HLA-A、B和DRB1流式微珠高分辨分型方法结果分析

目的 分析流式微珠高分辨分型试剂检测样品HLA-A、B和DRB1的结果.方法 用美国one lambda公司流式微珠高分辨分型试剂对631例骨髓库样品进行HLA-A、B和DRB1三个位点的检测,计算用此试剂最终能得出高分结果 的比率.结果 631份样本中,三个位点均仅出现一组结果的只有3例,占0.475%.出现多组结果,但根据ASHI及NMDP标准能判为高分辨的,A位点有489例,占77.50%;B位点有520例,占82.41%;DRB1位点有582例,占92.23%;A、B和DRB1三个位点均能得出高分辨结果的有374例,占59.27%.结论 使用流式微珠高分辨试剂指定高分辨结果是可行的,大多数标本可获得高分辨结果.     

应用流式微珠高分辨分型方法对深圳汉族人群HLA基因频率的研究

目的 统计深圳地区汉族人群HLA-A,HLA-B和HLA-DRB1基因频率,分析该人群HLA等位基因多态性及其特点.方法 应用one Lambda公司的SSO分型试剂和Luminex流式微珠分析仪对457名健康、无血缘关系的深圳汉族人群标本进行高分辨分型检测.结果 共检出等位基因:A位点30个,B位点60个,DRB1位点39个.频率从高到低依次为A*1101(0.274 6),A*2402(0.154 3),A*3303(0.100 6);B*4001(0.141 1),B*4601(0.124 7),B*5801(0.084 2);DRB1*0901(0.138 9),DRB1*1202(0.106 1),DRB1*1501(0.097 3);基因型频率最高的分别为HLA-A*1101,2402(0.096 2);HLA-B* 4001,4601(0.037 3);HLA-DRB1*0901,1202(0.035 0).结论 深圳汉族人群HLA基因具有较为丰富的多态性,与国外不同人群比较,其基因频率分布既与亚洲人群有相似之处,又具有中国人群自身特点.     

基于PCR-SSP技术的HLA-A、B、CW、DRB1位点直接高分辨分型方法的应用

在骨髓移植过程中,HLA配型准确与否直接影响骨髓移植的结果[1]。随着分子生物学技术的发展,借助PCR技术已建立了多种基因分型方法。其中PCR-SSP法是近年来发展起来的应用最广、最简便的方法[2]。目前国内进行HLA-A、B、CW、DRB1位点高分辨分型都是先检测出受检样品的HLA-A、B、CW、DRB1位点低分辨分型结果,再针对每一个等位基因,进行高分辨分型检测,实验耗时长,费用高。笔者应用PCR-SSP技术,在384孔板上一步即可获得HLA-A、B、CW、DRB1位点高分辨的结果,整个试验只需2~3h即可完成,效率高且成本低。1材料与方法1.1检测对…     

中华骨髓库造血干细胞捐献志愿者HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1高分辨等位基因频率分析

目的分析中华骨髓库造血干细胞捐献者HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1 5位点在高分辨基因分型水平上的等位基因频率特征。方法根据718名中华骨髓库捐献者HLA5位点高分辨分型数据,运用直接计数法计算各位点基因频率。结果在718名捐献志愿者中,共检出28个HLA-A等位基因、61个HLA-B等位基因、30个HLA-C等位基因、40个HLA-DRB1等位基因、18个HLA-DQB1等位基因;其中HLA-A位点最常见等位基因为A*1101(21.66%)、A*2402(16.37%)、A*0201(13.79%);HLA-B位点最常见等位基因为B*4001(11.49%)、B*4601(9.54%);HLA-C位点最常见等位基因为Cw*0702(15.74%)、Cw*0102(15.32%)、Cw*0304(11.56%);HLA-DRB1位点最常见等位基因为DRB1*0901(14.69%)、DRB1*1501(12.40%)、DRB1*0701(9.89%);HLA-DQB1位点最常见等位基因为DQB1*0301(20.54%)、DQB1*0303(15.81%)、DQB1*0601(10.79%)。结论本研究在高分辨基因分型水平提供了一套有关中国人群HLA-A,-B,-C,-DRB1和-DQB1 5位点基因频率数据。     

供、患者HLA-A、B、DRB1高分辨分型的无关供者外周血造血干细胞移植32例回顾分析

目的探讨供、患者的人类白细胞抗原HLA-A、B、DRB1基因高分辨相合及亚型相合,无关供者外周血造血干细胞移植后效果的情况,为临床造血干细胞移植治疗选择适配供者提供理论依据。方法采用PCR-SSP或SBT技术对供、患者HLA-A、B、DRB1的基因进行高分辨分型,定期随访患者在造血干细胞移植后状况,统计分析移植后效果。结果32例患者与供者的HLA低分辨分型结果完全相合,HLA-A、B、DRB1基因高分辨分型全相合的患者与HLA-A、B、DRB1基因高分辨分型不相合的患者,造血干细胞植活和两年半内的移植存活率比较,无统计学差异。结论HLA低分辨分型结果完全相合是临床医生选择造血干细胞移植的重要条件之一,供、患者HLA-A、B、DRB1高分辨分型是外周血造血干细胞移植治疗前组织配型不可少的实验之一,但HLA-A、B、DRB1基因高分辨分型错配对无关供者外周血造血干细胞移植的造血干细胞植活和两年半内的移植存活率影响较小,HLA基因高分辨分型可以帮助临床医生选择合适的供者。     

PCR-SBT技术在山东骨髓分库HLA高分辨分型工作中的初步应用

目的将基于测序分型(SBT)技术应用于中华骨髓库山东分库建设的探讨。方法使用ABI 3730 xlDNA测序仪,采用SBT直接测序法,对山东地区的3 500份志愿者血液标本进行DNA测序,其中HLAⅠ类基因对第2、3和4外显子双向测序,Ⅱ类基因对第2外显子双向测序,以得到其HLA高分辨分型结果;对部分呈现中分辨分型结果的标本,通过SSSP技术确认。结果 HLA-A、B、DRB1位点分别有48.23%、42.86%和76.91%得到高分辨结果。此3个位点均获得高分结果的比例为15.91%。在随机增选的760例中分辨标本中,659例(86.71%)经SSSP技术后,获得高分辨结果。结论 SBT技术是骨髓分库开展HLA高分辨分型工作的有力工具。     

741对非亲缘关系供、受者HLA高分辨基因分型结果分析

目的 研究造血干细胞捐献者资料库供、受者HLA-A、HLA-B、HLA-Cw、HLA-DRB1、HLA-DQB1位点等位基因高分辨全相合及不相合的概率.方法 采用基因测序分型(sequence based typing,SBT),序列特异性寡核苷酸探针(sequence-specific oligo nucleotide probes,SSOP),聚合酶链反应序列特异性引物(sequence-specific primers,SSP)对741对HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1低分辨全相合的无关供、受者进行HLA-A、HLA-B、HLA-Cw、HLA-DRB1、HLA-DQB1基因高分辨检测.结果 HLA-A、HLA-B、HLA-Cw、HLA-DRB1、HLA-DQB1基因位点高分辨分型供、受者全相合的概率为0.1916(142/741);1个等位基因不相合的概率为0.1930(143/741),不相合的位点频率次序为:HLA-A＞-Cw＞-DQB1＞-B＞-DRB1;2个等位基因不相合的概率为0.2362(175/741).其中仅在一个位点(loci)上的概率为0.0175(13/741),位于两个位点上的概率为0.2186(162/741),以A+Cw组合位点不相合的概率最高,其次以B+Cw和DRB1+DQB1组合位点次之.结论 对判断无关供、受者HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1低分辨全相合,而HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1、HLA-Cw、HLA-DQBI高分辨基因分型全相合或部分相合的概率有重要参考价值,并且不仅能提高非亲缘造血干细胞移植的成功率,还有助于提高造血干细胞捐献者资料库数据的使用率.     

中华骨髓库HLA分型质控工作中分型结果错误原因的分析及探讨

目的对中国造血干细胞捐献者资料库（简称中华骨髓库）中人类白细胞抗原（HIA）分型数据质控抽枪中发现的错误分型情况进行归纳总结，探讨其产生的原因及解决策略，以提高造血干细胞捐献者HLA分型的准确性。方法采用聚合酶链反应（PCR）-序列特异件引物（sequence specific primers, SSP） 、PCR-序列特异性寡核苷酸探针（sequence specific oligonucleotide probes, SSOP）及基因测序（ sequence based typing,SBT）分型方法，对中华骨髓库按比例随机抽取的7313份已完成HLA-A、B、DRB1基因分型的标本进行复检，使用与所抽检标本原始分型试剂小同的试剂盲检，对结果不符者，采用第3种试剂及其原始分型试剂复检；对于难以确定的结果，采用SBT方法确认。采用直接计数法进行HLA差错统计。结果质控抽检6期共7313份标本，发现HLA分型结果错误标本数183份，平均错误率为2．50％。HLA基因分型错误率逐年降低，6期错误率分别为8．18％、3．84％、2．85％、1．70％、1．10％、0．84％。HLA-A位点错误率为0．49％，其中漏检现象占A位点错误的61．11％；HLA-B位点错误率为0．85％，其中以同一宽特异性组之间的业型判断错误者居多，占B位点错误的41．94％；HLA-DRB1位点错误率为0．66％；另外，可能由于标本搞错导致的HLA-A、B、DRB1 3个位点分型全错有41例，错误率为0．56％。结论错误产生的原因有实验人员的技术操作水平及工作责任心上的原因，也有分型方法及试剂本身的原因。采用DNA分型技术，使用特异性、重复性好的合格试剂及加强质控监督，有助于提高HLA分型的准确性，并将有助于提高骨髓库造血干细胞捐献者HLA分型的质量。     

流式磁珠PCR-SSOP法漏检2例HLA-A位点罕见基因型的原因分析

目的对采用流式磁珠PCR-SSOP法复核2例HLA-A位点罕见基因型,查找分析原因。方法对2 688例HLA-A、B、DRB1SBT基因分型结果中43例罕见型结果,采用流式磁珠PCR-SSOP法复核,查找差异,确定分型,并分析差异结果原因。结果 2例罕见基因型在流式磁珠PCR-SSOP法同一批号03A高分试剂中均有1组磁珠假阳性,造成HLA-A位点罕见基因型漏检。2例罕见基因型在流式磁珠PCR-SSOP法同一批号004高分试剂检测结果与SBT结果一致。结论 HLA罕见基因型不能轻易排除,应用多种方法复核,保证HLA基因分型结果的准确。     

3238名江苏汉族造血干细胞捐献者HLA-A、B、DRB1位点高分辨基因分型结果的研究

目的 分析中国江苏地区汉族人群造血干细胞捐献志愿者的HLA-A、B、DRB1位点在高分辨基因分型水平上的基因多态性弹倍型分布特征以及常见与罕见等位基因的分布.方法 大量应用基因序列分型技术和少量应用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术对中华造血干细胞捐献志愿者资料库江苏分库3238名无关供者的HLA-A、B、DRB1位点等位基因作高分辨分型.结果 HLA-A基因46个,HLA-B基因85个,HLA-DRB1基因51个.HLA-A位点频率最高的是A*11∶01(16.52％),HLA-B位点为B*13∶ 02(11.60％),HLA-DRB1位点为DRBl* 07∶01( 15.78％).单倍型频率最高是A* 30∶ 01-B* 13∶02-DRBl* 07∶01 (8.87％).HLA-A位点常见等位基因(CWD)种类有40种,在样本中的含量达到99.8％,HLA-B位点CWD则有77种(99.5％),HLA-DRB1位点的CWD有47种(99.8％),并发现少量在中国人群未报道的罕见基因.结论 本资料从高分辨水平反映了江苏地区汉族人群HLA的分布状况.对指导临床寻找HLA匹配的无关造血干细胞供者,HLA与疾病相关研究和我国人群群体遗传学研究等有重要意义.     

中华骨髓库造血干细胞捐献志愿者HLA基因分型中模棱两可结果解决方案的探讨

目的 探讨中华骨髓库造血干细胞捐献志愿者HLA基因分型中模棱两可结果的解决方案。方法 采用聚合酶链式反应(PCR)-测序分型技术(SBT)对20621名中华骨髓库供者的HLA-A、B、DRB1基因进行高分辨分型，并对其中的模棱两可分型结果进行精确分型。根据精确分型后的HLA等位基因频率计算模棱两可结果中真基因型的相...     

中国北方汉族造血干细胞捐献者人类白细胞抗原-A、B、DRB1基因和单倍型高分辨水平的多态性研究

目的 从高分辨率水平研究中国北方汉族人群人类白细胞抗原(Human Leukocyte Antigens,HLA)-A、B、DRB1基因和单倍型的多态性.方法 采用聚合酶链反应-测序分型方法(Polymerase Chain Reaction-Sequence Based Typing,PCR-SBT)对631名随机北方汉族个体的HLA-A、B、DRB1基冈进行序列分析,进而采用最大似然性方法计算等位基因和单倍型的分布频率.结果 30个HLA-A等位基因中,频率高于0.05的5种常见等位基因A*1101、A*2402、A*0207、A*0201和A*3303的频率总和为69.26%;64个HLA-B等位基因中,频率高于0.05的4种常见等位基因B*4001、B*4601、B*5801和B*1502的频率总和为38.11%,41个DRB1等位基因中,频率高于0.05的7种常见等位基因DRB1*0901、DRB1*1501、DRB1*1202、DRB1*0701、DRB1*0803、DRB1*1101和DRB1*0405的频率总和为59.98%.499条A-B、659条BDRB1和2 426条A-B-DRB1单倍型中,分别有38、39和31条单倍型频率高于0.005,其频率总和分别为59.82%、53.69%和32.38%,A*0207-B*4601、B*4601-DRB1*0901和A*0207-B*4601-DRB1*0901分别为其最主要单倍型.结论 中国北方汉族人群高分辨水平的HLA-A、B、DRB1等位基因和单倍型的多态性数据可作为人类学、法医学、移植配型和疾病相关性研究和应用的参考数据.     

PCR—SBT法HLA基因分型模棱两可结果的判读及解决对策

目的研究PCR—SBT法HLA基因分型结果判读中出现的模棱两可问题并提出解决策略。方法对306名随机抽取的组织配型患者的DNA采用PCR-序列特异性引物（Sequence Specific Primer,SSP）低分辨方法检测,同时采用PCR—SBT法进行HLA—A,B,DRB1高分辨基因分型。PCR—SBT法模棱两可结果用PCR—SSP高分辨方法复核确认。结果所有306例检测标本的高低分辨血清学抗原一致,经PCR—SBT基因测序方法检测有111份模棱两可结果,占36．3％（111／306）。其中HLA—A座位有30对等位基因存在模棱两可结果,占所有检测标本等位基因总数的3．3％;HLA—B座位有66对,占7．2％;HLA—DRB1座位有36对,占3．9％。所有模棱两可标本经PCR—SSP HLA基因高分辨分型试剂PCR—SSP等方法复核确认。结论针对PCR—SBT法进行HLA—A,B,DRB1高分辨基因分型模棱两可结果所建立的解决策略,对于提高HLA数据分型的速度和分型准确性有重要意义。     

斑秃患者HLA-A、B、DRB1基因多态性调查分析

目的 调查河南汉族斑秃患者HLA-A、B、DRB1中低分辨多态性分布,探讨该病与HLA的关联性.方法 收集2007年10月至2008年2月被河南省某医院皮肤科诊断为斑秃的121例河南籍汉族无血缘关系者血液标本,提取基冈组DNA,采用PCR-SSO流式荧光微珠法进行HLA-A、B、DRB1中低分辨检测,统计分析A、B、DRB1等位基因频率,并与本地区24 930份造血干细胞捐献者(对照组)进行对比,u检验分析两组样本间率的差异的显著性.结果 共检测斑秃患者血样121例,其中A位点等位基因频率较高的有A*02(0.2603)、A*11(0.1653)、A*24(0.1240),B位点等位基因频率较高的有B*15(0.2107)、B*13(0.1198)、B*40(0.1074),DRB1位点等位基因频率较高的有DRB1*15(0.2273)、DRB1*07(0.1364)、DRB1*09(0.1198)、DRB1*04(0.1074);在对照组中A位点等位基因频率较高的有A*02(0.2909)、A*11(0.1666)、A*24(0.1570),B位点基因频率较高的有B*15(0.1370)、B*13(0.1316)、B*40(0.1315)、B*51(0.0765),DRB1位点基因频率较高的有DRB1*15(0.1786)、DRB1*07(0.1322)、DRB1*09(0.1302)、DRB1*04(0.1082),两组样本A位点等位基因分布差异无统计学意义;斑秃患者DRB1*12频率低于正常对照组(P<0.05),B*15(62)和DRB1*15基因频率显著高于正常对照组(P<0.05).结论 斑秃患者与正常人群中HLA-A位点等位基因分布差异无统计学意义.DRB1*12可能对于斑秃的发病有抵御作用,B*15(62)和DRB1*15可能为斑秃的易感基因.     

陕西地区与其他地区汉族人群HLA等位基因分布的比较

目的 了解陕西地区HLA-A、B、DRB1等位基因分布的特征,并与其他地区汉族人群进行比较.方法 采用PCR-SSP和PCR-SSO方法对中华骨髓库陕西分库的10 122名汉族造血干细胞捐献者血液样本进行HLA-A、B、DRB1等位基因分型分析.结果 检出了20个A等位基因,34个B等位基因,14个DRB1等位基因.频率最高的基因分别为A*02、B*15、DRB1*15,其相应基因频率分别为30.03%、14.09%和15.51%.结论 陕西地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因频率具有较丰富的多态性.与山西地区和北方地区人群具有相似的遗传背景.     

等位基因频率在鉴别模棱两可HLA基因型中的应用价值分析

本研究探讨采用等位基因频率直接鉴别模棱两可HLA基因型的应用价值。应用聚合酶链式反应（PCR）-测序分型方法（SBT）对658名汉族供者HLA-A、B、DRB1基因进行测序分型，并分别采用PCR-序列特异性引物法（SSP）和杂合性歧义引物分离法（HAPRs）对其中的模棱两可标本进行精确分型，进而利用等位基因频率计算真基因型的相对概率并与真实结果进行比对。结果表明：222个HLA-A，238个HLA-B和107个HLA-DRB1基因的模棱两可标本中，真基因型的相对概率高于95％的比例分别为99．5％（221／222）、95．8％（228／238）和97．7％（104／107）；与PCR—SSP和HAPRs分型结果相比，3个基因座的吻合率分别为100％（222／222）、99．6％（237／238）和99．1％（106／107），仅有B％3501／5501和DRB1＊1201／1504不同，其相对概率值分别为40．3％和2．1％。结论：在大规模供者HLA基因的PCR—SBT分型中，应用等位基因频率直接鉴别模棱两可基因型的方法不仅具有较高的准确率和可信度，而且更加经济、简便、快捷，但在移植前供、患者HLA基因的确认试验中必须慎重应用。     

山东省汉族人群HLA-A、B、DRB1位点基因多态性研究

目的分析山东省汉族人群HLA-A、B、DRB1位点基因多态性,获得更完整、准确的群体HLA分子遗传学数据。方法应用PCR-SSP及SSOP技术对7418名山东省汉族造血干细胞志愿捐献者进行HLA-A、B、DRB1位点基因分型。结果共检出低分辨HLA-A基因18种,B基因44种,DRB1基因13种,其中包括一些以前国内未检出的低频率基因。山东汉族人群最常见的HLA基因为A*02、B*13和DRB1*15,其相应基因频率分别为0.2883、0.1431和0.1762;山东汉族人群最常见的A-B单倍型为A*30-B*13,频率为0.0896,最常见的A-B-DRB1单倍型是A*30-B*13-DRB1*07,频率为0.0743。结论山东省汉族人群HLA-A、B、DRB1基因具有显著多态性,大样本和DNA分型有助于低频率基因的检出,适当扩大造血干细胞库志愿捐献者登记人数及各地重新进行HLA多态性分析实有必要。     

11755名中国北方汉族造血干细胞供者HLA-A、B、DRB1基因和单倍型研究

为了研究中国北方汉族造血干细胞供者的人类白细胞抗原（HLA）-A,B,DRB1等位基因、HLA单倍型频率及其连锁不平衡特征,采用PCR-SSP和PCR-SSO流式微磁珠检测方法对中华骨髓库陕西分库内11755名中国北方汉族骨髓供者进行HLA基因低分辨分型,并根据HLA表型群体资料,运用基于最大数学预期值算法（Expectation-Maximization,EM）的计算机软件Arleguin计算HLA单倍型频率。结果表明：11755例样本符合Hardy-Weinberg平衡检验,共检出HLA-A、B、DRB1等位基因（按分解抗原统计）分别为18、42、15种,包括很少在汉族人群中检测到的HLA-A25、B42、B53、B73和DR3,未发现HLA-A36,A43,A80,B78,B82和DR18等6种特异性。HLA-A＊02,A＊11,A＊24,A＊33,A＊30,A＊01,A＊03,A＊13,B62,B＊51,B＊46,B60,B61,B＊35,B＊44,DRB1＊15,DRB1＊09,DRB1＊04,DRB1＊07,DRB1＊12,DRB1＊11,DRB1＊14,DRB1＊08,DRB1＊13的频率〉0.05。EM法计算求得频率〉10-6的HLA-A-B-DR单倍型共计2026种,其中HLA-A30-B13-DR7、A2-B46-DR9、A33-B58-DR17等26种单倍型频率〉0.005,A30-B13-DR7是中国北方汉族最常见单倍型。计算求得的HLA-A-B、A-DR、B-DR单倍型共计538、227、522种,频率〉10-6者分别有409、195、423种,其中A30-B13,A2-B46,A33-B58等28种单倍型频率〉0.01;A2-DR9,A2-DR15,A30-DR7等26种单倍型频率〉0.01;B13-DR7,B46-DR9,B13-DR12等24种单倍型频率〉0.01。具有统计学意义（P〈0.05）的连锁不平衡HLA-A-B、A-DR和B-DR单倍型分别有296种（72%）、130种（67%）和308种（73%）,其中A30-B13、A33-B58、A1-B37、A30-DR7、A33-DR13、A1-DR10、B37-DR10、B8-DR17、B13-DR7、B58-DR17等单倍型表现为显著的正连锁不平衡。结论：本研究使用EM算法获得了目前中国北方汉族样本量最大的HLA-A/B/DRB1等位基因多态性、单倍型频率分布及连锁不平衡的特征,这将有助于临床为患者寻找合适供者,为移植免疫、HLA与疾病相关性及本地区群体遗传学等方面的研究提供了重要依据。     

河南省骨髓库汉族捐献者HLA-A、B、DR高分辨基因多态性调查分析

背景：2009年开始,中华骨髓库加大HLA高分检测的力度,可缩短配型检索周期,提高配型成功率。目的：统计分析河南省骨髓捐献者HLA-A、B、DRB1高分辨基因多态性。方法：河南省汉族造血干细胞志愿捐献者血样3874人份,志愿捐献静脉血,EDTA抗凝。采用SSOHD荧光微珠流式高分辨HLA-A、B、DRB1基因分型检测方法,对3874份骨髓捐献志愿者血样进行高分辨分型检测,用PCR-SSP高分辨检测、SBT检测解决存在的模棱两可问题。等位基因计数法计算等位基因的基因频率。结果与结论：共检出A34个,B84个,DRB150个,A位点基因频率处于前5位的有A＊0201（0.1609）、A＊1101（0.1627）、A＊2402（0.1602）、A＊3001（0.0808）、A＊3303（0.0789）;B位点处于前5位的是B＊1302（0.0777）、B＊4001（0.0722）、B＊5101（0.0628）、B＊4601（0.0612）和B＊0702（0.0507）;DRB1位点处于前5位的是DRB1＊1501（0.1469）、DRB1＊0901（0.1318）、DRB1＊0701（0.1211）、DRB1＊1202（0.0612）、DRB1＊0405（0.0582）。