基于网络药理学探讨六君子汤治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的基于网络药理学探究六君子汤治疗非小细胞肺癌的作用靶点,探索其作用机制。方法通过TCMSP数据库检索六君子汤6味中药所含活性化学成分,通过Swiss Target Prediction数据库进行靶点的搜集整理;通过Gene Cards、Pharm GKB和TTD数据库查询非小细胞肺癌的靶点,将药物与疾病的靶标基因交集后得到六君子汤治疗非小细胞肺癌的潜在靶点;采用Cytoscape3.7. 2软件筛选核心靶点,使用R软件(v. 4.0. 2)对靶点进行GO富集和KEGG富集分析。结果通过网络药理学方法,筛选出六君子汤6味中药101个活性成分,944个相应靶点,与非小细胞肺癌5152个疾病相关靶点交集后得到579个靶点,根据Cytoscape3.7. 2软件进行分析,共确定18个核心靶点。对18个核心靶点进行GO富集和KEGG富集分析,GO富集得到1482条富集结果,其中生物过程1339条,细胞组成46条,分子功能97条; KEGG富集得到131条非小细胞肺癌相关通路。结论六君子汤可能通过多靶点、多通路协同治疗非小细胞肺癌。     

基于网络药理学探讨鸦胆子对肺癌的作用机制

目的：采用网络药理学方法探讨鸦胆子对肺癌的作用机制。方法：通过检索中药系统药理学数据库（TCMSP）提取鸦胆子的有效成分及其相关作用靶点;检索GeneCards和OMIM数据库提取肺癌疾病靶点;采用STRING数据库构建蛋白互作网络,Cytoscape构建化合物-靶点网络以及化合物-靶点-生物过程-通路网络,DAVID数据库对靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果：检索TCMSP得到并通过OB值和DL值筛选得到有效成分15中,有效靶点44个。检索GeneCards数据库和OMIM数据库得到疾病靶点21 729个,将化合物靶点与疾病靶点相映射得到交集靶点39个。将结果导入Cytoscape软件,构建“化合物-靶点”网络;再构建“药物-化合物-靶点-疾病”网络。将关键靶点导入STRING数据库,构建蛋白互作网络,其中度值较高且处于较核心位置的靶点有CASP3、CCND1、EGFR、IL6、AR等。再对39个关键靶点进行富集分析,结果显示鸦胆子治疗肺癌的关键靶点共富集为7个生物过程聚类,涉及58个条目,经过筛选剩余9个生物过程。对鸦胆子治疗肺癌的39个关键靶点进行通路富集,结果显示共有7个富集的通路聚类,涉及62个条目,经过筛选剩余12条通路。结论：鸦胆子治疗肺癌的临床疗效确切,基于数据库的机制分析也证实它不仅可以治疗小细胞肺癌,同时也可以作用于非小细胞肺癌。     

基于网络药理学研究六君子汤治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制

目的 运用网络药理学技术建立“药效成分-疾病靶标-信号通路”之间的关系,研究六君子汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的作用靶点及信号通路,明确作用机制.方法 使用中药系统药理学成分分析平台(TCMSP),获得六君子汤的活性成分及作用靶点,并从G...     

基于网络药理学探讨小柴胡汤抗肺癌作用机制

目的:运用网络药理学方法构建小柴胡汤多成分-多靶点-多通路的相互作用网络,探究其抗肺癌的作用机制。方法:利用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)中药分子机制综合数据库(TCMID)和文献获取小柴胡汤的有效活性成分;运用Pharm Mapper的反向药效团匹配方法对潜在靶标进行预测,利用自开发软件TCMKD1. 0进行"肘点法"筛选优化,通过检索药物靶标数据库(TTD),人类孟德尔遗传数据库(OMIM),Gene Cards等数据库及查阅文献筛选出肺癌相关靶点;进而构建化合物-靶点网络、蛋白互作(PPI)网络、靶点-通路网络;通过STRING数据库进行靶点信息的注释;通过Cytoscape 3. 6软件构建小柴胡汤成分-靶点-通路网络。结果:得到小柴胡汤中162个有效活性成分,涉及71个抗肺癌靶点和11个相关通路;拓扑网络分析后得到槲皮素(quercetin),人参皂苷Rh2(ginsenosideRh2),芒柄花黄素(formononetin),β-谷甾醇(β-sitosterol)等96个重要成分,表皮生长因子受体(EGFR),血管内皮生长因子(KDR),半胱氨酸蛋白酶-3(Caspase-3),丝裂原活化蛋白激酶(MAPK1),肝细胞生长因子(MET)等28个关键靶点,非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer),小细胞肺癌(small cell lung cancer),ErbB信号通路(ErbB signaling pathway),VEGF信号通路(VEGF signaling pathway)等61条核心通路。结论:研究结果表明小柴胡汤抗肺癌的活性成分可能是槲皮素,人参皂苷Rh2,6-姜烯酚,芒柄花黄素,β-谷甾醇等,其作用机制可能与ErbB signaling pathway,MAPK signaling pathway,VEGF signaling pathway等通路有关,该研究为深入阐述小柴胡汤抗肺癌作用机制提供依据。     

基于网络药理学探讨益气复元汤治疗肺癌的作用机制

目的：基于网络药理学方法探讨益气复元汤治疗肺癌的作用机制。方法：通过TCMSP平台筛选出益气复元汤的主要药物成分,通过GeneCard、OMIM、TTD数据库检索肺癌疾病靶点,使用软件Cytoscape 3.8.2建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,基于DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：共获得益气复元汤主要活性成分131种,潜在靶点273个,肺癌相关疾病靶点13215个,药物-疾病靶点256个。PPI网络显示主要靶点有雌激素受体1、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、肿瘤坏死因子、白细胞介素6、丝裂原活化蛋白激酶1、肿瘤相关蛋白53、丝裂原活化蛋白激酶3等。GO功能主要包括药物反应、细胞缺氧反应、细胞外空隙、细胞溶质、酶结合、药物结合、蛋白结合等。KEGG通路主要有信号转导、肿瘤及癌症的特定类型、病毒相关通路等。预测丝裂原活化蛋白激酶3为益气复元汤治疗肺癌的主要靶点。结论：益气复元汤治疗肺癌具有多成分、多靶点、多通路的作用机制,其主要作用成分可能为槲皮素,作用机制可能与信号转导、肿瘤及癌症的特定类型、缺氧诱导因子-1...     

基于网络药理学及分子对接探究六君子汤治疗结直肠癌的作用机制

目的：采用网络药理学分析方法探究六君子汤治疗结直肠癌的药理机制。方法：应用中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）检索六君子汤中的中药活性成分及作用靶点;通过Gene Cards、OMIM、TTD、Drug Bank四个数据库获取结直肠癌疾病靶点;借助STRING数据库及Cytoscape软件分析六君子治疗结直肠癌的关键靶点;运用Metascape平台进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析;利用AutoDock Vina软件进行分子对接,初步验证药物结合力。结果：筛选出六君子汤主要活性成分132个,主要包括槲皮素、山柰酚、柚皮素等;活性成分对应的作用靶点277个;结直肠癌疾病相关靶点1 508个;二者共同靶点138个,核心靶点有前列腺素氧化环化酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)等。GO和KEGG结果分析表明六君子汤治疗结直肠癌可能涉及的信号通路有磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B、白细胞介素-17、T细胞受体等;分子对接结果显示,7-甲氧基2-甲基异黄酮、苜蓿毒素等主要活性成分与PTGS2、过氧化物酶体增...     

基于网络药理学研究白及治疗肺癌的潜在靶标及作用机制＊

本研究探讨了中药白及治疗肺癌的潜在靶标及作用机制。在TCMSP、ETCM数据库中基于药代动力学特征筛选白及活性成分,Genecards数据库中收集肺癌靶标,利用Swiss target prediction在线工具预测成分作用靶标。经Cytoscape3.7.0软件及其STRING插件构建“活性成分-作用靶标”、“蛋白质-蛋白质相互作用”网络图,取交集得到白及和肺癌的共同靶标;将共同靶标导入Metascape中进行基因本体和KEGG通路富集分析,利用Cytoscape3.7.0软件构建“成分-潜在靶标互作-信号通路”网络。共获得25个潜在活性成分、20个潜在靶标和5条潜在通路,共确定了16个GO条目。白及治疗肺癌可能与跨膜受体蛋白酪氨酸激酶和一氧化氮合酶调节活性有关;参与了毒性反应、共生过程、肌肉细胞增殖、线粒体膜电位调节、横纹肌组织发育的正向调节等过程。白及可能通过ESR1、PTGS2、ALB、HSP90AA1、HER2、EGFR、ESR2等靶标作用于表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药、PI3K-Akt信号通路、癌症中的转录失调过程等通路,从而发挥治疗肺癌作用。     

基于网络药理学探讨白藜芦醇治疗肺癌的生物分子机制

目的 基于网络药理学,运用在线数据库研究白藜芦醇治疗肺癌的潜在作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、PubChem、SwissTargetPrediction、GeneCards数据库分别获取白藜芦醇和肺癌的相关基因,取二者交集基因,使用String数据库获得交集基因的蛋白相互作用(PPI)...     

基于网络药理学和分子对接探讨鸡血藤治疗肺癌的分子作用机制

通过网络药理学和分子对接方法探讨鸡血藤治疗非小细胞肺癌的分子机制研究.以中药鸡血藤Spatholobi Caulis为对象,通过在中药药理学系统分析平台(TCMSP)数据库中获得鸡血藤中活性成分和相应潜在的药物靶点,利用GeneCards数据库收集癌症相关基因,借助Cytoscape软件构建鸡血藤活性成分-作用靶点-通...     

基于网络药理学和分子对接探讨沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接探讨沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制。方法：检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中医分子机制生物学信息分析工具(BATMAN-TCM)数据库获取沙参麦冬汤的化学成分及靶点。借助人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DrugBank、GeneCards数据库获取肺癌相关靶点。借助Cytoscape 3.8.0软件,构建“药物-活性成分-关键靶点-疾病-信号通路”图。利用STRING平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,Cytoscape进行蛋白聚类分析,使用Metascape进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析并借助R语言进行可视化处理,将核心成分与蛋白进行分子对接。结果：最终得到沙参麦冬汤活性成分192个,对应靶点3 585个,肺癌相关靶点1 910个,药物与疾病共有靶点191个。CytoNCA显示核心靶点有JUN、MAPK8、MYC、MAPK14、STAT3、MAPK1、RELA、TP53、IL-6。GO富集分析得到2 684条生物过程,117条细胞组分,210条分子功;主要富集在癌症途径、TNF信号通路、...     

基于网络药理学探讨丹参-红花药对治疗冠心病的作用机制

目的：利用网络药理学的方法探讨丹参-红花药对治疗冠心病的作用机制。方法：运用TCMSP网络数据库对丹参-红花两味药主要有效成分及作用靶点进行筛选和挖掘,利用Cytoscape3.7.2软件,构建中药成分-靶点网络图;以OMIM在线分析平台挖掘冠心病的相关作用靶点,基于STRING数据库构建丹参-红花治疗CHD的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,然后进行拓扑分析,筛选出丹参-红花治疗冠心病的核心靶点。利用Metascape数据库对药物-疾病交集靶点进行生物通路及富集分析。结果：丹参-红花成分-靶点网络图包含87个有效成分,相对应靶点1 693个;核心靶点涉及TNF、白细胞介素-1B（IL-1B）、髓过氧化物酶（MPO）、血管细胞黏附蛋白1（VCAM1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、基质金属蛋白酶3(MMP3)等。结论：丹参-红花治疗冠心病主要靶点参与与流体剪切应力与动脉粥样硬化、活性氧代谢过程、DNA结合转录因子活性的正调控、蛋白质复合物装配的正调控、细胞活化的调节等相关,其中聚集在流体剪切应力与动脉粥样硬化的靶点最多。     

基于网络药理学探讨大补脾汤治疗肝癌的作用机制＊

目的 利用网络药理学的方法，建立大补脾汤的活性成分-作用靶点-通路的网络图，对作用靶点的基因功能和通路进行富集分析，从而探讨大补脾汤治疗肝癌的可能作用机制。方法 通过TCMSP 数据库、中国台湾中医药资料库获得大补脾汤主要活性成分。采用Swiss Target Prediction 预测活性成分的潜在靶点，并与肝癌疾病靶点数据进行比对，获得大补脾汤治疗肝癌的作用靶点。采用DAVID数据库平台对作用靶点的GO注释和KEGG 通路进行富集分析和蛋白功能归属。最后通过Cytoscape 构建大补脾汤治疗肝癌的“活性成分-作用靶点-通路”网络图。结果 大补脾汤潜在的有效成分共有118个，其中人参、甘草、旋覆花含有65种成分可能具有治疗肝癌的作用。大补脾汤治疗肝癌的可能靶点共29个，其中EGFR、SRC、PTGS2、MMP9、MMP2、MCL1、MET、AR和ESR1等可能为关键靶点基因，涉及到对微小RNAs、雌激素受体通路、肿瘤相关通路等的调控作用。结论 大补脾汤中山奈酚、槲皮素、木犀草素等可能通过调控微小RNAs和雌激素信号通路等机制，作用于EGFR、ESR1、SRC、MET等靶点发挥治疗肝癌的作用，为大补脾汤药效机制的多角度研究和肝癌的中医药治疗提供思路。     

基于网络药理学探讨茵栀黄口服液治疗黄疸的作用机制研究

目的：基于网络药理学方法构建茵栀黄口服液成分-靶点-通路的相互作用网络,探究其治疗黄疸可能的分子机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取茵栀黄口服液4种成分-茵陈、栀子、黄芩、金银花的有效活性成分,并对潜在靶点进行预测,进而绘制药物有效活性成分韦恩图及化合物-靶点网络图,通过人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、GeneCards及Drugbank数据库筛选出黄疸相关靶点,与获得的药物预测靶点取交集,再将交集靶点导入STRING数据库及Cytoscape 3.7.2,得到蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图;通过Metascape对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：茵栀黄口服液的4种成分-茵陈、栀子、黄芩、金银花在TCMSP数据库中共检索到530个化学成分,根据口服生物利用度(OB)和类药性(DL)共筛选出87个活性成分,得到作用于黄疸的靶点共233个,通过与疾病数据库筛选出黄疸相关靶点取交集,获得交集靶点122个,GO功能分析集中在对细胞凋亡、细胞因子受体结合的调控,对多种蛋白激酶活性的调节等方面,KEGG通路分析得到T细胞受体信号通路、IL-17信号通路、PI3K-AKT信号通路、核因子κB信号通路等通路。结论：本研究结果显示茵栀黄口服液治疗黄疸具有多成分、多靶点的作用特点,并预测了可能的作用机制,为后期实验研究提供了理论依据。     

基于网络药理学探究马齿苋缓解结肠炎的作用机制

目的：利用网络药理学探究马齿苋活性成分缓解结肠炎的作用机制。方法：基于TCMSP数据库获得其活性成分和对应靶标,利用STRING进行靶标间互作分析并筛选核心靶标,经KEGG富集分析得到马齿苋治疗疾病的相关信号通路。基于Drugbank数据库获取结肠炎的相关疾病靶标,与马齿苋成分靶标进行映射,得到马齿苋治疗结肠炎的作用机制。结果：共筛选获得马齿苋活性成分花生四烯酸、β-谷甾醇、山柰酚、木犀草素、异甜菜素、槲皮素等10个,其对应靶标共187个,核心靶标共62个,经KEGG富集分析发现核心靶标与癌症、病毒感染、炎症性肠炎和免疫调节相关通路密切相关,并通过ABCC4、ABCG2、ACAT1、ALB、ALOX5、CYP3A4、IFNG、IKKA、MPO、NOS2、NQO1、NR1I2、PPARG、PTGS1、PTGS2、TNF、XDH起到治疗结肠炎的作用。结论：马齿苋可通过抗炎、抗氧化和调节细胞增殖与凋亡发挥多靶点、多通路缓解结肠炎的作用。     

基于网络药理探讨四妙散治疗骨性关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨四妙散治疗骨性关节炎(OA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中检索四妙散中黄柏、苍术、薏苡仁、牛膝的活性成分,以口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18为条件进行筛选,通过Uniprot数据库进行靶点预测;通过TTD、Drugbank、CTD、Gencards、OMIM、PharmGKB、GAD、KEGG数据库获取OA的相关靶标,并进一步对药物和疾病靶点相映射得到四妙散治疗OA的潜在靶点,运用Cytoscape和STRING软件构建“中药-成分-靶点”与蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,筛选可能发挥治疗作用的重要成分及靶点,并对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获知其潜在的作用机制。结果:从四妙散中共筛选出活性成分67个,包括槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、汉黄芩素、非洲防己碱等,与骨关节炎相关的作用靶点524个,包括TNF、IL6、MAPK1、PTGS2、MAPK8等。四妙散主要通过调节TNF信号通路、HIF-1信号通路、NOD样受体、Toll样受体信号通路等发挥治疗骨关节炎的作用。结论:本研究运用网络药理学预测了四妙散治疗OA可能的活性成分、关键靶点及作用通路,体现了中药治疗疾病具有“多成分、多靶点、多途径”的特点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

基于网络药理学和分子对接技术阐释芪甲扶正方治疗肺腺癌相关性疲乏的潜在作用机制

目的:探究芪甲扶正方治疗肺腺癌相关性疲乏的作用机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCM-SP)、中医药综合数据库(TCMID)、Pubchem、Swiss Target Prediction等数据库收集芪甲扶正方有效成分及作用靶点;通过GeneCards、OMIM等数据库获取"肺腺癌相关性疲乏"相关靶基因...     

基于网络药理学研究复健片治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的：借助网络药理学平台技术探究复健片治疗缺血性脑卒中（IS）的作用机制。方法：利用中药系统药理学与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、Batman-TCM数据库筛选出复健片中何首乌、桑寄生、决明子、淫羊藿、海马的活性成分及其靶点;利用Uniprot数据库对复健片中靶点信息进行校对;运用GeneCards数据库获取IS的疾病靶点基因;通过Cytoscape 3.7.2软件及STRING 11.0数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并进行生物富集分析。结果：获取复健片治疗IS的共45个活性成分和144个靶点,关键靶点涉及IL6、IL1β、TNF、VEGFA、NOS3等;IS相关靶点1 485个;获得300条GO生物过程和84条相关信号通路,涉及PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、cGMP-PKG信号通路、cAMP信号通路、核因子κB信号通路等。结论：复健片是通过多成分、多靶点、多通路相互作用的机制来达到治疗IS的目的,通过本研究为复健片面向临床进一步推广应用提供理论支持,并为未来研究提供思路。     

基于网络药理学及分子对接探讨交泰丸治疗心 律失常的作用机制

目的:运用网络药理学及分子对接分析交泰丸治疗心律失常的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)与BATMAN数据库检索黄连、肉桂的活性成分和靶基因,利用GeneCards数据库检索得到与心律失常相关的靶基因,采用Cytoscape软件绘制交泰丸的"活性成分-作用靶点"网络图,采用STRING数据...