蛋白质组技术在大肠癌生物标志物筛选中的应用

蛋白质组学是研究蛋白质的组成和动态变化的一门新兴学科，蛋白质组技术主要包括双向凝胶电泳(2-DE)、质谱(MS)、蛋白质芯片及蛋白质信息技术和数据库。目前，蛋白质组技术已成为研究肿瘤发生发展机制及寻找肿瘤标志物的重要工具。现就蛋白质组技术在分离、鉴定大肠癌生物标志物的应用进展作一介绍。     

SELDI-TOF质谱技术与肿瘤体液标志物研究

本文简要总结近年用于临床蛋白质组研究中的表面增强激光解吸电离蛋白质芯片飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-filght mass spectrometry,SELDI-TOF)技术及其在肿瘤体液标志物研究中的应用.该技术以其简便、快速和无需纯化直接检测体液中蛋白质的特点迅速用于临床体液蛋白质组研究,取得了一些重要进展.同时,该技术也有许多缺点,本文对此做了总结.     

MALDI-TOF-MS检测宫颈浸润癌血清中蛋白质谱的变化

目的:建立宫颈癌的蛋白质组指纹诊断模型,筛选宫颈癌相关蛋白,为建立宫颈癌肿瘤标志物提供理论基础.方法:采用弱阳离子交换磁珠、基质辅助激光解析附电离飞行时间质谱(MB-WCX、MALDI-TOF-MS)技术对37例宫颈浸润癌(宫颈癌组)及50例健康人(对照组)的血清进行蛋白质组的对比研究.结果:宫颈癌组和对照组中共有21种蛋白质质峰谱强度差异有统计学意义(P＜0.05),以M1450.35Da,M1778.7Da,M1896.65Da,M5520.42Da的4种蛋白质作为分类变量建立分类预测模型并对宫颈癌和对照组进行分类诊断,其识别率和预测能力分别为90.45%和81.75%;宫颈癌不同病理分化程度蛋白质组时比发现共有2种蛋白质质峰强度差异有统计学意义(P＜0.05),以M5904.14Da,M5264.26Da的2种蛋白质作为分类变量建立分类模型并对不同分化程度进行分类诊断,其识别率和预测能力分别为81.48%和78.89%.结论:利用MALDI-TOF-MS技术筛选出来的具有分类意义的蛋白质,有可能成为宫颈癌诊断及预后判断的一组生物学指标,为宫颈癌肿瘤标志物提供重要线索.     

血清蛋白质组技术在肿瘤标志物筛查中的应用

蛋白质组学研究可以动态、整体、定量的检测肿瘤发生、发展过程中蛋白质种类、数量的改变,有助于寻找与鉴定肿瘤诊断和预后的特异标志物及药物治疗靶点,目前已广泛应用于生物学各研究领域.近年来,出现了将蛋白质组技术与血清学相结合的新方法,为在血清中筛选、鉴定肿瘤标志物提供了技术平台,运用这些技术有可能在多种肿瘤中发现更多有研究前景的肿瘤标志物候选蛋白.     

肿瘤蛋白质组学:过去、现在和将来

将蛋白质组学的技术方法应用到肿瘤生物学的研究中,产生了-门新学科--肿瘤蛋白质组学.它以寻找肿瘤标志物为目的,以蛋白质组学方法为手段,结合肿瘤分子机制的基础研究与肿瘤检测、诊断等临床研究.最终产出能应用于临床的肿瘤检测和治疗的蛋白质靶标.肿瘤蛋白质组学经历了表达谱、修饰谱到活性谱的进化过程,在不同的层面上揭示肿瘤可能的致病机制.本文概述了近年来在常见的恶性肿瘤中进行的肿瘤蛋白质组研究,应用各种蛋白质组技术方法,如二维凝胶电泳(two-dimensional gel eleetrophresis,2DE)、细胞培养稳定同位素标记技术(stable isotope labeling by amino acid in cell culture,SILAC)、基质辅助激光解析(matrix assisted laser desorption/ionization,MALDI)质谱等,找到了大量的蛋白质标志物.将来的挑战在于如何从理论上应用候选标志物解析肿瘤的分子机制,以及从实践上鉴定能真正应用于临床的标志物.     

Studies on plasma candidate tumor biomarkers in Uyghur women with cervical carcinoma by 2-D DIGE analysis

目的:血清蛋白组学在肿瘤标志物的筛查研究中被广泛应用,本研究采用双向荧光差异电泳联合质谱技术,寻找与维吾尔族妇女宫颈鳞癌相关的血浆蛋白候选肿瘤标志物.方法:收集维吾尔族妇女宫颈病变血浆标本(慢性宫颈炎患者22例,宫颈癌早期患者26例),制备血浆低丰度蛋白质组样品,通过蛋白质双向荧光差异电泳技术分离与鉴别分析,筛选出慢性宫颈炎与宫颈癌早期患者两组间血浆差异表达的蛋白位点,运用质谱和生物信息学技术对其进行鉴定和功能识别分析.结果:确定了宫颈炎和早期宫颈鳞癌患者的血浆低丰度蛋白质组差异荧光电泳图谱,筛选出43个差异表达蛋白位点,通过质谱技术鉴定出16种蛋白质,在宫颈鳞癌早期患者血浆中有7个蛋白上调表达、9个蛋白下调表达.通过生物信息学分析,差异蛋白涉及的通路主要有补体和代谢相关蛋白和酶类.结论:本研究针对新疆维吾尔族妇女宫颈癌及宫颈炎患者,展开血浆低丰度蛋白组表达水平的研究,鉴定出多种差异表达蛋白质,为宫颈癌的早期诊断及癌变机制研究提供了依据.     

血清蛋白质组技术在肿瘤标志物筛查中的应用

蛋白质组学研究可以动态、整体、定量的检测肿瘤发生、发展过程中蛋白质种类、数量的改变，有助于寻找与鉴定肿瘤诊断和预后的特异标志物及药物治疗靶点，目前已广泛应用于生物学各研究领域。近年来，出现了将蛋白质组技术与血清学相结合的新方法，为在血清中筛选、鉴定肿瘤标志物提供了技术平台，运用这些技术有可能在多种肿瘤中发现更多有研究前景的肿瘤标志物候选蛋白。     

人胆管癌与正常人胆汁蛋白质组学研究

背景与目的:胆管癌是目前常见的消化道恶性肿瘤,由于大多数患者确诊时疾病已属中晚期,总体5年生存率极低,所以改善预后的关键在于早期诊断.近年来,蛋白质组学的迅猛发展,为检测肿瘤标志物提供了一种新技术.本研究采用蛋白质组学的相关技术,建立胆汁蛋白质组双向电泳图谱,筛选胆管癌患者胆汁和正常人胆汁中的差异表达蛋白,以发现可能用于早期诊断胆管癌的肿瘤标志物.方法:收集胆管患者和正常人胆汁标本,经脱盐、脱脂纯化处理后提取蛋白,进行二维电泳,应用PDQuest 8.0 2D图像软件对银离子染色的双向电泳图像进行分析,并对差异表达的蛋白质行质谱鉴定.结果:成功建立胆管癌和正常人胆汁的双向凝胶电泳图谱,其图谱上平均蛋白质点数分别为(352±23)个和(317±26)个.选取其中表达差异超过2倍的蛋白质斑点10个,行质谱分析和数据库检索,鉴定出5种有意义的蛋白质,包括(angiopoien-related protein 1)、(fibroblast growth factor substrate 2)、(catenin,beta 1)、(kertain,type I cytoskeletal 16)和(ras-related protein 37).从功能上分析这些差异蛋白质与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关.结论:蛋白质组学能很好地显示胆管癌患者与正常人胆汁间的差异表达蛋白,研究鉴定的5种差异表达蛋白质可能为研究胆管癌的生物学行为提供新的分子标志物.     

蛋白质芯片质谱仪在肿瘤标志物研究中的应用

表面加强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)是一种新的蛋白质检测技术.与传统的蛋白质组学方法相比,该技术具有快速、灵敏、高通量等特点.利用该技术制成的蛋白质芯片质谱仪已成为蛋白质组学研究中的重要工具.现综述该技术在肿瘤标志物研究中的应用.     

血浆中卵巢癌相关蛋白质的筛选

目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析卵巢癌的血浆蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血浆肿瘤标志物,以利于卵巢癌的早期诊断.方法:收集卵巢浆液性癌30例、卵巢浆液性瘤18例、妇科良性疾病(包括卵巢囊肿和子宫肌瘤)30例的血浆样本,经磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析及ClinproTools生物信息学方法研究其血浆蛋白表达谱.结果:在卵巢癌组和非癌组间,得到差异性蛋白48个(P＜0.05),用其中四个联合分组能力最强的蛋白质4 210.91(m/z),4 470.17(m/z), 2 210.9(m/z), 1 866.88(m/z)建立了诊断模型,癌组和非癌组的识别率为100%.结论:利用液体芯片-飞行质谱技术进行血浆卵巢癌相关蛋白质的研究,得到了差异蛋白和诊断模型,对卵巢癌的诊断具有潜在价值.     

Possibility of predicting the results of the surgical treatment of cancer of the thoracic portion of the esophagus

Within a 18-year period in the clinic 273 patients were subjected to radical surgery for cancer of the thoracic esophagus. 206 patients were discharged from the clinic. The survival rate for 5 years and longer was noted in 58 patients. The data and results of the treatment depending on a sum of clinical signs were treated mathematically. It is noted that the patients' survival is influenced by such factors as sex, the stage of the disease, the morphological structure of tumor, the character of course, tumor size and spread, the type of surgical intervention. An advanced course, changes in blood presence of metastases do not seem to be the reason for cancellation of the operation.     

Cardiac tolerance of the combination paclitaxel-anthracyclines in the context of the management of cancer of the breast

Within the past decades there has been major interest in associating the paclitaxel into the management of breast cancer patients with a strong improvement of clinical results. Moreover, doxorubicin is historically one of the major chemotherapeutic agents in breast cancer treatment. So, investigations of the combination of the paclitaxel with doxorubicin have logically taken place in the strategy of breast cancer management. Also, this association became a standard of care neoadjuvantly in locally advanced breast cancer. The aim of this review of literature consists to make a special focus on cardiac toxicity occurring after doxorubicin and paclitaxel association and to give adequate directions for the next future in this promising combination.     

Improvement of the efficiency of the treatment of gastric cancer by the standardization of the treatment plan

Standardized treatment plan for gastric cancer was established in our department by which surgeons and nurses understood the treatment schedules of each gastric cancer patient as the common knowledge, and the cooperation of surgeons and nurses could be improved. Furthermore, the modality decreased the length of hospital stay from 35 +/- 15 days to 24 +/- 8 days, which indicated that the number of patients per one bed for one year increased from 10 to 15, and the efficiency of the treatment of gastric cancer patients 50% by our system.