慢加急性肝衰竭不同预后患者血浆外泌体差异蛋白的生物信息学分析

目的筛选不同预后慢加急性肝衰竭(ACLF)患者血浆外泌体中的差异蛋白,分析其功能及生物学过程,为患者临床诊断提供参考依据。方法前瞻性选取2019年7月—10月于首都医科大学附属北京佑安医院住院确诊的ACLF患者10例,随访90 d,患者死亡或肝移植归入肝移植/死亡组(n=5),患者存活归入生存组(n=5),两组一般资料指标比较采用Mann-Whitney U秩和检验。采用非标记(Label-free)定量蛋白质组学技术对血浆外泌体蛋白进行鉴定和定量分析,筛选差异蛋白并进行功能富集分析,使用R-3.5.1软件对差异蛋白进行层次聚类分析,分析其参与的生物学过程。结果外泌体蛋白质组学分析共鉴定出860种蛋白,以倍数上调>1.2倍或下调>1.2倍且P<0.05的标准筛选出差异表达蛋白116种,与肝移植/死亡组相比,生存组上调蛋白62种、下调蛋白54种。生物信息学分析结果显示,这些蛋白主要参与了免疫反应、信号转导、囊泡介导的转运、细胞死亡和增殖等生物学过程,并与炎症反应、糖类和氨基酸代谢、肝细胞损伤及再生等信号通路密切相关。结论非标记定量蛋白质组学技术筛选出的差异蛋白可能作为ACLF早期诊断及预后判断的血清学标志物。     

非酒精性脂肪性肝病患者血浆外泌体差异蛋白分析*

目的 筛选非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者血浆外泌体差异蛋白,分析其功能及其生物学过程,为NAFLD患者临床诊断提供参考依据。方法 2020年7月～10月我院诊治的NAFLD患者3例和健康体检者3例,采用串联质谱标签(TMT)标记定量蛋白质组学技术对血浆外泌体蛋白进行鉴定和定量分析,筛选差异蛋白并进行功能富集分析,了解其参与的生物学过程。结果 经外泌体蛋白质组学分析,共鉴定出蛋白质387种,以倍数上调＞1.2倍或下调＞1.2倍,且P＜0.05为标准筛选出差异表达蛋白34种;健康人比,NAFLD患者上调蛋白25种,下调蛋白9种;生物信息学分析结果显示,这些蛋白主要参与了脂质的储存和代谢、免疫反应、纤维素形成等生物学过程,并与胰岛素抵抗、炎症反应、细胞损伤等信号通路密切相关。结论 采用TMT标记定量蛋白质组学技术筛选NAFLD患者差异蛋白可能为其诊治提供指引。     

酒精性肝病患者脂代谢相关差异蛋白的定量分析

目的应用串联质谱标记(TMT)技术筛选和鉴定酒精性肝病(ALD)患者肝脏组织中的差异蛋白, 对脂代谢相关蛋白和通路进行分析, 探索其功能及生物学过程。方法收集符合纳入标准的肝脏组织, 筛选出酒精性肝硬化患者样本8例, 正常对照组样本3例。采用TMT技术筛选差异蛋白并进行富集信号通路分析和蛋白质网络互作分析, 探索其参与的生物学过程。结果蛋白质组学分析鉴定出2组资料中有2 741种差异蛋白具有统计学意义(P < 0.05), 以P<0.05且|log2(foldchange)| >1的标准筛选出差异表达蛋白106种, 与对照组相比, ALD组上调蛋白12种, 下调蛋白94种。其中, 与脂代谢相关的上调差异蛋白有2种, 下调差异蛋白有14种。生物信息学分析结果显示这些蛋白在脂代谢中主要参与了脂质转运, 脂肪酶活性的调节, 脂肪酸结合以及胆固醇代谢等生物学过程, 并与过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、胆固醇代谢、甘油三酯代谢及脂肪细胞内脂解的调节等脂代谢相关信号通路密切相关。结论 16种脂代谢相关差异蛋白可能是ALD发病机制中的关键蛋白。     

高通量技术筛选主动脉夹层生物标志物的研究

目的:通过iTRAQ联合Label-free法筛选主动脉夹层潜在诊断标志物。方法:入选急性主动脉夹层及对照组(急性冠状动脉综合征)血清各50例。将两组患者中各15例血清标本用于iTRAQ及Label-free分析筛选表达差异蛋白。对所有收集血清进行差异蛋白的免疫吸附测定(ELISA)验证。结果:两组血清标本使用iTRAQ方法共鉴定出84种差异表达蛋白质,Label-free方法共鉴定有或无差异蛋白20种。通过Panther软件进行生信分析与主动脉夹层发病机制9种相关蛋白作为候选生物标志物。进行ELISA验证后得出2种差异蛋白Lumican、PI16有统计学差异,且特异性和敏感性较高。结论:蛋白Lumican、PI16可能成为主动脉夹层潜在的诊断标志物。     

酒精性肝病患者血浆外泌体差异蛋白的分析

目的筛选酒精性肝病(alcoholic liver disease, ALD)患者血浆外泌体中的差异蛋白,分析其功能及生物学过程,为ALD患者的治疗和诊断提供参考依据。方法选取2021年5月至2021年10月在首都医科大学附属北京佑安医院住院并确诊为ALD的患者和健康体检者各3例,超速离心分离提纯外泌体,提取蛋白,串联质谱标签(tandem mass tag, TMT)标记后,采用定量蛋白组学技术对两者血浆中的外泌体蛋白进行鉴定和定量分析,筛选出差异蛋白,并用生物信息学分析差异蛋白的功能及其参与的生物学过程。结果共鉴定到可定量蛋白质387种,以倍数上调>1.2倍或下调>1.2倍且P<0.05为标准筛选出差异蛋白27种,与健康对照组相比,ALD组上调蛋白15种、下调蛋白12种,生物信息学分析结果显示,这些蛋白主要参与了脂质的代谢、免疫反应和细胞的死亡等生物学过程,并与炎症反应、细胞的损伤和补体级联反应等信号通路密切相关。结论 TMT标记定量蛋白质组学技术筛选出的差异蛋白可能作为ALD早期诊断的血清学标志物及治疗靶点。     

基于iTRAQ技术的阿司匹林相关胃黏膜病变差异蛋白质组学研究

目的 应用同位素相对标记与绝对定量技术(isotope relative labeling and absolute quantification technique, iTRAQ)筛选阿司匹林相关胃黏膜病变的差异蛋白，分析生物信息，探讨阿司匹林导致胃黏膜病变的发病机制。方法 分别收集口服阿司匹林6个月以上患者的胃黏膜病变(包括胃炎、胃溃疡)标本作为实验组，未口服阿司匹林健康体检者的正常胃黏膜标本作为对照组，采用iTRAQ技术对差异蛋白进行筛选与鉴定。通过检索Gene Ontology数据库，针对细胞组分、生物学过程、分子功能对差异蛋白在功能方面进行富集；通过KEGG的Pathway数据库，定位差异蛋白到相应的生化代谢途径和信号转导途径，将不同的蛋白质富集到共同代谢途径中。结果 共鉴定出298个差异蛋白，与对照组相比差异有统计学意义，其中235个蛋白表达上调，63个蛋白表达下调。生物信息学分析发现差异蛋白主要参与了129种细胞组分、733种生物学过程、123种分子功能、55条信号转导通路。差异蛋白的基因分子功能主要包括异源性二聚体蛋白的活性、MAPK级联反应、受体激动剂活性、CCR10...     

基于iTRAQ结合质谱筛选HBV肝纤维化的差异表达蛋白

目的:采用核素标记相对和绝对定量(isobaric rags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)蛋白组学技术分析乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)肝纤维化患者和健康人血清中的差异表达蛋白.方法:肝纤维患者与正常人血清各30例,去除血清中14种高丰度蛋白,运用液相色谱基质辅助激光解析/电离-飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-fight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)筛选并鉴定差异表达蛋白,并对差异表达蛋白进行生物学分析.结果:共鉴定血清蛋白274个,符合条件的差异蛋白20个.其中,在肝纤维患者血清中有11个蛋白表达上调,7个蛋白表达下调.20种差异表达蛋白参与48种生物学过程、8种细胞组分和12种分子途径;蛋白功能交互网图显示APOC3、CLU、C4B、CRP和APOE在网图中处于功能网络交叉点.结论:处于差异蛋白功能交互网中交叉点位置的载脂蛋白C-Ⅲ(apolipoprotein C-Ⅲ,APOC3)、聚集素(clusterin,CLU)、补体C4B(complement C4-B,C4B)、C-反应蛋白(c-reactive protein,CRP)、载脂蛋白E(apolipoprotein E,APOE),可能在HBV肝纤维化的发生发展过程中发挥重要作用.     

我国利什曼原虫伽师株有毒力和无毒力前鞭毛体定量蛋白质组学比较分析

目的 应用定量蛋白质组学方法比较我国利什曼原虫伽师株有毒力和无毒力前鞭毛体蛋白表达的差异。方法 将分离于我国新疆伽师县黑热病患者婴儿利什曼原虫JS5有毒力株前鞭毛体和无毒力株前鞭毛体经酶解后进行液相色谱串联质谱(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)的非标记(Label-free)定量分析,利用MaxQuant软件查库,进行Label-free非标定量(LFQ)分析;每个样品重复3次质谱分析,只有1次有LFQ值的蛋白舍弃。结果 本研究共鉴定蛋白3 994个,有毒力和无毒力株间差异蛋白为298个(差异倍数>1.2或差异倍数<0.83,P<0.05),其中利什曼原虫有毒力株前鞭毛体特有表达蛋白15个,无毒力株前鞭毛体特有表达蛋白23个,二者间表达丰度有显著差异蛋白260个,其中有毒力前鞭毛体表达上调蛋白(高表达)78个,表达下调蛋白(低表达)182个。这些差异表达蛋白中已鉴定功能的蛋白分别涉及糖与脂质代谢、核酸代谢、压力反应、细胞骨架形成、细胞周期与增殖等生物功能。结论 利什曼原虫伽师株有毒力株和无毒力株前鞭毛体蛋白质组的表达存在差异,为筛选和鉴定与利什曼原虫感染相关关键分子奠定了基础。     

基于同位素标记的相对和绝对定量的糖尿病并发肺结核患者血浆蛋白质组学研究

目的: 比较糖尿病(diabetes mellitus,DM)患者与糖尿病并发肺结核(diabetes mellitus complicated with pulmonary tuberculosis,DM-PTB)患者的血浆蛋白质谱差异,筛选DM-PTB潜在蛋白质生物标志物,为进一步探索DM-PTB的发病机制提供思路。方法: 采用回顾性研究的方法,选取于2017年1月至2018年1月在黑龙江省传染病防治院确诊的DM患者和DM-PTB患者各16例,采用基于同位素标记的相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)蛋白质组学技术分析两组间血浆蛋白质谱,以DM-PTB组对DM组蛋白表达量变化倍数>1.2或<0.83且P<0.05为标准筛选差异蛋白,并对差异蛋白进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析等生物信息学分析。结果: 共筛选出275个差异表达蛋白,其中有111个在DM-PTB组上调,有164个在DM-PTB组下调。GO分析显示,差异表达蛋白富集数目最多的生物学过程为细胞过程(92.00%,253/275),定位于细胞器(87.27%,240/275),分子功能为结合(90.55%,249/275)。KEGG代谢通路分析显示,差异表达蛋白共富集到26条代谢通路(错误发现率<0.05),富集数目最多的通路为黏着斑通路(22个蛋白),此外PI3K-Akt信号通路、胆固醇代谢通路、血小板激活通路、吞噬体通路和补体及凝血通路等与糖脂代谢和免疫相关的通路也发生了变化。结论: 本研究通过iTRAQ蛋白质组学方法筛选出了DM-PTB患者的差异表达蛋白,发现这些差异表达蛋白参与了与细胞活动、糖脂代谢和免疫调节相关的信号通路,提示上述通路的变化可能与DM-PTB的发病密切相关。     

扩张型心肌病蛋白质组学研究

目的:通过蛋白质组学方法比较扩张型心肌病(DCM)患者和正常人心肌组织差异蛋白质谱,找出与DCM相关的差异蛋白,进一步探讨DCM发生的分子生物学机制。方法:选择9例原发病为DCM、左心室射血分数<35%且接受心脏移植手术的患者作为DCM组:心肌组织取自患者自有心脏的左心室游离壁。对照组:心肌组织取自6例不能用作移植的供体心脏。采用双向凝胶电泳(2-DE)分析蛋白质谱差异,热考马斯亮蓝染色,串联质谱(MS-MS)鉴定差异蛋白。采用生物医学研发软件及资料库Ingenuity PathwaysAnalysis分析差异蛋白的定位、功能和相互作用。结果:DCM组和对照组心肌组织2-DE图像中蛋白点的整体分布比较相似,可以检测到超过1 000个蛋白点。通过比较分析,共鉴定出25种差异蛋白,其中在DCM组15种上调,10种下调。使用LOCATE数据库分析差异蛋白的亚细胞定位,提示其中大分子蛋白占40%,细胞骨架蛋白为28%,线粒体蛋白为28%。蛋白的PANTHER分类显示大多数差异蛋白参与了细胞的结构、肌肉收缩、钙离子转运和水解酶的活性等功能。生物学途径分类揭示差异蛋白参与了组织的形成过程、生物调节、发育过程、代谢过程和对刺激的应答过程等。结论:对DCM患者心肌组织蛋白质组学研究发现25种差异蛋白,其中上调表达的蛋白有15种,下调表达的有10种;这些蛋白参与了线粒体能量代谢、心肌收缩、凋亡等过程;提示这些过程可能在DCM发生发展中发挥重要作用。     

类风湿关节炎的血清多肽差异

目的筛选风湿性关节炎患者血清中与疾病相关的差异性表达多肽,尝试建立类风湿关节炎(rheu-matoid arthritis,RA)的多肽鉴别诊断模型。方法以RA患者作为实验组,将活动期系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)患者作为疾病对照组,健康志愿者作为正常对照组,应用弱阳离子交换磁珠分离纯化血清样本,MALDI-TOF-MS获取样本生物学信息,用ClinProt2.1软件进行统计学分析,用遗传算法建立分类预测模型。结果成功筛选出一系列差异表达多肽,建立了具有高预测能力和交叉验证能力的诊断预测模型。验证该分类模型后,显示对RA组的识别率达100%,交叉验证能力达87.88%。结论将蛋白质组学技术应用于RA发病机制研究,从多肽指纹图谱新角度进行疾病分析,为更好地理解RA的发病机制、指导RA治疗及其预后提供依据。     

血清骨桥蛋白水平与类风湿关节炎活动性的关系及在伴肺间质病变中的意义

目的 检测类风湿关节炎(RA)患者血清骨桥蛋白(OPN)水平,分析血清OPN水平与RA疾病活动的相关性,初步探讨OPN在RA合并肺间质病变(ILD)发病机制中的作用.方法 收集临床确诊的65例RA患者血清.其中活动期RA患者43例,缓解期RA患者22例;其中合并ILD者24例,未合并ILD者41例.以20名健康体检者血清为健康对照组.采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测血清OPN水平,并与RA患者的临床及实验室指标进行相关性分析.结果 ①RA组血清OPN水平(中位数18.0 ng/ml),高于健康对照组(中位数14.0 ng/ml,P<0.01);活动期RA组血清OPN水平(中位数20.0 ng/ml),高于缓解期RA组(中位数1.5 ng/ml,P<0.01).②RA组血清OPN水平与病程、关节压痛数、红细胞沉降率(ESR)、C反应蛋白(CRP)等呈显著正相关,与关节肿胀数无相关性.③RA合并ILD组血清OPN水平(中位数20.0 ng/ml),高于RA未合并ILD组(中位数17.0 ng/ml,P<0.05);且与动脉氧分压(PaO2)呈负相关;与肺功能(肺活量、一氧化碳弥散吸收率)无相关性.④RA合并ILD组关节压痛数,关节肿胀数、ESR、CRP等与RA未合并ILD组相比差异具有统计学意义(P均<0.01);RA合并ILD组血清类风湿因子(RF)(IgM)高于RA未合并ILD组(P<0.05).结论 OPN在RA发病机制中具有一定意义且与RA活动性有关,可作为评价疾病活动度的炎性指标;OPN参与了RA合并ILD的发生及进展,并与肺损害严重程度有关.     

肝硬化合并门静脉血栓患者的差异蛋白筛选

目的筛选肝硬化合并门静脉血栓形成(PVT)患者的血清差异表达蛋白。方法收集2015年11月-2016年11月在新疆医科大学第一附属医院感染疾病中心住院的45例肝硬化患者血清标本,其中合并PVT患者22例,无PVT患者23例。采用相对和绝对同位素定量标记(i TRAQ)联合色谱质谱技术筛选两组患者的血清差异蛋白,并对差异蛋白进行生物信息学分析。非正态分布的计量资料组间比较采用Mann-Whitney U检验;计数资料组间比较采用χ~2检验。采用Fisher确切检验比较各个GO分类或KEGG通路在目标蛋白质集合和总体蛋白质集合中的分布情况,以此评价某个GO term或KEGG通路蛋白质富集度的显著性水平。结果共筛选出800个蛋白。有差异的蛋白86个,其中32个蛋白上调(ratio≥1.2,P0.05),54个蛋白下调(ratio≤0.83,P0.05)。在这些蛋白中,有14类蛋白与细胞组分有关,22类蛋白与生化过程有关,10类蛋白与分子功能有关。使用KEGG分析发现肝硬化合并PVT组较无PVT组有18个蛋白在5个代谢和信号通路中有显著的差异。5个代谢和信号通路分别与脂肪消化和吸收、血小板激活、乙醛酸及二羧酸代谢、破骨细胞分化、轴突导向有关。结论 i TRAQ联合色谱质谱技术能够有效筛选血清差异蛋白,其中GP5、FGA、FGG可能为肝硬化发生PVT的潜在生物标志物,值得进一步研究。     

三水白虎汤对类风湿关节炎滑膜成纤维细胞增殖的蛋白质组学影响

目的 探讨三水白虎汤(SSBH)对类风湿关节炎(RA)滑膜成纤维细胞(FLS)增殖的蛋白质组学影响.方法 组织块培养法收集RA患者的关节FLS,体外传代培养,取3～6代细胞,分别加入SSBH含药血清培养(SSBH组)及加入生理盐水制备的血清培养(对照组).培养72 h后提取细胞总蛋白,用双向凝胶电泳(2-DE)分离细胞总蛋白,凝胶经银染显色和图像数据分析识别差异蛋白位点;基质辅助激光解析电离飞行时间质谱对差异蛋白位点进行鉴定.结果 两组FLS蛋白2-DE图谱均出现差异蛋白质点.在差异蛋白表达量超过3倍的蛋白质点中,选取27个差异蛋白位点进行质谱分析,共鉴定出包括表达上升的IL-1受体拮抗蛋白等25种蛋白质.结论 SSBH可能通过上调RA患者FLS中IL-1受体拮抗蛋白来抑制滑膜增生,这可能是该方剂治疗RA的药理作用机制之一.     

基于数据非依赖性采集技术的扩张型心肌病血清蛋白质组学分析

目的 比较扩张型心肌病（DCM）患者和对照组血清蛋白的表达差异,探索DCM新的循环生物标志物。方法 使用数据非依赖性采集（DIA）技术的质谱分析方法鉴定两组样本蛋白质的表达情况,对鉴定出的差异蛋白进行基因本体（GO）富集分析、真核生物同源组（KOGs）分析、京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果 与对照组相比,DCM患者血清中表达上调的蛋白144种,下调的蛋白10种。GO富集分析显示,差异蛋白参与细胞过程、生物调节、对刺激应答、代谢过程等生物学过程,发挥绑定功能、催化活性、分子功能调节等分子功能。KOG分析显示差异蛋白种类以细胞骨架最多。KEGG通路分析显示差异蛋白富集最多的通路为免疫系统。差异蛋白S10A8、S10A9富集于白细胞介素17(IL-17)信号通路,CO4A2、SDC1、GPV富集于细胞外基质受体交互通路。结论 本研究筛选出154种差异蛋白,可能成为DCM新的循环标志物。     

类风湿关节炎患者外周血单个核细胞蛋白质组学研究

目的 运用蛋白质组学的方法,比较正常人及早期活动性类风湿关节炎(RA)患者外周血单个核细胞(PBMCs)蛋白质的差异表达,寻找RA疾病相关致病蛋白质.方法 选取9例早期活动期RA患者以及9名健康成年志愿者,用淋巴细胞分离液分离PBMCs,抽提PBMCs中的蛋白,采用同相pH梯度(IPG)双向凝胶电泳(2-DE)分离正常人及RA患者PBMCs总蛋白质.凝胶经考马斯亮蓝染色显色后,PDQuest图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白质,对差异蛋白质点用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)进行鉴定,运用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法验证部分差异蛋白质.结果 获得RA患者及正常人PBMCs蛋白质双向凝胶电泳图谱,平均蛋白质点数分别为556和579,匹配率分别为89.4%和 88.5%,通过比较分析,差异表达蛋白质点数为23,选取18个点进行质谱鉴定,成功鉴定14个蛋白质,其中a-肌动蛋白、纤维蛋白素原a-链、载脂蛋白A-I(ApoA-I)等9个蛋白质点在RA中表达上调,硫氧还蛋白-2、谷胱甘肽S-转移酶等6个蛋白质点在RA中表达下调,这些差异蛋白质的功能涉及物质代谢、抗氧化、信号传导、能量产生及细胞骨架.并用RT-PCR方法验证差异蛋白质ApoA-I.其结果与上述蛋白质差异表达结果相符.结论 在RA患者PBMCs中存在着差异表达蛋白质,这些差异蛋白质可能是RA发病的内在因素.其RT-PCR结果与蛋白质差异表达相符,证明蛋白质组研究的可靠性.     

血清白细胞介素-33检测对类风湿关节炎肺间质病变的价值探讨

目的探讨血清白细胞介素-33(IL-33)与类风湿关节炎(RA)合并肺间质病变(ILD)的相关性。方法纳入RA患者177例,分为RA合并ILD(RA-ILD)组47例与单纯RA组130例,观察并比较2组肺功能等相关实验室指标。测定2组的血清IL-33水平,采用Pearson相关分析探讨IL-33水平及其与相关变量间的关系。结果与RA组相比,RA-ILD组血清IL-33水平更高,差异有统计学意义(P0.05)。与RA组比较,RA-ILD组的肺活量占预计值百分比(VC%)、用力肺活量占预计值百分比(FVC%)和一氧化碳弥散量(DLCO)均显著降低(P0.05)。RA-ILD组中36例(占76.6%)出现动脉血氧分压(Pa O2)降低,且RA-ILD组Pa O2明显低于RA组(P0.05)。RA-ILD组红细胞沉降率(ESR)、C反应蛋白(CRP)、类风湿因子(RF)和抗环瓜氨酸多肽抗体(ACPA)水平明显低于RA组(P均0.05)。相关性分析显示,血清IL-33水平与RF、ACPA滴度呈正相关(r分别为0.90和0.61,P均0.05),与DLCO水平呈负相关(r=-0.77,P0.05)。血清IL-33水平与ESR、CRP和Pa O2无相关性。结论 IL-33参与RA的发病过程,且可能与RA-ILD的发病相关。     

冠心病不同阶段血清的差异蛋白质组学研究

目的通过比较冠心病4个不同阶段的血清蛋白质表达的差异,寻找与冠心病的发生发展相关的特异蛋白质。方法采用蛋白质组学双向凝胶电泳联合质谱的技术方法对正常健康人、冠心病中高危人群、冠心病急性期患者及冠心病稳定期患者蛋白质组学比较研究。结果通过鉴定得到了7种差异蛋白质:视黄醇结合蛋白4(RBP4)、载脂蛋白E(ApoE)、载脂蛋白A1(ApoA1)、CD5抗原样蛋白(CD5L)、结合珠蛋白(Hp)、血清白蛋白(ALB)、簇连蛋白(CLU)。结论这些与冠心病相关的差异蛋白质主要通过参与脂质代谢、炎症反应以及氧化损伤等过程而导致动脉粥样硬化的发生。     

溃疡性结肠炎血清差异蛋白的筛选研究

目的 应用蛋白质组学寻找溃疡性结肠炎(UC)血清差异蛋白,初步探索UC可能的生物标志物.方法 收集UC患者30例和健康对照者30名的血清标本,双向凝胶电泳(2-DE)分离等量混合血清的蛋白质,运用图像分析软件进行比较和分析,识别差异表达蛋白质.应用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定部分差异蛋白质点.结果 UC组和对照组之间年龄、体重指数、吸烟情况和饮酒量的差异均无统计学意义(P值均＞0.05).初步筛选出UC患者与健康对照者存在明显差异的39个蛋白点,选择其中9个点,经质谱分析发现触珠蛋白、热休克转录因子2、受体酪氨酸激酶、醛脱氢酶、载脂蛋白C-Ⅲ、中心粒旁物质1在UC患者中表达水平升高,角蛋白1、细丝蛋白A结合蛋白1、肌球蛋白3在UC患者中表达水平降低.结论 采用蛋白质组学2-DE和质谱技术,筛选并鉴定出与UC相关的9个血清蛋白质,为提供新的UC生物学行为研究分子标志物奠定基础.     

维生素D结合蛋白在类风湿关节炎滑膜中表达的研究

目的 本研究通过蛋白质组学的方法比较类风湿关节炎(RA)、骨关节炎及强直性脊柱炎(AS)滑膜组织中表达的蛋白,筛选RA滑膜中表达特异性下调的蛋白,并通过单核苷酸多态性(SNPs)分析方法分析靶蛋白编码基因对RA的遗传易感性.方法 提取RA( 10例)、骨关节炎(10例)及AS(10例)滑膜组织总蛋白,每类疾病的样本等比例混合,然后用2-D凝胶电泳进行分析,对RA样本中表达量明显低于骨关节炎和AS的蛋白进行飞行时间质谱鉴定,检测结果用蛋白印迹法验证.用Taqman方法对中国人群中267例RA患者和160名健康对照的维生素D结合蛋白(VDBP)编码基因的标签SNPs进行基因分型,并扩大样本量(389例RA和371名健康对照)验证分型结果.采用单因素方差分析和Fisher确切概率法进行检验.结果 蛋白质组学研究发现,在RA患者滑膜中VDBP表达量明显下降,蛋白印迹法也验证了这一结果.基因分型研究发现,SNP位点rs2282679与RA密切相关(P=0.026 794).进一步扩大样本实验也得出了一致结果,rs2282679与RA有相关性[比值比(OR )=0.678 639,95％可信区间(CI)0.541 113～0.851 118,P=0.000 776].结论 与骨关节炎和AS患者相比,VDBP在RA患者滑膜中表达量明显下降.VDBP基因上的SNP位点rs2282679与RA有相关性.VDBP在RA中的表达下调及其基因的遗传效应显示VDBP可能参与RA的病理过程.