长链非编码RNA及其与肿瘤发生发展的关系

随着基因测序技术的发展,人们发现非编码RNA在机体正常的生命活动及疾病发生、发展中发挥作用,其中长链非编码RNA(lncRNA)在非编码RNA中较晚引起人们重视,是目前研究的热点。lncRNA在机体中的功能多样且复杂,在转录水平、转录后水平以及表观遗传水平上均能调节基因的表达,参与基因组修饰、转录激活、转录干扰、染色体沉淀等过程,并在多种疾病(包括肿瘤)的发生、发展中起重要作用。研究lncRNA内在机制能帮助人们更加深入地了解肿瘤,有望作为肿瘤诊断和预后的分子标志物应用于临床,并能够为临床治疗肿瘤提供新的靶点。     

染色体8q24.21区域lncRNA基因多态性和胃癌易感性的研究进展

胃癌是影响公共卫生健康的主要恶性肿瘤之一,其高发病率、高病死率严重影响着公众的身心健康,早发现、早预防、早治疗已成为全球胃癌防治的公共策略。胃癌的发生、发展是多种环境和遗传因素相互作用的结果,其中,长链非编码RNA(lncRNA)扮演着重要角色。研究发现,lncRNA基因中存在大量与疾病相关的单核苷酸多态性,可通过影响癌症的遗传易感性,从而增加肿瘤发生的风险。染色体8q24.21区域不仅是众多lncRNA的位点,也是近几年肿瘤基因多态性的研究热点。大量的研究表明,8q24.21 lncRNA在诸如胃癌、肝癌、结直肠癌等多种肿瘤中高表达,并参与肿瘤的发生、发展。该文拟对8q24.21区域lncRNA基因多态性与胃癌遗传易感性做一综述,为胃癌高危人群的筛查和预防提供一定的理论依据。     

长链非编码RNA在泌尿系肿瘤诊断中的研究进展

长链非编码RNA (Long non-coding RNA,lncRNA)是细胞中一类转录本长度超过200个核苷酸,具有调控基因表达作用的非编码RNA分子。近年来,很多研究表明lncRNA与人类多种肿瘤的发生和发展密切相关,因此lncRNA作为一类新的肿瘤标志物越来越受到人们的重视。本文就lncRNA在泌尿系肿瘤诊断中的研究进展进行综述。     

外泌体源性非编码RNA作为肝癌标志物的研究进展

非编码RNA(ncRNA)为不具备编码蛋白质功能的基因组转录产物,在基因转录、转录后及翻译水平发挥调控作用,与肿瘤发生和发展密切相关。外泌体ncRNA在细胞间通讯中起着关键作用。某些外泌体ncRNA在肿瘤中存在差异性表达,提示其具备作为肿瘤液体活检标志物的潜在价值。本文对外泌体ncRNA中的微小RNA(microRNA, miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)、环状RNA(circular RNA, circRNA)作为肝细胞癌标志物的研究进展进行综述,探讨了外泌体源性非编码RNA作为肝癌诊断与预后新型生物标志物的临床应用价值。     

长链非编码RNA在肝细胞癌发生发展及转移和复发中的研究进展

肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性侵袭性肿瘤之一,其转移率和复发率高,且缺乏高度特异度和灵敏度的检测系统及合适的治疗靶点,HCC患者的总体生存率较低。因此,阐明HCC发生、发展及转移和复发中的潜在分子机制变得越来越重要。长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA转录本,对HCC细胞增殖、凋亡、侵袭、转移和上皮间质转化等多个生物学过程发挥重要调节作用。因此,lncRNA有希望作为HCC的新的诊断标志物、预后标志物和治疗靶点。本文就lncRNA如何在表观遗传、转录和转录后水平与染色质、RNA和蛋白质相互作用来影响HCC发生发展及转移和复发方面进行综述,为HCC的早期干预和个性化治疗提供新的治疗靶点和防治思路。     

非编码RNA在卵巢癌中的研究进展

卵巢癌是妇科常见的恶性肿瘤疾病,具有早期诊断困难、预后较差的特点。非编码RNA是一类不具有蛋白编码潜能的RNA转录本,包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)。它们能够在生物体内大量存在,参与调控细胞增殖、分化、凋亡等一系列生物过程,并且与肿瘤的发生、发展、转移及预后等方面有着密切联系。该文分别综述miRNA、lncRNA、circRNA与卵巢癌的发生、发展、转移和预后的有关研究进展。     

lncRNA与miRNA相互调控作用机制及其在胃癌中的影响

微小RNA(miRNA)是一类通过与mRNA结合从而调控众多编码基因的非编码小RNA。长链非编码RNA(lncRNA)在不同程度上调控基因的表达,包括染色质修饰、转录和转录后处理等,其转录本长度大于200bp。miRNA和lncRNA的相互调控在肿瘤的发生、发展中也发挥重要作用。本文在介绍lncRNA与miRNA相互调控及机制的基础上,总结其对胃癌(gastric cancer,GC)发生、发展的影响。     

长链非编码RNA与肿瘤关系的研究现状及未来

随着人类基因组计划的完成,整个人类基因的转录图谱已绘出。然而,蛋白编码基因以外的、特别是和人类疾病有关的基因的转录程度和功能机制却是有待探索的问题。长链非编码RNA(lncRNA)作为非编码RNA的重要组成部分,目前尚无确切完整的定义,也无统一的分类体系,主要功能是在遗传、转录及转录后调控基因的表达,与人类肿瘤关系密切。一些lncRNA在肿瘤组织中异常表达,其具体的分子机制虽不完全清楚,但在肿瘤的诊断和治疗中有潜在应用价值。     

lncRNA与心血管疾病

非编码RNA(ncRNA)占哺乳动物RNA的98%,既往认为非编码RNA不具备生物学功能,但近些年来的研究发现,非编码RNA可从表观遗传学、转录调控及转录后调控等多个层面实现对基因表达的调控,其表达水平的变化与多种疾病密切相关,亦影响到心血管疾病的发病进程。其中,长链非编码RNA(lncRNA)成为基因组学研究中一颗冉冉升起的新星,其可从转录水平调控疾病相关基因的表达,亦可竞争性结合microRNA,以影响目的基因的表达和功能。文章从非编码RNA的来源、分类、作用机制及lncRNA在心血管疾病中的研究进展进行综述。具有细胞和组织特异性的lncRNA未来则有望成为一类全新的疾病诊断、判断预后的特异标志物和新药作用靶点,为疾病的临床诊断与治疗提供新思路。     

长链非编码RNA的作用机制与肿瘤的关系

长片段非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA分子,具有调控基因表达作用的非编码RNA。lncRNA广泛参与机体的生理、病理过程,在肿瘤的发生、发展中起重要作用,本文在介绍lncRNA的基础上,综合分析lncRNA对基因表达调控作用的机制及其与肿瘤的关系。     

肾结石患者血清中LncRNA TapSAKI表达及其与预后的关系

目的 探究长链非编码RNA(LncRNA)TapSAKI在肾结石患者血清中的表达水平及预后的关系。 方法 选取2017年1月—2019年6月宁波市医疗中心李惠利医院收治的144例肾结石患者为肾结石组,并选取同期本院148例健康体检者为正常组。以实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测所有受试者血清中LncRNA TapSAKI水平;酶联免疫吸附法(ELISA)检测所有受试者血清单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)、白介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平;分析肾结石患者行经皮肾镜碎石术预后情况;比较2组不同预后患者血清LncRNA TapSAKI、MCP-1、IL-6、TNF-α水平;分析肾结石患者血清LncRNA TapSAKI与MCP-1、IL-6、TNF-α水平的相关性;分析肾结石预后的影响因素。采用SPSS 22.0统计学软件进行分析。 结果 肾结石组患者血清LncRNA TapSAKI、MCP-1、IL-6、TNF-α水平均明显高于正常组(均P<0.05);术后不良并发症发生率为23.61%(34/144);预后不良组患者血清LncRNA TapSAKI、MCP-1、IL-6、TNF-α水平均明显高于正常组(均P<0.05);肾结石患者血清LncRNA TapSAKI与MCP-1、IL-6、TNF-α水平均呈正相关(均P<0.05);LncRNA TapSAKI与MCP-1、IL-6、TNF-α均为肾结石患者预后不良的危险因素(均P<0.05)。 结论 肾结石患者血清LncRNA TapSAKI呈高表达,高水平LncRNA TapSAKI可能是肾结石患者不良预后因素,可作为评估肾结石预后的参考指标。      

免疫相关LncRNA与乳腺癌预后关系分析及预后风险模型建立

目的 探讨免疫相关LncRNA的表达与乳腺癌预后的关系,构建乳腺癌免疫相关LncRNA预后风险模型。 方法 从TCGA公共数据库下载乳腺癌的转录组数据和临床病理信息,利用Perl软件提取乳腺癌数据表达矩阵,采用R语言使用共表达法提取免疫相关LncRNA,单因素和多因素Cox回归分析筛选预后相关LncRNA,根据最佳AIC值确定免疫预后相关LncRNA构建预后风险模型,根据风险值将患者分为低分险组和高风险组,采用Kaplan-Meier分析法进行生存分析并绘制两组患者生存曲线,使用ROC曲线对预后风险模型准确性进行评估,同时单因素和多因素Cox回归分析评估预后风险模型与肿瘤预后相关性。 结果 从TCGA数据中共下载1 041例乳腺癌样本,提取到14 142个LncRNA表达谱,通过共表达法获得免疫相关LncRNA 644个,对免疫相关LncRNA进行单因素Cox回归分析筛选出14个LncRNA,对14个LncRNA进行多因素Cox回归分析,根据最佳AIC值筛选出6个LncRNA用于构建预后风险模型,根据风险值将患者分为低分险组和高风险组,生存分析显示两组患者差异有统计学意义,同时预后风险模型曲线下AUC值为0.703,模型具有较好的准确性。多因素Cox回归分析结果显示,年龄和患者风险评分为乳腺癌的独立危险因素。 结论 免疫相关LncRNA预后风险模型为乳腺癌的独立预后影响因子,可以有效预测乳腺癌患者的生存预后,可作为乳腺癌独立的预后生物标志物。     

LncRNA CASC2、miR-155-5p与上皮性卵巢癌病人化疗敏感性及预后的相关性研究

目的：分析长链非编码RNA(LncRNA)癌易感性候选基因2(CASC2)、miR-155-5p与上皮性卵巢癌病人化疗敏感性及预后的相关性关系。方法：采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测87例上皮性卵巢癌病人(上皮性卵巢癌组)及72例卵巢良性肿瘤病人(对照组)LncRNA CASC2、miR-155-5p表达水平,比较2组LncRNA CASC2、miR-155-5p表达水平,分析上皮性卵巢癌组LncRNA CASC2、miR-155-5p表达水平与临床病理特征的相关性关系。根据上皮性卵巢癌组病人术后化疗是否出现继发耐药分为化疗耐药组(n=32例)和化疗敏感组(n=55例),分析LncRNA CASC2、miR-155-5p表达水平与化疗敏感性的关系。同时采用Pearson法分析上皮性卵巢癌组织中LncRNA CASC2与miR-155-5p的相关性关系,采用Kaplan-Meier法分析两者与上皮性卵巢癌病人5年生存情况的关系。结果：上皮性卵巢癌组LncRNA CASC2表达水平低于对照组,而miR-155-5p表达水平高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.01);...     

LncRNA CBR3-AS1在骨肉瘤中的表达和临床意义及对肿瘤生物学的影响

摘要：目的：探讨LncRNA CBR3-AS1在骨肉瘤患者中的表达、临床意义及对肿瘤生物学的影响。方法：回顾性收集2012年1月到2014年1月于我院骨科诊治的骨肉瘤66例患者病理组织样本和临床资料,qRT-PCR法检测病理组织中LncRNA CBR3-AS1表达,并将患者分为LncRNA CBR3-AS1高低表达两组,卡方检验LncRNA CBR3-AS1表达情况与骨肉瘤临床参数的相关性,Kaplan-Meier 生存分析法比较LncRNA CBR3-AS1高低表达骨肉瘤患者生存率的差异。体外实验敲低LncRNA CBR3-AS1表达对骨肉瘤细胞系U-2 OS肿瘤生物学行为影响。结果：LncRNA CBR3-AS1在骨肉瘤组织和细胞系中高表达（P<0.001）;LncRNA CBR3-AS1表达与Enneking分期（P<0.001）、远处转移（P=0.004）和组织学分级（P=0.036）显著性相关;LncRNA CBR3-AS1高表达与骨肉瘤患者总生存率呈负相关（P <0.01）;LncRNA CBR3-AS1高表达是骨肉瘤患者的不良预后因素（HR= 1.558, 95％CI:1.041-2.641,P=0.013）;敲低LncRNA CBR3-AS1表达可抑制骨肉瘤细胞系MG-63细胞增殖、迁移和侵袭、并促进细胞凋亡（P<0.001）;骨肉瘤组织中LncRNA CBR3-AS1和CBR3mRNA表达之间正相关（r=0.44,P=0.036）,敲低LncRNA CBR3-AS1对骨肉瘤细胞CBR3 mRNA和蛋白质表达降低。结论：LncRNA CBR3-AS1具有调节骨肉瘤细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的致癌作用,是骨肉瘤患者预后独立危险因素。     

长链非编码RNA与肺癌

长链非编码RNA(1ong noncoding RNA,lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA分子,其数量众多,但缺少蛋白质编码功能。研究发现,lncRNA能在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达,在各类生物过程中起重要的调节作用,并与多种肿瘤等疾病相关,已经成为现代遗传学的研究热点。近期研究证据显示,肺癌中有多种lncRNA的表达水平发生了变化,并在肺癌的发生、发展及预后中起着重要的调控作用,本文就lncRNA的定义、分类、功能机制及与肺癌的相关性研究作一综述。     

利用CRISPR/Cpf1系统构建稳定敲除LncRNA458314的肾癌细胞株及其功能探讨

［摘要］目的: 通过新基因编辑系统CRISPR/Cpf1稳定敲除肾癌细胞769P中的LncRNA458314,并初步研究LncRNA458314在肾癌中的作用。方法: 使用CRISPR/Cpf1系统敲除肾癌细胞769P的LncRNA458314,并通过荧光定量PCR检测敲除效率。通过CCK8实验检测LncRNA458314敲除后769P细胞的增殖能力;蛋白质印迹法检测LncRNA458314敲除后769P细胞pAKT、pERK和LC3A/B蛋白的表达。结果： 荧光定量PCR结果表明CRISPR/Cpf1系统成功敲除了目标LncRNA458314,并且通过多次荧光定量PCR检测对比后,挑选了两个稳定LncRNA458314低表达的769P单克隆细胞（6#和13#）用于后续实验。CCK8实验表明,LncRNA458314下调后,肾癌769P细胞的增殖能力明显下降;蛋白质印迹结果表明,LncRNA458314敲除后的769P细胞pAKT、pERK表达水平明显下降,LC3A/B表达水平明显上升。结论： LncRNA458314可能通过调控pAKT、pERK和LC3A/B表达发挥其生物学功能。     

大鼠坐骨神经Wallerian溃变过程中LncRNA的差异表达分析*

目的：采用分子生物学和生物信息学方法筛选大鼠坐骨神经损伤后Wallerian溃变(Wallerian degeneration, WD)过程中的关键长链非编码RNA(long none coding RNA, LncRNA),并分析该关键LncRNA分子在大鼠坐骨神经损伤过程中的作用。方法：采用Affymetrix大鼠Non Coding RNA芯片,分析大鼠坐骨神经损伤后WD过程中差异表达的LncRNA;通过实时定量聚合酶链式反应验证关键LncRNA的表达;预测关键LncRNA相关基因及功能。结果：基因芯片分析结果显示共有显著差异性LncRNA 708个和mRNA 2 649个,上调LncRNA 283个,下调LncRNA 425个。通过编码—非编码基因共表达分析和预测竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA, ceRNA)机制,显示在WD过程中发挥作用的LncRNA,其中上调19个,下调17个。WD早期差异表达的LncRNA靶基因11个,WD后期差异表达的LncRNA靶基因31个。结论：大鼠坐骨神经损伤后,LncRNA显著差异性表达,提示LncRNA在周围神经损伤修复与再生过程中可能发挥了一定作用,为进一步分析LncRNA在神经再生中的作用提供了实验基础。     

NEAT1在胃癌中的表达及与胃癌患者临床病理学参数相关性分析

目的 研究LncRNA NEAT1在胃癌中的临床意义。方法 采用荧光定量PCR法检测胃癌组织及癌旁正常组织标本中LncRNA NEAT1表达水平,分析NEAT1的表达水平与胃癌患者临床病理学参数及预后的相关性。结果 NEAT1在胃癌组织中的表达高于癌旁正常组织(P<0.01)。NEAT1的表达与胃癌患者脉管侵犯、远处转移、以及是否复发显著相关(P<0.05),而与患者年龄、性别、分化程度、神经侵犯、分期、淋巴结转移无显著相关性。单因素与多因素COX回归分析显示,NEAT1表达水平为患者无病生存期及总体生存期相关,且可以作为胃癌患者预后的独立危险因素;生存分析结果显示,与NEAT1低表达组相比,NEAT1高表达组胃癌患者预后较差。结论 NEAT1可能在胃癌中发挥着促癌作用,可作为临床诊断及评估患者预后的潜在指标。     

长链非编码RNA在结直肠癌发生发展中的研究进展

 我国结直肠癌（colorectal cancer,CRC）的发病率和死亡率均保持上升趋势,且多数患者发现时已属晚期。随着CRC的发病机制与分子通路的研究进展,其中长链非编码RNA（long non-coding RNA,LncRNA）参与CRC发生。抑癌基因LncRNA-p21,致癌基因LncRNA结直肠癌差异表达基因（LncRNA colorectal neoplasia differentially expressed,LncRNA-CRNDE）、LncRNA牛磺酸上调基因1（LncRNA taurine up-regulating gene 1,LncRNA-TUG1）、胃腺癌相关LncRNA （gastric adenocarcinoma related LncRNA,LncRNA-GAPLIC）等在CRC中异常表达,并通过多种途径调控CRC发生和发展。LncRNA对癌细胞的增殖、迁移、侵袭、凋亡进行调控,所以对CRC早期筛查、治疗及预后有重要意义。本文就上述4种LncRNA在CRC发生发展中的研究进展进行综述。     

LncRNA GAS5对结肠癌细胞生长及化疗药物作用的影响

目的 检测长链非编码RNA生长抑制特异因子5(Lnc RNA GAS5)对结肠癌细胞的凋亡和生长的影响及其与化疗药物的敏感性是否有关联.方法 siRNA干扰结肠癌细胞株SW480 LncRNA GAS5基因,检测细胞的存活率,加入化疗药物5氟尿嘧啶(5-FU),检测细胞的克隆形成能力,流式细胞仪检测干扰前后细胞的凋亡.结果 siRNA干扰结肠癌细胞SW480 LncRNA GAS5基因后,加入化疗药物5氟尿嘧啶,敲除GAS5基因后癌细胞存活率比敲除GAS5基因前多,其差异具有统计学意义(P<0.05);敲除GAS5基因后,结肠癌细胞的克隆形成能力比敲除GAS5基因前强,其差异具有统计学意义(P<0.05);流式细胞仪检测敲除GAS5前后的结肠癌细胞,敲除GAS5后结肠癌细胞凋亡数量降低,其差异具有统计学意义(P<0.05).结论 GAS5可促进结肠癌细胞的凋亡;GAS5能促进化疗药物对结肠癌细胞的作用;GAS5可能作为抑癌基因存在于结肠癌细胞中,为结肠癌的分子靶向治疗提供依据.