基于Oncomine数据库分析ENO1在卵巢癌中的表达及其预后价值

目的:拟探讨α-烯醇化酶(α-enolase,ENO1)在卵巢癌中的表达及其预后意义。方法:收集Oncomine数据库中关于ENO1的信息,并对目前数据库中资料进行二次分析,对其在卵巢癌中的作用进行荟萃分析,同时利用Kaplan-Meier Plotter进行卵巢癌患者生存分析。结果:Oncomine数据库中共有14项研究涉及ENO1在卵巢癌组织和正常组织中的表达,共包括1 001个样本。与对照组相比,ENO1在卵巢癌组织中高表达(P<0.05)。高表达ENO1的卵巢癌患者总体生存率较高,而低表达ENO1的卵巢癌患者预后较差(P<0.05)。进一步亚组分析发现,ENO1表达水平对浆液性卵巢癌患者预后有显著影响,而在子宫内膜样卵巢癌患者中,其表达水平对预后无显著影响(P<0.05)。结论:通过对Oncomine基因芯片数据库中肿瘤相关基因信息的深入挖掘,发现ENO1在卵巢癌中高表达,且与卵巢癌的预后有关,可作为肿瘤预后标志物及替代药物治疗的新靶点。     

基于数据库挖掘分析BUB1基因在卵巢癌中的表达及意义

目的探讨BUB1在卵巢癌(Ovarian cancer, OV)中的表达及与预后的关系。方法利用Oncomine数据库挖掘BUB1在各种肿瘤中的表达;通过GEPIA数据库分析BUB1在卵巢癌组织中的表达,采用Kaplan-Meier数据库分析BUB1在卵巢癌中的预后价值;通过Coexpedia数据库构建BUB1在卵巢癌中的共表达基因网络,并用FunRich软件对score>13的共表达基因注释。利用WebGestalt对其进行KEGG通路富集分析。按score高低筛选出关键基因,GEPIA进一步分析BUB1与关键基因的相关性。结果 (1)从Oncomine数据库检索出BUB1基因相关研究424项,其中高表达85项,低表达15项。(2)GEPIA分析表明,BUB1在卵巢癌组织中的表达高于正常组织(P<0.05)。(3)Kaplan-Meier数据库分析结果显示,BUB1基因低表达的卵巢癌患者总生存期(HR=1.2,P<0.05)增加。(4)BUB1的共表达基因主要有AURKA、DLGAP5、KIF2C、TPX2、BUB1B、DEPDC1、KIF23、CDCA3、TTK、...     

血根碱与c-myc G4-DNA相互作用的光谱法研究

目的 研究血根碱与c-myc G4-DNA的相互作用.方法 采用紫外可见吸收光谱、圆二色谱、变温试验等方法,对血根碱与c-myc G4-DNA的结合常数、结合比例、结合模式及稳定性进行研究.结果 在紫外可见吸收光谱中,血根碱在300～ 350 nm之间的特征吸收峰随c-myc G4-DNA浓度的增加出现明显的减色效应和红移,减色率△H=35.4％(△λ=7 nm),与c-myc G4-DNA结合常数为3.1×104 mol/L;G-四链体/血红素过氧化物酶竞争试验中,血根碱竞争血红素引起吸光度下降;变温试验中c-myc G4-DNA的熔点在血根碱作用下升高4.7℃.结论 血根碱以结合比例为1∶1外部堆积于c-myc G4-DNA,并促使其结构稳定,这可能是血根碱抗肿瘤的分子机制之一.     

PDE4D在哮喘患儿和哮喘模型的表达差异

目的：筛选哮喘相关候选基因,并在人群和动物水平验证。方法：从高通量基因表达数据库（gene expression omnibus,GEO）搜索哮喘痰相关基因芯片数据,利用GEO 2R筛选表达差异基因,并参考全基因关联分析（genome?wide association study,GWAS）筛选哮喘相关基因,收集哮喘患儿及同期健康儿童痰标本,构建小鼠哮喘模型、大鼠肥大细胞株（RBL?2H3）哮喘模型,应用RT?PCR进行验证。结果：共纳入2套哮喘痰基因芯片数据,选出有交集的差异表达基因190个,结合GWAS最终筛选出哮喘相关基因磷酸二酯酶4D（PDE4D）。进一步验证PDE4D在哮喘患儿痰样本中表达上调（P < 0.05）,但在哮喘小鼠模型整个肺组织中表达下调（P < 0.05）,而在致敏的RBL?2H3细胞中表达上调（P < 0.05）。结论：PDE4D在人群、哮喘小鼠及肥大细胞中存在差异表达,可能作为肥大细胞参与哮喘发展的研究靶点。     

血水草中血根碱和白屈菜红碱的分离制备研究

目的:从血水草中分离血根碱和白屈菜红碱。方法:用干燥的血水草粉末选用浸泡、超声、微波或渗漉提取,用大孔吸附树脂分离。比较不同提取方法,不同萃取剂、洗脱剂等因素对提取的影响。结果:浸渍提取和微波提取效率较高,但是渗漉提取所得的提取物中生物碱的含量较高,血根碱含量为:80.10±3.68 mg/g,白屈菜红碱含量为:44.31±0.28 mg/g。盐酸提取率明显高于其它酸。依次用20%、60%、90%的甲醇水溶液、100%的乙醇溶液洗脱分离效果最好。结论:渗漉提取是分离血水草中血根碱和白屈菜红碱的一种有效方法。     

基于Oncomine数据库分析SLC16A1基因在口腔癌等头颈癌中的表达和预后

目的 研究SLC16A1基因在口腔癌等头颈癌中的表达并进行相关肿瘤预后分析。方法 挖掘Oncomine数据库中口腔癌等头颈癌中SLC16A1基因相关数据,并进行生存分析。结果 Oncomine数据库中SLC16A1基因癌组织/正常组织表达量分析结果共有442个,在癌组织中显著高表达99个,低表达30个。其中21个分析结果显示SLC16A1在头颈癌组织(包括6个口腔癌组织分析结果)中显著高表达,低表达的分析结果为0。通过Oncomine数据集生存分析表明,在头颈癌中SLC16A1的表达量与预后存在明显正相关,且SLC16A1表达量越高,总体生存越好。结论 SLC16A1基因可能是一种肿瘤抑制基因,可为后续深入研究提供线索,为肿瘤药物的开发提供参考。     

基于Oncomine数据库及生物信息学方法分析KIF11在浆液性卵巢癌中的表达及临床意义

目的：探究驱动蛋白家族成员11(KIF11)在浆液性卵巢癌中的表达及临床意义。方法：应用Oncomine、GEPIA数据库分析KIF11 mRNA在卵巢癌与正常卵巢中的表达情况;应用Kaplan-Meier Plotter分析KIF11表达水平与卵巢癌预后的关系;应用免疫组化法检测89例浆液性卵巢癌组织及26例正常卵巢组织中KIF11蛋白表达水平,分析KIF11蛋白表达水平与卵巢癌患者临床病理特征的相关性。结果：Oncomine数据库示,浆液性卵巢癌组织中KIF11 mRNA的表达高于正常卵巢组织（P<0.05）。GEPIA数据库示,KIF11 mRNA在卵巢癌中高表达（P<0.05）。Kaplan-Meier Plotter分析示,KIF11高表达组卵巢癌患者的总生存期（OS）、无进展生存期（PFS）低于低表达组（P<0.05）。免疫组化示,KIF11蛋白在浆液性卵巢癌中高表达率高于正常卵巢（P<0.05）,浆液性卵巢癌中KIF11高表达与淋巴结转移（P=0.001）、FIGO分期（P=0.005）及组织分级（P=0.002）有关。结论：KIF11 mRNA及...     

基于Oncomine及GEPIA数据库分析的EGR1基因在弥漫大B细胞淋巴瘤中的表达与预后研究

目的:通过Oncomine数据库分析弥漫大B细胞淋巴瘤(Diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)中EGR1基因表达及意义,为DLBCL的治疗提供新的靶标.方法:在Oncomine及GEPIA数据库中分析EGR1的表达及其与DLBCL患者预后之间的关系.结果:与正常样本中的表达相比,EGR...     

人类激肽释放酶基因4、5在卵巢癌中的表达

目的研究人类激肽释放酶基因4(KLK4)与激肽释放酶基因5(KLK5)在卵巢癌组织中的表达水平,探讨其在恶性肿瘤中的作用机制。方法50例卵巢肿瘤组织标本分为恶性肿瘤组(n=23)、交界性肿瘤组(n=6)和正常或良性肿瘤组(对照组,n=21)。采用荧光定量RT-PCR技术对各组卵巢肿瘤组织标本进行检测,获得KLK4与KLK5的表达水平。结果KLK4在卵巢癌中的表达水平显著高于对照组(P<0.05);KLK5在卵巢癌和交界性卵巢肿瘤中的表达水平也显著高于对照组(P<0.001);KLK5在浆液性囊腺癌中的表达水平显著高于其他组织学类型的恶性肿瘤(P<0.05)和对照组(P<0.001),且低分化浆液性囊腺癌的表达水平高于中分化浆液性囊腺癌的表达(P<0.05)。KLK5的表达水平与血清CA125水平呈正相关。结论KLK5在卵巢癌,尤其是浆液性囊腺癌的发生与发展过程中可能具有潜在促进作用。     

人类激肽释放酶基因4、5在卵巢癌中的表达

目的 研究人类激肽释放酶基因4(KLK4)与激肽释放酶基因5(KLK5)在卵巢癌组织中的表达水平,探讨其在恶性肿瘤中的作用机制.方法 50例卵巢肿瘤组织标本分为恶性肿瘤组(n=23)、交界性肿瘤组(n=6)和正常或良性肿瘤组(对照组,n=21).采用荧光定量RT-PCR技术对各组卵巢肿瘤组织标本进行检测,获得KLK4与KLK5的表达水平.结果 KLK4在卵巢癌中的表达水平显著高于对照组(P＜0.05);KLK5在卵巢癌和交界性卵巢肿瘤中的表达水平也显著高于对照组(P＜0.001);KLK5在浆液性囊腺癌中的表达水平显著高于其他组织学类型的恶性肿瘤(P＜0.05)和对照组(P＜0.001),且低分化浆液性囊腺癌的表达水平高于中分化浆液性囊腺癌的表达(P＜0.05).KLK5的表达水平与血清CA125水平呈正相关.结论 KLK5在卵巢癌,尤其是浆液性囊腺癌的发生与发展过程中可能具有潜在促进作用.     

卵巢癌中多药耐药基因的表达及其意义

为探讨卵巢癌隐含的耐药机制及其对化疗的影响,用RT－PCR方法对7例正常卵巢组织及32例卵巢癌进行了多药耐药基因（mdr1)检测,结果表明：正常卵巢组织中,rdr1基因均无表达,32例卵巢癌中,mdr1表达阳性率为28．1％,mdr1基因表达与病理类型有关（P＜0．05）,而且mdr1表达阳性者耐药发生率（55．6％）显著高于阴性者（8．6％,P＜0．01）。结果提示：卵巢癌中隐含有由mdr1介导的多药耐药机制,mdr1的表达与卵巢癌的化疗耐药有一定的关系。     

卵巢上皮癌中nm23基因蛋白的表达及其意义

目的：探讨nm23基因蛋白二磷酸苷激酶(NDPK)在卵巢上皮癌中的表达及其临床意义。方法：应用免疫组化S－P法,检测nm23基因蛋白在45例卵巢上皮癌,12例卵巢交界性瘤及10例良民生卵巢上皮性肿瘤组织中的表达。结果：卵巢上皮癌nm23基因蛋白表达阳性率为73.3％,明显高于卵巢良性上皮肿瘤(30.0%）和卵巢交界性上皮肿瘤（41.7％）差异显著（P＜0.05）。nm23基因七卵巢上皮癌的组织学类型,癌组织的分化程度无明显关系,而与卵巢上皮癌的临床分期有关（P＜0.05）。卵巢上皮癌nm23基因蛋白阳性患者术后生存期明显高于nm23基因蛋白阴性患者（P＜0.05）。结论：nm23基因蛋白的表达可以作为判断卵巢癌患者预后的一个有价值的指标。     

锌指蛋白23在卵巢癌中的表达

目的:分析ZnF23 mRNA在卵巢癌组织和细胞中的表达情况,以探讨其与细胞凋亡的关系.方法:采用实时荧光定量RT-PCR法检测22例卵巢癌患者癌组织和其癌旁正常组织中ZnF23表达水平.结果:22例卵巢癌患者癌组织及其癌旁正常组织标本中ZnF23相对表达量(ZnF23/GAPDH)分别为(0.2±0.15)和(1.0±0.1),差异有统计学意义(P＜0.05).结论:卵巢癌患者中ZnF23蛋白表达水平显著下降,可能与卵巢癌的发生发展有密切的关系.     

卵巢上皮性癌中RIZ1基因表达缺陷的意义及其与甲基化的关系

目的:研究抑癌基因RIZ1在卵巢上皮性癌组织及卵巢癌细胞系中的表达变化,分析其表达变化与甲基化的关系。方法:以卵巢癌组织及卵巢癌细胞系为研究对象。RT-PCR检测RIZ1 mRNA水平;MSP检测RIZ1基因甲基化状况;蛋白印迹检测RIZ1蛋白表达。结果:卵巢癌组织、卵巢癌细胞系及正常卵巢组织中RIZ1 mRNA相对含量的平均值分别为0.32±0.14,0.26±0.11和1.17±0.08。RIZ1蛋白相对含量的平均值分别为0.38±0.11,0.34±0.06和1.56±0.14。卵巢癌组织及卵巢癌细胞系中RIZ1的甲基化率分别为25.8%、20%。卵巢癌组织、卵巢癌细胞系分别与正常卵巢组织比较,RIZ1基因的表达差异均有统计学意义(P<0.05);存在甲基化的卵巢癌组织及细胞系中,RIZ1基因表达缺失或下降。5-杂氮-2′-脱氧胞苷处理RIZ1基因发生甲基化的卵巢癌细胞系后,RIZ1基因重表达;且去甲基化处理后,卵巢癌细胞生长均减慢。结论:RIZ1基因表达缺陷与卵巢癌的发生有关,DNA甲基化是其表达缺陷的原因之一;去甲基化处理可使RIZ1基因重表达,并抑制卵巢癌细胞的增殖。     

前列腺素D合酶基因在卵巢癌组织中的表达

目的　研究Lipocalin型前列腺素D合酶的基因在卵巢癌中的表达及其意义。 方法　用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)方法和原位杂交技术对 5 4例卵巢癌组织中的L PGDS基因进行检测。结果　从卵巢癌组织中克隆的L PGDS的cDNA ,经测序证明与基因库所报道的L PGDS的基因序列完全一致。 5 4例卵巢组织标本中 ,肿瘤细胞均有不同程度L PGDS基因mRNA表达 ,经统计学分析 ,不同型别间表达差异有显著意义 (P <0 .0 1)。结论　卵巢癌中存在L PGDS的mRNA表达 ,且与卵巢癌分型和分级有关 ,L PGDS的表达差异预示其在卵巢癌发生、发展中可能存在着作用     

卵巢癌中ASC基因表达缺陷与其甲基化的关系

目的 探讨ASC(apoptosis-associated speck-like protein containing CARD)基因在卵巢组织中的表达,并分析其临床意义及其表达缺陷与基因甲基化的关系.方法 以18例卵巢癌组织和8例正常卵巢组织、8例卵巢良性肿瘤作为研究对象,采用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)检测卵巢组织中ASC基因启动子区域甲基化的状态,用RT-PCR和免疫组织化学SP法分别检测其mRNA和蛋白的表达.结果 在正常卵巢和卵巢良性肿瘤组织中均未扩增出甲基化条带,在卵巢癌组织中,ASC基因甲基化率为38.9%(7/18).在正常卵巢组织、卵巢良性肿瘤组织和卵巢癌组织中,ASC基因mRNA和蛋白的表达强度依次下降,其中发生甲基化组织的mRNA和蛋白的表达明显低于未发生甲基化的组织.ASC蛋白在高中分化的卵巢癌组织中的表达明显高于低分化组织.结论 卵巢癌中存在ASC基因甲基化,这可能是导致该基因沉默的原因之一,且在卵巢癌的发病机制中起作用.     

卵巢上皮性癌组织中 WAF1基因的表达

【目的】探讨卵巢上皮性癌组织中WAF1表达情况及其与肿瘤临床病理参数的关系。【方法】用RT-PCR和免疫组化分别检测30例正常卵巢、32例良性卵巢上皮性肿瘤和55例卵巢上皮性癌组织中WAF1mRNA和WAF1蛋白表达情况,并结合临床病理进行探讨。【结果】正常卵巢、良性卵巢上皮性肿瘤、卵巢上皮性癌组织中WAF1mRNA阳性表达率分别为73%、56%、40%(P=0.012),WAF1蛋白阳性表达率分别为80%、56%、36%(P=0.001),卵巢上皮性癌WAF1mRNA及其蛋白表达均低于其它两组。卵巢上皮性癌中WAF1mRNA表达与其蛋白表达呈正相关。WAF1蛋白低表达与卵巢癌FIGO分期晚有关(P=0.032),与年龄、组织学类型、病理分级、残余肿瘤大小无关(P>0.05),而WAF1mRNA与上述各项临床病理参数均无关(P>0.05)。【结论】与正常卵巢和良性卵巢肿瘤相比较,卵巢上皮性癌存在WAF1基因转录抑制及蛋白表达低下,WAF1下调可能与上皮性卵巢癌发生有关;晚期卵巢上皮性癌较早期者WAF1蛋白表达低,提示WAF1蛋白低表达与卵巢上皮性癌的恶性生物学行为有关。