IDUA基因复合杂合突变致黏多糖贮积症Ⅰ型1例报告

目的 探讨黏多糖贮积症Ⅰ型的临床表型及基因型。方法 回顾分析l例黏多糖贮积症Ⅰ型患儿的临床资料。结果 患儿,男,9月13天。5个月时出现双眼无神,眼科检查发现双眼角膜混浊。临床表型及外周血α-L-艾杜糖苷酶（IDUA）活性检测符合黏多糖贮积症Ⅰ型（MPSⅠ）。全外显子测序发现：在4p16.3区域存在大片段杂合缺失,缺失段为（980784-985463）×1;在c.911delT和c.76G>A存在1个杂合突变和一个半合子突变,均来源于母亲。结论 本例患儿为IDUA基因复合杂合突变致黏多糖贮积症I型发病,临床罕见。     

黏多糖贮积症ⅢA型一个家系的遗传学分析

目的探讨1例以肥厚型心肌病为首发表现的黏多糖贮积症ⅢA型(MSP ⅢA)患者的临床及遗传学特征。方法选取2022年1月就诊于济宁医学院附属医院的1例MPS ⅢA先证者及其家系成员(3代共7人)作为研究对象。收集先证者的临床资料, 采集先证者及其家系成员的外周血样, 进行全外显子组测序, 对候选变异进行Sanger测序家系验证。同时根据变异位点的相关疾病进行硫酸乙酰肝素硫酸酯酶的活性检测。结果先证者为49岁女性, 心脏MRI提示左室壁明显增厚, 最厚处近20 mm, 钆延迟增强扫描心尖部心肌局部延迟强化。全外显子组测序发现患者SGSH基因存在c.545G>A(p.Arg182His)/c.703G>A(p.Asp235Asn)复合杂合变异。Sanger测序提示其母亲携带c.545G>A(p.Arg182His)杂合变异, 父亲、姐姐、妹妹和儿子均携带c.703G>A(p.Asp235Asn)杂合变异。依据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南, c.545G>A及c.703G>A均评级为致病性变异(PM2_Supporti...     

Ⅱ型粘多糖贮积症致病基因内含子中一个新的RNA剪切变异

目的对1个粘多糖贮积症Ⅱ型(mucopolysaccharidosis Ⅱ,MPSⅡ)家系的艾杜糖-2-硫酸酯酶(iduronate-2-sulfatase, IDS)基因进行变异分析,探讨其分子遗传学发病机制。方法应用高通量测序和Sanger测序技术对先证者进行基因变异分析,基因变异确定后,对其母亲、父亲进行致病基因位点确认,确定变异基因的遗传关系;应用逆转录-聚合酶链反应检测变异对mRNA的影响。结果先证者IDS基因存在IVS1-3T>G半合子变异,导致变异等位基因产生了两种转录本,一种转录本保留了第1内含子的3′端c.104-216到c.104-1的216个核苷酸,并提前出现终止密码,导致肽链从550个氨基酸截短至38个;另一种转录本缺失了第2外显子5′端c.104-c.212的109个碱基,产生移码变异,IDS肽链由550个氨基酸缩短至92个。先证者为IVS1-3T>G变异的半合子,而其母亲为IVS1-3T>G变异的杂合子;其他家系成员及100名正常对照则未见该变异。结论 IDS基因的IVS1-3T>G变异导致IDS基因表达异常,进而引起IDS蛋白异常,...     

一例糖原贮积症Ⅵ型患儿的临床表型及致病变异分析

目的对一例糖原贮积症Ⅵ型(glycogen storage disease Ⅵ, GSD-Ⅵ)患儿进行表型和致病变异分析, 明确其遗传学病因。方法分析患儿的临床资料, 应用全外显子组测序(whole exome sequencing, WES)对其进行致病变异检测, 用Sanger测序对候选变异进行验证。结果患儿男, 3岁9个月, 表现为腹部膨隆、肝脏肿大、身材矮小, WES检测发现其携带PYGL基因c.320dupA(p.Asn107fs)和c.697G>A(p.Gly233Ser)复合杂合变异, Sanger测序证实二者分别遗传自其父母, 其中c.320dupA(p.Asn107fs)既往未见报道。结论上述发现明确了该GSD-Ⅵ患儿的遗传学病因, 丰富了PYGL基因的变异谱, 并为患儿的治疗和遗传咨询提供了依据。     

黏脂贮积症Ⅱ型α/β和Ⅲ型α/β家系的溶酶体酶学分析

目的分析总结黏脂贮积症(mucolipidosis, ML)Ⅱ型α/β和Ⅲ型α/β溶酶体酶酶学检测的特点, 为选择酶学检测指标提供依据。方法检测两例确诊为ML Ⅱ型α/β和Ⅲ型α/β患者及10例健康个体血浆及白细胞中的多种溶酶体酶活性, 比较患者与健康个体的差异;分别以"mucolipidosis"及"黏脂贮积症"为关键词, 检索PubMed、CNKI、万方数据库, 分析总结已报道的ML Ⅱ型α/β和Ⅲ型α/β的酶学检测结果。结果两例患儿血浆中多种溶酶体酶活性与健康个体相比均明显增高, 程度由高至低分别为:芳基硫酸酯酶A(arylsulphatase A, ASA)和α-L-艾杜糖醛酸酶(α-iduronidase, IDUA)(20倍以上)、β-葡萄糖醛酸酶(β-glucuronidase, GUSB)(10倍以上)、β-D半乳糖苷酶(β-galactosidase-1, GLB1)和α-半乳糖苷酶(α-galactosidase A, GLA)(5倍以上)、α-N-乙酰葡萄糖胺酶(α-N-acetylglucosaminidase, NAGLU)(2倍), 葡萄糖脑苷酯酶(gluc...     

遗传性FⅪ缺陷症一家系的基因新复合杂合变异分析

目的 对1个复合杂合变异导致的遗传性凝血因子Ⅺ(coagulation factor Ⅺ,FⅪ)缺陷症家系进行表型和基因变异分析,探讨其发病的分子机制。方法 检测先证者及其家系成员(共3代11人)的活化部分凝血活酶时间(activated partial thromboplastin time,APTT)、凝血酶原时间(prothrombin time,PT)、纤维蛋白原(fibrinogen,FIB)、血浆FⅪ活性(FⅪ activity,FⅪ∶C)及FⅪ抗原(FⅪ antigen,FⅪ∶Ag)等指标以明确诊断;用Sanger测序法分析先证者F11基因的所有外显子及侧翼序列、5′和3′非翻译区及家系成员相应的变异位点区域,用反向测序予以证实。用PolyPhen-2和SIFT软件分析变异对蛋白质功能的影响;用Swiss-PdbViewer软件对变异位点进行蛋白模型和氨基酸相互作用分析。结果 先证者和其姐姐APTT、FⅪ∶C、FⅪ∶Ag均明显异常,分别为73.0 s、10.0%、15.0%和87.1 s、2.0%、11.5%;其部分家系成员的APTT稍有延长,FⅪ∶C和FⅪ∶Ag也均有不...     

基因复合杂合变异导致卵母细胞透明带缺失而不孕

目的探讨1例原发不孕伴卵母细胞透明带缺失患者的遗传学病因。方法应用全外显子组测序技术对患者及其父母ZP1基因进行变异检测、Sanger测序及生物信息学分析。结果检出患者ZP1基因第5外显子c.874C>T(Gln292*)及第7外显子c.1127₁128delCT(ALa376GlyTer386)的复合杂合变异,母亲携带c.874C>T(p.Gln292*)杂合变异,父亲携带c.1127₁128delCT(p.Ala376GlyTer386)的杂合变异。结论患者者ZP1基因复合杂合变异是导致其卵母细胞透明带缺失的可能遗传学病因。     

粘多糖贮积症Ⅰ型IDUA基因的一个新突变

目的研究粘多糖贮积症Ⅰ型（mucopolysaccharidosis type Ⅰ，MPS Ⅰ）患者发病的分子遗传学机理。方法采用聚合酶链产物直接测序的方法对患者的α-L-艾杜糖醛酸酶（alpha-L-iduronidase，IDUA）基因（仍删）外显子进行突变检测，并对发现的突变进行限制性酶切和等位基因特异性寡核苷酸杂交分析验证；同时，采集50名健康体检者血样，针对新发现的突变位点进行测序分析，以排除多态性位点的可能性。结果患者／DUA基因第2外显子和第6外显子分别出现杂合突变Q60X（178C〉T）和D203N（607G〉A），前者为已报道的无义突变，后者为新发现的错义突变。限制性酶切分析证实患者母亲是Q60X突变携带者，等位基因特异性寡核苷酸杂交分析证实患者父亲是D203N突变携带者。另外，在对50名正常人的测序分析中，未检测到D203N突变。结论筛查所得的两个点突变可能是患者的致病原因。     

中国人黏多糖贮积症ⅣA型家系GALNS基因新突变的鉴定

目的 研究黏多糖贮积症ⅣA型(mucopolysaccharidosis type ⅣA,MPS ⅣA)患者发病的分子遗传学机制,揭示其基因型与表现型的相互关系,为产前基因诊断等创造必要的前提条件.方法 采用尿糖胺聚糖(glycosaminoglycans,GAGs)定性检测法对疑似MPS ⅣA型的先证者进行初诊,然后采用PCR及扩增产物直接测序法对先证者及其家庭成员进行突变检测.在检出GALNS基因c.1567T＞G新突变后,先后建立XspⅠ酶切鉴定法和扩增阻碍突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)快速特异鉴定法,对随机采集的110名正常对照与先证者及其家庭成员的GALNS基因第14外显子进行序列分析,同时采用生物信息学方法对蛋白质二级、三级结构进行预测,以及直接测定患儿GALNS酶活性的方法,对该新突变进行致病性鉴定.结果 先证者尿检呈弱阳性GAGs(±),其GALNS基因第14外显子内存在杂合的c.1567T＞G终止密码突变,第4外显子存在杂合的c.374C＞T错义突变,为两种突变的复合杂合子.其妹突变类型与先证者完全相同,其母仅在第14外显子存在杂合的终止密码突变,为该病的携带者,其父仅在第4外显子存在杂合的错义突变,也为杂合子;第14外显子的PCR产物经XspⅠ酶切后,正常对照组切出28 bp、120 bp、399 bp 3条带,而患者和携带者的母亲均切出28 bp、120 bp、148 bp和399 bp 4条带;用ARMS特异引物扩增后,正常对照组均扩增阴性,而患者及携带者均扩增阳性;蛋白质二级、三级结构预测结果显示:c.1567T＞G变异导致终止密码(TAG)突变为谷氨酸(GAG),使多肽链延长了92个氨基酸残基,导致蛋白质二、三级结构发生明显改变,而正常对照无此变化.酶活性测定的结果显示:患者的GALNS酶活性仅为8.3 nmol/17 h/mg pr,明显低于正常值(正常参考值为41.9～92.1 nmol/17h/mg pr).结论 c.1567T＞G变异是一种新的致病性突变,是引起该家系患儿发病的根本原因.

Abstract：

Objective To study the molecular genetic mechanism of mucopolysaccharidosis type ⅣA(MPS ⅣA), and reveal the relationship between the genotype and phenotype, and provide a basis for prenatal gene diagnosis in the future. Methods A preliminary diagnosis was made by qualitative detection of urinary glycosaminoglycans of the suspected MPS ⅣA proband. Then, mutation detection was performed on the proband and her family members with PCR and direct sequencing of the PCR products. After a novel c.1567T＞G mutation was detected,XspⅠrestriction enzyme digestion and amplification refractory mutation system(ARMS) fast specific identification were established to analyze the sequences of exon 14 in GALNS gene, including 110 randomly selected healthy controls, the proband and other pedigree members. At the same time, bioinformatic approaches for protein secondary, tertiary structure prediction were applied to identify the novel pathologic mutation. Results The proband's urine GAGs test was a weak positive(±),and a c.1567T＞G heterozygous termination codon mutation in exon 14 and a c.374C＞T heterozygous missense mutation in exon 4 were found. The proband was compound heterozygous of the two mutations, so was her younger sister. Her mother was a carrier with only a c.1567T＞G heterozygous mutation in exon 14. Her father had a heterozygous mutation of c.374C>T in exon 4. After XspⅠrestriction enzyme digestion, healthy controls had three bands including 28 bp, 120 bp and 399 bp, while the proband and her mother had four bands consisting of 28 bp, 120 bp,148 bp and 399 bp. For amplification by ARMS specific primers, it was negative for the controls,while it was positive for the proband and the carrier. The results of protein secondary and tertiary structure prediction showed that the c.1567T＞G mutation located in the stop codon, resulted in stop codon (TAG) changing to glutamic acid (GAG), with the peptide chain extending 92 amino acid residues, and secondary and tertiary protein structure change, which were not found in the controls. The result of enzyme assay showed that the activity of GALNS enzyme in the affected child was 8.3 nmol/17h/mg pr, which was obviously lower than the normal value (the normal range is 41.9-92.1 nmol/17h/mg pr). Conclusion These results illustrate that the c.1567 T＞G is a novel pathologic mutation, which is the main cause of the disease in this family.     

一个复合杂合变异致遗传性凝血因子Ⅺ缺陷症家系分析

目的探讨一个遗传性凝血因子XI(coagulation factor Ⅺ, FⅪ)缺陷症家系成员的分子致病机制。方法提取外周血基因组DNA, 并采用Sanger测序法检测先证者的15个外显子、侧翼序列及家系成员的相应变异外显子区域, 并用反向测序予以验证;ClustalX-2.1-win软件分析变异氨基酸位点的保守性;用Mutation Taster、PolyPhen2、PROVEAN三个在线生物信息学软件分析变异的致病性;用Swiss-pdbViewer软件分析变异氨基酸对蛋白质结构的影响。结果基因分析显示先证者第10外显子存在c.1107C>A(p.Tyr369stop)杂合无义变异以及第13外显子存在c.1562A>G(p.Tyr521Cys)杂合错义变异;其父亲携带c.1107C>A杂合无义变异, 其母亲和女儿均携带c.1562A>G杂合错义变异, 丈夫为野生型。保守性分析表明Tyr521在进化过程中为高度保守位点。变异碱基致病性预测发现c.1107C>A和c.1562A>G均为致病性变异。蛋白质模型分析显示在野生型FⅪ蛋白结构中, Tyr5...     

一例以痛风为主要表现的糖原累积症Ⅰa型患者的遗传学分析

目的探讨1例以痛风为主要临床表现的糖原累积症Ⅰa型患者的遗传学病因。方法收集患者的临床资料, 对患者及其父母进行二代测序, 对疑似致病变异用Sanger测序进行验证。结果患者为30岁女性, 主要表现为高尿酸血症、慢性痛风性关节炎、空腹低血糖、高甘油三酯血症、高乳酸血症、肝肿大、泌尿系结石, 并逐渐出现肝脏结节、肾功能不全。测序发现其携带G6PC基因c.648G>T和c.260delG复合杂合变异, 分别遗传自其父亲(表型正常)和母亲(患高尿酸血症), 其中c.260delG移码变异既往未见报道。生物信息学分析预测二者均为致病性。结论患者被诊断为G6PC基因缺陷导致的糖原累积症Ⅰa。患高尿酸血症和(或)痛风的青年女性, 在合并其他糖脂代谢异常时, 应注意排除糖原累积症Ⅰa型。     

F11基因复合杂合变异导致遗传性凝血因子Ⅺ缺陷症一个家系的分析

目的探讨1个F11基因新变异导致复合杂合性遗传性凝血因子Ⅺ(FⅪ)缺陷症家系的分子致病机制。方法选取2020年11月30日因尿路结石就诊于温州医科大学附属第一医院的1例遗传性凝血因子Ⅺ缺陷症男性先证者及其家系成员(3代7人)作为研究对象, 收集先证者的临床资料, 检测先证者及其家系成员的相关凝血指标。提取外周血基因组DNA进行PCR扩增, 用DNA直接测序法分析先证者F11基因的全部外显子、侧翼序列、5′和3′端非翻译区序列及家系成员相应的变异位点区域。用生物信息学软件分析氨基酸变异位点的保守性, 分析变异对蛋白质功能的影响。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关变异评级指南对变异位点进行评级。结果先证者为36岁男性, 其活化部分凝血活酶时间(APTT)为89.2 s, 明显延长, FⅪ活性(FⅪ:C)和FⅪ抗原(FⅪ:Ag)分别为2.0%和3.5%, 均极度降低。基因测序发现先证者和其姐姐的F11基因第7外显子存在父源c.689G>T(p.Cys230Phe)杂合错义变异, 第13外显子存在母源c.1556G>A(p.Trp519*)杂合无义变异。保守性分析...     

一个IDS基因第2外显子单独缺失导致黏多糖贮积症Ⅱ型家系的遗传学分析及产前诊断CSCD

目的探讨一个黏多糖贮积症Ⅱ型(Mucopolysaccharidosis typeⅡ,MPSⅡ)患者的遗传学病因并对该家系胎儿进行产前诊断。方法通过一代测序、琼脂糖凝胶电泳、real-time PCR和多重连接探针扩增(multiple ligation-dependent probe amplification,MLPA)等方法对患者IDS基因进行检测并在其母亲身上验证;对该家系胎儿通过羊水穿刺进行产前诊断。结果琼脂糖凝胶电泳、Real-time PCR和MLPA皆显示患者IDS基因第2外显子缺失,其母亲IDS基因正常。产前诊断结果显示胎儿为正常男性。结论患者为IDS基因新发第2外显子缺失导致的MPSⅡ患者,其母亲非携带者;本研究结果拓宽了IDS基因致病变异谱;多方法联合应用检测IDS基因变异可对MPSⅡ进行准确的遗传学诊断和产前诊断。     

广东汉族群体粘多糖贮积症Ⅰ型KpnⅠ位点的RFLP

本文对８５ 例无亲缘关系的广东汉人的１７０ 例染色体进行ＩＤＵＡ 基因Ｋｐｎ Ⅰ位点的ＲＦＬＰ研究,结果显示：等位基因Ａ１ 频率为０ ．１８ ,等位基因Ａ２ 频率为０．８２,杂合率为３２％ 。经ｘ２ 检验,证实这些结果与国外报道的无显著性差异。对３个家系１０ 位成员等位基因传递规律的研究结果表明：Ａ１ 、Ａ２ 在世代中的传递完全符合孟德尔遗传规律。     

一例先天性白内障患儿的 GJA8基因新复合杂合变异分析

目的明确1例先天性白内障患儿的遗传学病因, 为该家系的临床诊断及遗传咨询提供依据。方法应用高通量测序技术对先证者进行遗传性眼病相关基因检测, 筛选相关变异, 采用Sanger测序法对先证者及家庭成员进行变异位点的验证。结果基因检测结果显示先证者发生源自父母的GJA8基因c.855del和c.872dup的复合杂合变异, 这两个变异均未见报道。根据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)遗传变异分类标准与指南, 对这两个变异进行分析, GJA8基因c.855del判读为可能致病性(likely pathogenic)变异(PVS1_S+PM2+PP4), c.877dup为致病性(pathogenic)变异(PVS1_S+PM2+PM3+PP4)。结论 GJA8基因c.855del和c.872dup的复合杂合变异可能为这例先天性白内障患儿的致病原因。     

肠道病毒基因重组研究进展

肠道病毒(enterovirus, EV)可引起多种感染性疾病, 临床表现复杂多样。作为RNA病毒, EV的RNA依赖的RNA聚合酶缺乏校对功能, 导致其基因发生高频率的突变和重组, 从而使EV获得进化优势, 进而发生对宿主的免疫逃逸、对抗病毒药物的抗性, 也可使病毒的传播力和致病性增强或组织嗜性发生改变。本文综述了EV的重组机制, 并对部分重要型别和新型别EV的重组情况以及重组对病毒流行、致病性的影响进行了概述。     

基因生殖腺嵌合变异的分析

目的 对1例亲代表型正常但反复妊娠骨骼发育异常胎儿(可疑成骨不全)的家系进行遗传学分析,探讨胎儿的发病原因。方法 对胎儿标本及亲代DNA进行全外显子组测序(whole exome sequencing, WES),针对WES检测到的阳性位点进行Sanger测序验证。采集提取丈夫精液与单精子DNA,对致病位点进行PCR扩增并Sanger测序。结果 WES检测到胎儿COL1A2基因c.1378G>A(p.G460S)杂合变异,为致病变异,夫妻双方外周血DNA均未检测到该变异。精液DNA检测到该位点野生型与变异型序列,在15个精子中有4个检测到该位点变异。结论 为1例骨骼发育异常的胎儿明确了成骨不全的遗传学诊断。亲代的生殖腺嵌合是该家系反复妊娠骨骼发育异常胎儿的原因。在临床遗传咨询过程中,对于表型和和基因型均正常但反复生育或妊娠相同异常表型后代的案例,需要考虑到生殖腺嵌合的可能原因。     

AGPAT2基因新变异导致先天性全身性脂肪代谢障碍Ⅰ型一例

目的探讨1例先天性全身性脂肪代谢障碍患儿的遗传学病因。方法采集患儿及其父母的外周血样, 提取基因组DNA, 用Sanger法对AGPAT2基因的全部外显子以及侧翼序列进行测序分析。结果患儿AGPAT2基因第6和第3外显子分别存在c.792₈05delGGAGAACGGGGCCA(p.Gln264Hisfs*208)和c.335C>T(p.P112L)复合杂合变异, 分别遗传自其母亲和父亲。其中c.792₈05delGGAGAACGGGGCCA(p.Gln264Hisfs*208)尚未见文献报道, 而c.335C>T(p.P112L)为已知致病变异。结论 AGPAT2基因c.792₈05delGGAGAACGGGGCCA(p.Gln264Hisfs*208)和c.335C>T(p.P112L)复合杂合变异可能是患儿的致病原因。     

人腺病毒重组研究进展

人腺病毒(HAdV)是急性呼吸道感染、腹泻、急性眼角结膜炎等多种疾病的常见病原体。许多研究表明HAdV基因组易发生基因重组, 进而形成新的基因型别, 迄今已报道的104个型别中53～104型为重组形成的新基因型, 在全球范围内引起多次疫情, 对疾病的防控提出新挑战。目前对其重组研究较少, 亟需深入研究以揭示重组机制及临床意义。     

一例 PC基因复合杂合变异所致丙酮酸羧化酶缺乏症A型患儿的分析

目的探讨1例丙酮酸羧化酶缺乏症(pyruvate carboxylase deficiency, PCD)A型患儿的临床特征与遗传学基础。方法回顾分析患儿的临床资料, 对患儿及其父母进行家系全外显子组测序, 并对候选变异的致病性以及变异蛋白的结构进行分析。结果患儿因"发热伴呕吐、意识障碍"入院, 表现为严重的失代偿性酸中毒、高乳酸血症、顽固性休克等, 头颅磁共振成像提示大脑信号异常, X光检查提示急性肺水肿。基因检测提示患儿携带PC基因复合杂合变异c.182T>C(p.I61T)和c.2581G>A(p.V861M), 分别遗传自父母。上述变异查询ClinVar及HGMD数据库均未见收录。蛋白质预测提示二者均可能影响结构和功能的稳定性。结论 PC基因c.182T>C(p.I61T)/c.2581G>A(p.V861M)复合杂合变异可能是患儿的遗传学病因, 结合其临床特征最终诊断为PCD-A型。上述发现进一步拓展了PC基因的变异谱-表型谱。