HBV基因型、亚型及其临床关系

乙型肝炎病毒（HBV）是引起人兽共患病的最小DNA病毒,全球分布,引发急性肝炎、慢性肝炎、肝硬化、乙肝相关性肝癌,对人类健康威胁大。目前根据HBV全基因序列异质性≥8％或S基因序列异质性≥4％将HBV分为8种基因型A～H,并根据全基因序列异质性≥4％而≤8％将HBV同1种基因型再分为不同的亚型。不同基因型、亚型的HBV各具独特的流行病学特点及分子生物学特征。并发现可能与HBV感染途径、疾病谱、病程进展以及抗病毒治疗的反应具相关性。     

PCR-微流芯片法检测HBV基因型及其临床应用

根据HBV全基因序列异质性≥8％或S基因序列异质性≥4％，可将HBV分为A～H8种基因型。文献报道基因型存在一定的地理区域分布，并可能与感染途径、感染谱、疾病的进展有一定的相关性。我们采用PCR-微流芯片法对96例乙型肝炎患者进行HBV基因型检测，并与病毒指标、肝纤维化、肝功能等指标进行相关性分析，报道如下。     

乙型肝炎病毒基因型流行病学与临床

HBV是最小的人类DNA病毒，其基因组全长仅为3200个碱基，以部分环状双链存在。其中负链为完整的环链，包括4个相互重叠的读框：前C／C基因、P基因、S基因和X基因。1988年，Okamaoto等比较了18株HBV全基因序列，将它们分为4组，并命名为A～D，并指出，依据核苷酸序列异质性≥8％可将HBV毒株分成不同的基因型，这个分型标准延用至今。进一步研究HBV全基因序列以及它们之间的进化关系，发现了另外4个基因型：E、F、G和H。以下结合我们在HBV基因型研究方面的工作，介绍有关研究进展和初步共识。     

山东地区HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者病毒基因型和亚型分布与临床

根据HBV全基因组序列差异≥8%或S基因序列差异≥4%,可将HBV分为A、B、C、D、E、F、G、H 8个基因型。目前已有报道,不同基因型可进一步分为不同的基因亚型。本研究对128例山东地区HBeAg阳性CHB患者HBV基因型、亚型及其临床意义进行了初步探讨。     

贵州地区发现的一株疑似基因Ⅰ型乙型肝炎病毒分析

根据HBV全基因核苷酸序列的异质性≥8％或S区基因序列差异≥4％,将HBV分为A-H 8种基因型[1].除了这些已知的基因型外,还有一些新基因型未被列入其中,包括HBV-Ⅰ和HBV-J[2-3].HBV基因型的分布具有明显的地域特征,HBV基因型不仅能反映核苷酸变异程度和病毒种系的发生关系,还可能与感染者的临床表现、预后及疗效有一定的关系.现报道在贵州发现的1例HBV病毒株可能为新的基因型HBV-Ⅰ.     

乙型肝炎病毒D基因型与原发性肝癌的关系

根据HBV全基因序列的同源性差异≥8％，现已将HBV分为A～G8个基因型。HBV DNA的基因型别呈一定的地域性分布，不同的基因型与HBV感染途经、致病性亦有一定的相关性。在我国约有90％原发性肝癌(HCC)合并HBV感染，HBV感染与HCC的发生密切相关。然而，迄今为止对HBV感染后的确切致癌机制还不甚清楚，有关HBV基因型与HCC关系的研究甚少。应用PCR微板核酸杂交-酶联免疫吸附试验(ELISA)对73例HBV DNA阳性HCC患者进行了基因分型，旨在探讨HBV基因型与HCC的关系。     

江苏省乙型肝炎病毒基因型分布与临床相关性

目前依据S区基因序列异质性大于或等于4%,将乙型肝炎病毒(HBV)分为A～H八种基因型[1,2],基因型反映HBV自然感染发生变异特点,是病毒变异进化的结果.越来越多的证据表明,HBV基因型可能与病毒感染途径、基因突变、疾病进程和抗病毒疗效具有一定相关性[3-5],且不同地区分布不一致.我们对江苏省215例乙型肝炎患者进行HBV基因分型,分析江苏省基因型分布规律,并结合肝穿刺活检病理检查分析基因型与临床相关性.     

乙型肝炎病毒基因型研究进展

1988年Okamoto等[1]通过对18株不同血清型乙型肝炎病毒(HBV)DNA进行全序列分析,将HBV分为A、B、C、D四种基因型。目前,根据HBV全基因组核苷酸序列差异≥8%或S基因序列差异≥4%,将HBV分为8个基因型,分别命名为A~H。每种基因型又可分为不同亚型,如A基因型可进一步分为A1(Aa)、A2(Ae)、A3(Ac)亚型;B基因型分为B1(Bj)、B2(Ba)、B3、B4和B5亚型;C基因型分为C1(Cs)、C2(Ce)、C3、C4和C5亚型;D基因型分为D1、D2、D3和D4亚型;F基因型分为F1和F2亚型等[2-6]。一、HBV基因型的地域和种族分布HBV基因型的分布具有明显的种族和…     

乙型肝炎病毒基因亚型研究进展

近年来,各国学者对乙型肝炎病毒（HBV）基因型及其亚型的研究十分关注。HBV基因型不仅能反映核酸变异程度和病毒种系发生关系,而且与感染者的临床表现、预后及疗效有关。目前,根据HBV全基因组序列差异≥8％,或S基因序列≥4％,将HBV分为A、B、C、D、E、F、G、H等8个基因型,但基因型H是否是独立于F的一个新基因型,还有待进一步证实。各基因型之间还存在混合感染,如B与C、C与D混合感染等∞。有人认为,混合感染可能与重叠感染或基因型之间的同源重组或部分转换有关。值得注意的是：近年来,除研究HBV基因型外,对HBV基因亚型也进行了深入研究,发现A基因型可进一步分为Aa和Ae亚型0;B型可分为B1（Bi）、B2（Ba）、B3和B4亚型N;C型可分为c1、c2、c3和c4亚型;D型可分为D1、D2、D3和D4亚型,F型可分为F1和F2亚型等（见表1）。     

四川省德阳地区慢性乙型肝炎病毒感染者病毒基因型的分布与临床意义

根据HBV全基因组序列差异≥8％或S基因序列差异≥4％,将HBV分为A～I 9个基因型[1-2].HBV基因型呈明显的地域分布,甚至在同一个国家的不同地区基因型分布也有差异;不同HBV基因型在病毒生物学特性方面有各自的特点,与HBV感染相关疾病的进展及预后显著相关,并且与IFNα抗病毒疗效之间也存在一定关系.为此,四川省德阳市人民医院感染科应用型特异性引物PCR法,分析了德阳地区608例慢性HBV感染者的HBV基因型分布并探讨其临床意义.     

168例慢性HBV感染者HBV基因型分布调查分析

目的 探讨HBV基因型与乙肝的临床转归关系.方法 应用PCR微板核酸分子杂交ELISA法检测168例慢性HBV感染者的HBV基因型,了解在各临床类型中HBV基因型的分布情况,阐明HBV基因型与HBeAg的关系;HBV基因型与乙肝临床转归的关系;HBV基因型与年龄性别的关系.结果 168例慢性HBV感染者中B基因型有78例占46.4396,C基因型有90例占53.57%.在肝硬化与肝癌病人中C基因型(73.17%)明显多于B基因型(26.83%),统计学分析有明显差异(P<0.05).90例C基因型病人HBeAg阳性62例,HBeAg阴性28例,两者比较有显著性差别(P<0.05).在高年龄组病人中以C基因型为主.结论 HBV基因型与乙肝临床转归有密切关系,C基因型是导致HBeAg持续阳性,引起肝硬化、肝癌的主要因素之一.     

中国乙型肝炎病毒B、C基因型参照序列的建立

目的 建立中国HBV B、C基因型参照序列.方法 从GenBank中获得来源于中国不同地区的HBV全基因序列.通过基因分型和序列比对,以相同位置频率最高碱基作为参照碱基建立序列;将这些参照序列与国内外的参照序列进行比较,了解其中的不同点,对不同编码区的氨基酸序列进行比较.对B,C基因型HBV的碱基替代情况进行统计学分析,其中1762、1764、1896位点采用χ~2检验,1858位点采用Fisher's确切概率法检验. 结果获得了中国HBV B,C基因型参照序列.Bc与Ba、Bj基因型HBV的全基因序列同源性分别为99.32%,95.52%,S基因序列同源性分别为99.71%、98.68%; Cc与C、Caus基因型的全基因序列同源性分别为98.44%、93.97%,S基因序列同源性分别为99.27%、95.01%.与Bj型相比.Bc和Ba型同源性更高;与Caus型相比,Cc和C型同源性更高.不同编码区的氨基酸序列也有差异;两种基因型在1762、1764、1858位点的碱基分布差异均有统计学意义(P值均<0.05).结论 建立的HBV B、C基因型参照序列可以作为中国HBV参照序列,为设计引物和分析碱基或(和)氨基酸变异提供参考.     

乙肝病毒基因分型的临床意义

自从1988年首次报道HBV基因型以来，基因型一直是学者研究的热点问题，目前将HBV分为A-H8种基因型，HBV不同基因型与HBV变异等可能具有某些相关性。我们检测了88例慢性乙型肝炎、肝炎肝硬化患者的基因亚型，分析与临床的关系。     

西藏地区60例慢性乙型肝炎患者病毒基因分型及分布特点

目的 了解西藏地区HBV基因型分型及分布特点.方法 选择2000年1月至2004年3月西藏地区HBsAg阳性的藏族HBV感染者60例.采用S基因序列分析法检测HBV基因型,并分析相应的前C/C区基因序列特点.结果 60例HBV样本基因型中,59例为Dc混合型,1例为Dbc混合型,其前C/C基因与B、C基因型均发生重组.结论 本次调查HBV基因型为Dc混合型和Dbc混合型,无纯D型及其他基因型.     

抗乙肝病毒治疗对自然病程的影响

一.乙型肝炎病毒感染的自然病程(一)引言:乙型肝炎病毒(HBV)基因组约长3.2kb,为部分双链环状DNA。根据HBV全基因序列差异≥8%或S区基因序列差异≥4%,目前可将其分为A—H8种基因型【1、2】,HBV基因型的分布具有明显的地理学特点:美国及北欧以A型为主;亚洲和远东地区以B型、C型多见;D型主要分布于地中海地区;E型仅见于非洲;F型则分布在中美洲;而G和H型的分布尚不明确【1】。(二)慢性乙型肝炎的定义为:HBsAg阳性,HBVDNA定量>105拷贝/ml,有持续或间断的ALT升高>6个月,肝组织炎症活动指数≥4。(三)慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染可分…     

重组乙型肝炎病毒研究进展

乙型肝炎病毒(HBV)具有较高的异质性,因此根据HBV全基因序列核苷酸异源性≥8％,可将HBV分为8个基因型,即A、B、C、D、E、F、G和H型,多基因型是HBV高度变异进化选择的结果。不同的基因型有不同的地域分布;基因型A和D几乎呈全球分布;B和C则主要分布于亚洲及远东地区;E通常局限于非洲西部;F则仅在新大陆和太平洋存在;G主要见于美国和法国;H主要分布于尼加拉瓜、墨西哥和美国。HBV的人群感染相当普遍,且同一个体可同时或先后感染2种或2种以上不同     

新疆汉族人群HBV基因型与临床病情的关系

目的了解新疆汉族人群乙型肝炎患者乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布及与临床病情的关系.方法新疆HBV感染者的血清226份,包括慢性乙型肝炎轻度、中度、重度、重型肝炎、肝硬化、肝癌患者.采用型特异性引物巢式PCR方法对血清中的HBV进行基因分型.结果新疆汉族人群HBV基因型以B、C混合型为主,占43.8%(99/226),B型31.46%(71/226),C型24.34%(55/226),未分型1例(0.44%),未见有A、D、E、F型分布.随机选取的4株HBV株经S基因序列的测定证实与本检测结果一致.C型HBV感染者的平均ALT、AST、γ-GT、AKP水平及HBV DNA浓度均高于B型、B+C型者(P＞0.05),C、B+C型TBIL平均水平高于B型,差异有统计学意义(P＜0.05).C型HBV感染者TP平均水平低于B、B+C型患者(P＞0.05).随着病情的加重,C型所占百分比逐渐高于B、B+C型,在LC、HCC中分别为36.4%,27.3%,C型感染者抗HBe阳性率逐渐增高,在HCC中B、C、B+C混合型者中抗HBe阳性率分别为26.7%、42.9%和32.6%(P＞0.05).结论新疆汉族人群HBV患者存在B、C与B+C基因型,以B、C混合型为主,基因型的分布与国内其它地方汉族人群相比有自身特点,且与临床病情有关,除TBIL外,各型在临床生化指标方面差异虽无统计学意义,但认为C型可能与较严重肝病有关,B+C型与HBV感染后病情的关系有待进一步明确.     

乙型肝炎病毒基因型的临床意义

根据HBV全基因序列异质性≥8％或S基因序列异质性≥4％为界,将其分为A～G 7种基因型。过去将HBV分为不同的基因组,目前认为基因型比基因组更具应用性,它能更好地区分毒株之间的关系。近年来国内外学者对HBV基因型的研究较多,现将这方面的研究进展作一综述。 1 乙型肝炎病毒基因组 HBV基因组是一个小环形(3.2kb)双链DNA,仅约3200个碱基对,双链的长度不对称,全长的一链因与病毒的RNA互补称为负链,较短的一链称为正链,正链的长度为负链的50％～100％,因此,正负链匹配,仅有部分长度为双链。负链核苷酸序列至少有4个开放读框(open readingframe,ORF)。即C、P、S和X,其中C、P和S基因分别编     

泉州地区慢性重型肝炎患者乙型肝炎病毒基因型及亚型分布特点

目前已知,HBV被分为A～H 8种基因型,由于在同一基因型病毒株之间还存在着一定的差异,故依据全基因序列异质性>4%且<8%的原则,进一步将基因型分为不同亚型,如B型分为B1(Bj)、B2(Ba)、B3(Ba)、B4(Ba)等亚型,C型分为C1(Cs)、C2(Ce)、C3、C4、C5等亚型,在基因型亚型之间也存在着地域分布及临床差异[1-3].泉州地区HBV感染引起慢性重型肝炎的基因型以B型为主,其次为C型,亦存在一定比例的B/C基因型混合感染[4].为进一步明确泉州地区重型肝炎HBV基因型、基因亚型的分布特点,我们对慢性重型肝炎患者进行HBV S基因测序,通过HBV S基因进化树图验证了HBV基因型、区分HBV基因亚型.     

干扰素单用及联合拉米夫定、阿德福韦、胸腺肽α1治疗e抗原阳性、C基因型慢性乙型肝炎的疗效

目前依据S区基因的序列异质性≥4%,将HBV分为A～H 8种基因型[1-2],基因型反映了HBV自然感染发生变异特点,是病毒变异进化的结果.越来越多的证据表明,HBV基因型可能与病毒感染途径,基因突变,疾病的进程,抗病毒疗效具有一定相关性[3-5],尤其HBV C基因型的患者,对单用IFN疗效较差.本研究自2006年4月-2008年11月选择HBV C基因型、HBeAg阳性的慢性乙型肝炎患者采用拉米夫定(LAM)+干扰素(IFN)、阿德福韦(ADV)+ IFN、胸腺肽α1(Tα1)+IFN治疗,并与单用IFN相对照.