共查询到20条相似文献,搜索用时 93 毫秒
1.
目的评价2种基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统(Autoflex MALDI-TOF MS和Vitek MALDI-TOF MS)在快速鉴定血培养中分离的白念珠菌以外酵母样真菌的应用。方法收集复旦大学附属中山医院2010年10月至2013年1月住院患者血培养中分离的白念珠菌以外酵母样真菌59株,以真菌内转录间隔区(ITS)测序鉴定结果为金标准,比较Autoflex MALDI-TOF MS、Vitek MALDI-TOF MS和API 20C AUX 3种系统鉴定的准确性。结果 59株菌株包含了11种真菌,其中近平滑复合体30株(占50.8%)、热带念珠菌11株(占18.6%)、光滑念珠菌8株(占13.6%)、克柔念珠菌2株(占3.4%)、新生隐球菌2株(占3.4%)、异常威克汉姆酵母2株(占3.4%)、季也蒙念珠菌复合体1株(占1.7%)、葡萄牙念珠菌1株(占1.7%)、阿萨希毛孢子菌1株(占1.7%)和酿酒酵母1株(占1.7%)。3种系统鉴定真菌总的准确性分别为Autoflex MALDITOF MS 93.2%、Vitek MALDI-TOF MS 83.1%和API 20C AUX 79.7%,2种MALDI-TOF MS比较,差异无统计学意义(P=0.155)。其中对白念珠菌以外酵母样真菌的鉴定准确性分别为Autoflex MALDI-TOF MS 100.0%、Vitek MALDI-TOF MS 84.9%和API 20C AUX 84.9%,2种MALDI-TOF MS比较,差异具有统计学意义(P=0.006)。对念珠菌属外的少见真菌鉴定准确性分别为Autoflex MALDI-TOF MS 33.3%、Vitek MALDI-TOF MS66.6%和API 20C AUX 33.3%。结论 MALDI-TOF MS系统和目前常规生化鉴定方法相比,具有快速、操作简便、结果准确等优点;对于临床血培养分离真菌的鉴定,Autoflex MALDI-TOF MS鉴定准确性和Vitek MALDI-TOF MS相似,但对常见非白念珠菌的鉴定,Autoflex MALDI-TOF MS鉴定准确性优于Vitek MALDI-TOF MS。 相似文献
2.
目的了解VITEK MS对1株从血培养分离的福氏志贺菌的鉴定能力。方法采用VITEK MS、Vitek 2 Compact全自动细菌鉴定仪、血清凝集试验及16S rRNA基因测序进行鉴定;采用VITEK MS分别对福氏志贺菌临床株、福氏志贺菌CMCC51572、大肠埃希菌ATCC8739进行质谱鉴定及蛋白质谱图比较分析。结果 VITEK MS鉴定为大肠埃希菌,可信度为99.9%;Vitek 2 Compact鉴定为志贺菌属,可信度为89.0%;血清学结果为福氏志贺菌3a型;16S rRNA基因测序为志贺菌、福氏志贺菌1a、福氏志贺菌2a、大肠埃希菌,序列同源性达97%以上;福氏志贺菌临床株、福氏志贺菌CMCC51572、大肠埃希菌ATCC8739的蛋白质谱图相似。结论志贺菌和大肠埃希菌在基因角度上符合同一个种,VITEK MS不能区分志贺菌和大肠埃希菌,需要附加生化反应、科玛嘉尿道定位显色培养及血清学试验进行志贺菌的排除。 相似文献
3.
目的 评估Autof MS 1000 质谱鉴定系统对临床实验室常见菌株的鉴定能力。方法 参考CLSI M52 标准对
Autof MS 1000 质谱鉴定系统进行评估。菌株鉴定的评估指标包括准确度和精密度。准确度评估以Bruker MALDI-TOF
作为参比设备,以Autof MS 1000 为待评估设备,选取231 株能够涵盖实验室80% ~ 90% 的常见分离菌株及1 株室间
质评菌株作为检测标本,包括革兰氏阳性需氧菌77 株,革兰氏阴性需氧菌95 株,厌氧菌30 株,酵母样真菌30 株,待
评估设备鉴定结果与参比设备鉴定结果一致时判断为相符,若结果不一致则以测序方法(细菌为16S RNA,真菌为ITS
区测序)鉴定结果为准。精密度评估为选取12 株室内质控菌株和临床分离菌株作为检测标本,在Autof MS 1000 质谱
鉴定系统上进行重复性测试,每株菌重复检测3 次,判断其鉴定结果的一致性。以准确度大于90%、精密度大于95%
为判断合格标准。结果 232 株临床实验室常见分离菌株鉴定结果准确度为100%;12 株室内质控菌株和临床分离菌株
重复性检测结果的精密度为100%。结论 Autof MS 1000 质谱鉴定系统对临床实验室常见菌株鉴定的准确度和精密度
都很高,并且具有快速、低耗及易操作等优势,建议可在临床微生物实验室推广使用。 相似文献
4.
目的 评估国产基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统microTyper MS鉴定革兰阴性菌的性能.方法 使用国产MALDI-TOF MS系统microTyper MS与进口质谱系统VITEK MS系统同步鉴定该实验室储存的标准菌株及2018年6月至2019年6月临床分离的革兰阴性菌株.鉴定结果不一致时,使用表型试验或16 s rDNA测序进行确认,以此评估microTyper MS对革兰阴性菌的鉴定能力.结果 纳入鉴定的革兰阴性菌株一共45属4509株.VITEK MS系统准确鉴定4419株,准确率为98.0%;microTyper MS准确鉴定4405株,准确率为97.7%.结论 microTyper MS在革兰阴性菌鉴定方面具有与VITEK MS系统相仿的临床细菌鉴定能力. 相似文献
5.
目的比较MicroflexTM基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统(简称Vitek 2 Compact)对肠杆菌科细菌的鉴定能力。方法采用MicroflexTMMALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact同时对545株肠杆菌科质控菌株和临床分离菌株进行鉴定,鉴定结果不一致者采用沙门菌血清凝集试验或细菌16S r DNA基因测序予以确证。结果 MicroflexTMMALDI-TOF MS对545株细菌的种和属的鉴定率分别为97.1%、2.9%。Vitek 2 Compact对545株细菌的种、群、属的鉴定率分别为83.3%、13.9%和2.2%,鉴定错误率为0.2%,未鉴定率为0.4%。结论 MicroflexTMMALDI-TOF MS对肠杆菌科细菌的鉴定符合率高于Vitek 2 Compact,且操作快速、简便,成本低,可用于临床肠杆菌科细菌的常规快速鉴定。 相似文献
6.
目的运用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定系统对中段尿样本中的细菌进行直接快速检测,以建立快速的细菌检测方法便于临床应用。方法 692例中段尿样本接种于固体培养基上,利用MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统(简称Vitek 2 Compact)对单个菌落进行鉴定;同时对尿液样本进行前处理后直接进行质谱分析。结果 692例中段尿样本中,98例单一菌感染且细菌数104CFU/m L的样本应用MALDI-TOF MS直接检测出74株菌,检出率达75.5%,其中大肠埃希菌39株,检出率达79.6%;粪肠球菌23株,检出率为100.0%;摩根摩根菌5株,检出率为100.0%。64例样本为2种菌混合感染,采用MALDI-TOF MS直接检测出44例样本中的1种优势细菌。质谱直接检测尿液的鉴定结果与单菌落质谱鉴定结果及Vitek 2 Compact鉴定结果完全一致,符合率为100.0%。结论 MALDI-TOF MS可用于直接检测尿液样本中的细菌,检出率高,结果可靠;MALDI-TOF MS对混合菌感染的样本有一定鉴定能力;该方法可比常规尿培养鉴定方法提早42 h报告鉴定结果,是对临床尿液样本细菌鉴定的一大革命性进步。 相似文献
7.
目的了解基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对链球菌属临床菌株的鉴定能力。方法收集2015-2019年同济大学附属东方医院临床分离的链球菌,16SrRNA基因测序确定细菌种类。采用直接涂抹法平行使用Autof MS1000型质谱仪、VITEK MS质谱鉴定系统及Bruker Biotyper系统对菌株进行质谱鉴定。结果134株链球菌属细菌中,3套质谱鉴定系统对无乳链球菌、化脓链球菌、解没食子酸链球菌、戈登链球菌及变异链球菌的准确鉴定率均为100%。Bruker Biotyper和Autof MS1000型质谱仪对21株停乳链球菌及14株星座链球菌未能鉴定到亚种,5株缓症链球菌鉴定为口腔链球菌,肺炎链球菌和咽峡炎链球菌各有1株鉴定错误;Autof MS1000型质谱仪鉴定链球菌种水平置信度高于Bruker Biotyper系统。VITEK MS质谱鉴定系统可鉴定停乳链球菌的部分亚种,但14株星座链球菌未能鉴定到亚种,7株缓症链球菌鉴定为缓症链球菌/口腔链球菌,2株咽峡炎链球菌分别鉴定为星座链球菌和肺炎链球菌。结论3套质谱鉴定系统对链球菌属中临床常见的无乳链球菌、化脓链球菌可准确鉴定、直接报告,但是对一些种类菌株鉴定结果有误或不能鉴别亚种,需要DNA序列分析或结合血清学或其他补充实验来准确鉴定。 相似文献
8.
目的对含有革兰阳性球菌的痰培养分离出的草绿色链球菌样菌落进行16S rRNA基因序列分析与质谱鉴定,探讨16S rRNA基因序列分析与质谱在临床病原菌鉴定方面的意义。方法将分离的菌株采用奥布托辛(OP)试验、Vitek MS质谱鉴定以及16S rRNA基因测序进行鉴定。结果OP试验结果在5%CO2气体环境中抑菌圈直径为15mm,在大气中培养抑菌圈直径为25mm。Vitek MS质谱鉴定显示为假肺炎链球菌,可信度99.9%。16S rRNA基因测序鉴定结果显示该菌与肺炎链球菌的相似度为99.63%,与假肺炎链球菌的相似度更高为99.75%。结论结合表型鉴定结果,可进一步确定分离株为假肺炎链球菌。 相似文献
9.
目的评估基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对醋酸钙不动杆菌-鲍曼不动杆菌复合群内菌种的鉴定能力。方法收集2018年1月至2020年3月经Vitek 2全自动微生物鉴定仪鉴定为醋酸钙不动杆菌-鲍曼不动杆菌复合群的菌株280株,用Vitek MALDI-TOF MS(V3.2)鉴定并用gyr B基因测序验证,比较复合群内不同种间的耐药性差异。结果 280株醋酸钙不动杆菌-鲍曼不动杆菌复合群经Vitek MALDI-TOF MS鉴定,结果为鲍曼不动杆菌251株、医院不动杆菌15株和皮特不动杆菌14株。质谱鉴定结果与基因测序结果符合率为100%。鲍曼不动杆菌对多种抗菌药物均表现为高度耐药,耐药率多在60%以上,医院不动杆菌和皮特不动杆菌对多种抗菌药物呈现高度敏感。除了对阿米卡星、米诺环素、复方磺胺甲噁唑外,鲍曼不动杆菌对各种检测药物的耐药性显著高于医院不动杆菌和皮特不动杆菌,差异有统计学意义(P0.05);医院不动杆菌和皮特不动杆菌在各种检测药物耐药率上差异无统计学意义(P 0.05)。结论 Vitek MALDI-TOF MS3.2版本可实现醋酸钙不动杆菌-鲍曼不动杆菌复合群不同种的鉴定;醋酸钙不动杆菌-鲍曼不动杆菌复合群不同种的药敏结果存在差异性。 相似文献
10.
井然 侯欣 肖盟 康梅 陈淑兰 李若瑜 罗燕萍 孙自镛 廖康 冯羡菊 胡志东 潘玉红 褚云卓 梅亚宁 刘文恩 杨青 苏丹虹 邹桂玲 俞云松 刘丽文 胡辛兰 周铁丽 张嵘 喻华 邵海枫 倪语星 王勇 宋秀兰 侯铁英 吕火祥 徐修礼 张智洁 贾伟 李克诚 马玲 李国雄 邓林强 孟灵 宋卫青 徐元宏 王晶 许小敏 张琼 章强强 杨滨 雷金娥 徐英春 《中国感染与化疗杂志》2020,(2):175-180
目的回顾性分析2010-2014年中国侵袭性真菌耐药监测网(CHIF-NET)62所监测中心重症监护室(ICU)侵袭性酵母的现状,了解我国侵袭性酵母分布的特征及其对唑类药物的耐药情况。方法收集各所监测中心初步鉴定的菌株,送至北京协和医院检验科,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术结合分子测序技术对所有菌株进行复核鉴定,再进行唑类药物敏感性检测。结果2010-2014年,62所监测中心ICU共检出侵袭性酵母2863株,其中以念珠菌属最多,计2771株。标本类型包括血液标本(50.8%,1453/2863),无菌体液标本(49.2%,1410/2863);其中,50.7%(1404/2771)的念珠菌属分离自血液标本。5年间,白念珠菌对氟康唑和伏立康唑十分敏感,敏感率>99.0%;热带念珠菌对氟康唑和伏立康唑的耐药率显著升高,均从12.2%升至23.1%(P<0.01);光滑念珠菌对氟康唑的耐药率也显著升高,从14.7%升至27.7%(P<0.01)。非念珠菌属中,新型隐球菌复合体对伏立康唑全部敏感,从2013年开始出现对氟康唑耐药菌;其他酵母对两种唑类药物耐药率整体较高,分别为43.6%和32.7%。菌株复核鉴定的正确率为86.2%(2467/2863)。结论ICU中侵袭性酵母分离株中以念珠菌属为主,主要分离自血液,氟康唑和伏立康唑对其抗菌作用非常显著;而非白念珠菌的耐药率有不同程度的升高及交叉耐药的出现,临床需要加以重视。 相似文献
11.
目的建立并评价实验室自建的红色毛癣菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)数据库的可行性。方法将红色毛癣菌标准菌株ATCC 28188用沙保罗葡萄糖琼脂(SDA)平板28℃培养5d,分别用双甲酸夹心法和甲酸提取法作为蛋白提取方法,利用MALDI-TOF MS对标准菌株进行质谱数据采集,建立2种不同蛋白提取方法的菌株数据库"双甲酸夹心法自建库"和"甲酸提取法自建库";并用2种蛋白提取方法对21株红色毛癣菌临床分离株进行蛋白提取后,分别选取"双甲酸夹心法自建库+Bruker商品库"、"甲酸提取法自建库+Bruker商品库"和"Bruker商品库"做质谱鉴定,从而对各数据库的鉴定效果进行评价。结果"甲酸提取法自建库+Bruker商品库"对21株红色毛癣菌临床分离株的鉴定得分显著高于其余两组,差异有统计学意义(P<0.05),匹配率为21/21;"Bruker商品数据库"与"Bruker商品数据库+双甲酸夹心法自建库"的鉴定得分比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论本实验室建立的"甲酸提取法自建库+Bruker库"对红色毛癣菌的鉴定能力好,适用于临床微生物实验室。与待测菌统一培养条件所建立的数据库丰富了原有的数据库信息,使待测菌的鉴定更为准确。双甲酸夹心法操作简便,但对红色毛癣菌蛋白提取的效果欠佳。 相似文献
12.
目的探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)系统用于快速鉴定临床分离菌的可靠性和实用性。方法收集南京军区南京总医院2013年7~10月自临床标本分离的非重复细菌1 061株,分别使用MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact全自动细菌鉴定仪系统进行鉴定,结果不一致的菌株采用16S r DNA测序验证。结果 1 061株临床分离菌中1 058株(99.7%)经MALDI-TOF MS系统正确鉴定到属水平,1 016株(95.8%)正确鉴定到种,其余3株(0.3%)未给出鉴定结果。5株鉴定结果不一致的菌株经16S r DNA测序确认,结果与MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact鉴定符合率分别为40.0%(2/5)和0(0/5)。结论 MALDI-TOF MS可以作为一个快速、准确和价廉的工具应用于临床分离菌的鉴定。 相似文献
13.
目的评估不同培养基生长类鼻疽伯克霍尔德菌在Vitek 2 Compact中的鉴定结果。方法收集2010年6月至2017年5月海南省人民医院分离的类鼻疽伯克霍尔德菌127株,分别接种于哥伦比亚羊血平板(CBA)、麦康凯平板(MAC)和流感嗜血巧克力平板(CHA)上,以多位点序列分型(MLST)为金标准,评估Vitek 2 Compact VT2.R7.01版GN卡对不同培养基上生长的类鼻疽伯克霍尔德菌的鉴定准确性。结果 CBA平板上生长的类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定准确率最高,为98.4%,2株被错误鉴定为洋葱伯克霍尔德菌;MAC次之,准确率为94.5%,其中4株被错误鉴定为洋葱伯克霍尔德菌,2株为伯克霍尔德菌某种,1株被错误鉴定为铜绿假单胞菌;CHA鉴定准确率最低,为91.3%,其中4株被错误鉴定为洋葱伯克霍尔德菌,2株为伯克霍尔德菌某种,5株无鉴定结果。结论 Vitek 2 Compact GN卡对不同培养基上类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定准确率不同,建议优先选择CBA平板上菌落。 相似文献
14.
15.
目的 分析梅里埃基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flightmass spectrometry,MALDI-TOF-MS)系统与VITEK 2 Compact 全自动微生物鉴定仪对临床常见病原菌鉴定的一致性。方法 收集福建医科大学孟超肝胆医院2018 年6 月~ 2019 年3 月来自临床不同标本分离的非重复菌株300 株,分别采用梅里埃MALDI-TOF-MS 系统和VITEK 2 Compact 全自动微生物鉴定仪对病原菌进行鉴定,结果不一致菌株采用16SrDNA 基因测序予以确认,比较两种鉴定方法的准确性与一致性,评估两种方法在鉴定16 株大肠埃希菌的时间和经济成本。结果 300 株临床分离菌中,鉴定到种水平的菌株MALDI-TOF-MS 有268 株(89.33%),VITEK 2 Compact 有266 株(88.67%);鉴定到属水平的菌株MALDI-TOF-MS 有297 株(99.00%),VITEK 2 Compact 有297 株(99.00%);两种方法在种属鉴定的一致性分别为82.67% 与98.33%,MALDI-TOF-MS 的准确性略高于VITEK 2 Compact。两种方法鉴定不一致菌株有39 株(13.00%),与16SrDNA 测序鉴定结果相比,MALDI-TOF MS 的准确率(79.49%) 高于VITEK 2Compact(58.97%)。对16 株大肠埃希菌的鉴定,MALDI-TOF-MS 耗时较VITEK 2 Compact 少3.5h,且成本仅为VITEK2 Compact 的2/5。结论 MALDI-TOF MS 与VITEK 2 Compact 对于临床常见病原菌的鉴定结果较为一致,但MALDITOFMS 准确率更高,且更快速与经济。 相似文献
16.
目的 探讨两种质谱仪Biotyper MS和Vitek-MS系统在临床常规分离细菌鉴定中的应用价值。方法 收集沈阳军区总医院2012年3月至2013年1月分离自血液、尿液、脑脊液、分泌物和痰液等标本的临床常见菌细菌149株(包括14个菌属和30个菌种)。同时采用两种MALDI-TOF-MS系统对上述菌株进行鉴定,结果与Vitek2compact常规生化鉴定进行比较,对3种方法检测结果不一致菌株用16Sr RNA测序进行确认。结果 在149株常见细菌中,Bruker Biotype属和种的正确鉴定率分别为98%和96%,Vitek-MS属和种的正确鉴定率分别为97%和95%。两者均无错误鉴定菌株。结论 对该组常见细菌,两种质谱仪鉴定结果比较差异无统计学意义(P>0.05),均呈现出优异的鉴定水平,适合用于临床微生物的常规鉴定。 相似文献
17.
目的探讨对经过全自动微生物分析仪Vitek 2 Compact、基质辅助激光解吸飞行时间质谱仪Vitek MS鉴定为“不确定”菌,以及在不同显色平板上产生类似色素菌的进一步鉴定方法,以明确病原学诊断。方法对来自国家卫生健康委临床检验中心与广东省临床检验中心室间质量评价菌株中的“不确定”菌70株,使用不同的鉴定系统结合表型特征、血清学试验进行鉴定,并对显色平板上产生类似色素的菌株做补充鉴定。结果自动化微生物鉴定系统报告的32株“不确定”菌中,Vitek 2 Compact有65.6%(21/32)需要进一步鉴定,Vitek MS有59.4%(19/32)需要进一步鉴定,部分菌株在2种自动化微生物鉴定系统间的鉴定结果存在差异;32株“不确定”菌经不同鉴定系统、表型特征、血清学试验鉴定,全部鉴定到种/型水平。对念珠菌平板等3种不同显色平板上产生类似色素的38株菌的补充鉴定,结果全部为非目标菌。结论通过不同鉴定方法的互补,可以提高临床微生物鉴定的质量。 相似文献
18.
目的回顾分析室间质评1304号菌株的鉴定过程,评价Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统(简称Vitek 2 Compact系统)在临床少见疑难细菌鉴定中的应用。方法采用传统的细菌形态学检查、手工生化反应及Vitek 2 Compact系统等多种手段对1304号菌株进行鉴定分析,同时用基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)仪对最终鉴定结果进行佐证。结果 1304号菌株为革兰阴性小杆菌,氧化酶试验阳性,初次上机鉴定结果为支气管炎鲍特菌,鉴定率99%,转种分纯后2次上机鉴定结果为低分辨,粪产碱杆菌占51%,类产碱假单胞菌占49%,补充硝酸盐还原试验,结果为阴性,报告最终鉴定结果为粪产碱杆菌,质谱鉴定得分值为2.158,与最终结果相符。结论 Vitek 2 Compact系统鉴定临床少见疑难细菌有一定局限性,遇到少见疑难细菌应该用多种方法加以确定,综合分析以免造成错误鉴定。 相似文献
19.
20.
目的通过比较两种微生物鉴定系统基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和Vitek 2Compact,评价MALDI-TOF MS在临床常规分离微生物中的应用价值。方法对比MALDI-TOF MS和Vitek 2Compact系统的菌种数据库,筛选出MALDI-TOF MS菌库中新增菌种,统计该院自2015年5月MALDI-TOF MS投入使用起至2016年12月新增菌种被检出的菌株及频次,以及高置信度鉴定临床常见致病菌的检出频次。结果 MALDI-TOF MS较Vitek 2Compact菌库中新增205种菌株,在2015年5月至2016年12月临床微生物检验中共检出206次,且MALDI-TOF MS系统高置信度鉴定4种临床常见致病菌共286例。结论 MALDI-TOF MS菌种数据库更大、准确度高,更能满足临床微生物检验的需求,适于更广泛地投入到临床微生物鉴定的应用中。 相似文献