自动双向测序法检测基因的单核苷酸多态性

目的：通过检测21号染色体上的所有已知基因中存在的单核苷酸多态性(single nucleotide ploymorphism，SNP)，建立一种检测基因SNP的高通量的方法。方法：应用聚合酶链反应技术和荧光标记的自动双向测序法，对中国汉人、少数民族共96个人DNA标本，在21号染色体上所有已知基因的启动子区、全部编码区及其临近的内含子区进行自动测序，并通过Polyphred软件识别SNP。结果：应用聚合酶链反应技术和荧光标记的自动双向测序法在128个基因发现了许多SNP。汉族人与少数民族在一些基因有SNP的差异。结论：自动双向测序法检测基因的SNP是直接、可靠和高通量的一种方法。     

2型糖尿病肾病的载脂蛋白E基因多态性研究

目的研究载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与2型糖尿病肾病的关系.方法采用聚合酶反应(PCR)和限制性片段、长度多态性分析(RFLP)技术,研究58例2型糖尿病肾病患者、56例2型糖尿病未合并肾病患者和76例正常对照者载脂蛋白(ApoE)的基因多态性.结果①2型糖尿病肾病患者ε2等位基因频率(14.6%)高于2型糖尿病非肾病患者(3.6%)(P<0.01,χ2=8.37)和正常对照者(5.7%)(P<0.05,χ2=4.28),3组中ε3和ε4等位基因频率差异无显著性(P>0.05).②携带ε2等位基因的2型糖尿病患者TG水平较携带ε3和ε4等位基因的2型DM患者增高(P<0.01 vs P<0.05),而LDL-C水平降低(P<0.05),携带ε4等位基因的2型DM患者,其TC和LDL-C水平较携带ε2和ε3等位基因的个体增高(P<0.01).③ApoE基因多态性在男女性别上差异无显著性(P>0.05).结论 ApoE基因多态性与2型糖尿病肾病的发生有关,提示ε2等位基因频率越高,发生2型糖尿病肾病的可能性越大.     

载脂蛋白E基因多态性与散发阿尔茨海默病的关系

目的:探讨载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与散发阿尔茨海默病(sporadic Alzheimer disease ,SAD)的关系.方法:通过DNA直接测序的方法检查30例SAD和30例正常老人ApoE基因的3个编码外显子.结果:ApoEε4等位基因频率(23.3%,8.3%)及ε4/4,ε3/4,ε2/4基因型合并后其基因型频率(40%,16.7%)在SAD和对照组之间有显著差异(χ2=5.065, P＜0.05;χ2=4.022,P＜0.05);SAD组ε2等位基因频率与对照组相比差异不明显.结论:结果提示ApoEε4等位基因为本地区老年人群的危险因素.     

2型糖尿病患者脂联素基因单核苷酸多态性与罗格列酮疗效的相关性研究

目的 研究脂联素基因（ADIPOQ）单核苷酸多态性（SNP）＋45与马来酸罗格列酮治疗2型糖尿病疗效的相关性。方法 选取103例新诊断2型糖尿病患者,口服马来酸罗格列酮24周,并定期检测糖脂代谢相关临床指标,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法检测脂联素基因SNP＋45（T／G）多态位点。结果 （1）103例2型糖尿病患者中,TT、TG、GG基因型频率分别为55．34％（57例）、35．92％（37例）、8．74％（9例）,T、G等位基因频率分别为73．30％、26．70％;（2）TG＋GG基因型患者的治疗有效率（56．41％）显著高于TT基因型患者（33．93％）,（P=0．0295）;多变量的Logistic回归分析发现基线糖化血红蛋白（HbAlc）和ADIPOQSNP＋45是影响该药物治疗有效性的独立相关因素;（3）马来酸罗格列酮治疗24周,1TT基因型和TG＋GG基因型患者的空腹血糖（FPG）、餐后2h血糖（2hPG）、HbAlc和稳态模式评估法计算的胰岛素抵抗（HOMA-IR）水平均较基线时（13．1±0．4,14．0±0．5）显著降低（分别为4．6±0．4、4．7±0．4）,差异有统计学意义;（4）24周各临床指标及其与基线的差值和脂联素基因SNP＋45无显著相关性。结论ADIPOQSNP＋45（T／G）与马来酸罗格列酮治疗2型糖尿病患者的有效性相关,是该药物治疗有效性的主要决定因素之一,TG＋GG基因型患者的治疗有效率高于TT基因型患者。     

载脂蛋白E基因多态性和Ⅱ型糖尿病肾病相关性的研究

目的研究载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与Ⅱ型糖尿病肾病的关系.方法以载脂蛋白E基因为候选基因,以相互之间无亲缘关系的56例Ⅱ型糖尿病未合并肾病的患者、58例Ⅱ型糖尿病肾病患者和76例正常对照者为对象,应用聚合酶链反应(PCR)扩增从白细胞中提取的载脂蛋白E基因DNA片段,以限制性内切酶Hha Ⅰ消化,经限制性片段长度多态性(RFLP)分析,区分6种ApoE的基因表型:E2/2、E2/3、E3/3、E3/4、E4/4.     

中国人群高血压病、糖尿病及冠心病与载脂蛋白E基因多态性

目的：研究载脂蛋白E（ApoE)基因多态性与中国人群高血压病（EH）、非胰岛素依赖性糖尿（NIDDM）及冠心病（CHD）的关联。方法：250例呈不同组合的患及90例正常对照用聚合酶链反应－限制性片段长度多态性（PCR－RFLP）方法检测ApoE基因型，比较基因型及等位基因频率分布。结果：（1）NIDDM及EH组ApoE基因型及等位基因频率与正常对照无显差异；（2）CHD组无论是否并EH及／或NIDDM，ε3／3基因型及ε3等位基因频率均显低于正常对照，而ε3／4基因型及ε4等位基因频率均显主于正常对照；（3）NIDDM合并 CHD组及EH合并CHD组中ε3／3基因型及ε等位基因频率均显低于正常对照，而ε3／4基因型及ε4等位基因频率均显高于正常对照。结论：ApoE基因多态性与中国人群CHD相关。这种关联亦见于EH或NIDDM合并CHD中，但ApoE基因仅是CHD发病的遗传学基础，而与是否合并EH及／或NIDDM无关。     

APPL1基因与2型糖尿病患者体脂含量及分布的相关性

目的 观察APPL1基因单核苷酸多态性(SNP)与体脂含量及分布的关系.方法 590例无血缘关系的上海地区中国人,糖耐量正常(NGT)者358名,2型糖尿病(T2DM)者232例.用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测rs3806622、rs4640525基因型.测定体重指数(BMI)、腰围(W)、臀围和股围.测定空腹血脂谱、空腹及糖负荷后2 h血糖、胰岛素和C肽水平.结果 不论在NGT组还是T2DM组,其BMI＞25 kg/m2与BMI≥25 kg/m2亚组间rs3806622、rs4640525基因型频率和等位基因频率比较差异均无统计学意义;T2DM组腰围亚组问rs3806622、rs4640525等位基因频率分布差异有统计学意义(均P＜0.05),腰围值高者G等位基因频率显著增高[0.084,W＜90 cm(0.022)],OR值分别为2.26(95%可信区间1.05～4.86)和4.13(95%可信区间1.21～14.09);经年龄、性别、BMI校正后,T2DM组rs3806622、rs4640525位点携带G等位基因者均较非携带G等位基因者腰围值高(P＜0.05);相关因素的逐步多元回归分析发现性别、BMI及rs4640525均独立相关因素(均P＜0.05).结论 APPL1基因SNP(rs3806622和rs4640525)与中国人2型糖尿病患者体脂分布相关.     

载脂蛋白E基因第四外显子多态性与血管性痴呆的关系

目的探讨载脂蛋白E（apolipoprotein E,ApoE）基因第四外显子多态性与血管性痴呆（Vascular dementia,VD）的关系。方法通过DNA直接测序的方法检查30例VD和30例正常老人ApoE基因第四外显子的多态性。结果ApoE基因第四外显子存在112位点T／C多态和158位点C／T的多态,未发现新的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,8NP）。ApoEε4等位基因频率（11.7％,8．5％）及ε4／4,ε3／4,ε2／4基因型合并后其基因型频率（22％,16．7％）在VD和对照组之间无显著差异（x^2=0．111,p〉0.05;x^2=0.759,p〉0.05）;VD组ε2等位基因频率与对照组相比差异不明显。结论结果提示ApoEε4等位基因不是本地区老年人群血管性痴呆的危险因素。     

APEX1单核苷酸多态性与肝癌易感性关系的研究

目的 探讨中国福建人群APEX1单核苷酸多态性(SNP)与肝细胞癌(HCC)易感性的关系. 方法 应用连接酶检测反应(LDR)及直接测序法检测APEX1 rs2307486、rs1130409及rs33956927 3个SNP位点,并进行连锁不平衡及单倍型分析,探讨3个SNP在福建HCC人群中的分布情况,并分析其与该人群HCC易感性的关系. 结果 相对于GG基因型,rs33956927位点的GA基因型增加了患HCC的风险(P=0.002),而rs2307486和rs1130409多态性与HCC易感性无关(P＞0.05). 结论 APEX1 rs33956927多态位点携带GA基因型人群可能对HCC更易感,APEX1 rs33956927多态性可作为筛查HCC好发的危险因素;rs2307486和rs1130409多态性与HCC的发生无关.     

脂联素基因5′端调控区 11391G/A核苷酸多态性与2型糖尿病发病的相关性

目的探讨中国人脂朕素基因SNP 11391G/A和 11371C/G位点变异与2型糖尿病发病的关系。方法运用PCR RFLP技术在258例（86例非糖尿病者和172例2型糖尿病患者）大连地区汉族人检测APN基因SNP 11377C/G和 11391G/A变异情况,分析其与2型糖尿病发病的相关性。结果 11377C/G多态性与糖尿病发病无关, 11391G/A多态性与2型糖尿病发病相关（χ2=7.662,P<0.005）。结论APN基因 11391A基因变异可能与变异携带者胰岛细胞代偿功能相关。     

过氧化氢酶单核苷酸多态性与氟斑牙相关性的研究

目的 探讨过氧化氢酶(CAT)单核苷酸多态性与氟斑牙是否存在关联。 方法 在贵州省氟病区收集氟斑牙患者195例,通过问卷调查收集研究对象的一般情况、饮食以及氟中毒相关信息,采用TaqMan方法分析CAT rs769217和rs2300182两个位点的单核苷酸多态性。 结果 单因素及多因素分析均未发现CAT rs769217及rs2300182位点不同遗传模式与氟斑牙有关; 但发现在钙摄入较多时(≥482 mg/d),rs769217位点AT+TT基因携带者相对于AA基因型携带者氟斑牙明显降低,而钙摄入较少时(<482 mg/d)该保护作用消失。交互作用分析发现,rs769217位点基因多态性与膳食钙摄入水平存在交互作用(P<0.05)。 结论 CAT rs2300182位点的单核苷酸多态性与氟斑牙风险之间无明显关联,CAT rs769217位点的单核苷酸多态性与氟斑牙风险降低有关,但这取决于钙的摄入量。     

贵州汉族人群肿瘤坏死因子-α基因启动子区的单核苷酸多态性

目的: 了解贵州汉族人群肿瘤坏死因子-α (tumor necrosis factor alpha, TNF-α)基因启动子区的基因多态性.方法: 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP) 和序列特异性引物-PCR(SSP-PCR) 方法,对贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区已知的5个多态性位点进行基因分型检测,并用统计学方法分析各位点基因型、等位基因频率及其组间差异.结果: 贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238(G,96%;A,4.0%)、-308(G,92%;A,8%)、-857(C,65.0%;T,35.0%)、-863(C,80.0%;A,20.0%)、-1 031(T,48.0%;C,52.0%).结论: 贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性具有独特的特征,这为TNF-α基因多态性与疾病的相关性研究提供了基础资料.     

ATP结合盒转运体A1基因多态性与2型糖尿病及肥胖的相关性

目的 研究上海地区汉族人群中，ATP结合盒转运体Al（ABCAl）基因位点rs2020927的单核苷酸多态性与2型糖尿病（T2DM）及肥胖发病的相关性。方法 选取上海地区无亲缘关系的T2DM患者440例，根据体质量指数（BMI）分为肥胖组（n=252，BMI〉25kg／m^2）和正常体质量组（n=188，BMI〈25kg／m^2）；另选取正常对照者315例。采用等位基因特异的实时PCR，对ABCAl基因位点rs2020927进行基因分型，并通过相关和Logistic回归分析，研究该位点与T2DM及肥胖的相关性。结果 ABCAl基因rs2020927位点基因型频率在不同组间有显著性差异（P=0．001），其中AA、AG、GG基因型频率在对照组人群中分别为43．8％、35．9％和20.3％；在正常体质量的T2DM组中分别为33％、53．2％和13．8％；在肥胖的T2DM组中分别为40．9％、47．2％和11．9％。基因型GG在T2DM肥胖组和对照组中有显著性差异（P=0．009），而T2DM正常体质量组和对照组之间无显著性差异（P〉0．05）。结论 中国上海汉族人群中，ABCAl基因多态性位点rs2020927可能与T2DM及肥胖的发病相关。     

白癜风易感基因单核苷酸多态性研究进展

白癜风是一种色素脱失性疾病,其发病受多种因素影响,其中遗传因素占据重要地位。单核苷酸多态性是遗传变异中最常见的一种,可通过候选基因分析、全基因组关联分析研究方法进行检测。近年来研究发现多个易感基因在白癜风发生发展中起着重要作用。本文按照基因功能对白癜风易感基因单核苷酸多态性进行了归纳与介绍。     

2型糖尿病家系脂联素基因多态性研究

目的:研究脂联素(adiponectin)APM1基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与2型糖尿病的关联性.方法:应用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性技术,选择3个APM1基因SPNs位点:-11377C＞G、 45T＞G和 276G＞T,对75个2型糖尿病家系(337例)进行基因分型,并以Genehunter软件分析单个SNP在家系中传递不平衡(transmission-disequilibrium,TDT)情况和多个SNPs所构成的单倍型传递情况,同时进行人体测量学、血糖、血脂等临床参数的检测.结果:(1)经TDT分析,未发现APM1基因SNPs单个位点在2型糖尿病患病子代中优势传递;(2)所检测的3个SNPs所构成的单倍型在患病子代中未见优势传递;(3)对-11377C＞G位点不同基因型生理、生化指标分析:在糖代谢异常组,GG基因型体质量指数(BMI)、腰围(WC)明显高于CC基因型(P=0.032,P=0.030);G等位基因携带者HDL-C水平低于CC基因型(P=0.006),而空腹胰岛素(FINS)水平高于CC基因型(P=0.011);在家系正常对照组,G等位基因携带者FINS水平明显低于CC基因型(P=0.021);(4)对 45T＞G多态性的分析:在糖代谢异常组,GG基因型BMI明显高于TT基因型(P=0.036),而FINS水平明显低于TT基因型(P=0.014);(5)对 276G＞T多态性的研究:在家系正常组,T等位基因携带者的BMI明显低于GG基因型(P=0.043).结论:未发现APM1基因3个多态性位点与2型糖尿病存在相关性.但APM1基因对胰岛B细胞功能、肥胖可能有一定影响.     

蛋白激酶Cξ亚型基因内SNP功能分析

目的对中国北方汉族人群2型糖尿病易感基因蛋白激酶Cξ亚型(PRKCZ)基因内的5个单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphismSNP)标记在疾病发生中的作用进行分析。方法通过生物信息学比对及报告基因活性测定等方法分析PRKCZ基因内5个SNP位点对基因表达的影响。结果PRKCZ基因中rs427811和rs809912位点两种等位基因重组质粒报告基因活性存在明显差异,提示这两个位点可能影响PRKCZ基因表达。结论PRKCZ基因中两个SNP位点可能通过影响基因的表达水平而在中国人2型糖尿病发生中发挥作用。     

高血压相关基因HSG上游调控序列单核苷酸多态性的发现及其与高血压的关联

通过研究不同人群中新发现的高血压相关基因HSG基因多态性 ,以揭示高血压相关基因多态性与高血压的关系。选取 74例正常对照 ,其中男性 3 8例 ,女性 3 6例 ,平均年龄 (5 4.1 5± 7.77)岁 ;原发性高血压患者 5 1人 ,其中男性 2 7人 ,女性 2 4人 ,平均年龄 (5 7.2 5± 7.97)岁 ;高血压家族患者 2 0例 ,其中女性 1 1人 ,男性 9人 ,平均 (4 9.97±6.93 )岁。取外周静脉血并提取DNA ,进行PCR扩增法获得相应的产物 ,应用DNA测序法直接得到PCR产物的核苷酸序列后比较不同人群的该片段的碱基组成及其特征。结果 :肌酐 (Cr)和尿素氮 (BUN)在高血压组明显高于正常血压组 ,而高血压组和高血压家族组的收缩压和舒张压均明显高于正常血压组 (P <0 .0 1 ,P <0 .0 5 ) ;高血压组的血浆血管紧张素Ⅱ (AngⅡ )、内皮素 (ET)、利钠多肽 (心钠素 ,ANP)及降钙素基因相关肽 (CGRP)质量浓度均高于正常血压组 ,且两者之间存在着明显的差异 (P <0 .0 1 ) ;HSG基因 1 2位内含子的 1 40位点在 3种人群中存在G点删除变异。且其基因频率在高血压家族组、高血压组、正常人之间存在着明显的差别 (0 .80、0 .41、0 ,P <0 .0 0 1 )。提示 :肾功能的指标 (Cr和BUN)可能可以较早地反映高血压的进展和靶器官损害状况。血浆AngⅡ、ET、ANP及C     

结直肠癌PINCH基因单核苷酸多态性的小样本检测

目的 筛选结直肠癌患者PINCH基因单核苷酸多态性(SNP)位点,初步探讨PINCH基因SNP与结直肠癌相关性,为后续结直肠癌风险预测提供参考.方法 抽提36例结直肠癌患者和30例非结直肠癌人群外周血单个核细胞DNA;同时对术中采集的配对的36例正常黏膜组织匀浆后提取DNA.对PINCH基因外显子区进行PCR扩增并对产物进行测序分析.结果 PINCH基因外显子区域内共筛查出10个SNP,其中rs74632558的SNP基因型在结直肠癌和非结直肠癌人群之间有差异,但无统计学意义,同时发现了3个未登陆的SNP.结论 PINCH基因外显子区rs74632558 SNP可能与结直肠癌发生有一定关系.