基于网络药理学探究大黄煎剂治疗轻微型肝性脑病的作用机制

目的:基于网络药理学方法,预测大黄煎剂治疗轻微型肝性脑病(MHE)的作用靶点和作用机制.方法:使用TCMSP平台采集大黄煎剂的有效成分及作用靶点基因;再从Gene Cards、OMIM数据库搜集MHE的靶点,将二者取交集获得药物-疾病交集靶点;使用Cytoscape 3.7.2软件,将有效成分、药物-疾病交集靶点导入建立关系网络,并绘制网络图;将药物-疾病交集靶点导入String数据库,构建药物对疾病靶点蛋白相互作用的PPI网络;最后使用R语言程序对药物-疾病交集靶点基因进行GO和KEGG富集分析.结果:大黄煎剂筛选出11种活性成分、116个治疗MHE的潜在靶点;PPI网络结果中,筛选出大黄煎剂调控的核心靶点包括AKT1、JUN、MAPK1等;GO功能富集得到142个功能条;KEGG通路富集分析得到157条通路.结论:该研究初步预测大黄煎剂可能通过靶向作用关键蛋白和重要通路达到治疗MHE的目的,充分体现了中药多成分、多靶点、多通路的特点,并有望对大黄煎剂治疗MHE提供新的证据和研究思路.     

基于网络药理学研究赤芍治疗动脉粥样硬化的作用机制

目的:运用网络药理学的研究方法筛选赤芍治疗动脉粥样硬化的相关信号通路.方法:以赤芍为关键词对中药系统药理学数据库与分析平台进行检索,根据口服生物利用度及类药性筛选出赤芍的主要有效成分及作用靶点,在Gene-Cards和OMIM数据库找到与动脉粥样硬化相关的靶基因.将赤芍作用靶点与疾病靶基因取交集,构建赤芍-有效成分-动...     

基于网络药理学探究大黄治疗脑水肿作用机制

目的 基于网络药理学方法探究大黄对脑水肿的治疗作用及其机制。方法 运用中药系统药理学分析平台数据库（TCMSP）获取大黄活性成分及作用靶点,在Uniprot数据库寻找大黄靶基因,并与GeneCards、OMIM及TTD等数据库筛选得到的脑水肿疾病靶点,通过建立药物靶基因与疾病靶点venn图寻找共有基因靶点;运用Bisogent对共有基因靶点进行蛋白相互作用（PPI）网络分析,运用拓扑方法分析关键靶点及药物-成分-靶点网络中的关键成分。通过Metascape对共有基因靶点进行GO分析及KEGG分析,构建靶点-疾病-通路关联图,揭示高频药物治疗脑水肿的潜在作用机制。结果 通过TCMSP获得大黄30种活性成分,113个靶点;脑水肿疾病靶点1 691个,二者共同靶点共45个,其中较为关键的活性成分包括2-羟基丙酸、芦荟大黄素、β-谷甾醇、L-羟基丁酸、泽兰黄醇等;关键靶点包括HSP90AA1、APP、ESR1、CUL3、HSP90AB1、XPO1、EGFR等。涉及的传导途径主要包括癌症蛋白多糖通路、雌激素信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路等。结论 研究表明大黄治疗脑水肿的作用机制可能与抑...     

基于网络药理学探讨赤芍抗血吸虫病及肝纤维化的作用机制

目的：通过网络药理学方法探讨赤芍有效成分治疗血吸虫病及肝纤维化的潜在作用机制。方法：通过TCMSP数据库检索并收集赤芍有效成分及其对应的作用靶点,借助UniProt数据库将靶点蛋白的genename转换为genesymbol;通过GeneCards、OMIM、TTD疾病数据库搜集血吸虫病及肝纤维化相关靶点;将赤芍成分靶点和疾病靶点取交集,获得赤芍治疗血吸虫病及肝纤维化的潜在靶点,利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”和“成分-靶点-通路”网络;通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,采用Cytoscape 3.8.2软件进行分析和可视化呈现;通过Metascape数据库进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：筛选得到赤芍活性成分29种,成分靶点与血吸虫病及肝纤维化疾病的交集靶点19个,其中肿瘤抑制蛋白(TP53)、前列腺素内过氧化物合酶(PTGS2)、肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素8...     

基于网络药理学分析牡丹皮-赤芍治疗银屑病的作用机制

[目的]通过网络药理学方法分析牡丹皮-赤芍治疗银屑病的有效成分、作用靶点及作用通路,探讨其作用机制.[方法]通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP),检索牡丹皮和赤芍的有效成分以及相应的作用靶点,通过The Human Gene Database(GeneCards)平台检索银屑病的相关靶点,利用ClusterP...     

基于网络药理学及分子对接研究六味醒神颗粒治疗肝性脑病的分子作用机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨六味醒神颗粒治疗肝性脑病的具体分子机制。方法:从中国知网、TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM 4个数据库对六味醒神颗粒主要成分及潜在作用靶点进行收集,并与肝性脑病相关基因进行映射,得出其治疗该病最终作用靶标,构建PPI网络并进行可视化。利用DAVID数据库进行KEGG Pathway富集并构建活性成分-靶标-作用通路图。将PPI中排名前5的靶标与君药进行分子对接,以验证其治疗作用。结果:研究得到243个有效成分,241个靶基因及34个信号通路。分子对接表明5个靶标蛋白与君药结合性较好。结论:从分子对接技术揭示了六味醒神颗粒有直接治疗肝性脑病的作用,从网络药理学角度初步揭示了其治疗肝性脑病的分子机制,为后续的研究提供了基础。     

基于网络药理学探讨丹参治疗肝纤维化的作用机制

目的 采用网络药理学技术筛选丹参治疗肝纤维化的作用靶点,并探讨其治疗肝纤维化的作用机制.方法利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选丹参的主要活性成分及相应靶点,并检索OMIM、Genecard数据库以筛选肝纤维化的作用靶点.基于筛选结果,建立药物成分-靶点基因-疾病关系网络,进行基因GO功能和KEGG通路...     

基于网络药理学的大黄利胆片的作用机制研究

大黄利胆片由大黄、手掌参、余甘子组成,功效为清热利湿、解毒退黄,治疗酒精性脂肪肝、胆汁淤积、胆囊炎等病症疗效显著。3味中药分别是中药、蒙药、藏药的常用药,各自药性特点依附于不同的民族药体系,体现了不同的民族药特色,形成了一个独特的民族药的研究载体。该研究通过分子模拟技术预测了3味药的作用靶标,根据靶标蛋白相互信息构建了大黄利胆片的蛋白相互作用网络。采用分子复合物检测算法(MCODE)进行网络功能模块分析,并对模块功能进行注释。研究发现大黄、余甘子生物网络模块具有功能相似性,主要通过对炎症相关通路的协同调节作用发挥保肝护肝作用,而手掌参则通过调节营养物质代谢和机体生理状态,起到补益气血、调和全方的作用。该研究解释了大黄利胆片配伍发挥保肝护肝作用的作用机制,有助于大黄利胆片的进一步开发研究,为民族药的进一步开发利用提供了借鉴。     

基于网络药理学探讨大黄治疗儿童功能性便秘的作用机制研究

目的:采用网络药理学探讨大黄治疗儿童功能性便秘(FC)的作用机制.方法:通过TCMSP数据库获取大黄的主要活性成分和作用靶点,利用Genecards数据库检索出FC的潜在靶点,再筛选以上两者的共同靶点,获得靶蛋白之间的相互作用关系,采用Cytoscape3.7.2软件绘制大黄-活性成分-靶点-FC相互作用网络图,最...     

基于网络药理学方法赤芍-牡丹皮药对治疗中风作用机制探讨

目的:采用网络药理学的分析方法研究赤芍-牡丹皮经典药对治疗中风的分子作用机制。方法:基于中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、药物与疾病数据库(Drug Bank)、赤芍-牡丹皮的疾病与化学成分靶点网络则分别由治疗靶标数据库(TTD)建立,而它的药效成分与靶点网络主要运用Cytoscape 3.7.0软件构建而成,并同时进行了网络拓补分析; 至于核心靶点对基因本体(GO)的功能富集则主要运用DAVID数据库完成,同时也对百科全书KEGG(基因组)通路的功能富集进行了研究。结果:网络拓补分析结果表明,最核心的药效成分可能为槲皮素、山奈酚、鞣花酸、黄芩苷,最核心的GO功能有活性氧代谢过程、脂多糖、核受体活性、细胞因子受体结合、细胞膜微区、囊腔作用等; 最核心的作用通路有VERF通路、Toll样受体通路、肿瘤坏死因子(TNF)通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶b(P13K-Akt)通路等。结论:本文基于网络药理学方法对赤芍-牡丹皮药对干预中风的作用机制进行了分析发现,赤芍-牡丹皮药对可能是通过VERF通路、Toll样受体通路、TNF通路、IL-17信号通路、P13K-Akt等通路协同作用发挥治疗缓解中风功效,上述预测结果可为赤芍-牡丹皮药对在中风治疗的药理作用研究及临床应用提供一定的理论依据。     

基于网络药理学探讨大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病的作用机制。方法:借助中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取大黄黄连泻心汤主要化学成分、对应靶点及靶标基因,借助人类基因数据库(Gene Cards)获取2型糖尿病相关靶标基因,将药物靶标基因与疾病靶标基因映射得到大黄黄连泻心汤作用于2型糖尿病的预测靶点。利用Cytoscape3. 7. 1软件构建中药化合物-靶点网络及蛋白与蛋白相互作用网络(PPI),利用DAVID 6. 8在线工具进行潜在基因的基因本体(GO)分析和京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:大黄黄连泻心汤作用于2型糖尿病的有效成分有17个,相关靶点94个,关键有效成分17个,关键靶点16个。GO分析结果显示,大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病潜在基因的生物功能主要涉及氧化应激、细胞凋亡、蛋白结合、炎症反应等; KEGG通路富集结果显示,大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病潜在基因的通路主要涉及低氧诱导因子(HIF),肿瘤坏死因子(TNF),磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),核转录因子-κB(NF-кB),血管内皮生长因子(VEGF)等信号通路。结论:大黄黄连泻心汤治疗2型糖尿病是多成分、多靶点、多通路的复杂过程,主要通过参与氧化应激、细胞凋亡、蛋白结合、炎症反应等发挥治疗2型糖尿病的作用。     

基于网络药理学探讨赤芍-白芍药对治疗系统性红斑狼疮的作用机制

目的:探讨二芍治疗系统性红斑狼疮(SLE)的潜在生物学机制.方法:利用TCMSP数据库,结合文献研究的方法,收集白芍、赤芍2味药物所包含的活性成分,以口服吸收利用度(OB)≥30％,药物相似性(DL)≥0.18作为筛选条件,得到赤芍、白芍的有效活性成分群.通过化学成分靶点预测的方式获取2味药物的重要成分和潜在生物学靶点...     

基于网络药理学及生物信息学探讨大黄促进肝再生的机制研究

目的基于网络药理学及生物信息学探讨大黄促进肝再生(liver regeneration, LR)的分子作用机制。方法利用TCMSP、ECTM和SymMap数据库筛选出大黄的作用靶点,利用GEO数据库筛选出LR的相关作用靶点。利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape构建蛋白相互作用网络,利用David数据库进行GO分析,利用KEGG进行信号通路富集分析,利用iGEMDOCK软件进行分子对接来验证大黄-肝再生作用靶点的结合性。结果共筛选出大黄的潜在靶点103个,LR的相关潜在靶点1030个,大黄-LR的交集靶基因37个,其涉及26个生物学过程(Biological Process,BP)、8种分子功能(Molecular Function,MF)、14个细胞组分(Cellular Component,CC),筛选出21条信号通路。结论大黄促进LR具有多靶点-多通路-多作用的特性,其作用机制可能是通过促进肝细胞增殖分化、降低肝细胞凋亡、抑制炎症反应等过程发挥作用。     

基于网络药理学的丹参-赤芍药对治疗急性心肌梗死的作用机制分析

目的利用网络药理学方法探讨丹参-赤芍药对治疗急性心肌梗死的作用机制。方法利用TCMSP数据库筛选出丹参和赤芍所含有效化学成分,用Drug Bank数据库和Pharmmapper服务器对有效化学成分进行作用靶点预测;通过Gene Gards、CTD和OMIM数据库筛选出与急性心肌梗死相关靶点,将以上数据导入STRING数据库进行蛋白相互作网络分析,并利用Cytoscape软件构建蛋白互作网络,最后利用David在线分析工具对靶标基因进行GO分析和KEGG分析。结果共得出94个活性成分,对应145个靶点,与急性心肌梗死相关靶点19个,通过GO分析得出94个生物学过程,16个细胞组成,24个分子功能,通过KEGG分析得出富集通路18条。结论本研究从网络药理学层面初步揭示了丹参-赤芍药对治疗急性心肌梗死的作用机制,预测丹参-赤芍药对可能通过FOXO、PI3K-AKT、c AMP等通路对心肌损伤细胞起到相应保护作用,为下一步深入验证研究提供了良好的理论基础。     

生大黄对大鼠肝性脑病治疗作用的实验研究

目的观察生大黄对大鼠肝性脑病（HE）的影响。方法采用药物诱导加结扎、切除2/3肝脏的方法建立大鼠HE模型,用生大黄水煎液5g/100g灌胃为治疗组,乳果糖溶液0.5g/100g灌胃为对照组。观察大鼠脑电图、取血检测血清天门冬酸氨基转移酶（AST）、丙氨酸氨基转移酶（ALT）、血氨（BA）、内毒素（LPS）水平,并取大鼠肝组织,常规HE染色观察肝组织病理学变化。结果治疗后生大黄组大鼠脑电图有改善,血清AST、ALT、BA、LPS水平显著降低,肝组织损伤减轻,疗效优于乳果糖组。结论生大黄对大鼠HE有治疗作用,作用机制可能与其泻下作用,缩短肠道对BA、LPS等有害物质的吸收,促进其排泄有关。     

应用大黄防治肝性脑病

肝性脑病(Hepatic encephalopathy,HE),是由严重肝功能失调或障碍引起的以代谢紊乱为基础的中枢神经系统功能失调的综合征,主要表现为意识障碍、行为异常和昏迷。根据其临床表现,可归属于祖国医学“昏蒙”、“郁冒”、“谵妄”、“癫狂”等范畴。运用中医理论治疗本病的方法很多,其中,通下法较为常用,而大黄是通下的常用品。笔者认为该药来源丰富,疗效肯定。现就此问题讨论如下。     

赤芍承气汤治疗肝性脑病30例疗效观察

肝性脑病(Hepatic Encephalopathy,HE)是因急慢性肝功能衰竭或门体静脉分流所致的中枢神经系统功能紊乱,以意识障碍、行为异常、精神紊乱、运动障碍为主要表现.其发病机制尚未完全明了,治疗也无特效疗法.我们临床观察用赤芍承气汤对促HE苏醒有较好疗效,现报告如下.     

基于网络药理学探讨天麻治疗脑血管性眩晕作用机制

目的:基于网络药理学探讨天麻防治脑血管性眩晕的作用机制.方法:应用中药与化学成分数据库获取天麻的主要活性成分,借助SwissTargetPrediction数据库预测靶点;通过GeneCards数据库获得脑血管性眩晕的疾病靶点;通过R语言及Venny软件筛选交集靶点;应用String数据库构建PPI网络,通过Cytos...