Identification of the cholera diffusion process in Ibadan, 1971

The paper tries to examine and identify which spatial diffusion process was responsible for generating the pattern of cholera diffusion (an epidemic spread which was apparently wave-like) within Ibadan City in 1971. In this paper one of Moran's statistics, the BW join-count measure of spatial autocorrelation is employed. Five different plannar graphs are used in the study. The results show that contagion was apparent on the various models of spatial processes employed and on their different combinations. But it is the radial contact diffusion which was discovered to be most important in the spread of the epidemic. But even, though such a radial contact diffusion process was discovered to be the most important, during the advance and peak phases of the epidemic wave; as the epidemic intensity rose to a spread phase, a mixture of the various models became a best contributor to the contagion.     

北京市2003年SARS疫情的多维分布及其影响因素分析

目的采用多维可视化分析研究北京市2003年严重急性呼吸综合征(SARS)疫情的扩散过程。方法以北京市SARS疫情数据,结合北京市地理信息系统,基于数据驱动和模型驱动的理论和技术,利用热点分析、空间过程分析和因子识别等数据探索分析方法,根据传染病的多维传播特性,同时利用遗传规划和模拟退火相结合的算法对易感-感染-移出(SIR)模型求解,从模型直接求取SARS流行病学参数。结果SARS密切接触者在城市内部呈现出大尺度上沿交通线聚集和在小尺度上随机分布态势;在不同发展阶段,北京市SARS发病趋势存在显著的空间聚集和扩散变化特征;地理位置、人口以及医院和医生数量是SARS空间传播的重要影响因子;通过对SIR模型直接求解,反演传染病参数,对SARS确诊病例数可进行早期预报性分析。结论对SARS密切接触者的集聚探测揭示了北京市人群存在两个空间尺度上的流动接触过程,为人-人接触性传染病的预防和控制策略制定提供重要依据;多个环境和人文因子对SARS传播起作用,其统计显著性随时间变化;有效的算法可以对SIR直接求解,使其可以用于传染病参数反演和早期预测。     

中国COVID-19疫情的空间格局和时空演化

  目的  掌握COVID-19疫情的空间格局和时空变化特征,探索其分布和扩散规律,有助于更好地防控COVID-19疫情扩散。  方法  本文以2020年1月22日-5月26日中国COVID-19疫情省级逐日发病率数据为数据源,利用空间自相关技术分析COVID-19疫情的空间格局,并利用重心轨迹迁移算法对其进行时空演化分析。  结果  在研究时间段范围内,中国COVID-19疫情在省级尺度上具有较强的空间依赖性。2020年1月22日-5月26日,中国COVID-19疫情的全局空间关联程度呈由强变弱再增强的发展趋势,Moran's I在(-0.04,-0.02)区间内,均为负值且波动范围小;疫情总体呈现以湖北省武汉市为中心,向周围城市蔓延扩散且随机分布的空间格局,国内疫情主要以高-低集聚为主,高-高集聚集中在香港和澳门特别行政区,而湖北省一直处于高-低集聚模式,并且在研究时间段内高-低集聚模式只有湖北省一个省份,低-低集聚模式主要集中在黑龙江省和西藏自治区;T₁-T₃时间段疫情以武汉市为中心向西北方向急剧扩散,T₄-T₆时间段范围内疫情逐渐转为向西南方向发展扩散,T₇-T₉时间段内疫情向东北方向扩散蔓延。  结论  在今后的疫情防控工作中应更注重疫情空间扩散模式的研究,探索影响扩散的因素,为后期精准防疫措施的制定提供有力的理论支撑。     

北京地区医务人员SARS感染的分析

目的　探讨医务人员SARS医院感染的危险因素。方法　对北京地区 2 0 0 3年 3月 2 0日～ 2 0 0 3年 5月 31日 6 6 6所医院进行医务人员SARS感染调查。结果　医务人员SARS感染的发病期较社会人群前移 ,综合门 (急 )诊医务人员SARS感染发病率占医务人员感染构成比 71 34% ,其中护士占 4 8 81% ,医生占 35 4 9% ;年龄 <4 0岁占 83 5 8% ;医务人员感染暴发为三级医院为主 6 9 2 8%。结论　由于信息封闭、指导诊断失误和控制措施不利导致SARS在北京地区暴发 ,医务人员是首批受感染者同时也是医院感染的传播链 ;必须在人类与疾病的斗争中加强医务人员的职业防护与保健。     

北京市海淀区403例传染性非典型肺炎的流行病学分析

目的　分析北京市海淀区常住人口传染性非典型肺炎 [严重急性呼吸综合征 (SARS) ]的流行病学特征。方法　对海淀区常住人口中发生的SARS病例进行个案调查和描述性分析。结果2 0 0 3年 3月 1 8日至 5月 31日 ,海淀区常住人口中共发生SARS病例 40 3例 ,发病率约为 1 8.0 1 0万 ,死亡 2 7例 ,病死率为 6 .7%。患者中青壮年占 70 .4% ,尤以 2 0～ 2 9岁组高发。全区除一个乡外均受累 ,多以散发为主 ,只有 3个街道呈现明显的家庭或学校内爆发。流行基本可以划分为初始增长期(2 7天 )、高峰期 (2 1天 )和快速下降期 (2 6天 )。患者中有密切接触史的比例随各期呈递减趋势 (趋势χ2 =8.80 0 ,P =0 .0 0 3) ;初期接触地点主要在医院 (72 .7% ) ,而迅速下降期则以家中接触为主(85 .7% ) ;各期的职业构成谱也明显不同 (χ2 =36 .41 ,P <0 .0 1 )。无明确接触史的患者中 2 6 .6 %有外出史 ,其中又有 47.6 %是去医院 ,并且 65 %在流行的高峰期光顾医院。结论　海淀区常住人口SARS流行强度与全市持平 ,医院内获得感染是SARS流行的主要原因     

Spatial dynamics of an epidemic of severe acute respiratory syndrome in an urban area

OBJECTIVE: To map risk of exposure to severe acute respiratory syndrome (SARS) in an urban area and assess the ability of traditional interventions to control dispersion of the disease. METHODS: Data on the Beijing SARS epidemic were used to map spatial clusters of identified contacts and to estimate transmission of SARS using a model with a time-dependent transmission rate. RESULTS: The estimated transmission rate decreased dramatically from 20 to 30 April 2003. The total number of cases in the epidemic in Beijing was estimated to be 2521. Hierarchical clustering revealed that risk-exposures were widespread, but clustered in a pattern that is distinctly related to the Beijing urban ring roads. CONCLUSION: Traditional control measures can be very effective at reducing transmission of SARS. Spatial patterns of risk-exposures can inform disease surveillance, prediction and control by identifying spatial target areas on which interventions should be focused.     

北京市后SARS时期发热门诊现状和合理设置模式的研究

目的 研究SARS疫情解除后北京市发热门诊设置和功能执行上存在的问题，提出合理的设置模式。方法 采用定量和定性调查相结合的方式。定量调查包括(1)后SARS时期18区县各发热门诊设置和运行方式的调查，调查对象为北京市所有现存的63家医院发热门诊的管理人员。(2)发热门诊就诊的发热患者的整群抽样调查。(3)在发热门诊工作的医生的调查。定性调查包括：北京市发热门诊负责人调查、北京市18区县分层随机抽取的23家不同级别医院主管领导、发热门诊负责人及发热门诊工作的医生个人或小组访谈和实地考察，未设置发热门诊的医院中随机抽取了28家进行了电话调查。结果SARS疫情解除后，这种仍然以集中就诊的方式对一种疾病进行长期常规监测的系统存在如下问题：(1)监测网覆盖率低。全市89％的医院和所有的门诊部均未在监测范围内，而未设发热门诊的医院和门诊部已逐渐自发的接受发热患者。但无规范化的管理和完善的信息系统支持。(2)目前建立的SARS监测信息系统对SARS疫情的监测功能尚可，但对发热病例监测的信息准确性、完整性存在明显问题，实名制未真正实施。(3)多数发热门诊的人力物力投入和就诊病例的数量明显不成比例，造成不同程度的医疗资源利用不足，特别是发热定点医院的投入和产出差别极大，医疗资源浪费严重。结论 根据研究发现的问题和分析，对今冬明春发热门诊的设置方式提出了建议，同时对其长期发展提出了建议。     

传染性非典型肺炎传播链案例分析

目的 研究SARS传播规律及发病特点，为制定防制措施提供理论依据。方法 采用北京市统一的非典型肺炎个案流行病学调查表、非典型肺炎密切接触的调查表逐一对病例和密切接触进行调查。对出院病例进行随访。利用SPSS ll．0软件进行描述性分析。结果 首例患A感染SARS后，引起与其有过接触的家人和医务人员8人发病(第二代)，这些患又引起第三代5人发病。同与患A的接触情况看，第二代发病的患均与患A有近距离密切接触。接触时间越长越容易感染。本传播链病例发病的病程：潜伏期平均5d；发病到首诊时间平均3d；首诊到确诊时间平均10d。结论 SARS传播为近距离飞沫传播，密切接触发病与接触时间有关，发病到首诊的时间对控制传染源有意义。     

北京市2005-2015年肺结核发病时空特征分析

目的 在街道/乡镇水平上分析2005-2015年北京市肺结核发病的时空流行特征。方法 从结核病管理信息系统收集2005-2015年北京市肺结核发病数据,以地理信息系统和空间分析为基础,在街道/乡镇水平上采用全局空间自相关和局部空间自相关统计量（Moran''s I）分析肺结核发病的空间聚集性,采用时空扫描统计分析时空聚集性。结果 在街道/乡镇水平上,北京市各年肺结核发病整体上呈现空间自相关性（Moran''s I值均>0,均P<0.05）,高-高发病聚集区为门头沟区的军庄镇、王平办事处、永定镇、潭柘寺镇,房山区的阎村镇,丰台区的王佐镇,西城区的天桥街道和顺义区的天竺镇8个街道/乡镇。时空扫描统计结果显示,一级聚集区主要分布在朝阳区和顺义区,覆盖17个街道/乡镇,分别为朝阳区的崔各庄、麦子店、东风、太阳宫、左家庄、和平街、小关、香河园、东坝、将台、望京、金盏、酒仙桥、来广营、孙河和顺义区的后沙峪、天竺等街道/乡镇;聚集时间为2005年1-12月。结论 2005-2015年北京市肺结核发病在街道/乡镇水平上呈现空间聚集性,且发病热点地区主要集中在中南部地区。     

How did general practitioners protect themselves, their family, and staff during the SARS epidemic in Hong Kong?

CONTEXT: Severe acute respiratory syndrome (SARS) is a newly emerging infectious disease and how the frontline community doctors respond to it is not known. OBJECTIVES: To explore the impact of SARS on general practitioners (GPs) in Hong Kong. DESIGN: A cross sectional survey. SETTING: Community based primary care clinics. PARTICIPANTS: 183 family medicine tutors affiliated with a local university. Postal survey sent to all tutors with a 74.8% response rate. MAIN OUTCOME MEASURES: Change of clinical behaviour and practices during the epidemic; anxiety level of primary care doctors. RESULTS: All agreed SARS had changed their clinical practices. Significant anxiety was found in family doctors. Three quarters of respondents recalled requesting more investigations while a quarter believed they had over-prescribed antibiotics. GPs who were exposed to SARS or who had worked in high infection districts were less likely to quarantine themselves (10.8% versus 33.3%; p<0.01; 6.5% versus 27.5%; p<0.01 respectively). Exposure to SARS, the infection rates in their working district, and anxiety levels had significant impact on the level of protection or prescribing behaviour. CONCLUSION: The clinical practice of GPs changed significantly as a result of SARS. Yet, those did not quarantine themselves suggesting other factors may have some part to play. As failure to apply isolation precautions to suspected cases of SARS was one major reason for its spread, a contingency plan from the government to support family doctors is of utmost importance. Interface between private and public sectors are needed in Hong Kong to prepare for any future epidemics.     

SARS病区医院感染控制与管理

目的 探讨和总结SARS流行期间，医院感染控制与管理的方法和经验。方法 建立规范隔离病区、制定严格消毒隔离制度和规范消毒方法、采取严格患者管理、有效切断传播途径、加强医护人员防护等综合控制医院感染措施。结果 避免了SARS在医院内的传播，有效预防了医护人员与患者间的交叉感染。结论 加强医院感染控制与管理，针对SARS传播特点，制定科学的消毒隔离制度及医护人员防护措施，对控制SARS医院感染具有重要的作用。     

山西省SARS疫情的分布特征

目的　了解山西省传染性非典型肺炎 (SARS)爆发流行的流行病学特征 ,为今后制定预防控制对策和措施提供科学依据。方法　利用山西省SARS病例的监测结果 ,分析其流行过程、地区、时间、人群分布及聚集性等特征。结果　山西省累计报告临床诊断病例就有 4 48例 ,累计发病率1 36 / 10万 ,死亡 2 4例 ,占 5 36 %。病例分布于 11个地、市 ,共有 39(32 77% )个县 (市、区 )发生疫情 ;SARS病例的职业构成前 4位分别为医务人员、学生、干部职工和农民 ;男性的构成比(5 2 2 3% )明显高于女性 (4 7 77% ) ;2 0岁以前的人群中发病人数的构成远远超过了其人口数的构成 ,特别是儿童中尤其明显 ,在 70岁以上的老人中也有类似趋势 ;医院和家庭是传染发生的高发区 ,有医院和家庭聚集现象。     

不同空间权重矩阵在疟疾空间分布模式分析中的探讨

目的探索不同空间权重矩阵在疟疾发病的空间自相关性以及空间分布模式中的适用性及其应用价值。方法采用Queen权重、距离阈值权重、K最邻近点权重生成不同的空间权重矩阵,应用GeoDa和R软件对疟疾的全局和局域空间自相关模式进行分析。结果 3种权重矩阵均显示2005-2007年云南疟疾全局Moran’sⅠ系数有统计学意义,2006年聚集性最强;局域显示3年均存在滇西部的＂正热点＂区域,2007年新增西北部＂正热点＂,部分＂负热点＂随着发病扩散逐渐有高发病趋势;全局Moran’sⅠ系数在最小距离阈值和K=3时取最大值,探测热点时距离阈值权重更易使聚集区域扩大,K最邻近点权重不容易发现低值聚集。结论应用不同的空间权重矩阵得到的热点区域存在一定差异,结合不同的空间权重矩阵进行分析,有助于加深对疟疾发病空间分布模式和流行蔓延趋势的认识。     

Spatial pattern analysis of heavy metals in Beijing agricultural soils based on spatial autocorrelation statistics

This study explored the spatial pattern of heavy metals in Beijing agricultural soils using Moran's I statistic of spatial autocorrelation. The global Moran's I result showed that the spatial dependence of Cr, Ni, Zn, and Hg changed with different spatial weight matrixes, and they had significant and positive global spatial correlations based on distance weight. The spatial dependence of the four metals was scale-dependent on distance, but these scale effects existed within a threshold distance of 13 km, 32 km, 50 km, and 29 km, respectively for Cr, Ni, Zn, and Hg. The maximal spatial positive correlation range was 57 km, 70 km, 57 km, and 55 km for Cr, Ni, Zn, and Hg, respectively and these were not affected by sampling density. Local spatial autocorrelation analysis detected the locations of spatial clusters and spatial outliers and revealed that the pollution of these four metals occurred in significant High-high spatial clusters, Low-high, or even High-low spatial outliers. Thus, three major areas were identified and should be receiving more attention: the first was the northeast region of Beijing, where Cr, Zn, Ni, and Hg had significant increases. The second was the southeast region of Beijing where wastewater irrigation had strongly changed the content of metals, particularly of Cr and Zn, in soils. The third area was the urban fringe around city, where Hg showed a significant increase.     

上海市新型冠状病毒肺炎流行与疫情时空变化分析

目的 阐明2022年上海市新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）的流行特征和空间聚集性演变规律。方法 收集2022年3月1日至5月31日上海市各行政区卫生健康委员会官方网站公布的新冠肺炎疫情数据，应用GeoDa软件进行空间自相关分析；利用logistic增长模型进行拟合预测并与实际感染病例进行对比。结果 上海市各行政区中，浦东新区确诊病例数和无症状感染者人数最多，占总病例数的29.30%和35.58%，各区累计罹患率和感染率差异有统计学意义（P<0.001），其中黄浦区显著高于其他区域。2022年3月1日至5月31日新冠肺炎罹患率具有全局空间正相关性（P<0.05），不同时段新冠肺炎罹患率空间分布不同，其中3月16-29日、4月6-12日和5月18-24日3个时段内Moran''s I值差异无统计学意义（P>0.05）。局部自相关分析结果表明，8个时段共探测到22个高-高聚集区，高风险流行的热点区域经历一个“少-多-少”的变化过程。logistic增长模型拟合与实际感染者情况基本吻合。结论 本轮上海市新冠肺炎疫情整体分布具有明显的空间聚集性，防控措施有效阻止了疫情的增长，尤其在空间上遏制了高风险传播区域的扩散，减少了向其他省份的传播风险。     

Monitoring the severe acute respiratory syndrome epidemic and assessing effectiveness of interventions in Hong Kong Special Administrative Region

OBJECTIVE: To estimate the infection curve of severe acute respiratory syndrome (SARS) using the back projection method and to assess the effectiveness of interventions. DESIGN: Statistical method. DATA: The daily reported number of SARS and interventions taken by Hong Kong Special Administrative Region (HKSAR) up to 24 June 2003 are used. METHOD: To use a back projection technique to construct the infection curve of SARS in Hong Kong. The estimated epidemic curve is studied to identify the major events and to assess the effectiveness of interventions over the course of the epidemic. RESULTS: The SARS infection curve in Hong Kong is constructed for the period 1 March 2003 to 24 June 2003. Some interventions seem to be effective while others apparently have little or no effect. The infections among the medical and health workers are high. CONCLUSIONS: Quarantine of the close contacts of confirmed and suspected SARS cases seems to be the most effective intervention against spread of SARS in the community. Thorough disinfection of the infected area against environmental hazards is helpful. Infections within hospitals can be reduced by better isolation measures and protective equipments.     

基于ESDA的湖北省新冠肺炎疫情分析

目的 分析湖北省新型冠状病毒肺炎疫情趋势及时空聚集性,为防控工作提供依据。方法 收集湖北省1月22日—3月25日新冠肺炎发病、死亡与治愈数据,描述疫情趋势,并通过GeoDa1.14.0软件进行空间自相关分析。结果 2020年1月22日 - 3月25日期间,湖北省共报告新冠肺炎67 801例,新增确诊病例数总体呈先上升后下降趋势,2月12日当天新增人数激增;累计确诊和死亡人数较高地区集中在湖北省东北部,武汉市为确诊及死亡人数最多的地区;湖北省累计确诊全局自相关不显著（Moran’s I≠0,P＞0.05）,累计死亡则在1月22日存在全局空间负相关（Moran’s I = - 0.01306,z = - 1.7797,P = 0.01）,此后全局自相关不显著（P＞0.05）;累计确诊及死亡人数局部空间自相关均存在显著聚集与异常情况（P＜0.05）,武汉市呈“高—低”异常,其周围地区（黄冈市、鄂州市、黄石市）呈“低—高”异常。结论 湖北省新冠肺炎疫情未存在显著的空间聚集性,武汉市作为疫情高值区未发生转移。建议 湖北省的防控工作仍应将武汉市作为重点,复工复产要采取差异化策略,应当分区、分时进行。     

综合性医院收治SARS病人的医院感染控制

目的 探讨和总结严重急性呼吸综合征(SARS)流行期间，医院感染控制与管理的方法和经验。方法 建立规范隔离病区，制定严格消毒隔离制度和规范消毒方法，采取严格病人管理，有效切断传播途径，加强医护人员防护等综合控制医院感染措施。结果避免了SARS在医院内的传播，有效预防了医护人员与病人间的交叉感染。结论 加强医院感染控制与管理，针对SARS的传播特点，制定科学的消毒隔离制度及医护人员防护措施，对控制SARS医院感染具有重要的作用。     

SARS患者发病及病例报告时间干预效果分析

目的 分析北京市SARS患者发病、住院和病例报告时间及其间隔天数，评价传染性非典型肺炎流行期间公共卫生干预措施的影响与效果。方法 对北京市传染病非典型肺炎疫情报告卡数据库中有关变量，采用描述性流行病学方法进行分析。结果 在北京市SARS流行早期，病人就诊间隔天数与报告间隔天数均不规律；4月中旬后，平均报告间隔天数开始下降；患者就诊及疫情上报的混乱状况得到了有效控制。结论 北京市的SARS公共卫生干预措施起到了积极作用，疫情控制信息系统的敏感性与及时性在流行中后期明显提高，对有效控制疫情效果良好。     

SARS流行期间北京市临床供血的管理

目的探讨北京市在发生重大疫情时,如何保障临床安全用血和预防因输血引起的医源性医院感染. 方法对北京在SARS期间保障临床安全用血的措施和方法进行总结和比较分析. 结果北京血液中心在SARS期间采取的应急方案,满足了临床安全用血. 结论在发生重大疫情时,通过及时有效的组织、科学有序的资源调配、安全可靠的质量保证,可以保障在发生各种灾害和事故时血液的安全供应,以预防因输血引起的医源性医院感染.