线粒体DNA转录表达与胃癌发生关系的研究

目的：检测胃癌组织线粒体DNA的转录表达水平变化，探讨mtDNA转录表达变化与胃癌发生的关系。方法：应用RT—PCR法检测42例配对的胃癌和癌旁正常胃粘膜组织的线粒体编码基因CO Ⅰ、ND4、ND5、cyt—b和ATP-6的转录表达差异，并以β—actin作为定量标准物，最后行琼脂糖凝胶电泳。结果：胃癌组织线粒体C0I和ND4的转录水平显著高于远癌正常胃粘膜组织．P〈0．01；胃癌CO Ⅰ和ND4的表达水平与胃癌的组织分化程度呈负相关；肠型胃癌ND4和CO Ⅰ的表达高于弥漫型胃癌，P〈0．05。结论：胃癌的发生需要线粒体提供的某些转录物和蛋白以维持其恶性表型所需要的能量和（或）其他物质，而且分化程度愈低愈需要这种活动以增强其恶性生物学表型和行为。     

同源盒转录因子CDX2与Y染色体决定因子SOX9在肠上皮化生及胃癌组织中的表达

目的:研究同源盒转录因子CDX2和Y染色体决定因子SOX9在肠上皮化生(intestinal metaplasia,IM)及胃癌组织中的表达,探讨CDX2和SOX9在IM发生、进展及胃癌发生、发展中的作用及相互关系.方法:选取慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)伴IM 24例、癌旁IM 17例、胃癌组织50例,用HE染色对IM及胃癌进行组织学分型,免疫组化法观察CDX2、SOX9蛋白在上述各种胃黏膜组织中的表达,研究二者表达与胃癌临床病理学特征之间的关系.结果:CDX2蛋白表达阳性率在CAG伴IM组、癌旁IM组和胃癌组分别为87.50％、76.47％和62.00％,CAG伴IM组显著高于胃癌组(P＜0.05),CAG伴IM组与癌旁IM组、癌旁IM组与胃癌组之间比较无统计学差异(P＞0.05),肠型胃癌显著高于弥漫型胃癌(77.78％ vs 43.48％,P=0.013).CDX2蛋白在胃癌中的表达与胃癌临床分期、分化程度、Lauren分型及是否有浆膜浸润等有关.SOX9蛋白表达阳性率,在CAG伴IM组、癌旁IM组及胃癌组分别为54.17％、70.59％、80.00％,CAG伴IM组显著低于胃癌组(P＜0.05),CAG伴IM组与癌旁IM组、癌旁IM组与胃癌组之间比较无统计学差异(P＞0.05),肠型胃癌显著高于弥漫型胃癌(92.59％ vs 65.22％,P=0.040).SOX9蛋白在胃癌中的表达与胃癌分化程度、临床分期、Lauren分型和是否淋巴结转移等有关联.胃癌组织中CDX2和SOX9的阳性表达存在显著性负相关(r=-0.391,X2=5.778,P=0.016).结论:CDX2、SOX9在IM及肠型胃癌的发生中可能有重要作用,可做为IM及肠型胃癌预测的特异性指标之一.二者可能在胃癌进展及浸润转移过程中起重要作用,联合检测对选择合适治疗方式及预后判断具有重要价值.     

胃癌内质网应激特征相关基因的筛选及预后风险模型的构建

目的基于生物信息学方法筛选胃癌内质网应激(ERS)特征相关差异表达基因并构建预后风险模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取375例胃癌和32例癌旁组织样本的转录组测序数据(RNA-seq)及相应临床信息作为训练集样本;从基因表达综合(GEO)数据库中下载387例胃癌患者数据(GSE84437)作为验证集样本;数据获取时间均为2021年12月25日。从GeneCards数据库中获取785个ERS特征相关基因(ERS-RG)。分析TCGA数据库中胃癌组织与癌旁组织之间差异表达基因。将鉴定出的胃癌差异表达基因与GeneCards数据库中ERS-RG取交集, 得到胃癌ERS特征相关差异表达基因, 对其进行基因本体功能(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用单因素Cox比例风险模型筛选具有预后价值的胃癌ERS特征相关差异表达基因, 进行LASSO回归分析, 构建多基因预后风险模型, 计算预后风险评分。根据预后风险评分的中位数(2.369), 将训练集和验证集中患者分别分为高风险组与低风险组;采用Kaplan-Meier生存分析比较两组患者总生存(OS), 并绘制时...     

散发性肠型和遗传性弥漫型胃癌中上皮钙黏附素的表达差异及意义

目的探讨上皮型钙黏附素(E-cadherin,E-cad)在肠型和弥漫型胃癌中的表达情况及其对疾病发生、治疗和预后评估的意义。方法采用免疫组化S-P法对30例正常胃或胃炎粘膜上皮组织、30例散发性肠型胃癌组织和30例遗传性弥漫型胃癌组织中E-cad表达情况进行研究。结果正常或胃炎上皮组织中E-cad全部为阳性表达,表达均匀,散发性肠型胃癌和遗传性弥漫型胃癌组织中E-cad表达均明显减低(P<0.05),表达阳性率分别为63%(19/30)和23%(7/30)。散发性肠型胃癌中E-cad的表达与临床分期相关(P<0.05),遗传性弥漫型胃癌中E-cad的表达与疾病临床分期无关(P>0.05)。结论散发性肠型胃癌E-cad表达降低,呈断续性或者胞浆异位性表达,并与临床分期相关,可能对肠型胃癌的预后评估和治疗具有指导意义。E-cad在遗传性弥漫型胃癌中表达降低更为明显,大部分癌组织中呈现表达缺失,但与分期无关,E-cad表达缺失在遗传性弥漫型胃癌发病的早期可能具有重要作用。     

cDNA微阵列对22例弥漫型胃癌基因的检测

目的从转录组水平识别弥漫型胃癌与正常胃黏膜间的基因表达差异,探讨胃癌分子发生发展机制。方法收集22例弥漫型胃癌患者的新鲜冻存胃癌组织及同例相应正常胃黏膜。杂交芯片采用含14592个点的cDNA表达谱芯片。差异表达基因的筛选标准为该基因在50％以上样本中的肿瘤与正常组织荧光强度比（ratio比值）〉2或〈0．5。采用系统聚类法进行基因表达的相似性分析,标本组间比较采用方差分析。应用实时定量RT—PCR方法对芯片结果进行验证。结果胃癌组织与正常胃黏膜间的差异表达基因共357个,其中表达上调者153个,下调者204个。上调基因功能主要与细胞骨架运动、基质重建、细胞增殖及信号传导等相关;下调基因功能则主要与细胞免疫防御、毒理代谢、功能分化、核一浆转运及凋亡抑制等相关。TNM分期的Ⅰ＋Ⅱ期组与Ⅲ＋Ⅳ期组间,有7个基因的表达差异有统计学意义（P〈0．05）。RT—PCR验证结果与芯片表达结果一致。结论运用cDNA芯片进行弥漫型胃癌基因表达谱分析,有助于从分子水平全方位阐明弥漫型胃癌的发病机制及生物学特性,也有助于进一步发现新的分子诊断指标和基因治疗靶标。     

胃癌组织中肿瘤浸润的免疫细胞NIBP表达与胃癌发生发展的关系

目的:分析胃癌组织中肿瘤浸润的免疫细胞NIBP（NIK and IKKβ binding protein,NIBP）的表达,探讨其与胃癌发生发展的关系。方法:应用免疫组织化学染色法,检测组织芯片中123例胃癌组织肿瘤浸润的免疫细胞和123例相匹配的癌旁良性胃组织上皮细胞间免疫细胞NIBP蛋白的表达水平。结果:胃癌（P=0.012）和萎缩性胃炎伴肠上皮化生（P=0.015）组织中免疫细胞NIBP表达水平明显高于正常胃黏膜和浅表性胃炎。弥漫型胃癌组织中免疫细胞NIBP的表达水平明显高于肠型胃癌（P=0.013）和癌旁良性胃组织（P=0.002）。胃癌组织（P=0.087）及肠型胃癌组织（P=0.860）与癌旁良性胃组织相比,免疫细胞NIBP的表达水平无明显差异。在弥漫型胃癌组织中,肿瘤浸润的免疫细胞NIBP表达水平与淋巴结转移显著相关（P=0.032）,随着淋巴结转移数量增多,肿瘤浸润的免疫细胞NIBP表达水平增高。结论:肿瘤浸润的免疫细胞NIBP表达可能在炎症反应促进胃癌的发生、发展过程中发挥重要作用。NIBP可能是今后胃癌治疗新的分子靶点。     

胃癌组织中抗体产生细胞的研究(综述)

胃癌的发生、发展和转移与机体的免疫功能密切相关。胃癌局部组织内的免疫反应与全身免疫功能的变化并不一致。研究机体对胃癌的免疫作用,了解癌组织的局部免疫反应十分重要。Inberg 对575例胃癌进行病理分析,发现弥漫型胃癌局部免疫细胞浸润少,5年存活率低;肠型胃癌局部免疫细胞浸润明显,5年存活率高。国内也有类似报导。児玉好史、陈铁镇等对胃癌局部淋巴结进行研究,亦发现T 淋巴细胞区(PH)和B 淋巴细胞区(GH)增生明显者5年存活率明显升高。说明胃癌组织内的T、B 淋巴细胞均能抑制肿瘤生     

c-fos、bcl-2基因表达与肠型、弥漫型胃癌的关系

目的：探讨c-fos、bcl-2基因蛋白表达与肠型、弥漫型胃癌的发生的关系，为胃癌分型、早期诊断提供分子病理学依据。方法：用免疫组织化学方法，检测54例胃癌切除标本c-fos、bcl-2基因蛋白的表达，所有结果均用EXCEL录入计算机、SAS统计软件包分析。结果；在肠型胃癌中c-fos、bcl-2基因蛋白表达高于弥漫型胃癌（P＜0.01）；c-fos、bcl-2基因表达淋巴结转移组高于非转移组（c-fos为63.64%、54.55%；bcl-2为50.00%，27.27％），但无统计学意义；c-fos、bcl-2在癌旁组织、异型增生组织和高分化腺癌中呈强阳性表达。结论：c-fos、bcl-2在肠型和弥漫型胃癌中的不同表达表明两型胃癌的发生机制有所不同，可为胃癌分型提供分子病理学依据；c-fos、bcl-2基因蛋白表达变化发生在肿瘤细胞形态变化之前，可作为胃癌早期诊断的分子病理学指标。     

青年胃癌发病与病理特点分析

目的:分析青年胃癌的发病特点和病理特征,为青年胃癌的预防和治疗提供理论依据。方法:对我院1983年～2005年收治的1839例患者资料进行筛选和研究,并对青年胃癌的性别、发病年龄和不同病理学类型进行分析,评价遗传因素在胃癌发病中的作用。结果:青年胃癌以弥漫型多见(40.49%),病理分型多为低分化腺癌、黏液细胞癌和印戒细胞癌,恶性程度高,女性发病年龄更低,男女性比例接近。具有家族遗传背景或遗传性胃癌患者中青年发病者多于中老年(39/189vs69/1454,P<0.001;16/189vs21/1454,P<0.001),男性更易受遗传因素影响。结论:青年胃癌以高度恶性弥漫型为主,发病呈上升趋势,且与遗传背景具有一定的相关性,临床上应提高警惕,特别是对于具有遗传背景的高危人群。     

198例胃癌手术标本Her-2蛋白表达与临床病理的相关性和靶向治疗

背景与目的:通过组织芯片(tissue microarry,TMA)和免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)技术检测人类表皮生长因子受体2(Human epidermal growth factor receptor2,Her-2)在胃癌(gastric carcinoma,GC)中的表达,研究胃癌中Her-2表达的临床意义,为胃癌靶向治疗奠定理论基础.方法:构建包含198例目癌组织和89例正常胃黏膜的组织芯片,应用免疫组化方法检测胃癌中Her-2蛋白的表达.分析Her-2表达与临床病理参数之间的相关性及其对预后的影响.结果:198例胃癌中男性147例,女性51例,男女比例为2.9:1.患者年龄31～85岁,中位年龄66.5岁.按照Lauren's分型分为肠型169例,弥漫型29例.组织芯片免疫组化结果显示198例胃癌细胞中Her-2总表达率为32.8%,而正常胃黏膜无表达.Her-2表达与肿瘤大小、组织类型、肿瘤侵袭深度和TNM分期有关.肠型胃癌的表达率(36.7%)明显高于弥漫型胃癌(10.4%,P=0.005).Her-2蛋白表达与患者性别、年龄、肿瘤部位及预后无关.结论:胃癌中Her-2蛋白的表达率为32%,其表达与胃癌的某些生物学行为有关.肠型胃癌Her-2蛋白表达率明显高于弥漫型胃癌.因此,肠型胃癌患者町能为曲妥珠单抗靶向治疗的主要群体,并有可能从辅助靶向治疗中获益.     

胶原蛋白作为胃癌潜在生物标志物的生物信息学分析

目的： 应用生物信息学方法探讨胃癌的潜在生物标志物。方法： 检索与“Gastric cancer”相关的数据集,使用R语言和韦恩图分析胃癌中的差异表达基因（DEGs）;使用DAVID软件对DEGs进行功能注释;利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络并确定核心基因;Oncomine数据库分析核心基因在胃癌中的表达模式;最后,利用Kaplan-Meier数据库分析核心基因的预后价值。结果： NCBI筛选获得3个与胃癌相关的数据集,得到了110个DEGs。功能富集分析显示,DEGs主要富集在细胞外基质受体相互作用的功能和途径中。其中一组基因在胃癌组织中显著上调,并以COL1A1、COL1A2、COL2A1、COL12A1、COL6A3、COL10A1等为重要节点构成蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用miRNA-mRNA分析发现hsa-miR-29a-3p、hsa-miR-29b-3p和hsa-miR-29c-3p可以同时调控COL1A1、COL1A2、COL6A3和COL2A1,且均属于hsa-miR-29家族成员。进一步分析核心蛋白在胃癌中的表达情况,发现collagen家族成员中COL1A1、COL1A2、COL12A1、COL6A3、COL10A1等在胃癌组织中均较正常胃组织表达上调（P<0.05）。生存分析显示COL1A1、COL1A2、COL12A1、COL6A3、COL2A1和COL10A1高表达患者较低表达患者预后差（P<0.05）。结论： 本研究发现胶原蛋白在胃癌中表达明显上调,并与胃癌患者的预后密切相关,可能是胃癌患者潜在的生物标志物。     

Linc00704对结直肠癌细胞增殖、迁移及侵袭的影响

目的 探讨Linc00704（long non-coding RNA 00704）对结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。方法 RT-qPCR检测配对结直肠癌及癌旁正常组织、结直肠癌细胞和正常永生化人结肠上皮细胞系FHC中Linc00704 mRNA的表达。反义寡核苷酸（antisenseoligonucleotide,ASO）转染结直肠癌细胞构建Linc00704低表达细胞模型,慢病毒感染结直肠癌细胞构建Linc00704过表达细胞模型,RT-qPCR检测转染效率;CCK-8实验检测细胞增殖能力,Transwell实验检测细胞迁移及侵袭能力。结果 相比癌旁组织,Linc00704在结直肠癌组织中表达降低（t=4.103,P<0.001）。8种结直肠癌细胞系中有6种细胞系（RKO、HCT15、NCI-H716、SW480、SW1463、SW48）Linc00704的表达较FHC细胞低（F=44.750,P<0.001）。沉默 Linc00704表达可促进Caco-2、DLD-1细胞迁移和侵袭能力（均P<0.01）,但对增殖无明显影响（均P>0.05）。过表达Linc00704可抑制RKO、HCT15细胞迁移和侵袭能力（均P＜0.001）,但对增殖无明显影响（均P>0.05）。结论 Linc00704在结直肠癌组织中呈低表达,过表达Linc00704可抑制结直肠癌细胞迁移和侵袭能力。     

基于生物信息学和转录组测序分析结直肠癌5-FU耐药关键靶点北大核心

目的:筛选结直肠癌5-氟尿嘧啶(5-FU)耐药靶基因,并探究该基因对结直肠癌耐药细胞的作用及其作用机制。方法:通过GEO数据库分析GSE28702芯片筛选结直肠癌患者5-FU耐药与5-FU敏感的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);利用GO与KEGG数据库对DEGs进行通路富集分析;通过STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,利用Cytoscpae的cytohubba工具筛选枢纽基因。构建5-FU耐药细胞株HCT8/5-FU,利用高通量转录组测序鉴定;采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)对诊断价值进行评价并基于TCGA数据库COAD数据集分析关键基因表达及预后;构建TF基因过表达载体转染到HCT8/5-FU细胞系,MTT法检测细胞活力;流式细胞术测定细胞凋亡与细胞周期;qRT-PCR与Western Blot检测基因mRNA和蛋白水平。结果:共筛选出239个DEGs;DEGs主要富集在细胞外囊泡、内吞囊泡腔、药物代谢等通路;PPI得到20个枢纽基因;转录组学显示转铁蛋白(transferrin,TF)在耐药株中显著下调(P<0.05)与生物信息学分析得到的DEGs中TF基因改变趋势相同;与正常结直肠组织相比,癌组织中TF低表达(P<0.05);TF高表达患者总体生存期更长(P<0.05);上调TF表达增强了耐药细胞的5-FU敏感性(P<0.05);上调TF表达增加了5-FU诱导的细胞凋亡与G_(0)/G_(1)期的阻滞(P<0.05);上调TF表达抑制了耐药细胞ABCC1的表达(P<0.05)。结论:基于生物信息学和转录组测序筛选出结直肠癌5-FU耐药靶基因TF,TF基因可能通过调控ABCC1表达降低结直肠癌5-FU的耐药性。     

基于生物信息学筛选胰腺导管腺癌关键基因

目的:利用生物信息学方法分析胰腺导管腺癌（PDAC）基因表达谱芯片并筛选关键基因。方法:从公共数据库基因表达数据库（GEO）中下载PDAC基因表达谱芯片GSE28735、GSE15471、GSE101448,共纳入108例PDAC样本和97例癌旁组织样本。应用R语言limma包和impute包筛选差异表达基因。利用DAVID数据库和在线分析工具Kobas分别对差异基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。利用STRING数据库和Cytoscape软件构建差异蛋白互作网络并进一步筛选关键基因。结果:3个基因表达谱芯片共有161个差异表达基因（|log2 fold-change(FC)|>2,P<0.05）,包括54个上调基因,107个下调基因。GO功能富集分析显示差异基因与extracellular exosome、extracellular space、extracellular matrix organization密切相关。KEGG通路分析显示差异基因主要富集在protein digestion and absorption、ECM-receptor interaction和focal adhesion等通路。蛋白质相互作用网络图中显示节点最多的10个枢纽基因分别是ALB、COL11A1、COL3A1、FN1、EGF、COL1A1、MMP9、COL5A2、ITGA2、COL6A3。结论:筛选所得的10个关键基因可能在PDAC发生发展中发挥重要作用,有望成为PDAC诊断及治疗的生物学靶标,为进一步研究PDAC发生发展的分子机制提供了理论依据。     

胃癌中STAT3、p-STAT3和Bcl-xL的表达及临床意义

目的 检测STAT3、p-STAT3与其下游靶基因产物Bcl-x_L蛋白在胃癌组织中的表达,探讨STAT3及其靶基因产物在胃癌发病机制中的作用。方法 采用免疫组织化学SP法检测53例胃癌及44例正常胃黏膜组织中STAT3、p-STAT3及Bcl-x_L蛋白的表达,并分析其与胃癌临床病理特征的关系。结果 STAT3、p-STAT3及Bcl-x_L蛋白在胃癌组织中的阳性表达率显著高于其在正常胃黏膜组织中的阳性表达率,差异均有统计学意义(P均<0.05)。STAT3蛋白的表达与胃癌组织的分化程度及淋巴结转移显著相关（P<0.05）;p-STAT3、Bcl-xL蛋白的表达与胃癌组织的分化程度、浸润深度、有无淋巴结转移及临床分期均有关(P均<0.05);三者与性别、年龄、肿瘤大小无明显相关性（P均>0.05）。胃癌组织中的p-STAT3与Bcl-xL蛋白表达之间呈正相关（r =0.346,P=0.011）。结论 STAT3信号转导通路在胃癌的发生、发展过程中起重要作用,检测胃癌组织中STAT3及靶基因Bcl-x_L的表达有助于判断肿瘤的恶性程度及病情进展。     

基于GEO数据库筛选胃癌分子标志物

目的：运用生物信息学方法结合基因表达数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）筛选参与胃癌发生发展的关键基 因,以获得用于胃癌诊断、治疗靶标选择及预后判断相关分子标志物。方法： 从GEO数据库中下载与胃癌（gastric cancer,GC）相 关芯片数据集,筛选差异表达基因（differentially expressed gene,DEG）, 对DEG 做功能富集分析,构建蛋白互作网络（proteinprotein interaction network,PPI）,筛选关键基因（key gene）,进而构建共表达网络、生存曲线以及层次聚类分析。结果：共筛选出 261个GC相关DEG,通过分析获得14个关键基因,分别为PLOD1、PLOD3、COL1A1、COL1A2、COL2A1、COL3A1、COL4A1、 COL4A2、COL8A1、COL12A1、COL15A1、ITGA2、LUM、SERPINH1。关键基因主要参与胶原纤维的组织、细胞外基质的组织、 细 胞外结构的组织、皮肤形态发生、胶原的合成及血管的发育等生物学过程。生存曲线分析表明,基因COL3A1（P=0.0241）表达的 改变显著降低了胃癌患者整体生存率;基因ITGA2（P=0.0679）的表达改变也显示与GC患者的无病生存率降低有关。与正常胃 组织相比,层次聚类分析表明,GC组织中基因PLOD1、PLOD3、COL3A1、ITGA2、COL1A2、COL1A1、COL4A1、LUM、COL12A1、 SERPINH1、COL8A1表达上调。结论：经筛选获得的关键基因可作为潜在分子标志物用于GC的早期诊断、治疗靶点选择和预 后判断,并为后续的研究提供参考。     

结直肠癌中miR-31的表达及预测靶基因的生物信息学分析

目的 检测microRNA-31（miR-31）在结直肠癌中的表达及功能,预测其靶基因并进行生物信息学分析,为研究其作用和调控机制奠定基础。方法 采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应（qRT-PCR）检测8种结肠癌细胞株、40例结直肠癌（colorectal cancer, CRC）患者癌组织及匹配的正常黏膜组织及33例结直肠腺瘤组织中miR-31的表达情况,并分析癌组织中miR-31表达与患者临床特征的关系。MTS法观察转染miR-31模拟物（mimics）组、抑制剂（inhibitor）组和对照组（miRControl）及空白细胞组细胞生长的差异,Western blot检测空白细胞组、miR-31 mimics和inhibitor三组细胞PCNA蛋白的表达。TargetScan、DIANA-microT、miRanda等软件预测miR-31的靶基因,并进行KEGG功能和信号通路富集分析。结果 miR-31在8种结肠癌细胞株中高表达,同时CRC患者癌组织中的表达高于腺瘤及正常黏膜组织（P<0.05）。其中癌组织和匹配的正常黏膜相比,miR-31表达明显上调（P=0.035）,但腺瘤和正常黏膜相比,差异无统计学意义（t=0.122, P=0.904）。miR-31的表达与临床病理特征间未见明显关系（P均＞0.05）。转染miR-31 mimics后,miR-31的表达明显上调且和miR-Control组及空白细胞组相比,miR-31 mimics组细胞生长加快;而转染miR-31 inhibitor组miR-31表达显著降低,细胞生长活力明显受抑制。同时转染miR-31 inhibitor组PCNA蛋白表达较miR-31 mimics组和空白细胞组显著降低。生物信息学分析miR-31靶基因功能集中于转录后及翻译水平的调节、细胞连接、迁移及细胞运动等生物学过程。信号通路主要富集于内吞作用、轴突导向、T细胞受体信号通路、Wnt及MAPK信号通路。结论 miR-31在结直肠癌中高表达,且miR-31可以促进细胞生长和增殖,其靶基因可能通过调节多种生物学过程发挥作用。     

miR-7及SP-1与非小细胞肺癌患者放疗敏感性的相关性研究

目的 探讨miR-7及其下游靶点特异性蛋白1（specific protein 1,SP-1）与非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）患者放疗敏感性的相关性。方法 收集湖南师范大学附属第一医院2018年7月—2020年9月收治的116例原发性NSCLC患者癌组织及其相应癌旁组织,并采集外周血。采用实时荧光定量PCR法测定组织和外周血血清中miR-7的表达水平,免疫组化检测SP-1蛋白表达水平,Logistic回归模型分析影响NSCLC患者放射敏感性的因素。结果 NSCLC患者癌组织中miR-7表达水平低于癌旁组织（P<0.001）,SP-1阳性表达率高于癌旁组织（P<0.001）。Pearson相关分析显示,血清miR-7与癌组织中的miR-7表达呈正相关（r=0.492,P<0.001）,SP-1表达阳性患者血清中的miR-7相对表达量低于阴性表达患者（P=0.005）。T3~4分期、TNM分期ⅢA~B期、有吸烟史、发生放射性肺损伤者血清和癌组织中的miR-7表达水平降低（均P<0.05）;癌组织中SP-1阳性表达率升高（均P<0.05）。与放射敏感组比较,放射抵抗组血清和癌组织中miR-7相对表达量降低（均P<0.001）,SP-1阳性表达率升高（P<0.001）。受试者工作特征曲线显示,血清miR-7预测NSCLC患者发生放射抵抗的曲线下面积为0.822 （95%CI：0.746~0.897）。血清miR-7表达水平降低是放疗敏感性的危险因素（P=0.009）。结论 血清miR-7在预测放疗抵抗中具有良好的效能,miR-7及其下游靶分子SP-1可能是潜在的放疗增敏靶点。     

基于生物信息学方法探讨Her-2基因表达对胃癌免疫细胞浸润的影响

目的 探讨人类表皮生长因子受体2（human epidermal growth factor receptor-2,Her-2）对胃癌组织中免疫细胞浸润的影响及可能的机制。方法 从癌症基因组图谱（the Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库下载胃癌转录测序数据及临床资料。采用CIBERSORT反卷积算法获得胃癌微环境中浸润的免疫细胞占比,分析其与Her-2表达的关系,筛选Her-2基因潜在的调控浸润免疫细胞的类型。采用基因集变异分析（gene set variation analysis,GSVA）评估与胃癌组织Her-2表达相关的信号通路集合,利用GEO（gene expression omnibus）收录的胃癌转录组数据验证Her-2基因表达与胃癌免疫细胞浸润程度的关系。结果 CIBERSORT分析TCGA数据库胃癌样本发现CD8⁺T细胞、静息状态记忆性CD4⁺T细胞、M0型巨噬细胞及肥大细胞在Her-2高表达及低表达组中的浸润程度差异有统计学意义（P=0.029,0.049,0.027,0.008）。GEO数据库与TCGA数据库分析结果均显示,Her-2基因高表达与CD8⁺ T细胞、静息状态记忆性CD4⁺T细胞、M0型巨噬细胞及肥大细胞的发育、诱导分化、迁移调控有关（P<0.05）,并影响胃癌组织中部分免疫细胞的浸润能力和程度。结论 在胃癌中Her-2基因高表达可能对部分免疫细胞形成和功能发挥具有抑制作用。