SNCA基因多态性与帕金森病

帕金森病(PD)在我国是仅次于Alzheimer病(AD)的神经系统变性疾病,＞ 65岁老年人的发病率为2％[1].其临床特征为运动迟缓、静止性震颤、肌强直及姿势、步态的异常;病理特征为黑质多巴胺能神经元的变性丢失及胞浆内嗜酸性包涵体即路易小体(LB)的形成.PD大多数是散发病例,家族性发病＜10％,遗传因素在家族性PD的发病机制中所起的重要作用已经成为共识.然而在过去的很长一段时间内认为散发性PD发病是环境因素而不是遗传因素在起作用[2].从1990年起,越来越多的研究结果确立了遗传因素在散发性PD发病中的重要地位.对PD的遗传学研究[2,3]发现,SNCA基因编码的α-突触核蛋白在PD发病中起了关键的作用.现对SNCA基因的多态性与PD发病的关系综述如下.     

单核苷酸多态性SNCA rs356221对帕金森病认知功能的影响

目的探讨单核苷酸多态性SNCA rs356221与帕金森病患者认知功能之间的关系。方法共收集2015年1月至2018年12月在四川绵阳四〇四医院神经内科帕金森病专科门诊就诊的帕金森病患者361例。所有患者均接受神经心理学评估(包括听觉词语学习测试,AVLT)、简易精神状态检查(MMSE)、蒙特利尔认知评估(Mo CA)和Stroop色词测验(SCWT)。利用SNaPShot方法进行SNCA rs356221的基因分型。结果利用SCWT量表,发现卡片C耗时SNCA rs356221携带者组较SNCA rs356221野生型组耗时延长(199.80±0.15 s vs 153.40±0.15 s,P 0.001)。SNCA rs356221携带者组的干扰指数要比SNCA rs356221野生型组显著增高(3.75±0.15 vs 2.88±0.24,P 0.001)。结论SNCA rs356221单核苷酸多态性对帕金森病的执行功能有一定的影响。     

SNCA、P450基因多态性和环境因素交互作用与新疆地区帕金森病的关联研究

目的探索基因-环境因素交互作用对新疆地区帕金森病(Parkinson disease,PD)发病风险的影响。方法以新疆地区224例PD患者、241例自然对照者为研究对象,采用PCR-RFLP法检测SNCA-rs3822086、P4501A1-Msp I的基因分型,并收集其环境因素(吸烟史、饮酒史、喝茶史、农药接触史、化肥接触史、饮用井水史、重大精神创伤史)的暴露情况,在遗传平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)的基础上,采用多因子将维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)法分析基因-环境间的交互效应。结果 (1)在男性群体中,最佳交互模型为吸烟史、重大精神创伤史、化肥接触史联合作用模式,该模型的检验平衡准确度最大(77.91%)、交叉验证一致性结果为10/10。(2)在年龄≥60岁的群体中,最佳交互模型为P450 1A1 Msp I多态性、重大精神创伤史、饮用井水史、化肥接触史联合作用模式,该模型的检验平衡准确度最大(76.12%)、交叉验证一致性结果为10/10。结论在我们的研究中,发现基因-环境间可能存在交互作用影响新疆地区PD的发病风险。     

中国人GRIN2B、SNCA基因多态性与帕金森病相关幻觉的关联分析

目的探讨GRIN2B和SNCA基因多态性与不伴痴呆的帕金森病(PD)患者的幻觉症状是否相关。方法利用SNa Pshot SNP分型技术检测2个基因多态性,对53例幻觉组和47例无幻觉组及其两个亚组之间进行相关性分析。结果 GRIN2B和SNCA在PD有幻觉组和PD无幻觉组及其两个亚组的等位基因和基因型频率不存在显著差异。校正临床相关因素后,GRIN2B rs7301328的GG基因型降低PD相关幻觉发生风险(Recessive:OR’=0.246,95%CI[0.071~0.848],P’=0.026;Additive:OR’=0.432,95%CI[0.208~0.895],P’=0.024)。SNCA rs894278的GG基因型增加早发型PD幻觉发生的风险(Recessive:OR’=8.281,95%CI[1.217~56.334],P’=0.031)。未发现与PD幻觉迟发型的幻觉风险增加相关的基因多态性。结论在中国人不伴痴呆的PD人群中,GRIN2B rs7301328的GG基因型可能是PD相关幻觉的保护因素。而SNCA rs894278的GG基因型可能是PD患者幻觉早发型的幻觉发生的危险因素。     

Parkin 基因多态性与散发性帕金森病关系的研究

目的探讨Parkin基因S/N 167多态性与散发性帕金森病(PD)的遗传易感性之间的关系.方法以120例散发性PD患者为研究对象,分为早发性PD组和晚发性PD组,120名正常人作为对照.采用聚合酶链式反应(PCR)扩增所需DNA片段,用限制性内切酶酶切技术测定所研究对象的基因型和等位基因.比较各组间基因型及等位基因频率的差异.结果 PD组与对照组S/N 167多态性等位基因频率无显著性差异(P>0.05);早发性PD组S/N 167多态性等位基因频率显著高于对照组和晚发性PD组(均P<0.05).结论Parkin基因S/N 167多态性可能是早发性PD的危险因素,其患PD的危险性较对照组增高1.69倍.     

铁相关基因多态性与帕金森病的关联分析

目的 探讨铁相关基因转铁蛋白(Tf)258 G/S及转铁蛋白受体(TfR)82 S/G多态性与中国华北和西北地区帕金森病(PD)间的关联. 方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法对61例华北地区PD患者(华北PD组)、56例西北地区PD患者(西北PD组)及两地各70名健康对照者之间的Tf258 G/S和TfR 82 S/G的基因型和等位基因分布频率进行检测. 结果 (1)Tf258G/S位点:两PD组的G等位基因和GS基因型均明显高于相应对照组,差异有统计学意义(P＜0.05);而两PD之间、两对照组之间各基因型和等位基因分布差异均无统计学意义(m0.05).(2)TfR 82 S/G位点:两PD组、两对照组之间各基因型和等位基因分布差异均无统计学意义(P＞0.05). 结论 (1)TfG/S位点多态性与华北、西北地区PD的发病可能存在关联,等位基因G、杂合基因型GS增加了PD的易患性.(2)TfR S/G位点多态性与中国华北、西北地区PD患者患病率无关.     

BDNF基因启动子区多态性与散发性阿尔茨海默病的相关性研究

目的研究脑源性神经营养因子(BDNF)基因启动子区单核苷酸多态性与散发性阿尔茨海默病(SAD)发病的相关性。方法随机选取10例正常对照组及10例SAD患者进行BDNF基因启动子区-1～-2812bp测序,针对所发现的启动子区单核苷酸多态性(SNP),利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对328例正常对照者及292例SAD患者进行基因型检测后进行病例-对照关联分析。结果在中国北方汉族人群的BDNF基因启动子区发现1个SNP:-2467G/A(rs908867)。其等位基因及基因型分布在两组间无显著性差异(P值分别为0.10和0.27),经APOEε4分层后它们的分布在两组间也无显著性差异(P>0.05)。结论中国北方汉族人群BDNF基因启动子区的遗传变异可能与SAD发病无关。     

CLTCL1 基因 rs1061325 位点多态性与中国 汉族精神分裂症的关联分析

目的 探讨中国汉族人群网格蛋白重链 1（CLTCL1）基因 rs1061325 多态性与精神分裂症 的相关性。方法 选取 2007— 2008 年在上海交通大学医学院附属精神卫生中心门诊或住院的 662 例 精神分裂症患者作为病例组，选取同期的 414 名健康志愿者作为对照组。采用 TaqMan 探针基因分型技 术对两组的 CLTCL1 基因 rs1061325 位点进行分型，采用阳性与阴性症状量表（PANSS）对病例组进行精 神症状严重程度评定，并分析 PANSS 评分与不同基因型的相关性。结果 病例组与对照组的 rs1061325 等位基因和基因型频率分布比较，差异无统计学意义（χ2 =0.25、0.28，P=0.62、0.87）；在共显性、显性、隐 性、超显性、加性遗传模式下基因型分布差异也无统计学意义（P＞ 0.05），rs1061325 基因型多态性对精 神分裂症患者的发病年龄［（24.15±6.71）岁］、病程［（31.23±9.49）年］和 BMI［（26.46±5.28）kg/m2 ］也均 无明显影响（F=1.15、0.33、0.75，P=0.32、0.72、0.48），rs1061325 基因型多态性与 PANSS 阳性症状分、阴 性症状分、一般精神病理分及 PANSS 总分无相关性（F=1.26、0.37、0.34、0.49，P=0.29、0.69、0.72、0.62）。 结论 在中国汉族人群中，CLTCL1 基因 rs1061325 位点与精神分裂症无关联。     

TPH2基因rs7305115单核苷酸多态性与抑郁症自杀未遂的关联研究

目的探讨色氨酸羟化酶2(TPH2)基因rs7305115单核苷酸多态性与抑郁症自杀未遂的关系。方法选取106例抑郁症自杀未遂者为研究对象,122例抑郁症无自杀行为者为对照。采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)和PCR产物直接测序法,分析TPH2基因rs7305115单核苷酸多态性。结果在TPH2基因rs7305115附近312bp的范围内未发现其他的单核苷酸多态性。抑郁症自杀未遂组与无自杀行为组之间的rs7305115单核苷酸多态性的基因型和等位基因频率差异均有显著性(2=8.018,P=0.018;2=6.090,P=0.014),前者基因型AA与等位基因A低于后者。结论TPH2基因rs7305115单核苷酸多态性与抑郁症自杀未遂存在关联,其可能与抑郁症患者的自杀易感性相关。     

BST1基因rs4698412多态性与新疆地区帕金森病临床特征的相关性研究

目的 探讨BST1基因rs4698412位点多态性与新疆地区帕金森病(PD)的相关性,比较其多态性对PD患者临床症状的影响。方法 应用竞争性等位基因特异性PCR(KASP)技术分析新疆地区192例PD患者和199名健康对照者的BST1基因rs4698412位点多态性。评定PD患者的临床资料和专科评分,比较新疆地区BST1基因rs4698412位点多态性对PD患者临床症状的影响。结果 (1)BST1基因rs4698412位点不同基因型、等位基因型频率在PD组和对照组的分布无统计学意义(均P>0.05)。(2)总体样本中,PD患者中A/G基因型携带者合并痴呆的发生率(22.8%)低于A/A基因型(47.1%)和G/G基因型(41.8%)携带者,差异有统计学意义(P=0.011)。按年龄进行分层,年龄≤69岁的PD患者中A/G基因型携带者合并痴呆的发生率(11.6%)低于A/A基因型(35.7%)和G/G基因型(33.3%)携带者,差异有统计学意义(P=0.038)。按性别进行分层：男性PD患者中,在三种基因型间病程无差异的情况下,G/G基因型携带者的Hoehn-Yahr(H-Y)分级...     

脑源性神经营养因子基因多态性与散发性帕金森病的相关性研究

目的探讨脑源性神经营养因子(Brain-DerivedNeurotrophicFactor,BDNF)基因多态性与散发性帕金森病(SporadicParkinson'sDisease,SPD)的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法对196例健康人和85例SPD患者进行基因分型;利用x2检验统计分析实验数据。结果两组间BDNF基因G196A和C270T多态性位点各基因型和等位基因频率差异均无显著性(P>0.05)。结论BDNF基因多态性与SPD无显著相关性。     

中国汉族人群PARK16基因多态性与帕金森病易患性的关联

目的 探讨PARK16基因单核苷酸多态性(SNP)与帕金森病(PD)易患性的关系,分析其SNP的基因型和等位基因频率及不同基因型的优势比(OR)和其临床特征.方法 采用病例-对照研究选择PD患者226例和362名健康对照,利用TaqMan荧光定量PCR方法检测中国汉族人群中PARKl6基因Rs947211和Rs823128基因多态性,并对不同基因型临床资料进行分析.结果 PARKl6基因的多态性位点Rs947211在PD组基因型频率为∶GG 34.1%(77/226)、AG 46.0%(104/226)、AA 19.9%(45/226),对照组分别为23.8%(86/362)、53.0%(192/362)、23.2%(84/362),2组基因型频率差异具有统计学意义(以野生型GG为参考,AG∶OR=0.57,95%CI 0.38～0.85,P=0.006;AA∶OR=0.55.95%CI,0.34～0.85,P=0.015).以PD组野生型GG为参照,暴露于A等位基因型(AA+AG)的OR=0.56,95%CI0.38～0.82,P=0.003.晚发型PD(LOPD)Rs947211的基因型频率与对照组比较差异亦有统计学意义(AG∶OR=0.46,95%C/0.27～0.78,P=0.004∶AA∶OR=0.35,95%C/0.18～0.68,P=0.002).PD组3种基因型在临床表现上差异没有统计学意义.Rs823128在PD组基因型频率分布与对照组差异无统计学意义(以野生型AA为参照,AG∶OR=1.12,95%CI0.75～1.68,P=0.568;GG∶OR=0.99,95%CI0.35～2.76,P=0.994).结论 中国汉族人群中PARK16基因与PD易患性相关.

Abstract：

Objective To investigate the association between PARK16 gene polymorphism and Parkinson's disease(PD)susceptibility in Chinese Han population.and to analyze its single-nucleotide polymorphism(SNP)genotypes,frequencies and odds ratios(OR)of different genotypes.Methods The association between two SNP loci in PARK16 gene(Rs947211,Rs823128)and PD susceptibility was investigated by TaqMan quantitative polymerase chain reaction(PCR)in 226 PD patients and 362 healthy controls.Allele and genotype frequencies were calculated by the Chi-square test,and the clinical data were also analyzed.Results Three genotypes of Rs947211(GG,AG and AA)account for 34.1%(77/226),46.0%(104/226),19.9%(45/226)in the PD group,and 23.8%(86/362),53.0%(192/362),23.2%(84/362)in the control group,respectively.There was significant difference between two groups (P<0.05).Setting the GG genotype as the reference,OR values of AG and AA genotype were 0.57(95%CI0.38-0.85,P=0.006)and 0.55(95%CI 0.34-0.85,P=0.015),while the OR value for exposure to the A allele(AA+AG)was 0.56(95%CI0.38-0.82,P=0.003).Genotypes of Iate-onset PD were also significantly different from the controls(OR valne of AG=0.46,95%CI 0.27-0.78,P=0.004:OR value of AA=0.35.95%CI 0.18-0.68,P=0.002).And there was no diffefence in clinical features among the 3 genotypes. The frequency of Rs823128, another locus, in PD group was not significantly different from the control group( AA genotype as the reference, OR value of AG was 1. 12, 95% CI 0. 75-1.68, P = 0.568; OR value of GG was 0.99, 95% CI 0.35-2.76, P = 0.994). Conclusion Polymorphism of PARK 16 locus Rs947211 is associated with PD patients in Chinese Han population.     

S100B基因rs9722多态性与抑郁症的关联分析

目的 探讨星形胶质源性蛋白(S100B)基因与汉族人群抑郁症的关联.方法 采用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性方法检测152例抑郁症患者和150名正常对照S100B基因rs9722多态性,比较两组间该基因多态性基因型和等位基因频率的差异.结果 ①与对照组相比,患者组rs9722多态性的基因型和等位基因的频率差异无统计学意义(P＞0.05);把抑郁症按照早发/晚发、首发/复发分层后,早发、晚发型抑郁症患者间的基因型分布差异存在统计学意义(X2=11.01,P=0.004);首发、复发型抑郁症患者间的基因型分布差异有统计学意义(X2=8.128,P=0.017);但上述不同类型的抑郁症组分别与正常对照组相比,均未发现基因型分布差异有统计学意义(P＞0.05).②首次发作年龄在三种基因型患者组之间的差异有统计学意义(F=3.714,P=0.027).结论 S100B基因rs9722C/T多态性可能与中国汉族抑郁症的发病无关联,但与抑郁发作年龄可能关联.     

儿茶酚胺氧甲基转移酶基因rs4680位点多态性与强迫症的关联研究

目的:探讨儿茶酚胺氧甲基转移酶(COMT)基因多态性(rs4680)与强迫症的关联性。方法:以山东汉族人群中的400例强迫症患者和459名健康对照者为研究对象,按性别、发病年龄分层,采用MassARRAY飞行时间质谱(MALDI-TOF)技术对COMT基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs4680进行基因分型,比较各组等位基因、基因型频率。结果:COMT rs4680位点等位基因和基因型频率在强迫症组和对照组分布差异无统计学意义(P 0. 05)。按性别、发病年龄分层后,各强迫症组和对照组该位点等位基因和基因型频率分布差异也无统计学意义(P 0. 05)。结论:COMT基因多态性(rs4680)与强迫症可能不存在关联。     

5-羟色胺转运体基因第二内含子多态性与强迫症的关联分析

目的　探索上海地区汉族人口中 5 羟色胺转运体 ( 5 HTT)基因第二内含子多态性与强迫症的关系。方法　采用聚合酶链反应扩增片段长度多态 (PCR AmFLP)技术测定 10 2例强迫症 (OCD)患者和 110名健康对照的基因型。结果　强迫症患者 5 HTT第二内含子基因型与等位基因分布与健康对照之间均存在显著性差异 (P <0 0 5 ) ;等位基因 10和 12 / 10基因型与强迫症存在显著正关联 (OR值分别为 2 4 5和 2 4 2 ,P <0 0 5 )。结论　汉族人群中 5 HTT基因第二内含子多态性与强迫症的发病可能有遗传关联 ,等位基因 10和 12 / 10基因型可能是强迫症的风险因子     

RAB7L1基因启动子多态性与中国西南地区汉族帕金森病的关联

目的：探讨RAB7L1基因启动子区位点rs1572931的多态性与中国西南地区汉族帕金森病（PD ）的关联。方法收集2010年10月～2014年12月于川北医学院就诊的243例PD患者（PD组）和455名年龄匹配、无PD的健康体检者（对照组）,运用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（PCR －RFLP）方法进行基因分型,探讨RAB7L1基因 rs1572931位点的单核苷酸多态性（SNP）与中国西南地区汉族PD的关系。结果 rs1572931的 T 等位基因频率在 PD 组和对照组中分别为27．98％和34．18％,差异有统计学意义（ P＝0．019,OR＝0．748,95％ C I＝0．588～0．952）;T T基因型频率在PD组和对照组中分别为4．94％与10．99％,差异有统计学意义（ P＝0．008,OR＝0．421,95％ C I＝0．220～0．806）。结论 RAB7L1基因 rs1572931位点的 T T基因型可能在中国西南汉族人群 PD的发生中起保护作用。     

脑啡肽酶基因多态性与散发性阿尔茨海默病的关系研究

目的探讨脑啡肽酶(neprilysin,NEP)基因单核苷酸多态性与中国北方汉族散发性阿尔茨海默病(sporadic Alzheimer’s disease,SAD)的关系。方法临床确诊的99例中国北方汉族SAD患者及109例正常对照,提取外周血基因组DNA,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性结合DNA直接测序法确定NEP基因rs989692位点及rs6776185位点基因型,分析上述两个位点单核苷酸多态性与AD的关系。结果 AD组和正常对照组NEP基因rs989692位点各等位基因频率及基因型分布无显著性差异(P>0.05);AD组NEP基因rs6776185位点A等位基因频率显著高于正常对照组(88.9%vs 81.2%,P=0.029),AA基因型频率显著高于正常对照组(80.8%vs 67.0%,P=0.024);携带A等位基因者,发生AD的风险是不携带A等位基因者的1.85倍(OR=1.85,95%CI 1.07~3.20);经载脂蛋白E基因(apolipoprotein E,Apo E)ε4等位基因及年龄分层比较,携带ε4基因及年龄<75岁组,AD组A等位基因及AA基因型分布频率仍明显高于正常对照组(P<0.05)。结论 NEP基因rs6776185位点A等位基因和AA基因型可能是中国北方汉族人群SAD的危险因素,可使AD发病年龄提前,并与Apo Eε4等位基因可能具有协同作用。     

NOS1AP基因rs348624多态性与中国汉族早发性精神分裂症的关联分析

目的:探讨中国汉族人群一氧化氮合酶1接头蛋白(NOS1AP)基因rs348624多态性与早发性精神分裂症的易感性及其首发年龄的关联性。方法:选取285例早发性精神分裂症患者为研究组和826名正常对照组,采用Taq Man法,检测NOS1AP基因rs348624位点多态性,并分析研究组危险等位基因的频率与首发年龄的关联性。结果:研究组与对照组rs348624等位基因和基因型频率分布比较差异有统计学意义[χ2=149.17,自由度(df)=1,P=0.00;χ2=137.25,自由度(df)=2,P=0.00];Kaplan-Meier分析显示,rs348624等位基因T的频率与早发性精神分裂症首发年龄显著相关(Kaplan-Meier log rank检验P=0.00)。结论:在中国汉族人群中NOS1AP基因与早发性精神分裂症存在关联,其rs348624多态性可能是导致早发性精神分裂症患者发病年龄提前的重要因素。