扩增大肝型磷酸果糖激酶基因对唐氏综合征进行定量基因诊断的研究

目的：扩增位于唐氏综合征关键区域的大肝型磷酸果糖激酶基因（PFKL基因），对唐氏综合征进行定量基因诊断，方法：采用定量PCR－微孔板杂交检测PCR产物量的方法，对26例唐氏综合征患者及278例正常人外周血DNA标本，扩增PFKL基因，扩增片段长度为185bp；另外，将人肌型磷酸糖激酶基因（PFKM基因）作为内参照同时扩增，扩增片段长度为365bp，定量PCR产物用微孔板杂交检测。结果：26例患者（包括1例易位型）PFKM与PFKL扩增产物的OD值比值介于0．40－0．60之间，平均值为0．51；正常人扩增产物的OD值比值介于0．80－1．20之间，平均值为1．12，两者比较差异显著（P＜0．001）。对278例正常人进行同样基因扩增和检测无一例假阳性，所得结果与染色体核型分析结果完全符合。结论：定量PCR－微孔板杂交检测PFKL基因拷贝数的方法，简便，快速，特异，可用于唐氏综合征基因诊断。     

定量荧光PCR在唐氏综合征快速产前诊断中的应用研究

目的 :了解中国人 D2 1 S1 1、D2 1 S1 2 70、D2 1 S2 2 6、D2 1 S1 41 1四个短串联重复序列 ( STR)位点的多态性信息含量 ( PIC) ,建立定量荧光 PCR快速产前诊断唐氏综合征的方法。方法 :以染色体2 1 q2 1～ q2 2 .3区段内四个短串联重复序列作为遗传标记 ,采用定量荧光 PCR对 5 0例正常人外周血 DNA进行分析 ,计算中国人该四对 STR位标的多态性信息含量 ( PIC) ,并用该方法对 1 1例正常孕妇羊水 DNA进行分析 ,及对唐氏综合征血清生化指标筛查阳性孕妇羊水标本进行产前诊断。结果 :D2 1 S1 1、D2 1 S1 2 70、D2 1 S2 2 6、D2 1 S1 41 1的多态性信息含量分别是 0 .90 2、0 .889、0 .5 2 1、0 .775 ,建立了定量荧光 PCR产前诊断唐氏综合征的方法。应用该技术产前诊断出 3例唐氏综合征患儿 ,并经染色体核型分析所证实。结论 :以上四对 STR在中国人中均具有较高多态性信息含量 ,可应用于唐氏综合征的定量荧光 PCR产前诊断技术中     

RhD血型的基因诊断及临床应用

目的 :建立RhD血型基因诊断的方法并对胎儿RhD血型进行产前诊断。方法 :采用PCR方法 ,对 4 89例供血者 (其中Rh-2 3例 ,Rh+ 4 6 6例 )外周血标本和 2 7例胎儿羊水 /脐血标本进行RhD基因外显子 10及外显子 7特异性片段的扩增。结果 :凡扩增出 136bp一条特异性片段者判断为Rh-;扩增出 136bp和 186bp两条特异性片段者判断为Rh+ 。 2 3例Rh-供血者有 2 2例扩增出 136bp特异性片段 ,4 6 6例Rh+ 供血者均同时扩增出 136bp和 186bp特异性片段 ,该方法的灵敏度为 10 0 % ,特异度为 95 6 5 % ,假阳性率为 4 .35 %。 2 7例胎儿羊水 /脐血标本的扩增结果 ,1例Rh-,2 6例Rh+ 。结论 :PCR方法检测RhD基因型简便、快速 ,且和血清学检测结果吻合率高 ,可用于胎儿RhD血型的产前诊断。     

唐氏综合征的产前诊断分子技术研究进展

唐氏综合征是人类常见的染色体疾病,经典的细胞遗传学方法是诊断唐氏综合征的金标准,但其局限性不适合大规模的产前诊断.随着分子细胞遗传学技术发展,荧光原位杂交技术(FISH)、定量荧光PCR(QF-PCR)、微阵列-比较基因组杂交(Array CGH)、多重连接探针扩增技术(MLPA)、引物原位标记技术(PRINS)等被用于唐氏综合征快速产前诊断,各种方法各有优劣,改进后会大力推进唐氏综合征的产前诊断速度和准确性.     

实时荧光定量聚合酶链反应技术在产前诊断唐氏综合征中的应用

目的探讨实时荧光定量PCR技术用于产前诊断唐氏综合征的可行性。方法采用实时荧光定量PCR法,分别检测85例唐氏综合征高风险的中期妊娠妇女的羊水和7例智残儿外周血标本中,21号染色体上特异区域基因片段(DSCR3)和管家基因片段(GAPDH),并计算两者的比值。同时采用细胞遗传学方法分析其染色体核型。结果80例羊水细胞DNA检测DSCR3／GAPDH比值在0．46—1．30之间,染色体核型全部正常;而另5例羊水细胞和7例智残儿外周血DSCR,／GAPDH比值明显升高,达1．64～1．98,染色体核型均为21三体。5例中有3例核型为47,XY, 21;1例核型为47,XX, 21;另1例为易位型[46,XY,-15, t(15;21)]。7例智残儿中4例为47,XY 21;3例为47,XX 21。结论实时荧光定量PCR技术可作为产前快速准确诊断唐氏综合征的有效方法。     

先天性软骨发育不全的产前快速基因诊断

目的 探讨先天性软骨发育不全(ACH)的产前快速基因诊断方法.方法 选择2007年5～11月南京大学医学院附属鼓楼医院妇产科产前诊断中心收治的3个ACH家系:其中家系1为年龄6个月的ACH患儿;家系2为妊娠18周的孕妇,待采集胎儿羊水细胞进行产前诊断;家系3为孕39周经超声诊断为ACH的胎儿,待采集脐带血进行诊断.同时采用限制性内切酶(Sfc Ⅰ和MspⅠ)酶切、变性高效液相色谱(DHPLC)分析及序列分析3种检测方法,对外周静脉血或脐血中的成纤维细胞生长因子受体3(FGFR3)基因进行突变检测.结果 (1)DHPLC分析:家系1患者的色谱分析结果为异源双链杂合峰,家系2患者和胎儿的结果均为异源双峰,家系3胎儿的结果为异源双峰,正常对照的结果为同源单峰.(2)FGFR3基因10号外显子PCR产物酶切前的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果:家系1患者、家系2患者及胎儿的PCR产物经Sfc Ⅰ酶切后除有247 bp条带外,还产生162和85 bp两个酶切产物条带,但不能被Msp Ⅰ酶切,且只有247 bp 1条产物条带.家系3胎儿PCR产物不能被Sfc Ⅰ酶切,但经Msp Ⅰ酶切后可出现162和85 bp两个产物条带.正常对照PCR产物均不能被SfcⅠ和Msp Ⅰ酶切.(3)PCR产物测序结果:家系1患者PCR产物经测序发现FGFR3基因1138G→A杂合子突变,家系2患者及胎儿也均为FGFR3基因1138 G→A杂合子突变,家系3胎儿为FGFR3基因1138 G→C杂合子突变,正常对照在FGFR3基因1138位点为G纯合子.家系2胎儿以上各项检测结果均与家系2患者相同,是遗传母亲致病突变基因的结果.结论 DHPLC和限制性内切酶酶切分析均能准确检测致病突变的FGFR3基因,但DHPLC技术操作方便快捷、准确,而且敏感性更高,可在临床上推广用于ACH的产前快速基因诊断.     

不同扩增方法和探针长度对植入前单个卵裂球比较基因组杂交检测结果的影响

目的 探讨不同扩增方法和探针长度对植入前单个卵裂球比较基因组杂交(comparative genomic hybridization,CGH)检测结果的影响,为植入前产前诊断奠定基础.方法 随机将20枚植入前6～8细胞期胚胎卵裂球分为A和B组(各10枚),取1名正常男性外周血20枚淋巴细胞,分为C和D组(各10枚)作为对照.A和C组经简并寡聚核苷酸聚合酶链反应(degenerate oligonucleotide primed polymerase chain reaction,DOP-PCR)、B和D组经多重置换扩增(multiple displacement amplification,MDA)分别进行全基因组扩增(whole genome amplification,WGA),用上述全基因组扩增产物进行PCR扩增TBX1基因2号外显子,验证其特异性.将获得的WGA产物制备成250～750 bp和750～2000 bp 2种不同长度的探针与正常男性中期染色体核型进行杂交,Y染色体性别决定区(sex-determining region of Y,SRY)基因验证CGH检测结果.结果 (1)用DOP-PCR扩增时,A组10枚卵裂球中有9枚WGA成功,C组10枚淋巴细胞WGA均成功;但其扩增产物进一步扩增TBX1基因2号外显子时,出现较多非特异性条带.CGH检测中.5例卵裂球用长度250～750 bp的探针检测时,1例失败,1例CGH软件核型分析结果与SRY结果不一致.(2)经MDA的B和D组,均WGA成功;其产物进一步扩增TBX1基因2号外显子时,非特异性条带少.CGH检测中,探针长度为250～750 bp的5例卵裂球均检测成功,且与SRY验证结果一致.(3)用长度为750～2000 bp探针检测时,杂交效果不好.结论 单卵裂球全基因组扩增,MDA较DOP-PCR方法稳定,特异性强,CGH检测中,扩增产物酶切至250～750 bp制备的探针杂交图像均匀、清晰,软件分析核型结果稳定、准确.

Abstract：

Objective To investigate the effect of different amplification methods and probes with various length on the results of comparative genomic hybridization (CGH) analysis of pre-implanted single blastomere and to establish the basis for preimplantation genetic diagnosis.Methods Twenty blastomeres of embryo at 6-8 cells stage were randomly divided into A and B group with 10 in each.Twenty peripheral blood lymphocytes from a healthy man were similarly divided into C and D group with 10 in each.Degenerate oligonucleotide primed polymerase chain reaction (DOP-PCR) was used to amplify whole genomic DNA in group A and C,and multiple displacement amplification (MDA) was used in group B and D for whole genome amplification (WGA).The specificity of resultant products was confirmed by amplification of TBX1 gene exon 2.CGH was performed respectively with 250-750 bp and 750-2000 bp probes prepared from the amplified whole genomic DNA.The result of CGH was verified by sex-determining region of Y (SRY).Results (1) Nine of the 10 samples in group A and all in group C were amplifiable by DOP-PCR,but there were multiple non-specific bands in the amplification of TBX1 exon 2 when WGA products were used as templates.When 250～750 bp probe was used in CGH,1 of the 5 blastomeres was failed and another one had different karyotype from that analyzed by SRY.(2) All samples in group B and D were successfully amplified by MDA,and the non-specific bands were significantly less in the amplification of TBX1 exon 2.All 5 blastomeres were successful in CGH with the 250～750 bp probe.Moreover,the karyotype was in agreement with that of SRY.(3) When 750 ～ 2000 bp probe was used,the CGH results were suboptimal.Conclusions In WGA of single blastomere,MDA is superior to DOP-PCR in the stability and specificity.The karyotype image detected by CGH with the 250～750 bp probe is clear and homogenous.     

三核苷酸重复引物PCR和甲基化特异性多重连接探针扩增技术在脆性X综合征产前诊断中的应用

目的探讨脆性X综合征(FXS)产前基因诊断的方法。方法采用三核苷酸重复引物PCR法(TP-PCR)及甲基化特异性多重连接探针扩增技术(MS-MLPA)检测2个FXS家系及30例正常对照胎儿样本FMR1基因CGG重复数、AGG排布及FMR 1基因Cp G岛甲基化状态。结果正常对照FMR1基因(CGG)n重复数介于23~40之间,频数最大的重复数为29,AGG排布式以9A9A9最为常见。2个FXS家系中前突变等位基因向子代遗传过程中均发生了CGG扩展。正常对照及前突变携带者FMR1基因Cp G岛均为低甲基化状态,全突变患者Cp G岛为高甲基化状态。结论 TP-PCR和MS-PCR联合应用能够检出胎儿FMR1基因CGG重复数和Cp G岛甲基化状态,从而判断胎儿是否为脆性X综合征患儿,为优生干预提供可靠的依据。     

用荧光原位杂交技术检测唐氏综合征

目的: 探讨用荧光原位杂交技术在检测唐氏综合征中的应用价值。方法: 以Biotin标记的DSCR21q22.3探针与经处理的20例唐氏综合征患者标本外周血中期染色体及其间期细胞核进行原位杂交,统计杂交信号数量。结果: 14例唐氏综合征患者出现3个杂交信号的细胞,染色体和间期细胞核杂交平均出现率分别为98.79％和98.46％,与染色体检测的结果一致;其余染色体核型检测为嵌合体的6例患者,染色体和间期细胞核中3个杂交信号细胞平均出现率分别为75.33％和7 3.50％, 2个杂交信号细胞平均出现率分别为22.67％和21.33％。结论: 荧光原位杂交技术检测唐氏综合征具有快速、敏感度高、信号强、背景低、直观安全等优点,故FISH技术在临床遗传病检测领域中具有重要的应用价值和发展前景。     

卵巢早衰患者卵泡刺激素受体基因突变的检测

目的通过对卵巢早衰（POF）患者卵泡刺激素受体（FSHR）基因突变的检测,进一步探讨POF患者的发病原因.方法采用病例对照研究方法,抽取73例来自中国大陆的特发性POF患者（POF组）和月经规律、因输卵管或男性因素不孕患者25例及正常绝经妇女10例（对照组）的静脉血,提取白细胞基因组DNA,采用PCR方法扩增FSHR基因的第7外显子,其PCR产物经限制性内切酶Bsm Ⅰ酶切后,行琼脂糖凝胶电泳,观察有无51 bp和27 bp条带;并对2例POF患者的PCR产物进行测序,观察FSHR基因的第566位点是否为胞嘧啶（C）,以确定该位点C是否突变为胸腺嘧啶（T）,即C566T突变.结果POF组患者和对照组妇女PCR产物经限制性内切酶Bsm Ⅰ酶切后,均显示51 bp和27 bp两条条带;PCR产物经测序,FSHR基因的第566位点为C.结论POF患者和对照组妇女的FSHR基因均未发生C566T突变.我国大陆POF患者FSHR基因C566T突变可能很少见.