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1.
目的利用网络药理学方法探讨抗敏止嗽颗粒治疗支气管哮喘的潜在作用机制, 并结合动物实验加以验证。方法借助BATMAN-TCM数据库筛选抗敏止嗽颗粒的活性成分及对应靶点信息, 通过GeneCards、OMIM数据库获得支气管哮喘的相关疾病靶点, 将药物靶点与支气管哮喘靶点取交集后导入STRING数据库, 建立PPI网络, 采用Cytoscape 3.9.1软件构建"药物-活性成分-交集靶点"网络, 筛选核心靶点, 利用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。制备卵蛋白诱导的哮喘小鼠模型, 经抗敏止嗽颗粒干预后, 观察小鼠肺组织病理学变化, 采用ELISA法检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β水平。结果得到抗敏止嗽颗粒活性成分240个, 潜在作用靶点1 364个, 筛选得到TNF、IL-6、AKT1、ALB、IL-1β等11个核心靶点。GO功能富集分析结果显示, 抗敏止嗽颗粒治疗支气管哮喘主要涉及蛋白质磷酸化的正调节、炎症反应的调节、脂多糖反应等生物进程及TNF、MAPK、IL-17等信号通路。动物实验显示, 抗敏止嗽颗粒可降低血清TNF-α、IL-6、IL-1β水...  相似文献   

2.
目的:通过网络药理学和分子对接探讨茵陈蒿汤治疗慢加急性肝衰竭的作用机制。方法:利用TCMSP、Uniprot数据库收集茵陈蒿汤活性成分及对应靶点;使用GeneCards和OMIM数据库收集慢加急性肝衰竭相关靶点,并筛选药物与疾病交集靶点;运用STRING数据库获得蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape 3.9.1软件构建“中药-活性成分-靶点”网络,利用Metascape数据库进行GO生物功能和KEGG通路富集分析;借助AutoDock等软件进行分子对接验证。结果:茵陈蒿汤治疗ACLF的核心活性成分包括槲皮素、异鼠李素、山柰酚、豆甾醇、β-谷甾醇等,核心靶点有AKT1、MAPK、TNF、IL-6等。KEGG分析主要涉及AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和TNF信号通路等188条信号通路。分子对接结果显示核心成分与核心靶点具有良好的结合活性。结论:茵陈蒿汤治疗慢加急性肝衰竭具有多成分、多靶点、多通路的综合优势和特点。  相似文献   

3.
目的 运用网络药理学方法探讨宣白承气汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选宣白承气汤的活性成分及作用靶点,通过GeneCards数据库筛选支气管哮喘的疾病相关靶点,获取二者交集靶点,即宣白承气汤治疗支气管哮喘的潜在作用靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并分析网络中的核心活性成分;将交集靶点导入STRING数据库进行蛋白互作(PPI)网络分析,筛选出潜在核心靶点;运用R语言软件包对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 共筛选得到34个活性成分及64个潜在作用靶点(交集靶点);获得香叶木素、羟基芫花素、泽兰黄醇素、α-菠菜甾醇等核心活性化合物,IL-6、MAPK3、MMP-9、PPARG和ICAM1等核心靶点;共筛选得到67条信号通路,关键通路包括神经活性配体-受体相互作用信号通路、c AMP信号通路、钙信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、Th1/Th2细胞分化等。结论 宣白承气汤可能是通过香叶木素、羟基芫花素等关键活性成分,作用于IL-6、MAPK3、MMP-9等潜在核心靶点,调控神经活性配体-受体...  相似文献   

4.
目的:运用网络药理学方法探讨枸杞子-菟丝子“异病同治”2型糖尿病性骨质疏松症(DOP)和肾病综合征(NS)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选枸杞子-菟丝子的主要活性成分和作用靶点,利用UniProt数据库及Perl语言进行规范以及转化为标准基因名称,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络。通过GeneCards、OMIM及PharmGkb数据库搜集DOP和NS相关疾病靶点,将疾病靶点与药物靶点取交集,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络并筛选核心蛋白;对交集蛋白运用Rx4.1.3软件及R脚本进行GO功能富集和KEGG通路分析,运用Autodock 4.2软件进行分子对接。结果:筛选后得到枸杞子-菟丝子活性成分42个,作用靶点208个;DOP、NS疾病靶点分别为2834个、2114个,共有靶点915个,疾病和药物交集靶点86个。GO富集分析得到分子功能121条;KEGG通路富集分析获得126条信号通路,靠前的通路为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、IL-17信号通路,...  相似文献   

5.
目的 通过网络药理学方法探讨薏苡仁-苍术“异病同治”类风湿关节炎(RA)和痛风性关节炎(GA)的作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选薏苡仁-苍术的主要活性成分和作用靶点,利用UniProt数据库进行靶点名称规范及转化,通过GeneCards和OMIM数据库搜集RA和GA相关疾病靶点,将疾病靶点与药物靶点取交集,利用Cytoscape3.7.1软件构建药物-活性成分-靶点网络,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络;运用Rx4.0.5软件进行GO功能和KEGG通路富集分析,并借助Cytoscape3.7.1构建中药成分-靶点-通路网络。结果 筛选后得到薏苡仁-苍术活性成分10个,作用靶点70个;RA、GA疾病靶点分别为4 763个、1 572个,疾病和药物交集靶点24个。GO富集分析得到生物过程1 238条,细胞组分9条,分子功能38条;KEGG通路富集分析得到123条通路,与RA及GA相关且排序较靠前的通路有AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路及TNF信号通路等,主要与炎症反应、免疫调节和抗氧化等相关。结论 薏苡仁-苍术治疗RA和GA具...  相似文献   

6.
目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨白头翁汤抗结直肠癌的作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选白头翁汤的活性成分和对应靶点,利用疾病靶点数据库查找结直肠癌靶点,并通过venny2.1.0软件得到交集靶点,通过STRING数据库构建靶点互作网络图;采用Cytoscape软件构建方剂-药物-成分-靶点网络,对交集靶点进行GO和KEGG富集分析,最后采用分子对接技术对主要活性成分和关键靶点的结合能力进行验证。结果:白头翁汤包括白头翁、黄连、黄柏、秦皮4个主要活性成分以及182个潜在作用靶点,GO富集分析显示基因富集于2226条生物过程(BP)、70个细胞组成(CC)及197种分子功能(MF);KEGG富集分析提示共同靶点富集于171条通路,分子对接提示主要活性成分与关键靶点具有较好对接活性。结论:白头翁汤对结直肠癌的治疗作用发挥可能与槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇等成分调控TP53、MAPK1、MAPK14、RELA等基因以及影响TNF、IL-17等信号通路相关。  相似文献   

7.
目的基于网络药理学方法探讨黄芪-百合-沙棘(ALH)联用治疗阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)的可能作用机制。方法利用TCMSP 数据库筛选ALH 的活性成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM 数据库收集AD 相关靶点,将药物活性成分靶点与AD 疾病相关靶点取交集,获得药物-疾病共同靶点;采用 Cytoscape 3.7.2 软件构建药物-活性成分-靶点-疾病网络,并采用STRING 平台构建蛋白互作(PPI)网络,筛选 关键活性成分和靶点;采用Autodock 软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接;采用Clue GO 插件进行 KEGG 通路富集分析。采用D-半乳糖联合氯化铝诱导AD 小鼠模型,通过Morris 水迷宫实验、海马组织病理 学观察(HE 染色法)及ELISA 法检测海马组织中TNF-α、IL-6、IL-17 含量,对ALH 治疗AD 的作用机制进行 初步验证。结果经筛选共获得ALH 活性成分39 个,如槲皮素、山柰酚、7-O-甲基异丙醇胺、芒柄花黄 素、异鼠李素等,主要作用于ATK1、MAPK1、JUN、TP53、TNF 等靶点,涉及PI3K-Akt、MAPK、AGERAGE 、IL-17、TNF 等信号通路,共同发挥治疗AD 的作用。药理学实验结果显示,ALH 可显著提高小鼠学 习记忆能力(P<0.05,P<0.01),减轻海马组织损伤,降低海马组织中TNF-α、IL-6、IL-17 含量(P<0.05, P<0.01)。结论ALH 治疗AD 是多成分、多靶点、多通路相互作用的结果,其机制与抑制炎性因子表达,减 轻炎症损伤有关。  相似文献   

8.
目的?采用网络药理学方法分析藿香正气方治疗妊娠期新型冠状病毒肺炎的作用机制,探究其多成分—多靶点—多通路的相关关系。方法?运用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选藿香正气方中的活性成分,SwissTargetPrediction服务器收集成分靶点,人类基因数据库(GeneCards)获取妊娠期新型冠状病毒肺炎靶点,将成分靶点与疾病靶点映射,获取共有靶点。STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,用Cytoscape3.3.0软件进行拓扑参数分析,得到核心靶点,并构建“药物—成分—靶点—疾病”网络。DAVID数据库对核心靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果?筛选得到藿香正气方中84个活性成分,1 007个成分靶点,疾病靶点236个,两者交集靶点72个。涉及丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、白细胞介素6(IL-6)、MAPK3、MAPK8、肿瘤坏死因子(TNF)、表皮生长因子受体(EGFR)、IL-2等31个核心靶点。GO富集分析显示448个条目,主要集中于细胞凋亡的调控、氧化应激反应、对细胞因子刺激的反应等过程。KEGG富集分析有52条通路,主要参与Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、ErbB信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路和癌症、免疫、凋亡等相关通路调控。结论?藿香正气方的有效成分可通过作用于MAPK1、IL-6、MAPK3、MAPK8、TNF、EGFR等靶点调节多条信号通路,发挥对妊娠期新型冠状病毒肺炎的治疗作用。  相似文献   

9.
目的 基于网络药理学方法探讨金银花治疗登革热的活性成分及作用机制。方法 运用TCMSP、UniProt数据库筛选金银花的活性成分及其作用靶点;通过Genecards、CTD和DisGeNET数据库检索登革热疾病相关靶点;对金银花活性成分作用靶点与登革热疾病相关靶点取交集(共同靶点),即得金银花治疗登革热的潜在作用靶点;采用Cytoscape 3.8.2软件构建金银花治疗登革热的“活性成分-作用靶点”网络;对共同靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析、MCODE及KEGG通路富集分析。结果 共得到金银花活性成分12种,活性成分作用靶点209个,登革热疾病相关靶点3 374个,共同靶点124个。关键活性成分包括槲皮素、木犀草素、山柰酚和β-胡萝卜素等;核心靶点包括ALB、AKT1、TP53、IL6、TNF、VEGFA等;主要生物学过程包括外源性刺激引发自身免疫、氧化应激反应、细胞凋亡等;关键KEGG通路包括IL-17信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、C型凝集素受体信号通路、MAPK信号通路和Toll样受体信号通路等。结论 金银花治疗登革热具有多成分、多靶点、多通路的特点,主要...  相似文献   

10.
目的利用网络药理学方法及分子对接技术分析贞芪扶正胶囊辅助治疗艾滋病的分子机制。方法通过TCMSP获取贞芪扶正胶囊组方药物活性成分及作用靶点, 通过GeneCards、OMIM及DrugBank数据库获取艾滋病相关靶点;通过STRING 11.5数据库构建交集靶点PPI网络, 并采用Cytoscape 3.9.1软件进行网络拓扑分析;采用Metascape数据库对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;运用Cytoscape 3.9.1构建贞芪扶正胶囊成分-靶点-通路网络;利用Autodock Tools软件对核心靶点与活性成分进行分子对接。结果获得贞芪扶正胶囊31个活性成分及180个作用靶点, 确定TNF、IL6、AKT1、IL1B、TP53、VEGFA、RELA、EGFR、CASP3为核心靶点。GO功能富集分析获得生物过程1 436条、细胞组分53条、分子功能117条。KEGG通路富集分析获得167条通路, 与癌症、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路等密切相关。分子对接结果显示, AKT1、TNF等核心靶点与槲皮素、山柰酚、木犀草素等成分有良好的结合活性。...  相似文献   

11.
目的 采用网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索黄芩主要活性成分和作用靶点,通过OMIM、GeneCards、TTD及DrugBank等数据库筛选糖尿病和阿尔茨海默病的主要靶点,构建活性成分-靶点网络;利用STRING 11.0进行蛋白质互作分析,构建PPI网络以筛选重要靶点;运用Metascape库对关键交集靶点进行GO和KEGG富集分析;利用Cytoscape 3.7.2将分析得到的重要靶点和通路构建药物成分-疾病靶点-通路网络;进一步对关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果 筛选出黄芩重要活性成分有汉黄芩素、黄芩素、金合欢素、降穿心莲黄酮等,PPI网络中关键交集靶点61个,核心靶点有AKT1、IL-6、MAPK14、TNF、PRKCA、VEGFA等。GO富集分析得到细胞组成101条,分子功能76条,生物过程1 413条;KEGG通路富集分析得到258条,主要涉及AGE-RAGE信号介导的糖尿病并发症通路、IL-17、MAPK、TNF、PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗通路等。分子对接结果可知,汉黄芩素、金合欢素、黄芩素、红...  相似文献   

12.
目的:通过网络药理学和免疫浸润探讨中药荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的作用机制。方法:通过TCMSP、TCMIP数据库查找荜茇主要化学成分及其作用靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD数据库收集血吸虫病及肝细胞癌相关靶点,构建“药物-成分-靶点”和“成分-靶点-通路”网络图,对药物和疾病的交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析;通过R语言对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过GEPIA和UALCAN数据库对潜在靶点进行表达差异及生存预后分析;通过TIMER数据库对核心靶点进行免疫浸润分析。结果:获得荜茇抗血吸虫病及肝细胞癌潜在靶点11个,其中肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10(IL-10)、环加氧酶2(PTGS2)等可能是荜茇发挥作用的潜在靶点;KEGG通路富集主要涉及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、C型凝集素受体信号通路等,生物信息学结果表明葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)可能在荜茇治疗血吸虫病相关肝细胞癌过程中发挥重要作用。结论:本研究初步预测了荜茇...  相似文献   

13.
目的 运用网络药理学方法探讨复方丹参滴丸治疗糖尿病心肌病(DCM)的潜在作用机制。方法 通过检索TCMSP数据库平台获取复方丹参滴丸活性成分,查询对应靶基因;运用OMIM和GeneCards数据库查找DCM的疾病靶点,构建药物有效成分与疾病靶点的交集Venn图。利用Cytoscape 3.7.2软件构建核心靶点网络图;在DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 筛选获得药物有效成分73个,药-病交集靶点102个,其中IL-6、VEGFA、TNF、TP53等可能是治疗机制核心靶点。富集分析获得GO条目147条,主要包括NO生物合成过程的正调节、质膜、酶结合等生物过程。KEGG通路95条,主要涉及TNF信号途径、癌症信号通路、HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论 从分子层面分析得到复方丹参滴丸治疗DCM具有多成分、多靶点、多通路的特点,为临床应用提供了一定的理论依据。  相似文献   

14.
目的:基于网络药理学及动物实验分析参芪解郁方治疗产后抑郁症(PPD)的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Uniprot数据库对参芪解郁方药物进行成分和靶点的处理收集,再借助GeneCards数据库对疾病靶点进行收集,与药物靶点取“药物-疾病”交集,获得核心靶点,使用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。运用Metascape平台进行基因本体(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后通过造模和药物对大鼠进行干预后,予以旷场实验、强迫游泳实验和蔗糖水消耗实验进行行为学评估,再利用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测各组大鼠血清白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平。结果:筛选到57个参芪解郁方相关活性成分,对应产后抑郁症的潜在作用靶点103个,关键成分有槲皮素、β-谷甾醇、植物甾醇等,核心靶点涉及IL-6、TNF、IL-1β等,主要通过磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、雌激素、T细胞抗原受体等通路发挥药效。动物实验显示参芪解郁方可以提高大鼠...  相似文献   

15.
张敬周  刘金豹    许波    刘源  李刚   《陕西中医》2023,(4):519-523
目的:采用网络药理学方法探讨葛根桂枝牛膝汤治疗痛风性关节炎(GA)的作用机制。方法:采用TCMSP和TCMID数据库检索、筛选葛根桂枝牛膝汤的主要活性成分及对应靶标蛋白,与已知调控GA的蛋白靶标取交集作为候选预测靶标蛋白并绘制蛋白互作网络图。采用DAVID数据库对预测靶标进行GO功能分析以及KEGG通路富集分析。结果:葛根桂枝牛膝汤方中共有143个活性成分。葛根桂枝牛膝汤中的槲皮素、β-谷甾醇、7-O-甲基异琥珀酸醇、山柰酚、豆甾醇、美迪紫檀素、7-甲氧基-2-甲基异黄酮等成分可能通过IL-17信号通路、Th17细胞分化、TNF信号通路、VEGF信号通路、MAPK信号通路、坏死性凋亡通路等调控TNF、IL-6、VEGFA、IL-1β、EGFR等靶点治疗GA。结论:葛根桂枝牛膝汤可通过多组分、多靶点和多信号通路在GA的治疗中发挥抗炎和镇痛作用。  相似文献   

16.
《辽宁中医杂志》2021,48(10):143-149,后插3-后插4
目的基于网络药理学方法探讨活络效灵丹治疗冠心病的有效活性成分及靶点的作用机制。方法本研究运用TCMSP数据库结合筛选条件确定活络效灵丹的主要有效活性成分及其作用靶点。利用GeneCards数据库和OMIM数据库获取冠心病作用靶点,取活络效灵丹和冠心病作用靶点的交集,对交集靶点进行蛋白质互相作用网络分析、基因功能富集分析和信号通路富集分析。结果筛选主要有效活性成分118种,并获得药物靶点197个。通过GeneCards数据库和OMIM数据库共获得7266靶点,药物作用靶点与疾病作用靶点交集基因172个,PPI蛋白互作网络分析得出STAT3、AKT1、JUN、MAPK1、APP、ERLA、CXCL8、IL6、MAPK14、EGFR等可能是活络效灵丹治疗冠心病的核心靶点。GO功能富集分析得到163个条目,KEGG通路富集分析获得69条信号通路,其中富集排名靠前通路主要有IL-17信号通路TNF信号通路、HIF-1信号通路、内分泌抵抗、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、PI3K-Akt信号通路、铂耐药、细胞凋亡、C型凝集素受体信号通路、Th17细胞分化、Toll样受体信号通路等。结论活络效灵丹治疗动冠心病具有多途径、多靶点的作用特点,为探析中医治疗冠心病提供参考。  相似文献   

17.
目的:利用网络药理学探索龙胆泻肝汤治疗特应性皮炎的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM数据库挖掘龙胆泻肝汤的有效成分和作用靶点,利用CTD数据库筛选疾病靶点。将药物与疾病的交集靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,运用Cytoscape 3.7.2构建“疾病-药物-靶点-基因”四维网络,借助DAVID数据库对靶点进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最终使用Auto Dock进行分子对接验证。结果:从龙胆泻肝汤中筛选出有效成分195个、作用靶点328个,其中与特应性皮炎疾病密切相关的靶点79个。经筛选,GO功能富集分析得到条目295个,KEGG通路富集分析得到信号通路86条。分子对接结果显示复方活性成分与核心靶点结合程度较好。结论:龙胆泻肝汤治疗特应性皮炎主要通过槲皮素、山柰酚、豆甾醇等活性化合物作用于白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、前列素内环氧化物合成酶2(Prostaglandin-endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、丝裂原激活蛋白激酶(Mito...  相似文献   

18.
目的:分析芎芷地龙汤的活性成分,预测其治疗偏头痛的作用靶点及信号通路.方法:通过TCMSP平台收集芎芷地龙汤活性成分并进行ADME筛选,收集活性成分潜在靶点;通过GeneCards数据库收集偏头痛的相关疾病靶点,并与药物活性成分靶点取交集得到共同靶点,进行PPI分析;使用Cytoscape构建"药物-靶点-疾病"网络并进行分析,通过DAVID数据库对共同靶点进行GO富集与KEGG富集分析.结果:共筛选出芎芷地龙汤85个潜在活性成分和145个潜在治疗靶点;芎芷地龙汤治疗偏头痛关键靶点为JUN、TNF、MAPK1、AKT1、RELA等;可能参与的通路有Pathway in cancer通路、HIF-1信号、TNF信号通路、TLR信号通路、神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、T细胞受体信号通路等.结论:槲皮素、β-谷甾醇等是芎芷地龙汤中的主要活性成分;TNF、MAPK1、AKT1等基因可能在治疗偏头痛时参与调控;芎芷地龙汤主要通过调节氧化应激反应、低氧反应、炎性因子释放、神经递质传递、血管张力等机制治疗偏头痛.  相似文献   

19.
张涤  李慧洁  邓跃毅 《新中医》2024,56(5):187-199
目的:通过网络药理学探讨尿C 方治疗IgA 肾病(IgAN) 的关键成分和作用机制。方法:通过中 药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、PubChem、Swiss ADEM 和SwissTargetPrediction 获得尿C 方作用 靶点;应用Cytoscape 3.9.1 软件构建“药物-成分-靶点”相互作用网络;通过GeneCards、OMIM 和DisGeNET 平台获得IgAN 作用靶点;通过Venn 2.1 制作韦恩图获得尿C 方和IgAN 之间的交叉靶点并进行鉴定和可视 化,并利用STRING 数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);借助DAVID 数据库对交集靶点进行GO 和KEGG 富集分析并运用微生信在线平台对交集靶点进行GO 和KEGG 富集分析可视化;使用Autodock Vina 软件进行分子对接验证,并利用PyMol 软件得出对接结果。结果:共筛选得到尿C 方有效成分70 种及对应 1 363 个作用靶点,其中确定了10 个关键活性成分。IgAN 相关靶点1 593 个,除重复项后获得823 个疾病靶 点,交集靶点111 个。GO 富集分析得到706 个BP 条目,63 个CC 条目,123 个MF 条目。KEGG 富集分析得 到161 条与IgAN 显著相关的通路。分子对接结果表明,核心活性成分与核心靶点之间存在较强的结合活性。 结论:尿C 方治疗IgAN 的作用机制可能是通过槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、黄芩素等调控AGE-RAGE 信号 通路、IL-17 信号通路、脂质和动脉粥样硬化等发挥治疗作用。  相似文献   

20.
《四川中医》2021,39(7):32-38
目的:运用网络药理学方法研究清脉活血方治疗ASO的作用机制。方法:在中药数据库TCMSP中筛选出清脉活血方的化学成分及对应的靶点,通过Uniprot数据库将靶点名称标准化;通过OMIM、GeneCards数据库检索ASO相关靶点,取药物靶点与疾病靶点交集靶点制作韦恩图,交集靶点即为清脉活血方作用于ASO的预测靶点;使用Cytocsape3.7.2软件构建"中药活性成分-靶点-疾病"网络图,选出关键活性成分;然后在STRING数据库中构建关键蛋白相互作用网络(Protein-proteininteraction, PPI),选出关键靶点基因;利用Rstudio对交集靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果:筛选出清脉活血方有14个有效成分和273个靶点,作用于ASO的相关靶点有152个。GO分析显示,清脉活血方治疗ASO的机制可能与G蛋白偶联胺受体活性、类固醇受体活性、肾上腺素能受体活性、蛋白酶结合、RNA聚合酶II特异性等相关;KEGG通路富集显示清脉活血方治疗ASO影响的通路主要有AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路、白介素-17信号通路、内分泌抵抗、EB病毒感染通路、雌激素信号通路、乙肝病毒、钙信号通路等通路途径。结论:清脉活血方可能是通过JUN、TNF、TP53、IL6、VEGFA、CXCL8等多靶点,通过调节AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路等多条信号通路的形式治疗ASO。  相似文献   

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