基于网络药理学的升陷汤治疗心力衰竭的作用机制研究＊

目的 基于网络药理学方法探讨升陷汤治疗心力衰竭（heart failure，HF）的潜在作用机制。方法 采用TCMSP、TCM-MESH、化学专业数据库、ETCM平台筛选出升陷汤的活性成分，利用TCMSP靶点预测模型预测活性成分的潜在靶点；利用Genecards、OMIM、Disgenet、DigSee数据库检索心力衰竭的相关靶点；利用Biogenet分别对药物与疾病靶点进行蛋白质相互作用网络进行构建，并提取交集网络以获得升陷汤治疗心力衰竭的关键靶点；利用Metascape对关键靶点进行GO和KEGG富集分析。结果 得到药效成分60个、药物靶点156个、心力衰竭靶点1387个，最终获得关键靶点197个、KEGG通路157条。升陷汤治疗心力衰竭主要成分为槲皮素、山奈酚、黄芪多糖、黄芪甲苷等，关键靶点为TP53、ESR1、FN1、UBC、TNF-α，关键的生物学进程和通路可能包括PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、TLR信号通路、HIF-1α信号通路、FoxO信号通路、细胞周期信号通路等。结论 本研究初步揭示了升陷汤多成分、多靶点、多途径治疗心力衰竭的机制，为升陷汤的临床开发利用提供了依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨防己黄芪汤治疗心力衰竭的作用机制

<正>本研究借助网络药理学的方法与思路,探讨防己黄芪汤治疗心力衰竭的作用机制,以期为临床应用及后续研究提供依据。1资料与方法1.1防己黄芪汤活性成分及作用靶点收集：通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）,以口服利用度（OB）≥30%、类药性（DL）≥0.18为筛选条件,分别收集防己、黄芪、白术、甘草、大枣、生姜活性成分及其对应的蛋白靶点。通过Uniport数据库对收集到的蛋白靶点进行检索,物种限定为“Homo sapiens”,将蛋白靶点转换为对应的基因名称。     

基于网络药理学研究升陷汤治疗心力衰竭的作用机制

目的基于网络药理学研究升陷汤治疗心力衰竭的作用机制。方法以化合物的口服药物生物利用度(OB)和类药性(DL)为标准,借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)TCM Database、OMIM和Genecards数据库、反向分子对接服务器(DRAR-CPI)筛选并预测升陷汤的活性成分及治疗心力衰竭的作用靶标。借助STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络,运用Cytoscape软件绘制疾病靶点PPI网络,进一步进行基因GO功能和KEGG通路富集分析,初步构建升陷汤活性成分-心力衰竭作用靶点网络。结果从升陷汤中共筛选出76个活性成分,197个与心力衰竭相关的作用靶点,包括蛋白激酶(AKT1)、白介素(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等。经GO和KEGG通路富集分析显示,升陷汤参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录调控、辅酶因子结合、细胞因子结合、酰胺结合、细胞因子活性、类固醇激素受体活性、氧化还原还原酶活性、G蛋白偶联胺受体活性以及炎症反应等多种生物途径,并且抑制肾素血管紧张素系统激活,具有抗氧化能力;参与调控PI3K-Akt(磷脂酰肌醇3羟激酶-蛋白激酶)信号通路、IL-17信号通路、低氧诱导因子(HIF-1)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。结论升陷汤活性成分能通过多个靶点、多条通路发挥治疗心力衰竭的作用,可能是通过参与调节AKT1、VEGFA基因,干预PI3K-Akt信号通路来实现的。     

基于网络药理学与分子对接法探讨吴茱萸汤治疗偏头痛的作用机制

目的：采用网络药理学方法筛选吴茱萸汤的活性成分,预测其治疗偏头痛的潜在作用靶标和信号通路,进一步探究其作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）筛选吴茱萸汤的活性成分和候选靶标,利用Gene Cards数据库和OMIM数据库去重、合并,预测吴茱萸汤的相关靶标,筛选吴茱萸汤的活性成分治疗疾病的潜在作用靶标;利用Cytoscape软件创建出“疾病-药物-成分-靶点”网络;凭借蛋白质相互作用数据库（STRING）创建潜在靶标蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并找到吴茱萸汤治疗偏头痛的关键基因蛋白;使用Metascape对吴茱萸汤治疗偏头痛的潜在作用靶标进行生物学功能和代谢通路分析;利用Auto Tools软件将核心成分和靶点蛋白进行分子对接,并用Pymol软件对结合能最低的分子进行可视化。结果：吴茱萸汤中共筛选出72种有效活性成分,根据靶点预测技术预测出相关靶点201个;偏头痛与吴茱萸汤有106个共同靶点基因;...     

基于网络药理学探讨灵仙活络汤治疗膝骨关节炎的作用机制

目的：使用网络药理学方法寻找及分析自拟方灵仙活络汤治疗膝骨关节炎（KOA）的主要化合物、靶点及有关通路。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取灵仙活络汤中君药及用量最大的两味臣药（威灵仙、乳香、没药）的主要成分及靶点,再用SwissTargetPrediction预测靶点,保留P>0.5的有关靶点,使用Uniprot网站规范两次获得的靶点名称。使用GeneCards、DrugBank、OMIM数据库获取KOA的主要疾病靶点,利用Venny2.1得到药物-疾病重合靶点,即关键靶点,然后使用Cytoscape 3.7.2构建“疾病-药物-化合物-有效靶点”网络。利用String对关键靶点进行蛋白质相互作用分析,使用Cytoscape 3.7.2构建PPI网络,使用Metascape进行KEGG通路富集分析及Go富集分析。结果：得到槲皮素、鞣花酸、β-谷甾醇、豆甾醇等32种化合物,涉及TNF、IL6、AKT1、IL1B、TP53等112个靶点。GO富集分析显示,灵仙活络汤治疗KOA可能与细胞因子受体结合、DNA结合转录因子结合、细胞因子活性、磷酸酶结合等分子功能相关...     

基于网络药理学探讨炙甘草汤治疗心律失常的作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨炙甘草汤治疗心律失常的作用机制。方法：运用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM数据库,筛选出炙甘草汤有效成分及其作用靶点。通过GeneCards、OMIM数据库筛选出心律失常的疾病靶点,并与中药靶点合并取交叉靶点,采用String数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并运用Cytoscape 3.7.2筛选关键基因,同时借助CytoNCA插件进行拓扑分析;运用Bioconductor数据库及RX64 4.0.0软件对交集基因进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用swissdock在线分子对接工具对蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络中的核心蛋白与核心化合物分子进行分子对接。结果：筛选出171个化合物及4 090个靶点,得到关于心律失常疾病靶点435个;PPI结果显示,Degree值排名前6的基因分别为：INS、KCNH2、SCN5A、CAV3、GJA1、TNNI3;拓扑分析显示Degree排名前5的基因分别为：EGFR、HSPA8、NTRK1、ESR1、HSP90AA1;分子对接结果显示：炙甘草汤的大多数活性成分和关键靶点的结合率较强,其结合能最低为SCN5A与Lysine、KCNH2与Gamma-Aminobutyric Acid;GO富集分析显示炙甘草汤治疗心律失常与心脏收缩、心脏肌肉收缩、心的过程、横纹肌收缩、心脏收缩调节等有关。KEGG富集分析显示心肌细胞的肾上腺素能信号、肥厚型心肌病、cGMP-PKG信号通路、扩张型心肌病相关。结论：炙甘草汤治疗心律失常具有多成分、多靶点、多途径的特点。     

基于网络药理学探讨麻杏二三汤治疗支气管哮喘作用机制

目的：联合网络药理学数据库研究麻杏二三汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法：运用传统中药系统药理学数据库和分析平台与有机小分子生物活性数据库获取麻黄、苦杏仁、陈皮、半夏、茯苓、紫苏子、莱菔子、白芥子、诃子、甘草的有效成分及对应靶点;从人类基因数据库和在线人类孟德尔遗传数据库获取支气管哮喘相关靶标,同时利用Venny 2.1在线网络获取交集基因;运用Cytoscape (Version3.7.2)和STRING数据库构建药物-成分-靶标-疾病网络图和蛋白质-蛋白质相互作用网络,进而运用cytoHubba插件鉴定出核心靶标。最后,运用Metascape数据库进行基因本体（GO）富集分析与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：研究筛选得到麻杏二三汤治疗支气管哮喘的主要治疗靶标包括血管内皮生长因子A (VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子（TNF）、禽肉瘤病毒17(JUN)、p53肿瘤蛋白（TP53）、信号转导及转录激活蛋白3 (STAT3)、促分裂素原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、前列腺内过氧化物合成酶2 (PTGS2)、促分裂素原活化蛋白激酶1 (MAPK...     

基于网络药理学分析大柴胡汤治疗高脂血症的作用机制

目的 基于网络药理学方法研究大柴胡汤对高脂血症(HLP)治疗的作用机制.方法 检索TCMSP数据库,获取大柴胡汤的主要活性成分和潜在作用靶点.通过Genecards数据库和NCBI数据库获得HLP相关靶点,并与大柴胡汤所对应靶标取交集,筛选出大柴胡汤治疗HLP的潜在靶标.使用String数据库对大柴胡汤治疗HLP作用潜...     

基于网络药理学方法的芍药甘草汤治疗神经性疼痛作用机制探讨

目的基于网络药理学方法探讨芍药甘草汤治疗神经性疼痛的作用机制。方法基于TCMSP、DrugBank、TTD数据库分别建立了芍药甘草汤的化学成分-靶点网络和疾病靶点网络,基于Cytoscape 3.7.0软件建立了芍药甘草汤的活性成分-作用靶点网络并进行网络拓补分析;利用DAVID数据库对核心作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果构建了包含46个节点、2070条边的活性成分-作用靶点网络;核心靶点GO功能注释得到24条富集结果,其中生物过程13条,分子功能4条,细胞组成7条;富集得到10条核心的KEGG通路,包含神经组织交互通路、钙信号通路、唾液分泌、胆碱能突触、脂肪细胞脂解调控、肌动蛋白细胞骨架调控、含血清素的神经突触、心肌细胞肾上腺素能信号、cGMP-PKG信号通路、cAMP信号通路等。结论芍药甘草汤可能是通过调节细胞钙离子传导、胆碱突触信号传递、肾上腺素信号传递等通路协同作用于神经性疼痛,分析结果可为芍药甘草汤在神经性疼痛的药理作用研究及临床应用提供一定的理论依据,有待进一步实验验证。     

基于网络药理学探讨菟丝子治疗骨质疏松症的作用机制

摘 要：目的：采用网络药理学的方法探讨菟丝子治疗骨质疏松症可能的作用机制。方法：通过检索TCMSP、TCMID、SymMap、BATMAN-TCM、ETCM以及查阅文献获取菟丝子的全部成分，并筛选菟丝子活性成分以及治疗骨质疏松症的靶标；采用Cytoscape3.6.0构建菟丝子的“活性成分-靶标”网络并结合数据库String和Cytoscape3.6.0绘制所得靶标间相互作用关系；最后利用DAVID数据库对靶标基因进行GO功能分析与KEGG富集分析。结果：检索TCMSP、TCMID、Symmap、BATMAN-TCM、ETCM以及查阅文献获取菟丝子全部成分，进一步筛选出的与骨质疏松症相关的活性成分有14个，包括槲皮素、芹菜素，金丝桃苷等；活性成分发挥作用的潜在靶标有83个，主要有白细胞介素6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、骨分化特异性转录分子2（RUNX2）、雌激素受体α（ESR1）等；KEGG富集分析得到与骨质疏松症紧密相关通路主要有PI3K/Akt、MAPK、TNF信号通路等。结论：中药菟丝子中槲皮素、芹菜素，金丝桃苷等活性成分可能通过PI3K/Akt、MAPK、TNF等信号通路实现对骨质疏松症的防治。     

基于网络药理学的附子-干姜药对治疗心力衰竭的作用机制分析

目的:探讨附子-干姜药对治疗心力衰竭的作用机制。方法:本研究首先构建心力衰竭相关的蛋白互作网络,然后选取附子-干姜药对含有的24个活性成分,预测其作用靶点,进而构建附子-干姜药对活性成分-预测靶点网络、构建与心力衰竭相关的附子-干姜药对活性成分-潜在靶点网络、进行基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)的生物通路富集分析,研究附子-干姜药对治疗心力衰竭的作用机制。结果:与心力衰竭相关的附子-干姜药对活性成分-潜在靶点网络包含23个靶点,关键靶点涉及碳酸酐酶2(CA2),11-β-羟基类固醇脱氢酶1(HSD11B1),基质溶素-1(MMP-3),肽基脯氨酰顺反异构酶FKBP1A(FKBP1A),磷酸二酯酶4D(PDE4D),热休克蛋白90α(HSP90AA1)等。KEGG通路7条,主要涉及肾素-血管紧张素系统(Renin-angiotensin system)等。结论:本研究结果初步验证和预测了附子-干姜药对治疗心力衰竭的作用机制,并为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。     

复心汤治疗心衰的疗效及临床分析

目的:探讨复心汤治疗心衰的临床疗效,为进一步的临床治疗提供参考依据。方法:2012年12月至2013年12月期间,本院诊治的120例心衰患者,随机将其分为对照组(强心、利尿等常规抗心衰治疗)和观察组(在对照组治疗基础上,加用复心汤),每组各60例,观察和比较两组心功能疗效、中医证候评分疗效、不良反应、治疗前后左室舒张末期内径(LVEDD)、左室射血分数(LVEF)、血流舒张早期与心房收缩期峰值速率比(E/A值)。结果:与对照组相比,观察组心功能总有效率(96.7%vs 86.7%)、中医证候评分总有效率(91.7%vs 73.3%)均明显升高,不良反应发生率显著降低(1.7%vs13.3%),P<0.05;与对照组相比,治疗后观察组LVEF(47.0±1.0 vs 44.4±1.2),E/A值(1.3±0.4 vs 1.0±0.3)均明显提高(P<0.05)。结论:复心汤治疗心衰的疗效显著,明显改善患者的心功能和预后质量,并且不良反应少,具有较高治疗安全性,值得临床推广。     

生脉饮“异病同治”糖尿病和心力衰竭的网络药理学作用机制研究

目的采用网络药理学方法探讨生脉饮"异病同治"糖尿病和心力衰竭的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM数据库收集生脉饮组方药物的所有化学成分,通过UniProt数据库获取药物作用靶点,通过DisGeNET和GeneCards数据库筛选与糖尿病和心力衰竭相关的靶点,将药物有效成分作用靶点与疾病靶点比对筛选后,分别构建生脉饮治疗糖尿病和心力衰竭的化合物-靶点相互作用网络图;利用String平台绘制蛋白相互作用(PPI)网络,找出关键基因靶点;分别使用DAVID数据库和Cytoscape3.6.1对核心靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集,并分析PPI网络数据。结果共筛选出生脉饮50个活性成分和3754个潜在作用靶点,糖尿病、心力衰竭相关靶点分别为218、317个,生脉饮治疗糖尿病、心力衰竭作用核心靶点分别为109、196个;经KEGG通路富集分析,分别筛选出生脉饮对糖尿病和心力衰竭具有作用的通路,根据度值对PPI网络数据分析选取生脉饮治疗糖尿病和心力衰竭的主要药效靶点各10个。结论生脉饮治疗糖尿病和心力衰竭具有多成分、多靶点、整体调节的作用特点,可为其活性成分研究和实验研究提供依据。     

基于网络药理学和分子对接的泽泻汤治疗高脂血症作用机制研究

目的 基于网络药理学及分子对接技术,构建泽泻汤治疗高脂血症的成分-通路-靶点网络,探讨其潜在作用机制。方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）并结合文献,筛选泽泻汤的活性成分;借助TCMSP和PharmMapper数据库筛选泽泻汤活性成分的作用靶点,并建立活性成分靶点库;利用OMIM、TTD、DrugBank、PharmGKB和GeneCards数据库获取高脂血症的相关靶点,并建立疾病靶点库;运用STRING数据库和Cytoscape软件构建成分靶点与疾病靶点的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选得到核心靶点;采用DAVID数据库和OmicsBean平台分别对核心靶点进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析和基因本体（GO）功能分析;最后通过Discovery Studio软件验证泽泻汤中活性成分与髓过氧化物酶（MPO）、基质金属蛋白酶9（MMP9）、凝血因子Ⅱ（F2）、过氧化物酶增殖物激活受体a（PPARA）和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（mTOR）5个靶点的结合活性。结果 共挖掘到泽泻汤中16个活性成分及369个潜在成分靶点,与284个高脂血症相关靶点相互映射,并通过PPI网络分析筛选得到16个核心靶点,包括MPO、MMP9、F2、PPARA和mTOR等,推测这些靶点可能为泽泻汤治疗高脂血症的核心靶点。同时,分子对接结果显示,泽泻汤中所含的泽泻醇类、大黄素和白术三醇与高脂血症的核心靶点有较强的结合能力。KEGG富集分析发现与高脂血症相关的主要调控通路涉及缺氧诱导因子-1（HIF-1）、胰岛素抵抗、胰岛素信号等。结论 泽泻汤的活性成分可能通过作用于MPO、MMP9、F2、PPARA和mTOR等多个高脂血症相关靶点,调节HIF-1、胰岛素抵抗、胰岛素信号通路,从而发挥治疗高脂血症的作用,为后续研究泽泻汤治疗高脂血症的分子机制提供了思路。     

基于网络药理学及质谱技术的葶苈大枣泻肺汤抗心力衰竭的有效成分发现及作用机制分析

目的:基于网络药理学、高分辨质谱及分子对接技术探讨葶苈大枣泻肺汤治疗心力衰竭(简称心衰)的有效成分及作用机制.方法:通过文献查阅并结合BATMAN-TCM数据库对葶苈大枣泻肺汤中两味中药成分及药物靶标进行检索;以“heart failure”作为关键词,利用GeneCards数据库,对心衰疾病的靶标进行搜集;基于药物与...     

基于文献计量学和系统药理学方法探究半夏泻心汤对慢性胃炎的作用＊

目的 利用文献计量学方法筛选出治疗慢性胃炎的主要方药，并通过系统药理学方法分析其作用机理。方法 从中国知网、万方数据库查找自建库以来所有与慢性胃炎相关的文献，筛选出中医药治疗慢性胃炎的主要药物或复方。利用TCMSP搜索复方或药物的有效药物组成及作用靶点，从TTD、CTD、OMIM等数据库查找与慢性胃炎发病机制相关的靶点，取复方的作用靶点和慢性胃炎发病机制相关靶点的重叠靶点，利用生物信息学方法分析重叠靶点并利用分子对接技术验证化合物与靶点的结合性。结果 经过文献计量学分析，得到治疗慢性胃炎的主要方药是半夏泻心汤，其有效化合物有125个，这些化合物共有81个作用靶点，其中与性胃炎发病机制相关靶点重叠的有29个靶点，这些靶点参与50种生物学过程并富集50条信号通路，分子对接结果表示药物对特定靶标的亲和力及结合特性良好。结论 本研究通过系统药理学方法初步探究了半夏泻心汤对慢性胃炎的作用机制，为下一步的基础研究提供参考。     

基于网络药理学和实验验证探讨槲皮素治疗心力衰竭的分子机制

目的:通过网络药理学和分子对接方法预测槲皮素治疗心力衰竭的治疗靶点及相关信号通路,通过离体细胞模型进一步明确其作用机制.方法:通过SwissTargetPrediction,TargetNet数据库获取槲皮素药理作用相关靶点;通过在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM),GeneCards,疗效药物靶点数据库(TTD)数据...     

基于网络药理学的有关苓桂术甘汤干预治疗心力衰竭的作用机制〖JZ)〗〖HS)〗

目的:根据网络药理学方法寻找苓桂术甘汤治疗心血管疾病的潜在靶点。方法:从在线的中医药生物信息学分析网站(BATMAN-TCM)筛查和预见苓桂术甘汤干预心力衰竭的可能的有效成分及其作用于心力衰竭的靶点。使用Cytoscape软件建立苓桂术甘汤以及其中所含的单味药针对心力衰竭的靶点-成分网络图。采取韦恩图(Venny 2. 1)进一步研究苓桂术甘汤中茯苓及甘草治疗心力衰竭的机制。结果:我们从结果里发现苓桂术甘汤在治疗心力衰竭方面有79个活性成分,有18个靶点与心力衰竭是相关的,且检索到的靶点和有效成分有紧密的关系,找到的18个靶点主要是:ACE;ADRA2A; ADRA2B等。甘草在苓桂术甘汤中的靶点数最多,占全方治疗心力衰竭总靶点数的94. 4%。结论:苓桂术甘汤改善心力衰竭的机制可能与降低AngⅡ、抑制RAS的活性、调节交感神经系统等具有相关性,其中甘草在治疗心力衰竭方面是苓桂术甘汤中最突出药物。