TXT2DNA：基于DNA序列的文本编、解码及比对软件系统

TXT2DNA是由我们实验室新近设计完成的一个能够将汉字等文本信息编码为DNA序列并可将后者解码还原为文本信息,同时可提供基于DNA序列比对技术的文本数据分析软件系统。TXT2DNA通过建立包括汉字字符在内的多种语言字符与DNA序列之间的唯一对应关系,为每个字符分配Unicode（唯一序列码）,实现从文字字符到DNA序列的编码与解码功能,进而实现了DNA与汉字字符的互通。     

2型、5型腺病毒DNA与12型腺病毒DNA、大肠杆菌DNA序列的对比研究

目的通过对2型、5型人腺病毒DNA（Adv2、5 DNA）与Adv12 DNA及大肠杆菌DNA（EC DNA）序列进行对比研究,确定Adv2、5 DNA中能够拈抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸（CpG-N ODN）。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12 DNA和EC DNA序列,采用DNATools、BioEdit等软件对Adv2、5、12 DNA和EC DNA进行序列分析和比较,确定Adv2、5 DNA特征性的CpG基序,查找出Adv2、5 DNA中以上述CpG基序为核心的12碱基寡核苷酸（12-ODN）。结果确定了19种Adv2、5 DNA特征性的CpG基序,Adv2、5 DNA中以这19种CpG基序为核心的12-ODN共504条。结论504条12-ODN可能是Adv2、5 DNA的CpG-N ODN。     

白介素——8基因的克隆及DNA序列分析

本 文采用ＬＰＳ刺激健康人外周血的单核细胞，提取其总的ＲＮＡ，采用逆转录ＰＣＲ扩增目的基因，并且将获得的目的基因连接到克隆载体中，通过ＤＮＡ序列分析，证实获得的目的基因是所需的ＩＬ－８的基因。     

α半乳糖苷酶的c DNA克隆及序列测定

咖啡豆中存在的α半乳糖苷酶可作用于人Ｂ型血红细胞表面糖链末端的α半乳糖苷键,造成糖链末端的α半乳糖水解,使Ｂ型血表面的糖链结构与Ｏ型血相同,从而将Ｂ型血转变为Ｏ型血,在野战输血和自然灾害急救中具有重要的意义。为实现以基因工程方法生产α半乳糖苷酶的目的,我们克隆了海南兴隆咖啡豆的α半乳糖苷酶全长ｃＤＮＡ,并与已报道的桑托斯咖啡豆的α半乳糖苷酶ｃＤＮＡ序列进行了比较。根据已报道的桑托斯咖啡豆α半乳糖苷酶ｃＤＮＡ序列设计了５′、３′端上、下游引物和与全长ｃＤＮＡ中间部位完全匹配的引物,分别与上、下游引…     

1.5T颅内病灶对比增强序列的对比研究:2D-SE、BB Cube和BB Cube-FLAIR序列

正摘要目的本研究通过评估流动相关伪影、可检测性和颅内病灶的对比度,对比研究了T1W BB Cube(black-blood Cube)序列、T1W BB Cube FLAIR序列在脑对比增强成像中的应用,并与常规T1W自旋回波(SE)序列进行对比。方法首先采用水模研究确定BB Cube和BB Cube-FLAIR的最佳序列参数。其次对23例颅内病变的病人进行临床研究,通过与传统的2D T_1W-SE序列的比较来评估这两个序列对颅内病灶的诊断效能。结果通过水模研究得到最优的对比增强     

DNA及RNA G4链体抗体序列的生物信息学分析

目的对DNA及RNA G4链体抗体BG4的核苷酸序列和氨基酸序列进行分析,探讨其结构与功能的关系。方法利用Expasy网站预测BG4蛋白分子量等电点信息。利用在线网站NCBI中nucleotide blast,protein blast及Expasy网站中相关链接对BG4蛋白进行高级结构预测。结果 BG4核苷酸序列全长为875 bp,为287个氨基酸编码。核苷酸序列比对分析表明,BG4蛋白与人免疫球蛋白重链可变区Ig H的mRNA高度一致,两者核苷酸序列的相似度为(281/291)97%,氨基酸组成序列比对分析表明,BG4蛋白与抗干扰素γ免疫球蛋白高度同源,相似度为(195/255)76%。结论 DNA及RNA G4链体抗体BG4蛋白与人类免疫球蛋白Ig H及抗干扰素γ免疫球蛋白同源性高,可能具有免疫调节的作用。     

MRCP诊断术后胆管结石:2D、3D FASE序列对照

目的评价磁共振胰胆管成像(MRCP)二维高级快速自旋回波(2D FASE)序列和三维高级快速自旋回波(3D FASE)序列对胆道术后残余对胆道术后病变的诊断价值.方法对72例胆道术后出现不明原因发热、黄疸、肝功能异常、右上腹痛等症状患者同时进行MRCP 2种序列检查,结果分别与手术、直接胆道造影对照.结果MRCP 2D FASE序列、3D FASE序列诊断肝内胆管结石的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、准确率分别为43.5%、100%、100%、79%、81.9%以及69.6%、95.9%、88.9%、87%、87.5%.2种序列诊断有显著性差异(P＜0.05).MRCP 2D FASE序列和3D FASE序列诊断胆总管及吻合口结石的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、准确率分别为77.8%、96.3%、87.5%、92.9%、91.7%以及83.3%、98.1%、93.8%、94.6%、94.4%.2种序列相比无显著性差异(P＞0.05).结论MRCP 2种序列对胆系结石均有很高的检出率.3D FASE序列较2DFASE序列能检出更细小的结石.     

GRE-T_2''WI、FSE-T_2WI、STIR序列在脊柱转移瘤MRI的应用比较

目的:比较3种MRI扫描序列在脊柱转移瘤的应用,探讨各种方法的序列设计特点、信号特点及适用性。方法:50例证实为脊柱转移瘤的患者均进行矢状GRET2WI、FSET2WI、STIR序列扫描,并与矢状T1WI图像对照,比较3种序列对椎体、附件骨质破坏,脊髓受压、受侵,椎间盘、椎旁软组织肿块的显示情况。结果:GRET2WI和STIR序列显示脊柱转移瘤椎体、附件骨质破坏较优;FSET2WI显示脊髓受压、受侵的情况较优;软组织肿块的显示基本一致。结论:矢状GRET2WI可作为脊柱转移瘤常规扫描序列的首选,FSET2WI如有脊髓受压、受侵时可作为常规扫描序列;STIR是常规扫描的补充。     

GRE-T2*WI、FSE-T2WI、STIR序列在脊柱转移瘤MRI的应用比较

目的：比较3种MRI扫描序列在脊柱转移瘤的应用,探讨各种方法的序列设计特点、信号特点及适用性。方法：50例证实为脊柱转移瘤的患均进行矢状GRE—T2^*WI、FSE—T2WI、STIR序列扫描,并与矢状T1WI图像对照,比较3种序列对椎体、附件骨质破坏,脊髓受压、受侵,椎间盘、椎旁软组织肿块的显示情况。结果：GRE—T2WI和STIR序列显示脊柱转移瘤椎体、附件骨质破坏较优;FSE—T2WI显示脊髓受压、受侵的情况较优;软组织肿块的显示基本一致。结论：矢状GRE-T2^*WI可作为脊柱转移瘤常规扫描序列的首选,FSE—T2WI如有脊髓受压、受侵时可作为常规扫描序列;STIR是常规扫描的补充。     

FLAIR序列T2WI上蛛网膜下腔内高信号:机制、常见疾病和原因

液体衰减反转恢复(FLAIR)序列T2WI上蛛网膜下腔(SAS)内出现高信号的原因繁多,机制复杂,不仅会出现在许多不同的疾病中,而且可由吸入高浓度氧、使用顺磁性对比剂和各种伪影造成,相互交织重叠,需认真分析、鉴别.总结了近年文献中FLAIR序列T2WI上SAS内出现高信号的各种因素及其产生机制,以提高诊断和鉴别诊断水平,并拓展其应用范围.     

磁共振3D-SPACE、3D-TrueFISP、2D-FSE-PD序列膝关节软骨成像的比较研究

目的：比较三维可变反转角快速自旋回波序列(3D-SPACE)、三维真稳态进动快速成像序列(3D-Ture FISP)以及二维快速自旋回波质子像序列(2D-FSE-PD)膝关节软骨的成像质量。方法40例健康志愿者和20例患者在1.5T MR 上行3D-SPACE、3D-True FISP 和2D-FSE-PD 序列成像。比较各序列软骨信噪比(SNR)、对比信噪比(CNR)、损伤显示能力。结果3种序列中,3D-SPACE 序列的软骨信噪比、滑液与软骨的对比信噪比最高。3D-SPACE 比3D-True FISP 能更好地显示膝关节软骨的Ⅰ、Ⅱ级损伤,在软骨的Ⅲ、Ⅳ级损伤中,3D-SPACE 与3D-True FISP 无明显差异,对于各级软骨损伤,3D 序列均好于2D 序列。结论相比3D-True FISP、2D-FSE-PD 序列,3D-SPACE 序列能更好地显示膝关节软骨结构和损伤。     

集成MR序列T1、T2弛豫定量的可重复性研究

【摘要】目的：探讨集成磁共振成像（SyMRI）T1、T2弛豫定量的可重复性。方法：纳入8例正常志愿者,在两台相同的1.5T MR扫描仪上分别进行前后两次SyMRI扫描,生成组织T1mapping和T2mapping。基于体素分析测量四个灰质区及四个白质区的T1、T2值,采用组内相关系数（ICC）评价同一MR前后（组内）及不同MR之间（组间）测量的可重复性,同时采用BlandAltman散点图显示组内及组间测量结果的一致性。使用配对样本t检验对比组内及组间T1、T2值的差异。结果：ICC结果显示8个特征性脑区的组内及组间测量的ICC值均在0.75以上,表现为很好的稳定性及可重复性。BlandAltman散点图显示测量结果基本均在95%的可信区间内,表明组内及组间测量结果具有很好的一致性。组内及组间的测量的值进行配对t检验,差异均无统计学意义（P>0.05）。结论：集成MRI测量的组织T1及T2值有很好的稳定性,可作为长期随访研究或多中心研究的有效指标。     

人IL2/GMCSF融合基因的克隆及序列测定

通过PCR技术,构建与克隆了IL2/GMCSF融合基因,并进行了序列测定。该融合基因的克隆成功,为表达具有IL2、GMCSF双功能活性的新型融合蛋白,以及发现细胞因子的新生物学功能等研究提供了有利条件。     

基于深度学习的MR电影序列的左心室功能全自动定量法:多供应商、多中心研究

正目的开发一种基于深度学习的方法,用于从短轴位MR电影序列影像中全自动地量化分析左心室(LV)功能,并在多供应商处及多个研究中心机构评估其性能。材料与方     

MR FLAIR序列、DWI序列及CT检查对急性蛛网膜下腔出血的诊断价值

目的探讨MR液体衰减反转恢复(FLAIR)序列、弥散加权成像(DWI)序列及CT对急性蛛网膜下腔出血(SAH)的诊断价值。方法分析69例经腰穿证实的SAH患者的MR检查(包括FLAIR、DWI序列)及CT资料,观察SAH的MR、CT表现,并比较两种方式的诊断价值。结果 69例经腰穿证实的SAH患者中,MR FLAIR序列检查阳性患者66例,3例阴性患者,检出率为95.65%,其中59例局限性SAH,7例广泛性SAH;而MR DWI序列检查阳性患者65例,4例阴性患者,检出率为94.20%,其中43例局限性SAH,22例广泛性SAH。CT扫描阳性患者55例,14例阴性患者,检出率为79.71%,其中44例局限性SAH,图像表现为局限于脑沟或脑池中的条形铸型或片状高密度影,11例广泛性SAH。MR FLAIR、DWI序列与CT三组间诊断SAH的价值比较,差异具有统计学意义(P0.05)。两两组间比较,除MR FLAIR序列与MR DWI序列的差异无统计学意义(P0.05)外,MR FLAIR序列与CT、MR DWI序列与CT比较,差异具有统计学意义(P0.05)。结论 MR FLAIR序列、DWI序列对急性蛛网膜下腔出血的诊断价值高于CT检查。     

登革2型病毒NS3基因的扩增及序列测定

采用热酚法从登革２ 型病毒４３ 株（Ｄ２ ４３） 感染的Ｃ６／３６ 细胞中提取了病毒ＲＮＡ,以病毒ＲＮＡ 为模板,进行Ｄ２ ４３ 株ＮＳ３ 基因ｃＤＮＡ 片段的反转录 ＰＣＲ 扩增,片段长度为１１７６ ｂｐ。将扩增的ｃＤＮＡ 片段克隆到Ｔ 载体ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ｋｓⅡ（ ＋ ） 中。通过双脱氧法测定了ｃＤＮＡ片段序列,与国际标准株ＮＧＣ株序列一致。     

肝脏肿块的磁共振成像:以屏气成像取代SE序列常规T_2WI

磁共振在腹部的应用未能达到象颅脑一样的效果,原因主要为腹部运动伪影和缺乏良好的腹部对比剂。作者评估了屏气T_2WI检查肝脏肿块的效果。两种快速成像序列(FSE和IR-FSE)和两种超快速脂肪抑制序列(half-Fourier-single-shot-FSE和IR-SE-EP)与常规不屏气的T_2WI进行了比较。图像评价根据以下几方面:肝脏的信噪比,肝与脾的对比/噪声比,病灶与肝的对比/噪声比,病灶的清晰度,图像的质量。32例病人(男15例,女17例,年龄24～78岁)的肝病灶均经CT、MRI或US证实。采用1.5T超导磁共振装置,能进行体部的平面回波成     

热杀伤细胞中DNA损伤的作用:耐热性、普鲁卡因和赤藓醇的影响

高热可以引起细胞的许多成分损伤,但这些损伤在热杀伤细胞和辐射增敏机制中的作用并不十分清楚。热对膜的损伤可以改变细胞内环境。作者通过增加细胞的耐热性,以及利用膜热活性物质普鲁卡因的热致敏效应和赤藓醇的热保护效应等方法,     

Acrp30基因的克隆、序列分析及在大肠杆菌中的表达

目的 :克隆人Acrp30基因 ,并在大肠杆菌中表达。方法 :提取人脂肪组织总RNA ,经RT_PCR扩增目的cDNA片段 ,进行核苷酸序列分析 ;将该基因克隆入原核表达载体pQE_30 ,在大肠杆菌M15中表达 ,用Ni2 + 固相化的螯合SepharoseFastFlow亲和层析纯化重组蛋白 ;并用Western印迹检测所制备多克隆抗体的特异性。结果 :从人脂肪组织总RNA中扩增得到 736bp的目的cDNA ,其序列与已报道的序列完全一致 ,并在大肠杆菌中成功获得高水平表达 ,蛋白相对分子质量大约为 30× 10 3,其表达量占菌体总蛋白的 15 %左右。重组蛋白经Ni2 + 固相化的螯合SepharoseFastFlow亲和层析纯化 ,纯度 >90 %。Western印迹试验证实所制备多克隆抗体具有较高特异性。结论 :本研究为进一步探讨Acrp30在肥胖症和糖尿病患者中的表达情况以及Acrp30的作用机制奠定基础