人胰腺癌细胞株MUC2基因启动子区甲基化状态检测和分析

近年表观遗传学修饰方式之-的DNA甲基化成为肿瘤研究的热点。目前已发现胰腺癌中存在MUC2表达异常。目的：探讨人胰腺癌细胞株MUC2表达与其基因启动子区甲基化的关系，以了解胰腺癌的发生机制。方法：以人胰腺癌细胞株AsPC-1、BxPC-3、CFPAC-1、PANC-1、SW1990和PaTu8988s为研究对象，以逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）和免疫细胞化学方法检测去甲基化制剂DNA甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-Aza-CdR）处理前后各胰腺癌细胞株MUC2 mRNA／蛋白表达的变化，以甲基化特异性PCR（MSP）结合测序检测MUC2基因启动子区CpG岛甲基化状态。结果：5-Aza-CdR处理前．胰腺癌细胞株AsPC．1、CFPAC-1和SW1990无MUC2mRNA／蛋白表达或低表达：经5-Aza-CdR处理后，MUC2mRNA／蛋白重新表达。MSP结合测序显示上述胰腺癌细胞株MUC2基因启动子区CpG岛存在高甲基化。结论：人胰腺癌细胞株MUC2表达抑制与其基因启动子区CpG岛高甲基化相关。MUC2基因启动子区CpG岛高甲基化可能在胰腺癌的发生、发展中起-定作用。     

胃癌患者TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化状态及蛋白表达

目的探讨胃癌组织中TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化及蛋白的表达与胃癌生物学行为的关系,并分析TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化与其蛋白表达的相关性。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)技术和免疫组织化学SP法检测45例患者的胃癌组织、正常胃黏膜组织中TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化情况及蛋白的表达。结果 TIMP3基因启动子区CpG岛在胃癌及正常组织中的甲基化阳性率分别为31.1%和0(P<0.05);TIMP3蛋白在胃癌及正常组织中的阳性表达率分别为46.7%和90.5%(P<0.05);TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化及蛋白的表达分别与胃癌的分化程度、淋巴结转移有关(P<0.05)。TIMP3基因启动子甲基化与蛋白表达呈明显的负相关(P<0.05)。结论 TIMP3基因启动子区CpG岛的异常甲基化是引起蛋白表达缺失的主要原因,TIMP3基因启动子区CpG岛的异常甲基化与胃癌的发生发展有关。     

结直肠癌组织及细胞株中分泌型卷曲相关蛋白家族的甲基化研究

目的 研究分泌型卷曲相关蛋白(SFRP)基因启动子区CpG岛甲基化与结直肠癌的关系.方法 采用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测20对结直肠癌及相应癌旁组织中SFRP基因启动子区CpG岛甲基化状况,T-A克隆测序验证MSP产物.5-氮杂-2'-脱氧胞苷对结直肠癌细胞株HCT116、SW480进行去甲基化处理,MSP和Western印迹法分别检测细胞株中SFRP基因甲基化和蛋白表达.结果 SFRP 1、2、4、5在结直肠癌中甲基化率分别为19/20、17/20、3/20、13/20,癌旁组织中分别为12/20、8/12、1/20、7/20.结直肠癌中SFRP 1、2、5甲基化率均高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05).HCT116细胞株SFRP 1、2、4、5基因均发生甲基化,而SW480细胞株中仅SFRP1和SFRP2出现启动子甲基化.SFRP蛋白表达与启动子甲基化呈明显负相关,经5-氮杂-2'-脱氧胞苷处理后能有效恢复SFRP蛋白表达.结论 SFRP 1、2、5甲基化可能与结直肠癌的发生有关,SFRP基因甲基化与其表达失活密切相关.     

Runx3基因甲基化及Runx3蛋白表达在结肠癌发生中的意义

目的:评价Runx3 基因启动子区CpG 岛甲基化状态及Runx3 蛋白表达在结肠癌发生中的作用及临床意义.方法:应用DNA 甲基化特异性PCR(MSP) 技术检测结肠癌、结肠腺瘤、正常结肠黏膜Runx3 基因CpG 岛甲基化状态,应用免疫组织化学发法检测Runx3 蛋白的表达.结果:MSP 方法检测发现Runx3 基...     

TIP30基因启动子甲基化与大肠癌细胞5-氟尿嘧啶化疗敏感性的关系

目的探讨TIP30启动子CpG岛甲基化状态与大肠癌细胞对5-氟尿嘧啶(5-Fu)敏感性的关系。方法采用MTT法检测HCT116和HT29大肠癌细胞株对5-Fu的敏感性。应用甲基化特异性PCR(MSP)方法,检测2细胞株对5-Fu敏感性有差异的大肠癌细胞株中TIP30基因启动子CpG岛甲基化状态,并用RT-PCR检测其mRNA的表达水平。结果 TIP30基因在HCT116及HT29癌细胞中甲基化状态有差异,其表达水平与启动子CpG岛甲基化状态有关,并且二者对5-氟尿嘧啶敏感度不同。结论 TIP30基因启动子甲基化状态可能影响大肠癌细胞对化疗药物的敏感性,为大肠癌患者的个体化治疗提供了可能。     

胃癌患者p16基因启动子甲基化检测及其临床意义

目的 探讨p16基因启动子CpG岛甲基化在胃癌发生、发展中的作用.方法 应用特异性甲基化PCR(MSP)检测58例胃癌及癌旁组织和30例正常胃黏膜组织中p16基因启动子CpG岛的甲基化状态,分析其与胃癌临床病理参数的关系.结果26例(44.8％)胃癌组织、5例(8.6％)癌旁组织也检测出甲基化的存在,30例正常胃黏膜组织标本中均未检测出p16基因甲基化的存在(P ＜0.05);p16基因甲基化与胃癌淋巴结转密切相关(P＜0.05).结论 p16基因启动子CpG岛甲基化可促进胃癌的发生、发展;此基因的异常甲基化可作为胃癌早期诊断的敏感指标.     

肝癌细胞p15基因CpG岛甲基化研究

目的通过检测肝癌细胞株HepG2的抑癌基因p15基因启动子区CpG岛的甲基化状态,探讨其与肿瘤发生的可能相关性。方法应用甲基化特异性PCR(MSP)技术,对人肝癌细胞株HepG2的p15基因启动子区域CpG岛的甲基化状态进行检测,以人淋巴瘤细胞株Raji为阳性对照,以正常人外周血单核细胞(PBMC)和肝细胞为阴性对照。结果肝癌细胞HepG2中p15基因启动子区域CpG岛甲基化和非甲基化检测均呈阳性,正常人外周血单核细胞和肝细胞甲基化检测阴性。结论肝癌细胞株HepG2抑癌基因p15基因CpG岛存在高度甲基化,可能与肝癌的发生相关。     

肿瘤抑制基因p16在胰腺腺癌细胞系中因纯合性缺失而失表达

目的检测肿瘤抑制基因p16在胰腺腺癌细胞系中的基因改变和在mRNA以及蛋白质水平的表达.方法使用PCR方法检测基因的缺失情况;使用单链构象多态性(SSCP)方法检测基因有无突变;使用甲基化特异性PCR(MSP)方法检测基因启动子区域的甲基化状态;使用RT-PCR方法检测基因在mRNA水平的表达;使用免疫细胞化学染色和Western blot方法检测基因在蛋白质水平的表达.结果被检测的6个胰腺腺癌细胞系中,有3个细胞系存在p16基因的纯合性缺失,这3个细胞系在mRNA水平和蛋白质水平均无p16基因的表达.在全部6个细胞系中没有发现p16基因突变和启动子区域的过甲基化.结论在被检测的6个胰腺腺癌细胞系中,纯合性缺失是造成p16基因失表达的原因.     

p16、hMLH1基因甲基化与结肠癌的相关性研究

目的检测正常黏膜、结肠腺瘤、结肠癌中p16、hMLH1基因CpG岛甲基化状态,评价其在结肠癌发生中的作用及临床意义。方法收集四川省人民医院2008年10月～12月结肠组织标本60例,其中结肠癌20例、腺瘤20例、正常组织标本20例。采用特异性甲基化PCR（MSP）方法检测p16、hMLH1基因的CpG岛甲基化状态。结果 MSP方法检测发现p16启动子CpG岛甲基化阳性表达率结肠癌组与腺瘤组、正常组比较有显著性差异（P=0.020、0.020）,而腺瘤组与正常组比较无显著性差异（P〉0.05）。hMLH1启动子CpG岛甲基化阳性表达率结肠癌组与正常组比较有显著性差异（P=0.047）,结肠癌组与腺瘤组、腺瘤组与正常组比较无显著性差异（P〉0.05）。p16、hMLH1基因CpG岛甲基化与Dukes分期、肿瘤大小、淋巴结转移、分化程度具有相关性（P〈0.05）,与肿瘤部位、性别无相关性（P〉0.05）。结论 p16、hMLH1启动子区CpG岛甲基化是促进结肠癌发生的重要基因事件,且可能与结肠癌Duke分期相关。     

5-杂氮-2’脱氧胞苷对肝癌细胞中TIMP-3基因的作用

目的观察多株肝癌细胞中TIMP-3CpG岛的甲基化状况,观察甲基化药物5-杂氮-2’脱氧胞苷对肝癌细胞株中TIMP-3基因表达及其CpG岛甲基化程度的影响。方法运用MSP定性检测8株肝癌细胞中TIMP-3CpG岛甲基化状况。使用去甲基化药物5-杂氮-2’脱氧胞苷对甲基化阳性的细胞株进行于预,观察干预组与对照组TIMP-3基因表达差异,并使用焦磷酸测序技术定量检测CpG岛甲基化差异。结果在8株肝癌细胞系中C3A、Hep-3B、HepG23株检测到TIMP-3CpG岛甲基化阳性。经去甲基化药物干预后,在这3株肝癌细胞中均发现TIMP-3mRNA的表达较对照组有明显上调（P〈0．05）,CpG岛的甲基化率下降（P〈0．05）。结论甲基转移酶抑制剂能显著降低肝癌细胞株TIMP-3CpG岛甲基化程度及上调TIMP-3mRNA的表达。     

EMs患者在位子宫内膜hMLH1蛋白表达变化及其基因启动子CpG岛甲基化观察

目的观察子宫内膜异位症（EM s）患者在位子宫内膜组织中hMLH1蛋白的表达变化及hMLH1基因启动子CpG岛甲基化情况。方法采用免疫组化法分别检测52例（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期分别为9、16、12、15例）EM s患者及30例健康志原者（对照组）在位子宫内膜中的hMLH1,采用甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）法检测两组在位子宫内膜hMLH1启动子CpG岛甲基化情况。分离hMLH1启动子CpG岛甲基化异常者在位内膜中的腺细胞和间质细胞,采用MSP志愿分别检测两种细胞hMLH1启动子CpG岛甲基化情况。结果 EM s组中hMLH1蛋白表达减弱共6例,其中Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期分别为0、0、1、5例,其余样本hMLH1蛋白表达均呈阳性;对照组30例无hMLH1蛋白表达减弱者,hMLH1蛋白表达均表现为阳性。EM s组中hMLH1启动子CpG岛部分甲基化3例,其中Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期分别为0、0、0、3例,余均表现为非甲基化;对照组30例均表现为hMLH1启动子CpG岛非甲基化。EM s组Ⅳ期患者与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期患者及对照组相比,P均〈0.05。3例hMLH1启动子CpG岛表现为部分甲基化者子宫内膜组织中hMLH1蛋白表达均减弱,其腺细胞中hMLH1启动子区表现为半甲基化,间质细胞hMLH1启动子区未见明显甲基化条带。结论 EM s患者在位子宫内膜组织中存在hMLH1表达减弱及hMLH1启动子CpG岛部分甲基化,主要集中在腺细胞,hMLH1异常与严重EM s的发病有关。     

Hypermethylated promoter region of DR3, the death receptor 3 gene, in rheumatoid arthritis synovial cells

OBJECTIVE: To examine the promoter activity and protein expression of the death receptor 3 gene DR3, a member of the apoptosis-inducing Fas gene family, with particular reference to the methylation status of its promoter region in rheumatoid arthritis (RA). METHODS: Genomic DNA was prepared from peripheral blood mononuclear cells obtained from healthy individuals and from patients with RA and synovial cells obtained from patients with RA and osteoarthritis. The methylation status of the DR3 promoter was analyzed by bisulfite genomic sequencing and methylation-specific polymerase chain reaction techniques. Gene promoter activity and protein expression were examined using the luciferase reporter and Western blotting techniques. RESULTS: The promoter region of the DR3 gene contained many CpG motifs, including one CpG island that was specifically hypermethylated in synovial cells from patients with RA. Promoter assays showed that the promoter CpG island was essential for the transactivation of the DR3 gene and that forced hypermethylation of the CpG island with the bacterial methylase Sss I in vitro resulted in inhibition of the DR3 gene expression. Furthermore, the expression of DR-3 protein was down-modulated in association with methylation of the promoter CpG island in RA synovial cells. CONCLUSION: The CpG island in the DR3 gene promoter was specifically methylated to down-modulate the expression of DR-3 protein in rheumatoid synovial cells, which may provide resistance to apoptosis in RA synovial cells.     

hMLH1基因高甲基化在胃癌发生、发展中的作用

基因启动子区CpG岛甲基化使许多基因失活，从而导致恶性肿瘤的发生和发展。目的：检测hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化水平，探讨其胃癌发生、发展中的作用。方法：以甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测41例胃癌、40例癌前病变和38例对照组织中hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化状态，并分析其与胃癌患者临床病理特征的关系。结果：胃癌组织中hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化阳性率为34．1％，显著高于癌前病变组的5．0％和对照组的0％（P〈0．05）。hMLHl基因甲基化阳性率与胃癌患者的年龄和肿瘤浸润深度有关（阳性率分别为46．4％对7．7％和55．0％对14.3％，P〈0．05），与性别、肿瘤分化程度和淋巴结转移无关（阳性率分别为34．8％对33．3％、28．0％对43．8％和38．1％对30．0％）。结论：胃癌组织中存在hMLHl基因启动子区CpG岛高甲基化，可能与胃癌的发生、发展有关．且可能在老年胃癌患者的肿瘤发生过程中起重要作用。     

High-resolution mapping of DNA hypermethylation and hypomethylation in lung cancer

Changes in DNA methylation patterns are an important characteristic of human cancer. Tumors have reduced levels of genomic DNA methylation and contain hypermethylated CpG islands, but the full extent and sequence context of DNA hypomethylation and hypermethylation is unknown. Here, we used methylated CpG island recovery assay-assisted high-resolution genomic tiling and CpG island arrays to analyze methylation patterns in lung squamous cell carcinomas and matched normal lung tissue. Normal tissues from different individuals showed overall very similar DNA methylation patterns. Each tumor contained several hundred hypermethylated CpG islands. We identified and confirmed 11 CpG islands that were methylated in 80-100% of the SCC tumors, and many hold promise as effective biomarkers for early detection of lung cancer. In addition, we find that extensive DNA hypomethylation in tumors occurs specifically at repetitive sequences, including short and long interspersed nuclear elements and LTR elements, segmental duplications, and subtelomeric regions, but single-copy sequences rarely become demethylated. The results are consistent with a specific defect in methylation of repetitive DNA sequences in human cancer.     

散发性乳腺癌组织中EMSY基因启动子甲基化状态观察

目的观察散发性乳腺癌组织中EMSY基因启动子CpG岛甲基化的状态。方法用特异性甲基化PCR法检测66例散发性乳腺癌和32例正常乳腺组织中EMSY基因启动子区甲基化情况。结果乳腺癌组织有11例（16．7％）、正常乳腺组织有12例（37．5％）EMSY基因启动子发生甲基化,两者相比,P〈0．05。结论散发性乳腺癌组织中EMSY基因启动子区呈低甲基化状态,可能与散发性乳腺癌的发生发展有关。     

DNA methylation represses the expression of the human erythropoietin gene by two different mechanisms

The human erythropoietin gene is expressed predominantly in the kidney and liver in response to hypoxia. Although the signaling cascade for hypoxia is present in many different cell types, the expression of erythropoietin is restricted to only a few tissues. The authors show that the promoter and 5'-untranslated region (5'-UTR) of the erythropoietin gene comprise a CpG island and that methylation of the CpG island correlates inversely with expression. Methylation represses the expression of the erythropoietin gene in 2 ways: high-density methylation of the 5'-UTR recruits a methyl-CpG binding protein to the promoter, and methylation of CpGs in the proximal promoter blocks the association of nuclear proteins. (Blood. 2000;95:111-119)