≥103的标本同时进行基因分型检测。结果:5 080例丙型肝炎患者中Anti-HCV检测阳性率为99.8%,HCV-RNA阳性率为49.1%。HCV-RNA阳性患者年龄和抗体含量均明显高于HCV-RNA阴性患者(P<0.01)。在进行基因分型的1 723例HCV-RNA阳性标本中,1b、2a分别占59.49%和36.20%,两型总占比达到95.69%;另外3b和4不常见型以及1b/2a、1b/4混合感染也检测到。结论:Anti-HCV含量与患者的病毒载量之间缺乏相关性,不能作为丙型肝炎治疗过程中的动态观察指标;HCV-RNA定量适于丙型肝炎疗效评价和预后判断指标;临床丙型肝炎患者中主要基因型是1b、2a型,对HCV-RNA阳性患者进行基因分型,可为丙型肝炎的个性化治疗提供决策依据。     

广州地区丙型肝炎患者HCV基因分型研究

目的研究广州地区丙型肝炎患者HCV基因型分布的变化情况。方法收集207例HCV RAN阳性丙型肝炎患者血清,对其HCV Core区(C区)和NS5B区基因序列进行RT-nPCR扩增,两区扩增成功的PCR产物进行基因测序,测序结果分别与相应的参照株序列比对,构建系统进化树,两区基因分型结果一致者确定HCV基因亚型。结果 185例HCV C区和NS5B区都扩增成功,其中179例两区基因分型结果一致。共检出1、2、3、6型4种基因型和8种基因亚型,其中1b型占40.78%(73/179),6a型占27.37%(49/179),3b型占11.73%(21/179),3a型占8.94%(16/179),2a型占6.15%(11/179),1a型占3.91%(7/179),2b型占0.56%(1/179),6n型占0.56%(1/179)。1b株可分为A、B、C三大簇,A簇与中国广泛流行1b株接近、B簇与中国中部及南部地区流行1b株接近,6a株分为Ⅰ、Ⅱ两大簇,与献血人群及静脉吸毒人群中6a型株接近。结论广州地区丙型肝炎患者HCV基因型以1b、6a、3型为主,存在多种亚型;1b型株包含中国大部分地区的1b型株,6a、3型已取代2a型分别成为第二、三主要流行基因型;未发现6型变异株。     

HCV-cAg与HCV-Ab联合检测的互补作用及HCV阳性者与ALT的关系

目的探讨丙肝病毒核心抗原（HCV-cAg）与丙肝病毒抗体（HCV-Ab）联合检测对诊断丙肝病毒（HCV）感染的互补作用及HCV感染阳性者与丙氨酸氨基转移酶（ALT）的关系。方法检测手术前检查组2061例患者和ALT〉80U／L组242例患者的HCV-cAg、HCV-Ab和ALT等指标,然后将检测结果作出统计分析。结果手术前检查组联合检测有2．7％的阳性率,显著高于单独HCV-tAg和单独HCV-Ab的1．6％（P〈0．05）;ALT〉80U／L组联合检测有14．5％的阳性率,显著高于单独HCV-tAg的7．0％（P〈0．01）;手术前检查组ALT均值和ALT〉80U／L例数是2项均阳性高于HCV-Ab阳性、HCV-Ab阳性高于HCV-cAg。结论HCV-cAg和HCV-Ab2项联合检测明显优于单项检测,这对HCV感染的诊断能起到很好的互补作用,加上ALT等肝功能指标的检测,有利于HCV感染的正确诊断。     

丙型肝炎病毒感染致2型糖尿病机制的研究进展

丙型肝炎病毒(HCV)感染是影响全人类的高发的感染性疾病。HCV感染除了会造成极大的感染率和病死率外,更为严重的是HCV可导致终末期器官损害。糖尿病是由遗传和环境因素共同作用而引起的一组以糖代谢紊乱为主要表现的临床综合征。近年来越来越多的研究发现,糖尿病患者的HCV感染率显著高于普通人群,而慢性丙型肝炎患者2型糖尿病的患病率也显著高于正常人。     

青岛地区丙型肝炎基因分型的研究

目的 探讨青岛地区丙型肝炎基因型的分布状况,发现丙型肝炎病毒（HCV）流行优势株,分析丙型肝炎基因型与病人性别、感染途径、炎症活动度、病毒载量等的相关性。方法 应用RT-PCR方法,对46例青岛地区丙型肝炎病人的血清RNA提取物NS5B区和（或）CORE-E1区进行扩增,扩增片段进行基因测序,根据测序结果在PUBMED网站中获得基因分型结果,分析不同丙型肝炎基因型与病人性别、感染途径、肝病程度、HCV RNA含量及谷丙转氨酶（ALT）、谷草转氨酶（AST）水平的关系。结果 46例血清标本,HCV RNA均为阳性,44例可以分型,分型率为95.65%,其中基因1b型28例（63.64％）,2a型14例（31.81％）,3b型2例（4.55％）。丙型肝炎基因型的分布与病人性别、感染途径、肝病程度、HCV RNA含量及ALT、AST水平均无关（P〉0.05）。结论 青岛地区HCV流行株为基因 1b型和2a型,基因1b型为优势株,同时发现3b基因型。基因型与丙型肝炎的疾病进展程度及炎症活动度无关。     

湖北省部分地区经血途径感染艾滋病人群中丙型肝炎病毒基因型分布

目的了解湖北省经血途径感染HIV-1人群中合并HCV感染情况及HCV基因型分布。方法2004年7月至2010年12月间在本院诊治或会诊的597例抗HIV阳性者进行HCV筛查,并行HCV病毒载量检测,对HCVRNA阳性者进行逆转录巢式聚合酶链反应扩增HCV核心基因区,并对扩增产物进行测序,采用Mega软件对所得序列进行基因树分析。结果既往有偿供血和受血的HIV感染者中HCV的感染率分别为76．5％（205／268）,57．4％（189／329）。97例HIV、HCV合并感染者行HCV基因分型检测,发现1b型90例（92．8％）和2a型7例（7．2％）,两型的HCV病毒载量（HCV—VL）差别无统计学意义[对数值分别为（6．0±1．0）拷贝／ml、（5．8±1．4）拷贝／ml,t=0．40,P=0．69]。结论血液途径为HIV、HCV合并感染的主要途径。受血感染者合并HCV感染率低于献血人群,感染者中HCV的基因型主要为1b型和2a型。     

体检人群中慢性丙型肝炎患者临床特征研究

【目的】分析体检人群中慢性丙型肝炎（CHC）患者的临床特征,为CHC患者的早期诊断与治疗提供依据。【方法】回顾性分析体检人群中CHC患者的临床资料,并记录患者初次治疗时的 HCV‐RNA含量、丙肝病毒基因型及谷丙转氨酶（ALT）、谷草转氨酶（AST）、白蛋白（ALB）、血红蛋白（Hb）、血小板的（PLT）的水平。【结果】体检人群中共发现CHC患者58例,其中1b型占63．79％,2a型占17．24％,其他基因型占19．97％。体检人群CHC患者（HE组）与非体检发现的CHC患者（NHE组）相比,在HCV感染的危险因素、基因型分布、肝脏炎症相关指标方面均存在显著性差异（ P ＜0．05）。【结论】体检人群中CHC患者HCV基因型以1b、2a型为主,ALT、AST、HCV‐RNA水平低于非体检发现的CHC患者。     

慢性丙型肝炎患者对NS3／4A蛋白酶抑制剂预存耐药的研究

目的对我国南方184例无抗病毒治疗史的慢性丙型肝炎患者进行NS3／4A蛋白酶抑制剂相关耐药位点检测。方法NS3／4A蛋白酶抑制剂相关的耐药位点分析采用自行设计型别特异性引物行巢式PCR．PCR产物经纯化后采用直接测序法鉴定。结果184例样本中有162例扩增成功,其中125例（77．16％）患者共检出266个变异位点。HCVlb型A156S变异率为18．33％,V170I为16．67％;HCV2a型V36L、Q80G、V170I变异率为100％,A156S为64．29％;HCV6a型Q80K变异率为95．45％,V170I为98．86％。结论未使用抗病毒药的慢性丙型肝炎患者对NS3／4A蛋白酶抑制剂也存在预存耐药,变异率因HCV基因型而不同。1b型发生变异较少,HCV2a型及6a型普遍发生变异。     

聚乙二醇干扰素联合利巴韦林治疗不同基因型慢性丙型肝炎疗效分析

目的:探讨聚乙二醇干扰素联合利巴韦林治疗不同基因型慢性丙型肝炎（丙肝）的疗效。方法:80例丙肝患者,采用特异性探针杂交法进行丙肝病毒（HCV）基因型分型,根据病毒基因型分型结果分成HCV 1b型组和非1b型组,2组均给予聚乙二醇干扰素（1.5 μg/kg皮下注射）和口服利巴韦林,治疗前后及随访中检测高灵敏HCV RNA作为疗效评价的指标。获得各组持续病毒学应答率,并比较2组持续病毒学应答率。结果: HCV 1b型组与非1b型组获得持续病毒学应答率分别为58.1%和86.5%,2组比较差异有统计学意义（P<0.01）。结论:聚乙二醇干扰素联合利巴韦林治疗HCV1b基因型疗效不佳,丙肝的疗效与基因型密切相关。