广东省江门市HIV-1亚型及流行毒株gag基因特征分析

目的了解广东省江门市1型艾滋病病毒(HIV-1)基因亚型分布状况及其主要流行株CRF01_AE的传播和基因变异特征。方法收集江门市2018-2019年新确证为HIV-1感染且未经抗病毒治疗的208例样本,采用巢式荧光定量聚合酶链反应法(PCR)扩增gag基因序列并测序,应用Genotyping Tool进行基因分型、PhyML3.0软件构建系统进化树,利用Entropy和VESPA程序对CRF01_AE毒株亚簇进行氨基酸序列特征分析。结果成功测得gag序列173条,异性性传播占72.83%(126条),同性性传播占17.92%(31条);亚型分析结果显示,CRF01_AE 69例(39.88%),CRF07_BC 57例(32.95%),19例(10.98%)CRF55_01B,12例(6.94%)B亚型,其他亚型包括CRF08_BC、CRF59_01B、C亚型和URFs共16例(9.25%)。CRF01_AE在系统进化树上形成4个传播簇,其中2个主要传播簇共有11个氨基酸位点的特征性氨基酸分布存在显著差异,且传播簇I的氨基酸多态性大于传播簇Ⅱ。结论江门市HIV-1亚型分布复杂多样,以异性性传播为主,存在多种传播簇。CRF01_AE亚型为江门地区的优势流行株,其亚簇的氨基酸存在变异。     

运用系统进化分析技术研究全国献血人群HIV感染特征

目的了解献血人群中艾滋病病毒(HIV)感染者的病毒亚型分布及流行毒株特征,为无偿献血者的招募、健康征询提供科学数据。方法对来自全国13个省市献血人群中的HIV阳性样本进行分子流行病学调查。对pol区基因进行扩增和测序。基于系统进化分析技术构建贝叶斯(BI)和最大似然(ML)系统树,确定毒株亚型,并针对亚型地理分布进行统计分析。结果来自全国13个省市的115例HIV阳性献血者标本中,成功扩增并获得pol区基因序列89例,发现HIV-1基因亚型9种,其中,亚型CRF01_AE和CRF07_BC所占比例最高,分别占46.1%(41/89)和37.1%(33/89);亚型CRF08_BC、B分别占2.2%(2/89)、5.6%(5/89);其他亚型CRF65_CPX、CRF55_01B、CRF59_01B、CRF68_01B、CRF62_BC各占1.1%(1/89)。系统进化进一步分析显示,所占比例最高的是CRF01_AE中的Cluster 4和Cluster 5亚簇以及CRF07_BC中的msm亚簇,所占比例分别达到23.6%(21/89)、21.3%(19/89)和33.7%(30/89),这3个均是全国男男性行为者(MSM)传播途径中的主要流行亚簇。结论全国献血途径检测出的HIV-1基因型呈现复杂的多样性特征,尤其在MSM传播HIV感染者中占绝对优势毒株的CRF01_AE(C4和C5簇)和CRF07_BC-msm簇也是本次在献血人群中发现的主要流行毒株。     

河南驻马店市性传播HIV感染者中流行的HIV亚型分析北大核心

目的分析河南驻马店市经性传播的艾滋病病毒(HIV)感染者中,HIV流行毒株亚型及其毒株特征。方法通过专业问卷调查,了解驻马店地区经性传播HIV感染者的基本状况。采集感染者的EDTA抗凝静脉血,检测其CD+4T淋巴细胞(简称CD4细胞)计数,提取外周血浆中病毒核糖核酸(RNA),使用反转录巢式荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法扩增病毒全长gag和部分pol基因,利用Clustal软件比对序列,利用BioEdit软件手工校对,利用NCBI网站HIV分型工具分析病毒亚型,利用MEGA软件构建NJ树,分析病毒系统进化关系。结果共收集到HIV感染者血液74份,全部经性传播感染HIV。经过测序,共获得HIV全长gag基因56条(75.7%),全长pol基因38条(51.4%)。对61例HIV感染者感染病毒亚型进行了分析,其中B亚型毒株47例(77.0%),CRF01_AE毒株6例(9.8%),CRF07_BC毒株4例(6.6%),C亚型毒株2例(3.3%),新型重组毒株2例(3.3%)。系统进化分析显示,所有的B亚型毒株均为Thai B毒株。38例获得pol区序列的样本中,有4例具有耐药突变。结论驻马店市性传播HIV感染者中流行的HIV毒株构成复杂,Thai B亚型毒株是优势毒株,CRF01_AE、CRF07_BC、C等亚型毒株均已进入该人群,而且出现了新型重组毒株。针对该人群的HIV流行毒株监测至关重要。     

河南驻马店市性传播HIV感染者中流行的HIV亚型分析

目的分析河南驻马店市经性传播的艾滋病病毒(HIV)感染者中,HIV流行毒株亚型及其毒株特征。方法通过专业问卷调查,了解驻马店地区经性传播HIV感染者的基本状况。采集感染者的EDTA抗凝静脉血,检测其CD+4T淋巴细胞(简称CD4细胞)计数,提取外周血浆中病毒核糖核酸(RNA),使用反转录巢式荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法扩增病毒全长gag和部分pol基因,利用Clustal软件比对序列,利用BioEdit软件手工校对,利用NCBI网站HIV分型工具分析病毒亚型,利用MEGA软件构建NJ树,分析病毒系统进化关系。结果共收集到HIV感染者血液74份,全部经性传播感染HIV。经过测序,共获得HIV全长gag基因56条(75.7%),全长pol基因38条(51.4%)。对61例HIV感染者感染病毒亚型进行了分析,其中B亚型毒株47例(77.0%),CRF01_AE毒株6例(9.8%),CRF07_BC毒株4例(6.6%),C亚型毒株2例(3.3%),新型重组毒株2例(3.3%)。系统进化分析显示,所有的B亚型毒株均为Thai B毒株。38例获得pol区序列的样本中,有4例具有耐药突变。结论驻马店市性传播HIV感染者中流行的HIV毒株构成复杂,Thai B亚型毒株是优势毒株,CRF01_AE、CRF07_BC、C等亚型毒株均已进入该人群,而且出现了新型重组毒株。针对该人群的HIV流行毒株监测至关重要。     

浦东新区中老年人群HIV-1分子流行特征分析

目的 了解上海市浦东新区近年来中老年人群中未经抗病毒治疗的新确诊感染者HIV-1分子流行特征及耐药情况,为艾滋病防治策略制定提供科学依据。方法 对2018-2021年期间浦东新区确诊实验室HIV-1抗体首次确诊阳性的50岁及以上患者开展面对面访谈,并同步收集血浆标本,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增HIV-pol基因,进行基因亚型及耐药位点分析。结果 获216份HIV-pol区基因全序列片段,HIV-1基因亚型主要有CRF07＿BC(46.30%)、CRF01＿AE(31.02%)、CRF08＿BC(6.48%)、CRF55＿01B(1.39%)、B(4.63%)、C(5.09%)、URFs(4.17%);感染途径主要为同性性传播(41.20%,89/216)、异性性传播(57.87%,125/216),其中流行株CRF01＿AE的同性和异性性传播占比均为49.25%(33/67)、CRF07＿BC同性和异性性传播分别占比45.00%(45/100)、54.00%(54/100),不同性传播途径的病毒亚型分布差异有统计学意义(χ²=18.022,P=0...     

长春市HIV感染者病毒基因亚型分布状况及CRF01_AE毒株基因特征

目的了解长春市艾滋病病毒(HIV)感染者病毒基因亚型分布状况及当前主要流行株CRF01_AE毒株的基因变异特征。方法采集HIV感染者血液标本,提取病毒核糖核酸(RNA),应用巢式聚合酶链反应对HIV的gag区(HXB2:863~1486)基因进行扩增并测序。PhyML3.0软件构建系统进化树,采用HIV database数据库中Entropy、N-Glycosite、VESPA对CRF01_AE毒株两个独立进化簇的氨基酸多态性、糖基化位点、特征性氨基酸进行分析。结果成功测得gag序列的97例感染者中,经男男同性传播感染者71例(73.2%);经异性传播感染者13例(13.4%),双向传播感染者1例,12例感染途径未知。基因亚型分析结果显示,CRF01_AE 73例(75.3%),CRF07-BC 18例(18.6%),B亚型5例(5.2%)。URFs1例(0.1%)。系统进化树显示CRF01_AE在感染者中形成两个独立的进化簇,其中簇Ⅰ44株(61.1%),簇Ⅱ28株(38.9%)。进一步对CRF01_AE两个进化簇分析显示:这两个独立进化簇有10个特征性氨基酸存在差异,簇Ⅰ糖基化位点多态性大于簇Ⅱ,但氨基酸位点多态性小于簇Ⅱ。结论长春市HIV感染者主要以男男同性接触感染为主,CRF01_AE已成为本地最主要流行株。CRF01_AE毒株流行簇Ⅰ和Ⅱ存在特征性氨基酸,糖基化位点和氨基酸位点存在多态性差异,提示应密切关注本地区HIV的基因变异特征。     

上海市浦东新区HIV-1感染者基因亚型分析

目的了解浦东新区艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的病毒亚型分布特征,为该区制定针对性的艾滋病防治策略和措施提供科学依据。方法采用分层抽样的方法选取浦东新区242例HIV-1感染者的血浆标本,应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,将PCR产物测序分析,确定基因亚型,并结合现场流行病学调查资料进行分析。结果获得186份pol区基因片段,HIV-1亚型分布显示,CRF01_AE比例最大,为52.69%,其次为CRF07_BC,31.72%,B,5.91%。CRF08_BC未在同性性传播者中发现,在异性性传播者中占5.36%。CRF01_AE与B亚型重组体在25岁以下年龄组和外地户籍感染者中相对较高,分别为12.20%和6.25%。在同性性传播者中发现2例CRF01_AE和CRF07_BC的重组体。结论浦东新区HIV感染者HIV-1型流行株呈现多样化的特点,且分布与年龄、户籍、文化程度以及传播途径相关。     

应用分子传播网络研究北京男男性行为者HIV-1毒株的传播特征

目的通过艾滋病病毒(HIV)毒株基因序列构建北京男男性行为者(MSM)传播关系的分子网络,探索HIV毒株在该人群中的传播特征。方法以2013年在北京招募的MSM感染者为调查对象,收集问卷并采集全血。使用比对好的pol基因区序列构建进化树判定亚型。计算两两序列间的基因距离,确定鉴别能力最高的基因距离阈值,最终构建传播网络。结果共获得pol基因区序列405条,主要的亚型为CRF01_AE(230,56.8%)和CRF07_BC(116,28.6%),其他亚型分别为B(40,9.9%)、CRF55_01B(1.2%)、C(1.0%)、CRF15_01B(0.2%)。拟合曲线,观测一系列阈值下传播簇、连接总数的变化,得到1.25%为该人群的最佳基因距离阈值。在此条件下,有233条序列(57.5%)进入传播网络。多因素回归分析显示,年龄25岁、在北京居住时间≥4年、过去3个月与男性有无保护被动肛交及亚型为CRF07_BC的感染者,入网率显著偏高。秩和检验表明,网络内CRF07_BC感染者的关联程度显著高于其他亚型的感染者。结论入网率高、关联程度高的人群具有更高的传播风险,应该有针对性的加强对具有高风险特征的人群的教育和干预。     

广西柳州16～25岁HIV-1感染者中流行毒株亚型及耐药分析

目的通过对广西壮族自治区柳州市,2011-2013年艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)新近感染者毒株基因特征的研究,了解当地HIV毒株流行及耐药毒株发生传播的情况。方法采集当年新确证的、16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,共176份。提取病毒核糖核酸(RNA),通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 3年共获得pol区序列176条,主要以CRF01_AE为主(86.9%,153/176);其次也发现了少量CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型。共有5例(2.8%,5/176)出现耐药突变,4例为异性性传播,1例为注射吸毒传播,其中1例针对蛋白酶类抑制剂(PI),3例针对非核苷类抑制剂(NNRTIs),另有2例针对核苷类抑制剂(NRTIs)发生耐药突变。结论当地主要流行毒株为CRF01_AE,广西柳州HIV-1新近感染者耐药传播目前处于低度传播水平,但仍要进一步加强对新近感染者的耐药监测和病人的治疗管理。     

广西柳州16～25岁HIV-1感染者中流行毒株亚型及耐药分析北大核心

目的通过对广西壮族自治区柳州市,2011-2013年艾滋病病毒Ⅰ型（HIV-1）新近感染者毒株基因特征的研究,了解当地HIV毒株流行及耐药毒株发生传播的情况。方法采集当年新确证的、16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,共176份。提取病毒核糖核酸（RNA）,通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 3年共获得pol区序列176条,主要以CRF01_AE为主（86.9%,153/176）;其次也发现了少量CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型。共有5例（2.8%,5/176）出现耐药突变,4例为异性性传播,1例为注射吸毒传播,其中1例针对蛋白酶类抑制剂（PI）,3例针对非核苷类抑制剂（NNRTIs）,另有2例针对核苷类抑制剂（NRTIs）发生耐药突变。结论当地主要流行毒株为CRF01_AE,广西柳州HIV-1新近感染者耐药传播目前处于低度传播水平,但仍要进一步加强对新近感染者的耐药监测和病人的治疗管理。     

福建省HIV-1流行毒株基因分型与流行特征分析

目的了解HIV-I流行株在福建省感染人群中的基因亚型分布及流行特征。方法随机抽取福建省2003-2005年发现的70例HIV感染者血样，提取前病毒DNA进行体外扩增，获得核心蛋白（gag）、包膜蛋白（env）及pol区基因的核酸片段，并对各基因区核苷酸序列进行测定和序列分析。结果选取46份流行病学资料以及不同基因区域序列资料完整的样本进入亚型分析，结果显示目标人群中存在B、C2种亚型以及CRF07-BC、CRF08-BC、CRF01-AE3种流行重组型，以及国内未见报道的B／F重组毒株、A1／D重组毒株等，其中以CRF01-AE重组毒株为主，占69．56％。基因亚型的流行特征分析显示，本省感染的HIV患者中以CRF01-AE重组型占多数，可能的新型重组型全部分布于境外感染者中；在性接触传播的感染者（71．74％）中呈现多种亚型分布的特征；随着时间变化福建省HIV感染者的亚型分布发生变化。结论福建省HIV-I亚型分布众多，各亚型在不同感染地分布不平衡，性乱人群中的亚型分布较为复杂，从总的亚型流行特征来看，HIV-1在我省有流行加快的趋势。     

贵州省2009年HIV耐药警戒线调查

目的监测贵州省未治疗的HIV感染人群中HIV耐药毒株的传播情况、特点和趋势,为指导抗病毒治疗工作,评价治疗效果,合理调整治疗方案和制订相应应对措施提供依据。方法根据世界卫生组织(WHO)推荐的资源最小化的艾滋病病毒(HIV)警戒线调查方法(HIVDR-TS),对47例艾滋病阳性血清样本用In-house方法,对pol基因区进行了扩增测序,检测耐药传播相关的耐药突变,并分析其相关的亚型及其比例。结果 47例样本中未发现耐药传播相关的突变位点,pol区基因型分析结果显示,47例样本中CRF01_AE亚型占40.4%(19/47),CRF07_BC亚型占29.8%(14/47),CRF08_BC亚型占27.7%(13/47)、C亚型占2.1%(1/47),未发现其他亚型。结论贵州省耐药株流行率<5%,属HIV耐药株的低度流行水平区,其中CRF01_AE亚型所占比例较大。     

CRF07-BC亚型HIV的gag-pol区基因序列分析

目的对2株人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)CRF07-BC亚型病毒的完整gag基因和部分pol基因进行基因重组和耐药位点突变分析。方法从确诊的HIV感染者的全血样本中提取基因组DNA,经套式聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增后,将扩增产物进行纯化和测序,然后将所得序列进行系统进化树和氨基酸变异分析。用Simplot软件进行序列重组分析以确定重组断点区域,并分析其pol基因的耐药位点突变。结果在所研究的基因区段内,2份样本均未发现重组断点的变化,在蛋白酶区(PR)出现2个次要耐药相关突变,而未发现主要耐药相关突变。结论所研究的2株HIV-1CRF07-BC亚型病毒与在我国新疆地区广泛流行的CRF07-BC模式毒株非常接近,且不存在天然耐药的情况,适于抗逆转录类药物的应用。     

2018年广西崇左边境ART人群HIV-1分子网络特征分析

目的构建广西边境崇左市四个边境县接受ART的HIV/AIDS患者的本底分子网络并识别重点人群,为当地防控艾滋病进行重点干预提供依据。方法纳入2018年1-9月在广西崇左市大新县、宁明县、凭祥市、龙州县四个地区进行常规CD4细胞检测的在治HIV/AIDS患者作为研究对象,并收集研究对象基本信息,使用HIV-TRACE对研究对象pol区基因序列进行分子网络分析。结果共获得371例患者的HIV pol区序列,CRF01_AE亚型是主要的传播亚型,占85.2%,其次是CRF08_BC(6.7%)和CRF07_BC(5.4%),CRF55_01B、CRF59_01B、B、A1和URF亚型散在分布。在371条pol序列中,有191条入网,形成31个包含2～53个序列以上的分子簇,入网率51.5%。农民、男性、壮族、小学文化、有商业性行为史,来自大新县、年龄大于60岁,CD4细胞计数大于500个/μL在入网人群中占比较高。病例来自大新县、龙州县及年龄60岁的个体节点间的连接度较高。还发现一个CRF08_BC亚型高度耐药簇,耐药突变位点以K103 N为主,主要对EFV和NVP产生耐药。结论崇左地区接受ART的HIV/AIDS患者基因亚型复杂,农村中老年和低文化程度人群传播风险较高,存在高度耐药毒株流行,需重视对该地区的耐药基因序列常规监测并加强对重点人群的性健康教育。     

石家庄市2015年新确诊HIV-1感染者流行毒株的亚型分布及原发性耐药分析北大核心CSCD

目的了解河北省石家庄市2015年新确诊1型艾滋病病毒（HIV-1）流行毒株的亚型分布和原发性耐药情况。方法 2015年石家庄市新报告HIV-1感染者433例,共收集到感染者血浆样本335份,经反转录巢式荧光定量聚合酶链反应（RT-PCR）方法扩增,最终获得311份样本的HIV-1 pol基因片段并测序。对获得的核酸序列用Neighbor.Joining Tree方法构建进化树,以Boot strap值〉70%来判定HIV-1的基因亚型。同时将序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药基因型分析。结果 311例HIV-1感染者以男性（93.9%）、本市户籍（83.0%）、汉族（96.1%）为主。性接触是最主要的感染途径（98.1%）,其中同性性传播占77.5%。311例pol基因序列片段亚型分布显示,CRF01_AE占51.4%（160例）,CRF07_BC为28.6%（89例）,B亚型为13.2%（41例）,未定型CRF01_B为4.2%（13例）,CRF08_BC为1.3%（4例）,CRF55_01B为0.6%（2例）,CRF59_01B为0.3%（1例）,CRF65_cpx为0.3%（1例）和CRF01_AE/B为4.2%（13例）。CRF01_AE、CRF07_BC和B是主要的亚型。HIV-1基因亚型分布在性别之间（χ~2=14.039,P=0.005）、不同的职业类型之间（χ~2=21.716,P=0.041）以及不同的传播途径之间（χ~2=20.971,P=0.028）有统计学差异。311例中,14例感染者具有耐药位点,原发耐药率为4.5%,其中蛋白酶抑制剂和核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率均为1.6%（各5例）,非核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率为1.3%（4例）。结论石家庄市新报告的HIV-1感染者中,传播途径以同性性接触为主,病毒基因亚型以CRF01_AE为主,但具有多样化特点。原发耐药率为4.5%,处于低水平状态。     

浙江省2003-2005年HIV-1感染者分子流行病学研究

目的掌握浙江省2003-2005年新发现感染者艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株基因亚型分布和变异情况。方法对2003-2005年浙江省境内检测新发现的HIV-1感染者进行一般流行病学调查并采集血样,提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应对gag基因区进行扩增并测定其序列。结果采集143份血样,112份扩增阳性,检出CRF01-AE亚型43例,CRF07-BC 37例,CRF08-BC 11例,B亚型20例,CRF02-AG 1例。CRF01-AE分布在11个市中的9个市,主要存在于异性性途径感染者中(53.5%),并已成为外省籍注射吸毒感染者的主要构成(44.8%)。CRF01-AE和CRF07-BC的亚型组内平均离散率在静脉吸毒感染者和性传播感染者中比较,差异有统计学意义。结论浙江省2003-2005年新检出感染者HIV-1毒株呈现多重组型别特征,CRF01-AE成为分布最广的类别,呈现扩大流行的趋势。HIV-1在性乱人群之间的传播要比在注射吸毒人群复杂,变异更大。     

河北省治疗前人群HIV-1耐药毒株分子传播网络研究

目的 了解河北省抗病毒治疗前人群HIV-1耐药毒株流行与分子传播网络情况。方法 用in-house的方法扩增HIV-1 pol区基因序列,并利用TN93模型计算pol序列基因距离,构建HIV-1分子网络图。结果 研究发现17名HIV-1感染者出现耐药突变,耐药突变率为6.16%(17/276),其中,NNRTI类耐药率为4.35%(12/276),PI类耐药率为1.09%(3/276), NRTI类耐药率为0.36%(1/276),NNRTI类和PI类双重耐药率为0.36%(1/276);多因素Logistic回归分析显示年龄和亚型是HIV-1产生耐药的影响因素,虽然HIV-1耐药突变在CRF07_BC(2.44%)亚型中的分布明显低于CRF01_AE(8.03%)和B(3.70%)亚型,然而CRF07_BC序列构建的分子传播网络最多,传播速度最快。结论 河北省治疗前HIV-1耐药突变处于较高水平, 应制定措施实时监测未治疗人群中HIV-1耐药毒株流行情况。     

保定市1株新型HIV-1重组毒株的近似全长基因组鉴定分析

目的?对保定市新发现的1株pol区不能明确分型的HIV-1毒株（BD226AJ）进行近似全长基因组扩增,并分析其亚型、重组模式和基因特点。方法?提取患者血浆中HIV-1RNA并逆转录为cDNA,使用近末端稀释法分2段对其进行近似全长基因组扩增并测序。使用jpHMM和SimPlot 3.5软件对近似全长基因组序列进行重组模式和重组断点分析,采用MEGA 6.0软件分片段构建Neighbor-joining系统进化树进一步确认重组断点的准确性。构建该近似全长基因组序列及各亚型片段Neighbor-joining系统进化树,分析该毒株的亲本来源。结果?经过近似全长基因组扩增、测序、序列拼接后,获得1条长度为8830 bp的HIV-1近似全长基因组序列。重组分析结果显示,该序列是由CRF01_AE和B亚型重组形成的,其近似全长基因组序列被3个断点分成了4个亚型片段,分别为ICRF01_AE（HXB2, 823—4224 nt）、ⅡB（HXB2,4225—5991 nt）、ⅢCRF01_AE（HX B2,5992—9295 nt）、ⅣB（HXB2,9296—9406 nt）。各亚型基因片段的系统进化树分析进一步表明该序列的可能亲本来源为CRF01_AE和B亚型。HIV BLAST的结果显示,该序列与CRF112_01B的相似性为96%,系统进化树分析进一步验证该序列与北京市男男性行为者（men who have sex with men,MSM）中的CRF112_01B序列聚集。结论?本研究在保定市MSM人群中发现了1例由CRF01_AE和B亚型重组的新型重组毒株CRF112_01B,提示HIV-1 CRF112_01B已通过MSM人群传入河北,并开始在保定市传播,因此加强该亚型或者类似新型毒株的监测,对有关部门采取针对性防控措施和遏制新型重组毒株在本地区的传播和流行具有重要意义。     

深圳市人类免疫缺陷病毒-1不同亚型分布与传播途径的关联性分析

目的 了解深圳市HIV-1毒株的分布以及与传播途径的关联性.方法 对429例HIV-1感染者进行流行病学调查,采集外周静脉抗凝血,提取核酸,反转录套式PCR扩增包膜蛋白(env)和核心蛋白(gag)基因,结合HIV数据库和Mega软件分析测序结果,确定亚型,建立进化树,计算各亚型不同传播途径基因离散率.结果 在400份合格标本中,属于CRF01_AE207份,CRF07_BC115份,CRF08_BC 14份,CRF02_AG 1份,B亚型49份,C亚型14份.CRF01_AE涉及到同性、异性、静脉吸毒、医源性和血源性等传播途径,其中以性传播为主;血源性传播的10份标本中,9份为B亚型,且B亚型在各传播途径的基因离散率均高于其他亚型.在进化树上,各种传播途径在同一亚型内形成相对独立的簇,但也有交叉.结论 深圳市HIV-1亚型以重组型为主;传播途径以性传播为主;各亚型在各传播途径分布不均衡,各有特点;各传播途径之间存在关联性.     

四川省≥50岁HIV-1感染者的分子流行病学调查

目的了解四川省≥50岁艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者的流行毒株亚型、人群和地域分布及原发性耐药情况。方法通过抽样调查的方法,在成都、泸州、达州、内江、广元5个市州采集2017年3—5月新报告、未经抗病毒治疗的≥50岁HIV-1感染者的血样235份,扩增HIV-1 pol基因区,对获得的190份核酸序列进行系统进化分析分型。比较不同亚型毒株感染者的人口学特征和地域分布特征。序列提交斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药位点分析。结果四川省≥50岁HIV-1感染者的流行毒株亚型为CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B亚型和CRF85_BC。毒株分布显示出明显的地域特征。男性感染者的毒株亚型在非婚非商业和非婚商业两种不同感染途径中的分布差异有统计学意义(χ~2=12.519,P=0.028)。190例中,原发性耐药突变率为5.8%;泸州地区的原发性耐药比例最高,为9.7%。尚未发现具有双重耐药或多重原发性耐药突变的患者。结论四川省≥50岁年龄组感染的HIV-1主要毒株有独特的流行态势,应加强对HIV毒株的监测,掌握主要流行亚型和耐药毒株的流行特点和规律,针对性地进行艾滋病防治。