一起奥密克戎变异株引起的新型冠状病毒感染本土疫情流行特征与传播动力学分析

目的 分析云南省边境某县一起由奥密克戎变异株（BA. 2）引起的新型冠状病毒感染（新冠）本土疫情的流行特征及传播动力情况，为今后新冠疫情防控策略制定提供参考依据。方法 收集2022年4月8—25日云南省边境某县报告新冠阳性病例的个案信息和流行病学调查资料，采用描述流行病学方法及传染病传播动力学方法进行分析。结果 本次疫情共报告202例病例，经测序为奥密克戎变异株BA. 2；男女性别比1∶1.6，各年龄段、不同疫苗接种史的人群均有发病；出现51个家庭聚集性发病；潜伏期（2.38±2.20） d，代间距（2.85±2.11） d；实时再生数（Rt）最高时达到4.76 (95%CI:3.37～6.39)，但在实施防控措施约9 d后，Rt迅速下降至1以内，与防控效果相呼应。结论 奥密克戎变异株的潜伏期短、代际传播时间短、传播隐匿且速度快、容易造成聚集性发病，防控部门应进行早期疫情研判和采取有效的防控措施，对及时、快速地控制住疫情态势发展具有至关重要的作用。     

淮安市1起由奥密克戎变异株BA.5.2引起的聚集性疫情的调查分析

目的 了解1起由奥密克戎变异株引起的新型冠状病毒肺炎(简称“新冠”)聚集性疫情流行病学特点。方法 对本起疫情进行流行病学调查、实验室检测和序列分析，并进行溯源分析。结果 本起疫情持续时间为2022年11月1—6日，报告新冠感染者13例，以男性为主(占61.5%),中位年龄为52岁；包括无症状感染者10例(占76.9%)、确诊病例轻型2例(占15.4%)和普通型1例(占7.7%)。病例病毒基因测序结果显示为奥密克戎变异株BA.5.2,与邻省“10.04”疫情1例本土病例感染毒株高度同源。结论 本起疫情高度怀疑为外省输入引发，病毒株为奥密克戎变异株BA.5.2。     

四川省首起由新型冠状病毒奥密克戎变异株BA.2.12.1引起的本土疫情流行特征及其溯源分析

目的 对四川省首起由新型冠状病毒奥密克戎变异株BA.2.12.1引起的本土聚集性疫情进行系统分析，对于了解新变异株的特性具有重要意义；对其感染来源及传播链进行调查分析，为新型冠状病毒肺炎及其他传染病疫情的溯源调查和防控提供参考。方法 收集、录入、整理四川省2022年7月15日至7月25日新型冠状病毒肺炎本土病例的流行病学调查报告、实验室检测结果、大数据追踪的轨迹信息及其他疫情相关数据，进行统计和图表绘制，分析其流行特征、实时再生数Rt值及其趋势、感染途径、病例间传播关系等，判定首例病例及其感染来源。结果 本次疫情共报告本土病例149例，涉及3市16区县，50～59岁组最多（42/149,28.19%），离退人员（34/149,22.82%）居多。确诊病例中87.5%为轻症病例，多数表现为咽痛/咽痒、发热、咳嗽/咳痰、乏力和头痛等症状。病毒基因测序结果属于奥密克戎变异株BA.2.12.1（即BG.2进化分支），是一起新毒株引入引发的本土疫情。平均潜伏期为3 d，共5代病例，平均代间距为2 d；病例呈现家庭、工作场所、公共场所聚集性。推测的首例病例有境外人员密切接触史，发病时间最早，是引发...     

河南省首起奥密克戎新型冠状病毒感染传播链和聚集性疫情分析

目的 分析河南省首起奥密克戎新型冠状病毒感染聚集性疫情和传播链，指导不同场所疫情防控。方法 将河南省安阳市2022年1月本土报告的奥密克戎病毒株感染者468例作为研究对象，收集其流行病学调查、实验室检测等信息，采用描述流行病学方法分析不同聚集性疫情和传播链的特点。结果 该起疫情传染源头为2021年12月28日从天津返回的大学生。468例感染者中，9例感染来源不明确，其他459例共理清寄宿制学校链(304例)和A村链(155例)两大传播链；寄宿制学校链通过学校的老师和学生在校外的家庭接触、聚餐、就诊、邻居接触、集中隔离行为传播；A村链病例通过超市购物、参加葬礼、牙医诊所就诊、聚餐、工厂工作、家庭接触、打牌等行为造成疫情传播，J-W超市和L工厂传播链造成的病例数较多，存在拖尾现象。主要涉及8起聚集性疫情，包括1个学校(283例)、1个村庄(35例)、 1个小区楼栋(20例)、 2个超市(29例)、 1个工厂(8例)、 1起牙医诊所相关(10例)、 1起葬礼相关(10例)。寄宿制学校基本再生数R₀为5.46 (95%CI:3.11～8.77), A村R₀     

广州市2起由新型冠状病毒奥密克戎变异株引起的本地疫情流行病学参数研究

目的 本研究旨在估计广州市2起由新型冠状病毒（新冠病毒）奥密克戎变异株（BA.2）引起的本地疫情的潜伏期、序列间隔和基本再生数（R₀）等流行病学参数,探索不同场所聚集性对R₀的影响,为奥密克戎变异株疫情防控提供科学依据。方法 收集2022年4-5月广州市2起新冠病毒奥密克戎变异株本地疫情病例数据,使用Weibull、Gamma和lognormal分布对奥密克戎变异株本地疫情的潜伏期、序列间隔分布进行估计,采用指数增长法和极大似然法估计R₀。结果 两起疫情中位潜伏期为2.94（95%CI：2.52~3.38）d;中位序列间隔为3.32（95%CI：2.89~3.81）d。小型场所聚集性疫情R₀为4.40（95%CI：3.95~4.85）,机场聚集性疫情R₀为11.35（95%CI：11.02~11.67）。结论 广州市2起由新冠病毒奥密克戎变异株引起的本地疫情潜伏期较德尔塔变异株明显缩短。场所聚集程度越高,R₀越大,传播速度越快,易呈现暴发疫情,应及时调整防控策略。     

河南省首起奥密克戎新冠肺炎疫情流行特征分析

目的 分析河南省首起奥密克戎新冠肺炎疫情的流行特点。 方法 收集河南省安阳市2022年1月本土奥密克戎感染者的流行病学特征、实验室检测结果等信息,采用描述流行病学方法进行分析。结果 2022年1月8—29日,安阳市共报告468例感染者,年龄范围在8个月～85岁之间,中位年龄M（P25,P75）为18（17,34）岁,男女比例1∶1.4,职业以学生（64.1%）为主;按照发病日期,疫情共持续28 d（1月2—29日）;按照报告日期,11 d（1月19日起）实现社会面清零;283例（60.5%）来自于汤阴县某寄宿制学校,其他185例涉及4个县区14个乡镇38个村。90例（19.2%）感染者出现临床症状,主要为发热、咽痛、咳嗽、鼻塞流涕、头痛头晕等轻微症状;临床严重程度除2例为重型外,其余均为轻型和普通型,无死亡病例。潜伏期为1～9 d,中位数M（P25,P75）为2 d（2,4）;出现学校、村庄、小区、工厂、诊所、超市、家庭等多起聚集性疫情,家庭续发率为25.0%。基本再生数R0为5.25,实时再生数Rt于采取防控措施后迅速下降,在采取措施后第10 d降至1以下。结论 奥密克戎变异株的潜伏期短,传染性强,引起的临床症状轻微,传播更隐匿,应全面加快疫情防控速度,重点关注疫情放大器场所。     

新冠病毒奥密克戎变异株的特点与防控措施

自2021年11月新型冠状病毒奥密克戎变异株出现以来,几个月内迅速席卷全球。世界各国都出现了以奥密克戎为主要流行毒株的新一轮疫情,我国香港、深圳、上海等城市也未能幸免。奥密克戎刺突蛋白含有大量突变,具有强大的免疫逃逸能力,对现有的疫苗和抗体相关治疗造成了巨大的威胁。虽然奥密克戎变异株引起的疾病症状较轻,但由于其超高的传播率,全球卫生系统均承受了巨大的压力。本文就奥密克戎变异株的病原学特征、变异来源、传播特征、流行现状及防治措施等方面进行综述,以期为科学防控提供参考。     

两起麻疹聚集性疫情的流行病学关联调查分析

目的现场调查两起麻疹聚集性疫情,用时间曲线图的方法分析两起麻疹聚集性疫情是否存在流行病学关联,为研判、防控疫情提供依据。方法对两起麻疹聚集性疫情开展现场流行病学调查,结合麻疹的临床特点,通过描绘时间曲线图及传播链关系图,探讨病例在发病的时间和空间分布上是否具有一致性,结合流行病学调查,判断两起聚集性疫情及病例之间的流行病学关联。结果 2013年4月,珠海市发生两起麻疹的本地聚集性疫情(共6名病例),一起由输入性病例在住院期间同时传染同病房的两名本地人员引起;另一起为本地感染引起,表现为家庭聚集性,出现第3代病例。两起聚集性疫情不存在流行病学关联。结论时间曲线图能直观地显示病人的暴露、发病、传染及住院等时间分布,结合病例传播链关系图及流行病调查,能较好地理清病例之间的流行病学关联情况。     

上海某方舱医院新型冠状病毒 奥密克戎变异株感染者流行病学特征分析

[摘要]　目的　探讨上海某方舱医院新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者的发病情况及流行病学特征。方法　以2022年4月9日—5月5日上海国家会展中心方舱医院收治的新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者为研究对象,对感染者年龄、性别、地区、疫苗接种等疫情数据进行流行病学特征分析。结果　122 151例新型冠状病毒感染者均为奥密克戎变异株BA.2或BA.2.2亚型感染,其流行病学特征结果显示：患者男女比例为1.51:1;平均年龄为（44.91±15.38）岁;0～17岁、18～30岁、31～60岁和≥61岁感染者分别占4.74%、20.80%、62.52%和11.94%;无症状感染者占80.80%,轻型患者占19.20%;平均住院时间为（7.00±2.77）d;未接种和完成1、2和3次疫苗接种的感染者分别占20.30%、3.18%、31.30%和45.22%,其中≥61岁且完成3次疫苗接种的感染者仅占10.10%。结论　各个年龄段人群对于新型冠状病毒奥密克戎变异株普遍易感。无症状感染者是本次疫情的主体人群,临床症状不典型,早期隐匿传播,积极加强核酸检测是早期发现疫情的必要手段。     

新型冠状病毒Delta变异株引起的宁波市镇海区本土疫情传播链分析

目的调查新型冠状病毒(新冠病毒)Delta变异株引起的宁波市镇海区本土聚集性疫情, 分析其传播链, 为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控提供参考依据。方法资料来源于现场调查收集2021年12月6-18日宁波市镇海区新冠病毒感染者个案信息。采用现场流行病学调查方法, 描述COVID-19病例流行病学特征和传播链。结果首例病例为途经中风险地区, 直接或间接接触阳性感染者而感染新冠病毒, 后继出现家庭内聚集性疫情, 并通过工作、生活、艾灸养生活动等密切接触而传播。疫情共持续14 d, 共报告确诊病例74例, 潜伏期M(Q1, Q3)为4.0(3.0, 5.8)d。所有病例均在一条传播链上, 传播6代以上, 代间距M(Q1, Q3)为3.5(2.0, 5.3)d。基因测序结果为Delta变异株(AY.4进化分支), 流行病学调查和基因测序结果均显示宁波市镇海区本土疫情与上海市疫情为同一起关联疫情。结论本起疫情传播链清晰, Delta变异株(AY.4进化分支)具有明显的家庭、封闭场馆、集中居住地聚集性, 要加强重点区域、重点人群健康管理, 提高核酸检测频次。     

新型冠状病毒疫苗对四川省部分地区新型冠状病毒奥密克戎变异株感染人群中的保护效果评价

目的 评价新型冠状病毒（简称新冠病毒）疫苗预防新冠病毒奥密克戎变异株感染所致发病、肺炎和重症的保护效果（Vaccine effectiveness,VE）。方法 采用病例-病例研究，对2022年2至7月四川省成都市和广安市报告的新冠病毒感染本土病例进行调查，分析新冠病毒疫苗预防奥密克戎变异株发病、肺炎和重症的VE以及经年龄、性别、基础性疾病调整后的VE(aVE,Adjusted vaccine effectivenes)，通过SPSS 21.0软件进行单因素和多因素Logistic回归分析，检验水准α=0.05。结果 本研究共纳入新冠病毒感染病例1 683例，均为新冠病毒奥密克戎变异株BA.2感染，临床结局为发病、肺炎和重症分别是511例（30.4%）、66例（3.9%）和11例（0.7%），重症人群中90.9%(10/11)都是60岁及以上老年人群。加强免疫预防奥密克戎变异株发病和肺炎的aVE分别是52.4%(95%CI:17.8%～72.4%)和81.6%(95%CI:60.0%～91.5%)，基础免疫预防肺炎的a VE是69.2%(95%CI:26.9%～87.0%)，未完成全程...     

奥密克戎变异株流行形势下医疗机构感染防控策略探讨

目的 通过奥密克戎变异株流行形势下医疗机构感染防控策略探讨,为发现阳性病例和混采检测阳性、院内发现密切接触者等人员、急诊患者出现阳性病例、医院工作人员出现阳性病例等特殊情景下应急处置工作提供导则。方法 复盘山东省本轮新冠肺炎疫情流行以来各地卫生健康行政管理部门和医疗机构的应对行为与政策举措,总结应急处置过程和暴露的短板,探讨应对策略。结果 建立健全区域性、系统性医院感控应急预案体系,树立医疗机构感控意识和提升组织管理能力、风险管控能力、个人防护能力,制定医疗机构感染防控的应急处置指引。结论 本次奥密克戎变异株流行形势下医疗机构感染防控策略探讨,暴露出医疗机构疫情防控中的短板和弱项。应整合与组织资源的能力和医疗服务保障能力,推动医院感染精准防控,做好人力短缺调配,保障重点科室服务延续性,实现协调联动、协同治理。     

一起健身场所内新冠病毒感染聚集性疫情调查

目的 对一起健身场所内新冠病毒感染聚集性疫情进行流行病学调查分析，为大流行期间急性呼吸道传染病防控提供参考。方法 收集2022年3月浙江省嘉兴市嘉兴港区一起新冠病毒感染聚集性疫情现场处置期间报告的病例信息和流行病学调查报告，使用WPS Excel进行数据整理和描述性分析，用Microsoft Visio绘图，用SAS 9.4统计分析。结果 本次聚集性疫情共报告感染者25例，由新冠病毒奥密克戎变异株（Omicron BA.2.2进化分支）引起。末次核酸检测阴性前密接1 231人，无人感染；末次核酸检测阴性后密接416人，其中24人感染。共同打球密接的阳性率为77.8%(14/18)。在球场共同打球是暴露后感染的危险因素（OR=29.75,95%CI:15.41～44.07），而暴露时间（F=0.00,P=0.970）、疫苗接种剂次（F=0.00,P=1.000）、末次疫苗接种与本次暴露间隔时间（F=0.03,P=0.857）等因素与是否感染的差异无统计学意义。结论 在密闭空间内Omicron变异株具有较强传染性，但感染者末次核酸检测阴性前无传染性。建议在急性呼吸道传染病大流行期间，充分重...     

安徽地区一起新型冠状病毒肺炎家庭聚集性疫情调查

目的分析新型冠状病毒肺炎(COVID-19)家庭聚集性疫情多代传播的特点,为制定防控措施提供科学依据。方法本起家庭聚集性疫情病例发病时间为2020年1月23日—2月3日,收集病例的流行病学调查资料和实验室检测资料,分析感染来源,判定传播代际和传播链。结果本起家庭聚集性疫情出现3代共10例确诊病例和1例无症状感染者,首发病例通过日常密切接触和聚餐传播给2代病例,2代病例中的无症状感染者通过聚餐传播给3代病例。首发病例与2代病例的代间距平均数为4.5 d,3代病例的潜伏期平均数为7.3 d。本起家庭聚集性疫情总续发率为34.5%,其中2代病例续发率为53.8%,3代病例续发率为18.8%。结论新型冠状病毒(SARS-CoV-2)传播能力强,在家庭内可以通过接触、聚餐等方式快速导致多代病例出现。     

北京市一起新型冠状病毒Omicron变异株聚集性疫情特征分析

目的 分析北京市海淀区一起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学特征及传播链。方法 采用描述性流行病学方法分析疫情流行病学特征,应用现场调查和大数据技术分析传播链。结果 2022年4月27日至5月13日, 海淀区发生一起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情,全基因组测序系Omicron变异株（BA.2.2进化分支）;涉及感染者38例,确诊病例34例,无症状感染者4例;临床分型以轻型（88.2%）为主,无重型、危重型和死亡病例;早期临床症状以咽部不适（50.0%）、咳嗽（29.4%）为主;17 d内传播7代,涉及3起社区聚集、2起单位聚集和8个家庭内传播;暴露方式以同住（47.6%）、同时空暴露（31.6%）为主;代间距M（Q₁,Q₃）为3（1,6）d;总续发率为1.5%（37/2 482）,其中家庭续发率为36.7%（18/49）。结论 本起Omicron变异株疫情临床症状轻,家庭、社区聚集性明显,疫情传播速度较快,同时空暴露感染风险较高,需利用信息化技术全面摸排密切接触者,以快制快,有效阻断疫情传播。     

新冠病毒奥密克戎变异株感染的核酸转阴时间分析

目的 分析新冠病毒感染奥密克戎变异株上呼吸道标本核酸转阴时间,为了解新冠病毒感染奥密克戎变异株传染期提供参考。方法 以2022年11月1日—2023年1月10日湖北省荆州市某单位新冠病毒感染者为研究对象,收集感染者年龄、性别、新冠病毒疫苗接种史、2022年流感疫苗接种史以及发病日期、首次核酸检测阳性日期以及往后隔日核酸检测结果。发病日期或首次核酸阳性较早者定义为第0 d;连续2次（至少间隔24 h）核酸检测阴性定义为核酸转阴。采用生存分析计算转阴时间,Cox比例风险回归进行亚组比较。对定点收治医院感染者进行基因测序,监测荆州市流行毒株。结果 共102例新冠病毒感染者纳入研究,男女性别比0.96:1,年龄以40岁以上人群（65例,63.73%）居多,所有感染者既往均接种3剂次灭活疫苗,73例2022年7—8月接种4价流感疫苗。研究期间35名感染者进行基因测序结果显示均为Omicron BA.5.2变异株。感染者发病（或核酸检测首次阳性）5 d后核酸阳性率为97%。核酸转阴中位时间为12 d(95%CI:12～14 d),18 d后核酸均转阴。不同性别和年龄组感染者核酸转阴时间存在差异（P...     

2023年许昌市新冠病毒分子流行病学特征

目的 动态监测河南省许昌市本土流行的新冠病毒毒株组成，及时发现新变异株，评估变异株的传播力、致病力和免疫逃逸能力等生物学特性，为疫情防控提供技术支撑。方法 采用高通量测序方法对2023年2月15-19日来自哨点医院的6例新冠病毒感染者的咽拭子标本进行全基因测序，进行序列对比和进化分析。结果 6例新冠病毒感染者样本进行全基因测序，获得6条长度为29 844～29 853 bp序列。经过Nextclade V2.11.0在线分析，6条序列均属于新冠病毒奥密克戎BA.5变异株，其中病例1为BF.7.14，其余均为BA.5.2.48分支。进化树显示6条序列位于奥密克戎BA.5进化分支，与河南省其他地市BA.5进化株位于同一分支。未发现BQ、XBB等变异株。结论 测序的6例本土病例新冠病毒均为奥密克戎变异株，BA.5.2.48分支变异株依然是许昌市优势流行毒株。     

一起新型冠状病毒变异株XBB.1.5聚集性疫情流行病学调查

目的 针对中山市首起重点关注新型冠状病毒变异株XBB.1.5感染导致的本土聚集性疫情开展流行病学调查,梳理和分析其流行病学传播链和传播特征。方法 根据国家新型冠状病毒变异株流行病学调查方案要求,开展病例、同住和同班核心密接首轮广泛社区流行中的感染情况调查和多轮核酸检测,针对核酸检测阳性且CT值≤32病例开展基因测序,与指示病例基因序列进行比对。结果 该起聚集性疫情波及73人,其中53人（72.6%）在2022年12月有新冠病毒感染史,本次疫情无感染;20人既往无新冠病毒感染史,本次疫情7例感染,感染率为35%(95%CI:14.1%～55.9%),均在同一流行病学传播链,均为轻症,症状主要包括肌肉酸痛（3例）、咳嗽（3例）和发热（2例）。中山市疾控中心针对病例1～5完成基因测序,其基因组覆盖度分别为99.77%、99.83%、99.80%、99.82%、98.65%,均属于Omicron XBB.1.5进化分支。结论 本次新型冠状病毒变异株XBB.1.5聚集性疫情在班级和家庭小范围传播,涉及病例均为首次感染,无重症病例发生。     

上海市金山区一起新型冠状病毒感染家庭聚集性疫情流行病学特征分析

目的 分析上海市金山区某栋自建楼新型冠状病毒感染聚集性疫情的发病及传播特点，为阻断新型冠状病毒感染传播提供科学依据。方法 对2022年上海市金山区新型冠状病毒感染疫情流行期间的一起聚集性疫情的病例和密切接触者进行流行病学调查，分析流行病学特征。结果 该自建楼共三户居民10人，发病7人，罹患率70.0%,7名病例平均年龄34.3岁(最小年龄2岁，最大年龄55岁),男女比例3:4,按发病日期疫情持续7 d,均为新型冠状病毒感染确诊病例，临床严重程度均为轻型。该起聚集性疫情由从事蔬菜批发工作的病例，通过无防护接触将新型冠状病毒传播至病例A。该栋楼内的10人共用洗漱间，5人有酒店同一房间隔离经历，通过共同生活，新型冠状病毒从病例A扩散至楼栋内其余人员，传播链清晰。结论 新型冠状病毒Omicron变异株在社区广泛传播，常态化核酸检测有助于及时发现病例。Omicron变异株传播力强，容易引起家庭聚集性疫情，及早地处置干预可阻断新型冠状病毒蔓延。     

湖南省新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行特征分析

目的 分析湖南省195起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情的流行病学特征,为新型冠状病毒肺炎聚集性疫情防控提供科学依据。方法 收集2020年1—2月湖南省195起新型冠状病毒肺炎疫情资料,采用描述流行病学方法进行分析。结果 195起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情,发病696 例,无死亡病例;报告事件数位居前三的是长沙市(51起)、岳阳市(31起)、邵阳市(22起)。疫情起数、发病数在1月31日均达到高峰。男女性别比1.02∶1;平均年龄44.7岁,其中15岁以下儿童42例(6.3%);无症状感染者55例(8.28%);病例以轻型和普通型为主,占79.5%。仅发生一代病例的事件为28起(14.4%),二代病例的事件154起(79.0%),三代病例的事件10起(5.1%),四代病例的事件3起(1.5%)。一代病例与二代病例代际间隔平均为6.2 d(95%CI:5.1~7.3),中位数5.0 d。家庭暴露聚集性疫情续发率范围0.7%~100%,中位11.8%;医疗机构续发率范围0.9%~20.0%,中位6.9%。127起(65.1%)为湖北输入型疫情。696例聚集性病例中,268例(38.5%)为首代病例,387例(55.6%)为二代病例,32例(4.6%)为三代病例,9例(1.3%)为四代病例。事件暴露方式多种多样,184起有同住暴露,185起有同车暴露,118起有聚会暴露,149起有聚餐暴露,165起有交谈暴露,8起有会议培训暴露。结论 湖南省新型冠状病毒肺炎聚集性疫情主要发生在家庭,应关注重点地区、重点人群、重点场所,落实各项防控措施,有效处置新型冠状病毒肺炎聚集性疫情,防止疫情进一步扩散。