病毒载量对SARS-CoV-2测序准确性的影响

目的评估病毒载量对严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)全基因组测序准确性的影响, 为新冠病毒基因监测提供技术支撑。方法提取3例新冠病毒阳性病例的核酸进行4个梯度稀释处理, 同时提取83例新冠病毒阳性病例的核酸进行验证, 通过测序深度、基因组覆盖率和测序深度均一性等指标对测序结果进行评价。结果病毒载量的改变不能影响原始测序数据的质量, 病毒载量对测序数据的准确性具有一定的影响:当Ct值≤32时, 病毒载量变化对测序深度和基因组覆盖率的影响并不显著, 能够达到全基因组测序目的;当Ct达到38时, 覆盖率急剧下降至50%以下, 无法测到病毒的基因组全长。结论通过评估病毒载量对SARS-CoV-2的测序准确性的影响, 我们建议选取Ct值≤32的样本, 产生的测序数据的全基因组覆盖率能够满足后续分析要求。     

湖南省既往HIV-2疑似感染者血清流行病学调查

目的通过对湖南省既往HIV-2疑似感染者血清样本进行HIV-2抗体检测和流行病学调查, 了解湖南省HIV-2感染状况。方法收集全省15家艾滋病确证实验室2003—2020年原始记录中出现了HIV-2抗体指示性条带的库存血样和检测对象流行病学资料, 采用国内批准上市的能同时诊断HIV-1和HIV-2的试剂盒进行重复检测。结果判定按照试剂盒说明说明书。结果共收集到出现了HIV-2抗体指示性条带的样本378份, 涉及病例363例。血清检测结果显示, 326例(89.81%)HIV-1抗体阳性;18例(4.96%)HIV-2抗体阳性;12例(3.31%)HIV抗体阳性但不能分型;6例(1.65%)HIV抗体不确定;1例(0.28%)HIV-1/2抗体阴性。18例HIV-2抗体阳性样本来自湘潭市15例(83.33%)和长沙市3例(16.67%)。流行病学调查结果显示, 男性12例(66.67%)、女性6例(33.33%), 男女比2∶1;丧偶或离异6例(33.33%), 在婚单阳8例(44.44%)、在婚双阳2例(11.11%)、婚姻状况不详2例(11.11%);首次检测平均年龄(56.94±1...     

2015—2019年唐山市无偿献血人群HIV感染状况及其特征分析

目的了解2015—2019年唐山市无偿献血人群HIV感染状况, 分析其人群分布特征。方法对2015—2019年唐山市无偿献者的血标本采用酶联免疫吸附法进行抗-HIV检测, HIV初筛阳性的血标本采用免疫印迹法进行确证试验, 并对确诊HIV感染者进行流行病学分析。结果 2015—2019年唐山市无偿献血者463 077例, 发现HIV感染者92例, HIV阳性率为1.99/万, 年龄分布以31～40岁为主, 男性感染率高于女性。与国内其他地区相比, 唐山市无偿献血人群的HIV感染率与商丘市接近, 呈平稳而缓慢上升趋势。在92例HIV感染者中, 合并TP感染的最多, 有13例, 占14.13%(13/92)。感染途径以男女性传播和男男性传播多见, 分别占50.00%(46/92)、34.78%(32/92)。结论 2015—2019年唐山市无偿献血者HIV感染率呈平稳而缓慢上升趋势, 不同特征人群HIV阳性率有差异, 以文化程度低、首次献血的中青年男性为主, 应做好献血前的健康征询和献血后HIV实验室筛查, 确保临床输血安全。     

重视诺如病毒

1972年, 诺如病毒被发现, 此后被确认为全球急性胃肠炎散发病例及暴发的主要病因之一, 成为全球性的公共卫生问题。50年来, 人们对诺如病毒感染的临床特征、流行病学特征、病原特征等有了较深入认识, 但迄今未能建立有效的体外培养和实验动物模型, 导致其感染和致病机制研究受限, 也无特异的疫苗和药物上市。随着轮状病毒疫苗的全球普及, 诺如病毒成为继轮状病毒后又一亟待控制的重要公共卫生问题。     

306例艾滋病患者的血脂异常情况及相关因素分析

目的 分析艾滋病(AIDS)患者的血脂异常情况及相关因素。方法 纳入分析了2017年4月至2018年1月在北京协和医院感染科就诊的306例AIDS患者,对患者的一般资料、一般自我效能感量表、社会支持评定量表、国际体力活动短问卷和高脂血症患者膳食评价4个量表进行调查。结果 306例患者中血脂异常179名(58.50%),单因素分析结果为非核苷类逆转录酶抑制剂较其他抗病毒药物对血脂的影响更小(χ2＝10.710,P＝0.001),蛋白酶抑制剂较其他药物对血脂的影响更大(χ2＝12.559,P<0.001);血脂异常组的患者较正常组患者年龄、BMI更大。已婚者血脂水平存在差异。多因素分析结果为饮食习惯与女性性别、活动等级与BMI、年龄与病程在血脂异常中存在交互作用。结论 AIDS患者的血脂异常更多程度是由疾病本身及治疗造成的。医护人员在随访过程中尤其应关注使用蛋白酶抑制剂者、病程超过两年者、中年以上患者、初治时CD4计数高的特殊患者。     

基于qPCR的两种试剂在HIV-1病毒载量检测中的比较研究

目的比较两种实时荧光定量PCR试剂检测HIV-1病毒载量间的相关性和一致性, 以及性能参数。方法两种检测试剂各采用3个批号对系列稀释的定值质控品检测, 分析两种检测试剂的检测线性度和精密度。再用两种试剂对166例HIV抗体阳性样品和27例阴性样品分别进行检测, 比较两者的相关性和一致性。结果 TaqMan病毒载量检测试剂与系列浓度定值质控品检测结果的决定系数为R2=0.978, Xpert病毒载量检测试剂与系列浓度定值质控品检测结果的决定系数为R2=0.987;对不同浓度定值质控品检测结果的不同批号间和总变异系数均<7%。两种试剂不同批号检测定值质控品的结果差异无统计学意义。两种试剂对血浆样本检测结果显示, 对阴性样品检测的符合率为100%, 在40 cps/mL的临界值处的观察一致性为50%, 在其量化下限附近缺乏一致性, 线性范围内检测结果之间的决定系数为R2=0.946。Bland-Altman分析显示, 偏差均值为0.41 log10(IU/mL)。结论两种试剂检测性能均良好, 在HIV-1病毒载量检测中具有较好的临床等效性。     

呼吸道合胞病毒受体研究进展

呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)是急性呼吸道感染的主要病原体之一, 给全世界造成了巨大的负担。病毒与宿主细胞受体识别和相互作用, 是建立感染的关键初始步骤, 受体分布影响病毒的细胞嗜性和组织嗜性, 影响病毒在宿主体内的复制和增殖。但目前RSV受体尚不明确, 这也是阻碍RSV疫苗及治疗性药物研发的原因之一。本文通过对现有的RSV受体进行综述, 以期对RSV疫苗及治疗性药物的研发提供思路。     

合肥市新报告HIV-1感染者传播性耐药特征及分子传播网络研究

目的研究安徽省合肥市2020年新报告HIV-1感染者的传播性耐药(transmitted drug resistance, TDR)及分子传播网络情况。方法收集合肥市2020年1—12月新报告HIV-1感染者, 扩增pol基因区(2 253～3 314 nt), 判定基因型耐药情况, 构建分子传播网络并分析进入网络病例的相关特征。结果成功扩增pol基因区序列376条, 主要的毒株为CRF07_BC(157, 41.8%)和CRF01_AE(136, 36.2%)。新报告感染者TDR为2.7%(10/376), 10例携带监测性耐药突变(surveillance drug resistance mutation, SDRM), 并且毒株CRF55₀1B所占比例较大(4/10)。分别以0.5%作为基因距离阈值构建了分子传播网络, CRF01_AE的大型网络以已婚中年男男性行为者(men who have sex with men, MSM)为主, 而CRF07_BC则以教育水平较高的未婚M...     

滤泡辅助性T细胞在HIV感染及疫苗免疫中的作用及机制

滤泡辅助性T细胞( follicular helper T cell, Tfh )是近期发现的具有B细胞辅助功能的CD4+T淋巴细胞亚群, 对于生发中心形成、亲和力成熟、高亲和力抗体产生和记忆B细胞的发育至关重要。Tfh与艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome, AIDS)发展进程密切相关。在人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染过程中, Tfh细胞数量、功能、病毒潜伏、Tfh/滤泡调节T细胞(follicular regulatory T cell, Tfr)比例平衡、中和抗体产生等方面均发生变化。文章综述Tfh在HIV感染及疫苗免疫后抗体应答中的作用及机制, 旨在为HIV疫苗的设计与免疫策略制定提供参考。     

狂犬病病毒体外生存活力研究

目的了解狂犬病病毒在体外组织和体液样本中的生存能力。方法通过病毒滴度测定、直接免疫荧光、RT-PCR和病毒分离实验室技术手段对体外组织和悬液中狂犬病病毒生存活力进行验证。结果随着温度升高, 脑组织和悬液中狂犬病病毒活力逐渐下降, 在56℃, 30 min后病毒即失去感染力, 在37℃时, 组织中病毒活力可保持7 d;在pH9.6时, 1 h后无法检测病毒活力;终浓度30%以上乙醇, 500 mg/L以上次氯酸钠和100 mg/L以上苯扎溴铵对悬液中狂犬病病毒作用3 min后即可完全灭活;80%丙酮对组织中狂犬病病毒灭活作用最强, 在浸泡4 h后样本即无法进行病毒分离。结论狂犬病病毒不耐高温, 在pH6.8～7.4环境中较为稳定, 常用消毒剂即可对病毒发挥作用;本实验旨在为狂犬病病毒的体外生存活力提供详细数据, 为下一步狂犬病防控工作开展提供理论支持。     

狂犬病病毒的检测技术

狂犬病是一种病死率极高的人兽共患病, 在世界范围内广泛流行。通过对犬的大规模免疫等防控措施, 狂犬病逐步得到控制, WHO号召在2030年消除由犬传播的人间狂犬病。狂犬病病原体的检测既是狂犬病病例确诊的重要依据, 也是衡量狂犬病消除进度不可或缺的基本工具。国内外关于狂犬病病毒检测的研究众多, 本文从抗原检测技术、抗体检测技术、核酸检测技术以及其他检测技术4个方面进行了梳理并展开综述。     

一起入境航班关联新冠肺炎聚集性疫情病毒全基因组特征分析

目的分析2021年8月北京市一起入境航班关联新冠肺炎聚集性疫情中新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)基因组特征及变异情况, 为疫情防控和风险评估提供参考。方法收集此次疫情全部50例关联病例的呼吸道标本, 使用数字PCR方法对病毒载量进行测定, 使用高通量测序对病毒全基因组进行测定分析, 对基因组数据拼接整理后进行变异位点分析及系统发生分析。结果全部50例样本中病毒载量中位数为5.57×104拷贝/ml(ORF1ab基因)和5.85×104拷贝/ml(N基因)。共测定获得SARS-CoV-2病毒全基因组序列46份, 均为Omicron变异株BA.5分支。其中21例与7例形成两个进化簇, 内部全基因组核苷酸相似度高于99.993%和99.997%。结论该起聚集性疫情可能由两个传播链和其他散在感染共同构成, 疫情病毒为境外流行的Omicron变异株BA.5分支。     

3例急性期HIV-1感染病例实验室检测及病毒亚型分析

目的对艾滋病筛查有反应而确证试验阴性或不确定病例进行随访和HIV-1核酸检测, 分析感染毒株基因亚型。方法对3个艾滋病筛查有反应且免疫印迹试验(western blot, WB)阴性或不确定病例进行HIV-1核酸检测和随访。采用一步法RT-PCR扩增HIV-1pol基因片段, 构建系统进化树分析其基因亚型。结果 3个HIV抗体筛查有反应病例, 经WB检测病例1和3出现p24条、病例2未检测到特异条带。pol基因片段系统进化分析显示病例1和3均感染CRF07_BC毒株, 病例2感染CRF01_AE毒株(第5簇)。对病例1和3进行2周后随访检测, WB条带有进展, HIV-1病毒载量分别为476 385 cp/mL和103 462 cp/mL, CD4+T淋巴细胞计数分别为220个/μl和550个/μl。结论急性期HIV-1感染表现为筛查有反应而WB阴性或不确定, HIV-1核酸检测有助于提高急性期感染的发现和诊断能力。     

呼吸道合胞病毒

近期我国急性呼吸道疾病持续上升与多种呼吸道病原体感染有关。其中呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)感染是导致1岁以下婴幼儿肺内感染住院的第一原因。在RSV流行高发季节, 80%以上婴幼儿的急性下呼吸道感染由RSV感染引起。世界卫生组织数据表明, RSV感染是5岁以下儿童因病毒感染而住院甚至死亡的第一大因素。     

诺如病毒进化特征及疫苗研究进展

诺如病毒是急性非细菌性肠胃炎的主要病原体, 在全球范围内呈持续散发和季节性暴发的流行趋势, 对人类健康以及全球公共卫生事业造成威胁。由于该病毒不能体外培养, 且缺少有效的动物模型, 至今尚无相关疫苗和抗病毒药物上市。诺如病毒基因的多样性及持续的进化为疾病防控体系带来了极大困扰, 因而诺如病毒进化形式和趋势研究对于该病毒的防控具有重要意义。本文总结了诺如病毒两种主要的进化形式及其在不同基因型进化过程中的差异及作用, 分析了病毒、宿主及环境等多种因素影响诺如病毒进化的相关研究进展, 并对诺如病毒疫苗的研发现状进行综述。     

登革病毒与细胞自噬

登革病毒(dengue virus,DENV)在胞内复制、宿主间传播和机体内致病机制等方面均受到细胞自噬的影响,本文依据国内外最新研究进展以DENV与细胞自噬的关系为重点展开综述。自噬是一种真核生物普遍具备的、用于应对外界压力和维持细胞内稳态的程序性蛋白降解途径,其在保护细胞免受病毒等外源病原体侵染的机制中发挥重要作用。但是自噬在DENV的复制过程中发挥了相反的作用。自噬不仅为病毒复制提供了复制场所,而且为其提供能量来源,细胞自噬还参与了部分DENV致病过程。总之,自噬有助于DENV的复制。     

腺病毒肝炎

自2022年4月以来, 儿童不明原因重症肝炎在全球多国报道。截止5月11日, 全球已有20多个国家报告了至少448例不明原因儿童急性重症肝炎病例。鉴于部分病例检测出腺病毒, 因此腺病毒感染被怀疑是造成此次儿童急性重症肝炎的可能病因。本文就既往腺病毒感染引起肝炎(腺病毒肝炎)的流行病学、临床特征及发病机制等方面的研究和报道进行简单综述, 为我国开展不明原因重症肝炎的预防和控制提供参考。     

骨质疏松症与新型冠状病毒感染的研究进展

新型冠状病毒感染(COVID-19)对神经、肺、肾、血管和心脏均会产生负面影响, 但对肌肉骨骼的作用仍缺乏关注。新近的研究表明COVID-19与骨质疏松症(OP)存在紧密关联。COVID-19本身及其治疗、患者自身因素等都与OP的发生有关, 同时骨密度(BMD)降低与COVID-19患者的临床病程及预后也密切相关。此外, 抗OP治疗与COVID-19之间的关系尚未得到深入研究。因此, 本文就COVID-19与OP的相互关系进行总结分析, 以期为COVID-19患者以及未来疫情下治疗OP、加强骨健康管理提供新思路和指导。     

HIV感染与精神心理健康

目前人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染已经成为可防可控的慢性感染性疾病, HIV感染者的健康相关生活质量问题日益凸显。解决艾滋病最常见的心理健康问题, 对于实现和维持病毒抑制, 结束艾滋病流行也是必需的。本文综述了近年来HIV感染领域中筛查和解决精神心理健康的相关研究进展, 为HIV感染人群的精神心理健康的临床应用提供可参考的依据。     

长新冠研究进展

长新冠是COVID-19急性感染期后产生的多系统性疾病, 现已报道的长新冠相关症状有200多种, 累及机体的多个器官, 约有10%以上的长新冠患者产生长新冠症状。随着研究的深入, 有关长新冠的病理变化、风险因素以及疾病特征的研究证据越来越多。虽然这些发现对理解长新冠至关重要, 但目前仍有许多问题尚未解决。本文从长新冠的症状、患病率、发病机制、诊断标准、风险因素以及新发疾病等方面对相关研究进行综述, 以期为读者提供长新冠相关研究的参考信息。