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慢性非甲—戊型肝炎患者血清中庚型肝炎病毒核酸的检测及部分核苷… 总被引:5,自引:0,他引:5
目的 了解庚型肝炎病毒(HGV)在慢性非甲-戊型肝炎发病中的作用,并测定其非结构基因5(NS5)区部分核苷酸序列,方法 以逆转录-套式-聚合酶链反应法检测HGVRNA,并对阳性者血清中扩增出的994bp长的cDNA直接测序。结果 35例慢性非甲-戊型肝炎患者中1例血清HGVRNA阳性(2.9%)。该患者HGVNS5区部分核苷酸序列与美国株PNF2161及R10291的同源性分别为87.95%及89 相似文献
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目的进一步证实我国南方地区存在戊型肝炎病毒(HEV)不同的基因序列。方法用逆转录套式聚合酶链反应(RT-nestedPCR)检测8例厦门地区急性散发性成型肝炎患者血清中的HEVRNA,其中2例阳性;测定了广州分离株G93—2株病毒第5代培养液的HEVRNA。对阳性PCR产物进行克隆、核苷酸序列分析。结果厦门株X-S1与广州G93-2株病毒核苷酸和氨基酸序列的同源性为992%和975%;厦门株(X-S1)和广州株(G93-2)与缅甸株(Bur—121)和我国新疆株(87A)的核苷酸和氨基酸序列的同源性为79.9%和86.3%,与墨西哥株的同源性为774%和%.3%。结论经序列分析结果进一步证实我国南方地区确实存在一种不同的HEV基因型。 相似文献
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粪便中戊型肝炎病毒散发株的核酸序列分析 总被引:2,自引:0,他引:2
目的了解粪便中戊型肝炎病毒(HEV)散发株的核酸序列变异情况。方法用逆转录-套式-聚合酶链反应(RT-Nested-PCR)检测了8例广州地区散发性戊型肝炎患者粪便中的HEVRNA,3例阳性。对阳性PCR产物的238个碱基进行了基因克隆和核酸序列分析,并与已报道的HEV序列进行比较。结果本地区3株HEV与缅甸株(B)、巴基斯坦株(P)、墨西哥株(M)、中国新疆株(Ch1.1)和广州血清株(G-9)的核苷酸和氨基酸的同源性均值分别为80.67%和88.60(B)、81.25%和89.20%(P)、77.45%和84.81%(M)、81.25%和89.20%(C)、97.85%和96.20%(G)。结论本组3株HEV有一定程度的变异。 相似文献
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从长春分离的一株急性散发性戊型肝炎病毒部分核苷酸序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的分析长春一株急性散发性戊型肝炎病毒(HEV)的部分核苷酸序列。方法应用逆转录套式聚合酶链反应法检测HEVRNA;用荧光法(AppliedBiosystems)直接测序。结果被检的14例急性散发性戊型肝炎病人中,5例HEVRNA阳性。对其中一例病人的HBVcDNA开放读框2区进行核苷酸序列分析并与墨西哥株(M)和缅甸株(B)比较,发现长春散发性HEVc-187株与HEV(M)核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为79.9%和93.1%;与HEV(B)散发株和流行株的同源性分别为92.3%和96.2%及93.9%和97.7%;与新疆株(CH1.1)同源性分别为96.5%和95.4%。结论长春散发性HEVc-187株与新疆株(CH1.1)一样,可能与HEV(B)为同一亚型。 相似文献
6.
目的进一步研究丙型肝炎病毒5′NCR对结构蛋白编码基因的表达调控。方法以拼接好的HCV5′NCR,C,E1和E2/NS1区基因共长2547个核苷酸片段克隆于逆转录病毒载体LNSX得重组体pLHC2547,用聚合酶链反应(PCR)及核苷酸序列分析等方法对重组体进行鉴定。通过磷酸钙-DNA共沉淀法把经鉴定的重组体转染入PA317细胞,用G418进行克隆筛选,以NIH3T3细胞测其病毒滴度。提取转染细胞DNA及培养上清RNA分别用PCR和逆转录PCR进行鉴定。结果培养上清的病毒滴度为2×105CFU/ml,PCR及逆转录PCR(RT-PCR)分别可以从转染的细胞DNA及培养上清中扩增出HCV的基因片段。结论目的基因已整合到细胞的基因组中并得以表达 相似文献
7.
以HCV-T3序列为引物,结合RT-PCR和寡聚核甘酸探针Southern杂交,检测66例慢性非甲非乙型肝炎(NANBH)患者的血浆HCV-RNA,阳性42例(63.6%)。同样病例以相当于HCVC区基因编码和NS3区编码的人工合成肽抗原检测抗HCV,阳性49例(74.2%)。这66例慢性NANBH病例,抗HCV和HCV-RNA双阳性者38例(57.6%);抗HCV阴性而HCV-RNA阳性者4例(6.1%);抗HCV阳性而HCV-RNA阴性者11例(16.7%)。其中诊断为散发型NANBH者35例,检出HCV-RNA者17例(48.6%),为输血后NANBH者31例,检出HCV-RNA者25例(80.7%)。 相似文献
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广州地区非甲—戊型肝炎血清中庚型肝炎病毒核酸检测 总被引:7,自引:1,他引:6
1995年,美国相继报道[1-3]了两个新发现的与人类肝炎相关的RNA病毒基因组,分别称为GBVC和HGV,并指出其可能是非甲-戊型肝炎(HNA-E)的致病因子。由于GBVC和HGV的基因组序列具有较高的同源性,因此目前认为它们属同一病毒的不同基... 相似文献
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庚型肝炎临床和病理特征 总被引:10,自引:0,他引:10
目的探讨庚型肝炎(HG)临床和病理特征。方法采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测血清HGVRNA;用庚型肝炎病毒(HGV)NS5区抗原制备单克隆抗体(McAb),对22例临床和/或病理确诊的急、慢性庚型肝炎进行肝脏免疫组化。结果HGV感染的血清学模式以重叠HBV,HCV,HAV或HEV二重感染为主,占63.6%(14/22),单独HGV感染者占36.4%(8/22);HGV在肝脏内分布呈散在胞浆型。结论HGV单独感染者临床多呈隐匿性发病,症状轻,慢性化程度高 相似文献
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北京地区46例Ⅱ/1b型HCV高变区1的序列变异研究 总被引:8,自引:0,他引:8
目的研究北京地区Ⅱ/1b型丙型肝炎病毒(HCV)包膜蛋白E2/NS1高变区1(HVR1)序列变异规律及意义。方法应用逆转录巢式PCR技术从46例北京地区Ⅱ/1b型HCV感染病人血清中扩增了HCV部分包膜区基因片断(nt1119~1258),纯化后直接采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。结果北京地区Ⅱ型HCVHVR1位于氨基酸(aa)384-408位,与有关文献报道(383-410或414)略有差异。HVR1序列与HCV-J、台湾株、河北株、HB-11相应序列比较,核苷酸同源性依次为440%~66.7%(平均57.7%),48.0%~72.0%(60.0%),60.0%~85.3%(69.8%)和56.0%~81.3%(68.2%),氨基酸同源性依次为20.0%-56.0%(38.2%),32.0%~64.0%(45.7%),36.0%~76.0%(49.8%)和40.0%~76.0%(55.6%)。本组HVRI内发现6个较保守的氨基酸位点:385位Thr,389,390,406位Gly,401位Ser,403位Phe。结论对HVR1序列变异规律及生物学意义的进一步研究有助于HCV疫苗的发展。 相似文献