THBS1 在胶质母细胞瘤中的表达及功能研究

目的 研究THBS1在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达水平及功能。方法 在癌症基因组 图谱计划（TCGA）和中国脑胶质瘤基因组图谱计划（CGGA）_693、CGGA_325 和 CGGA_301 数据集中提取 数据,对基因表达数据进行标准化处理后,分析THBS1在低级别胶质瘤和 GBM 中的表达差异以及与异 柠檬酸脱氢酶（IDH）突变、1p/19q 共缺失状态和生存预后的关系。基于单细胞测序数据、空间转录组数 据,分析THBS1在胶质瘤组织中的主要分布。采用 CellCall 算法和 MAGIC 算法进一步分析THBS1在细 胞相互作用网络之中的功能和THBS1相关基因及其功能,采用 CIBERSORTx 算法分析THBS1与免疫细 胞浸润的关系。结果 THBS1在 GBM 组织中的表达水平高于正常组织,差异有统计学意义（P＜ 0.05）。 在 CGGA 和 TCGA 数据集中,THBS1在 GBM 患者中的表达水平高于低级别胶质瘤,差异有统计学意义 （P＜ 0.01）;THBS1在IDH野生型和非 1p/19q 共缺失型患者中的表达水平分别高于IDH突变型和 1p/19q 共缺失型,差异均有统计学意义（均P＜ 0.01）。在 CGGA_693 和 CGGA_325 数据集中,THBS1基因高表 达患者的生存率低于低表达患者,差异有统计学意义（P＜ 0.01）。单细胞测序数据分析显示,THBS1主 要在胶质瘤组织的单核 / 巨噬细胞中表达。空间转录组数据分析显示,表达THBS1的单核/巨噬细胞在 空间方面与星形胶质细胞、肿瘤细胞、神经元、少突细胞、少突胶质细胞前体细胞存在共定位。THBS1 阴性的单核/巨噬细胞和THBS1阳性的单核 / 巨噬细胞与肿瘤细胞、神经元之间细胞通信的通路活性及 所依赖的配体 - 受体途径不同。功能富集分析显示,THBS1相关基因参与囊泡介导的转运、自噬、DNA 结合转录因子活性的调节等生物过程。在 4 个数据集中,THBS1高表达组的巨噬细胞 M0 丰度高于低表 达组,差异有统计学意义（P＜ 0.05）。结论 THBS1在GBM中高表达,与患者较差的预后相关;THBS1 调控巨噬细胞M0浸润,表达THBS1的单核/巨噬细胞可能调控GBM的微环境,进而调控肿瘤发生。     

PGM2 在脑胶质瘤中的表达及临床意义

目的 探讨磷酸葡糖变位酶 2（PGM2）在脑胶质瘤中的表达及临床意义。方法 提取 中国胶质瘤基因组图谱计划（CGGA）数据库和癌症基因组图谱计划（TCGA）数据库中脑胶质瘤患者的临 床数据和 mRNA 测序数据,将测序数据与临床数据相匹配后提取PGM2基因的表达情况,并剔除临床数 据缺失的病例。根据受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线获得的临界值（Cut-off值） 将病例分为PGM2高表达组和PGM2低表达组。采用 ROC 曲线下面积（AUC）和 Kaplan-Meier 生存曲线评 价PGM2表达水平对胶质瘤患者总生存率的预测价值。采用单因素分析影响PGM2表达水平的胶质瘤 临床病理因素。采用单因素、多因素 Cox 回归分析脑胶质瘤相关临床病理因素和PGM2表达与胶质瘤患 者预后的关系。通过筛选共表达基因,进行基因本体（GO）富集分析和 KEGG 通路分析,探讨PGM2参与 生物学过程以及调控的相关信号通路。采用 CIBERSORT 算法分析胶质瘤PGM2表达与免疫细胞浸润 的关系。结果 CGGA-325 数据库剔除缺失值后余 273 例,TCGA 数据库剔除缺失值后余 560 例。PGM2 表达量预测胶质瘤患者总生存率的 ROC 曲线分析显示,其在 CGGA-325 数据库中的AUC为 0.705（95%CI： 0.640～0.769）,Cut-off 值为 10.1;在 TCGA 数据库中的AUC为 0.739（95%CI：0.699～0.778）,Cut-off 值为 8.9。根据 Cut-off 值将病例分为PGM2高表达组和 PGM2 低表达组。Kaplan-Meier 生存分析显示,PGM2 高表达组患者的总生存率较PGM2低表达组患者下降,差异有统计学意义（P＜ 0.001）。CGGA-325 和 TCGA 数据库中,PGM2低表达与高表达组的胶质瘤级别、IDH分型以及 1p/19q 缺失情况比较,差异均有 统计学意义（均P＜ 0.05）。多因素 Cox 回归分析显示,CGGA-325 数据库与 TCGA 数据库中胶质瘤共同 独立预后因素是胶质瘤级别与1P/19q共缺失,PGM2表达在CGGA-325数据库中显示为独立预后因素（均 P＜ 0.05）。GO 富集分析和 KEGG 通路分析显示,PGM2表达与内质网蛋白转运、Toll 样受体信号通路以 及 I-κB 激酶 /NF-κB 信号通路相关。CIBERSORT 分析显示,PGM2低表达组与高表达组的初始 CD4+ T 细胞、活化的记忆 CD4+ T 细胞、调节性 T 细胞、单核细胞、巨噬细胞（M0、M1、M2）、中性粒细胞等的免疫 浸润程度比较,差异均有统计学意义（均P＜ 0.05）。结论 PGM2的高表达与胶质瘤较差的预后相关, 可能作为判断胶质瘤患者预后的指标,未来有望成为胶质瘤潜在的治疗靶点。     

PTPN7在人脑胶质瘤中的表达及临床意义

目的 探究脑胶质瘤的潜在预后分子标志物,并为精准治疗提供理论依据.方法 纳入CGGA与TCGA两个独立数据库病例,其中CGGA数据库病例325例,TCGA数据库病例636例,分析PTPN7表达水平同脑胶质瘤病理级别、IDH突变状态、4个分型亚型以及预后的关系,并通过基因本体(GO)功能富集分析探讨PTPN7在脑胶质瘤中...     

IDH突变调控BMP2、COL27A1和SERPINA5基因表达影响人脑胶质瘤的生存预后

目的 探讨异柠檬酸脱氢酶（IDH）突变影响胶质瘤临床预后的潜在分子机制。方法 计算机检索CGGA和TCGA数据库,获取胶质瘤RNA测序数据（RNA-seq）,应用生物信息学分析方法分析IDH突变改善胶质瘤临床预后的潜在分子机制。结果从TCGA数据库下载胶质母细胞瘤（GBM）和低级别胶质瘤（LGG）相关RNA-seq,从CGCA数据量下载648例胶质瘤的RNAseq(234例GBM和414例LGG),从GEO数据量下载单细胞RNA-seq数据GSE131928数据集（28例IDH野生型GBM）。GO和KEGG分析显示,IDH突变显著下调胞外基质（ECM）相关基因表达,GEPIA分析显示BMP2、COL27A1、SERPINA5、VEGFA基因表达水平与胶质瘤生存预后有关,多因素Cox比例回归风险模型分析显示BMP2、COL27A1、SERPINA5基因表达是胶质瘤生存预后独立影响因素,BMP2联合SERPINA5预测胶质瘤生存预后效果最好。结论 我们结果提示胶质瘤IDH基因突变,可能通过调控BMP2、COL27A1和SERPINA5基因表达,影响病人生存预后。     

脑胶质瘤FBLIM1的表达及临床意义

目的 探讨FBLIM1在脑胶质瘤中的表达及临床意义。方法 采用R软件分析UCSC数据库中癌症基因组图谱联合基因型组织表达数据集（TCGA、TARGET、GTEx）中的662例胶质瘤和1 157例正常脑组织的FBLIM1表达水平。利用TCGA数据库698例胶质瘤mRNA-seq及临床数据分析FBLIM1表达与胶质瘤临床特征的关系,用Cox比例回归风险模型分析胶质瘤生存预后的影响因素,采用Kaplan-Meier法分析TCGA数据库及中国脑胶质瘤基因组图谱（CGGA）数据库共计1 975例胶质瘤的FBLIM1表达与生存预后的关系。结果 胶质瘤FBLIM1表达水平较正常脑组织明显增高（P<0.05）,且肿瘤WHO分级越高,FBLIM1表达水平越高（P<0.05）;胶质瘤FBLIM1表达与IDH基因状态、1p/19q联合缺失、WHO分级及病人年龄显著相关（P<0.05）;FBLIM1过表达为胶质瘤病人生存预后不良的独立危险因素（OR=1.444;95% CI 1.032~2.020;P<0.05）;生存曲线分析显示FBLIM1高表达的胶质瘤病人中位总生存期较低表达病人明显缩短（P<0.05）。结论 胶质瘤FBLIM1呈高表达,与病人生存预后不良相关。     

钙腔蛋白基因在脑胶质瘤中的表达及其临床意义

目的检测钙腔蛋白(CALU)基因在脑胶质瘤中的表达,探讨CALU对脑胶质瘤患者预后的影响,分析CALU共表达基因的相关生物学功能。方法回顾性分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)mRNAseq_325数据库中CALU阳性表达的288例脑胶质瘤患者的CALU测序表达量和临床资料,分析不同类型脑胶质瘤患者CALU的表达水平对生存期的影响,采用多因素Cox回归法分析影响患者生存期的相关因素。采用Pearson相关性分析筛选与CALU共表达的相关基因,应用在线富集分析工具分析共表达基因的生物学功能。结果288例患者中,世界卫生组织(WHO)Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ级患者CALU的表达量分别为4.74±0.68、5.49±1.12及6.17±0.94;异柠檬酸脱氢酶l(IDH1)野生型和突变型的脑胶质瘤中,CALU的表达量分别为6.13±1.17、5.08±0.76;无1p/19q共缺失和有1p/19q共缺失的胶质瘤中,CALU的表达量分别为5.79±0.07、4.71±0.07。上述指标比较,差异均有统计学意义(均P<0.01)。不同性别间、原发与复发性胶质瘤患者CALU的表达量差异均无统计学意义(均P>0.05)。CALU高表达、低表达患者(各144例)的中位生存期分别为13.0(1~132)个月和82.5(2~149)个月,差异有统计学意义(P<0.01)。在WHOⅡ~Ⅳ级胶质瘤患者中,CALU的高表达量主要与Ⅲ、Ⅳ级患者的生存时间降低有关(均P<0.01)。多因素Cox回归分析显示,CALU表达量是胶质瘤患者生存期的独立影响因素(RR=2.193,95%CI:1.507~3.192,P<0.01)。CGGA数据库中,与CALU表达呈正相关的基因有325个,这些基因的生物学功能主要为信号传导、细胞黏附及细胞代谢等,主要参与了内质网内的蛋白质处理、黏附作用及癌症通路。结论CALU与脑胶质瘤的恶性程度相关,其可作为高级别胶质瘤患者预后的预测因子,以及潜在的研究和治疗靶点。     

微小RNA-346与IDH基因野生型胶质瘤TRIM38基因表达和患者预后的关系

目的 探讨微小RNA (miR)-346与异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因野生型胶质瘤中三基序蛋白质38 (TRIM38)基因表达水平和患者总体生存期(OS)的关系。方法 利用中国胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库的多组学分子数据,比较miR-346在胶质瘤中的表达改变以及与TRIM38基因表达和患者OS的关系;采用细胞转染和双荧光素酶实验检测miR-346与TRIM38基因在胶质瘤细胞中的相互关系。结果 共纳入CGGA中各级别胶质瘤样本198例及对照脑组织样本5例进行比较,发现miR-346表达水平随肿瘤级别的增加而降低(P<0.05),且IDH基因野生型肿瘤表达水平低于IDH基因突变型肿瘤(P<0.05)。Pearson相关性分析发现IH基因野生型胶质瘤中,miR-346与TRIM38基因表达之间呈显著负向相关性(P<0.05)。生存分析显示miR-346低表达组患者的OS与miR-346高表达组患者相比显著缩短(P=0.05),其预后指示能力独立于患者年龄及治疗方案等因素(^均P<0.05),但不独立于肿瘤级别(P>0.05)。细...     

ALDH3B1在胶质瘤形成机制中的作用

目的 结合生物信息学分析和免疫组织化学检测,探讨ALDH3B1在胶质瘤发生、发展机制中的作用及临床意义。方法 提取TCGA的泛癌数据和GTEx中对应的正常组织数据,分析人脑胶质瘤患者中ALDH3B1的表达水平与临床预后及病理特征的相关性。通过富集分析,探讨ALDH3B1及其相关性基因参与胶质瘤的机制。同时,收集河北医科大学第二医院神经外科115例原发性脑胶质瘤标本(Ⅱ级:30例、Ⅲ级:35例、Ⅳ级:50例)和5例正常脑组织标本,通过免疫组织化学染色测定ALDH3B1的表达情况。结果 ALDH3B1的表达水平在胶质瘤组织中较正常脑组织显著增高(P<0.05),高级别胶质瘤、IDH野生型、1p/19q无联合缺失标本中表达分别较低级别胶质瘤、IDH突变型、1p/19q联合缺失标本中表达显著增高;胶质瘤患者中ALDH3B1表达水平与总生存期(OS)呈显著负相关(P<0.001);富集分析显示ALDH3B1相关基因参与胶质瘤患者免疫应答调节、炎症反应、肿瘤坏死因子产生等过程。结论 ALDH3B1参与胶质瘤的病理机制,可以作为脑胶质瘤的一个独立预后风险指标。     

脑胶质瘤病人血清β2微球蛋白含量的变化

目的 探讨脑胶质瘤病人血清β2微球蛋白（β2-MG）含量的变化。方法 收集2015~2017年手术切除及病理确诊的胶质瘤标本124例，其中WHO Ⅰ级9例，Ⅱ级28例，Ⅲ级34例，Ⅳ级53例。术前2~3 d采取静脉血，通过胶乳免疫比浊法检测血清β2-MG含量；并使用石蜡包埋的胶质瘤组织分别通过毛细管电泳法检测基因异柠檬酸脱氢酶1（IDH1）突变和PCR荧光探针法检测06-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶（MGMT）基因甲基化状态。结果 WHO Ⅳ级胶质瘤病人血清β2-MG含量显著高于其他级别（WHO Ⅰ~Ⅲ级）胶质瘤（P<0.05）。IDH1突变型胶质瘤病人血清β2-MG含量显著低于野生型病人（P<0.05）。MGMT甲基化胶质瘤病人血清β2-MG含量与非甲基化病人之间无明显差异（P>0.05）。结论 血清β2-MG含量对于WHO Ⅳ级胶质瘤与其他级别件胶质瘤的鉴别以及IDH1突变与野生型的鉴别中可能具有重要的参考意义。     

非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶12基因在脑胶质瘤中的表达及意义

目的基于中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库分析非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶12基因(PTPN12)在脑胶质瘤中的表达和意义。方法回顾性分析CGGA数据库(325例)和TCGA数据库(636例)中脑胶质瘤患者的临床资料和RNA测序数据。分析不同世界卫生组织(WHO)肿瘤级别、四分型亚型、异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化状态的患者PTPN12表达量的差异。根据PTPN12的表达量将患者分为PTPN12高表达组和PTPN12低表达组,采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,比较两组患者的生存差异。采用单因素和多因素Cox回归分析法判断PTPN12对脑胶质瘤患者的预后作用。进一步通过基因本体(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获得基因相关的功能以及有关的通路。结果两数据库中,PTPN12的表达量均随脑胶质瘤病理级别的升高而升高(均P<0.01);与IDH突变型比较,IDH野生型中PTPN12表达量升高(均P<0.01);MGMT启动子非甲基化者PTPN12表达量高于MGMT启动子甲基化者(均P<0.01);PTPN12在经典型、间质型、神经元型以及前神经元型中表达量的差异均具有统计学意义,间质型中表达量最高(均P<0.01)。两数据库中,PTPN12高表达者均比低表达者的生存期短(均P<0.01)。两个数据库中,多因素Cox回归分析结果均显示,PTPN12表达量为脑胶质瘤患者生存期的独立影响因素(CGGA数据库中,HR=1.433,95%CI:1.094~1.876,P=0.009;TCGA数据库中,HR=1.588,95%CI:1.018~2.477,P=0.042)。GO分析结果显示,PTPN12表达量正相关的基因更多地富集在增殖、凋亡、黏附、蛋白水解、免疫反应、血管生成、药物反应、缺氧反应、肿瘤细胞G2/M期的转化、肿瘤细胞G1/S期的转化等多个与脑胶质瘤恶性进展相关的功能上。KEGG分析结果显示,与PTPN12表达量呈正相关的基因更多地富集在肿瘤相关通路、PI3K-Akt通路、丝裂原活化蛋白激酶通路、肿瘤坏死因子通路、缺氧诱导因子1通路、p53通路、凋亡通路以及细胞周期通路上。结论不同WHO肿瘤级别的脑胶质瘤患者PTPN12表达量不同,PTPN12表达量可独立用于脑胶质瘤患者的预后判断,且与多个脑胶质瘤恶性进展相关的功能和通路有关。     

Physical and Sexual Abuse and Neglect and Eating Disorder Symptoms

For eating-disordered patients with a history of post-traumatic stress, childhood abuse and neglect, and dissociative disorder, eating behavior symptoms may function as a rational response to unmetabolized traumatic experiences. This paper will review trauma-based theory, dissociation, abreactive, and ego-states therapy as they apply to eating disorder patients.     

Efficacy and Effectiveness of Child and Adolescent Psychotherapy and Pharmacotherapy

Decades of intervention research have produced a rich body of evidence on the effects of psychotherapies and pharmacotherapies with children and adolescents. Here we summarize and critique that evidence. We review findings bearing on the efficacy of psychosocial treatments and medications under controlled experimental conditions. We also report evidence, where available, on the effectiveness of both classes of treatment with clinically referred youth treated in real-world clinical contexts. In general, the large body of evidence on efficacy contrasts sharply with the small base of evidence on effectiveness. Addressing this gap through an enriched research agenda could contribute importantly to linking scientific inquiry and clinical practice—to the benefit of both ventures. This is one element of a multifaceted agenda for future research and for synthesis of research, which will require the interplay of multiple disciplines related to child and adolescent mental health.     

Presence and severity of anorexia and bulimia among male and female Omani and non-Omani adolescents

OBJECTIVE: The population of Oman is a heterogeneous mix of nationalities providing a natural setting for studying the cross-cultural differences in the presence and severity of eating disorders as well as an opportunity for evaluating the performance of measurement instruments for these disorders. METHOD: Disordered eating screening instruments (the Eating Attitude Test and the Bulimic Investigatory Test) were administered to Omani teenagers, non-Omani teenagers, and Omani adults. RESULTS: On the Eating Attitude Test, 33% of Omani teenagers (29.4% females and 36.4% males) and 9% of non-Omani teenagers (7.5% of males and 10.6% females) showed a propensity for anorexic-like behavior. On the Bulimic Investigatory Test, 12.3% of Omani teenagers showed a propensity for binge eating or bulimia (13.7% females and 10.9% males). Among the non-Omani teenagers, 18.4% showed a tendency toward bulimia, with females showing a slightly greater tendency than males. In contrast, barely 2% of Omani adults showed either a presence of or a severity of disorderly behavior with food. CONCLUSION: Omani teenagers scored significantly higher than other ethnic groups and Omani adults. This finding is discussed in the light of emerging evidence from many parts of the world suggesting that cultural transition, compounded by demographic constraints, plays a significant role in abnormal eating attitudes.     

Physical and Sexual Abuse and Neglect and Eating Disorder Symptoms

Abstract

For eating-disordered patients with a history of post-traumatic stress, childhood abuse and neglect, and dissociative disorder, eating behavior symptoms may function as a rational response to unmetabolized traumatic experiences. This paper will review trauma-based theory, dissociation, abreactive, and ego-states therapy as they apply to eating disorder patients.     

Micro-affirmations and Recovery for Persons with Mental Health and Alcohol and Drug Problems: User and Professional Experience-Based Practice and Knowledge

Recurrent factors contributing to a recovery process from co-occurring mental health and addiction problems mentioned by users and professionals have been analyzed as part of working alliances and helpful relationships. Still, we lack knowledge about how helpful relationships are developed in daily practice. In this article, we focus on the concrete construction of professional helpful relationships. Forty persons in recovery and fifteen professionals were interviewed. The interviews were analyzed according to thematic analysis, resulting in three themes presented as paradoxes (1) My own decision, but with the help of others; (2) The need for structures and going beyond them; and (3) Small trivial things of great importance. Micro-affirmations have a central role in creating helpful relationships by confirming the individuals involved as more than solely users or professionals. More attention and appreciation should be paid to practices involving micro-affirmations.

     

Opiate and digitalis receptor assays distinguish between neuroexcitant and inactive organochlorines and between anesthetics and convulsants

Specific binding of [3H]naloxone to rat brain tissue in vitro was inhibited by the excitant organochlorinated insecticides (OCI), by ether (E) and octanol (OCT), and by the convulsant indoklon (IND) and its anesthetic isomer, isoindoklon (ISO). In the presence of 100 mM NaCl the inhibition of naloxone binding by E, OCT and ISO was greatly potentiated, whereas that by OCI and IND was attenuated. KCl (100 mM) was equally effective as NaCl on the action of anesthetics, but the effect of the excitant drugs was, in contrast to NaCl, unaffected by KCl. Specific binding of [3H]ouabain in the absence of Na, was depressed by anesthetics and enhanced by neuroexcitants. In the presence of NaCl, which by itself inhibits ouabain binding to brain, both anesthetics and excitants enhanced ouabain binding. DDE, a non-insecticidal analog of DDT, and the dimethyl derivative of the OCI, lindane, were inactive in the receptor assays. These observations point to a unique isolated system which responds consistently to anesthetic agents as a class and, in a different way, to neuroexcitant compounds.