m6A去甲基化酶ALKBH5在结直肠癌组织中的差异表达分析

目的:探讨ALKBH5在结直肠癌(colorectal cancer, CRC)及其癌旁组织中的差异表达,评估其作为CRC诊断肿瘤标志物的潜在应用。方法:通过GEPIA2数据库和UALCAN网站检索ALKBH5在CRC和癌旁组织中的表达水平,结合PCR和琼脂糖凝胶电泳验证ALKBH5 cDNA引物的特异性,并通过RT-qPCR分析ALKBH5的熔解温度曲线图。结果:ALKBH5在不同癌症中的表达水平和作用功能存在差异,在CRC中的相对表达量较低,而在癌旁组织中则较高,但与患者预后无显著相关性。PCR产物片段大小与ALKBH5 cDNA的121 bp一致,电泳条带清晰且单一,表明引物特异性良好。熔解温度曲线图显示RT-qPCR产物特异性良好,未产生引物二聚体。AUC值为0.945 8,表明ALKBH5具有较高的辅助诊断效能。结论:ALKBH5有望作为CRC诊断的肿瘤标志物,但ALKBH5 mRNA表达量难以单独作为CRC患者治疗靶点,需要综合考虑其表达产物的多样性。     

CSN6基因在肝细胞癌组织中的表达及临床意义

目的 探索组成型光形态发生因子9信号复合体亚基6(CSN6)在肝细胞癌中的表达及其在患者临床病理因素和预后方面的意义。方法 利用公共数据库人类蛋白质图谱数据库和StarBase数据库分析CSN6在肝细胞癌和正常肝脏组织中的蛋白和mRNA的表达情况。利用TCGA数据库分析CSN6在不同肿瘤分期和分级的肝细胞癌患者中的表达差异。利用免疫组化方法检测106例肝细胞癌患者组织中CSN6的蛋白表达,分析其与多项临床病理因素和总生存期的关系。结果 与正常肝脏组织相比,CSN6在肝细胞癌组织中的表达升高。CSN6在高病理分级(G3和G4)以及高分期(Ⅱ期和Ⅲ期)的患者中的表达更高;CSN6高表达的肝细胞癌患者的总生存期更短。CSN6在肝细胞癌中的表达与肿瘤分化程度和乙肝病毒感染具有相关性,并且是影响患者总生存期的独立预测因素。结论 肝细胞癌中CSN6的表达显著升高,肝细胞癌患者组织中CSN6表达升高提示患者预后不良,其表达升高与肝细胞癌的恶性进展相关,有潜力成为一个新的预测预后的标志物以及治疗靶点。     

组蛋白去乙酰化酶2在肝细胞癌组织中的表达及其临床意义

目的 探讨组蛋白去乙酰化酶2(histone deacetylase 2,HDAC2)在肝细胞癌组织中的表达及其与预后的关系.方法 采用Western blot法和免疫组化检测肝细胞癌组织及对应癌旁组织中HDAC2蛋白的表达情况,并分析其与患者临床病理学参数及预后的关系.结果 HDAC2蛋白在肝细胞癌组织中的表达明显高...     

EIF5A2在人肝细胞癌中的表达及其与术后生存期的关系

目的 检测真核翻译起始因子5A2(EIF5A2)在肝细胞癌(HCC)中的表达,探讨其与临床病理特征及预后的关系.方法 qRT-PCR和Western blot法分别检测12对新鲜HCC及癌旁非瘤组织中EIF5A2 mRNA和蛋白水平的表达;免疫组织化学检测284对HCC及癌旁非瘤组织中EIF5A2的表达水平,并分析其与...     

肝细胞癌组织中HMGA2表达及其临床意义

目的探讨肝细胞癌（HCC）组织中高迁移率族蛋白A2（HMGA2）的表达及其与临床病理特征和预后的关系。 方法收集本院2011年1月至2012年12月经手术切除的120例HCC组织、癌旁组织和正常肝组织,采用免疫组化SP法检测以上组织中的HMGA2表达情况,分析HMGA2表达与HCC临床病理特征（性别、年龄、分化程度、TNM分期、肝门淋巴结转移、癌灶数量、肿瘤大小和肝内转移）的关系,根据随访资料分析不同HMGA2表达HCC患者的预后情况。 结果HMGA2阳性表达在细胞核中呈棕黄色或棕褐色。HCC组织中HMGA2阳性率为6417％（77／120）,高于癌旁组织的834％（10／120）和正常组织的417％（5／120）,差异有统计学意义（P＜005）;癌旁组织和正常组织HMGA2阳性率的差异无统计学意义（P＞005）。HMGA2表达与HCC分化程度、TNM分期、肝门淋巴结转移、癌灶数量、肿瘤大小和肝内转移有关（P＜005）,与性别和年龄均无关（P＞005）。HMGA2阳性者的中位总生存期（OS）为135个月,阴性者的中位OS＞600个月,HMGA2阴性者的中位OS长于阳性者（P＜005）;HMGA2表达、TNM分期、肝内转移、肝门淋巴结转移、癌灶数量、肿瘤大小和分化程度与HCC患者的OS有关（P＜005）。经Cox回归模型进行多因素分析显示HMGA2阳性表达是影响HCC预后的独立危险因素（HR=2516,95％CI：1643～3855）。 结论HCC组织内HMGA2蛋白表达升高,且参与HCC的发生发展,HMGA2阳性表达者的预后较差,该蛋白可能作为一个评估HCC预后的潜在指标。     

miR-621在肝细胞癌组织中的表达及其临床意义

摘 要：［目的］ 探讨肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）组织中miR-621的表达及其临床意义,并对miR-621靶基因进行系统的生物信息学分析。［方法］ 基于GEO（Gene Expression Omnibus）和TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据库,比较HCC组织和癌旁组织中miR-621表达量,并分析miR-621表达与HCC患者临床病理特征及预后的相关性。利用生物信息学方法对miR-621的靶基因进行预测及功能富集分析,并结合蛋白互作网络及预后分析结果筛选miR-621关键靶基因。［结果］ miR-621在HCC组织中较癌旁组织低表达（P<0.05）。HCC组织中miR-621表达量与患者TNM分期、肿瘤分化程度以及血清甲胎蛋白（AFP）等指标显著相关（P均<0.05）。生存分析显示HCC组织中miR-621低表达是影响患者预后的独立危险因素（P<0.05）。富集分析提示miR-621的靶基因主要富集于细胞黏附、氨基酸跨膜运输、钙离子结合等功能,以及MAPK、细胞周期等信号通路。AURKA、CDC25A、ESPL1、GINS2、KIF20B、MCM5、NUSAP1、OIP5等为miR-621关键靶基因,其在HCC组织中均呈现表达上调,且相对高表达者预后不良（P均<0.05）。［结论］ miR-621可作为一种抑癌基因参与HCC的发生、发展,并具有成为HCC诊断标志物、预后指标及治疗靶点的潜在价值。     

肝细胞癌m6A相关免疫基因预后模型构建及DDX1在肝细胞癌中的作用

目的 筛选肝细胞癌中N6-甲基腺苷(m6A)相关免疫基因构建预后模型,并探讨其关键基因DDX1在肝癌细胞中的作用。方法 本研究选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中368例肝癌样本数据作为训练数据集,基因表达综合数据库(GEO)GSE 14520数据集中242例肝癌样本数据作为验证数据集,并基于表达相关性进行m6A相关的免疫基因筛选。通过LASSO Cox回归模型筛选与预后相关的m6A免疫基因,并构建风险评分(RS)模型。根据RS中位数值,分别将训练集和验证集中所有样本分为高与低风险组,Kaplan-Meier法评估高低风险组的生存预后差异。使用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测肝癌细胞系(HuH-7、SK-HEP-1、PLC/PRF/5和SNU-449)以及人正常肝细胞系THLE-2中筛选的关键基因表达水平;挑选表达变化较显著的基因,运用功能加强和缺失实验对其功能进行细胞验证。one-way ANOVA法比较多组间统计学差异,其中两两比较采用Tukey法。结果 基于共表达分析共获得130个m6A相关免疫基因,最终筛选了5个基因(DDX1、HDAC1、HDAC2、NRAS和PLK...     

m6A甲基化在多种消化道肿瘤中的研究进展

m6A甲基化是真核细胞mRNA中最常见的修饰方式,可在不改变碱基序列的基础上调控基因转录后的表达水平。m6A甲基化通过甲基转移酶和去甲基转移酶,在表观遗传修饰水平调控原癌基因、抑癌基因等的表达来影响肿瘤的发生发展。本文就m6A甲基化的相关概念、生物学功能以及在消化系统肿瘤中的最新研究进展作一综述,以期为消化道肿瘤的诊断、治疗、预后及监测提供新的有效策略。     

m6A甲基化酶METTL3在癌症发生发展中的作用

N6-甲基腺苷(m6A)是RNA中最普遍的表观遗传修饰.甲基化酶样3(methyltransferase like 3,METTL3)作为最主要的甲基化酶,参与m6A所调节的RNA的剪接、运输、翻译和降解等生物过程.目前,诸多研究证实METTL3在人类癌症中发挥着重要作用且影响癌症进展.METTL3能够通过多种机制调控...     

自噬相关基因5在肝癌组织中的表达及临床意义

背景与目的：肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）是死亡率极高的原发性肝癌,其恶变的机制目前尚未明确。近些年随着对自噬研究的深入,发现自噬可以提供肿瘤生长高能量的需求,增加肿瘤细胞对极端低氧、化疗药物等环境的适应性,因而与肿瘤的恶性进程关系密切。该研究旨在探讨自噬小体形成中泛素样连接系统Atgl2-Atg5-Atgl6参与自噬的关键因子,自噬相关基因5（autophagy-related gene 5,Atg5）在HCC组织中的表达及与临床病理参数的关系。方法：回顾性分析中国医科大学肿瘤医院于2015年3月—2017年6月进行肝癌手术切除的110例已确诊无误的HCC标本,免疫组织化学染色检测110例癌旁及HCC组织中Atg5蛋白的表达,同时分析HCC组织中Atg5蛋白表达与患者临床病理学特征之间的关系。蛋白质印迹法（Western blot）与实时荧光定量聚合酶链反应（real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR）分别检测46例癌旁和HCC组织中Atg5蛋白及mRNA的表达。结果：免疫组织化学结果显示,HCC组织Atg5蛋白的阳性率71.82%（79/110）,明显高于癌旁组织的阳性率20.09%（23/110）,差异有统计学意义（P<0.05）。HCC组织Atg5蛋白水平与肿瘤直径、甲胎蛋白（alpha fetoprotein,AFP）及血管侵犯相关（P<0.05）,肿瘤直径大于等于5 cm、AFP水平大于等于200 ng/mL且合并血管侵犯HCC患者的Atg5蛋白水平较高。Western blot结果显示,HCC组织Atg5蛋白水平为1.25±0.25,癌旁组织为0.47±0.12（P<0.05）。RTFQ-PCR结果显示,Atg5 mRNA在HCC组织中的表达相当于癌旁组织的4.37倍（P<0.05）。结论：HCC组织中Atg5的基因表达和蛋白水平均显著增加,HCC组织的发生、发展可能与Atg5自噬活性的激活有关。     

YEATS2在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的 探讨YEATS2在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）中的表达及其与预后的关系。方法 收集我院2010年1月至2014年1月112例手术切除的HCC癌组织和癌旁组织石蜡标本，采用Real-time PCR检测HCC癌组织及癌旁组织中YEATS2 mRNA的表达，Western blot和免疫组化染色检测YEATS2蛋白水平，免疫荧光染色检测YEATS2在HCC癌组织中的表达定位，并分析YEATS2与HCC患者临床病理特征和预后的关系，同时采用TCGA数据库数据验证。结果 Real-time PCR结果显示，YEATS2 mRNA在HCC癌组织中的表达较癌旁组织上调（P<0.001）；Western blot检测结果显示，YEATS2在约66.67%（12/18）的HCC癌组织表达升高；免疫组化染色分析发现，约71.43%（80/112）的HCC患者中YEATS2表达上调，其表达与TNM分期明显相关（P<0.001）；YEATS2主要在HCC癌组织细胞核中表达；多因素分析结果显示YEATS2高表达是患者不良预后的独立危险因素（HR=2.204，95%CI：1.388~3.500，P=0.001）。TCGA中HCC队列分析也表明YEATS2高表达的患者OS更差（HR=1.751，95%CI:1.107~2.770，P=0.017）。 结论 YEATS2在HCC组织中高表达，且与患者不良预后相关。     

KIF21B在肝细胞癌中的表达及临床意义的研究

背景与目的:驱动蛋白家族(kinesin superfamily,KIF)是一类调控微管运动的分子马达,参与细胞运动、有丝分裂、细胞内运输及癌变过程。KIF21B作为经典的驱动蛋白分子,同时也是微管系统动态平衡的调控子,其在肿瘤中的表达尚未见报道。探讨KIF21B在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达水平与HCC患者临床病理学特征的关系及对预后的影响。方法:通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)分析KIF21B在HCC组织及正常组织中的表达差异,及其与临床病理学特征的关系;应用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)检测2株HCC细胞及1株正常肝细胞中KIF21B的表达差异;应用免疫组织化学法检测于甘肃省人民医院2014年3月-2018年6月行HCC手术切除的116例HCC组织及其癌旁组织中KIF21B的表达差异,验证TCGA数据库结果,分析KIF21B表达水平与临床病理学特征之间的关系;应用COX回归模型及Kaplan-Meier法分析KIF21B表达对HCC患者预后的影响。结果:KIF21B在HCC组织的表达显著高于正常组织(P<0.01),此结果与TCGA数据库结果一致,与TNM分期、乙肝病毒感染和血管侵犯有关(P<0.05);KIF21B在2株HCC细胞中的表达明显高于正常肝细胞(P<0.05);Kaplan-Meier法分析显示,KIF21B高表达组5年生存率明显低于低表达组(P<0.05);COX分析显示,KIF21B是影响HCC预后的独立因素。结论:KIF21B在HCC组织中的表达明显高于正常组织,且与预后不良密切相关,可能参与HCC的发生、发展过程。     

m6A结合蛋白IGF2BP1在肝细胞癌中的基因调控网络分析

目的 分析m6A阅读器胰岛素样生长因子2-mRNA结合蛋白1（insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1，IGF2BP1）在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）中的表达水平及其对HCC患者预后的影响，并探讨IGF2BP1在HCC发生发展中的作用及其潜在机制。方法 基于5对HCC癌及相应癌旁组织mRNA-seq数据和TCGA数据库LIHC的mRNA-seq数据综合分析IGF2BP1在HCC中的表达情况，同时利用TCGA数据库中343例HCC患者的临床随访资料分析IGF2BP1表达水平对HCC患者总生存期的影响。基于TCGA数据库筛选IGF2BP1的共表达mRNA，并利用m6Avar在线网站预测mRNA的m6A位点及其RNA结合蛋白等信息，最终构建IGF2BP1的基因调控网络。结果 IGF2BP1基因在HCC中表达上调（log2FC HCC转录组数据=10.684，P<0.001；log2FC TCGA-LIHC数据集=7.032，P<0.001）。生存分析显示IGF2BP1低表达的HCC患者中位生存时间为5.84年，IGF2BP1高表达患者为4.44年，高表达患者总生存期缩短（P=0.011）。22个差异表达的mRNA与IGF2BP1存在靶向结合关系，并与其表达水平呈正相关。其中，HMGA2等15个高表达mRNA的HCC患者总生存期缩短。HMGA2、PEG10、CEP55、RHO、CDC6和KIF23基因中的潜在m6A甲基化位点位于mRNA 3'UTR端的miRNA结合区域。结论 IGF2BP1在HCC中高表达且导致患者总生存期缩短。IGF2BP1可能通过m6A甲基化及miRNA抑制作用的方式上调mRNA的表达，促进HCC发生并导致不良预后。     

轴突导向因子G1在肝细胞癌患者血清和组织中的表达及其临床意义

目的探讨轴突导向因子G1(netrin⁃G1,NTNG1)在肝细胞癌患者血清及组织中的表达水平及其临床意义。方法收集本院病理确诊为肝细胞癌的组织样本63例,采用Western Blot法检测NTNG1蛋白的表达,并分析其表达水平与临床病理特征及预后的关系。同时收集同期本院收治的肝细胞癌、肝炎、健康受试者、其他肿瘤患者血清共90例,采用ELISA法检测血清中NTNG1水平。结果NTNG1在肝细胞癌组织中高表达(P=0.001),是影响肝细胞癌患者总生存期的独立危险因素。肝细胞癌组患者血清中NTNG1水平显著高于其他对照组(均P<0.001),受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线显示其诊断肝细胞癌的灵敏度和特异度分别为84.62%和76.56%,ROC曲线下面积为0.8251。结论NTNG1在肝细胞癌组织中高表达且与患者预后不良有关,可能是肝细胞癌患者潜在的预后评估标志物。     

MKP-4在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的 探讨MKP-4在肝细胞癌（HCC）中的表达及其临床意义。方法 收集2005年1月至2010年12月在南通大学附属医院行肝癌根治术的100例HCC切除标本及对应癌旁组织,采用免疫组化SP法检测上述组织中MKP-4的表达,并分析其与临床病理特征及预后的关系。另收集8例新鲜HCC及对应癌旁组织,采用Western blotting法半定量检测MKP-4表达。结果 MKP-4蛋白在8例新鲜HCC组织中的表达量为0.611±0.136,显著低于癌旁组织的0.931±0.107（P＜0.05）。HCC组织中MKP-4的高表达率为20％,低于癌旁组织的34％,差异有统计学意义（P＜0.05）。MKP-4表达与组织学分级（P=0.047）、静脉侵袭（P=0.026）和TNM分期（P=0.036）有关。Kaplan-Meier法显示,MKP-4低表达者的中位总生存时间（OS）为52个月,MKP-4高表达者的中位OS未达到,后者OS明显长于前者（P＜0.05）。结论 MKP-4在HCC的发生、发展中起抑癌基因的作用,可能是HCC潜在的治疗靶点和判断预后的分子标志物。     

CISD2在肝细胞肝癌组织和细胞中的表达及其临床意义

目的:探究CDGSH铁硫结构域2(CISD2)在肝细胞肝癌（hepatocellular carcinoma,HCC）组织和细胞中的表达及临床病理意义。方法:采用免疫组织化学染色方法检测100例HCC肿瘤组织标本及46例癌旁肝组织标本中CISD2的蛋白表达水平,分析CISD2与临床病理特征、增殖相关蛋白Ki-67、患者生存率的相关性;运用Western blot法检测人HCC细胞株BEL7404、HepG2、SMMC-7721以及人正常肝细胞株L02中CISD2的表达,分析其表达差异。结果:CISD2在HCC肿瘤组织中的表达水平明显高于癌旁肝组织,CISD2在肝癌细胞株中的表达水平也明显高于正常肝细胞,差异有统计学意义(P＜0.01)。CISD2的表达与HCC患者的肿瘤大小（P＜0.05）以及Ki-67指数相关(P＜0.001),CISD2高表达患者的总生存率低于低表达者。结论:CISD2在HCC组织和细胞中高表达,其表达水平与患者的预后有关。CISD2可能成为HCC预后判断的标志和治疗的潜在靶点。