肺炎克雷伯菌随机DNA多态性分型研究

目的 建立肺炎克雷伯菌随机扩增DNA多态性分型技术,以应用于临床菌株流行病学调查。方法 对临床分离的29株肺炎克雷柏菌进行Etest检测,并用酚氯仿法提取其DNA后行RAPD分型。结果 29株临床分离菌有7株ESBL阳性,24株有稳定的RAPD带型,其中ICU分离的5株ESBL阳性株的4株RAPD指纹图谱相同。结论 RAPD基因分型技术不需已知核酸序列,分型率高,分辨力强,简便快捷可为肺炎克雷伯菌株提供分型标志,是分子流行病学研究的有效方法。     

阴沟肠杆菌随机扩增多态性DNA法基因分型

目的建立阴沟肠杆菌(ECL)随机扩增多态性DNA(RAPD)法基因分型图谱.方法以优化的随机引物和反应体系对临床分离的159株ECL进行RAPD法基因分型,并按DNA条带数及片段大小绘制指纹图谱.结果 159株临床分离ECL共得121种RAPD指纹图谱.结论 RAPD技术可将临床分离ECL分型121种.     

102株单核细胞增生李斯特菌随机扩增多态性DNA基因分型研究

目的:对单核细胞增生李斯特菌进行随机扩增多态性DNA(RAPD)基因分型研究。方法:以优化的随机引物和反应体系对生肉、熟肉、生奶、乳制品、水产品、冷冻食品、生食蔬菜共七大类食品中分离的102株单核细胞增生李斯特菌进行RAPD法基因分型,并按DNA条带数及片段大小绘制指纹图谱。结果:102株单核细胞增生李斯特菌共得26种RAPD指纹图谱,以第12、18、23和10型为主要型别,分别为15、14、8和6株。结论:RAPD技术可将单核细胞增生李斯特菌分型26种,我省食品中分离的单核细胞增生李斯特菌主要基因型为第12、18、23和10型。     

随机扩增DNA多态性技术在粘质沙雷菌分型研究中的应用

目的应用随机扩增DNA多态性(RAPD)技术对医院感染的粘质沙雷菌进行基因分型。方法对心外科ICU病房5例术后发热患者血液中分离出的粘质沙雷菌，用VITEK细菌全自动分析仪进行系统生化鉴定，K-B纸片扩散法进行药敏试验，用2条不同的随机引物进行RAPD基因分型。结果5株粘质沙雷菌药敏谱全部一致，2条随机引物中一条引物未能分型，另一条引物可分为2个基因型。其中，4株菌扩增出相同带谱，为同基因型；1株菌有独特的带谱为另一种基因型。结论本次调查的5株粘质沙雷菌有2种RAPD基因型，其中4株为相同基因型，证实存在感染流行。     

重庆市老年中心铜绿假单胞菌流行病学分型研究

目的对重庆市老年中心引起医院感染的铜绿假单胞菌(PAE)进行流行病学分型研究,了解其流行与耐药,以便更好地控制其引起的医院感染.方法采用随机扩增多态性DNA(RAPD)基因分型方法对重庆市老年中心分离的24株PAE进行RAPD基因分型.结果24株PAE共得RAPD 14型,分型率100%;同一病区不同患者分离出的PAE未检出相同基因型的PAE,3个不同病区间未检出相同RAPD型别的PAE;7例感染个体连续收集的PAE有5例RAPD指纹图谱完全一致,2例出现跳跃性指纹图谱,且与其他分型指纹图谱不相同.结论RAPD能满足对PAE进行分子流行病学分型;通过分型可判断内原性、外源性或突变PAE引起的感染.     

RAPD技术对表皮葡萄球菌DNA分型

目的对表皮葡萄球菌进行DNA分型并分析其多态性,为临床提供采用RAPD分析表皮葡萄球菌同源性的方法。方法用随机引物RAPD1,对眼科病房分离到的21株表皮葡萄球菌菌株DNA做RAPD并对其做药敏试验。结果以电泳图谱条带的差异对分离株的DNA分析后,21株表皮葡萄球菌分5个型别,其中属Ⅰ型的菌数占71%。结论RAPD技术能在DNA水平上对表皮葡萄球菌分型,其方法快速、简易、特异、可靠,适用于该菌致医院感染的追踪及流行病学研究。     

肠炎沙门菌随机扩增多态性DNA分子分型

目的对不同来源的12株肠炎沙门菌分离株进行分子分型。方法分别提取不同菌株基因组DNA,建立和优化随机扩增多态性DNA（RAPD）反应体系,试用22条随机引物对不同菌株进行RAPD扩增,筛选清晰稳定的扩增条带做统计分析。结果筛选到OPG-03、OPG-06、OPG-07和OPG-13共4条随机引物具有鉴别作用,每一菌株均可扩增出4~10条DNA片段,大多数片段在100~2000bp之间,共扩增出42条RAPD条带,其中共有条带7条,多态性条带35条,多态性为83.3%。不同来源的肠炎沙门菌分离株之间的遗传相似系数在42.6%~100%之间,在0.850的相似性水平上可将12株肠炎沙门菌分离株分为5个不同的亚型。结论应用RAPD技术在分子水平上对肠炎沙门菌进行鉴别和分型具有简便、快速和辨别能力高的优势,对肠炎沙门菌的分子流行病学研究具有较好的应用前景。     

RAPD技术在唐山市结核分枝杆菌指纹分型研究中的应用

[目的]RAPD DNA指纹分型方法的建立及其在分枝杆菌基因分型中的应用。[方法]收集结核病患者痰标本,分离培养获得分枝杆菌,进行表型鉴定及耐药性检测;提取基因组DNA,在建立RAPD DNA指纹分型方法的基础上对分枝杆菌进行DNA指纹图谱分析。[结果]RAPD指纹图谱分析将102株分枝杆菌分为7种菌型,其中Ⅰ型35株（34.31%）,Ⅱ型28株（27.45%）,Ⅲ型24株（23.53%）,Ⅳ型6株（5.88%）,Ⅴ型3株（2.94%）,Ⅵ型4株（3.92%）,Ⅶ型2株（1.97%）,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型是主要的3种类型。RAPD扩增特征条带大小为201～1 018 bp。分组统计显示,3种主要的RAPD DNA指纹的分布与患者的居住地、职业、结核菌耐药性有关,而与患者的性别、年龄、结核接触史等无关。[结论]RAPD DNA指纹分型方法是一种简单、快速的分枝杆菌的分型方法;3种主要类型的结核分枝杆菌在唐山地区流行。     

随机扩增多态性DNA分型法在铜绿假单胞菌流行病学研究方面的应用

目的摸索适于铜绿假单胞菌随机扩增多态性DNA分型法(RAPD)分型的最佳实验条件,并对我院临床分离到的34株铜绿假单胞菌进行分型研究。方法从随机引物筛选、镁离子浓度、模板量、引物浓度4方面对RAPD反应体系进行优化。结果不同病区分离到的铜绿假单胞菌的指纹图谱互不相同;从烧伤病房分离到的8株高度耐药的铜绿假单胞菌中,其中7株为同一指纹图谱,另外1株为独特的指纹图谱,而外科重症监护病房、肺科病房、干部病房同一病区内分离到的铜绿假单胞菌均为同一指纹图谱。结论铜绿假单胞菌在病区内存在交叉感染的情况,但未出现病区间感染同一流行株。     

随机扩增DNA技术在铜绿假单胞菌分型中的应用

目的:探讨随机扩增DNA多态性基因分型法对于细菌分型的应用价值。方法:对23株铜绿假单胞菌临床分离株提取基因组DNA,采用两条随机引物对基因组进行随机扩增后根据电泳条带分型。结果:两条随机可以把铜绿假单胞菌分为不同的基因型。结论:单纯应用单个随机引物对病原菌进行随机扩增DNA多态性基因分型结果缺乏可信度。     

金黄色葡萄球菌随机扩增DNA多态性分型研究

目的建立金黄色葡萄球菌随机扩增ＤＮＡ多态性（ＲＡＰＤ）分型技术，以应用于临床菌种鉴定及流行病学调查。方法对临床分离的１５株金黄色葡萄球菌，酚氯仿法提取其ＤＮＡ后行ＲＡＰＤ分型，同时进行噬菌体分型。结果１５株临床分离株大多数产生独特而稳定的ＲＡＰＤ带型，可分成５个噬菌体型和１４个ＲＡＰＤ谱型。采用同一反应体系，产肠毒素金黄色葡萄球未出现ＲＡＰＤ谱型。结论ＲＡＰＤ基因分型技术不需已知核酸序列，分型率高，分辨力强，简便快捷，可为金黄色葡萄球菌临床分离株提供分型标志，是分子流行病学研究的有效方法     

金黄色葡萄球菌随机扩增DNA多态性分型研究

目的建立金黄色葡萄球菌随机扩增ＤＮＡ多态性（ＲＡＰＤ）分型技术，以应用于临床菌种鉴定及流行病学调查。方法对临床分离的１５株金黄色葡萄球菌，酚氯仿法提取其ＤＮＡ后行ＲＡＰＤ分型，同时进行噬菌体分型。结果１５株临床分离株大多数产生独特而稳定的ＲＡＰＤ带型，可分成５个噬菌体型和１４个ＲＡＰＤ谱型。采用同一反应体系，产肠毒素金黄色葡萄球菌未出现ＲＡＰＤ谱型。结论ＲＡＰＤ基因分型技术不需已知核酸序列，分型率高，分辨力强，简便快捷，可为金黄色葡萄球菌临床分离株提供分型标志，是分子流行病学研究的有效方法。     

重症监护室内鲍曼不动杆菌随机扩增DNA多态性分型研究

目的：建立鲍曼不动杆菌随机扩增DNA多态性（RAPD）分型技术,以用于临床菌种鉴定及流行病学调查。方法：收集6个月内从ICU内分离出的14株鲍曼不动杆菌,提取DNA后进行RAPD分型;同时进行生物学分型和抗生素敏感性实验,结果：14株菌株被分为5种RAPD型,其中有5株属于同一种类型（A型）,有6株属于另外同一种类型（B型）,其他3株分别属于另3种不同类型（C,D,E型）,而生物学分型只有两种类型（生物型1,9）,抗生素敏感性实验表明14株菌株均为仅对亚胺培南／西司他丁（泰能）,头孢哌酮/舒巴坦（舒普深）等少数几种抗生素敏感的多重耐药菌株。结论：ICU内存在鲍曼不动杆菌暴发流行,RAPD分型技术分型率高,分辨力强,简便快速,具有分子流行病学研究的应用价值。     

ICU铜绿假单胞菌感染暴发的随机扩增多态性DNA分子分型 FREE

目的对铜绿假单胞菌（PA）进行随机扩增多态性ＤＮＡ(RAPD)分子分型,探讨重症监护室(ICU)中PＡ医院感染的流行规律。方法采用RAPD技术对13株分离自某院ICU临床诊断为医院感染肺炎患者下呼吸道标本的PＡ进行分型，并与抗菌药物耐药谱分型比较。结果13株PＡ产生A型（12株，92.31%）和B型（1株，7.69%）2种耐药表型，优势耐药表型为A型；RAPD分型可分2型，分别为Ⅰ型(6株，46.15%)和Ⅱ型(7株，53.85%)。7株分子Ⅱ型和5株分子Ⅰ型的耐药A型PA是优势菌株，可判断为引起ICU中PA医院感染暴发的病原菌。结论ICU存在PA暴发流行，流行株为耐药A型/分子Ⅱ型、耐药A型/分子Ⅰ型。PA产生多重耐药性，RAPD分型是目前比较理想的分子流行病学溯源手段。     

上海市浦东地区淋病奈瑟菌分型与耐药性的相关分析

目的了解上海市浦东地区淋病病原体奈瑟双球菌的不同基因分型及各基因型与耐药性之间的对应关系。方法运用随机扩增多态性DNA(RAPD)指纹图谱对78株分离自不同患者淋球菌菌株进行区分，从分子水平对淋球菌进行基因分型，并在此基础上探讨不同的基因分型与耐药性之间的关系。结果78株淋球菌分离株RAPD图谱上相似，但各菌株基因图谱之间有明显不同DNA多态性，可将菌株区分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三种基因分型，对此三种基因分型与A、B、C、D四种不同的耐药类型进行对应分析，发现耐药类型与基因型别之间存在对应关系。结论通过研究发现浦东地区淋球菌流行株有着不同的耐药特点及基因型别，耐药性与不同的基因分型之间存在着一定相关性。     

耐亚胺培南铜绿假单胞菌的耐药性及分子流行病学研究

目的了解广州市某医院烧伤科病房亚胺培南耐药铜绿假单胞菌的耐药谱特点及分子流行病学情况。方法采用Kirby-Bauer法进行药物敏感性试验,应用随机扩增DNA多态性分析(RAPD)技术,对从不同患者连续分离到的48株耐药菌进行DNA分型。结果48株亚胺培南耐药菌株均为多重耐药菌,对临床常用的多种抗菌药物耐药,敏感率由高到低依次为CIP、TOB、AMK、GEN和FEP;RAPD图谱显示48株菌分别属于A、B、C、D 4个不同克隆,其中A型、B型是主要流行克隆。结论该院烧伤科病房亚胺培南耐药铜绿假单胞菌的流行主要是医院感染所致,流行株呈多重耐药。     

随机扩增多态性DNA在淋球菌基因分型中的应用

目的 建立随机扩增多态性DNA(RAPD)对淋球菌进行基因分型的方法。方法 用4种不同的预处理方法提取淋球菌基因组DNA,对其优劣进行比较;并运用RAPD对淋球菌菌株进行区分及对经性伴传播的淋病病例进行RAPD指纹图谱比较。结果 运用经典的十六烷基三乙基溴化铵法可以抽提较完整的基因组DNA,获得良好的RAPD指纹图谱;各菌株的RAPD指纹图谱间有明显不同DNA多态性;性伴传播的病例中获得了非常相似的RAPD指纹。结论 选择最佳的DNA抽提技术,运用RAPD可以对淋球菌进行有效基因分型,并可用于分子流行病学对传染源的追踪。     

Typing of Acinetobacter baumannii isolated from hospital-acquired respiratory infections in a tertiary care centre in southern India

In an attempt to define the epidemiology of Acinetobacter baumannii infection, 27 isolates, obtained from hospital-acquired respiratory infections, were typed using random amplified polymorphic DNA (RAPD) profile and antimicrobial susceptibility patterns. Ten different patterns were obtained with ERIC2 primer: 14 isolates had a similar profile representing a single strain. Within RAPD types, isolates could be further classified based on their antibiogram; however, strains of different types had similar antibiograms. This study showed that many different genetic types of A. baumannii are prevalent in our hospital. While antibiograms alone are not sufficiently discriminatory, RAPD typing helps in identifying outbreaks and in assessing infection control procedures within a hospital.