人微小RNAs成熟体多态与鼻咽癌易感性关系

目的 探讨hsa-miR-499(miR499)和hsa-miR-608(miR608)成熟体常见单核苷酸多态位点(rs3746444 T→C和rs4919510 C→G)的遗传变异与中国南方人群鼻咽癌发病关系.方法 采用病例对照研究方法,收集原发性鼻咽癌患者612例和正常对照612人,采用TaqMan技术检测miR499和miR608成熟体单核苷酸多态(rs3746444 T→C和rs4919510 C→G)基因型,运用SAS 9.13软件进行非条件logistic回归分析,校正混杂因素影响,分析基因多态与鼻咽癌发病关系.结果 以rs3746444 TT基因型为参照,携带变异基因型(TC+ CC)的个体发生鼻咽癌危险增加44％(OR=1.44,95％CI=1.13～1.82);而携带rs4919510(GC+ GG)基因型个体发生鼻咽癌风险是携带rs4919510 CC基因型的1.58倍(OR=1.58,95％ CI=1.21 ～2.07);且rs3746444C和rs4919510 G变异的等位基因个数与鼻咽癌发病风险均存在明显剂量反应关系(P＜0.01).结论 人miR499(rs3746444 T--→C)和miR608(rs4919510 C→G)成熟体遗传变异可明显增加南方人群鼻咽癌发病风险.     

硒蛋白S基因多态性与内蒙古汉族人群胃癌发病风险的关联研究

目的探讨内蒙古汉族人群硒蛋白S(SelS)基因单核苷酸多态性(SNP)与胃癌发病风险的关联性。方法采用PCR-RFLP技术对133例内蒙古汉族胃癌患者及135例体检健康对照者进行SelS基因分型,并经测序验证结果。采用SPSS17.0分析SelS基因SNP rs34713741与胃癌发病风险的相关性。结果 SelS基因SNP rs34713741基因型CC、CT、TT及等位基因C、T在胃癌组和健康对照组间差异有统计学意义(分别为6.105、6.294,P均0.05)。内蒙古汉族人群中携带T等位基因的CT/TT个体患胃癌的风险是CC基因型个体的1.57倍(OR=1.570,95%CI:1.084~2.274);携带T等位基因且吸烟的个体患胃癌的风险增加,是CC基因型的2.216倍(OR=2.216,95%CI:1.530~3.209)。结论 SelS基因SNP rs34713741与内蒙古汉族人群胃癌的发病具有相关性,T等位基因可能是胃癌发病的危险因素之一,吸烟可增加发病的风险。     

Sp110基因多态性与重庆汉族肺结核遗传易感性关联性研究

目的研究Sp110基因SNP位点多态性与重庆市汉族人群肺结核发病的关系。方法采用病例-对照研究设计,问卷调查收集肺结核相关危险因素;多种方法检测rs1135791C/T、rs722555A/G、5′-UTRrs11679983A/G、rs28930679C/T、rs9061A/G、rs1063154G/T、rs1047254A/G、rs3948464C/T位点SNP多态性,用SAS软件进行显著性检验,用MDR软件分析与肺结核易患性相关的SNP位点的交互作用。结果 (1)Sp110基因rs1135791CT基因型、rs722555GG基因型、rs11679983GG基因型、rs3948464CC基因型在病例组的频率明显高于对照组;(2)Logistic回归分析rs1135791C/T、rs722555A/G、rs11679983A/G、rs3948464C/T基因型,吸烟史、家庭中有结核病人、人均居住面积及BMI与重庆地区汉族肺结核的易患性有关;(3)Sp110基因rs722555A/G与rs1135791C/T、rs11679983A/G、rs3948464C/T3个位点有交互作用。结论 rs1135791C/T、rs722555A/G、rs11679983A/G、rs3948464C/T可能是重庆市汉族人群肺结核易患的危险因素。     

着色性干皮病基因多态性及单体型与肺癌遗传易感的关联

目的探讨DNA的修复基因着色性干皮病基因B(XPB)、XPD、XPG的单核苷酸多态性和单体型与肺癌遗传易感的关联。方法用病例-对照研究的方法,选择海南省有吸烟暴露史、诊断明确的肺癌患者100例为病例组,与其有相近吸烟暴露史、胸外科其他疾病(如胸外伤、支气管扩张、肺结核等)患者100例为对照组。采用质谱法检测XPB基因rs4150441和rs4150434,XPD基因rs171140和rs11878544,XPG基因rs4771436、rs2094258、rs17655位点的多态性,采用Halopview软件进行单体型构建,探讨XP基因多态性及单体型与肺癌遗传易感性的关联。结果 XPB基因的rs4150434位点,携带GA基因型个体患肺癌的易感性是携带GG基因型个体的2. 071倍(OR=2. 071,95%CI 1. 055～4. 067),携带AA基因型个体患肺癌的易感性是携带GG基因型个体的2. 535倍(OR=2. 535,95%CI 1. 063～6. 044)。XPG基因的rs4771436位点,携带GG基因型个体患肺癌的风险是携带TT基因型个体的2. 494倍(OR=2. 494,95%CI 1. 038～5. 992)。XPG基因的rs2094258位点,携带AA基因型个体对肺癌的易感性是携带GG基因型个体的3. 020倍(OR=3. 020,95%CI1. 015～8. 980)。单体型结果显示,XPB基因rs4150441位点(G> A)和XPB rs4150434位点(G>A)所构成的单体型中,GA单体型的肺癌易感性是GG单体型的3. 643倍(OR=3. 643,95%CI 1. 113～11. 921)。XPG基因rs2094258位点(G>A)、rs4771436位点(T>G)和rs17655位点(C>G)所构成的单体型中,ATC单体型的肺癌易感性是GTC单体型的3. 800倍(OR=3. 800,95%CI 1. 073～13. 459)。结论XPB rs4150434、XPG rs4771436、XPG rs2094258位点多态性与肺癌的遗传易感性相关联,XPB基因的GA单体型和XPG基因的ATC单体型可能增加肺癌的发病风险。     

中国南方汉族人群哮喘与GSDMB/ORMDL3基因多态性

目的研究GSDMB/ORMDL3基因相关单核苷酸多态性位点(SNP)与中国广东人群哮喘发病、吸烟行为的相关性。方法于2014年3月—2015年3月对广东医学院附属医院就诊的394例哮喘患者、395名健康成人进行血样采集和问卷调查,用SNa Pshot技术检测GSDMB/ORMDL 3基因单核苷酸多态性(SNP)rs7216389、rs4794820、rs11650680基因型,并分析SNP变异与哮喘风险及吸烟因素的相关性。结果 SNP位点rs7216389C-T和rs4794820 A-G变异增加哮喘发病风险(OR分别为1.8和1.7,均为P0.000 1),而rs11650680 C-T位点变异与哮喘风险无明显相关性(OR=0.8,P=0.170 0);吸烟哮喘患者rs7216389 T/T和rs11650680 C/C高于戒烟与非吸烟组,而rs4794820 A/A低于非吸烟组(均为P0.000 1)。结论 rs7216389 C-T、rs4794820 A-G位点变异与哮喘发病风险明显相关,吸烟增加rs7216389 C-T、rs4794820 A-G、rs11650680 T-C位点的变异风险。     

MPO、NQO1、GSTP1和UGT1A6基因多态与慢性苯中毒遗传易感性关系

目的探讨MPO、NQO1、GSTP1和UGT1A6基因多态与慢性苯中毒易感性的关系。方法采用病例-对照研究,以268名苯中毒工人为病例组,268名接触苯而没有中毒表现的工人为对照组。应用TaqManPCR分析技术判定MPO(rs7208693),NQO1(rs1800566),GSTP1(rs947894)和UGT1A6(rs6759892,rs1105879,rs4124874,rs3755319,rs887829和rs4148323)基因型。结果携带GSTP1基因rs947894G等位基因个体患慢性苯中毒的危险性比AA基因型个体降低0.657倍(95%CI0.434~0.994,P=0.046);携带MPO基因rs7208693A等位基因人群中,UGT1 A6 rs6759892G等位基因个体发生慢性苯中毒的危险性是TT基因型的2.702倍(P=0.024),UGT1 A6 rs1105879C等位基因个体发生慢性苯中毒的危险性是TT型的2.619倍(P=0.035)。在饮酒人群中,携带NQO1基因rs1800566TT基因型个体慢性苯中毒的发病风险较携带CC和CT基因型个体增加9.000倍(95%CI1.460~55.478,P=0.021);在吸烟人群中,带NQO1基因rs1800566TT基因型个体慢性苯中毒的发病风险较携带CC和CT基因型个体增加7.000倍(95%CI1.555~31.575,P=0.012)。单倍型分析显示,本人群携带UGT1A6基因TACGGG单倍型个体慢性苯中毒的发病风险是携带TAATGG单倍型个体的1.446倍(OR=1.446,95%CI1.005~2.080,P=0.046)。结论同时携带MPO基因rs7208693A和UGT1A6基因rs6759892G或rs1105879C等位基因型个体对苯中毒易感;携带NQO1基因rs1800566TT基因型且同时吸烟或饮酒的个体对苯中毒易感;携带UGT1A6基因TAATGG单倍型个体可增加慢性苯中毒的发病风险;GSTP1基因多态与慢性苯中毒遗传易感性的关系仍需进一步研究。     

RTEL1基因多态性与冠心病患病风险的相关性研究

目的研究RTEL1基因多态性与冠心病(CHD)患病风险的相关性。方法选择2015年1月至2016年12月于西安医学院第二附属医院就诊的符合入选条件的CHD患者共300例,以及健康对照人群300例,分别采集血样。采用Mass ARRAY方法对RTEL1基因上rs6089953、rs6010620、rs6010621、rs4809324和rs2297441共五个位点的基因型进行测定,用SPSS 19.0软件统计基因多态性与CHD患病风险的相关性。结果采用χ2检验比较病例对照两组间各位点的等位基因频率差异,结果显示RTEL1基因上的rs6010620位点的等位基因"G"与降低冠心病患病风险具有相关性(OR=0.776,95%CI:0.649~0.928,P=0.005)。引入遗传模型后,结果显示rs6010620位点在隐性模型下,携带G/G基因型的个体患冠心病风险显著降低,是携带A/A和G/A基因型的0.49倍(OR=0.49,95%CI:0.30~0.80,P=0.0039);rs4809324在隐性模型下,携带C/C基因型的个体患冠心病风险显著降低,是携带T/T和T/C基因型的0.3倍(OR=0.30,95%CI:0.11~0.83,P=0.015);rs2297441在显性模型下,携带A/G和A/A基因型的个体患冠心病风险显著降低,是携带G/G基因型的0.62倍(OR=0.62,95%CI:0.43~0.91,P=0.014)。连锁不平衡分析发现,由rs6010620,rs6010621和rs4809324三个位点组成的GTT单体型与降低冠心病风险显著相关(OR=0.03,95%CI:0.01-0.12,P0.0001),结论 RTEL1基因上rs6010620、rs4809324和rs2297441三个位点与降低冠心病患病风险显著相关。     

XPG His1104Asp基因多态性与胃癌发病风险研究

目的评价XPG的两个常见SNPs和本地区胃癌发病风险的相关关系。方法纳入2008年1月-2012年12月期间238例新发胃癌病例,采用性别和年龄(5岁)进行1︰1匹配,在同一时间内某院体检的238例非肿瘤病人纳为对照。对XPG的XPG His1104Asp(rs17655)和XPG His46His(1800975)进行基因多态性分型,采用聚合酶反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法进行。结果幽门螺杆菌感染能够使患胃癌发病风险显著升高(P0.05)。Logistic回归分析表明,与携带rs17655 CC基因型相比,携带rs17655 GG基因型患胃癌的风险显著性的增加,调整后的OR值(95%CI为2.06(1.113.85)。同时,携带rs17655 G等位基因型与C等位基因型相比,患胃癌风险显著性增加,调整后的OR值(95%CI为1.42(1.071.88)。结论本研究表明XPG His1104Asp(rs17655)位点的遗传变异与胃癌发病风险存在相关关系。     

生长激素缺乏症与COL11A2基因单核苷酸多态性的相关性

目的 基于生长板功能在生长激素缺乏症(GHD)中的重要作用,本研究分析GHD患儿以及正常人群中XI型胶原α2(COL11A2)基因的多态性,以明确其与GHD的相关性。方法 采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)方法对229例GHD患儿和314例正常对照组儿童COL11A2基因单核苷酸多态性位点(SNP)进行基因检测,分析SNP位点的基因型频率、等位基因频率以及显性和隐性模式下的基因型分布频率在两组间的差异。结果 COL11A2基因位点rs9368758与GHD的发生具有相关性,差异具有统计学意义(P=0.012)。rs9368758基因位点A显性模式下A等位基因是GHD的保护因素,发生GHD的风险降低0.63倍(P=0.02,OR值=0.63,95%CI=0.43~0.92)。A隐性模式下G等位基因是GHD发病的危险因素,发生GHD的风险增加1.71倍(P=0.02,OR值=1.71,95%CI=1.11~2.65)。结论 COL11A2基因位点rs9368758与GHD存在相关性。rs9368758位点G等位基因是GHD发病的易感因素,携带者发生GHD的风险增加。A等位基因是GHD发病的保护性因素,携带者则不易患GHD。     

VEGF基因多态性与多囊卵巢综合征遗传易感性的相关性研究

目的 探索血管内皮生长因子基因（vascular endothelial growth factor gene, vegf）rs3025039C/T的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）和rs3025020C/T SNP与多囊卵巢综合征（polycystic ovary syndrome, PCOS）发病风险的相关性。方法 运用聚合酶链反应 - 连接酶检测反应（polymerase chain reaction - ligase detection reaction, PCR - LDR）的方法分析了152例PCOS患者组和160例健康对照组vegf基因rs3025039C/T和rs3025020C/T 的单核苷酸多态性和PCOS发病风险的关系。结果 与CC基因型相比,携带CT基因型可能增加PCOS的发病风险,OR值为1.75（95%CI:1.04～2.95）。用2LD软件对这2个多态性位点进行了联合分析,结果显示,2个位点之间存在连锁不平衡现象（D＇ = 0.81）。用EH软件进行单体型分析,结果显示,CC是人群中最常见的单体型,CT单体型增加了PCOS的发病风险（OR = 1.62,95%CI:1.01～2.60）。结论 vegf基因rs3025039C/T SNP增加了对PCOS的遗传易感性,携带CT基因型增加了PCOS的发病风险。     

CCR2和CCR5基因多态性与结核性脓胸的相关性研究

目的探讨CCR2基因-190G/A和CCR5基因-59029G/A单核苷酸多态性(SNP)与结核性脓胸的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对200例结核性脓胸患者和200例健康人进行-190G/A和-59029G/A SNPs检测,采用逐步logistic回归分析其与结核性脓胸的相关性。结果与CCR2基因-190G/G基因型相比,携带A/G和A/A基因型均可增加结核性脓胸发病风险(OR=2.250,95%CI=1.046~4.842,P=0.037和OR=8.706,95%CI=4.232~17.909,P=0.000)。无卡介苗接种史亦增加结核性脓胸发病风险(OR=3.031,95%CI=2.109~4.356,P=0.000)。CCR5基因-59029G/A位点各基因型未进入回归方程,与结核性脓胸的发病风险无明显相关性。结论 CCR2基因-190G/A SNP与结核性脓胸有相关性,CCR5基因-59029G/A SNP可能与结核性脓胸无关。     

MicroRNA基因单核苷酸多态性和DNA甲基化与儿童乙型肝炎疫苗无或低免疫应答的关联性

目的探讨MicroRNA基因单核苷酸多态性(SNP)和DNA甲基化与儿童乙型肝炎疫苗(HepB)无或低免疫应答的关联性。方法选取广西壮族自治区三家医院出生且已完成3剂HepB接种的8-9月龄儿童,采集血标本,开展乙型肝炎病毒(HBV)DNA含量和血清标志物检测、MicroRNA基因位点的基因型/等位基因SNP检测和DNA甲基化检测;比较HepB无/低应答和正常/高应答儿童MicroRNA基因位点的基因型/等位基因分布和DNA甲基化β值(中位数)。结果 miR196A2基因rs11614913位点的基因型(C/C、C/T、T/T)和等位基因(C、T)、miR499基因rs3746444位点的基因型(G/G、G/A、A/A)和等位基因(G、A)的分布在110名无/低应答和391名正常/高应答儿童之间均无显著性差异。miR196A2_2基因204位点、miR499B基因44、80、162位点的DNA甲基化β值在104名无/低应答和159名正常/高应答儿童之间均有显著性差异(0.028 vs 0.024,Z=-2.12,P=0.017;0.963 vs 0.956,Z=-2.43,P=0.007;0.965 vs 0.958,Z=-1.92,P=0.028;0.976 vs 0.973,Z=-1.93,P=0.027)。结论本研究中儿童HepB无/低免疫应答与MicroRNA基因SNP无显著性关联,而可能与miR196A2_2基因204位点、miR499B基因44、80和162位点的DNA甲基化存在关联。     

维生素D受体基因SNP rs2222570多态性与河南人群肺结核病易感性研究

目的调查河南地区维生素D受体(VDR)基因SNP位点rs2222570和结核病易感性之间关系。方法研究采用以医院为基础的病例对照研究方法,病例组纳入260个结核菌菌阳患者,并以年龄和性别相匹配纳入258名健康体检人群作为对照组。采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性对VDR基因SNP位点rs2222570多态性进行分析。结果在本次研究中258例对照人群中VDR基因C/C,C/T和T/T三种基因型分别占110(42.6%),106(41.1%),42(16.3%);在260例结核病患者中VDR基因C/C,C/T and T/T三种基因型分别占70(26.9%),130(50%),60(23.1%),二者分布存在统计学差异(=14.499,P=0.001)。单因素分析表明VDR基因SNP位点rs2222570多态性与结核病患病风险相关,VDR基因野生型C/C与杂合型C/T和突变型T/T相比降低了结核病发病50%的风险(校正OR=0.496,95%CI:0.344-0.717)。结论在河南地区VDR受体基因多态性与结核病发病相关。     

核糖体蛋白基因S 26单核苷酸多态性与多囊卵巢综合征易感性的相关性研究

目的探讨核糖体蛋白基因S 26(ribosomal protein gene S 26,RPS 26)基因多态性与多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)易感性的关系。方法用基因测序的方法检测2015年7月至2016年3月深圳市龙华新区人民医院诊治的100例PCOS患者和100例健康对照者RPS 26基因单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)rs1131017、rs56696262基因型分布。结果 rs1131017有3种基因型C/C、C/G、G/G,基因型和等位基因分布频率在两组比较差异无统计学意义(P0.05);rs56696262有3种基因型A/A、A/T、T/T,基因型A/T在PCOS组的分布频率高于对照组,基因型T/T在PCOS组的分布频率低于对照组,差异有统计学意义(P0.05)。野生的T/T基因型在PCOS组分布低于对照组(P0.05),可能为PCOS疾病发生的一种保护因素。T/T基因型患者睾酮水平低于非T/T基因型患者,差异有统计学意义(P0.05)。结论 RPS 26基因rs56696262位点SNP与PCOS遗传易感性可能有相关性。     

TCF7L2和KCNQ1基因多态性与2型糖尿病易感性的Meta分析

目的对TCF7L2,KCNQ1基因多态性与2型糖尿病(T2DM)相关性的研究进行Meta分析。方法通过检索PubMed和CNKI数据库中有关TCF7L2,KCNQ1基因多态性与T2DM易感性关联研究的文献,用漏斗图检验入选文献的偏倚,根据异质性检验结果采用固定效应模型或随机效应模型进行Meta分析,此过程均在软件包Launch Stata11.0上完成。结果该研究共纳入20篇文献(:1)KCNQ1基因rs2237892位点与T2DM发病风险相关性的研究共纳入7篇,得到7764例T2DM患者和8937例对照,Meta分析结果显示,rs2237892位点C等位基因能够增加T2DM的发病风险(OR=1.300,95%CI:1.234～1.366);CC/TC基因型是T2DM的危险基因型(OR=1.453,95%CI:1.279～1.651)。(2)TCF7L2基因rs7903146位点与T2DM发病风险相关性研究12篇,共得到11443例2型糖尿病患者和11003例对照,Meta分析结果显示,rs7903146位点T等位基因能够增加T2DM的发病风险(OR=1.379,95%CI:1.261～1.508),TT/TC基因型是T2DM的危险基因型(OR=1.469,95%CI:1.333～1.620)。(3)TCF7L2基因rs12255372位点与T2DM发病风险相关性的研究12篇,共得到12173例T2DM患者和10869例对照;Meta分析结果显示,rs12255372位点T等位基因能够增加T2DM的发病风险(OR=1.381,95%CI:1.275～1.495),TT/TG基因型是T2DM的危险基因型(OR=1.463,95%CI:1.337～1.602)。结论 TCF7L2基因rs7903146位点TT/TC基因型和rs12255372位点TT/TG基因型,以及KCNQ1基因rs2237892位点CC/TC基因型均能够增加T2DM的发病风险。     

单核细胞趋化因子-1受体CCR2基因190A/G、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶p22phox亚基基因C242T多态性与吸烟的交互作用增加非酒精性脂肪性肝病的发病风险

目的探讨单核细胞趋化因子-1(MCP-1)受体CCR2基因190A/G、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)氧化酶p22phox亚基基因C242T多态性与吸烟的交互作用与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的关系。方法采用病例-对照研究的方法,以600例NAFLD患者及600例健康对照者的外周血白细胞为样本,利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术分析了MCP-1受体CCR2基因190A/G和NADPH氧化酶p22phox亚基基因C242T多态性。结果 190A/G(GG)基因型和C242T(TT)基因型频率分布在病例组分别为50.17%、50.00%,在对照组分别为23.83%、24.17%,二者经χ2检验差异有统计学意义(χ2=88.8462,P=0.0031;χ2=85.8100,P=0.0039)。190A/G(GG)基因型者患NAFLD的风险显著增加(OR=3.2171,95%CI 1.9351~5.2184)。C242T(TT)基因型者患NAFLD的风险也显著增加(OR=3.1379,95%CI 1.7973~5.2362)。基因突变的协同分析发现190A/G(GG)/C242T(TT)基因型者在NAFLD组和对照组中的分布频率分别为39.67%和13.00%,二者经χ2检验差异有统计学意义(χ2=118.3021,P=0.0017)。190A/G(GG)/C242T(TT)基因型者患NAFLD的风险显著增加(OR=5.0211,95%CI 3.1853~7.7926)。病例组的吸烟率显著高于对照组(χ2=92.2234,P=0.0025),吸烟者患NAFLD的风险显著增加(OR=3.3032,95%CI 1.9147~5.7413),吸烟与190A/G(GG)/C242T(TT)基因型均有交互作用(r=3.9983;r=3.8553)。结论 190A/G(GG)、C242T(TT)基因型和吸烟是NAFLD的易患因素,基因多态性与吸烟的交互作用增加了NAFLD的发病风险。     

辐射诱发胸腺淋巴瘤与Ikaros及p16基因多态性

目的 探讨Ikaros及p16基因多态性与辐射诱发小鼠胸腺淋巴瘤的相关性.方法 采用Promega公司基因组DNA纯化试剂盒提取胸腺淋巴瘤细胞基因组DNA.采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-PEEP)方法检测Ikaros基因rs28185870位点(C/T)、rs28185923位点(C/T)及p16基因rs3695947位点(A/G)单核苷酸多态性(SNPs).结果 C57BL/6J及BALB/c小鼠rs28185870位点基因型分别为T/T、C/C;rs28185923位点基因型分别为C/C、T/T;rs3695947位点基因型分别为A/A、G/G.结论 辐射敏感性不同的C57BL/6J、BALB/c小鼠的rs28185870、rs28185923及rs3695947位点基因型不同,推测Ikaros及p16基因多态性与辐射诱发胸腺淋巴瘤相关.     

TRPV1 UTR-3基因多态性与北京汉族儿童哮喘的易感性研究

目的研究TRPV1 UTR-3基因多态性对北京汉族儿童哮喘易感性的影响。方法采用ISSAC统一问卷进行病例对照研究,从美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库选取TRPV1基因UTR-3区域rs58868916、rs9899485、rs4790521、rs4790522、rs402369及ENSSNP11193515作为目的SNP。通过PCR方法检测177名哮喘儿童、44名遗传性过敏症儿童及151名非哮喘对照儿童TRPV1基因多态性;通过Hardy-Weinberg平衡检验、卡方检验、连锁不平衡(LD)分析、Logistic回归分析和模型拟合,分析TRPV1基因SNP等位基因频率(MAF)、基因型及单倍型差异。结果Hardy-Weinberg平衡检验的P>0.05,满足基因型均衡要求;哮喘儿童与对照rs4790521T/C等位基因频率有显著差异(P<0.05);rs4790522A/C杂合子携带者哮喘患病风险显著低于纯合子A/A及C/C携带者(OR=0.588,95%CI=0.376～0.920,P<0.05),rs4790521隐性纯合子C/C携带者哮喘患病风险显著高于纯合子T/T及杂合子T/C携带者(OR=2.94,95%CI=1.32～6.53,P<0.01);LD分析显示rs4790521与rs4790522存在连锁不平衡(D’=0.959,r2=0.120),此2位点SNP构建出3个频率大于0.10的单倍型;通过Logistic逐步回归调整年龄、性别、家族遗传史及家庭成员吸烟等混杂因素后,rs4790521SNP的MAF、隐性纯合子C/C、及单倍型Hap2-C/C与儿童哮喘密切相关,是影响儿童哮喘易感性的重要危险因素,P值均小于0.05。结论TRPV1基因UTR-3多态性与中国北京汉族儿童哮喘易感性相关。     

雌激素相关基因多态性和流产对乳腺癌发病风险的影响

目的 探索雌激素合成/代谢相关基因CYP1B1rs1056836 (C＞G)、COMTrs4680 (G＞A)、ESR1rs2046210 (G＞A)多态性和流产对乳腺癌发病风险的影响。方法 采用病例对照设计,序贯收集2014年4月 - 2015 年6月间的乳腺癌新发病例794 例,健康体检女性805 例。采用统一编制结构化问卷收集信息,提取外周血DNA检测基因型,t/χ2检验筛选危险因素,广义多因素降维(GMDR)和非条件多因素logistic回归分析基因多态性与流产对乳腺癌发病风险的影响。结果 绝经前女性基因CYP1B1rs1056836 (C＞G)多态性、COMTrs4680 (G＞A)多态性对乳腺癌的发病危险度分别为ORCYP1B1 = 5.96(95%CI:1.20～29.64),ORCOMT = 0.69 (95%CI:0.52～0.92), ESR1rs2046210 (G＞A)多态性可能增加绝经前/后乳腺癌的罹患风险 (OR = 1.53,95%CI: 1.14～2.05;OR = 1.49,95%CI: 1.07～2.07)。有药流史可能增加绝经前/后乳腺癌的发病风险(OR = 3.63,95%CI:1.71～7.68;OR = 6.53,95%CI:1.83～23.32)。绝经前女性COMTrs4680 (G＞A)和药流相乘交互系数ORmulti = 0.16(95%CI:0.33～0.82)。结论 ESR1rs2046210 (G＞A)多态性、药流史可能增加乳腺癌罹患风险。     

JAK/STAT信号通路中关键分子基因多态性与肝细胞癌易感性的关系

目的 探讨宿主JAK/STAT信号通路中关键分子基因多态性与肝细胞癌(HCC)易感性的关系.方法 采用病例对照研究,用质谱法对367例诊断明确的HBsAg阳性HCC患者(HCC组)和性别、年龄匹配的367例对照的IL-6(rs1800796,-572C＞G)、STAT3 (rs744166,+26312T＞C; rs3816769,+42240T＞C; rs6503695,+40980T＞C)、EGFR(rs11543848,+142530A＞G)、mTOR(rs7211818,+170278A＞G;rs9674559,+196983A＞G;rs11653499,+65678G＞A)进行多态性检测.单因素分析确定各位点多态性比值比(OR)和95％可信区间(CI).结果 IL-6、STAT3、EGFR、mTOR的8个多态性位点各基因型在HCC组和对照组中分布的差异无统计学意义(P＞0.05).按性别分层后,在女性中,与TT基因型相比,携带STAT3 +26312CC、+42240CC、+40980CC基因型个体患HCC的危险性降低(OR=0.192,95％CI:0.047 ～ 0.784;OR=0.180,95％CI:0.045 ～ 0.725;OR=0.198,95％CI:0.049 ～ 0.806).与AA基因型相比,EGFR+142530(AG+GG)基因型降低女性患HCC的风险(OR=0.422,95％CI:0.179～ 0.994).结论 IL-6 (rs 1800796)、mTOR(rs7211818,rs9674559,rs11653499)多态性与HCC易感性无关;女性携带STAT3 (rs744166,rs3816769,rs6503695) CC基因型及EGFR(rs11543848) (AG+ GG)的个体患HCC的风险降低,但还需更大样本验证.