陕西省某三甲医院艰难梭菌分子流行特征及耐药情况分析

目的了解陕西省某三甲医院住院腹泻患者中艰难梭菌(Clostridioides difficile, Cd)分子流行特点及耐药情况。方法收集2018年10月—2021年12月425份住院腹泻患者的粪便标本进行艰难梭菌分离鉴定, 检测其毒素基因并进行多位点序列分型和E-test药敏试验。结果 425份标本中分离到49株艰难梭菌, 产毒艰难梭菌37株, 占75.5%(37/49), ≥65岁腹泻患者Cd检出率为14.0%(25/179), 肾内科Cd检出率为36.4%(4/11), A-B+CDT-有7株, 占18.9%(7/37), A+B+CDT-有29株, 占78.4%(29/37), A+B+CDT+有1株, 占2.7%(1/37);共有24个ST型别, 其中ST2、ST3和ST54为主要检出型别, 各占比为12.2%(6/49)。所有菌株对甲硝唑和万古霉素均敏感, 对环丙沙星耐药率较高为93.9%(46/49), 对利福平和美罗培南耐药率较低, 分别为12.2%(6/49)和10.2%(5/49)。结论产毒株以A+B+CDT-为主要型别, ST2、ST3和ST54为主要型别, 各S...     

947株尿培养病原菌分布及耐药特征分析

目的:探讨947株尿培养病原菌分布及耐药特征。方法:收集2017年1月至2019年5月我院中段尿标本,共检出947株菌株纳入研究。根据临床检验操作流程进行标本接种,观察菌株构成情况、病原菌分布情况及耐药特征分析。结果:在检出的947株非重复菌株中,革兰阴性杆菌584株,占61.67%;革兰阳性球菌275株,占29.04%;真菌88株,占9.29%。女性感染率高于男性(P0.05)。在检出的947株非重复菌株中,泌尿外科病原菌303株(32.00%),所占比例最高。革兰阴性杆菌在尿培养结果中较常见。其中,主要是大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、奇异变形杆菌。革兰阳性球菌在尿培养结果中也占有一定比例。其中,主要是屎肠球菌、粪肠球菌。临床常见真菌为白假丝酵母菌、热带假丝酵母菌。对5-氟胞嘧啶和两性霉素敏感率均为100.00%。白假丝酵母菌对伊曲康唑、伏立康唑、氟康唑敏感率为97.18%、98.69%、96.79%。结论:947株尿培养病原菌主要是革兰阴性杆菌、革兰阳性球菌、真菌,女性感染率高于男性,泌尿外科病原菌检出比例最高,临床需根据病原菌分布情况及耐药特征进行用药治疗,而且要避免交叉感染。     

大内科住院患者多种耐药菌感染的病原学分布特点及耐药性分析

目的:分析大内科住院患者多种耐药菌感染的病原学分布特点及耐药性.方法:对 2022 年1 月至 2023 年7月于我院大内科住院期间发生耐药菌感染的 62 例患者进行耐药菌培养及药敏实验,分析耐药菌感染的病原学分布特点及耐药性.结果:大内科住院 62 例患者共检出 124 株耐药菌,其中革兰阴性菌共 101 株占比 81.45%,革兰阳性菌共 23 株,占比 18.55%.痰液标本中共检出 100 株耐药菌,灌洗液标本中共检出 10 株耐药菌;尿液标本中共检出 6 株耐药菌,血液及分泌物标本中共检出 8 株耐药菌.主要革兰阴性菌均对亚胺培南、美罗培南耐药;主要革兰阳性菌对苯唑西林耐药.结论:在对我院大内科住院患者进行治疗时应根据耐药菌的分布特点和耐药性合理用药,保证药物的治疗有效性.     

中国汉族、维吾尔族人群甘露聚糖结合凝素基因多态性的检测

分别收集广东省汉族和新疆维吾尔族自治区维吾尔族一般人群血标本,提取白细胞基因组DNA,以多聚酶链反应扩增目的基因片段,应用荧光探针杂交可视技术检测其甘露聚糖结合凝集素(MBL)基因54位密码点突变(GGC54GAC)。从138份汉族样本中检出GGC54GAC突变型纯合子4例,占2.9%,杂合子30例,占21.74%;120份维吾尔族标本中,检出突变型纯合子3例,占2.5%,杂合子34例,占28.33%。因此,汉族和维吾尔族人群MBL基因GGC54GAC突变的频率分别为0.138和0.167,两民族间无明显差异。     

山西省不同人群丙型肝炎病毒的基因分型研究

目的探索丙型肝炎病毒(HCV)基因型在山西省不同人群中的分布规律及流行的优势型。方法用RT-PCR和型特异性引物逆转录巢式PCR法,对山西省271例抗HCV阳性的丙型肝炎病人、原发性肝细胞癌患者、非肝癌癌症患者、性关系混乱者和性病患者、职业献血员、吸毒者及公共场所从业人员进行了HCVRNA的检测和基因分型。结果271份抗HCV阳性标本中,HCVRNA检出率为45.45%～89.66%,平均67.52%。以丙型肝炎病人、献血员和吸毒者的HCVRNA检出率较高(76.9%～89.7%),χ2=30.44,P<0.01。在133份HCVRNA阳性血清中,仅检出了108例1b型、2a型和此两种基因型的混合感染者。未检出1a型、2b型和3a型。其中1b型占80.00%(88例),2a型占11.81%(13例),混合型占6.36%(7例)。在肝癌患者和献血员中,仅检出1b型的感染;非肝癌的其他癌症患者中,未发现混合感染。各基因型在各人群中的分布比例也有差别,丙型肝炎患者、非肝癌的其他癌症患者、吸毒者和从业人员的各基因型构成比较接近,均以1b型为主。而性病患者和性关系混乱者中1b型和2a型感染者比例相等。结论山西省HCV的基因以1b型占优势。     

2010年广州某医疗中心儿童夏季细菌性腹泻的病原学调查

目的研究广州地区小儿夏季细菌性腹泻的病原菌分布。方法采集2010年5～7月广州市妇女儿童医疗中心珠江新城院区腹泻患儿的大便标本进行常规病原菌的分离培养,通过生化反应和血清凝集试验进行鉴定和分型,并使用金标法对空肠弯曲菌抗原进行检测。结果从110份标本中检出44株病原菌,检出率为40.0%。其中致病性大肠埃希菌17株,2岁以下患儿检出15株;空肠弯曲菌12株,2岁以下患儿检出10株;沙门菌6株;念珠菌纯生长6株;产气荚膜杆菌3株。结论广州地区夏季儿童细菌性腹泻的主要病原菌是致病性大肠埃希菌及空肠弯曲菌,两者的易感人群以2岁以下婴幼儿为主。     

2008-2010年江门市腹泻病原菌现状调查

目的了解江门市细菌性腹泻病原菌的种类和构成特点,为预防和临床治疗提供科学的参考依据。方法 2008年12月至2010年6月,采集监测点腹泻患者的粪便（或肛拭）,分离霍乱弧菌、志贺菌、沙门菌、出血大肠O157：H7、空肠弯曲菌、结肠耶尔森菌、副溶血性弧菌、变形杆菌等10种病原菌,采用传统分离培养法及BD PHOENZX SYSTEM全自动鉴定系统鉴定。结果 1260份标本共分离各类病原菌189株,检出率为15.00%,其中检出金黄色葡萄球菌61株,沙门菌52株,蜡样芽胞杆菌22株,变形杆菌24株,副溶血性弧菌24株,空肠弯曲菌2株,结肠耶尔森菌1株,志贺菌3株,霍乱、出血大肠O157：H7未检出。结论金黄色葡萄球菌、沙门菌是江门市细菌性腹泻的主要病原菌。     

武汉社区腹泻病人粪便中致病菌的构成与耐药性研究

目的了解夏秋季武汉社区引起腹泻病原菌的流行性及耐药状况。方法收集2004年7月1日至10月31日武汉社区4所大型医院4536份门诊腹泻病人粪便标本进行鉴定及药敏试验;REP-PCR对主要致病菌进行基因分型。结果4536份粪便标本中,分离出非伤寒沙门菌64株（1.4%）,志贺菌29株（0.6%）,致病性大肠杆菌33株（0.7%）。其中主要致病菌是鼠伤寒沙门菌33株（52%）,D群志贺菌16株（55%）。挑选13种抗菌药物进行体外敏感试验,并将分离的致病菌对这13种抗生素的耐药率﹑敏感率﹑中介率进行比较,其中非伤寒沙门菌对喹诺酮类的耐药率较其他两种要高,但对第三代头孢的敏感性较强。分离的3种致病菌在第三代头孢抗生素的作用中对头孢他啶的敏感性最强。32株鼠伤寒沙门菌基因分型为9种,16株D群志贺菌基因分型为7种。结论武汉社区内感染性腹泻的致病菌主要以非伤寒沙门菌﹑致病性大肠杆菌和志贺菌为主,其中非伤寒沙门菌占了51%,基因分型提示有社区流行趋势,而且这些致病菌对肠道杆菌常用抗生素的耐药性较为严重。本次调查结果对该社区临床用药起到一定的提示作用。     

2007—2008年北京大学深圳医院急性感染性腹泻细菌病原学监测结果分析

目的了解2007年7月至2008年7月间北京大学深圳医院急性感染性腹泻的流行病学特征。以便及时采取措施以防传染病暴发流行。方法选择每日排便≥3次的患者作为研究对象,在患者未使用抗菌药物之前进行大便细菌病原学检验并进行统计分析。结果共检测1017份标本,检出病原菌133株,阳性率为13．07％。133株病原菌中,致病性大肠埃希菌、副溶血弧菌、产毒大肠埃希菌、侵袭性大肠埃希菌、沙门菌分别分离出43株（32．34％）、37株（27．82％）、19株（14．28％）、18株（13．54％）和13株（9．77％）。夏秋季检出肠道致病菌90株（67．66％）,高于春冬季节的43株（32．34％）。结论不仅要针对各病原菌检出率的差异在不同季节开展相应的防控措施,还要结合地域的特点对特定的病原菌进行重点监测。     

黏液在羊水栓塞病理诊断中的价值

目的探讨黏液在羊水栓塞(amniotic fluid embolism,AFE)病理诊断指标中的价值。方法从12例AFE中提取15份标本(6例尸解、其中3例尸解同时取腔静脉血、6例腔静脉血)采用HE染色、黏液(p H 2. 5)染色及免疫组化En Vision法标记CKpan、CD34、CR,显微镜下观察、计数羊水有形成分。另收集15例作为对照组进行对比分析。结果在6例AFE尸解病例的肺小血管中及9例腔静脉血标本中检出不同比例的羊水有形成分,其中上皮占23. 56%,黏液占65. 60%,脂肪占1. 27%,胎粪占8. 91%,毳毛占0. 63%。5种有形成分的检出率总体比较,黏液(P 0. 001)、上皮(P 0. 001)、脂肪(P 0. 001)阳性检出物显著高于对照组,两者差异有统计学意义;胎粪(P=0. 430)及毳毛(P=0. 183)两者差异无统计学意义。结论 AFE的黏液检出率显著高于对照组,而在检出的羊水有形成分中黏液检出率较高,其在AFE病理诊断中有较高的应用价值。     

广东地区副溶血性弧菌暴发分离优势血清型菌株的分子特征

目的 研究广东地区多宗副溶血性弧菌暴发分离的优势血清型(O3:K6、O1:Kut、O4:K8)株的毒素基因携带情况、“大流行群”株分布特征以及不同血清型株之间的相关性.方法 对2008-2010年23起副溶血性弧菌暴发患者临床样本和当餐食品分离的62株优势血清型进行tdh、trh基因检测及“大流行群”鉴定(GS-PCR...     

2012～2017年北京某医院耐万古霉素屎肠球菌临床分布及分子特征变迁分析

目的 对我院6年间分离的耐万古霉素屎肠球菌(VREfm)进行临床分布和分子特征变迁分析。方法 收集2012年1月至2017年12月从我院住院患者临床标本中分离的168株VREfm,采用多重PCR法检测vanA和vanB基因。采用另一种多重PCR法检测常见5种毒力基因(esp、gelE、asa1、cylA和hyl)。同源性分析采用多位点序列分型(MLST)。结果 所有菌株均携带vanA基因,且同时对万古霉素和替考拉宁耐药,基因型和表型均属于高水平耐药。分离自尿液标本的菌株最多(58.9%),其次是肛拭子(16.1%)和血液(15.5%)。esp和hyl的检出率分别为89.2%和27.9%,且hyl在血液来源菌株的检出率显著高于肛拭子(42.3%vs 14.8%,P<0.05)。MLST分型共检出21个ST型,均属于同一个group,其中ST78占绝对优势(50.0%),在医院内广泛传播,其他ST型均处于散发状态,且呈动态变化。与全部168株VREfm相比,ST78型具有较高的esp检出率(97.6%vs 89.2%,P<0.05)和较低的hyl检出率(15.5%vs 27.9...     

西安地区幽门螺杆菌iceA1、iceA2和babA2基因型与致病性的研究

目的:检测西安地区幽门螺杆菌(Hp)菌株iceA1,iceA2和babA2基因性分布及其与胃十二指肠疾病的关系。方法:从胃十二指肠疾病患者的胃黏膜活检组织中分离培养到Hp菌株88株,抽提基因组DNA后用PCR法检测Hp的iceA1,iceA2和babA2基因的分布,用χ2检验分析各基因在不同胃十二指肠疾病中的统计学意义。结果:163份标本中检出Hp88株,检出率为54%。iceA1基因性阳性率为76.1%,iceA2为21.6%,babA2为25%,各基因在不同类型疾病中的分布无统计学意义(P>0.05)。结论:西安地区Hp的iceA1占绝大多数,iceA1,iceA2和babA2基因型与Hp感染后的临床结局无相关性。     

2018—2020年丽江市手足口病持续流行及2020年EV-A71分离株VP1区基因特征分析

目的明确2018—2020年丽江市手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)的流行情况及2020年EV-A71分离株的基因特征。方法对收集到的2018—2020年丽江市HFMD患者粪便标本进行核酸检测, 结果为EV-A71阳性的标本进行病毒分离, 扩增其VP1区, 获得的序列与参考株构建系统进化树。结果 2018—2019年, 丽江市HFMD报告病例以≤5岁儿童为主。历年男性病例数均高于女性, 但男女性病例阳性检出率差异无统计学意义。构成丽江市HFMD主要病原的是EV-A71、CV-A16和其他EV。其中EV-A71阳性病例2018年1份(0.48%, 1/210), 2019年未检出, 2020年159份(66.53%, 159/239)。系统进化分析显示丽江市EV-A71分离株均处于C4a分支, 分离株间核苷酸和氨基酸同源性分别是99.44%～100%和99.65%～100%, 与攀枝花参考株核苷酸和氨基酸同源性分别是99.10%～100%和98.99%～100%。所有丽江分离株在中国大陆EV-A71常见的氨基酸变异位点均发生了S283T和A2...     

多重核酸检测在儿童下呼吸道感染病原学诊断中的应用分析

目的对临床诊断为下呼吸道感染(支气管肺炎、大叶性肺炎、支气管炎、毛细支气管炎)的住院患儿采集深部痰液进行细菌培养及咽拭子进行多重RT-PCR和毛细电泳联用技术,检测呼吸道常见病原(呼吸道合胞病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、副流感病毒、鼻病毒、偏肺病毒、冠状病毒和腺病毒、博卡病毒、肺炎支原体、衣原体),分析多重PCR检测技术在儿童下呼吸道感染病原学诊断的临床应用价值。方法收集2018年12月至2019年2月在成都儿童专科医院住院的155例下呼吸道感染患儿的鼻咽分泌物及深部痰液标本,年龄在1月～14岁,病程在1～60天。结果本组患者男93例(60%),女62例(40%),平均发病时间为7.2天,≤7天94例,7天61例,1岁组39例(25.2%),1～3岁组42例(27.1%),3～5岁组41例(26.5%),5岁33例(21.3%),平均年龄3.1岁。多重核酸检测结果发现,155例患儿的鼻咽分泌物标本中至少有一种病原检测阳性的共计143份标本(占92.3%),其中有40份标本(占27.97%)检测到两种或两种以上病原。排名前三位的病原依次为、呼吸道合胞病毒、甲型流感病毒和偏肺病毒。按照不同年龄组病原阳性率分析,除呼吸道合胞病毒外(χ2=29.241,P0.001),其余病毒组间差异无统计学意义。通过多重PCR检查阳性标本中混合细菌感染者占57例共计59株(36.77%),各年龄组混合感染差异无统计学意义,其中卡他布兰汉菌28株(47.46%),流感嗜血杆菌18株(30.51%),肺炎链球菌9株(15.25%),金黄色葡萄球菌3株(5.08%),大肠埃希菌1株(1.70%);根据发病时间分为≤7天和7天组,核酸检测阳性结果≤7天组91例(58.71%),与7天组阳性例数52例(33.54%)(χ2=5.4,P=0.020.05)差异具有统计学意义。结论呼吸道合胞病毒是本院冬春季3岁以下儿童下呼吸道感染主要病原,偏肺病毒、流感病毒是5岁以下儿童该时期下呼吸道感染的主要病原,支原体感染仍多见于5岁以上儿童;和痰培养比较,进行多重PCR病原检测有助于全面了解儿童下呼吸道感染的病原,发病早期(≤7天)检测阳性率更高。     

2018—2020年云南省手足口病病原监测及柯萨奇病毒A组4型VP1基因特征分析

目的阐明2018—2020年云南省手足口病优势肠道病毒感染类型及柯萨奇病毒A组4型(CVA4)VP1基因特征分析。方法手足口病监测肠道病毒实时荧光定量PCR核酸阳性标本进一步病毒分离, 送中国疾病预防控制中心并对VP1基因测序分析。结果 2018—2020年共采集手足口病标本21 757份, 其中阳性标本16 457份, 阳性检出率75.64%。共分离阳性标本4 114份, 分离到毒株533份, 其中肠道病毒71型(EVA71)共89例, 占总病原的16.70%;柯萨奇病毒A组16型(CVA16)共180例, 占33.77%;CVA10为76例, 占14.26%;CVA6、CVA4分别占22.14%、4.88%;其他型别共44例, 占8.26%。5岁以下儿童是手足口患者主要人群, 男女性别比1.35∶1, 气温较高的第二、三季度是手足口病高发季。云南省CVA4主要分布在曲靖和昆明等地, 文山、红河零星分布, VP1基因全长915 bp, 26株CVA4毒株均属于C基因型的C2亚型, 与原始株AY421762-HighPoint之间遗传距离较远。VP1基因的18、23、34、102、14...     

2015—2018年青海省手足口病病原谱变化和流行趋势

目的了解青海省手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)患者中肠道病毒流行情况和基因型特征。方法采集青海省HFMD患者的咽拭子标本, 进行病毒分离和特异性引物聚合酶链反应(RT-PCR), 对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析, 并参考NCBI部分毒株序列构建基因进化树。结果采集临床诊断HFMD阳性病例标本1 738份, 其中人肠道病毒A组71型(EV-A71)型326例, 占18.76%、人肠道病毒柯萨奇A16型(CV-A16)型237例, 占13.64%、人肠道病毒柯萨奇A6型(CV-A6)型628例, 占36.13%, 4年间不同基因型别间存在差异, 具有统计学意义(EV-A71, χ2=245.315,P<0.001; CV-A16, χ2=27.680,P<0.001; CV-A6, χ2=702.713,P<0.001), 用RD细胞分离后共得到到317株细胞培养物, 测序后选取2017年和2018年典型基因型的VP1区核酸序列进行序列分析, 全部基因型VP1区核酸序列间同源性在59%～100%之间, 19株EV-A71...     

深圳宝安区儿童感染致病性A群链球菌流行现状及emm基因分型研究

目的了解深圳宝安地区儿童感染致病性A群链球茵(group A streptococcus,GAS)流行现状及其M蛋白基因(emm)分型的分布状况。方法收集2013年2月~2015年11月份来本院门诊和住院的急性咽炎、急性化脓性扁桃体炎、风湿热、猩红热患儿咽拭子和皮肤化脓性感染伤口分泌物共2043例,分别进行细胞培养与鉴定,分析不同年龄儿童GAS感染情况,并采用PCR扩增GAS的M蛋白N末端,进行测序,确定GAS的emm基因分型。结果 2043例临床标本中共分离鉴定出GAS 76株,GAS检出率为3.72%(73/2043),其中学龄前和学龄儿童分别检测出17株和59株,检出率为22.4%和78.6%,学龄儿童GAS感染率明显高于学龄前儿童,差异有统计学意义(χ~2=31.852,P0.01),但不同年龄段学龄儿童GAS感染率之间比较差异无统计学意义(χ~2=1.694,P0.05);GAS在急性咽炎和化脓性扁桃体炎的患儿中检出率最高,分别为34.2%和30.6%;76株GAS的emm基因型以emml(40.8%)和emm12(28.9%)多见。结论深圳宝安地区学龄儿童GAS感染发病率明显高于学龄前儿童,急性咽炎和急性化脓性扁桃体炎患儿中检出率最高,76株GAS感染的emm基因型以emm1和emm12为主。各地加强emm基因分型研究可为GAS疫苗的研制提供重要的分子流行病学依据。     

拷贝数变异测序用于孕中期高危妊娠胎儿产前诊断的临床价值

目的探讨核型分析及基于下一代测序技术的基因组拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)对于孕中期产前诊断的诊断价值。方法对215例孕中期胎儿羊水同时行染色体核型分析及CNV-seq检测。结果 215例胎儿羊水标本中,染色体核型分析共检出4例异常核型(1.86%),其中2例特纳综合征,1例克氏综合征的嵌合体,以及1例平衡易位。在211例核型分析正常的标本中,CNV-seq额外检出了23例CNVs(10.69%),检出23例染色体微缺失/微重复,包含 3例明确致病性CNV,5例可能致病性CNV,2例致病性未知CNV,4例可能良性CNV,9例良性CNV。结论孕中期羊水细胞行核型分析及CNV-seq技术相结合的方法是胎儿产前诊断准确且有效的方法之一。     

呼吸道病毒特异性IgM检测对儿童呼吸道感染的指导意义

目的:统计分析急性呼吸道感染患儿5种常见呼吸道病毒特异性Ig M的检出情况用以指导临床。方法:2012年1月~12月我院儿科住院急性呼吸道感染患儿1 609例,收集血清采用间接免疫荧光方法检测呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、甲型流感病毒(IVA)、乙型流感病毒(IVB)、副流感病毒(PIV)特异性Ig M。结果:1 609例患儿检出阳性标本263例(16.35%),IVB检出率最多,共136例(8.45%),其余依次为IVA 63例(3.92%)、PIV 62例(3.85%)、ADV 44例(2.73%)、RSV 42例(2.61%)。不同年龄组患儿阳性标本检出率不同,差异具有统计学意义(χ2=134.822,P0.01),随年龄增长阳性标本检出率逐渐增高,学龄期儿童检查率最高(34.55%);IVB、PIV、IVA阳性标本检出率在不同年龄阶段的比较差异具有统计学意义(χ2分别为102.660、86.145、39.791,均P0.05),IVB和IVA以学龄期儿童检查率为最高,分别达20.00%和8.64%,PIV以学龄前儿童检出率最高(12.07%)。不同呼吸道病毒Ig M阳性检出率在不同月份有各自的特点,IVB在3月和10月出现两个检出高峰,检出率分别达20.15%和11.11%;IVA在3月和5月出现两个检出高峰,检出率分别达10.27%和11.81%;PIV、RSV检出率在1~6月份平缓上升,在3月份检出率最高,分别达7.98%和6.46%,随后检出率又平稳下降;ADV在3、4、5三个月份检出率为最高,检出率达6.19%。结论:5种呼吸道病毒检出阳性率达16.35%,尤以IVB检出率为最高;呼吸道病毒特异性Ig M阳性检出率随年龄增长而逐渐增高,IVB和IVA以学龄期儿童感染率最高,而PIV以学龄前儿童感染率最高;5种呼吸道病毒感染在2012年有各自的流行特点。