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1.
目的 建立一种REDE-DHPLC检测外周血肿瘤游离核酸EGFR、KRAS基因突变的方法,并探讨其临床应用价值.方法 采用限制性内切酶Mse Ⅰ、Msc Ⅰ、BstN Ⅰ和BglⅠ分别切断EGFR基因第19、21号外显子和KRAS基因第12、13号密码子的野生型片段以富集突变片段,建立检测血浆EGFR和KRAS基因突变的REDE-DHPLC法,并采用50%、10%、5%、1%和0.1%稀释度的质粒标准品评价REDE-DHPLC法和传统DHPLC法的检测灵敏度.然后,采用REDE-DHPLC法检测120例NSCLC和120例结直肠癌患者血浆和石蜡组织标本中的EGFR和KRAS基因突变.同时,用传统DHPLC法和测序法进行平行检测,以评价REDE-DHPLC法检测NSCLC和结直肠癌患者血浆中2个基因突变的诊断效能.结果 REDE-DHPLC法对EGFR和KRAS基因4个突变位点检测的灵敏度均达0.1%,传统DHPLC法检测灵敏度均为1.0%,REDE-DHPLC法对含0.1%突变的质粒标准品重复2~3次检测均为阳性.REDE-DHPLC法、传统DHPLC法和测序法检测120例NSCLC患者血浆EGFR基因总突变率分别为27.5%、16.7%和12.5%,检测120例结直肠癌患者血浆KRAS基因总突变率分别为38.3%、25.8%和16.7%.REDE-DHPLC法检测EGFR和KRAS基因总突变率均高于传统DHPLC法(x2值分别为4.092、4.301,P均<0.05)和测序法(x2值分别为8.438、14.127,P均<0.05);将REDE-DHPLC法检测EGFR和KRAS基因突变与传统DHPLC法相比,敏感度均为100%(20/20,31/31),特异度分别为87.0%(87/100)和83.2%(74/89);与测序法相比,敏感度均为100%(15/15,20/20),特异度分别为82.9%(87/105)和74.0%(74/100).REDE-DHPLC法与传统DHPLC法检测EGFR、KRAS基因突变的符合率分别为89.2%(107/120,Kappa=0.690,P<0.05)和87.5%(105/120,Kappa=0.718,P<0.05).REDE-DHPLC检测血浆与组织标本中EGFR和KRAS基因总突变符合率分别为91.7%(33/36,Kappa=0.939,P<0.05)和90.2%(46/51,Kappa=0.914,P<0.05).结论 REDE-DHPLC法灵敏度和特异性高,结果易判读,且可有效避免纯合点突变漏检,有望成为临床实验室外周血EGFR和KRAS基因突变检测的推广方法.
Abstract:
Objective To establish a REDE-DHPLC method for detecting the EGFR and KRAS mutations in plasma DNA from tumor patients, and investigate its clinical significance. Methods Restriction endonucleases Mse Ⅰ , Msc Ⅰ , BstN Ⅰ and Bgl Ⅰ were used to digest the wild type fragments of exon 19,exon 21 of EGFR gene and coden 12, 13 of KRAS gene for enriching the mutation fragments, and REDE-DHPLC method was established to detect EGFR and KRAS mutations. The sensitivities of REDE-DHPLC and conventional DHPLC were analyzed by using a series of plasmids containing 50%, 10%, 5%, 1% and 0. 1% mutation genes. Then, Plasma samples and paraffin-embedded tissue samples of 120 NSCLC patients and 120 colorectal cancer patients were detected by REDE-DHPLC. Compared with conventional DHPLC and sequencing, the diagnostic efficiency of REDE-DHPLC method was evaluated by detecting the mutation status of 2 genes in plasma of NSCLC and colorectal cancer patients. Results The sensitivity values of REDE-DHPLC and conventional DHPLC for detecting mutations in 4 loci were 0. 1% and 1%respectively. Plasmid DNA containing 0.1% mutation gene was detected to be positive continually for 2 to 3 times by REDE-DHPLC. EGFR mutation rates of 120 plasma from NSCLC patients detected by REDE-DHPLC, conventional DHPLC and sequencing methods were 27. 5%, 16. 7% and 12.5% respectively, and KRAS mutation rates of 120 plasma from colorectal cancer patients were 38. 3%, 25. 8% and 16. 7%,respectively. The positive rates of EGFR and KRAS mutation detected by REDE-DHPLC were significantly higher than conventional DHPLC(x2 = 4. 092, 4. 301, all P < 0. 05 ) and sequencing method (x2= 8. 438,14. 127,all P < 0. 05 ). In comparison with conventional DHPLC, the sensitivities of REDE-DHPLC for detecting EGFR and KRAS mutation were 100% (20/20,31/31), the specificities were 87. 0% (87/100)and 83. 2% (74/89). In comparison with sequencing method, the sensitivities of REDE-DHPLC were 100%( 15/15,20/20), the specificities were 82.9% (87/105)and 74. 0% (74/100). The coincidence rate of the two methods for detecting EGFR and KRAS mutation were 89. 2% ( 107/120, Kappa = 0. 690, P < 0. 05 ) and 87.5% ( 105/120, Kappa= 0. 718, P < 0. 05 ). The Consistency of EGFR and KRAS mutation status in plasma and tissues detected by REDE-DHPLC were 91.7% (33/36, Kappa =0. 939,P <0. 05)and 90. 2 %(46/51, Kappa = 0. 914, P < 0. 05 ), respectively. Conclusions The REDE-DHPLC method is highly sensitive and specific for detecting EGFR and KRAS mutations in plasma DNA from tumor patients. The results are easy to be interpreted without missing homozygous point mutation, which indicate that the detection of EGFR and KRAS mutations in plasma DNA by REDE-DHPLC could therefore extend to be usedin clinical laboratory.  相似文献   

2.
Objective To establish a REDE-DHPLC method for detecting the EGFR and KRAS mutations in plasma DNA from tumor patients, and investigate its clinical significance. Methods Restriction endonucleases Mse Ⅰ , Msc Ⅰ , BstN Ⅰ and Bgl Ⅰ were used to digest the wild type fragments of exon 19,exon 21 of EGFR gene and coden 12, 13 of KRAS gene for enriching the mutation fragments, and REDE-DHPLC method was established to detect EGFR and KRAS mutations. The sensitivities of REDE-DHPLC and conventional DHPLC were analyzed by using a series of plasmids containing 50%, 10%, 5%, 1% and 0. 1% mutation genes. Then, Plasma samples and paraffin-embedded tissue samples of 120 NSCLC patients and 120 colorectal cancer patients were detected by REDE-DHPLC. Compared with conventional DHPLC and sequencing, the diagnostic efficiency of REDE-DHPLC method was evaluated by detecting the mutation status of 2 genes in plasma of NSCLC and colorectal cancer patients. Results The sensitivity values of REDE-DHPLC and conventional DHPLC for detecting mutations in 4 loci were 0. 1% and 1%respectively. Plasmid DNA containing 0.1% mutation gene was detected to be positive continually for 2 to 3 times by REDE-DHPLC. EGFR mutation rates of 120 plasma from NSCLC patients detected by REDE-DHPLC, conventional DHPLC and sequencing methods were 27. 5%, 16. 7% and 12.5% respectively, and KRAS mutation rates of 120 plasma from colorectal cancer patients were 38. 3%, 25. 8% and 16. 7%,respectively. The positive rates of EGFR and KRAS mutation detected by REDE-DHPLC were significantly higher than conventional DHPLC(x2 = 4. 092, 4. 301, all P < 0. 05 ) and sequencing method (x2= 8. 438,14. 127,all P < 0. 05 ). In comparison with conventional DHPLC, the sensitivities of REDE-DHPLC for detecting EGFR and KRAS mutation were 100% (20/20,31/31), the specificities were 87. 0% (87/100)and 83. 2% (74/89). In comparison with sequencing method, the sensitivities of REDE-DHPLC were 100%( 15/15,20/20), the specificities were 82.9% (87/105)and 74. 0% (74/100). The coincidence rate of the two methods for detecting EGFR and KRAS mutation were 89. 2% ( 107/120, Kappa = 0. 690, P < 0. 05 ) and 87.5% ( 105/120, Kappa= 0. 718, P < 0. 05 ). The Consistency of EGFR and KRAS mutation status in plasma and tissues detected by REDE-DHPLC were 91.7% (33/36, Kappa =0. 939,P <0. 05)and 90. 2 %(46/51, Kappa = 0. 914, P < 0. 05 ), respectively. Conclusions The REDE-DHPLC method is highly sensitive and specific for detecting EGFR and KRAS mutations in plasma DNA from tumor patients. The results are easy to be interpreted without missing homozygous point mutation, which indicate that the detection of EGFR and KRAS mutations in plasma DNA by REDE-DHPLC could therefore extend to be usedin clinical laboratory.  相似文献   

3.
目的:完善华南地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)和KRAS基因突变谱,探讨其与临床表型的关系。方法:直接测序法对172例NSCLC患者肿瘤组织DNA的EGFR 18-21外显子和KRAS 2号外显子进行突变鉴定并分析。结果:EGFR和KRAS在本群体中突变率分别为32%(55/172)和8.1%(14/172),其中热点突变为EGFR 19号外显子缺失,21号外显子L858R和KRAS 12位密码子点突变。女性、无吸烟史患者与男性、吸烟者相比,EGFR突变率显著增高,而KRAS突变率显著降低。腺癌患者EGFR突变率显著高于非腺癌患者,KRAS突变则无显著差别。结论:华南地区人群EGFR具有丰富的突变谱。完善该地区的突变数据库,确证各种突变对TKI的治疗敏感性的影响,对靶向治疗在NSCLC患者中更深入、广泛开展具有重要的指导作用。  相似文献   

4.
目的 KRAS基因突变可能导致非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)治疗的耐药。本研究旨在探讨外周血检测KRAS基因的可行性,以及对EGFR-TKIs治疗的疗效预测价值。方法应用实时荧光定量PCR(FQ-PCR)法检测120例NSCLC患者外周血标本和97例肿瘤组织标本KRAS基因突变情况,其中70例外周血标本和肿瘤组织相匹配。全组共55例接受EGFR-TKIs治疗,52例可评价疗效。比较外周血和组织标本突变一致性,分析KRAS基因突变和患者临床特征相关性。结果外周血标本中检测出14例突变(11.7%),组织中11例(11.3%),两种标本一致性为75.0%。接受EGFR-TKIs治疗患者中,外周血标本35例,其中检测KRAS突变者2例,疗效评价均为疾病进展(PD);未突变者33例,客观缓解率(ORR)27.3%,疾病控制率(DCR)57.6%。组织标本45例,其中检测KRAS突变者4例,疗效评价均为PD;未突变者41例,ORR26.8%,DCR56.1%。结论 NSCLC患者外周血和肿瘤组织中KRAS基因突变一致性较高,组织中检测KRAS基因突变和EGFR-TKIs...  相似文献   

5.
表皮生长因子受体(EGFR)是酪氨酸激酶活性的受体,由配体激活后,调解上皮细胞的生长分化。近年来研究发现有62%的非小细胞肺癌患者存在EGFR高表达和异常激活。针对EG—FR突变研发的靶向治疗药物——吉非替尼、埃罗替尼已通过美国FDA验证用于临床,但是存在不同程度的耐药。可见,决定非小细胞肺癌(NSCLC)对酪氨酸激酶受体抑制剂(TKI)——Gefitinib,Erlotinib敏感性的突变基因不仅仅只有EGFR基因,其存在复杂的基因突变谱。本文就目前对NSCLC基因突变类型与靶向治疗的研究进展作一综述。  相似文献   

6.
目的检测非小细胞肺癌患者外周血游离DNA中表皮生长因子受体(EGFR)基因19和21外显子的突变情况,并与相应的肿瘤组织检测结果进行比较,探讨非小细胞肺癌患者应用外周血游离DNA检测EGFR突变的临床意义。方法应用实时荧光聚合酶链反应(PCR)技术检测32例非小细胞肺癌患者术后肿瘤组织和术前外周血游离DNA中EGFR基因19和21外显子的突变,所有扩增标本均经基因测序法验证。结果 32份外周血标本中,共检测到13份EGFR基因突变,突变率达40.6%,肿瘤组织中有16份EGFR基因突变,突变率达50.0%,外周血和肿瘤组织EGFR基因同时突变的有13份,两者突变一致性达到81.2%,两者间差异无统计学意义(P0.05)。结论外周血游离DNA代替肿瘤组织进行EGFR基因突变检测具有可行性,为无法取得肿瘤组织的非小细胞肺癌患者提供一种更快捷、简便的EGFR基因突变检测方法,其检测结果可为临床选择靶向药物治疗提供依据。  相似文献   

7.
目的:建立突变体富集法检测非小细胞肺癌中表皮生长因子受体(EGFR)基因19外显子的缺失突变,并比较突变体富集法与直接法的检出率.方法:构建EGFR野生型和突变型的载体,按不同的比例配成混合液.分别用突变体富集法和直接测序法检测混合液中EGFRl9外显子的缺失突变,确定两种方法的灵敏度.收集198例非小细胞肺癌住院患者的手术切除组织,分别采用两种方法对EGFR基因19外显子进行基因分析.结果:直接测序法可检测出1:10突变质粒和野生型质粒混合液中的突变型,突变体富集法可迭1:100.198例标本中,直接测序法检出杂合性缺失23例,突变率为11.6%,突变体富集法检测出杂舍性缺失4l例,突变率为20.7%.EGFR19缺失突变多见于女性,病理类型多为肺腺癌和腺鳞癌.结论:突变体富集法检测EGFR19外显子缺失突变敏感性高,可提高样本EGFRl9缺失突变的检出率.  相似文献   

8.
表皮生长因子受体(EGFR)是酪氨酸激酶活性的受体,由配体激活后,调解上皮细胞的生长分化.近年来研究发现有62%的非小细胞肺癌患者存在EGFR高表达和异常激活.针对EG-FR突变研发的靶向治疗药物--吉非替尼、埃罗替尼已通过美国FDA验证用于临床,但是存在不同程度的耐药.可见,决定非小细胞肺癌(NSCLC)对酪氨酸激酶受体抑制剂(TKI)--Gefitinib,Er-lotinib敏感性的突变基因不仅仅只有EGFlR基因,其存在复杂的基因突变谱.本文就目前对NSCLC基因突变类型与靶向治疗的研究进展作一综述.  相似文献   

9.
目的分析宁夏某医院非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因突变检测结果。方法选择2014年1月至2017年12月在宁夏医科大学总医院住院的NSCLC患者225例进行回顾性分析,用扩增阻滞突变系统-聚合酶链反应(ARMS-PCR)检测EGFR基因突变情况。结果 EGFR基因总突变率50.22%(113/225),最常见突变位点为19外显子19-del及21外显子L858R,突变率分别为21.33%及17.78%,20外显子T790M耐药突变率及20-Ins插入突变(非敏感突变)的突变率分别为3.56%及1.33%;EGFR各外显子双突变共10例;EGFR基因突变率在性别、年龄、民族、季节、标本类型之间差异无统计学意义(P>0.05),在年份、病理类型之间差异有统计学意义(P<0.05)。结论 ARMS-PCR可有效应用于临床病理石蜡标本基因突变检测,EGFR基因在19和21外显子存在较高的突变率,其突变亚型能指导小分子表皮生长因子酪氨酸酶抑制剂(EGFR-TKI)的肿瘤靶向治疗。  相似文献   

10.
目的探讨循环肿瘤DNA(ctDNA)在晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)突变检测中的应用价值。方法检索PubMed、Embase、Medline、万方数据库、中国知网数据库、中国生物医学文献数据库、维普数据库,纳入报道了ctDNA检测晚期NSCLC患者EGFR突变灵敏度与特异度的文献;采用合并灵敏度、特异度、似然比点状图、集成受试者工作特征(SROC)曲线及曲线下面积(AUC)评估ctDNA诊断价值。结果共纳入28篇文献,包括3 644例晚期NSCLC患者,合并后的灵敏度、特异度分别为64.0%(95%CI:0.59~0.70)、98.0%(95%CI:0.95~0.99)。SROC曲线下面积为0.85(95%CI:0.82~0.88),表明ctDNA有较高的诊断价值。结论对于晚期NSCLC患者EGFR突变的检测,ctDNA是一个高特异性及高诊断价值的生物标志物,ctDNA基因检测将是晚期NSCLC患者个体化靶向治疗的重要组成部分。  相似文献   

11.
目的探讨表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)与食管癌临床病理特征及预后的关系。方法采用免疫组织化学法检测92份食管癌组织,26份Ⅰ度不典型增生组织,17份Ⅱ/Ⅲ度不典型增生组织,89份正常食管黏膜组织(正常组)的EGFR表达情况,并分析EGFR与临床组织病理特征及预后的关系。结果正常组、Ⅰ度不典型增生组、Ⅱ/Ⅲ度不典型增生组、食管癌组中EGFR过表达率分别为0(0/89),19.23%(5/26),58.82%(10/17),69.57%(64/92);EGFR过表达在不同浸润深度,是否伴淋巴结转移上差异均有统计学意义(P<0.05);EGFR过表达阳性组与阴性组生存曲线差异有统计学意义(P<0.05)。结论 EGFR过表达与食管癌发生、发展及预后密切相关。  相似文献   

12.
目的探讨青海地区非小细胞肺癌(NSCLC)治疗过程中表皮生长因子受体(EGFR)突变状态。方法利用实时荧光Taqman探针法,采用PCR体外扩增,回顾性分析150例晚期NSCLC患者的临床特征、EGFR突变状态。结果 150例NSCLC患者标本检测发现EGFR(exon18)突变2例,突变率1.3%;EGFR(exon19)突变18例,突变率12.0%;EGFR(exon20)未检测出;EGFR(exon21)突变27例,突变率18.0%。结论青海地区NSCLC患者EGFR基因外显子19和21的突变(体细胞突变)率较高,可接受EGFR-TKIs治疗。  相似文献   

13.
目的研究非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因突变与血清癌胚抗原(CEA)、糖类抗原(CA125、CA199)的关系,研究其对靶向治疗的价值。方法选择非小细胞肺癌患者193例,术前行血清CEA、CA125、CA199检测作为备用数据,术后对标本行EGFR检测,分析CEA、CA125、CA199与EGFR基因突变的关系及临床意义。结果全组患者中发生EGFR基因突变者共83例,基因突变率为43.0%;EGFR基因突变在女性、非吸烟及腺癌患者多见(P0.05);EGFR基因突变与CEA值呈正相关(P0.05);EGFR与CA125、CA199无相关性(P0.05)。结论非小细胞肺癌EGFR基因突变在女性、非吸烟及腺癌患者中多见,其突变与血清CEA水平升高有关。  相似文献   

14.
目的采用液滴式数字PCR(ddPCR)法检测晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者外周血循环肿瘤DNA(ctDNA)EGFR基因突变的情况,探讨试剂盒的性能、检测结果的可靠性和准确性以及ddPCR法在外周血ctDNA中的应用价值。方法使用标准突变比例的模拟cfDNA样本ddPCR法对试剂检测限、准确性、特异性、精密度、抗干扰能力等指标进行分析及评价;使用ddPCR法检测262例NSCLC患者外周血ctDNA,随机选取30例样本同时进行Super-ARMS法检测,并从方法学标准化和检测结果准确性两方面进行统计学分析。结果检测试剂在检测限以上的准确性、特异性均为100%,定量精密度(突变比例对数的绝对值变异系数CV)5%,关键环节质量控制各主要参数的相关性和线性关系均符合要求;Super-ARMS和ddPCR法同步检测30例NSCLC患者外周血ctDNA的结果具有较好的一致性(Kappa=0.783,P=0.000)。结论 ddPCR法灵敏度高,可绝对定量,是血液检测的有效的方法,但其在检测过程中存在较多对检测结果产生影响的环节,故而检测方法标准化至关重要。  相似文献   

15.
目的 检测大肠癌(CRC)患者外周血循环肿瘤细胞(CTCs)数,探讨其临床意义.方法 58例CRC患者术前静脉采血,使用多重聚合酶链式反应(PCR)结合荧光定量PCR(RTFQ PCR)方法检测外周血细胞角蛋白20(CK20)及癌胚抗原(CEA) mRNA表达,比较CTCs细胞阳性率与临床病理参数的关系.结果 58例CRC患者外周血中CK20及CEAmRNA表达的阳性率为93.1%.CTCs的阳性检出率与Ducke's分期及淋巴结转移相关(P<0.05).结论 多重RTFQ PCR方法可应用于CRC患者外周血中CTCs检测,对预后判断有着重要的临床意义.  相似文献   

16.
目的探讨新疆维吾尔族非小细胞肺癌(NSCLC)患者组织中表皮生长因子受体(EGFR)及KRAS基因突变与临床病理特征的关系。方法应用探针扩增阻滞突变系统(ARMS)检测50例NSCLC组织中EGFR基因第18、19、20和21外显子及KRAS基因12、13密码子上7种热点体细胞的突变情况,分析EGFR及KRAS基因突变与维吾尔族NSCLC患者临床病理特征之间的相关性。结果50例标本中,EGFR总检出率为12.0%,其中4例为19外显子缺失突变,2例为21外显子L858R点突变;KRAS总检出率为10%,均位于12密码子Glyl2Ala突变;无1例发生EGFR与KRAS同时突变。腺癌、鳞癌、大细胞癌EGFR及KRAS基因突变检出率分别为27.8%、3.5%、0%和22.2%、3.5%、0%。腺癌患者EGFR基因突变率(27.8%)明显高于非腺癌者(3.1%),差异有统计学意义。腺癌与非腺癌患者KRAS基因突变比较,差异有统计学意义。维吾尔族患者EGFR及KRAS基因突变与年龄、性别、吸烟状况、TNM分期及ECOG评分均无关。结论与汉族人群相比,新疆维吾尔族NSCLC患者EGFR突变率较低,KRAS突变率较高,类似于欧美高加索人群的突变特点。  相似文献   

17.
血液中微粒是由血液细胞、血管内皮细胞在受到刺激活化后形成的,能直接而特异地反映其来源细胞的功能状态,为揭示血液或血管性疾病的发病机制、发展趋势提供依据,也可作为鉴别诊断、临床疗效的指征之一,因而检测血液中微粒具有重要意义。本文就已有的一些检测方法及其与临床疾病的相关性进行阐述,以期为深入研究提供基础与策略。[编者按]  相似文献   

18.
目的 探讨乳腺癌患者外周血乳腺小粘蛋白(SBEM)及人乳腺珠蛋白(hMAM)的表达及临床意义.方法 采用酶联免疫吸附试验(ELISA)定量检测68例乳腺癌患者及20例乳腺纤维腺瘤患者及20例健康志愿者术前血清SBEM和hMAM的水平.结果 乳腺癌组术前血清SBEM和hMAM水平均高于纤维腺瘤组和健康对照组(P均<0.01).有淋巴结转移的乳腺癌患者血清中SBEM和hMAM水平明显高于无淋巴结转移者,差异均有统计学意义(P均<0.05).Ⅲ期患者血清SBEM和hMAM水平显著高于Ⅰ+Ⅱ期患者(P均小于0.01).结论 SBEM及hMAM特异性表达于乳腺癌外周血,有可能作为检测乳腺癌外周血微转移的标志物,有望成为判断乳腺癌患者病情发展和预后的新指标.  相似文献   

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