载脂蛋白M基因rs707921位点多态性与冠心病易感性的关系

目的检测载脂蛋白M(ApoM)基因rs707921位点的基因多态性,探讨其与冠心病(CHD)的相关性。方法采用单荧光标记探针技术检测111例CHD患者及248例对照组的ApoM rs707921位点单核苷酸多态性,分析其基因型和等位基因频率的分布情况。结果 ApoM rs707921位点3种基因型(AA型、AC型和CC型)在CHD组中分布频率为1.8%、13.5%和84.7%,在对照组中分布频率为2.0%、25.4%和72.6%,两组差异有统计学意义(P=0.039);ApoM rs707921位点A、C等位基因的频率在CHD组和对照组中分布频率分别为8.6%、91.4%和14.7%、85.3%,两组比较差异有统计学意义(P=0.023)。CHD组中AC+AA基因型者甘油三酯水平显著低于CC基因型者(P=0.043)。CHD组rs707921位点多态性不同基因型间冠状动脉病变严重程度差异无统计学意义(P0.05)。结论ApoM基因rs707921位点A等位基因可能降低CHD的发病风险,但与CHD的严重程度无关。     

肝细胞癌患者IL-18基因-137G/C和-607A/C位点单核苷酸多态性变化及其意义探讨

目的探讨肝细胞癌(HCC)患者白细胞介素-18(IL-18)基因-137G/C和-607A/C位点单核苷酸多态性(SNP)的变化。方法在178例伴有HBV感染的HCC患者和251例健康人,取外周静脉血提取DNA,采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)行基因分型,测定IL-18基因-137G/C和-607A/C位点SNP。结果 HCC患者和健康人IL-18-37 G/C基因GG基因型、GC基因型和CC基因型分布频率分别为75.3%对47.0%(P0.05)、20.8%对51.4%(P0.05)和3.9%对1.6%(P0.05),G等位基因和C等位基因分布频率分别为93.6%对72.7%(P0.05)和6.4%对27.3%(P0.05);HCC患者和健康人IL-18-607A/C位点AA基因型、AC基因型和CC基因型分布频率分别为37.6%对13.5%(P0.05)、43.3%对66.9%(P0.05)和19.1%对19.5%(P0.05),A等位基因和C等位基因分布频率分别59.3%对47.0%(P0.05)和40.7%对53.0%(P0.05);HCC组IL-18-137G/C位点的GG基因和G等位基因频率显著高于健康人(P0.05),HCC组IL-18-607A/C位点的AA基因和A等位基因频率也显著高于健康人(P0.05),提示携带IL-18-137G/C和IL-18-607A/C位点基因型和A等位基因者罹患HCC的风险增加。结论携带IL-18基因-137G/C位点GG基因型和G等位基因以及-607A/C位点AA基因型和A等位基因者可能更容易发生HCC,对HBV感染者筛查这些基因可能有助于早期发现肝肿瘤,以利于早期处理和改善预后。     

Lp-PLA2基因多态性与急性心肌梗死患者的易感性和临床特征的相关性研究

目的探讨脂蛋白相关磷脂酶A2(Lp-PLA2)基因多态性与急性心肌梗死(AMI)易感性之间的关系。方法选取2017年1月～2018年2月于西安交通大学医学院第一附属医院住院的AMI患者176例(AMI组)以及健康体检志愿者191例(对照组),采集受试者血清标本,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测Lp-PLA2基因rs1805017、rs16874954、rs1051931位点单核苷酸多态性(SNP);采用Logistic回归分析Lp-PLA2基因突变与AMI易感性的相关性。结果 rs1805017位点检测到GG、GA、AA三种基因型;rs16874954位点检测到CC、AC两种基因型;rs1051931位点检测到AA、AC、CC三种基因型;AMI组rs1805017位点AA基因型以及rs16874954位点CC基因分布频率相对对照组更高(P0.05)。rs1805017位点GA+AA基因型患者三酰甘油(TG)水平高于GG基因型患者,而高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平明显低于GG基因型患者(P0.05);rs16874954位点AC基因型患者TG水平明显高于CC基因型患者(P0.05);其余血脂水平在不同基因型患者之间并无统计学差异(P0.05)。经单因素二元Logisitic回归分析,rs1805017(OR=0.788,95%CI:0.713～0.923,P0.05)、rs16874954(OR=0.923,95%CI:0.859～0.983,P0.05)位点SNP与AMI密切相关。多因素回归分析结果表明rs1805017位点多态性与AMI发病独立相关(OR=0.839,95%CI:0.804～0.975,P0.05)。结论本研究人群Lp-PLA2基因rs1805017、rs16874954多态性位点与急性心肌梗死的发生有关,而rs1051931位点SNP与AMI的发生可能无直接相关性。     

云南地区汉族2型糖尿病患者二甲基精氨酸二甲胺水解酶1、二甲基精氨酸二甲胺水解酶2基因单核苷酸多态性与动脉粥样硬化关系的研究

目的探讨云南地区汉族T2DM患者发生动脉粥样硬化(AS)与二甲基精氨酸二甲胺水解酶1(DDAH1)基因rs233113、二甲基精氨酸二甲胺水解酶2(DDAH2)基因rs805304单核苷酸多态性(SNP)的相关性。方法选取2016年10月至2018年12月于昆明医科大学第一附属医院内分泌二科住院的T2DM患者464例,根据有无AS分为单纯T2DM组(n=208)和合并AS组(AS,n=256)。另选取同期我院体检健康人群294名为正常对照(NC)组。ELISA法检测各组血浆非对称性二甲基精氨酸(ADMA)的浓度,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析法(PCR-RFLP)对DDAH1、DDAH2基因SNP进行基因分型。结果 T2DM、AS组CC基因型频率高于NC组(P0.05),AS组CC基因型频率高于T2DM组(P0.05)。AS组DDAH1基因rs233113 AA基因型ADMA水平低于TT+AT基因型(P0.05),DDAH2基因rs805304 CC基因型LDL-C水平高于AA、AC基因型(P0.05)。Logistic回归分析显示,SBP、FPG、LDL-C、ADMA、DDAH2基因rs805304位点CC基因型是T2DM患者发生AS的影响因素。结论云南地区汉族T2DM患者DDAH2基因rs805304CC基因型可能与AS易感性相关,携带该基因型患者LDL-C水平升高。DDAH1基因rs233113位点SNP可能与T2DM发生AS无相关性,携带该位点AA基因型患者ADMA水平降低。     

DNA修复基因XPC和XPG单核苷酸多态性与肝细胞癌易感性的关系

目的 探讨广西地区DNA修复基因XPC(Ala499Va1、Lys939G1n)和XPG(His1104Asp)单核苷酸多态性与肝细胞癌(HCC)易感性的关系.方法 采用以医院为基础的病例对照研究.经组织病理学确诊的HCC患者500例,相同地区,年龄、性别和民族频数匹配的非肿瘤患者507例.采用TaqMan MGB实时荧光定量PCR检测XPC和XPG基因多态性,比较不同基因型与HCC患病风险的关系.分别用t检验和X2检验对计量资料和计数资料进行统计分析;采用非条件的Logistic同归计算比值比(OR)及其95%可信区间(CI).结果 与XPC基因Ala499Va1位点CC基因型相比,CT或者TT基因型与HCC患病风险无相关性(校正OR=1.34,95%CI:0.85～2.12;校正OR=1.30,95%CI:0.68～2.51);与Lys939G1n位点AA基因理相比,AC或者CC基因型与HCC患病风险无相关性(校正OR=1.20,95%CI:0.78～1.85;校正OR=1.81,95%CI:0.88～3.73).与XPG基因His1104Asp位点CC基因型相比,CG或者GG基因型与HCC患病风险尢相关性(校正OR=0.85,95%CI:0.56～1.27;校正OR=1.12,95%CI:0.67～1.87).分层分析结果显示,与携带XPC基因Lys939G1n位点AA基因型女性相比,携带AC+CC基因型的女性患HCC的风险增加2.17倍(95%CI:01～4.64).结论 XPC基因Ala499Va1和Lys939G1n位点以及XPG基因His1104Asp位点SNP的单独效应可能与HCC易感性无相关性,但是XPC基因Lys939G1n位点C等位基因可协同增加女性患HCC的风险.     

环指蛋白145基因多态性与急性心肌梗死的关联性研究

目的探讨新疆地区维吾尔族人群环指蛋白145(RNF145)基因单核苷酸多态性(SNP)与急性心肌梗死(AMI)的关联性。方法选取2016年6月至2020年6月在新疆医科大学第一附属医院心脏中心住院的患者,根据是否为AMI,分为AMI组(410例)和对照组(484例)。比较两组的基线资料。采用改进的多重高温连接酶检测反应技术对RNF145基因3个SNP位点(rs12188266、rs17056583、rs7732603)进行基因分型。采用logistic回归分析RNF145基因SNP位点与AMI发病的关系。结果 AMI组中有饮酒史、合并高血压、糖尿病病史的患者比例以及收缩压、总胆固醇水平均高于对照组,差异均有统计学意义(均为P0.05)。RNF145基因rs17056583和rs7732603位点的基因型和等位基因比较均有统计学差异(均为P0.05)。在校正饮酒、合并疾病及血清学指标后,logistic回归分析结果显示,新疆维吾尔族人群中rs17056583位点的CC基因型患AMI风险是GC+GG基因型的2.891倍(OR=2.891,95%CI:1.608～5.196,P0.001)。rs7732603的CC基因型患AMI的风险也明显高于AA和AC基因型者(OR=1.860,95%CI:1.201～2.882,P=0.005)。结论在新疆地区维吾尔族人群中RNF145基因SNP与AMI具有相关性,rs17056583的CC基因型可能是AMI发病的危险因素,且携带rs7732603位点C等位基因者患AMI的风险也显著增加。     

SLC30A8、CDKN2A/2B、HHEX、TCF7L2基因多态性与中国东北汉族人2型糖尿病的关联

目的探讨SLC30A8、CDKN2A/2B、HHEX、TCF7L2基因多态性与中国东北汉族人群2型糖尿病(T2DM)的相关性。方法应用连接酶检测反应(LDR)技术对中国吉林省长春地区113例T2DM患者及107例正常对照(NC)者SLC30A8基因rs13266634位点、CDKN2A/2B基因rs10811661位点、HHEX基因rs1111875位点、TCF7L2基因rs7903146位点的SNP进行检测。结果 SLC30A8(rs13266634)CC、CT基因型的空腹胰岛素(FINS)、胰岛B细胞功能(HOMA-B)均低于TT基因型(P0.05),总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)均高于TT基因型(P0.05),CC基因型的空腹血糖(FPG)高于TT基因型(P0.05)。三组CC、CT、TT基因型合并心血管并发症的构成比,差异有统计学意义(P0.05)。CDKN2A/2B(rs10811661)TT、CT基因型的FINS、HOMA-B均低于CC基因型(P0.05),FPG、糖化血红蛋白(Hb A1c)、TC均高于CC基因型(P0.05),TT基因型的TG高于CC基因型(P0.05)。三组CC、CT、TT基因型合并微血管并发症的构成比差异有统计学意义(P0.05)。HHEX(rs1111875)GG、GA基因型的FINS、HOMA-B均低于AA基因型(P0.01),FPG、TC、TG均高于AA基因型,GG基因组的低密度脂蛋白胆固醇(LDL)-C高于AA基因组(P0.05)。三组GG、GA、AA基因型合并心血管并发症的构成比差异有统计学意义(P0.05)。结论 SLC30A8基因多态性位点rs13266634、HHEX基因多态性位点rs1111875与T2DM心血管并发症存在一定的相关性,CDKN2A/2B基因多态性位点rs10811661与T2DM微血管并发症存在一定的相关性。     

白细胞介素-18基因编码区105位点A/C多态性与冠心病易感性的关系

目的:研究IL-18基因编码区105位点多态性与冠心病遗传易感性的关系。方法:采用多聚酶链反应限制性片段长度多态性分析法检测162例冠心病患者和134例对照者IL-18基因编码区105位点基因型,分析其与冠心病易感性的关系。结果:IL-18基因编码区105位点多态性中AA、AC、CC3种基因型在冠心病组和对照组中的频率分别为70.4%、29.0%、0.6%和88.1%、11.9%、0%。AC基因型患者患冠心病风险为AA基因型者的3.041倍(95%CI1.631～5.669),C等位基因携带者发生冠心病的风险是A等位基因携带者的2.806倍(95%CI1.556～5.061)(均P0.01)。结论:IL-18基因编码区105位点多态性与福建地区部分汉族人群冠心病的发生存在相关性,携带AC、CC基因型人群发生冠心病风险较高。     

PR方案治疗慢性丙型肝炎患者ITPA基因rs1127354位点多态性与利巴韦林相关性溶血关系探讨*

目的 探讨应用标准抗病毒(PR)方案治疗慢性丙型肝炎(CHC)患者三磷酸次黄嘌呤核苷(ITPA)基因多态性对抗病毒疗效及其对利巴韦林(RBV)相关性溶血的影响。方法 2016年3月~2018年3月我院收治的CHC患者235例,给予聚乙二醇化干扰素α-2a联合RBV治疗24～48 w。采用基因测序法检测血ITPA基因rs1127354位点多态性。结果 经检测,发现ITPA基因型rs1127354位点为CC型193例和AA/AC型42例;在完成24周疗程的188例(CC型152例和AA/AC型36例)CHC患者中, AA/AC型患者快速病毒学应答和早期病毒学应答率分别为44.4%和47.2%,与CC型的42.1%和42.7%比,无显著性差异(P>0.05),而持续病毒学应答率为72.2%,显著高于CC型的53.3%(P<0.05);在治疗4周、8周、12周和24周,AA/AC型患者Hb水平分别为(138.2±14.7) g/L、(130.5±12.6) g/L、(123.7±12.5)g/L和(118.0±10.2)g/L,显著高于CC型【分别为(132.3±13.9)g/L、(113.1±10.5)g/L、(108.4±9.4)g/L和(106.7±11.3)g/L,P＜0.05】。结论 在PR方案治疗的慢性丙型肝炎患者,ITPA基因(rs1127354)CC基因型较AA/AC基因型更易发生RBV 相关性溶血,而ITPA基因型与抗病毒效果密切相关,临床应加以重视和预防性处理。     

慢性丙型肝炎患者病毒基因型与IL-28B基因型分布

目的：了解慢性丙型肝炎患者白细胞介素-28B（IL-28B）基因型多态性分布的特点及其临床意义。方法在27例慢性丙型肝炎患者,分离外周血细胞DNA,采用IPLEX Gold法检测宿主IL-28B基因多态性;分析患者IL-28B基因型与血清丙型肝炎病毒（HCV）基因型、HCV RNA载量和肝功能指标的相关性。结果在27例慢性丙型肝炎患者中,感染HCV基因1型1例（3.7%）,1b基因型7例（25.9%）,其它基因型19例（19/27,70.4%）;在IL-28B基因型中,rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型及rs8099917 TT基因型共24例（88.9%）,而IL28B rs12979860 CT基因型、rs12980275 GA基因型和rs8099917 GT基因型共3例（11.1%）;在HCV基因1型或1b型感染者中,IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占62.5%（5/8）,而HCV其他基因型感染者IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占100%（19/19）;HCV基因1型或1b型感染者与HCV其他基因型感染者比,其IL28B rs12979860位点、rs12980275位点和rs8099917位点基因型分布有显著性差异（P＆lt;0.01）;IL-28B基因多态性分布与患者血清HCV RNA载量或肝功能指标的变化无显著性相关。结论本组慢性丙型肝炎患者HCV基因型大多为非1型;大多数感染者IL-28B基因为rs12979860 CC、rs12980275 AA和rs8099917 TT基因型。     

肝细胞癌患者外周血PD-L1基因多态性与肝细胞癌易感性及预后关系研究*

目的 探讨肝细胞癌（HCC）患者血程序性死亡配体（PD-L）1基因多态性与易感性和预后之间的关系。方法 2010年1月~2015年6月诊治的HCC患者100例和肝功能正常的正常人100例,采集外周血,采用直接测序法和聚合酶链反应-单链构象多态性分析（PCR-SSCP）法检测PD-L1基因rs4143185、rs17718883和rs28906583三个位点的单核苷酸多态性（SNP）,分析其与肝细胞癌易感性和预后之间的关系。结果 携带rs2890658的AC杂合突变基因可以降低肝细胞癌的发病风险（OR=0.391,P<0.05）,携带rs17718883的CG杂合突变基因也会降低肝细胞癌的发病风险（OR=0.009,P<0.05）;rs2890658位点的3个基因型AA、AC和CC的中位生存时间分别为18（15,21） m、20（16,22） m和19（15,21） m,组间差异无统计学意义（P>0.05）,合并AC和CC基因型者,中位生存时间为20（16,23） m,明显比AA基因型者长,差异有统计学意义（P<0.05）;携带rs4143185位点的3个基因型CC、GC和GC者中位生存时间分别为16（13,19）m、20（15,23） m和17（15,21） m,组间差异有统计学意义（P<0.05）,合并CG+GG者中位生存时间为21（17,24）m,明显长于CC者,差异有统计学意义（P<0.05）;COX回归分析显示,携带rs4143185突变基因者可以获得较好的预后（HR<1,P<0.05）。结论 检测外周血PD-L1基因多态性可能有助于筛选HCC高危人群中的高危人群,并可能对预测患者预后有帮助。     

血管紧张素Ⅱ-1型受体基因A1166C多态性与心房颤动相关性研究

目的探讨遗传背景对AF的影响。方法房颤组121例、对照组100例,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法鉴定AT1R基因1166位点基因型进行比较,Logistic回归分析基因型对房颤的独立危险性。结果房颤组AC+CC基因型频率、C等位基因频率均较对照组增高(P分别为0.017、0.013),与AA型比较,AC型+CC型者发生AF的风险率为3.657(95%CI:1.181～11.322),基因型、收缩压参与增加总体AF发生的概率(P分别为0.019、0.002),以AA型为参照,AC型+CC型发生AF的OR为4.132(95%CI:1.263～13.513)。结论携带AT1R基因1166位点C等位基因者有增加发生AF风险的倾向。     

前列腺干细胞抗原基因和磷脂酶CE1基因多态性与老年幽门螺旋杆菌感染胃溃疡的易感性及对临床预后的影响

目的探讨前列腺干细胞抗原基因(PSCA)和磷脂酶(PL)CE1基因多态性与老年幽门螺旋杆菌(Hp)感染胃溃疡的易感性及对临床预后的影响。方法采用病例-对照研究设计,选取130例胃溃疡并且Hp检查为阳性的老年患者作为病例组,另外按性别和年龄匹配的胃溃疡并且Hp检查为阴性的老年患者作为对照组。所有患者治疗前抽取外周静脉血并提取DNA,设计PSCA(rs2294008)和PLCE1(rs11599672)聚合酶链反应(PCR)引物进行PCR扩增,扩增产物采用DNA测序分析PSCA和PLCE1基因类型,采用Logistic回归计算校正相对危险度(OR)和95%置信区间(95%CI)评价PSCA和PLCE1基因多态性与老年Hp感染胃溃疡的易感性。结果 1两组年龄、性别、病程、病变部位差异均无统计学意义(P0.05);2与rs2294008基因型CC比较,基因型为CT、TT和CT/TT的患者Hp感染危险性降低(P0.01);3与PLCE1 rs11599672基因型AA比较,基因型为AC、CC和AC/CC的患者Hp感染危险性降低(P0.05);4不同PSCA多态位点rs2294008和LCEl多态位点rs11599672患者的Hp根除率和溃疡愈合率差异具有统计意义(P0.01)。结论 PSCA rs2294008基因型CC和PLCE1 rs11599672基因型AA可增加Hp感染胃溃疡易感性,并且显著降低临床预后。     

IL-18基因105A/C多态性与胃癌的相关性

目的探讨白细胞介素(IL)-18基因105A/C多态性与胃癌发病风险的相关性。方法从该校附属医院选取204例胃癌患者进入病例组,使用同时期参与胃癌早期筛检的社区人群100例作为对照组,使用回顾性的病例-对照研究方式,通过聚合酶链反应(PCR)与对个样本IL-18基因105A/C位点进行基因分型,并统计分析两组差异显著性。结果 PCR分型结果显示,胃癌患者中IL-18基因105位点分型中,AA型、CA型与CC型频率分别为62.5%,26.9%与10.6%;而健康人中AA型、CA型与CC型频率分别为81%,17%与2%,两组差异显著(P<0.05)。相对风险分析显示,等位基因C的携带者(包括AC、CC两种基因型)患胃癌的风险是AA基因型的2.562倍(OR=2.562,95%CI:1.476⁴.448),差异具有统计学意义(P=0.001)。结论携带IL-18基因105位点等位基因C的人群患胃癌风险显著高于基因型为AA的人群。     

维生素D结合蛋白基因遗传变异与海南省老龄慢性鼻窦炎的关联性

目的探讨维生素D结合蛋白(VDBP)基因GC遗传变异与海南者老龄慢性鼻窦炎的关联性。方法 37例老龄慢性鼻窦炎患者作为病例组,99例健康老年体检者作为对照组,检测GC基因三个多态性位点rs7041、rs222016、rs4588的基因型,利用统计学在线分析软件SNPStats进行数据分析。结果三个单核苷酸多态性(SNP)位点均可以检测出三种基因型,其中rs7041的三个基因型TT、GT、GG在病例组的发生率为20例(54.1%)、14例(37.8%)、3例(8.1%),在对照组分别为44例(44.4%)、41例(41.4%)、14例(14.2%)。rs222016的三种基因型AA、AG、GG在病例组的发生率分别为14例(37.8%)、17例(46.0%)、6例(16.2%),在对照组分别为34例(34.3%)、39例(39.4%)、26例(26.3%)。rs4588的三种基因型CC、AC、AA在病例组的发生率为17例(46.0%)、18例(48.6%)、2例(5.4%),在对照组分别为59例(59.6%)、33例(33.3%)、7例(7.1%)。三个SNP位点基因型及等位基因在组间的分布频率均无统计学意义(P0.05)。结论 GC基因三个多态性位点rs7041、rs222016、rs4588的遗传差异可能与海南老龄慢性鼻窦炎无关联。     

DNA甲基化酶3b多态性与乳腺癌易感性的关系

目的探讨DNA甲基化酶(DNMT)3b基因单核苷酸多态性(SNPs)与乳腺癌易感性的关系。方法采用直接测序法检测157例女性乳腺癌患者(疾病组)和同期162例健康女性(对照组)DNMT3b基因rs6119954、rs4911107、rs4911259和rs2424913位点多态性分布情况,采用比值比(OR)及95%可信区间(CI)表示DNMT3b多态性与乳腺癌易感性的关系,同时分析以上位点多态性与临床病理参数(年龄、肿瘤大小、侧别、TNM分期、淋巴结转移、绝经状态、乳腺良性病史及HER-2表达)的关系。结果疾病组和对照组rs6119954、rs4911107、rs4911259和rs2424913位点多态性基因型分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡。两组DNMT3b rs4911107和rs4911259基因型分布无统计学差异(P<0.05);两组DNMT3b rs6119954位点的GG、GA和AA型分布频率及DNMT3b rs2424913位点的TT、CT和CC型分布频率均有统计学意义(P<0.05)。DNMT3b rs4911107和rs4911259位点各基因型及等位基因分布与乳腺癌发病风险无关(P>0.05)。DNMT3b rs6119954、rs2424913位点上,携带突变等位基因者的乳腺癌风险升高,均有统计学意义(P<0.05)。DNMT3b rs6119954基因型分布与肿瘤大小、TNM分期及淋巴结转移有关,而DNMT3b rs2424913基因型分布与TNM分期及乳腺良性病史有关(P<0.05)。结论 DNMT3b rs4911107和rs4911259位点多态性与乳腺癌易感性有关,且其突变基因型增加了乳腺癌的发病风险。     

中国藏族PSCA基因rs2294008多态性与胃癌遗传易感性的关系

目的:研究前列腺干细胞抗原基因(prostatestem cell antigen gene,PSCA)rs2294008位点多态性与中国藏族胃癌患者遗传易感性的关系.方法:收集185例藏族胃癌患者与200例健康人群的外周血样本,提取基因组DNA,采用dHPLC方法进行PSCA基因rs2294008位点分型.结果:PSCA基因rs2294008位点3种基因型C C、C T、T T在胃癌病例组中频率分别为:40.00%、48.65%和11.35%,而在对照组中分别为54.00%、39.50%和6.50%.与CC型比较,携带CT,TT型基因型者胃癌发生的危险性增加,OR值分别为1.66(95%CI 1.09-2.54)和2.36(95%CI 1.11-5.00).结论:PSCA基因rs2294008位点CT,TT基因型增加中国藏族人群的胃癌易感性.     

雌激素受体基因多态性与肝细胞癌易感性的Meta分析

目的系统评价雌激素受体(estrogen receptor,ER)基因多态性与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的关系.方法采用Coehrane系统评价方法,检索Conchrane Library、Pub Med,EMBASE及万方、维普、知网等数据库,筛选相关文献数据后,综合评价ER各基因型在HCC组与对照组中是否有差异.采用I~2对异质性进行定量分析,计数资料采用比值比(OR)及95%可信区间(95%CI)表示,应用Review Manager5.3软件包进行统计分析.结果共纳入7篇文献,累计样本量2343例;Meta分析结果表明,携带ERα的PvuⅡ及rs2077647基因多态性的三种基因型(T,TT,CC)与HCC有关,但各研究间存在明显异质性(P0.05),进行敏感性分析后,异质性明显减小(P0.05).携带ERα XbaI基因多态性的三种基因型(A、AA、GG)及ERβ AluI的两种基因型(G、GG)与HCC有关.ERβ AluI的隐性模型AA与HCC无关(P0.05).另两个位点(ERαrs1801132,ERβRsa I)基因多态性与HCC的相关性无统计学意义(P值分别为0.59及0.15).结论ERα的PvuⅡ、XbaI、rs2077647及ERβ的AluI位点基因多态性与HCC相关,ERαrs1801132和ERβRsaI基因多态性与HCC无关.     

ITPA基因变异与干扰素联合利巴韦林治疗过程中发生贫血的相关性

目的探讨C20orf194基因rs6051702位点和ITPA基因rs1127354位点与慢性丙型肝炎治疗过程中利巴韦林引起的溶血性贫血之间的相关性。方法入选慢性丙型肝炎患者742例、健康人群203例,提取上述两组人群的基因组DNA进行两个位点的焦磷酸测序;对208名慢性丙型肝炎患者进行干扰素联合利巴韦林抗病毒治疗,并在抗病毒治疗的基线、2 w、4 w、12 w对患者进行血常规、HCV RNA定量检测。用SAS9.0软件进行分析。结果 (1)我国健康人群rs6051702及rs1127354位点的最小等位基因频率分别为15.3%、15.8%,与欧洲和日本接近,但水平略低。(2)2、4、12 w血红蛋白下降量与rs1127354位点的不同基因型的关系有统计学意义(均P<0.05),A等位基因具有保护作用。(3)2、4、12 w血红蛋白下降量与rs6051702位点的不同基因型的关系无显著差异(均P>0.05)。(4)rs1127354位点4 w血红蛋白降低超过3 g/dl的CC组与AC+AA组存在差别(P=0.001)。结论 (1)rs6051702位点、rs1127354位点在慢性HCV感染者、健康人群之间没有显著差异。(2)rs6051702位点与抗HCV治疗过程中血红蛋白下降量无相关性。(3)ITPA基因rs1127354位点与抗HCV治疗过程中血红蛋白下降量呈明显相关,含A等位基因(AC和AA型)的患者贫血程度较CC型的低,提示A等位基因为保护基因,可用来预测患者抗HCV治疗过程中血红蛋白下降的程度,并指导早期调整利巴韦林剂量。     

IL28B基因多态性与HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者聚乙二醇化干扰素α应答的关系

目的探讨IL28B基因多态性与HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者聚乙二醇化干扰素α(PEG-IFN)治疗应答的关系。方法采集212例接受PEG-IFN治疗48周的HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者外周血,提取基因组DNA,应用时间飞行质谱技术(MassARRAY)检测IL28B基因的3个SNP位点rs12980275、rs12979860、rs8099917的多态性。应答定义为:PEG-IFN治疗48周,患者HBV DNA<200 IU/mL、HBeAg血清学转换及ALT复常。结果应答患者为74例,无应答者138例,应答率为34.9%。HBV基因分型以C型为主(C型117例,B型95例)。rs12980275基因型AA和N-AA(AG/GG)的比例分别为77.8%和22.2%;rs12979860基因型CC和N-CC(CT/TT)的比例分别为78.3%和21.7%;rs8099917基因型TT和N-TT(TG/GG)的比例分别为79.2%和20.8%。这3个SNP位点干扰素治疗应答组和非应答组中等位基因的频率和基因型的分布差异均有统计学意义(P<0.05)。在多因素分析中,校正了性别、年龄、HBV基因型、基线HBV DNA水平及基线ALT水平后,发现IL28B野生纯合基因型(AA、CC和TT型)是PEGIFN高应答率的独立预测因素。其中rs12980275基因型AA、N-AA的有效率分别为38.8%、21.3%(OR 2.70,95%CI1.21~6.01;P=0.015);rs12979860基因型CC、N-CC的有效率分别为38.6%、21.7%(OR 2.56,95%CI 1.15~5.67;P=0.021);rs8099917基因型TT、N-TT的有效率分别为38.7%、20.5%(OR 2.80,95%CI 1.23~6.39;P=0.015)。此外,还发现了一个由rs12980275和rs12979860组成的单体域,其中单体型A-C与干扰素高应答率显著相关(OR2.53,95%CI 1.20~5.34;P=0.015)。结论IL28B基因多态性与HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者对PEG-IFN治疗的应答密切相关,IL28B野生纯合基因型(AA、CC和TT型)是PEG-IFN高应答率的独立预测因素。