基于网络药理学探讨加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭的潜在靶点及作用机制

【目的】利用网络药理学预测加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭（CHF）的潜在靶点及其作用机制。【方法】通过TCMSP和BATMAN数据库获取加味参附颗粒的相关活性成分和靶点，通过GeneCards、DisGeNET数据库遴选慢性心力衰竭相关的靶点，取交集靶点；运用STRING数据库进行靶蛋白互作分析。运用Metascape数据库对药物-疾病共同靶点进行基因本体论（GO）和京都基因与基因百科全书（KEGG）富集分析。运用Cytoscape 3.9.1软件构建成分-靶点-通路网络图。【结果】筛选出加味参附颗粒中42个活性成分和435个直接作用的蛋白靶点，得到38个药物-疾病交集靶点。GO与KEGG富集分析结果显示，加味参附颗粒在血液循环、清除氧自由基、平滑肌细胞的调节、细胞和基因调控等多生物过程方面，通过IL-6、RELA、TNF、VEGFA、MMP-2、MAPK8、TP53、EDN1、MMP-9等核心靶点，流体剪切应力与动脉粥样硬化途径、AGERAGE、HIF-1、MAPK、IL-17、TNF、cAMP、钙等信号通路治疗慢性心力衰竭。【结论】加味参附颗粒可通过改善心脏供血、抑制炎症反应、抗氧化...     

精神分裂症发病机制及治疗靶点的研究现状

精神分裂症是一种严重的精神疾病,但确切的机制至今尚未研究透彻。近来,研究者们发现D1、D2受体的过度活化、多巴胺和环腺苷酸调节的磷蛋白的调节机制、受体磷酸化磷酸酶β/ζ的编码基因PTPRZ1(蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,Z多肽1)与精神分裂症密切相关;γ氨基丁酸α受亚单位α5受体进行变构调节,能逆转多巴胺功能异常亢进,进而缓解精神分裂症的阳性症状。     

基于随机森林算法预测红景天治疗心脑血管类疾病的潜在靶点

目的 应用网络药理学研究方法中的随机森林算法构建药物-靶点模型,预测红景天治疗心脑血管类疾病的关键靶标。方法 搜集KEGG数据库中小分子药物-核蛋白、小分子药物-G蛋白、小分子药物-离子通道、小分子药物-酶四类药靶数据作为训练集,采用随机森林算法构建药物-靶点模型并预测红景天体内潜在作用靶点,应用Cytoscape软件构建红景天化学成分、体内潜在作用靶点及相关疾病网络;利用十折交叉验证进行模型精度评价。结果 红景天的9个化学成分被预测出多个作用靶点并得到较好的文献验证,小分子药物-核蛋白、小分子药物-G蛋白、小分子药物-离子通道、小分子药物-酶四类药靶模型的预测正确率分别是68.22%、73.71%、67.08%、71.36%。结论 本方法所建模型预测红景天治疗心脑血管类疾病的关键靶标精度较高,也可用于预测其他中药化学成分的潜在作用靶点。     

组蛋白去乙酰化酶调控在小鼠哮喘发病机制中的作用

目的比较组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂曲古抑菌素A(TSA)及地塞米松(Dex)对哮喘小鼠治疗作用的差异,探讨HDAC调控在哮喘发病机制中的作用。方法BALB/C小鼠分为空白对照(A)组、哮喘对照(B)组、Dex治疗(C)组和TSA治疗(D)组。B、C、D组小鼠通过卵清蛋白腹腔注射致敏、经鼻滴注激发造成哮喘模型,C、D组小鼠每次激发前30 min分别予Dex 1.5 mg/kg(0.2 mL)和TSA 1 mg/kg(0.2 mL)腹腔注射。末次激发24 h后测定肺功能,采用酶联免疫吸附试验测定血浆和左肺肺泡灌洗液(BALF)上清液中白细胞介素(IL)-4及干扰素(IFN)-γ水平,对血细胞及BALF沉淀中的白细胞进行分类计数,观察右上肺组织切片的病理改变。结果与B组比较,C、D组小鼠的哮喘症状明显减轻,气道阻力显著降低(P值均<0.05),肺顺应性显著升高(P值均<0.05)。C组血液中淋巴细胞及嗜酸性粒细胞(EOS)计数显著低于B组(P值分别<0.05、0.01),C组及D组BALF中EOS计数显著低于B组(P值均<0.05);D组血液中淋巴细胞计数及BALF中EOS计数显著高于C组(P值均<0.05)。C组及D组血清和BALF中IL-4水平显著低于B组(P值分别<0.01、0.05),B、C、D 3组间血液及BALF的IFN-γ水平的差异均无统计学意义(P值均>0.05)。结论TSA及Dex均能显著缓解小鼠的哮喘症状,改善气道高阻力及肺顺应性。TSA抑制BALF中淋巴细胞增生的作用弱于Dex。Dex及TSA均能显著抑制哮喘小鼠辅助性T淋巴细胞2型细胞因子IL-4的分泌,但都缺乏升高IFN-γ的作用。     

多发性硬化的免疫机制进展及潜在治疗靶点

多发性硬化(multiple sclerosis,MS)是一种好发于中青年患者的中枢神经系统(central nervous system,CNS)自身免疫性疾病。该病可导致认知、运动、感觉、语言等多种功能障碍。深入探索MS的发病机制,发掘有效的药物作用靶点具有重要意义。本文通过分析、归纳近年来国内外MS的研究进展,旨在为进一步阐明其发病机制及潜在治疗靶点提供借鉴。     

基于网络药理学探究甘草查尔酮A抗鼻咽癌的潜在靶点和作用机制

目的:运用网络药理学的方法预测甘草查尔酮A(LCA)抗鼻咽癌的潜在作用靶点及作用机制.方法:通过PubChem平台获得LCA的3D结构,并用Swiss Target Prediction数据库筛选出LCA靶点以及Uniprot数据库进行靶点蛋白和基因信息校正,得到相应的基因名称数据库.通过人类基因组注释数据库(gene...     

基于蛋白质组学筛选单肺通气潜在肺损伤标志物

目的 应用蛋白质组学研究单肺通气及急性肺损伤( ALI)/急性呼吸窘迫综合征( ARDS)的差异蛋白,筛选单肺通气潜在肺损伤相关标志物. 方法 检索数据库应用蛋白质组学研究ALI/ARDS生物标志物的文献(文献组);应用同位素标记绝对和相对定量( iTRAQ)技术检测20例行单肺通气肺癌患者血清差异蛋白质(实验组). 分析文献数据与实验数据的异同. 结果 文献组检索获得符合求文献13篇,涉及ALI/ARDS蛋白标志物229个;实验组共鉴定出189个蛋白,至少在2个时间点发生差异表达的蛋白质31个,利用生物信息学选出11个核心蛋白. 综合两组经数据分析后,共筛选出21个潜在肺损伤差异蛋白,其中有9个蛋白被重复发现2 次以上,包括触珠蛋白、S100 钙结合蛋白A8、抗凝血酶Ⅲ等.结论 数据分析后获得的21个蛋白质可能是潜在增加单肺通气肺损伤的生物学标志物,值得进一步研究.     

基于网络药理学和分子对接分析醒消丸治疗肺癌潜在靶点及作用机制

目的：基于网络药理学方法分析醒消丸治疗肺癌的靶点与分子机制,为临床拓展运用及基础研究提供参考。方法：通过BATMAN-TCM数据库获取醒消丸的主要化学成分及其靶点,根据Swiss ADME筛选有效化合物,并通过SwissTargetPrediction预测其靶点;通过GeneCards、OMIM(OMIM-Gene-Map-Retrieval)、TTD、DRUGBANK数据库获取肺癌主要靶点并整合;通过Venn获取醒消丸治疗肺癌的交集靶点;运用String平台获取交集靶点,BisoGenet3.0筛选醒消丸治疗肺癌的核心靶点;采用Metasacpe数据库分析交集靶点参与的生物过程及通路;采用Cytoscape3.7.2软件构建“醒消丸有效成分-靶点-通路”网络;最后采用Autodock进行分子对接验证。结果：醒消丸调治肺癌主要通路有PI3K/Akt/mTOR、MAPK、MicroRNA等,核心靶点有AKT1、SIRT7、MDM2、MTOR等。结论：研究初步揭示了醒消丸治疗肺癌可能涉及肿瘤血管生成、转移、代谢重编程等机制,为今后临床应用和基础研究提供了一定的思路和参考。     

血管老化在腹主动脉瘤发病中的作用及潜在的治疗靶点

腹主动脉瘤是老年人中常见的主动脉退行性疾病,随着人口老龄化的进展,其发病率逐渐增高。然而,目前尚无特定的药物可以治愈或延缓腹主动脉瘤的扩张,动脉瘤一旦破裂患者死亡率接近90%,严重威胁患者生命健康。鉴于腹主动脉瘤在老年人群中的高发病率,本文将从血管老化的角度讨论衰老在腹主动脉瘤发病中的作用,包括慢性炎症、氧化应激、线粒体功能障碍、蛋白质稳态失衡、凋亡和坏死增加、细胞外基质重塑、营养感应失调、表观遗传改变、促衰老因子增加等,并列举一些腹主动脉瘤衰老相关的潜在药物靶点。本文将为腹主动脉瘤发病机制、药物研发、生物标志物等转化研究提供新思路。     

Utilization of LCM Technique in Sample Preparation for Proteomics Study of Lung Cancer Tissue

Objective Protein-based study plays a very important role in exploring tumor pathogenesis in the post-genomic era. However, tissue heterogeneity presents a major problem in the proteomics study of lung cancer. The aim of this study was to explore the methods of sample preparation for protein-based study of lung cancer tissue using laser capture microdissection （LCM） technique. Methods Six patients with lung squamous cell carcinoma （SQCC）, six patients with lung adenocarcinoma （AD） and six normal lung tissues including 2 cases matched with SQCC and 4 cases matched with AD （from at least 5 cm away the edge of the tumors were included in this study. Tissue sample firstly were cut with a cryostat sections and stained with the improved hematoxylin and eosin （H ＆ E）. LCM using the Arcturus PixCell II system was performed to enrich specific cell populations. The protein was quantitated by Bradford assay after protein extraction from LCM cells. One-way analysis of variance （ANOVA） was used to compare the differences of cell number and protein quantity among three groups. Results We found that fresh frozen material was more desirable in protein-based studies. The improved H＆ E was a feasible staining methods for recognizing cells of interest under light microscope. 56, 60, 63 LCM caps in lung SQCC, lung AD and normal lung were respectively collected. Cell number of normal lung tissue was significantly less than that of lung SQCC and lung AD under visual field of microscope （P〈0.05）. Total protein of lung SQCC, lung AD and normal lung group were respectively 248.20 μg, 261.64 μg and 183.88 p.g. Conclusion The results indicated LCM was a powerful tool in facilitating the molecular biology analysis of lung cancer tissue. It could effectively overcome the heterogeneous problem of lung cancer tissue and provide a more meaningful insight into tumor pathogenesis.     

季节性哮喘的发病与治疗

季节性哮喘是一种特殊类型的哮喘,具有季节性、地域性等特点,其发病与接触过敏原、气候变化、环境状况、地域等有关。笔者认为,肾、肺、脾三脏虚损是其发病内因;宿根内伏于肺,遇感引发是其发病特点;治疗应注重培补正气,从本调治,根据体质和脏气的不同虚候,采取益肾、补肺、健脾之法,发作时再配合清肺化痰、疏风解痉、行气平喘之法,以冀控制其发作。     

基于网络药理学研究止嗽散治疗咳嗽变异性哮喘的分子机制

目的 通过整合药物代谢动力学数据进行多重药物靶点预测,探究止嗽散治疗咳嗽变异性哮喘(cough variant asthma,CVA)的作用机制。方法 先利用大规模数据挖掘、文献检索搜集止嗽散方中所有中药的化学成分,再利用药物代谢动力学数据筛选其活性成分并用Swiss Target Prediction、SysDT和TargetNet方法进行靶点预测,并借助GeneCards和OMIM数据库获得CVA的致病基因,并与药物靶点取交集以构建蛋白相互作用网络,对获得的核心靶点进行生物学功能富集分析,最后选取若干核心靶点及其关键的成分进行分子对接验证。结果 共筛出止嗽散治疗CVA的活性成分97个（包括白前苷元C、7,4′-二羟基黄酮、甘草酸、新对叶百部碱和β-谷甾醇）及靶点144个。通过分析蛋白相互作用网络得到MAPK3、TNF、CASP3、EGFR、PTGS2和MMP-9等10个核心靶点。KEGG富集分析得到30条与CVA相关的通路。分子对接验证核心靶点中EGFR、PTGS2和MMP-9与其关键化合物有较好结合力。结论 止嗽散治疗CVA涉及多条信号通路,其分子机制可能是通过止嗽散中主要活性成分对PI3K-Akt、NF-κB和HIF-1等通路的调控,最终达到治疗CVA的效果。     

基于网络药理学探讨沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制

目的 从药物、疾病、靶点角度研究沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制,为进一步实验验证提供理论基础.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及中医药综合数据库(TCMID)收集沙参麦冬汤药物有效成分,导入PubChem数据库获取有效成分结构,将结构导入Swiss TargetPrediction数据库进行靶点预测...     

白细胞介素与哮喘发病机制的研究进展

支气管哮喘是由多种细胞和细胞因子参与的肺部慢性炎症性疾病,发病机制尚未完全清楚。目前认为,Th1/Th2反应失衡导致Th2细胞过度激活是支气管哮喘重要的免疫学机制之一。现对近年新发现的不同种类的白细胞介素在哮喘发病机制中的作用进行综述,确定了白细胞介素在哮喘发生、发展中的地位,对哮喘的临床实践有一定的指导意义。     

哮喘夜间发作病因病机探讨

哮喘常在夜间发作、加重或导致猝死,从阴阳变化、经脉流注及气机升降等角度探讨其病因病机,认为夜间阴盛而阳虚,痰为阴邪,同气相求,夜间痰邪偏盛,阻塞气道,使肺气宣发肃降失常,引发哮喘;夜间卫气入里,无力御邪,白天接触的过敏原等外来之邪易在夜间袭肺而致哮喘发作;肺主寅时,寅时阳始升,阴始衰,此时卫阳较弱,寒邪较盛,邪胜正虚,故易发病;肺胃同主降气,哮喘患者睡眠时由于体位的改变,易致胃气上逆,上传于肺,令肺气肃降失常,上逆为咳、痰、喘。     

CpGODN对哮喘小鼠肺组织GITR/GITRL表达的影响

目的 观察CpGODN干预对哮喘小鼠肺组织GITR及GITRL表达的影响.方法 48只SPF级雄性BALB/c小鼠随机分为正常对照组(简称对照组),哮喘模型组(简称模型组),地塞米松治疗组,CpGODN治疗组.以卵清白蛋白(OVA)致敏和激发建立小鼠哮喘模型.观察肺组织病理;对支气管肺泡灌洗液(BALF)进行细胞分类及计数;反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、免疫组化检测肺组织中GITR、GITRL的表达.结果 BALF中嗜酸性粒细胞平均((x)±s,下同)计数:CpGODN组为(2.76±0.25)×107/L,地塞米松组为(1.05±1.72)×107/L,均低于模型组的(12.09±2.62)×107/L,差异有统计学意义(P＜0.01),CpGODN组与地塞米松组比较差异无统计学意义(P＞0.05).RT-PCR、免疫组化结果:CpGODN组与地塞米松组GITR、GITRL表达高于模型组,差异有统计学意义(P均＜0.05),CpGODN组GITRL mRNA、GITR蛋白表达高于地塞米松组,差异有统计学意义(P＜0.05).相关分析:肺组织GITR与GITRL表达呈正相关(P＜0.01,n=40).结论 CpGODN能改善哮喘小鼠气道炎症,显著增强哮喘小鼠模型中GITR及GITRL在肺组织中的表达.     

不同亚型Smads信号蛋白在慢性支气管哮喘小鼠肺组织表达的意义

目的 观察慢性支气管哮喘小鼠肺组织内Smads不同亚型信号蛋白的表达,探索不同亚型Smads蛋白及其传导的信号通路在慢性支气管哮喘小鼠慢性气道炎症及气道重塑过程中的作用。 方法 建立急性哮喘及慢性哮喘小鼠动物模型,行肺组织病理切片,分别以免疫组织化学法和Western-blot法检测肺组织Smad 1,3,4,5,7的表达。 结果 慢性哮喘组小鼠的肺组织病理可见杯状细胞顶部空泡化明显,支气管黏膜下及肺实质血管旁多种炎症细胞浸润,支气管黏膜皱襞明显增多,上皮细胞增生紊乱。免疫组织化学法和Western-blot法检测结果显示,急性哮喘组小鼠的R-Smads(Smad 1,3,5)及Co-Smad(Smad 4)表达较正常对照组均明显升高(P<0.05),I-Smad(Smad 7)表达减少(P<0.05); 慢性哮喘组BMP/Smads信号通路Smads蛋白(Smad 1,5)表达较急性哮喘组降低(P<0.05),Smad 7较急性哮喘组明显升高(P<0.05),而TGF-β1/Smads信号通路Smads蛋白(Smad 3)及Co-Smad(Smad 4)表达则较急性哮喘组进一步升高(P<0.05)。 结论 转导不同上游信号分子的Smads蛋白所介导的信号通路在慢性支气管哮喘活化状态不同,TGF-β1/Smads信号通路在慢性支气管哮喘活化,BMP/Smads信号通路在急性哮喘中活化,但在慢性哮喘中活化降低。