淋巴瘤比较基因组杂交研究

目的评价比较基因组杂交（CGH）技术在淋巴瘤研究中的应用价值。方法采用CGH技术检测20例淋巴瘤患者核型异常，部分病例与核型分析比较。结果20例淋巴瘤患者CGH核型异常检出率为60％。8例进行常规核型分析的患者，CGH检测出4例常规核型分析未发现的异常。8例弥漫大B细胞淋巴瘤5例发现染色体拷贝数改变，其中3例发现13号染色体长臂扩增。5例滤泡性淋巴瘤中3例分别检测出7q11-21和15c11-14扩增和18号三体。4例小淋巴细胞淋巴瘤中1例6q16—25缺失，1例发现复杂核型异常：1p21—23扩增伴有2p12-ter，9p13-ter，10p13-ter缺失。结论淋巴瘤患者存在多种染色体异常，CGH是一有用的分析淋巴瘤核型异常的分子细胞遗传学工具.     

淋巴瘤比较基因组杂交研究

目的评价比较基因组杂交(CGH)技术在淋巴瘤研究中的应用价值。方法采用CGH技术检测20例淋巴瘤患者核型异常,部分病例与核型分析比较。结果20例淋巴瘤患者CGH核型异常检出率为60%。8例进行常规核型分析的患者,CGH检测出4例常规核型分析未发现的异常。8例弥漫大B细胞淋巴瘤5例发现染色体拷贝数改变,其中3例发现13号染色体长臂扩增。5例滤泡性淋巴瘤中3例分别检测出7q11-21和15q11-14扩增和18号三体。4例小淋巴细胞淋巴瘤中1例6q16-25缺失,1例发现复杂核型异常:1p21-23扩增伴有2p12-ter,9p13-ter,10p13-ter缺失。结论淋巴瘤患者存在多种染色体异常,CGH是一有用的分析淋巴瘤核型异常的分子细胞遗传学工具。     

比较基因组杂交在白血病和淋巴瘤研究中的应用

大多数造血系统恶性肿瘤的发生都可以用比较基因组杂交的方法加以研究,现有研究表明,除了碱基重排以外的基因组改变也是这些恶性肿瘤发生的原因。这些基因组改变不但在肿瘤的发展和分类中起重要作用,还与其对化疗的反应性和患者的生存率都有很大关系。本文就其在白血病和淋巴瘤中的应用作一综述。     

比较基因组杂交技术在软组织肉瘤诊断中的应用

比较基因组杂交(CGH)技术是在荧光原位杂交(FISH)基础上，结合消减技术发展起来的一种能快速、全面分析染色体基因组获得和缺失的分子遗传学方法。它不需要特殊探针，能进行全基因组检测，并可在正常中期染色体上定位。目前CGH技术是对整个染色体扫描分析最常用的技术，在软组织肉瘤的诊断和研究中有重要意义。     

比较基因组杂交在肿瘤病理诊断中的应用

比较基因组杂交（comparativegenomehybriclization，CGH）是一种将原位荧光杂交技术与数字图象分析相结合，用于检测肿瘤组织DNA异常（缺失、扩增、复制），并在染色体上定位的细胞遗传学新方法（门。与传统分子水平的DNA检测手段相比，在一次实验中即可对整个基因组进行分析，并能确定肿瘤DNA异常发生于哪条染色体，位于染色体的哪个区带，同时还可获得相应的癌基因扩增或抑癌基因丢失的信息。目前这一方法在国外已被用于肿瘤遗传学研究的多个领域，其在肿瘤病理诊断中的应用对阐明肿瘤的发病机制、疾病分类、推断之发展的不同阶段，…     

微阵列比较基因组杂交技术及其在肿瘤拷贝数变化研究中的应用进展

肿瘤是一种严重威胁健康和生命的疾病,据统计约有50%的男性和30%的女性可能患病[1],并且超过半数的肿瘤患者分布在医疗条件欠缺的发展中国家[2]。肺癌的发生发展是一个多基因参与、多阶段发展的病理过程,而基因组DNA拷贝数变化（CNVs）是引起肿瘤基因异常的重要机制之一,识别特征性CNVs及所含基因对认识肿瘤的将起到重要作用。     

阵列比较基因组杂交技术在肿瘤研究中的应用进展

基因组变异是肿瘤细胞的一个重要特点,其参与肿瘤形成的生物学过程和通路。阵列比较基因组杂交技术能以高分辨率在全基因组范围内检测基因变异和DNA拷贝数改变,尤其能对特异的基因变异进行高度准确的定位。现综述目前常用的几种阵列平台及其在寻找肿瘤相关基因、监测肿瘤发展进程、判断预后等方面的应用。     

微阵列比较基因组杂交技术在产前诊断中的应用

在遗传和环境因素共同影响下,大约3％的婴儿有严重的出生缺陷,其中5％～10％将会发展成智力障碍,所以产前诊断是优生优育的必要保障.从20世纪60年代染色体显带技术发展以来,染色体核型分析就成为产前诊断的金标准[1],该技术能够检测到染色体数量变化、平衡/不平衡易位、倒位和显微镜下可见的大片段缺失和重复等问题.但目前该技术还存在一定的局限,如由于分辨率较低不能够检测出少于5 Mb片段的染色体异常;同时,产前染色体（羊水、绒毛染色体）条带较少增加了异常检出的难度;诊断前需要细胞培养的过程延长了出最终报告的时间;对于结果的分析也依赖于检验人员的水平（图1A）[2].以上这些因素都限制了染色体核型分析技术在高通量自动化分析中对亚显微镜染色体结构异常的发现.     

应用微阵列比较基因组杂交技术检测乳腺癌患者共有拷贝数变异的初步研究

目的 探讨乳腺癌患者基因组中共有的拷贝数变异与乳腺癌发生发展的关系,为乳腺癌的预防、治疗和预后提供基本依据. 方法 使用微阵列比较基因组杂交技术检测样本基因组DNA的拷贝数变异.将得到的拷贝数变异在人类基因组变异数据库和孟德尔遗传数据库进行变异分析,寻找样本共有的拷贝数变异并分析其与乳腺癌的关系.结果 发现1q21、8p11、8p12、8q11、14q32、14q32.33(其中包含2个片段),20q13和22q11共9个共有拷贝数变异,其中4个拷贝数变异通过人类基因组变异数据库证实为正常多态性拷贝数变异.有5个拷贝数变异在人类基因组变异数据库中不存在相似片段并且在孟德尔遗传数据库中有致病基因,包括4个扩增片段和1个缺失片段. 结论 1q21.1q42.2、8q21.12q23.3和20q13.2q13.31 3个片段的扩增及8p12p11.23的缺失与乳腺癌的发生和发展有一定联系,但8q11.22q11.23的扩增与乳腺癌的发生、发展的相关性尚有待于进一步验证.     

基于基因芯片的比较基因组杂交方法在分析非特指型外周T细胞淋巴瘤染色体改变中的价值评估

【摘要】目的探讨基于基因芯片的比较基因组杂交（array—basedcomparativegenomichybridiza—tion。Array—CGH）方法检测非特指型外周T细胞淋巴瘤（peripheralT—celllymphoma—nototherwisespeci—fled,PTCL—NOS）的分子遗传学改变特征的临床价值。方法收集2001年10月至2008年12月PTCL—NOS患者组织标本31例,采用1MbArray—CGH检测其基因变化,并用TilepathArray—CGH对检测结果进行验证。数据采用SPSS14．0统计软件进行分析。结果31例PTCL—NOS标本中,有17例（54．8％）出现不同程度的染色体改变,且有基因改变的患者生存期明显短于无基因改变的患者,差异均有统计学意义（P均〈0．05）。经TilepathArray—CGH检测验证,1MbArray—CGH检测的基因改变与TilepathAr—ray—CGH检测的基因改变完全一致。结论Array—CGH可以全面快速检测与肿瘤相关的染色体改变,对研究淋巴瘤特异性遗传特征具有重要意义。     

Molecular cytogenetic characterization of esophageal cancer detected by comparative genomic hybridization

Aim: Detection of cytogenetic alterations in esophageal cancer (EC). A total of 40 cases of primary EC and their paired nearby nontumor tissues were collected. The comparative genomic hybridization (CGH) is the technique that brings out the gains and losses of chromosome fragments and was applied to determine the aberrations from the tissue DNA. In noncancer tissues, the gains were at 19p (5/40, 13%), 20q (5/40, 13%), and losses at 9p (13/40, 33%), 2q (10/40, 25%), 12q (10/40, 25%), 13q (10/40, 25%), 5q (9/40, 23%), 6q (9/40, 23%), 7q (9/40, 23%), and 8p (9/40, 23%). Two cases in nontumor tissues showed no CGH change. In the 40 cases of primary EC, the gains were at 8q (10/40, 25%), 3q (9/40, 23%), 2q (7/40, 18%), and 13q (7/40, 18%), and the losses were at 1q (8/40, 20%), 4q (8/40, 20%), 3p (7/40, 18%), 5q (7/40, 18%), and 18q (7/40, 18%) in comparison with paired nearby noncancerous tissues. We found that the loss aberrations were on 1q, 2p, 3p, 5q, 6q, 9p, 11p, 15q, 16q, 18q, 21q and gains on 20p in both tumor and nontumor tissues; nevertheless, ?4p, ?7q, ?8p, ?10q, ?12q, ?13q, ?14q and +17p, +19q, +22q were only found in nontumor tissues and +1q, +2pq, +3q, ?4q, +4q, +5q, 7p, +8q, +10q, +12q, +13q, +14q ?17p, ?19pq, ?22q in EC. From these results, we suggest that most of the tissues near the cancer parts of EC may be considered as a precancerous region. The alteration between cancer and noncancer tissues may play a role in the development of EC. J. Clin. Lab. Anal. 24:167–174, 2010.© 2010 Wiley‐Liss, Inc.     

微阵列比较基因组杂交用于智力低下和发育迟缓伴2q37微缺失患儿的分子诊断

目的寻找1例生长发育迟缓(development delay,DD)、智力低下(mental retardation,MR)患儿潜在的致病性基因组不平衡(genomic imbalance),分析其与表型的相关性;探讨高密度微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomichybridization,array-CGH)在临床分子遗传学诊断中的应用价值。方法用array-CGH技术对患儿进行全基因组高分辨率扫描分析,并用多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)对新发现的基因组不平衡进行验证。结果该患儿外周血细胞G显带核型未见异常,array-CGH结果发现患儿2号染色体末端存在1个亚显微结构微缺失del(2q37.1-37.3,-9.3 Mb)。MLPA结果也验证了患儿该缺失区域的存在,患儿的基因组不平衡为新发的,但患儿父母该区域未见异常。文献查询与表型基因型分析证实了该缺失具有病理性意义。结论新发现的Del(2q37.1-37.3,-9.3Mb)是该患儿真正的致病原因;array-CGH技术在MR/DD患儿的分子遗传学诊断中具有重要价值。     

基于微阵列芯片的比较基因组杂交技术在原发性闭经患者中的应用

目的 采用array-CGH技术对原发性闭经患者进行检测,探讨原发性闭经的分子生物学机制.方法 选取原发性闭经患者10例,另外选择10名具有规则月经周期的同龄女性自愿者作为健康对照者.分别采用常规细胞核型分析技术及array-CGH技术对10例原发性闭经患者和健康对照者进行分析.细胞核型分析技术采用常规G显带染色体核型分析技术,array-CGH技术采用美国Affymetrix公司Cytogenetic 2.7M微阵列芯片技术.结果 10例原发性闭经病例经常规G显带染色体核型分析未发现异常,所有病例和健康对照标本均为正常女性染色体核型:46,XX.Array-CGH 分析结果显示,有5例原发性闭经患者的X染色体短臂末端发生了约110000 bp的细小缺失,定位到染色体上的位置为:46,X,del(X)(p22.33).所有健康对照者经array-CGH分析均未见异常的DNA拷贝数改变.结论 Array-CGH技术在DNA水平上提高了染色体病的诊断水平,对于常规方法不能明确诊断的原发性闭经患者,有必要应用array-CGH技术进行更高分辨率的遗传学分析.     

Array-CGH技术在胚胎植入前遗传学诊断中的应用进展

微阵列比较基因组杂交(a CGH)作为一种新兴的高通量检测技术,给分子生物学及医学研究带来了巨大变化,因其检测范围覆盖全基因组、高效率、操作简便等特点,在人类遗传疾病诊断,肿瘤基因组学,系统生物学研究及产前诊断中已有了广泛应用。植入前遗传学诊断(PGD)是辅助生殖技术的重要组成部分,随着分子遗传学技术的发展,其应用范围也不断拓宽。基于a CGH技术在PGD中对胚胎全染色体组非整倍体及结构异常的筛查,PGD/植入前遗传学筛查(PGS)胚胎植入率和临床妊娠率均有显著提高,本文就a CGH技术在胚胎植入前遗传学诊断中的应用进行综述。     

Unbalanced translocation in an adult patient with premature ovarian failure and mental retardation detected by spectral karyotyping and array-comparative genomic hybridization

Background  There are only three cases of unbalanced translocation (X;1) reported in childhood in the literature, while no such phenotypic information is available in adults.
Materials and methods  To delineate the phenotype–genotype relationship of unbalanced translocation (X;1) in adulthood, we reported here a 20-year-old female with an unbalanced translocation (X;1) which was determined by spectral karyotyping, array-comparative genomic hybridization and subtelomeric fluorescence in situ hybridization (FISH).
Results  The phenotype of partial trisomy 1 and partial monosomy X of the present case was much attenuated, including premature ovarian failure, mental retardation, class I obesity, mild dysmorphism and delayed secondary sexual characteristics. The breakpoints of the unbalanced translocation were accurately located at Xq28 and 1q32·1. The large amplification on Chromosome 1 q arm was found to involve 312 genes and the deletion on Chromosome X q arm also involved 141 genes. Overall, genes associated with physiological process (47 genes), cellular process (33), development (23), response to stimulus (1) and reproduction (1) were observed in the amplification on Chromosome 1 q arm. In addition, genes related to physiological process (23 genes), cellular process (13), development (6) and response to stimulus (2) were observed in the large deletion on chromosome X q arm. Late-replication studies revealed the existence of skewed X inactivation in the derivative X chromosome.
Conclusions  The phenotype of partial monosomy X and partial trisomy 1q is much attenuated in case of unbalanced translocation (X;1) in adulthood probably owing to skewed X inactivation in derivative X chromosome.     

Application of array-based comparative genomic hybridization to clinical diagnostics

Microarray-based comparative genomic hybridization (array CGH) is a revolutionary platform that was recently adopted in the clinical laboratory. This technology was first developed as a research tool for the investigation of genomic alterations in cancer. It allows for a high-resolution evaluation of DNA copy number alterations associated with chromosome abnormalities. Array CGH is based on the use of differentially labeled test and reference genomic DNA samples that are simultaneously hybridized to DNA targets arrayed on a glass slide or other solid platform. In this review, we examine the technology and its transformation from a research tool into a maturing diagnostic instrument. We also evaluate the various approaches that have shaped the current platforms that are used for clinical applications. Finally, we discuss the advantages and shortcomings of "whole-genome" arrays and compare their diagnostic use to "targeted" arrays. Depending on their design, microarrays provide distinct advantages over conventional cytogenetic analysis because they have the potential to detect the majority of microscopic and submicroscopic chromosomal abnormalities. This new platform is poised to revolutionize modern cytogenetic diagnostics and to provide clinicians with a powerful tool to use in their increasingly sophisticated diagnostic capabilities.     

原发性中枢神经系统淋巴瘤的临床病理及与EB病毒的关系

目的　探讨原发性中枢神经系统淋巴瘤 (primarycentralnervoussystemlymphoma ,PCNSL)的临床病理特点及与EB病毒 (EBV)的关系。方法　对 6例PCNSL进行临床病理观察 ,采用ABC法行LCA、CD2 0、CD79a、CD4 5RO、CD3免疫组化标记 ,并以生物素标记的EBER 1寡核苷酸为探针进行原位杂交检测。结果　 6例均无HIV感染病史 ,其中 5例为B细胞来源淋巴瘤 ,1例为T细胞来源淋巴瘤 ,EB病毒原位杂交检测均为 (- )。结论　PCNSL多数为B细胞性淋巴瘤 ,少数为T细胞性淋巴瘤 ,非HIV感染的PCNSL的发生可能与EB病毒感染关系不密切。