人类白细胞抗原HLA-B/DR座位间基因重组一家系

目的 了解一家系人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)复合体HLA-B/DR座位间的基因重组.方法 采集拟进行造血干细胞移植的1例急性淋巴细胞白血病患者(男,16岁)及其父母和3个姐姐的外周血标本,首先对其HLA Ⅰ、Ⅱ类A、B、DRB13个位点采用聚合酶链反应-序列特异寡核苷酸探针技术(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide,PCR-SSO)和聚合酶链反应-序列特异性引物技术(polymerase chain reaction sequence specific primer,PCR-SSP)进行低分辨基因分型,然后用基于测序的分型方法(sequencing-based typing,SBT)进行高分辨基因分型,再进行遗传家系分析研究,确定HLA基因重组相关位点.结果 HLA高分辨基因分型的结果证实患者的2条单倍型分别为A*3101-B*1301-DRB1*0701和A*3303-B*4403-DRB1*1302;其父亲的2条单倍型为A*3001-B*1302-DRB1*0701和A*3101-B*1301-DRB1*1501.从遗传家系分析显示,患者所携有的父源A*3101-B*1301单倍体是源自父亲的1条染色单体,而DRB1*0701则源自父亲的另1条染色单体,这表明父亲的2条染色单体在减数分裂时HLA-B和-DRB1基因座位间发生了交换,重组后的单倍型又完整地遗传给了患者.结论 发现了1个中国汉族人群HLA-B/DR基因座位间的基因重组家系.     

人类白细胞抗原分子遗传中的基因重组

深入研究人类白细胞抗原（human leucocyte antigen，HLA）基因重组的分子生物学特性，对于揭示其等位基因多样性形成的演化机理以及人体所具有的抵抗多样致病微生物的防御能力具有重要意义。国外学者通过家系调查研究、统计学分析等方法估算了HLA的重组频率，证实了一些重组发生的热点，并且对重组的单倍型特异性、序列基序特异性、性别特异性等进行了深入研究。本文就HLA重组的交换频率、重组热点以及其它特性的研究现状作一综述。     

人类白细胞抗原HLA-Cω基因第2,3,4外显子测序分型方法的初步研究

目的 初步建立可靠的HLA-Cω基因第2、第3和第4外显子测序分型技术.方法 基于中国汉族人群HLA-Cω基因的全长序列,设计和合成1对PCR引物,采用Stratagene P fu Taq DNA聚合酶特异性扩增HLA-Cω基因5'-启动子区至第4内含子目的基因片段,涵盖完整的第1～4外显子.PCR产物经纯化,采用自行设计的6条测序引物和ABI PRISM BigDye 1.1 Terminator,以及优化的测序反应体系和PCR条件,对HLA-Cω,基因第2、第3和第4外显子进行双向测序.测序反应产物纯化后,采用ABI3730测序仪电泳和Assign 3.5 SBT软件分析结果.结果 PCR扩增获得了清晰的HLA-Cu,基因日的片段,所用的6条测序引物进行HLA-Cω基因第2、第3和第4外显子测序,序列中无背景信号和杂峰.156份汉族随机骨髓志愿捐献者样本用本文的方法检测.分型结果与Atria AlleleSEQR HLA-Cw Plus测序分型试剂盒的结果相一致.结论 初步建立了可靠的HLA-Cω基因测序分型方法,在HLA-Cω基因群体遗传学及组织配型等领域,具有广泛应用前景.     

人类白细胞抗原新等位基因B*55:35的鉴定及家系调查

目的 鉴定人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因B位点的1个新等位基因并调查其遗传情况.方法 应用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reactionsequence specific oligonucleotide probe,PCR-SSOP) HLA分型技术发现1个疑似的新HLA等位基因,通过DNA测序鉴定其序列,并与同源性最高的HLA基因进行核苷酸序列比对,对携带者家系进行调查.结果应用PCR-SSOP进行HLA基因分型时,该样本HLA-B位点反应格局异常.DNA序列分析证实其为1个新HLA-B等位基因.与同源性最高的等位基因B*55:02比较,在第2外显子区域中有7个碱基发生改变,导致6个密码子发生了变化,造成2个氨基酸改变,即第69位的氨基酸由谷氨酸(Glu)变为甲硫氨酸(Met)、第70位的氨基酸由谷氨酸(Glu)变为丙氨酸(Ala).结论 发现并鉴定了HLA-B位点的1个新等位基因,GenBank注册号为FJ898284,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B* 55:35.     

人类白细胞抗原G和人类白细胞抗原E在宫颈癌中的表达及临床意义

目的 评估人类白细胞抗原G(HLA-G)和人类白细胞抗原E(HLA-E)的表达在宫颈癌进展中的意义及对患者预后的影响.方法 采用聚合酶链反应和流式细胞术检测正常组、CIN Ⅰ、CINⅡ、CINⅢ(宫颈上皮内瘤变Ⅰ-Ⅲ级)及浸润癌组HLA-G和HLA-E基因及蛋白的表达,比较两者在各组表达的差异及其对病人长期生存的影响.结果 CINⅢ及浸润癌组HLA-G表达与CIN Ⅰ、CINⅡ和正常组比较U值分别为564.0、536.0和565.5,P均＜0.05,HLA-E前两组的表达与后者比较U值分别为550.0、542.0和578.5,P均＜0.05;并且HLA-G和HLA-E阳性的患者生存率明显低于阴性者(P＜0.05).结论 HLA-G和HLA-E的异常表达促使宫颈癌的发生和发展,并且影响患者的术后长期生存.     

人类白细胞抗原-A基因芯片分型研究

目的 探索人类白细胞抗原-A（HLA-A）基因芯片分型，为器官移植临床配型服务。方法 根据中国汉族南方人常见的HLA-A位点基因及其多态性的独特序列，设计并合成48条特异性的寡核苷酸分型探针，将其点在玻片上，制成芯片。基因组DNA通过组间特异性引物扩增，并用荧光素Cy5标记。标记后的产物与结合在芯片上的探针进行杂交，通过荧光扫描仪获得杂交产生的荧光信号值，再经过计算机软件自动分析，确定样品的HLA-A基因亚型。用该方法对120份样本进行HLA-A基因分型。结果 120份待检样本，其中6份因PER无产物，不能分型。1份信号杂乱，不能分型。其余113份样本分型成功。实际检出A抗原特异性结果为A2（含A203）：56；A11（含A1101）：52；A24：33；Al：8；A30（含A3001）：7；A33：21；A26：1；A29：2；A31：3；A68：2；A3：9；A32：1。未检出A＊3002基因型。整个检测耗时约4．5h。芯片检测的重复率为100％。结论 HLA-A基因芯片是一种理想的分型方法，具有特异性高、重复性好、操作简便、所需样本量少、结果判读容易、一次可作多份样本的优点，适合临床器官移植配型应用。     

广西壮族人HLA-A座位的基因分型

人类白细胞抗原（HLA）基因具有高度的多态性,不同种族和地区的人群在HLA基因型别和频率分布上存在明显的族群特异性,是群体识别和个体识别的重要遗传标记之一.壮族是我国人口最多的少数民族，共1600余万人，主要聚居在广西南宁、百色、柳州、河池及贵港等地区，其余散居在云南、贵州、广东及海南等省份。至今，我们已公布了壮族HLA-DQA1、-DQB1、-DRB1等HLA-Ⅱ类基因的资料，     

西藏那曲地区藏族群体人类白细胞抗原-E基因多态性分析

目的:调查西藏那曲地区藏族人群人类白细胞抗原-E(HLA-E)等位基因的分布情况,为探讨HLA-E基因多态性与疾病的关联奠定基础。方法:检测采用聚合酶链反应/序列特异的寡核苷酸探针杂交(PCR-SSO)方法对150名那曲地区藏族正常人HLA-E等位基因进行了检测。结果:共检测到3个HLA-E等位基因:HLA-E~*0101的频率最高,为40.59%,其次为HLA-E~*01032和HLA-E~*01031,分别占36.63%和22.77%。结论:那曲地区藏族人群HLA-E等位基因频率分别为E~*0101 40.59%、E~*01031 36.63%和E~*01032 22.77%。提供了一套比较完整准确的藏族HLA-E基因频率参数。     

人类白细胞抗原HLA-DPA1和HLA-DPB1基因高通量测序分型的研究

目的 建立可靠的人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因HLA-DPA1和HLA-DPB1同步测序分型方法,研究南方汉族人群HLA-DPA1和HLA-DPB1基因的多态性.方法 根据HLA-DPA1和HLA-DPBI等位基因的全长序列,分别采用位点特异性引物扩增HLA-DPA1和HLA-DPBI目的基因片段,涵盖完整的第2外显子.PCR产物经磁珠纯化,用自行设计的测序引物及优化的测序反应体系对HLA-DPA1和HLA-DPB1第2外显子进行双向测序.纯化的测序反应产物经ABI 3730测序仪测序,用Assign 3.5 SBT软件分析结果.结果 PCR扩增获得了清晰的HLA-DPA1和HLA-DPB1基因目的片段,对HLA-DPA1和HLA-DPB1基因的第2外显子进行的双向测序结果中,序列无背景信号和杂峰.在176名南方汉族健康无关个体中,共检出了4种HLA-DPA1等位基因,其频率分布依次为:DPAI* 02:02(0.589)＞DPAl* 01:03(0.284)＞ DPAI* 02:01(0.096)＞ DPAl* 04:01(0.031).HLA-DPB1检出了14种等位基因,其中频率大于5％的4种等位基因为:DPBl* 05:01、DPBl* 02:01、DPBl* 04:01和DPBl* 02:02,频率介于1％～5％的7种,其余3种等位基因的频率均为1％以下.HLA-DPB1测序分型的结果与用AtriaAlleleSEQR商品化测序分型试剂盒检测的结果一致.结论 建立了HLA-DPA1及HLA-DPB1测序分型的方法,在群体遗传学及疾病关联研究等领域具有广泛的实用价值.     

HLA单倍型等位基因交换重组对移植配型的影响(7个家系分析)

人类白细胞抗原（HLA）又称移植抗原，在器官移植中起着重要作用。HLA遗传区域在人的第6号染色体短臂6p21位置上，HLA—A，B，C，D，E，F，G的7个座位是表达基因，由于其座位靠得很近，故在遗传时常一起传递。同一条染色体不同座位上的等位基因组合成单倍型，每个人都有两条分别来自父母的单倍型。HLA复合体是紧密连锁的，这些连锁在一条染色体上的等位基因很少发生同源染色体间的交换。2005．3-2006．6期间，我们在骨髓移植HLA配型时，发现7例家系中的7位个体HLA单倍型座位中等位基因分别发生交换重组。现分析报告如下。     

人类白细胞抗原-G与肝炎病毒感染的相关性研究进展

人类白细胞抗原-G(human leukocyte antigen G,HLA-G)属于非经典主要组织相容性复合体Ⅰ类分子,选择性表达在母胎交界面的细胞滋养层细胞使得妊娠期间形成母体对胎儿的免疫耐受。但是,HLA-G的有限多态性和异常表达与多种病理改变有关,例如肿瘤、自身免疫病和感染性疾病等。近来有研究表明,乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒感染过程中HLA-G的表达均会发生改变,而且HLA-G的表型与病毒的易感性相关。但是,至于HLA-G分子在乙型肝炎和丙型肝炎疾病发展中的作用目前仍不完全清楚。HLA-G与病毒性肝炎的相关性仍需深入研究。     

Association of human leukocyte antigen with postherpetic neuralgia in Koreans

Postherpetic neuralgia (PHN), the most frequent complication of varicella‐zoster virus reactivation, is characterized by pain that persists for more than 3 months, often for years after healing of zoster rash. A few studies revealing the association of human leukocyte antigen (HLA) with PHN have been reported, but only in the Japanese. The aim of this study was to investigate the primary HLA locus associated with PHN susceptibility in Koreans. We compared HLA‐A, ‐B, ‐C, and DRB1 genotypes of 66 PHN patients with those of 54 herpes zoster (HZ) patients without developing PHN and 235 healthy controls. Frequencies of HLA‐B*13, B*44, B*15 (B75), DRB1*10:01, and DRB1*12:02 were increased, and those of HLA‐C*01, C*12, and DRB1*01:01 were decreased in PHN patients compared to those in controls (each, p < 0.05). Among these alleles, only the frequency of HLA‐B*44 was significantly increased in PHN patients compared to that in HZ patients and the change was due to HLA‐B*44:03 (PHN vs controls, p = 0.043; PHN vs HZ, p = 0.012). The results suggest that HLA‐B*44:03 or other closely linked gene of the major histocompatibility complex is associated with susceptibility to the development of PHN after HZ, but not with the onset of HZ.     

应用SBT直接测序分型法研究中国南方汉族人群HLA五个基因座单倍型

目的 研究中国南方汉族人群HLA-A、B、Cw、DRBl、DQBl等位基因多态性及单倍型的分布特征.方法 应用聚合酶链反应-直接测序分型(polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR-SBT)法对186名中国南方汉族健康人群HLA-A、B、Cw、DRBl、DQBl进行基因分型.结果 检出的HLA-A、B、Cw、DRBl、DQBl等位基因分别有28、49、24、29、20种.经统计分析A*0207-B*4601(10.81%),A*3303-B*5801(6.14%),B*4601-DRBl*0901(6.22%),B*4001*DRBl*0901(3.78%),DRBl*0901-DQBl*0303(12.16%)和DRBl*1202-DQBl*0301(8.38%)单倍型呈强连锁不平衡单倍型(RLF≥0.5,X<'2>>3.84,P<0.05);A*0207-B*4601-Cw*0102(10.75%),A*3303-B*5801-Cw*0302(5.14%),A*0207-B*4601-DR*0901(5.07%),A*3303-B*5801-DRBl*0301(2.96%),A*0207-B*4601-Cw*0102-DRBl*0901-DQBl*0303(4.87%)和A*1101-B*1301-Cw*0304-DRBl*1501-DQBl*0601(2.43%)单倍型分别是中国南方汉族人群常见单倍型.结论 中国南方汉族人群HLA 5个基因座单倍型分布具有高度的遗传多态性且有其自身分布特点.本研究获得的较完整的HLA 5个基因座单倍型分布数据,将为人类学、HLA疾病相关性和器官移植等研究提供遗传学参考数据.     

DRB1*1454:中国汉族人群人类白细胞抗原-DRB1*14的常见等位基因

RB1*14等位基因的分布格局明显不同,DRB1*1405在两个群体中的分布比例比较接近,而DRB1*1454在南方汉族中的分布比例明显高于北方汉族.     

HLA新等位基因B*5827核苷酸序列的分析

目的 确认人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因B*5827并分析其核苷酸序列.方法 用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针对1份HLA分型反应异常的血样进行基因分型,并用基因克隆测序技术正反向测定DNA序列.结果 测序结果显示HLA-B位点有1个与已知HLA等位基因序列均不同的新等位基因,该等位基因与HLA-B*5820序列同源性最高.但在第3外显子存在8个碱基的差异,分别为nt 290(G＞C)、nt 346(T＞A)、nt 390(A＞C)、nt 404(G＞C)、nt 413(C＞G)、nt 471(A＞G)、nt 486(A＞G)和nt 487(C＞A).碱基的不同导致了氨基酸不同nt 97(ser＞arg)、nt115(phe＞tyr)、nt 130(ser＞arg)、nt 157(thr＞ala)和nt 162(thr＞glu),其中nt 404和nt 413是同义突变.结论 该等位基因为HLA新等位基因,基因序列已提交至GenBank数据库,提交号为GU071234,于2010年1月被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*5827.

Abstract：

Objective To investigate the molecular basis for a novel human leukocyte antigen(HLA)allele B * 5827. Methods DNA from the proband was analyzed by polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide (PCR-SSO) typing. The amplified product was sequenced bidirectionally. Results Abnormal HLA-B locus was observed and its nucleotide sequence was different from the known HLA-B allele sequences, with highest homology to HLA-B * 5820 allele. It differs from HLA-B * 5820 by 8 nucleotide substitutions in exon 3, i. e. , nt 290 (G＞C), nt 346 (T＞A), nt 390 (A＞C), nt 404 (G＞C),nt 413 (C＞G), nt 471 (A＞G), nt 486 (A＞G) and nt 487 (C＞A), resulting in an amino acid change from ser＞arg at nt 97, phe＞tyr at nt 115, ser＞arg at nt 130, thr＞ala at nt 157 and thr＞glu at nt 162.Nucleotide differences of nt 404(G＞C) and nt 413(C＞G) did not change amino acid. Conclusion The sequences of the novel allele have been submitted to GenBank (access No. GU071234). A novel HLA class Ⅰ allele B * 5827 has been officially assigned by the WHO HLA Nomenclature Committee in Jan 2010.     

新等位基因人类白细胞抗原B*4609的发现和确认

目的 鉴定一个人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因HLA-B*4609.方法 使用序列特异性寡核苷酸PCR技术进行HLA基因分型,发现反应格局异常的可疑新等位基因,应用分子克隆和DNA双向测序技术测定新等位基因的核苷酸序列,并与已知等位基因进行序列比对分析.结果 检出1个样本HLA-B位点反应格局异常,DNA测序分型结果一个为B*151101,另一个的核苷酸序列与已知的HLA等位基因均不同,该基因序列与同源性最高的HLA-B*460101基因序列相比,在第3外显子区域中527位碱基发生A→T突变,导致176位编码氨基酸由谷氨酸(GAG)变成缬氨酸(GTG).结论 样本中含有HLA-B新等位基因序列.该序列申报后,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*4609.     

人类白细胞抗原新等位基因B*54:09的序列分析

目的 鉴定1名中国人白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因.方法 应用基于Luminex平台的聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)方法对先证者进行HLA基因分型、PCR产物测序和基因克隆DNA测序,通过软件分析该基因序列并与同源性最高的HLA等位基因比较序列差异.结果 PCR-SSOP基因分型显示先证者HLA-B位点反应格局异常,疑为HLA新等位基因.基因克隆后测序结果显示,其中1个等位基因为B*59:01,另一个等位基因序列与所有已知HLA等位基因不同,与同源性最高的HLA-B* 54:06基因序列相比,在第3外显子有6个核苷酸不同(nt486G→C、nt527A→T、nt538T→C、nt539G→T、nt559 C→A和nt560 T→C),导致了3个氨基酸改变,152位氨基酸由Glu→Val,156位氨基酸Trp→Leu和163位氨基酸Leu→Thr.结论 该等位基因为HLA新等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B* 54:09.